KR20240163743A - 변형된 올리고뉴클레오티드 - Google Patents

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KR20240163743A
KR20240163743A KR1020247035748A KR20247035748A KR20240163743A KR 20240163743 A KR20240163743 A KR 20240163743A KR 1020247035748 A KR1020247035748 A KR 1020247035748A KR 20247035748 A KR20247035748 A KR 20247035748A KR 20240163743 A KR20240163743 A KR 20240163743A
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fluoro
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methyl
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sense strand
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KR1020247035748A
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대런 에이치 웨이크필드
로렌 알메이다
데이비드 로제마
옴리 고테스만
데이비드 루이스
Original Assignee
엠피리코 인크.
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Abstract

본원에서 변형된 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이 개시된다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 소수성 모이어티를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 2' 변형된 리보스 분자와 같은 변형된 올리고뉴클레오티드 당을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 포스포로티오에이트 결합과 같은 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 siRNA를 포함한다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 양쪽 말단에 돌출부가 있는 이중체 영역을 포함한다.

Description

변형된 올리고뉴클레오티드
교차 참조
본 출원은 2022년 3월 28일에 출원된 미국 가출원 제63/324,487호, 및 2022년 12월 2일에 출원된 미국 가출원 제63/429,756호의 이익을 주장하며, 두 출원 모두 본원에 참고로 포함된다.
서열 목록
본 출원은 전자 형식의 서열 목록과 함께 제출된다. 서열 목록은 2023년 3월 20일에 생성된 54462-739601_PCT.xml이라는 명칭의 파일로 제공되며, 크기는 541 킬로바이트이다. 서열 목록의 전자 형식의 정보는 전체적으로 참고로 포함된다.
배경
유전자 발현을 감소시키기 위한 개선된 올리고뉴클레오티드에 대한 필요성이 해당 분야에 존재한다.
발명의 요약
본원에서, 일부 실시 양태에서, mRNA를 표적화하고 유효량으로 투여될 때 표적 mRNA 또는 단백질 수준을 감소시키는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이 기재된다. 본원에서, 일부 실시 양태에서, 센스 가닥, 안티센스 가닥, 및 센스 또는 안티센스 가닥의 말단에 연결된 지질 모이어티를 포함하는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함하는 조성물이 기재되며; 여기서 지질 모이어티는 페닐 또는 시클로헥실 링커를 포함하며, 여기서 링커는 지질과 센스 또는 안티센스 가닥의 말단에 연결된다. 지질 모이어티는 센스 또는 안티센스 가닥의 5' 또는 3' 말단에 연결될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 지질과 센스 또는 안티센스 가닥의 말단은 1,4; 1,3; 또는 1,2 치환 패턴(예를 들어, 파라, 메타, 또는 오르토 페닐 배열)으로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질과 센스 또는 안티센스 가닥의 말단은 1,4(파라 페닐) 배열로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함한다:
; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어, 공유 연결)을 나타내고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, R은 옥탄이 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 4-7개 또는 9-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함한다:
; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어, 공유 연결)을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함한다:
; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어, 공유 연결)을 나타내고, n은 0-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함한다: ; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어, 공유 연결)을 나타내고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조 중 어느 하나를 포함한다:
; ; 또는 ; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결을 나타내고, n은 0-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 표 1에 도시한 지질 모이어티를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 5' 말단에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 센스 가닥의 5' 말단에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 포스페이트를 통해 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 5' 말단에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 센스 가닥의 말단에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 5' 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥 또는 안티센스 가닥은 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 5' 또는 3' 말단에 1개 또는 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 예를 들어, 안티센스 가닥의 5' 말단으로부터 첫 번째와 두 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있거나, 안티센스 가닥의 5' 말단으로부터 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 1개 또는 2개의 3' 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 예를 들어, 안티센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째와 두 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있거나, 안티센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 예를 들어, 센스 가닥의 5' 말단으로부터 첫 번째와 두 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있거나, 센스 가닥의 5' 말단으로부터 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함하지 않는다. 예를 들어, 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 5' 말단에서 마지막 3개의 뉴클레오티드 사이에는 포스포로티오에이트가 없다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 5' 포스페이트 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 3' 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 예를 들어, 센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째와 두 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있거나, 센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트가 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함; 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함; 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥 또는 안티 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하나, 단, 센스 가닥 또는 안티센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함함. 센스 가닥은 위치 9에서 2-데옥시 변형을 포함할 수 있다.
본원에서, 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함하는 조성물이 기재되며; 여기서 안티센스 가닥은 비닐 포스포네이트와 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥은 소수성 모이어티를 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하나, 단, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있으며: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함; 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 본원에서, 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함하는 조성물이 기재되며; 여기서 안티센스 가닥은 비닐 포스포네이트와 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥은 소수성 모이어티를 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하며: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함; 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함함; 단, 모두 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 본원에서, 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함하는 조성물이 기재되며; 여기서 안티센스 가닥은 비닐 포스포네이트와 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥은 소수성 모이어티를 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하며: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함; 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함함. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 5' 말단은 포스페이트 결합을 통해 연결된 2개의 뉴클레오티드를 포함하고, 포스포로티오에이트 결합에 의한 것은 포함하지 않는다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 5' 말단은 포스페이트 결합을 통해 연결된 2개의 뉴클레오시드를 포함하고, 포스포로티오에이트 결합에 의한 것은 포함하지 않고, 센스 가닥의 3' 말단은 포스포로티오에이트 결합을 통해 연결된 2개의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 5' 말단은 1개 또는 2개의 포스포로티오에이트 결합을 추가로 포함한다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 페닐 또는 시클로헥실 링커에 의해 센스 가닥의 5' 말단에 연결된 지질을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질과 센스 가닥의 5' 말단은 1,4; 1,3; 또는 1,2 치환 패턴(예를 들어, 페닐 배열의 경우 파라, 메타 또는 오르토)으로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질과 센스 가닥의 5' 말단은 1,4(파라 페닐) 배열로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 다음 구조 중 어느 하나를 포함한다:
; ; 또는 ; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함한다:
; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어, 공유 연결)을 나타내고 R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, R은 옥탄이 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 4-7개 또는 9-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함한다:
; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어, 공유 연결)을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함한다:
; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어 공유 연결)을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함한다:
; 여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 연결(예를 들어 공유 연결)을 나타내고 R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 표 1에 도시된 지질 모이어티를 포함한다. 센스 가닥은 위치 9에서 2-데옥시 변형을 포함할 수 있다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥은 이중체를 형성한다. 일부 실시 양태에서, 이중체는 적어도 10개 염기쌍, 적어도 11개 염기쌍, 적어도 12개 염기쌍, 적어도 13개 염기쌍, 적어도 14개 염기쌍, 적어도 15개 염기쌍, 적어도 16개 염기쌍, 적어도 17개 염기쌍, 적어도 18개 염기쌍, 적어도 19개 염기쌍, 적어도 20개 염기쌍, 적어도 21개 염기쌍, 적어도 22개 염기쌍, 적어도 23개 염기쌍, 적어도 24개 염기쌍, 또는 적어도 25개 염기쌍을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 이중체는 19개 염기쌍을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 이중체는 센스 가닥 돌출부를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥 돌출부는 1-4개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥 돌출부는 2개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥 돌출부는 우라실을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 이중체는 안티센스 가닥 돌출부를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥 돌출부는 1-4개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥 돌출부는 2개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥 돌출부는 우라실을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥은 1-3개의 뉴클레오티드의 센스 가닥 3' 돌출부와 1-3개의 뉴클레오티드의 안티센스 가닥 3' 돌출부를 포함하는 이중체를 형성한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥은 2개의 우라실 뉴클레오티드의 센스 가닥 3' 돌출부와 2개의 우라실 뉴클레오티드의 안티센스 가닥 3' 돌출부를 포함하는 이중체를 형성한다. 일부 실시 양태에는 약학적으로 허용 가능한 담체가 포함된다. 본원에서, 일부 실시 양태에서, 치료를 필요로 하는 대상체에게 유효량의 조성물을 투여하는 단계를 포함하는 치료 방법이 기재된다. 본원에서, 일부 실시 양태에서, 세포에서 RNA 또는 단백질의 양을 감소시키는 방법으로서, 세포에 조성물을 투여하는 단계를 포함하는 방법이 기재된다. 일부 실시 양태에서, 세포에 조성물을 투여하는 단계는 세포를 포함하는 대상체에게 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
본원에서, 일부 실시 양태에서, 치료를 필요로 하는 대상체에게 본원에 기재된 조성물 또는 siRNA의 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 치료 방법이 기재된다. 일부 실시 양태에서, 투여는 피하, 유리체 내, 척수강 내, 또는 뇌실 내 투여를 포함한다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 대상체의 질병을 매개하는 단백질을 코딩하는 mRNA를 표적화한다. 일부 실시 양태에서, mRNA는 대상체의 조직에 있으며, 조직은 눈, 간, 지방, 뇌, 또는 척수를 포함한다.
본원에서, 일부 실시 양태에서, 세포에서 RNA에 의해 코딩된 표적 RNA 또는 단백질의 양을 감소시키는 방법으로서, 본원에 기재된 조성물 또는 siRNA를 세포에 투여하는 단계를 포함하는 방법이 기재되며, 여기서 안티센스 가닥은 RNA에 상보적이고 RNA에 결합하는 서열을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 세포에 조성물을 투여하는 단계는 세포를 포함하는 대상체에게 조성물을 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 투여는 피하, 유리체 내, 척수강 내, 또는 뇌실 내 투여를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 투여는 표적 RNA 또는 RNA에 의해 코딩된 단백질의 측정치를 기준선 측정치 또는 대조군에 비해 적어도 10% 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 세포는 눈, 간, 지방, 뇌, 또는 척수 세포를 포함한다.
본원에서, 일부 실시 양태에서, 변형된 올리고뉴클레오티드가 개시된다. 변형된 올리고뉴클레오티드는 리보스 고리 및 포스페이트 결합에 대한 변형을 포함하는 siRNA일 수 있다. 변형은 세포 전달, 안정성, 및 효율성을 극대화하는 특정 패턴일 수 있다. siRNA는 또한 비닐 포스포네이트 및 소수성 기를 포함할 수 있다. 이러한 변형은 대상체 내의 세포 또는 조직으로의 전달을 도울 수 있다. 변형된 올리고뉴클레오티드는 치료 방법 또는 유전자 발현을 감소시키는 방법과 같은 방법에 사용될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 19개 염기 쌍 사이에 염기 쌍을 이루는 21개의 뉴클레오티드 단일 가닥으로 이루어진 이중체를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 이중체는 각 가닥의 3' 말단에 있는 단일 가닥의 2개의 뉴클레오티드 돌출부를 포함한다. 한 가닥(안티센스 가닥)은 표적 mRNA에 상보적이다. 안티센스 가닥의 각 말단에는 1 내지 2개의 포스포로티오에이트 결합이 있다. 5' 말단에는 비닐 포스포네이트와 같은 선택적 포스페이트 모방체가 있다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 표적 mRNA 또는 표적 단백질을 녹다운시키는 데 사용된다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 표적 mRNA와 동일한 서열을 갖는다. 일부 실시 양태에서, 3' 말단에 1 내지 2개의 포스포로티오에이트가 있다. 일부 실시 양태에서, 5' 말단에 포스포로티오에이트가 1개 있거나 없다. 일부 실시 양태에서, 포스포디에스테르 결합을 통해 5' 말단에 부착된 12 내지 25개의 탄소의 소수성 접합체가 있다.
1. 조성물
본원에서, 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이 개시된다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 올리고뉴클레오티드를 표적화하는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 표적 올리고뉴클레오티드는 표적 RNA를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 RNA를 표적화하는 올리고뉴클레오티드로 이루어진다. 표적 RNA는 표적 mRNA를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 대상체에서 표적 mRNA 발현을 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 대상체에서 표적 단백질 발현을 감소시킨다. 올리고뉴클레오티드는 RNA 이중체를 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드는 안티센스 올리고뉴클레오티드(ASO)를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 치료를 필요로 하는 대상체에서 장애를 치료하는 방법에 사용된다. 일부 실시 양태는 장애를 치료하는 방법에 사용하기 위한 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애를 치료하는 방법에 있어 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물의 용도에 관한 것이다.
표적은 다양한 방법으로 식별될 수 있다. 일부 경우에, 표적 올리고뉴클레오티드는 장애(예를 들어, 지방 관련 또는 눈 관련 장애)의 발생과 관련된 발현 수준을 갖는 mRNA를 포함한다. 일부 경우에, 표적 올리고뉴클레오티드는 장애와 관련된 특정 유전자형을 갖는 유전자에 의해 코딩되는 mRNA를 포함한다. 대규모 인간 유전 데이터는 의약품 발견 및 개발의 성공률을 개선할 수 있다. 게놈 전체 연관 연구(GWAS)는 인구 샘플에서 유전적 변이와 특성 간의 연관성을 감지할 수 있다. GWAS는 질병의 생물학을 더 잘 이해하고 적용 가능한 치료법을 제공할 수 있다. GWAS는 유전자형 및/또는 시퀀싱 데이터를 활용할 수 있으며, 종종 게놈 전체에 비교적 고르게 분포된 수백만 개의 유전적 변이의 평가를 포함한다. 가장 일반적인 GWAS 설계는 사례 대조 연구로, 대조군 대비 사례의 변이 빈도의 비교를 포함한다. 변이가 대조군에 비해 사례에서 유의하게 다른 빈도를 갖는 경우, 해당 변이는 질병과 관련이 있다고 한다. GWAS에서 사용할 수 있는 연관 통계는 통계적 유의성의 척도인 p-값; 효과 크기의 척도인 승산비(OR); 또는 효과 크기의 척도인 베타 계수(베타)이다. 연구자들은 종종 가산 유전 모델을 가정하고 대립유전자 승산비를 계산하는데, 이는 (대립유전자 사본을 보유하지 않은 경우와 비교하여) 대립유전자의 각 추가 사본에 의해 부여되는 질병 위험의 증가(또는 감소)이다. GWAS의 설계 및 해석에서 추가적인 개념은 연관 불평형으로, 이는 대립유전자의 비무작위적 연관이다. 연관 불평형의 존재는 어떤 변이가 "인과적"인지 모호하게 만들 수 있다.
변이의 기능적 주석 및/또는 습식 실험실 실험이 GWAS를 통해 식별된 인과적 유전 변이를 식별하는 데 사용되며, 많은 경우 질병을 유발하는 유전자의 식별로 이어진다. 특히, 인과적 유전 변이의 기능적 효과(예를 들어, 단백질 기능 상실, 단백질 기능 획득, 유전자 발현 증가, 또는 유전자 발현 감소)를 이해하면 해당 변이를 표적 유전자의 치료적 조절을 위한 대용물로 사용하거나 해당 표적을 조절하는 치료제의 잠재적 치료 효능 및 안전성에 대한 통찰력을 얻을 수 있다.
이러한 유전자-질병 연관성을 식별하면 질병 생물학에 대한 통찰력을 얻을 수 있으며 약학 산업을 위한 새로운 치료 표적을 식별하는 데 사용된다. 인간 유전학에서 얻은 치료적 통찰력을 해석하기 위해 환자의 질병 생물학은 인간 유전학으로부터의 관찰을 복제하도록 외인적으로 '프로그래밍'된다. 인간 유전학을 통해 식별된 치료 표적을 새로운 의약품으로 해석하는 데 적용할 수 있는 치료 방식에 대한 몇 가지 옵션이 있다. 여기에는 소분자 및 단클론 항체와 같이 잘 확립된 치료 방식, 올리고뉴클레오티드와 같은 성숙된 방식, 및 유전자 치료 및 유전자 편집과 같은 새로운 방식이 포함된다. 치료 방식의 선택은 표적의 위치(예를 들어, 세포 내, 세포 외, 또는 분비), 관련 조직(예를 들어, 폐 또는 눈) 및 관련 적응증과 같은 요인에 따라 달라진다. 이러한 연구는 본원에 기재된 조성물 또는 화합물에 의한 siRNA 억제를 위한 특정 장애 관련 표적을 식별하기 위해 수행될 수 있다. 일부 경우에 표적이 특정 조직과 관련이 있을 수 있다.
본원에서 표적 RNA를 표적화하는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이 개시된다. 표적 RNA의 억제 또는 표적화가 개시되는 경우, 일부 실시 양태는 표적 단백질 또는 표적 RNA를 억제 또는 표적화하는 단계를 포함할 수 있음이 고려된다. 예를 들어, 본원에 기재된 올리고뉴클레오티드를 사용하여 표적 유전자에 의해 코딩된 RNA(예를 들어, mRNA)를 억제 또는 표적화함으로써, 표적 RNA의 번역에 의한 표적 단백질의 생성이 감소함에 따라 표적 단백질이 억제 또는 표적화될 수 있거나, 표적 RNA에 결합하거나 표적 RNA와 상호 작용하여 표적 RNA로부터 표적 단백질의 생성을 감소시키는 올리고뉴클레오티드에 의해 표적 단백질이 표적화 또는 억제될 수 있다. 따라서, 표적화는 표적 RNA를 결합하고 표적 RNA 또는 단백질 수준을 감소시키는 것을 의미할 수 있다. 올리고뉴클레오티드는 소형 간섭 RNA(siRNA) 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드(ASO)를 포함할 수 있다. 또한, 표적 장애를 치료하는 방법으로서, 표적을 표적화하는 올리고뉴클레오티드를 이를 필요로 하는 대상체에게 제공함에 의한 방법이 본원에 제공된다.
일부 실시 양태는 mRNA를 표적화하고 대상체에게 유효량으로 투여될 때 세포, 체액 또는 조직에서 표적 mRNA 또는 단백질 수준을 감소시키는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 RNA를 표적화하고 대상체에게 유효량으로 투여될 때 세포 또는 조직에서 표적 mRNA 수준을 감소시키는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 투여 전과 비교하여 약 10% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에 있어서, 표적 mRNA 수준은 투여 전과 비교하여 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 또는 약 100% 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 투여 전과 비교하여 약 10% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 투여 전과 비교하여 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 또는 약 90% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 2.5%, 5%, 7.5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 감소하거나, 상기 언급된 임의의 두 백분율로 정의된 범위만큼 감소한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA를 표적화하고 대상체에게 유효량으로 투여될 때 세포, 체액 또는 조직에서 표적 단백질 수준을 감소시키는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 투여 전과 비교하여 약 10% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 투여 전과 비교하여 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 또는 약 100% 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 투여 전과 비교하여 약 10% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 투여 전과 비교하여 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 또는 약 90% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 2.5%, 5%, 7.5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 감소하거나, 상기 언급된 임의의 두 백분율로 정의된 범위만큼 감소한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 mRNA를 표적화하고 대상체에게 유효량으로 투여될 때 질병 표현형을 감소시키는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 질병 표현형은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 질병 표현형은 투여 전과 비교하여 약 10% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 질병 표현형은 투여 전과 비교하여 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 또는 약 100% 감소한다. 일부 실시 양태에서, 질병 표현형은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 질병 표현형은 투여 전과 비교하여 약 10% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 질병 표현형은 투여 전과 비교하여 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 또는 약 90% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 질병 표현형은 2.5%, 5%, 7.5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 감소하거나, 상기 언급된 임의의 두 백분율로 정의된 범위만큼 감소한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 mRNA를 표적화하고 대상체에게 유효량으로 투여될 때 대상체의 질병에 대한 방어적 표현형을 향상시키는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 10% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 또는 약 100% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 200% 이상, 약 300% 이상, 약 400% 이상, 약 500% 이상, 약 600% 이상, 약 700% 이상, 약 800% 이상, 약 900% 이상, 또는 약 1000% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하로 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 10% 이하 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 약 90% 이하, 또는 약 100% 이하 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 투여 전과 비교하여 약 200% 이하, 약 300% 이하, 약 400% 이하, 약 500% 이하, 약 600% 이하, 약 700% 이하, 약 800% 이하, 약 900% 이하, 또는 약 1000% 이하만큼 증가한다. 일부 실시 양태에서, 방어적 표현형은 2.5%, 5%, 7.5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 600%, 700%, 800%, 900%, 또는 1000% 증가하거나, 상기 언급된 임의의 두 백분율로 정의되는 범위만큼 증가한다.
A. siRNA
일부 실시 양태에서, 조성물은 mRNA와 같은 표적 RNA를 표적화하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA를 표적화하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 센스 가닥은 길이가 12-30개의 뉴클레오시드이다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 길이가 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 또는 30개의 뉴클레오시드이거나, 상기 언급된 임의의 두 수로 정의된 범위인 센스 가닥을 포함한다. 센스 가닥은 길이가 14-30개의 뉴클레오시드일 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 길이가 12-30개의 뉴클레오시드인 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 길이가 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 또는 30개의 뉴클레오시드이거나, 상기 언급한 임의의 두 수로 정의된 범위인 안티센스 가닥을 포함한다. 안티센스 가닥은 길이가 14-30개의 뉴클레오시드일 수 있다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 각 가닥은 독립적으로 길이가 약 12-30개의 뉴클레오시드이고, 센스 가닥과 안티센스 가닥 중 적어도 하나는 전체 길이의 인간 표적 mRNA 서열의 약 12-30개의 연속 뉴클레오시드를 포함하는 뉴클레오시드 서열을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥 중 적어도 하나는 표적 RNA의 약 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30개 이상의 연속 뉴클레오시드를 포함하는 뉴클레오시드 서열을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하고, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 센스 가닥과 안티센스 가닥은 이중 가닥 RNA 이중체를 형성한다. 일부 실시 양태에서, 이중 가닥 RNA 이중체의 첫 번째 염기쌍은 AU 염기쌍이다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 추가로 3' 돌출부를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 3' 돌출부는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 뉴클레오시드, 또는 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 3' 돌출부는 1, 2개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 3' 돌출부는 2개의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 추가로 5' 돌출부를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 5' 돌출부는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 뉴클레오시드, 또는 상기 언급된 수 중 임의의 2 개로 정의된 범위의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 5' 돌출부는 1, 2개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 5' 돌출부는 2개의 뉴클레오시드를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 추가로 3' 돌출부를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 3' 돌출부는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 뉴클레오시드, 또는 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 3' 돌출부는 1, 2개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 3' 돌출부는 2개의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 추가로 5' 돌출부를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 5' 돌출부는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 뉴클레오시드, 또는 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 5' 돌출부는 1, 2개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 5' 돌출부는 2개의 뉴클레오시드를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 siRNA는 인간 표적 mRNA의 19mer와 결합한다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA의 12mer, 13mer, 14mer, 15mer, 16mer, 17mer, 18mer, 19mer, 20mer, 21mer, 22mer, 23mer, 24mer, 또는 25mer와 결합한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 siRNA는 비인간 영장류 표적 mRNA의 17mer와 결합한다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 비인간 영장류 표적 mRNA의 12mer, 13mer, 14mer, 15mer, 16mer, 17mer, 18mer, 19mer, 20mer, 21mer, 22mer, 23mer, 24mer, 또는 25mer와 결합한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 siRNA는 인간 표적 mRNA와 20개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 2개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 10개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 2개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 30개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 2개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 40개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 2개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 50개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 2개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 10개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 3개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 20개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 3개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 30개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 3개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 40개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 3개 이하의 불일치가 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA는 인간 표적 mRNA와 50개 이하의 인간 오프-타겟과 결합하며, 안티센스 가닥에서 3개 이하의 불일치가 있다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, siRNA는 SNP를 보유하지 않는 인간 표적 mRNA 표적 부위와 결합하며, 소수 대립유전자 빈도(MAF)는 1% 이상이다(pos. 2-18). 일부 실시 양태에서, MAF는 약 2%, 약 3%, 약 4%, 약 5%, 약 6%, 약 7%, 약 8%, 약 9%, 약 10%, 약 11%, 약 12%, 약 13%, 약 14%, 약 15%, 약 16%, 약 17%, 약 18%, 약 19%, 또는 약 20% 이상이다.
B. ASO
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 안티센스 올리고뉴클레오티드(ASO)를 포함한다. 일부 실시 양태에서, ASO는 길이가 12-30개의 뉴클레오시드이다. 일부 실시 양태에서, ASO는 길이가 14-30개의 뉴클레오시드이다. 일부 실시 양태에서, ASO는 길이가 적어도 약 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 또는 30개의 뉴클레오시드이거나, 상기 언급된 임의의 2개의 수로 정의된 범위이다. 일부 실시 양태에서, ASO는 길이가 15-25개의 뉴클레오시드이다. 일부 실시 양태에서, ASO는 길이가 20개의 뉴클레오시드이다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 길이가 약 12-30개의 뉴클레오시드인 ASO를 포함하고, 전체 길이의 인간 표적 mRNA 서열의 약 12-30개의 연속된 뉴클레오시드에 상보적인 뉴클레오시드 서열을 포함하며; (i) 올리고뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오시드 및/또는 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함하는 변형을 포함하고/하거나, (ii) 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함한다. 일부 실시 양태에서, ASO는 표적 mRNA의 적어도 약 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30개 이상의 연속된 뉴클레오시드에 상보적인 뉴클레오시드 서열을 포함한다.
C. 변형
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오시드 및/또는 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함하는 변형을 포함하고/하거나, (ii) 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오시드 및/또는 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함하는 변형을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드 간 결합은 알킬포스포네이트, 포스포로티오에이트, 메틸포스포네이트, 포스포로디티오에이트, 알킬포스포노티오에이트, 포스포아미데이트, 카바메이트, 카보네이트, 포스페이트 트리에스테르, 아세트아미데이트, 또는 카복시메틸 에스테르, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드 간 결합은 하나 이상의 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 포스포로티오에이트는 올리고뉴클레오티드의 포스페이트 골격에 있는 비가교 산소 원자를 포함할 수 있으며, 이는 황으로 대체된다. 변형된 뉴클레오시드 간 연결은 siRNA 또는 ASO에 포함될 수 있다. 변형된 뉴클레오시드 간 결합의 이점에는 독성 감소 또는 약동학 개선이 포함될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함하며, 올리고뉴클레오티드는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 또는 20개의 변형된 뉴클레오시드 간 결합 또는 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 18개 이하의 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 20개 이하의 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 2개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 3개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 4개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 5개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 6개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 7개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 8개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 9개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 10개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 11개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 12개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 13개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 14개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 15개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 16개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 17개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 18개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 19개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합, 또는 20개 이상의 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 잠금 핵산(LNA), 헥시톨 핵산(HLA), 시클로헥센 핵산(CeNA), 2'-메톡시에틸, 2'-O-알킬, 2'-O-알릴, 2'-플루오로, 또는 2'-데옥시, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 LNA를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2',4' 제약된 에틸 핵산을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 HLA를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 CeNA를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-메톡시에틸 기를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-알킬 기를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-메톡시에틸을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 메톡시에틸을 포함한다. 예를 들어, 센스 가닥의 위치 4는 2'-메톡시에틸 티민과 같은 메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-알릴 기를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-플루오로 기를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-데옥시 기를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-메틸 뉴클레오시드, 2'-데옥시플루오로 뉴클레오시드, 2'-O-N-메틸아세트아미도(2'-O-NMA) 뉴클레오시드, 2'-O-디메틸아미노에톡시에틸(2'-O-DMAEOE) 뉴클레오시드, 2'-O-아미노프로필(2'-O-AP) 뉴클레오시드, 또는 2'-아라-F, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-메틸 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-데옥시플루오로 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-NMA 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-DMAEOE 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-O-아미노프로필(2'-O-AP) 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2'-아라-F를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 하나 이상의 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 변형된 뉴클레오시드는 2' O-알킬 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 변형된 뉴클레오시드의 이점에는 독성 감소 또는 약동학 개선이 포함될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 또는 21개의 변형된 뉴클레오시드, 또는 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 19개 이하의 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 21개 이하의 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 2개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 3개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 4개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 5개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 6개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 7개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 8개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 9개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 10개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 11개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 12개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 13개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 14개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 15개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 16개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 17개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 18개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 19개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 20개 이상의 변형된 뉴클레오시드, 또는 21개 이상의 변형된 뉴클레오시드를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 올리고뉴클레오티드의 3' 또는 5' 말단에 부착된 모이어티를 포함한다. 모이어티의 예로는 소수성 모이어티 또는 당 모이어티, 또는 이들의 조합이 포함된다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥을 갖는 siRNA이고, 모이어티는 센스 가닥의 5' 말단에 부착된다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥을 갖는 siRNA이고, 모이어티는 센스 가닥의 3' 말단에 부착된다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 안티센스 가닥을 갖는 siRNA이고, 모이어티는 안티센스 가닥의 5' 말단에 부착된다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 안티센스 가닥을 갖는 siRNA이고, 모이어티는 안티센스 가닥의 3' 말단에 부착된다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 ASO이고, 모이어티는 ASO의 5' 말단에 부착된다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 ASO이고, 모이어티는 ASO의 3' 말단에 부착된다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 소수성 모이어티를 포함한다. 소수성 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드는 소수성 접합체를 포함하거나, 소수성 접합체로 지칭될 수 있다. 소수성 모이어티는 세포 흡수를 향상시키는 데 유용할 수 있다. 소수성 모이어티는 올리고뉴클레오티드의 3' 또는 5' 말단에 부착될 수 있다. 소수성 모이어티는 지방산과 같은 지질을 포함할 수 있다. 소수성 모이어티는 탄화수소를 포함할 수 있다. 탄화수소는 선형일 수 있다. 탄화수소는 비선형일 수 있다. 소수성 모이어티는 지질 모이어티 또는 콜레스테롤 모이어티, 또는 이들의 조합을 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 시클로헥사닐을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 지질을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 본원에 기재된 특정 형식으로 사용된다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 5' 말단에 포스포로티오에이트 기 또는 결합 없이 센스 가닥의 5' 말단에 부착된다. 소수성 모이어티는 에스테르화된 지질을 포함할 수 있다.
소수성 모이어티는 지질 모이어티이거나 지질 모이어티를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 올리고뉴클레오티드의 3' 또는 5' 말단에 부착된 지질을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질은 콜레스테롤, 미리스틸, 팔미틸, 스테아릴, 리토콜릴, 도코사닐, 도코사헥사에닐, 미리스틸, 팔미틸 스테아릴 또는 α-토코페릴, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질은 스테아롤, t-부틸페놀, n-부틸페놀, 옥틸페닐, 도데실페닐, 페닐 n-도데실, 옥타데실벤즈아미드, 헥사데실벤즈아미드, 또는 옥타데실시클로헥실을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질은 페닐 파라 C12를 포함한다. 지질 모이어티는 에스테르화될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 다음 구조의 임의의 측면을 포함한다: . 일부 실시 양태에서, R은 옥탄이 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 옥탄이 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 4-7개 또는 9-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 다음 구조의 임의의 측면을 포함한다: . 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 다음 구조의 임의의 측면을 포함한다: . 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 다음 구조의 임의의 측면을 포함한다: . 올리고뉴클레오티드에 포함된 측면은 표시된 구조 중 임의의 것의 전체 구조를 포함할 수 있거나 그의 지질 모이어티를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, n은 1-3이다. 일부 실시 양태에서, n은 1이다. 일부 실시 양태에서, n은 2이다. 일부 실시 양태에서, n은 3이다. 일부 실시 양태에서, R은 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 또는 20개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 또는 18개의 탄소를 함유하거나, 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 4-18개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, R은 옥탄(C8)이 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 C4-7 알킬이다. 일부 실시 양태에서, R은 C9-18 알킬이다. 일부 실시 양태에서, R은 C4-7 알킬 및 C9-18 알킬이다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 11개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 12개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 13개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 14개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 15개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 16개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 17개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 18개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, R은 옥탄(C8)이 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 분지형 탄소 사슬을 포함한다. 일부 실시 양태에서, R은 비분지형 탄소 사슬을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 알코올 또는 에테르를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 적어도 하나의 불포화 정도를 갖는다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 오메가-3, 오메가-5, 오메가-6, 오메가-7, 또는 오메가-9 지방산과 같은 오메가 지방산이다.
일부 실시 양태에서, 지질은 지방산을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질은 표 1에 도시된 지질을 포함한다. 표 1의 예시 지질 모이어티는 올리고뉴클레오티드의 5' 말단에 부착되어 도시되어 있으며, 올리고뉴클레오티드의 5' 말단 포스페이트가 지질 모이어티와 함께 도시되어 있다. 일부 실시 양태에서, 표 1의 지질 모이어티는 표시된 것과 다른 부착 지점에 부착될 수 있다. 예를 들어, 표의 임의의 지질 모이어티의 부착 지점은 3' 올리고뉴클레오티드 말단에 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 지질은 올리고뉴클레오티드를 간이 아닌 세포 또는 조직으로 표적화하는 데 사용된다.
[표 1]
일부 실시 양태에서, 지질 또는 지질 모이어티는 16 내지 18개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질은 16개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질은 17개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질은 18개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 16개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 17개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 18개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 19개의 탄소를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 20개의 탄소를 포함한다.
소수성 모이어티는 탄소환을 포함하는 링커를 포함할 수 있다. 탄소환은 6원자일 수 있다. 탄소환의 일부 예는 페닐 또는 시클로헥실을 포함한다. 링커는 페닐을 포함할 수 있다. 링커는 시클로헥실을 포함할 수 있다. 지질은 탄소환에 부착될 수 있으며, 탄소환은 올리고뉴클레오티드의 포스페이트(예를 들어, 5' 또는 3' 포스페이트)에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 지질 또는 탄화수소, 및 센스의 말단은 1,4; 1,3; 또는 1,2 치환 패턴(예를 들어, 파라, 메타 또는 오르토 페닐 배열)으로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질 또는 탄화수소, 및 센스의 말단은 1,4 치환 패턴(예를 들어, 파라 페닐 배열)으로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 오르토 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 파라 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 메타 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 1,4 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 1,3 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 1,2 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다.
지질 모이어티는 다음 구조를 포함하거나 이로 이루어질 수 있다: . 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함하거나 이로 이루어질 수 있다: . 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함하거나 이로 이루어질 수 있다: . 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함하거나 이로 이루어질 수 있다: . 일부 실시 양태에서, 점선은 공유 연결을 나타낸다. 공유 연결은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단 사이에 있을 수 있다. 예를 들어, 연결은 센스 가닥의 5' 말단에 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, n은 0-3이다. 일부 실시 양태에서, n은 1-3이다. 일부 실시 양태에서, n은 0이다. 일부 실시 양태에서, n은 1이다. 일부 실시 양태에서, n은 2이다. 일부 실시 양태에서, n은 3이다. 일부 실시 양태에서, n은 4이다. 일부 실시 양태에서, n은 5이다. 일부 실시 양태에서, n은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10이다. 일부 실시 양태에서, R은 분지형 탄소 사슬을 포함한다. 일부 실시 양태에서, R은 비분지형 탄소 사슬을 포함한다. 일부 실시 양태에서, R은 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 또는 20개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 또는 18개의 탄소를 함유하거나, 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 11개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 12개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 13개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 14개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 15개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 16개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 17개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 18개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기를 포함하거나 이로 이루어진다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 페닐옥틸 기가 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 옥탄이 아니다. 일부 실시 양태에서, R은 C4-7 알킬이다. 일부 실시 양태에서, R은 C9-18 알킬이다. 일부 실시 양태에서, R은 C4-7 알킬 및 C9-18 알킬이다. 일부 실시 양태에서, 지질 모이어티는 페닐옥틸 기가 아니다.
일부 실시 양태에서, 5' 소수성 모이어티는 다음 구조 중 어느 하나를 포함한다:
,, , 또는 , 여기서 점선은 센스 가닥의 5' 말단의 말단과의 공유 연결을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, R은 옥탄이 아니다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 4-7개 또는 9-18개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 14개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 15개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 16개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 17개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 18개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 5' 소수성 모이어티는 표 1의 소수성 모이어티를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 5' 소수성 모이어티는 페닐 파라 C12를 포함한다. 일부 실시 양태에서, n은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 또는 14이다. 일부 실시 양태에서, n은 0-3이다. 일부 실시 양태에서, n은 1-3이다. 일부 실시 양태에서, n은 1이다. 일부 실시 양태에서, n은 2이다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 알코올 또는 에테르를 포함한다. 일부 실시 양태에서, R은 불포화 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 불포화 알킬기는 단일 불포화일 수 있다. 일부 실시 양태에서, 불포화 알킬기는 오메가-3 위치, 오메가-4 위치, 오메가-5 위치, 오메가-6 위치, 오메가-7 위치, 오메가-8 위치, 오메가-9 위치, 또는 이들의 조합에서 불포화될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 5' 소수성 모이어티는 페닐옥틸 기가 아니다.
소수성 모이어티는 탄소환을 포함하는 링커를 포함할 수 있다. 탄소환은 6원자일 수 있다. 탄소환의 일부 예로는 페닐 또는 시클로헥실이 포함된다. 링커는 페닐을 포함할 수 있다. 링커는 시클로헥실을 포함할 수 있다. 지질은 탄소환에 부착될 수 있으며, 탄소환은 올리고뉴클레오티드의 포스페이트(예를 들어, 5' 또는 3' 포스페이트)에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 지질 또는 탄화수소 및 센스의 말단은 1,4; 1,3; 또는 1,2 치환 패턴(예를 들어, 파라, 메타 또는 오르토 페닐 배열)으로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 지질 또는 탄화수소 및 센스의 말단은 1,4 치환 패턴(예를 들어, 파라 페닐 배열)으로 페닐 또는 시클로헥실 링커에 연결된다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 오르토 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 파라 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 메타 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 1,4 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 1,3 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다. 지질은 올리고뉴클레오티드에 대해 1,2 방향으로 탄소환에 부착될 수 있다.
지질 모이어티는 올리고뉴클레오티드의 5' 말단에 부착될 수 있다. 5' 말단은 지질 모이어티를 올리고뉴클레오티드의 당의 5' 탄소에 연결하는 1개의 포스페이트를 가질 수 있다. 5' 말단은 지질 모이어티를 올리고뉴클레오티드의 당의 5' 탄소에 연결하는 2개의 포스페이트를 가질 수 있다. 5' 말단은 지질 모이어티를 올리고뉴클레오티드의 당의 5' 탄소에 연결하는 3개의 포스페이트를 가질 수 있다. 5' 말단은 올리고뉴클레오티드의 당의 5' 탄소에 연결된 1개 포스페이트를 가질 수 있으며, 여기서 1개 포스페이트는 지질 모이어티에 연결된다. 5' 말단은 올리고뉴클레오티드의 당의 5' 탄소에 연결된 2개의 포스페이트를 가질 수 있으며, 여기서 2개의 포스페이트 중 하나는 지질 모이어티에 연결된다. 5' 말단은 올리고뉴클레오티드의 당의 5' 탄소에 연결된 3개의 포스페이트를 가질 수 있으며, 여기서 3개의 포스페이트 중 하나는 지질 모이어티에 연결된다. 당은 리보스를 포함할 수 있다. 당은 데옥시리보스를 포함할 수 있다. 당은 2' 변형된 당(예를 들어, 2' O-메틸 또는 2' 플루오로 리보스)과 같이 변형될 수 있다. 5' 말단의 포스페이트는 산소 대신 황과 같은 변형을 포함할 수 있다. 5' 말단의 2개의 포스페이트는 산소 대신 황과 같은 변형을 포함할 수 있다. 5' 말단의 3개의 포스페이트는 산소 대신 황과 같은 변형을 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 d(pT-G-G-G-G-G)가 아니다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 1개의 지질 모이어티를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 2개의 지질 모이어티를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 3개의 지질 모이어티를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 4개의 지질 모이어티를 포함한다.
일부 실시 양태는 소수성 접합체를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 제조 방법에 관한 것이다. 소수성 접합체의 제조 전략에는 페놀 또는 시클로헥사놀과 같은 6원 고리 알코올을 기반으로 하는 포스포아미다이트 시약의 사용이 포함될 수 있다. 포스포아미다이트는 뉴클레오티드와 반응하여 뉴클레오티드를 소수성 모이어티에 연결함으로써 소수성 접합체를 생성할 수 있다. 소수성 접합체를 생성하는 데 사용될 수 있는 포스포아미다이트 시약의 일부 예는 다음과 같다: , , 또는 . 일부 실시 양태에서, n은 1-3이다. 일부 실시 양태에서, n은 1이다. 일부 실시 양태에서, n은 2이다. 일부 실시 양태에서, n은 3이다. 일부 실시 양태에서, R은 알킬기이다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 또는 20개의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, 알킬기는 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 또는 18개의 탄소를 함유하거나, 상기 언급된 수 중 임의의 2개로 정의된 범위의 탄소를 함유한다. 일부 실시 양태에서, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기를 포함하거나 이로 이루어진다. 포스포아미다이트 시약 중 어느 하나를 올리고뉴클레오티드의 5' 말단과 반응시켜 소수성 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드를 생성할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 포스포아미다이트 시약은 siRNA의 센스 가닥의 5' 말단과 반응된다. 그런 다음, 센스 가닥은 안티센스 가닥에 혼성화되어 이중체를 형성할 수 있다. 혼성화는 주어진 온도에서 용액에서 센스 및 안티센스 가닥을 인큐베이션하여 수행할 수 있다. 온도는 점진적으로 감소될 수 있다. 온도는 센스 및 안티센스 가닥에 대한 어닐링 온도를 포함하는 온도를 포함(comprise 또는 include)할 수 있다. 온도는 센스 및 안티센스 가닥에 대한 어닐링 온도보다 낮거나 낮은 온도를 포함할 수 있다. 온도는 센스 및 안티센스 가닥의 용융 온도보다 낮을 수 있다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 음전하 기를 포함한다. 음전하 기는 세포 또는 조직 침투를 도울 수 있다. 음전하 기는 올리고뉴클레오티드의 5' 또는 3' 말단(예를 들어, 5' 말단)에 부착될 수 있다. 이를 말단 기라고 할 수 있다. 말단 기는 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트, 비닐포스포네이트, 메틸포스포네이트, 시클로프로필 포스포네이트, 또는 데옥시-C-말로닐일 수 있거나 이를 포함할 수 있다. 말단 기는 추가 5' 포스페이트, 예를 들어 추가 5' 포스페이트를 포함할 수 있다. 말단 기의 조합이 사용될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 포스페이트 모방체를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 포스페이트 모방체는 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 비닐 포스포네이트는 트랜스-비닐포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 비닐 포스포네이트는 시스-비닐포스포네이트를 포함한다. 비닐 포스포네이트를 포함하는 뉴클레오티드의 예는 아래에 나타낸다.
5' 비닐포스포네이트 2' O 메틸 우리딘
일부 실시 양태에서, 비닐 포스포네이트는 올리고뉴클레오티드의 안정성을 증가시킨다. 일부 실시 양태에서, 비닐 포스포네이트는 조직에서 올리고뉴클레오티드의 축적을 증가시킨다. 일부 실시 양태에서, 비닐 포스포네이트는 올리고뉴클레오티드를 엑소뉴클레아제 또는 포스파타제로부터 보호한다. 일부 실시 양태에서, 비닐 포스포네이트는 올리고뉴클레오티드와 siRNA 처리 기구의 결합 친화도를 개선한다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 1개의 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 2개의 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 3개의 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 4개의 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 안티센스 가닥은 5' 말단에 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 안티센스 가닥은 3' 말단에 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 센스 가닥은 5' 말단에 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 센스 가닥은 3' 말단에 비닐 포스포네이트를 포함한다.
올리고뉴클레오티드는 퓨린을 포함할 수 있다. 퓨린의 예로는 아데닌(A) 또는 구아닌(G), 또는 이들의 변형된 버전이 포함된다. 올리고뉴클레오티드는 피리미딘을 포함할 수 있다. 피리미딘의 예로는 시토신(C), 티민(T), 또는 우라실(U), 또는 이들의 변형된 버전이 포함된다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 2'-O-메틸은 2' O-메틸을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 올리고뉴클레오티드의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 위치 5와 11 사이의 1, 2, 3, 4 또는 5개의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하되, 단 한 줄에 3개의 2' 플루오로 변형된 피리미딘이 존재하지 않는다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드와 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고; 센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고; 위치 5와 11 사이의 1, 2, 3, 4 또는 5개의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하되, 단, 한 줄에 3개의 2' 플루오로 변형된 피리미딘이 존재하지 않고; 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함하고; 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드와 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 위치 5와 11 사이의 1, 2, 3, 4 또는 5개의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하되, 단, 한 줄에 3개의 2' 플루오로 변형된 퓨린이 존재하지 않는다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드와 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고; 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고; 위치 5와 11 사이의 1, 2, 3, 4 또는 5개의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하되, 단, 한 줄에 3개의 2' 플루오로 변형된 퓨린이 존재하지 않고; 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함하고; 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드와 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 한 줄에 3개의 2' 플루오로 변형된 퓨린이 존재하지 않는다. 일부 실시 양태에서, 한 줄에 3개의 2' 플루오로 변형된 피리미딘이 존재하지 않는다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 5, 7, 및 8은 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린 또는 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드와 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함하고; 센스 가닥의 위치 5, 7, 및 8은 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드를 포함하고; 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린 또는 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고; 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함하고; 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드와 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 5, 7, 및 8은 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘 또는 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드 및 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 위치 9는 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함하고; 센스 가닥의 위치 5, 7, 및 8은 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드를 포함하고; 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 위치 10 내지 21의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘 또는 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고; 안티센스 가닥의 홀수 위치는 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오티드를 포함하고; 안티센스 가닥의 짝수 위치는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오티드와 변형되지 않은 데옥시리보뉴클레오티드를 포함한다.
본원에 기재된 변형은 세포 또는 조직으로의 전달, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 조성물의 간 외 전달 또는 표적화에 유용할 수 있다. 본원에 기재된 변형은 올리고뉴클레오티드 조성물을 세포 또는 조직으로 표적화하는 데 유용할 수 있다.
1. 변형된 siRNA
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 핵산의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 센스 가닥은 변형 패턴 1S: 5'-NfsnNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNfsnsn-3'를 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 2S: 5'-NfsnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfsnsn-3'를 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 3S: 5'-NfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 4S: 5'-NfsnsNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNfsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 5S: 5'- nnnnnnNfnNfnnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 6S: 5'- nnnnnnnNfNfNfNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 7S: 5'- nnnnNfnnnNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 8S: 5'- nnnnnnnNfNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 9S: 5'- nnnnnnNfNfNfNfNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 10S: 5'- nnnnNfnNfNfNfNfnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 11S: 5'- nnnnnNfNfNfNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 12S: 5'- nnnnnNfNfNfNfnnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 13S: 5'- nnnnNfNfNfNfNfnnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 14S: 5'- nnnnnnnnNfNfnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 15S: 5'- nnnnnnNfNfNfNfnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 16S: 5'- nnnnNfNfnnNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'를 포함하며, 여기서 “Nf”는 2’ 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, “n”은 2’ O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, “s”는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 17S: 5'- nnnnNfnNfnNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 “Nf”는 2’ 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, “n”은 2’ O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, “s”는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 18S: 5' nnnnnNfnnNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 19S: 5'- nnnnnNfNfnNfnnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 20S: 5'- nnnnnnNfnNfNfnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 21S: 5'- nNfnNfnNfnNfNfnnnnnNfnNfNfnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 22S: 5'- snnnnnNfNfNfNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 23S: 5'- snnnnnNfNfNfNfnnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 24S: 5'- snnnnNfNfNfNfNfnnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하는데, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 25S: 5'- snnnnnnnnNfNfnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 26S: 5'- snnnnNfNfnnNfnNfnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 27S: 5'-snNfnNfnNfnNfNfnnnnnNfnNfNfnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 28S: 5'- NfnNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNfsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 29S: 5'- nnNfnNfnNfnNfnNfnNfnnnNfnNfsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 30S: 5'-nnnnnNfNfNfNfNfnnnnnnnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이고, N은 하나 이상의 뉴클레오시드를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 mRNA의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 안티센스 가닥은 변형 패턴 1AS: 5'-nsNfsnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 변형 패턴 2AS: 5'-nsNfsnNfnNfnNfnNfnnnNfnNfnNfnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 변형 패턴 3AS: 5'- nsnsnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 변형 패턴 4AS: 5'- nsNfsnnnNfnNfnnnnnNfnNfnnnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 변형 패턴 5AS: 5'-nsNfsnnnNfnNfnNfnNfnNfnNfnNfnsnsn-3'을 포함하며, 여기서 "Nf"는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드이고, "n"은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드이고, "s"는 포스포로티오에이트 결합이다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 핵산의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 센스 가닥은 패턴 1S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 2S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 3S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 4S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 5S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 6S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 7S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 8S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 9S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 10S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 11S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 12S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 13S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 14S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 15S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 16S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 17S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 18S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 19S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 20S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 21S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 22S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 23S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 24S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 25S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 26S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 27S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 28S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 29S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 30S를 포함하고 안티센스 가닥은 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 29S, 또는 30S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 1AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 29S, 또는 30S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 2AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 29S, 또는 30S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 3AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 29S, 또는 30S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 4AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 29S, 또는 30S를 포함하고 안티센스 가닥은 패턴 5AS를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 변형 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 또는 4AS를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥 또는 안티센스 가닥은 변형 패턴 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5S를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 변형 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 또는 29S를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥 또는 안티센스 가닥은 변형 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 29S, 또는 30AS를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥의 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 안티센스 가닥의 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함한다.
일부 실시 양태에서, siRNA는 센스 가닥, 안티센스 가닥, 및 센스 또는 안티센스 가닥의 말단에 연결된 지질 모이어티를 포함하며; 여기서 지질 모이어티는 페닐 또는 시클로헥사닐 링커를 포함하며, 여기서 링커는 지질과 센스 또는 안티센스 가닥의 말단에 연결된다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함함. 일부 실시 양태에서, siRNA는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하며; 여기서 안티센스 가닥은 비닐 포스포네이트와 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥은 소수성 모이어티를 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며; 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하며: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함; 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함, 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 데옥시 뉴클레오시드는 센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 9에 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 센스 가닥의 데옥시 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 데옥시 뉴클레오시드는 안티센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 9에 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 안티센스 가닥의 데옥시 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하되; 단, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 데옥시 뉴클레오시드는 센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 9에 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 센스 가닥의 데옥시 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 4에 있을 수 있다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 2'-O-메톡시에틸 티민 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 센스 가닥의 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 데옥시 뉴클레오시드는 안티센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 9에 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 안티센스 가닥의 데옥시 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 4에 있을 수 있다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 2'-O-메톡시에틸 티민 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 안티센스 가닥의 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나, 센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하되; 단, 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하되; 단, 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 4에 있을 수 있다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 2'-O-메톡시에틸 티민 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 센스 가닥의 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함함; 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함함; 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함함; 또는 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함함; 단, 상기의 어느 것에서나, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드 또는 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 피리미딘의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린은 2'-O-메틸 변형된 퓨린을 포함하고, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2' 플루오로 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 퓨린의 혼합물을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘은 2'-O-메틸 변형된 피리미딘을 포함하고, 모든 퓨린은 2' 플루오로 변형된 퓨린을 포함하되; 단, 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드가 포함될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 센스 가닥의 뉴클레오시드 위치 4에 있을 수 있다. 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 2'-O-메톡시에틸 티민 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 안티센스 가닥의 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드는 그 외에는 변형되지 않을 수 있다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하나, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하되, 단, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2’-O-메틸을 포함하되, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 일부 실시 양태는 센스 가닥이 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드(예를 들어, 5'에서 3'으로 세어 위치 4에서)를 포함할 수 있다는 조건을 포함한다. 일부 실시 양태는 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태는 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함한다. 일부 실시 양태는 센스 가닥이 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드(예를 들어, 5'에서 3'으로 세어 위치 4에서)를 포함할 수 있다는 조건을 포함한다. 일부 실시 양태는 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태는 센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하나, 단, 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단, 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단, 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하되, 단 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형되되, 단, 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하되, 단, 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는다. 일부 실시 양태는 안티센스 가닥이 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드(예를 들어, 5'에서 3'으로 세어 위치 4에서)를 포함할 수 있다는 조건을 포함한다. 일부 실시 양태는 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태는 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립한다: 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형된다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥에서, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함한다. 일부 실시 양태는 안티센스 가닥이 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드(예를 들어, 5'에서 3'으로 세어 위치 4에서)를 포함할 수 있다는 조건을 포함한다. 일부 실시 양태는 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태는 안티센스 가닥에 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오시드를 포함하지 않는다.
일부 실시 양태에 있어서, 안티센스 가닥은 1개 또는 2개의 3' 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 예를 들어, 안티센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째와 두 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트 결합이 있을 수 있거나, 안티센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트 결합이 있을 수 있다. 일부 실시 양태에 있어서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 예를 들어, 센스 가닥의 5' 말단으로부터 첫 번째와 두 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트 결합이 있을 수 있거나, 센스 가닥의 5' 말단으로부터 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트 결합이 있을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함하지 않는다. 예를 들어, 일부 실시 양태에서, 센스 가닥의 5' 말단에 있는 마지막 3개의 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트 결합이 없다. 일부 실시 양태에서는 센스 가닥은 5' 포스페이트 결합을 포함한다. 일부 실시 양태에서는 센스 가닥은 1개 또는 2개의 3' 포스포로티오에이트 결합을 포함한다. 예를 들어, 센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째와 두 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트 결합이 있을 수 있거나, 센스 가닥의 3' 말단으로부터 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 뉴클레오티드 사이에 포스포로티오에이트 결합이 있을 수 있다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 5' 말단을 포함한다. 5' 말단은 2개의 포스포로티오에이트 결합으로 분리된 3개의 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함한다. 3' 말단은 2개의 포스포로티오에이트 결합으로 분리된 3개의 뉴클레오시드를 포함할 수 있다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 핵산의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 소수성 모이어티를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 센스 가닥의 5' 말단에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 센스 가닥의 3' 말단에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 안티센스 가닥의 5' 말단에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 소수성 모이어티는 안티센스 가닥의 3' 말단에 부착될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 핵산의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 siRNA를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 비닐 포스포네이트를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 하나 이상의 비닐 포스포네이트는 센스 가닥의 5' 말단에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 하나 이상의 비닐 포스포네이트는 센스 가닥의 3' 말단에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 하나 이상의 비닐 포스포네이트는 안티센스 가닥의 5' 말단에 부착될 수 있다. 일부 실시 양태에서, 하나 이상의 비닐 포스포네이트는 안티센스 가닥의 3' 말단에 부착될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 RNA 또는 변형된 RNA 뉴클레오티드를 포함하거나 이로 이루어진다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 데옥시 뉴클레오시드는 DNA 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 데옥시 뉴클레오시드는 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하거나 이로 이루어진다. 데옥시 뉴클레오시드는 센스 가닥 내의 위치(5'에서 3'으로, 여기서 5' 위치는 1임)에 있을 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 2, 4, 6, 8, 9, 10, 12, 14, 16, 또는 18, 또는 상기 위치의 조합일 수 있거나 이를 포함할 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 또는 18, 또는, 상기 위치의 조합일 수 있거나 이를 포함할 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 2, 6, 9, 10, 14, 또는 18이거나, 상기 위치의 조합일 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 2, 6, 10, 14, 또는 18, 또는 상기 위치의 조합일 수 있거나 이를 포함할 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 4, 8, 9, 12, 또는 16, 또는 상기 위치의 조합일 수 있거나, 이를 포함할 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 4, 8, 12, 또는 16, 또는 상기 위치의 조합일 수 있거나 이를 포함할 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 9를 포함할 수 있다. 센스 가닥 내의 위치는 위치 9일 수 있다. 센스 가닥은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 또는 19개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥은 1개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 센스 가닥은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 또는 19개의 데옥시 뉴클레오시드, 또는 상기 언급된 수 중 임의의 두 수의 데옥시 뉴클레오시드로 정의된 범위의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 모든 짝수 위치에 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 일부 짝수 위치에 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 나머지 모든 짝수 위치에 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 1개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 1개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 2개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 3개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 4개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 5개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 6개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 7개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 8개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 9개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최소 10개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 2개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 3개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 4개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 5개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 6개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 7개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 8개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥은 최대 9개의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 센스 가닥에는 최대 10개의 데옥시 뉴클레오시드가 포함될 수 있다.
일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 RNA 또는 변형된 RNA 뉴클레오티드를 포함하거나 이로 이루어진다. 일부 실시 양태에서, 안티센스 가닥은 데옥시 뉴클레오시드를 포함한다. 데옥시 뉴클레오시드는 DNA 뉴클레오시드를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 데옥시 뉴클레오시드는 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하거나 이로 이루어진다. 안티센스 가닥은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 또는 19개의 데옥시 뉴클레오시드, 또는 상기 언급된 수 중 임의의 두 수의 데옥시 뉴클레오시드로 정의된 범위의 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있다.
센스 가닥에 (예를 들어, 5' 말단으로부터 세어서 9번째 뉴클레오티드에) 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 일부 실시 양태에서, 위치 1-8의 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드의 혼합물을 포함한다. 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 일부 실시 양태에서, 위치 1-8의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드의 혼합물을 포함한다. 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 일부 실시 양태에서, 위치 1-8의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드의 혼합물을 포함한다. 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 일부 실시 양태에서, 위치 1-8의 뉴클레오시드는 모두 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 경우, 위치 1-8의 퓨린은 모두 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 일부 실시 양태에서, 위치 1-8의 피리미딘은 모두 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 일부 실시 양태에서, 위치 1-8의 퓨린은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드의 혼합물을 포함하고, 위치 1-8의 피리미딘은 모두 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드를 포함한다. 센스 가닥에 데옥시 뉴클레오시드가 포함되는 일부 실시 양태에서, 위치 1-8의 피리미딘은 2' 플루오로 및 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드의 혼합물을 포함하고, 위치 1-8의 퓨린은 모두 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드를 포함한다.
안티센스 가닥은 짝수 번호의 뉴클레오시드가 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드를 포함하고 홀수 번호의 뉴클레오시드가 2'-O-메틸 변형된 뉴클레오시드를 포함하는 교대 패턴으로 시작할 수 있다. 그런 다음 센스 가닥은 일부 2' 플루오로 변형을 2'-O-메틸 변형으로 대체하여 최적화될 수 있다. 안티센스 가닥은 2' 플루오로 변형과 2'-O-메틸 변형의 혼합물을 포함할 수 있다.
2. 변형된 ASO
일부 실시 양태에서, 조성물은 표적 핵산의 발현을 억제하는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 올리고뉴클레오티드는 안티센스 올리고뉴클레오티드(ASO)를 포함한다. 일부 실시 양태에서, ASO는 변형 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 1AS, 또는 2AS, 또는 본원에서 기재된 변형의 임의의 다른 조합을 포함한다. 일부 실시 양태에서, ASO는 변형 패턴 1S, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S, 7S, 8S, 9S, 10S, 11S, 12S, 13S, 14S, 15S, 16S, 17S, 18S, 19S, 20S, 21S, 22S, 23S, 24S, 25S, 26S, 27S, 28S, 29S, 30S, 1AS, 2AS, 3AS, 4AS, 또는 5AS를 포함한다.
D. 제제
일부 실시 양태에서, 조성물은 약학 조성물이다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 멸균된다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 추가로 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 약학적으로 허용 가능한 담체는 물을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 약학적으로 허용 가능한 담체는 완충액을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 약학적으로 허용 가능한 담체는 식염수를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 약학적으로 허용 가능한 담체는 물, 완충액 또는 식염수를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 리포좀을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 약학적으로 허용 가능한 담체는 리포좀, 지질, 나노입자, 단백질, 단백질-항체 복합체, 펩티드, 셀룰로오스, 나노겔 또는 이들의 조합을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 혈액 뇌 장벽을 통과하도록 제제화된다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 중추 신경계(CNS) 전달을 위해 제제화된다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 친유성 화합물을 포함한다. 친유성 화합물은 혈액 뇌 장벽을 통과하거나 CNS 전달에 유용할 수 있다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 투여를 위해 제제화된다. 투여는 전신적일 수 있다. 일부 실시 양태에서, 투여는 정맥 내이다. 일부 실시 양태에서, 투여는 주사에 의한다. 일부 실시 양태에서, 주사는 피하이다. 일부 실시 양태에서, 주사는 피하이다. 일부 실시 양태에서, 주사는 복강 내이다. 일부 실시 양태에서, 주사는 근육 내이다. 일부 실시 양태에서, 주사는 척수강 내이다. 투여는 눈(예를 들어, 유리체 내)에 이루어질 수 있다. 투여는 신경 조직에 이루어질 수 있다. 투여는 뇌에 이루어질 수 있다. 투여는 뇌실 내일 수 있다. 투여는 척수강 내일 수 있다. 투여는 척수 또는 척추관에 이루어질 수 있다. 일부 실시 양태에서, 제제는 올리고뉴클레오티드와 같은 화합물을 눈 세포에 전달할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 제제는 올리고뉴클레오티드와 같은 화합물을 신경 세포에 전달할 수 있다.
B. 키트
본원에서, 일부 실시 양태에서, 키트가 기재된다. 키트는 본원에 기재된 siRNA와 같은 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드는 지질 모이어티에 접합될 수 있다. 키트는 본원에 기재된 지질 모이어티를 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오시드 변형 또는 변형된 뉴클레오시드 간 결합을 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드는 염기 서열로부터의 변형과 같은 본원에 기재된 임의의 변형을 포함할 수 있다. 키트는 전달 시약, 예컨대 바늘을 포함할 수 있다. 키트는 본원에 기재된 방법에서 사용하기 위한 방법과 같은 사용 설명서를 포함할 수 있다.
II. 방법 및 용도
본원에서, 일부 실시 양태에서, 본원에 기재된 조성물을 대상체에게 투여하는 방법이 개시된다. 일부 실시 양태는 본원에 기재된 조성물의 용도, 예를 들어 조성물을 대상체에게 투여하는 것에 관한 것이다.
일부 실시 양태는 장애의 치료를 필요로 하는 대상체에서 장애를 치료하는 방법에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 치료 방법에 있어 본원에 기재된 조성물의 용도에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애가 있는 대상체에게 본원에 기재된 조성물을 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 투여는 대상체에서 장애를 치료한다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 대상체에 장애를 치료한다.
일부 실시 양태에서, 치료는 대상체에서 장애의 예방, 억제, 또는 역전을 포함한다. 일부 실시 양태는 장애를 예방, 억제, 또는 역전시키는 방법에 있어 본원에 기재된 조성물의 용도에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애의 예방, 억제, 또는 역전을 필요로 하는 대상체에서 장애를 예방, 억제 또는 역전시키는 방법에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애가 있는 대상체에게 본원에 기재된 조성물을 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 투여는 대상체에서 장애를 예방, 억제, 또는 역전시킨다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 대상체에서 장애를 예방, 억제, 또는 역전시킨다.
일부 실시 양태는 장애의 예방을 필요로 하는 대상체에서 장애를 예방하는 방법에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애를 예방하는 방법에 있어 본원에 기재된 조성물의 용도에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애가 있는 대상체에게 본원에 기재된 조성물을 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 투여는 대상체에서 장애를 예방한다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 대상체에서 장애를 예방한다.
일부 실시 양태는 장애의 억제를 필요로 하는 대상체에서 장애를 억제하는 방법에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애를 억제하는 방법에 있어 본원에 기재된 조성물의 용도에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애가 있는 대상체에게 본원에 기재된 조성물을 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 투여는 대상체에서 장애를 억제한다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 대상체에서 장애를 억제한다.
일부 실시 양태는 장애의 역전을 필요로 하는 대상체의 장애를 역전시키는 방법에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애를 역전시키는 방법에 있어 본원에 기재된 조성물의 용도에 관한 것이다. 일부 실시 양태는 장애가 있는 대상체에게 본원에 기재된 조성물을 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 투여는 대상체에서 장애를 역전시킨다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 대상체에서 장애를 역전시킨다.
일부 실시 양태에서, 투여는 전신적이다. 일부 실시 양태에서, 투여는 정맥 내이다. 일부 실시 양태에서, 투여는 주사에 의한다. 일부 실시 양태에서, 주사는 피하이다. 일부 실시 양태에서, 주사는 피하이다. 일부 실시 양태에서, 주사는 복강 내이다. 일부 실시 양태에서, 주사는 근육 내이다. 투여는 눈(예를 들어, 유리체 내)에 이루어질 수 있다. 투여는 신경 조직에 이루어질 수 있다. 투여는 뇌에 이루어질 수 있다. 투여는 뇌실 내일 수 있다. 일부 실시 양태에서, 주사는 척수강 내이다. 투여는 척수강 내일 수 있다. 투여는 척수 또는 척추관에 이루어질 수 있다.
본원에서, 일부 실시 양태에서, siRNA를 세포 또는 조직에 표적화하는 방법으로서, siRNA(예를 들어, siRNA의 센스 가닥)를 본원에 기재된 지질 모이어티에 접합시키는 단계를 포함하는 방법이 개시된다. 방법은 지질 모이어티에 접합된 siRNA를 조직 또는 세포에 전달하는 단계를 포함할 수 있다. 방법은 조직 또는 세포를 지질 모이어티에 접합된 siRNA와 접촉시키는 단계를 포함할 수 있다.
본원에서, 일부 실시 양태에서, 세포 또는 조직에서 표적 RNA 또는 단백질의 양을 감소시키는 방법으로서, 본원에 기재된 조성물을 세포 또는 조직에 투여 또는 전달하는 단계를 포함하는 방법이 개시된다. 조성물은 RNA에 상보적인 서열을 갖는 안티센스 가닥을 갖는 siRNA를 포함할 수 있다. 안티센스 가닥은 RNA에 결합할 수 있다.
본원에서, 일부 실시 양태에서, siRNA 조성물의 제조 방법이 개시된다. 이 방법은 siRNA를 지질 모이어티에 접합시키는 단계를 포함할 수 있다. siRNA와 지질 모이어티는 본원에 기재된 임의의 siRNA 또는 지질 모이어티를 포함할 수 있다. 방법은 siRNA를 합성하는 단계를 포함할 수 있다. 방법은 지질 모이어티를 합성하는 단계를 포함할 수 있다.
A. 장애
본원에 기재된 방법의 일부 실시 양태는 장애의 치료를 필요로 하는 대상체에서 장애를 치료하는 것을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 장애는 눈 장애이다. 일부 실시 양태에서, 장애는 지방 관련 장애이다. 일부 실시 양태에서, 장애는 신장 장애이다. 일부 실시 양태에서, 장애는 뇌 장애이다. 일부 실시 양태에서, 장애는 혈관 장애이다. 일부 실시 양태에서, 장애는 근육 장애이다. 일부 실시 양태에서, 장애는 폐 장애이다.
B. 대상체
본원에 기재된 방법의 일부 실시 양태는 대상체의 치료를 포함한다. 대상체의 비제한적 예는 척추동물, 동물, 포유류, 개, 고양이, 소, 설치류, 마우스, 래트, 영장류, 원숭이, 및 인간을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 척추동물이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 동물이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 포유류이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 개이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 고양이이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 소이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 마우스이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 래트이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 영장류이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 원숭이이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 동물, 포유류, 개, 고양이, 소, 설치류, 마우스, 래트, 영장류, 또는 원숭이이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 인간이다.
일부 실시 양태에서, 대상체는 남성이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 여성이다. 일부 실시 양태에서, 대상체는 성인(예를 들어, 18세 이상)이다.
E. 기준선 측정치
본원에 기재된 방법의 일부 실시 양태는 대상체로부터 기준선 측정치를 얻는 단계를 포함한다. 예를 들어, 일부 실시 양태에 있어서, 기준선 측정치는 대상체를 치료하기 전에 대상체로부터 얻는다.
일부 실시 양태에 있어서, 기준선 측정치는 대상체로부터 직접 얻는다. 일부 실시 양태에 있어서, 기준선 측정치는 관찰, 예를 들어 대상체 또는 대상체의 조직의 관찰에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에 있어서, 기준선 측정치는 영상 장치를 사용하여 비침습적으로 얻는다.
일부 실시 양태에서, 기준선 측정치는 대상체의 샘플로부터 얻는다. 일부 실시 양태에 있어서, 기준선 측정치는 하나 이상의 조직학적 조직 절편으로부터 얻는다. 일부 실시 양태에서, 기준선 측정치는 대상체로부터 얻은 샘플에 대해 면역 분석, 비색 분석, 또는 형광 분석과 같은 분석을 수행함으로써 얻는다. 일부 실시 양태에 있어서, 기준선 측정치는 면역 분석, 비색 분석, 형광 분석, 또는 크로마토그래피(예를 들어, HPLC) 분석에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, 기준선 측정치는 PCR에 의해 얻는다.
일부 실시 양태에서, 기준선 측정치는 기준선 표적 단백질 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 단백질 측정치는 기준선 표적 단백질 수준을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 단백질 수준은 샘플 중량당 표적 단백질의 질량 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 단백질 수준은 샘플 부피당 표적 단백질의 질량 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 단백질 수준은 샘플 내 총 단백질당 표적 단백질의 질량 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 단백질 측정치는 기준선 순환/조직 표적 단백질 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 단백질 측정치는 면역 분석, 비색 분석, 또는 형광 분석과 같은 분석에 의해 얻는다.
일부 실시 양태에서, 기준선 측정치는 기준선 표적 mRNA 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 측정치는 기준선 표적 mRNA 수준을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 수준은 샘플 중량당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 수준은 샘플 부피당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 수준은 샘플 내 총 mRNA당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 수준은 샘플 내 총 핵산당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 수준은 샘플 내 항존 유전자의 mRNA 수준과 같은 다른 mRNA 수준과 비교하여 표시된다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 측정치는 기준선 조직 표적 mRNA 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 기준선 표적 mRNA 측정치는 중합효소 연쇄 반응(PCR) 분석과 같은 분석에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, PCR은 정량적 PCR(qPCR)을 포함한다. 일부 실시 양태에서, PCR은 표적 mRNA의 역전사를 포함한다.
본원에서 기재된 방법의 일부 실시 양태는 대상체로부터 샘플을 얻는 단계를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 기준선 측정치는 대상체로부터 얻은 샘플에서 얻는다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 본원에 기재된 조성물로 대상체를 투여하거나 치료하기 전에 대상체로부터 얻는다. 일부 실시 양태에서, 기준선 측정치는 조성물을 대상체에게 투여하기 전에 대상체로부터 얻은 샘플에서 얻는다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 공복 상태의 대상체로부터 얻는다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 밤새 공복 기간 후에 대상체로부터 얻는다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 식이 섭취 상태의 대상체로부터 얻는다.
일부 실시 양태에서, 샘플은 체액을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 체액 샘플이다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 혈액, 혈장, 또는 혈청 샘플이다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 혈액을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 혈액 샘플이다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 전혈 샘플이다. 일부 실시 양태에서, 혈액은 분획되거나 원심분리된다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 혈장을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 혈장 샘플이다. 혈액 샘플은 혈장 샘플일 수 있다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 혈청을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 혈청 샘플이다. 혈액 샘플은 혈청 샘플일 수 있다. 일부 실시 양태에서, 유체는 뇌척수액(CSF)을 포함한다. 예를 들어, 체액은 척추 천자에 의해 얻을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 체액은 척수액을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 체액은 뇌액을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 체액은 뇌액을 포함한다.
일부 실시 양태에서, 샘플은 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 조직 샘플이다. 일부 실시 양태에서, 조직은 눈, 신장, 근육, 지방, 뇌, 폐, 또는 혈관 조직을 포함한다. 예를 들어, 기준선 표적 mRNA 측정치, 또는 기준선 표적 단백질 측정치는 환자로부터 얻은 신장, 지방, 뇌, 폐, 또는 혈관 샘플에서 얻을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조직은 신장 조직을 포함한다. 신장 조직은 신수질 세포, 또는 신 근위 세관 세포를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조직은 지방 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 지방 조직은 백색 지방 조직을 포함한다. 지방 조직은 지방세포를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조직은 간 조직을 포함한다. 간은 간세포를 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조직은 간이 아닌 조직이다. 일부 실시 양태에서, 조직은 눈 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 눈 조직은 망막 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조직은 뇌 조직을 포함한다. 뇌 조직은 뉴런 또는 신경교세포를 포함할 수 있다. 뇌 조직은 소뇌를 포함할 수 있다. 뇌 조직은 전두엽 피질을 포함할 수 있다. 뇌 조직은 측두엽 피질을 포함할 수 있다. 뇌 조직은 뇌의 우반구로부터의 조직(예를 들어, 우전두엽 피질 또는 우측두엽 피질)을 포함할 수 있다. 뇌 조직은 뇌의 좌반구로부터의 조직(예를 들어, 좌전두엽 피질 또는 좌측두엽 피질)을 포함할 수 있다. 뇌 조직은 해마 조직을 포함할 수 있다. 일부 실시 양태에서, 조직은 신경 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조직은 신경을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조직은 척추 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조직은 척수 또는 척추관의 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조직은 폐 조직을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 조직은 혈관 조직을 포함한다. 혈관 조직은 혈관 내피 세포를 포함할 수 있다.
일부 실시 양태에서, 샘플은 세포들을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 샘플은 세포를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 세포는 눈 세포, 신장 세포, 근육 세포, 지방 세포, 뇌 세포, 또는 혈관 세포를 포함한다. 일부 실시 양태에서, 세포는 신장 세포이다. 일부 실시 양태에서, 신장 세포는 신장 수질 세포이다. 일부 실시 양태에서, 신장 세포는 신장 근위 세관 세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 지방 세포이다. 일부 실시 양태에서, 지방 세포는 지방세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 간 세포이다. 일부 실시 양태에서, 간 세포는 간세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 간이 아닌 세포이거나 간세포가 아니다. 일부 실시 양태에서, 세포는 눈 세포이다. 일부 실시 양태에서, 눈 세포는 망막 세포이다. 일부 실시 양태에서, 눈 세포는 간상 세포이다. 일부 실시 양태에서, 눈 세포는 원추 세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 뇌 세포이다. 일부 실시 양태에서, 뇌 세포는 소뇌, 피질, 해마 조직과 같은 뇌 조직에서 유래한다. 일부 실시 양태에서, 뇌 세포는 뉴런이다. 일부 실시 양태에서, 뇌 세포는 신경교세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 척추 세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 척수 세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 폐 세포이다. 일부 실시 양태에서, 세포는 혈관 세포이다. 일부 실시 양태에서, 혈관 세포는 내피 세포이다.
F. 효과
일부 실시 양태에서, 조성물 또는 조성물의 투여는 기준선 측정치에 비해 표적 단백질 측정치 또는 표적 mRNA 측정치와 같은 측정치에 영향을 미친다.
본원에 기재된 방법의 일부 실시 양태에는 대상체로부터 측정치를 얻는 단계가 포함된다. 예를 들어, 측정치는 대상체를 치료한 후 대상체로부터 얻을 수 있다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 조성물이 대상체에게 투여된 후 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플(예를 들어, 본원에 기재된 체액 또는 조직 샘플)에서 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 장애가 치료되었다는 표시이다.
일부 실시 양태에서, 측정치는 대상체로부터 직접 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 영상 장치를 사용하여 비침습적으로 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플에서 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 하나 이상의 조직학적 조직 절편에서 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플에 대해 분석을 수행하여 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 본원에서 기재된 분석과 같은 분석에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, 분석은 면역 분석, 비색 분석, 형광 분석, 크로마토그래피(예를 들어, HPLC) 분석, 또는 PCR 분석이다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 면역 분석, 비색 분석, 형광 분석, 또는 크로마토그래피(예를 들어, HPLC) 분석과 같은 분석에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 PCR에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 조직학에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 관찰에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, 추가 측정은 예를 들어 3번째 샘플, 4번째 샘플, 또는 5번째 샘플에서 이루어진다.
일부 실시 양태에서, 측정치는 조성물 투여 후 1시간 이내, 2시간 이내, 3시간 이내, 4시간 이내, 5시간 이내, 6시간 이내, 12시간 이내, 18시간 이내, 또는 24시간 이내에 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 조성물 투여 후 1일 이내, 2일 이내, 3일 이내, 4일 이내, 5일 이내, 6일 이내, 또는 7일 이내에 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 조성물 투여 후 1주일 이내, 2주일 이내, 3주일 이내, 1개월 이내, 2개월 이내, 3개월 이내, 6개월 이내, 1년 이내, 2년 이내, 3년 이내, 4년 이내, 또는 5년 이내에 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 조성물 투여 후 1시간 후, 2시간 후, 3시간 후, 4시간 후, 5시간 후, 6시간 후, 12시간 후, 18시간 후, 또는 24시간 후에 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 조성물 투여 후 1일 후, 2일 후, 3일 후, 4일 후, 5일 후, 6일 후, 또는 7일 후에 얻는다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 조성물 투여 후 1주일 후, 2주일 후, 3주일 후, 1개월 후, 2개월 후, 3개월 후, 6개월 후, 1년 후, 2년 후, 3년 후, 4년 후, 또는 5년 후에 얻는다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 기준 측정치에 비해 측정치를 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 감소는 조성물을 대상체에게 투여한 후 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플에서 측정된다. 일부 실시 양태에서, 감소는 조성물을 대상체에게 투여한 후 대상체에서 직접 측정된다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 감소된다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 10% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 10% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 약 90% 이하, 또는 약 100% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 2.5%, 5%, 7.5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 또는 100% 감소하거나, 상기 언급한 임의의 두 백분율로 정의된 범위만큼 감소한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 기준선 측정치에 비해 측정치를 증가시킨다. 일부 실시 양태에서, 증가는 조성물을 대상체에게 투여한 후 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플에서 측정된다. 일부 실시 양태에서, 증가는 조성물을 대상체에게 투여한 후 대상체에서 직접 측정된다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 10% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준 측정치에 비해 약 100% 이상, 약 250% 이상, 약 500% 이상, 약 750% 이상, 또는 약 1000% 이상 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 10% 이하 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 약 90% 이하, 또는 약 100% 이하 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 기준선 측정치에 비해 약 100% 이하, 약 250% 이하, 약 500% 이하, 약 750% 이하, 또는 약 1000% 이하로 증가한다. 일부 실시 양태에서, 측정치는 2.5%, 5%, 7.5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 250%, 500%, 750%, 또는 1000% 증가하거나, 상기 언급한 임의의 두 백분율로 정의된 범위만큼 증가한다.
일부 실시 양태에서, 측정치는 표적 단백질 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 표적 단백질 수준을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 샘플 중량당 표적 단백질의 질량 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 샘플 부피당 표적 단백질의 질량 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 수준은 샘플 내 총 단백질당 표적 단백질의 질량 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 순환/조직 표적 단백질 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 면역 분석, 비색 분석, 또는 형광 분석과 같은 분석에 의해 얻는다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 표적 단백질 측정치를 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 순환 표적 단백질 수준을 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 조직 표적 단백질 수준을 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 감소된 표적 단백질 수준은 조성물을 대상체에게 투여한 후 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플에서 측정된다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 약 10% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 기준치 표적 단백질 측정치에 비해 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 또는 약 100% 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 약 10% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 기준선 표적 단백질 측정치에 비해 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 약 90% 이하, 또는 약 100% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 단백질 측정치는 2.5%, 5%, 7.5%, 19%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 또는 100%, 또는 상기 언급된 임의의 두 백분율로 정의된 범위만큼 감소한다.
일부 실시 양태에서, 측정치는 표적 mRNA 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 표적 mRNA 수준을 포함한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 샘플 중량당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 샘플 부피당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 샘플 내 총 mRNA당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 샘플 내 총 핵산당 표적 mRNA의 양 또는 백분율로 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 수준은 샘플 내 항존 유전자의 mRNA 수준과 같은 다른 mRNA 수준과 비교하여 표시된다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 순환/조직 표적 mRNA 측정치이다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 PCR 분석과 같은 분석에 의해 얻는다. 일부 실시 양태에서, PCR은 qPCR을 포함한다. 일부 실시 양태에서, PCR은 표적 mRNA의 역전사를 포함한다.
일부 실시 양태에서, 조성물은 기준선 표적 mRNA 측정치에 비해 표적 mRNA 측정치를 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 조성물을 대상체에게 투여한 후 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플에서 얻는다. 일부 실시 양태에서, 조성물은 기준선 표적 mRNA 수준에 비해 표적 mRNA 수준을 감소시킨다. 일부 실시 양태에서, 감소된 표적 mRNA 수준은 조성물을 대상체에게 투여한 후 대상체로부터 얻은 두 번째 샘플에서 측정된다. 일부 실시 양태에서, 두 번째 샘플은 간 샘플이다. 일부 실시 양태에서, 두 번째 샘플은 지방 샘플이다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 기준선 표적 mRNA 측정치에 비해 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 또는 약 7.5% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 기준선 표적 mRNA 측정치에 비해 약 10% 이상 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 기준선 표적 mRNA 측정치에 비해 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 또는 약 100% 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 기준선 표적 mRNA 측정치에 비해 약 2.5% 이하, 약 5% 이하, 또는 약 7.5% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 기준선 표적 mRNA 측정치에 비해 약 10% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 기준선 표적 mRNA 측정치에 비해 약 20% 이하, 약 30% 이하, 약 40% 이하, 약 50% 이하, 약 60% 이하, 약 70% 이하, 약 80% 이하, 약 90% 이하, 또는 약 100% 이하 감소한다. 일부 실시 양태에서, 표적 mRNA 측정치는 2.5%, 5%, 7.5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 또는 100% 감소하거나, 상기 언급된 임의의 두 백분율로 정의된 범위만큼 감소한다.
III. 정의
달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용되는 모든 기술 용어, 표기법 및 기타 기술 및 과학 용어 또는 전문 용어는 청구된 주제가 속하는 기술 분야의 통상의 기술자가 일반적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 갖도록 의도된다. 일부 경우에, 일반적으로 이해되는 의미를 가진 용어는 명확성 및/또는 쉬운 참조를 위해 본원 정의되며, 이러한 정의를 본원에 포함한다고 해서 기술 분야에서 일반적으로 이해되는 것과 상당한 차이가 있는 것으로 해석되어서는 안 된다.
본 출원 전체에서 다양한 실시 양태는 범위 형식으로 제시될 수 있다. 범위 형식의 설명은 편의성과 간결성을 위한 것일 뿐이며 개시 내용의 범위에 대한 융통성 없는 제한으로 해석되어서는 안 된다. 따라서, 범위에 대한 기재는 해당 범위 내의 가능한 모든 부분 범위와 개별 수치를 구체적으로 개시한 것으로 간주되어야 한다. 예를 들어, 1 내지 6과 같은 범위에 대한 기재는 1 내지 3, 1 내지 4, 1 내지 5, 2 내지 4, 2 내지 6, 3 내지 6 등과 같은 구체적으로 개시된 부분 범위와 해당 범위 내의 개별 숫자(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6)를 포함하는 것으로 간주되어야 한다. 이는 범위의 폭에 관계없이 적용된다.
명세서 및 청구항에서 사용되는 바와 같이, 단수형 "a", "an" 및 "the"는 문맥상 명확히 달리 지시되지 않는 한 복수 지시어를 포함한다. 예를 들어, 용어 "샘플"에는 샘플의 혼합물을 포함한 복수의 샘플이 포함된다.
용어 "결정", "측정", "평가(evaluating, assessing)", "분석(assaying 및analyzing)"은 종종 본원에서 상호 교환하여 측정 형태를 나타낸다. 용어에는 요소가 존재하는지 여부의 결정(예를 들어, 검출)이 포함된다. 이러한 용어에는 양적, 질적 또는 양적 및 질적 결정이 포함될 수 있다. 평가는 상대적이거나 절대적일 수 있다. "존재의 검출"에는 맥락에 따라 존재하거나 부재하는지 여부의 결정 외에도 존재하는 것의 양의 결정이 포함될 수 있다.
용어 "대상체" 및 "환자"는 본원에서 상호 교환하여 사용될 수 있다. "대상체"는 발현된 유전 물질을 포함하는 생물학적 개체일 수 있다. 생물학적 개체는 예를 들어 박테리아, 바이러스, 진균, 및 원생동물을 포함한 식물, 동물 또는 미생물일 수 있다. 대상체는 포유류일 수 있다. 포유류는 인간일 수 있다. 대상체는 질병에 대한 고위험으로 진단되거나 의심될 수 있다. 일부 경우에, 대상체는 반드시 질병에 대한 고위험으로 진단되거나 의심되는 것은 아니다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "약"은 해당 수에서 해당 수의 10%를 더하거나 뺀 것을 말한다. 용어 "약" 범위는 해당 범위에서 가장 낮은 값의 10%를 뺀 것과 가장 큰 값의 10%를 더한 것을 말한다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "치료" 또는 "치료하는"은 수혜자에게 유익하거나 원하는 결과를 얻기 위한 약제 또는 기타 개입 요법을 언급하는 데 사용된다. 유익하거나 원하는 결과에는 치료적 이점 및/또는 예방적 이점이 포함되지만 이에 제한되지 않는다. 치료적 이점은 치료 중인 증상이나 기저 질환의 근절 또는 개선을 의미할 수 있다. 또한, 치료적 이점은 대상체가 여전히 기저 질환을 앓고 있을 수 있음에도 불구하고 대상체에서 개선이 관찰되도록 기저 질환과 관련된 하나 이상의 생리적 증상을 근절 또는 개선하여 달성될 수 있다. 예방적 효과에는 질병 또는 병태의 발현을 지연, 예방 또는 제거하는 것, 질병이나 병태의 증상 발현을 지연 또는 제거하는 것, 질병이나 병태의 진행을 지연, 정지, 또는 역전시키는 것, 또는 이들의 조합이 포함된다. 예방적 이익을 위해, 특정 질병이 발생할 위험이 있는 대상체, 또는 질병의 생리적 증상 중 하나 이상을 보고하는 대상체는 이 질병에 대한 진단이 내려지지 않았을 수 있더라도 치료를 받을 수 있다.
"치료" 또는 "치료하는"은 치료적 이점 및/또는 예방적 이점을 포함하지만 이에 제한되지 않는 질병, 장애, 또는 의학적 상태와 관련하여 유익하거나 원하는 결과를 얻기 위한 접근 방식을 포함할 수 있다. 치료적 이점에는 예를 들어 치료 중인 기저 장애의 근절 또는 개선이 포함될 수 있다. 또한, 치료적 이점에는 예를 들어 대상체가 여전히 기저 질환을 앓고 있을 수 있음에도 불구하고 대상체에서 개선이 관찰되도록 기저 질환과 관련된 하나 이상의 생리적 증상을 근절 또는 개선이 포함될 수 있다. 특정 실시 양태에서, 예방적 이점을 위해, 특정 질병이 발생할 위험이 있는 대상체, 또는 질병의 생리적 증상 중 하나 이상을 보고하는 대상체에게 이 질병에 대한 진단이 내려지지 않았을 수 있더라도 조성물이 투여된다. 본원에 기재된 화합물의 투여를 통한 치료는 의료 전문가의 참여가 필요하지 않다.
일부 실시 양태는 핵산 서열 정보를 참조한다. 일부 실시 양태에서 티민(T)은 우라실(U)과 상호 교환될 수 있거나 그 반대일 수 있음이 고려된다. 예를 들어, 서열 목록의 일부 서열은 T를 나열할 수 있지만, 이들은 일부 실시 양태에서는 U로 대체될 수 있다. 우라실을 포함하는 핵산 서열을 갖는 일부 올리고뉴클레오티드에서, 우라실은 티민으로 대체될 수 있다. 마찬가지로, 티민을 포함하는 핵산 서열을 갖는 일부 올리고뉴클레오티드에서, 티민은 우라실로 대체될 수 있다. 일부 실시 양태에서, siRNA와 같은 올리고뉴클레오티드는 RNA를 포함하거나 이로 이루어진다. 일부 실시 양태에서, 올리고뉴클레오티드는 DNA를 포함할 수 있다. 예를 들어, 올리고뉴클레오티드는 2' 데옥시리보뉴클레오티드를 포함할 수 있다. ASO는 DNA를 포함하거나 이로 이루어질 수 있다. 서열 목록이 본원의 개시 내용과 모순될 경우, 명세서가 우선한다.
일부 측면에는 뉴클레오티드 변형 또는 변형된 뉴클레오시드 간 결합이 있는 서열이 포함된다. 일반적으로, 달리 명시되지 않는 한, Nf(예를 들어, Af, Cf, Gf, Tf, 또는 Uf)는 2' 플루오로 변형된 뉴클레오시드를 나타내고, dN(예를 들어, dA, dC, dG, dT, 또는 dU)은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 나타내고, n(예를 들어, a, c, g, t, 또는 u)은 2' O-메틸 변형된 뉴클레오시드를 나타내고, "s"는 포스포로티오에이트 결합을 나타낸다.
피리미딘은 시토신(C), 티민(T), 또는 우라실(U)을 포함할 수 있다. 피리미딘은 C 또는 U를 포함할 수 있다. 피리미딘은 C 또는 T를 포함할 수 있다. 피리미딘에 대한 언급은 피리미딘을 구성하는 뉴클레오시드 또는 뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 퓨린은 구아닌(G) 또는 아데닌(A)을 포함할 수 있다. 퓨린에 대한 언급은 퓨린을 포함하는 뉴클레오시드 또는 뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
본원에서 사용된 섹션 제목은 구성 목적으로만 사용되며 기재된 주제를 제한하는 것으로 해석되어서는 안 된다.
알킬, 알케닐, 또는 알키닐과 같은 화학적 모이어티와 함께 사용될 때 용어 "Cx-y" 또는 "Cx-Cy"는 사슬에 x 내지 y개의 탄소를 함유하는 기를 포함하는 것을 의미한다. 예를 들어, 용어 "C1- 6알킬"은 1 내지 6개의 탄소를 함유하는 직쇄 알킬 및 분지쇄 알킬기를 포함하여 치환 또는 비치환된 포화 탄화수소 기를 지칭한다.
용어 "Cx -y 알케닐" 및 " Cx -y 알키닐"은 상기 기재된 알킬과 길이 및 가능한 치환이 유사하지만 각각 적어도 하나의 이중 또는 삼중 결합을 함유하는 치환 또는 비치환된 불포화 지방족 기를 지칭한다.
본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "탄소환"은 고리의 각 원자가 탄소인 포화, 불포화 또는 방향족 고리를 지칭한다. 탄소환에는 3원 내지 10원 단환식 고리, 5원 내지 12원 이환식 고리, 5원 내지 12원 스피로 이환, 및 5원 내지 12원 가교 고리가 포함된다. 이환식 탄소환의 각 고리는 포화, 불포화 및 방향족 고리에서 선택될 수 있다. 예시적 실시 양태에서, 방향족 고리, 예를 들어 페닐은 포화 또는 불포화 고리, 예를 들어 시클로헥산, 시클로펜탄, 또는 시클로헥센에 융합될 수 있다. 이환식 탄소환은 원자가가 허용하는 대로 포화, 불포화 및 방향족 이환식 고리의 임의의 조합을 포함한다. 이환식 탄소환은 또한 스피로 이환식 고리, 예를 들어 스피로펜탄을 포함한다. 이환식 탄소환은 3-3 스피로 고리계, 4-4 스피로 고리계, 4-5 융합 고리계, 5-5 융합 고리계, 5-6 융합 고리계, 6-6 융합 고리계, 5-7 융합 고리계, 6-7 융합 고리계, 5-8 융합 고리계, 및 6-8 융합 고리계와 같은 고리 크기의 임의의 조합을 포함한다. 예시적인 탄소환에는 시클로펜틸, 시클로헥실, 시클로헥세닐, 아다만틸, 페닐, 인다닐, 나프틸, 및 비시클로[1.1.1]펜타닐이 포함된다.
용어 "아릴"은 방향족 단환식 또는 방향족 다환식 탄화수소 고리계를 지칭한다. 방향족 단환식 또는 방향족 다환식 탄화수소 고리계는 수소와 탄소만을 포함하고 5 내지 18개의 탄소 원자를 포함하며, 여기서 고리계의 고리 중 적어도 하나는 방향족이다. 즉 휘켈 이론에 따라 순환적이고 비편재화된 (4n+2) π-전자계를 포함한다. 아릴 기가 유래하는 고리계는 벤젠, 플루오렌, 인단, 인덴, 테트랄린 및 나프탈렌과 같은 기를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다.
용어 "시클로알킬"은 고리의 각 원자가 탄소인 포화 고리를 지칭한다. 시클로알킬은 3원 내지 10원 단환식 고리, 5원 내지 12원 이환식 고리, 5원 내지 12원 스피로 이환, 5원 내지 12원 가교 고리와 같은 단환식 및 다환식 고리를 포함할 수 있다. 특정 실시 양태에서, 시클로알킬은 3 내지 10개의 탄소 원자를 포함한다. 다른 실시 양태에서, 시클로알킬은 5 내지 7개의 탄소 원자를 포함한다. 시클로알킬은 단일 결합에 의해 분자의 나머지 부분에 부착될 수 있다. 단환식 시클로알킬의 예로는, 예를 들어, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 시클로헥실, 시클로헵틸 및 시클로옥틸이 포함된다. 다환식 시클로알킬 라디칼에는 예를 들어 아다만틸, 스피로펜탄, 노르보르닐(즉, 비시클로[2.2.1]헵타닐), 데칼리닐, 7,7 디메틸 비시클로[2.2.1]헵타닐, 비시클로[1.1.1]펜타닐 등이 포함된다.
용어 "시클로알케닐"은 고리의 각 원자가 탄소이고 두 고리 탄소 사이에 적어도 하나의 이중 결합이 있는 포화 고리를 말한다. 시클로알케닐에는 3원 내지 10원 단환식 고리, 6원 내지 12원 이환식 고리, 5원 내지 12원 가교 고리와 같은 단환식 및 다환식 고리가 포함될 수 있다. 다른 실시 양태에서, 시클로알케닐은 5 내지 7개의 탄소 원자를 포함한다. 시클로알케닐은 단일 결합으로 분자의 나머지 부분에 부착될 수 있다. 단환 시클로알케닐의 예로는, 예를 들어, 시클로펜테닐, 시클로헥세닐, 시클로헵테닐 및 시클로옥테닐이 포함된다.
용어 "할로" 또는 대안적으로 "할로겐" 또는 "할라이드"는 플루오로, 클로로, 브로모 또는 요오도를 의미한다. 일부 실시 양태에서, 할로는 플루오로, 클로로, 또는 브로모이다.
용어 "할로알킬"은 하나 이상의 할로 라디칼, 예를 들어, 트리플루오로메틸, 디클로로메틸, 브로모메틸, 2,2,2-트리플루오로에틸, 1-클로로메틸-2-플루오로에틸 등으로 치환된, 상기 정의된 바와 같은 알킬 라디칼을 지칭한다. 일부 실시 양태에서, 할로알킬 라디칼의 알킬 부분은 선택적으로 본원에서 기재되는 바와 같이 추가로 치환된다.
본원에서 사용되는 바와 같이, 용어 "복소환"은 하나 이상의 헤테로원자를 포함하는 포화, 불포화 또는 방향족 고리를 지칭한다. 예시적인 헤테로원자로는 N, O, Si, P, B, 및 S 원자가 포함된다. 복소환에는 3원 내지 10원 단환식 고리, 6원 내지 12원 이환식 고리, 5원 내지 12원 스피로 이환, 5원 내지 12원 가교 고리가 포함된다. 이환식 복소환에는 원자가 허용하는 대로 포화, 불포화 및 방향족 이환식 고리의 임의의 조합이 포함된다. 예시적인 실시 양태에서, 방향족 고리, 예를 들어 피리딜은 포화 또는 불포화 고리, 예를 들어 시클로헥산, 시클로펜탄, 모르폴린, 피페리딘 또는 시클로헥센에 융합될 수 있다. 이환식 복소환은 4-5 융합 고리계, 5-5 융합 고리계, 5-6 융합 고리계, 6-6 융합 고리계, 5-7 융합 고리계, 6-7 융합 고리계, 5-8 융합 고리계, 및 6-8 융합 고리계와 같은 고리 크기의 임의의 조합을 포함한다. 이환식 복소환은 또한 스피로 이환식 고리, 예를 들어 2-옥사-6-아자스피로[3.3]헵탄과 같은 5원 내지 12원 스피로 이환을 포함한다.
용어 "헤테로아릴"은 2 내지 17개의 탄소 원자와 질소, 산소 및 황에서 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 포함하는 5 내지 18원 방향족 고리 라디칼에서 유래된 라디칼을 지칭한다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 헤테로아릴 라디칼은 단환식, 이환식, 삼환식 또는 사환식 고리계이며, 여기서 고리계의 고리 중 적어도 하나는 방향족이다. 즉 휘켈 이론에 따라 순환적이고 비편재화된 (4n+2) π-전자계를 포함한다. 헤테로아릴에는 융합 또는 가교 고리계가 포함된다. 헤테로아릴 라디칼의 헤테로원자는 선택적으로 산화된다. 존재하는 경우 하나 이상의 질소 원자는 선택적으로 4차화된다. 헤테로아릴은 고리(들)의 임의의 원자를 통해 분자의 나머지 부분에 부착된다. 헤테로아릴의 예로는 아제피닐, 아크리디닐, 벤즈이미다졸릴, 벤즈인돌릴, 1,3-벤조디옥솔릴, 벤조푸라닐, 벤족사졸릴, 벤조[d]티아졸릴, 벤조티아디아졸릴, 벤조[b][1,4]디옥세피닐, 벤조[b][1,4]옥사지닐, 1,4-벤조디옥사닐, 벤조나프토푸라닐, 벤족사졸릴, 벤조디옥솔릴, 벤조디옥시닐, 벤조피라닐, 벤조피라노닐, 벤조푸라닐, 벤조푸라노닐, 벤조티에닐(벤조티오페닐), 벤조티에노[3,2-d]피리미디닐, 벤조트리아졸릴, 벤조[4,6]이미다조[1,2-a]피리디닐, 카르바졸릴, 신놀리닐, 시클로펜타[d]피리미디닐, 6,7-디히드로-5H-시클로펜타[4,5]티에노[2,3 d]피리미디닐, 5,6-디히드로벤조[h]퀴나졸리닐, 5,6-디히드로벤조[h]신놀리닐, 6,7-디히드로-5H-벤조[6,7]시클로헵타[1,2-c]피리다지닐, 디벤조푸라닐, 디벤조티오페닐, 푸라닐, 푸라노닐, 푸로[3,2-c]피리디닐, 5,6,7,8,9,10-헥사히드로시클로옥타[d]피리미디닐, 5,6,7,8,9,10-헥사히드로시클로옥타[d]피리다지닐, 5,6,7,8,9,10-헥사히드로시클로옥타[d]피리디닐, 이소티아졸릴, 이미다졸릴, 인다졸릴, 인돌릴, 인다졸릴, 이소인돌릴, 인돌리닐, 이소인돌리닐, 이소퀴놀릴, 인돌리지닐, 이속사졸릴, 5,8-메타노-5,6,7,8-테트라히드로퀴나졸리닐, 나프티리디닐, 1,6-나프티리디노닐, 옥사디아졸릴, 2-옥소아제피닐, 옥사졸릴, 옥시라닐, 5,6,6a,7,8,9,10,10a-옥타히드로벤조[h]퀴나졸리닐, 1-페닐-1H-피롤릴, 페나지닐, 페노티아지닐, 페녹사지닐, 프탈라지닐, 프테리디닐, 퓨리닐, 피롤릴, 피라졸릴, 피라졸로[3,4d]피리미디닐, 피리디닐, 피리도[3,2-d]피리미디닐, 피리도[3,4-d]피리미디닐, 피라지닐, 피리미디닐, 피리다지닐, 피롤릴, 퀴나졸리닐, 퀴녹살리닐, 퀴놀리닐, 이소퀴놀리닐, 테트라히드로퀴놀리닐, 5,6,7,8-테트라히드로퀴나졸리닐, 5,6,7,8-테트라히드로벤조[4,5]티에노[2,3-d]피리미디닐, 6,7,8,9-테트라히드로-5H-시클로헵타[4,5]티에노[2,3-d]피리미디닐, 5,6,7,8-테트라히드로피리도[4,5-c]피리다지닐, 티아졸릴, 티아디아졸릴, 트리아졸릴, 테트라졸릴, 트리아지닐, 티에노[2,3-d]피리미디닐, 티에노[3,2-d]피리미디닐, 티에노[2,3-c]피리디닐, 및 티오페닐(즉, 티에닐)이 포함되지만 이에 제한되지는 않는다.
용어 "헤테로시클로알킬"은 탄소 원자와 적어도 하나의 헤테로원자를 갖는 포화 고리를 지칭한다. 예시적인 헤테로원자로는 N, O, Si, P, B, 및 S 원자가 포함된다. 헤테로시클로알킬에는 3원 내지 10원 단환식 고리, 6원 내지 12원 이환식 고리, 5원 내지 12원 스피로 이환, 및 5원 내지 12원 가교 고리와 같은 단환식 및 다환식 고리가 포함될 수 있다. 헤테로시클로알킬 라디칼의 헤테로원자는 선택적으로 산화된다. 존재하는 경우 하나 이상의 질소 원자는 선택적으로 4차화된다. 헤테로시클로알킬은 원자가가 허용하는 헤테로시클로알킬의 임의의 원자, 예를 들어 헤테로시클로알킬의 임의의 탄소 또는 질소 원자를 통해 분자의 나머지 부분에 부착된다. 헤테로시클로알킬 라디칼의 예로는 디옥솔라닐, 티에닐[1,3]디티아닐, 데카히드로이소퀴놀릴, 이미다졸리닐, 이미다졸리디닐, 이소티아졸리디닐, 이속사졸리디닐, 모르폴리닐, 옥타히드로인돌릴, 옥타히드로이소인돌릴, 2-옥소피페라지닐, 2-옥소피페리디닐, 2-옥소피롤리디닐, 옥사졸리디닐, 피페리디닐, 피페라지닐, 4-피페리도닐, 피롤리디닐, 피라졸리디닐, 퀴누클리디닐, 티아졸리디닐, 테트라히드로푸릴, 트리티아닐, 테트라히드로피라닐, 티오모르폴리닐, 티아모르폴리닐, 1-옥소-티오모르폴리닐, 2-옥사-6-아자스피로[3.3]헵탄, 및 1,1-디옥소-티오모르폴리닐이 포함되지만 이에 제한되지는 않는다.
용어 "헤테로시클로알케닐"은 탄소 원자와 적어도 하나의 헤테로원자를 갖는 불포화 고리를 지칭하며, 두 고리 탄소 사이에 적어도 하나의 이중 결합이 있다. 헤테로시클로알케닐은 헤테로아릴 고리를 포함하지 않는다. 예시적인 헤테로원자로는 N, O, Si, P, B, 및 S 원자가 포함된다. 헤테로시클로알케닐에는 3원 내지 10원 단환식 고리, 6원 내지 12원 이환식 고리, 및 5원 내지 12원 가교 고리와 같은 단환식 및 다환식 고리가 포함될 수 있다. 다른 실시 양태에서, 헤테로시클로알케닐은 5 내지 7개의 고리 원자를 포함한다. 헤테로시클로알케닐은 단일 결합에 의해 분자의 나머지 부분에 부착될 수 있다. 단환식 시클로알케닐의 예로는, 예를 들어, 피롤린(디히드로피롤), 피라졸린(디히드로피라졸), 이미다졸린(디히드로이미다졸), 트리아졸린(디히드로트리아졸), 디히드로푸란, 디히드로티오펜, 옥사졸린(디히드로옥사졸), 이소옥사졸린(디히드로이속사졸), 티아졸린(디히드로티아졸), 이소티아졸린(디히드로이소티아졸), 옥사디아졸린(디히드로옥사디아졸), 티아디아졸린(디히드로티아디아졸), 디히드로피리딘, 테트라히드로피리딘, 디히드로피리다진, 테트라히드로피리다진, 디히드로피리미딘, 테트라히드로피리미딘, 디히드로피라진, 테트라히드로피라진, 피란, 디히드로피란, 티오피란, 디히드로티오피란, 디옥신, 디히드로디옥신, 옥사진, 디히드로옥사진, 티아진, 및 디히드로티아진이 포함된다.
용어 "치환된"은 모이어티가 하나 이상의 탄소 또는 치환 가능한 헤테로원자, 예를 들어 화합물의 NH 또는 NH2에 있는 수소를 대체하는 치환기를 가짐을 나타낸다. "치환" 또는 "치환된"에는 이러한 치환이 치환된 원자와 치환기의 허용된 원자가에 따라 이루어지고, 치환으로 인해 안정한 화합물, 즉 재배열, 고리화, 제거 등과 같은 변형을 자발적으로 겪지 않는 화합물이 생성된다는 암묵적 조건이 포함되는 것으로 이해된다. 특정 실시 양태에서, 치환된은 모이어티가 동일한 탄소 원자에 있는 2개의 수소 원자를 대체하는 치환기를 가짐, 예를 들어, 단일 탄소에 있는 2개의 수소 원자를 옥소, 이미노 또는 티옥소 기로 대체하는 것을 나타낸다. 본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "치환된"은 유기 화합물의 허용 가능한 모든 치환기를 포함하는 것으로 고려된다. 광범위한 측면에서, 허용 가능한 치환기에는 유기 화합물의 비-환식 및 환식, 분지형 및 비분지형, 탄소환 및 복소환, 방향족 및 비방향족 치환기가 포함된다. 허용 가능한 치환기는 하나 이상일 수 있으며 적절한 유기 화합물에 대해 동일하거나 다를 수 있다.
일부 실시 양태에서, 치환기는 본원에 기재된 임의의 치환기, 예를 들어 다음을 포함할 수 있다: 예를 들어 할로겐, 히드록시, 옥소(=O), 티옥소(=S), 시아노(-CN), 니트로(-NO2), 이미노(=N-H), 옥시모(=N-OH), 히드라지노(=N-NH2), -Rb-ORa, -Rb-OC(O)-Ra, -Rb-OC(O)-ORa, -Rb-OC(O)-N(Ra)2, -Rb-N(Ra)2, -Rb-C(O)Ra, -Rb-C(O)ORa, -Rb-C(O)N(Ra)2, -Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2, -Rb-N(Ra)C(O)ORa, -Rb-N(Ra)C(O)Ra, -Rb-N(Ra)S(O)tRa(여기서 t는 1 또는 2임), -Rb-S(O)tRa(여기서 t는 1 또는 2임), -Rb-S(O)tORa(여기서 t는 1 또는 2임), 및 -Rb-S(O)tN(Ra)2(여기서 t는 1 또는 2임); 및 및 알킬, 알케닐, 알키닐, 아릴, 아르알킬, 아르알케닐, 아르알키닐, 시클로알킬, 시클로알킬알킬, 헤테로시클로알킬, 헤테로시클로알킬알킬, 헤테로아릴, 및 헤테로아릴알킬, 이들 중 임의의 것은 알킬, 알케닐, 알키닐, 할로겐, 할로알킬, 할로알케닐, 할로알키닐, 옥소(=O), 티옥소(=S), 시아노(-CN), 니트로(-NO2), 이미노(=N-H), 옥시모(=N-OH), 히드라진(=N-NH2), -Rb-ORa, -Rb-OC(O)-Ra, -Rb-OC(O)-ORa, -Rb-OC(O)-N(Ra)2, -Rb-N(Ra)2, -Rb-C(O)Ra, -Rb-C(O)ORa, -Rb-C(O)N(Ra)2, -Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2, -Rb-N(Ra)C(O)ORa, -Rb-N(Ra)C(O)Ra, -Rb-N(Ra)S(O)tRa(여기서 t는 1 또는 2임), -Rb-S(O)tRa(여기서 t는 1 또는 2임), -Rb-S(O)tORa(여기서 t는 1 또는 2임) 및 -Rb-S(O)tN(Ra)2(여기서 t는 1 또는 2임)로 선택적으로 치환될 수 있음; 여기서 각 Ra는 수소, 알킬, 시클로알킬, 시클로알킬알킬, 아릴, 아르알킬, 헤테로시클로알킬, 헤테로시클로알킬알킬, 헤테로아릴, 또는 헤테로아릴알킬로부터 독립적으로 선택되고, 여기서 각 Ra는 원자가 허용되면 알킬, 알케닐, 알키닐, 할로겐, 할로알킬, 할로알케닐, 할로알키닐, 옥소(=O), 티옥소(=S), 시아노(-CN), 니트로(-NO2), 이미노(=N-H), 옥심(=N-OH), 히드라진(=N-NH2), -Rb-ORa, -Rb-OC(O)-Ra, -Rb-OC(O)-ORa, -Rb-OC(O)-N(Ra)2, -Rb-N(Ra)2, -Rb-C(O)Ra, -Rb-C(O)ORa, -Rb-C(O)N(Ra)2, -Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2, -Rb-N(Ra)C(O)ORa, -Rb-N(Ra)C(O)Ra, -Rb-N(Ra)S(O)tRa(여기서 t는 1 또는 2임), -Rb-S(O)tRa(여기서 t는 1 또는 2임), -Rb-S(O)tORa(여기서 t는 1 또는 2임) 및 -Rb-S(O)tN(Ra)2(여기서 t는 1 또는 2임)로 선택적으로 치환될 수 있으며; 여기서 각 Rb는 독립적으로 직접 결합 또는 직쇄 또는 분지형 알킬렌, 알케닐렌, 또는 알키닐렌 사슬로부터 선택되고, 각 Rc 직쇄 또는 분지형 알킬렌, 알케닐렌 또는 알키닐렌 사슬임.
옥소 기와 같은 산소 원자에 대한 이중 결합은 본원에서 "=O" 및 "(O)"로 표현된다. 질소 원자에 대한 이중 결합은 "=NR"과 "(NR)"로 표현된다. 황 원자에 대한 이중 결합은 :=S"와 "(S)"로 표현된다.
본원에서 사용되는 바와 같이 “비경구 투여” 및 “비경구로 투여”라는 문구는 일반적으로 주사에 의해, 장내 및 국소 투여 이외의 투여 방식을 의미하며, 정맥 내, 근육 내, 동맥 내, 척수강 내, 낭 내, 안와 내, 심장 내, 피 내, 복강 내, 기관 내, 피하, 표피 하, 관절 내, 낭하, 거미막하, 척추 내 및 흉골 내 주사 및 주입을 제한 없이 포함한다.
"약학적으로 허용 가능한"이라는 문구는 합리적인 이익/위험 비율에 비례하여 과도한 독성, 자극, 알레르기 반응 또는 기타 문제나 합병증 없이 인간과 동물의 조직과 접촉하여 사용하기에 적합한, 건전한 의학적 판단의 범위 내에 있는 화합물, 재료, 조성물 및/또는 제형을 지칭하는데 본원에서 사용된다.
본원에서 사용되는 바와 같이 "약학적으로 허용 가능한 부형제" 또는 "약학적으로 허용 가능한 담체"라는 문구는 액체 또는 고체 충전제, 희석제, 부형제, 용매 또는 캡슐화 물질과 같은 약학적으로 허용 가능한 물질, 조성물 또는 비히클을 의미한다. 각 담체는 제제의 다른 성분과 호환되고 환자에게 해롭지 않다는 의미에서 "허용 가능해야" 한다. 약학적으로 허용 가능한 담체로 작용할 수 있는 물질의 몇 가지 예는 다음을 포함한다. (1) 락토오스, 글루코오스 및 수크로스와 같은 당; (2) 옥수수 전분 및 감자 전분과 같은 전분; (3) 셀룰로스 및 그 유도체, 예를 들어 카르복시메틸 셀룰로스 나트륨, 에틸 셀룰로스 및 셀룰로스 아세테이트; (4) 분말 트라가칸트; (5) 맥아; (6) 젤라틴; (7) 활석; (8) 코코아 버터 및 좌약 왁스와 같은 부형제; (9) 땅콩유, 면실유, 홍화유, 참기름, 올리브유, 옥수수유 및 대두유와 같은 오일; (10) 프로필렌 글리콜과 같은 글리콜; (11) 글리세린, 소르비톨, 만니톨 및 폴리에틸렌 글리콜과 같은 폴리올; (12) 에틸 올레에이트 및 에틸 라우레이트와 같은 에스테르; (13) 한천; (14) 수산화마그네슘 및 수산화알루미늄과 같은 완충제; (15) 알긴산; (16) 발열원 제거수; (17) 등장성 식염수; (18) 링거액; (19) 에틸 알코올; (20) 인산 완충액; 및 (21) 약학 제제에 사용되는 기타 무독성 호환 물질.
용어 "염" 또는 "약학적으로 허용 가능한 염"은 당 업계에 잘 알려진 다양한 유기 및 무기 반대 이온에서 유래된 염을 지칭한다. 약학적으로 허용 가능한 산 부가염은 무기산 및 유기산으로 형성될 수 있다. 염이 유래될 수 있는 무기산에는 예를 들어 염산, 브롬화수소산, 황산, 질산, 인산 등이 포함된다. 염이 유래될 수 있는 유기산에는 예를 들어 아세트산, 프로피온산, 글리콜산, 피루브산, 옥살산, 말레산, 말론산, 석신산, 푸마르산, 타르타르산, 시트르산, 벤조산, 신남산, 만델산, 메탄설폰산, 에탄설폰산, p-톨루엔설폰산, 살리실산 등이 포함된다. 약학적으로 허용 가능한 염기 부가염은 무기 및 유기 염기로 형성될 수 있다. 염이 유래될 수 있는 무기 염기에는 예를 들어 나트륨, 칼륨, 리튬, 암모늄, 칼슘, 마그네슘, 철, 아연, 구리, 망간, 알루미늄 등이 포함된다. 염이 유래될 수 있는 유기 염기에는 예를 들어 1차, 2차 및 3차 아민, 자연적으로 발생하는 치환 아민을 포함한 치환 아민, 환형 아민, 염기성 이온 교환 수지 등이 포함되며, 구체적으로는 예를 들어 이소프로필아민, 트리메틸아민, 디에틸아민, 트리에틸아민, 트리프로필아민 및 에탄올아민이 포함된다. 일부 실시 양태에서, 약학적으로 허용 가능한 염기 부가염은 암모늄, 칼륨, 나트륨, 칼슘 및 마그네슘 염으로부터 선택된다.
VI. 실시예
실시예 1: siRNA 이중체의 유리체 내 주사:
마우스(4-7주령 ICR, Envigo)에 유리체 내 주사를 위해, 유리 미세주사기(10 ㎕ 용량; Hamilton Company)와 함께 33 게이지 바늘을 사용하였다. 눈을 안구돌출시켜 바늘을 적도부 공막을 통해 삽입하여 유리체 방에 약 45도 각도로 삽입하였으며, 수정체의 후방부나 망막에 닿지 않도록 주의하였다. 1 ㎕ 인산 완충 식염수 비히클 중 5 ㎍의 siRNA 이중체를 유리체에 주사하였다. 주사된 siRNA 이중체는 표 2에 나타낸다.
[표 2]
주사 후 제14일에 마우스를 안락사시켰다. 각 동물의 양쪽 눈을 수거하고 적도에 따라 절개하고, 전방 및 후방 반구를 RNAlater에 넣었다. 균질화된 조직으로부터 총 RNA를 추출하여 First-Strand III cDNA 합성 키트를 사용하여 cDNA로 역전사시켰다. 형광 표지된 TaqMan 프로브/선택된 유전자(ANGPTL7, MYOC, COL1A1, COL5A1, VCAN, FN1, 및 PPIA)의 프라이머 세트를 사용하여 실시간 TaqMan PCR에 의해 정규화된 cDNA 정량화를 수행하였다. 반응은 ABI Prism 7500 Fast Real-Time PCR System Sequence Detection System에서 실행되는 TaqMan Universal PCR Master Mix No AmpErase UNG를 사용하여 20 ㎕ 분액에서 수행하고 7500 System 소프트웨어로 분석하였다. 처리된 샘플과 미처리된 샘플 간의 상대 정량화(RQ) 값을 2-ΔΔCT 공식으로 계산한다. 여기서 CT는 임계값에서의 사이클(자동 측정값)이며, ΔCT는 분석된 유전자의 CT에서 내인성 대조군(PPIA)의 CT를 뺀 값이며, ΔΔCT는 처리된 샘플의 정규화된 분석된 유전자의 ΔCT에서 미처리된 샘플의 동일한 유전자의 ΔCT(캘리브레이터)를 뺀 값이다.
결과는 표 3에 나타낸다. ETD1208이 ETD1207보다 더 효과적이었고, ETD1207이 EDT1206보다 더 효과적이었다. 이는 센스 가닥의 5' 말단에 포스포로티오에이트가 적은(또는 없는) 것이 소수성 기가 부착된 말단에 2개의 포스포로티오에이트가 있는 것보다 더 효과적이었음을 보여준다.
ETD1588이 ETD1589보다 활성이 더 높았는데, 이는 일부 서열이 안티센스 가닥에 5' 비닐 포스포네이트가 없는 경우보다 안티센스 가닥에 5' 비닐 포스포네이트가 있는 경우 더 큰 활성을 보였다는 것을 의미한다.
ETD1716-ETD1787 시리즈는 12-25개의 탄소를 가진 다양한 소수성 기를 가능하게 한다. 모두 센스 가닥의 5' 말단에서 포스포로티오에이트와 접합되었다.
[표 3]
실시예 2: 유리체 내 주사와 mRNA 및 siRNA 정량화
1 ㎕ 중 20 ㎍ siRNA로 상기와 같이 유리체 내 주사를 시행하였다. 주사 후 14일에 눈을 수거하여 이전 실시예에서 보여준 바와 같이 mRNA를 정량화하였다. siRNA는 공개된 절차(Cheng A, Li M, Liang Y, Wang Y, Wong L, Chen C, Vlassov AV, Magdaleno S 2009. Stem-loop RT-PCR quantification of siRNAs in vitro and in vivo. Oligo Nucleotides 19: 203-208)에 따라 스템 루프 분석을 사용하여 정량화하였다.
결과는 표 4에 나타낸다. 소수성 기의 크기, 녹다운 비율, 및 조직에서 관찰된 siRNA 수준 사이에 상관관계가 있었다. 일반적으로, 탄소가 더 많은 소수성 기에서 녹다운 비율이 증가하고 조직에서 더 많은 siRNA가 관찰되었다.
[표 4]
실시예 3: 마우스의 지방 조직에서 PLIN1의 siRNA 매개 녹다운
1군의 4-7주령 ICR mice(Envigo Labs) 마우스(n=4)에게 피하 주사로 100 ㎕의 인산 완충 식염수(PBS)를 투여하거나 100 ㎕ PBS 중 500 ㎍의 마우스 PLIN1 표적화 siRNA를 투여하였다. 제14일에, 마우스를 안락사시키고 각각으로부터 복부 백색 지방 샘플을 수집하여 RNAlater(ThermoFisher 카탈로그 번호 AM7020)에 넣었다. 5000 rpm에 설정된 Percellys 24 조직 균질화기(Bertin Instruments)를 2회 10초 주기로 사용하여 균질화 완충액(Maxwell RSC simplyRNA Tissue Kit)에서 간 조직을 균질화하여 간의 총 RNA를 준비하였다. 용해물로부터 얻은 총 RNA는 제조업체의 권장 사항에 따라 Maxwell RSC 48 플랫폼(Promega Corporation)에서 정제하였다. 마우스 PLIN1 및 마우스 항존 유전자 PPIA(ThermoFisher, 분석 번호 Mm02342430_g1)에 대한 TaqMan 분석을 사용하여 RT-qPCR로 간 PLIN1 mRNA 수준을 평가하였다. 데이터는 PBS를 투여받은 동물의 수준에 대해 정규화하였다.
결과는 표 5에 나타낸다. 5' 비닐포스포네이트를 첨가하면 효력이 증가하고 지방 조직으로의 전달이 가능하였다.
[표 5]
실시예 4 : 중추 신경계 주사 전달
기재된 바와 같이 변형 및 소수성 접합체를 갖는 siRNA는 공개된 절차에 따라 뇌실 내 또는 척수강 내로 주사한다(Alterman, J.F., Godinho, B.M.D.C., Hassler, M.R. et al. A divalent siRNA chemical scaffold for potent and sustained modulation of gene expression throughout the central nervous system. Nat Biotechnol 37, 884-894 (2019). https://doi.org/10.1038/s41587-019-0205-0, Njoo, C., Heinl, C., Kuner, R. In Vivo SiRNA Transfection and Gene Knockdown in Spinal Cord via Rapid Noninvasive Lumbar Intrathecal Injections in Mice. J. Vis. Exp. (85), e51229, doi:10.3791/51229 (2014)). 주사 후 14일에 마우스를 안락사시키고, 뇌 반구를 수거하여, 동결시키고, 나중에 균질화하여 표적 mRNA 및 단백질 발현을 테스트한다.
실시예 5: siRNA에 대한 요점 설명:
아래에 예시 siRNA를 기재한다:
● 21 mer:
a. 19개 염기쌍
b. 2 nt 돌출부
● 안티센스 가닥:
a. 5' 말단에 비닐 포스포네이트(VP)
b. 각 말단에 2개 포스포로티오에이트 결합(PS)
● 센스 가닥:
a. 5' 말단에 소수성 기(C16-C18)
b. 5' 말단에 선택적인 0-2개 PS
c. 3' 말단에 2개 PS
● 2' 플루오로 및 2' 메틸 기의 변형 패턴
실시예 6: 변형 모티프 1
예시 siRNA는 다음 변형의 조합을 포함한다:
● 센스 가닥의 위치 9(5'에서 3'으로)는 2' F이다.
● 위치 9가 피리미딘일 경우 센스 가닥의 모든 퓨린은 2'OMe이고, 위치 5와 11 사이의 1-5개 피리미딘은 2' F이되, 단, 한 줄에 3개의 2'F 변형이 존재하지 않는다.
● 위치 9가 퓨린일 경우 센스 가닥의 모든 피리미딘은 2' OMe이고, 위치 5와 11 사이의 1-5개 퓨린은 2' F이되, 단, 한 줄에 3개의 2' F 변형이 존재하지 않는다.
● 안티센스 가닥 홀수 위치는 2'OMe이고 짝수 위치는 2' F 및 2' 데옥시의 혼합물이다.
실시예 7: 변형 모티프 2
예시 siRNA는 다음 변형의 조합을 포함한다:
● 센스 가닥의 위치 9(5'에서 3'으로)는 2' 데옥시이다.
● 센스 가닥 위치 5, 7 및 8은 2' F이다.
● 위치 10-21의 모든 피리미딘은 2' OMe이고, 퓨린은 2' OMe 및 2' F의 혼합물이다. 또는, 위치 10-21의 모든 퓨린은 2' OMe이고 위치 10-21의 모든 피리미딘은 2' OMe 및 2' F의 혼합물이다.
● 안티센스 가닥 홀수 위치는 2' OMe이고 짝수 위치는 2' F 및 2' 데옥시의 혼합물이다.
실시예 8: ETL 포스포아미다이트의 합성
실시예 8A: ETL20 포스포아미다이트의 합성
N-(4-히드록시펜에틸)팔미트아미드(5)의 합성:
12.82그램의 1(팔미트산)을 칭량하여 450 ㎖의 CH2Cl2에 용해시켰다. 16.3 ㎖의 디-이소프로필 에틸 아민(DIEA)을 1의 용액에 첨가하였다. 그 후, 12.88 ㎖의 2(퍼플루오로페닐 2,2,2-트리플루오로아세테이트, "PFP")를 적하하고, 첨가를 완료한 후 10분간 반응물을 교반하였다. PFP 활성화 산의 용액에, 8.26그램의 4(4-(2-아미노에틸)페놀)을 첨가 깔때기를 통해 첨가하고, 첨가 깔때기를 50 ㎖의 CH2Cl2로 헹구었다. 반응물을 아르곤 하에 두고 밤새 교반하였다. 밤새 교반한 후 5가 침전물을 형성하였다. 침전물을 여과를 통해 수집하고, -20℃로 미리 냉각한 75 ㎖ MTBE로 세척하였다. 흰색에서 오프화이트 고체를 고진공 하에 밤새 건조하였다. 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다.
ETL20 포스포아미다이트(6)의 합성: 100 ㎖ 무수 에틸 아세테이트를 N-(4-히드록시펜에틸)팔미트아미드 5(5.2 그램)에 첨가한 다음, 250 mg 3-옹스트롬 분자체를 첨가하였다. 혼합물을 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 50℃에서 가열하여 투명한 용액을 얻었다. 7.3 ㎖의 DIEA를 첨가하고, 혼합물을 빙조에 넣었고, 용액이 탁해졌다. 3-((클로로(디이소프로필아미노)포스파닐)옥시)프로판니트릴(3.5 ㎖)을 탁한 용액에 천천히 첨가하였다. 첨가를 완료한 후, 반응 혼합물을 빙조에서 꺼내고 Ar 하에 실온에서 밤새 교반하였다. 그런 다음, 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(200 ㎖)로 희석하고, 포화 NaHCO3 용액(2x50 ㎖)으로 세척한 다음, 염수(50 ㎖)로 세척하였다. 용액을 Na2SO4로 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 얻어진 잔류물을 실리카겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하고, 2% 트리에틸아민을 함유하는 헥산 중 5-30% 에틸 아세테이트로 용출시켰다.
ETL18(C14) 및 ETL19(C12) 포스포아미다이트는 히드록실벤질아민 및 라우릴산(C12) 또는 미리스트산(C14)으로 ETL20 포스포아미다이트를 생성하는 절차를 사용하여 합성하였다.
실시예 9: 이중체의 유리체 내 주사:
마우스(4-7주령 ICR, Envigo)에 유리체 내 주사를 위해, 유리 미세주사기(10 μL 용량; Hamilton Company)와 함께 33 게이지 바늘을 사용하였다. 눈을 안구돌출시키고 바늘을 적도부 공막을 통해 삽입하여 유리체 방에 약 45도 각도로 삽입하였으며, 수정체의 후방부나 망막에 닿지 않도록 주의하였다. 1 ㎕ 인산 완충 식염수 비히클 중 2.5 또는 1 ㎍의 siRNA 이중체를 유리체에 주사하였다. 주사된 siRNA 이중체는 표 6에 나타낸다.
[표 6]
주사 후 제14일에 마우스를 안락사시켰다. 각 동물의 양쪽 눈을 수거하고 적도에 따라 절개하고, 전방 및 후방 반구를 RNAlater에 넣었다. 균질화된 조직으로부터 총 RNA를 추출하여 First-Strand III cDNA 합성 키트를 사용하여 cDNA로 역전사시켰다. 형광 표지된 TaqMan 프로브/선택된 유전자(ANGPTL7, MYOC, COL1A1, COL5A1, VCAN, FN1, 및 PPIA)의 프라이머 세트를 사용하여 실시간 TaqMan PCR에 의해 정규화된 cDNA 정량화를 수행하였다. 반응은 ABI Prism 7500 Fast Real-Time PCR System Sequence Detection System에서 실행되는 TaqMan Universal PCR Master Mix No AmpErase UNG를 사용하여 20 ㎕ 분액에서 수행하고 7500 System 소프트웨어로 분석하였다. 처리된 샘플과 미처리된 샘플 간의 상대 정량화(RQ) 값을 2-ΔΔCT 공식으로 계산한다. 여기서 CT는 임계값에서의 사이클(자동 측정값)이며, ΔCT는 분석된 유전자의 CT에서 내인성 대조군(PPIA)의 CT를 뺀 값이며, ΔΔCT는 처리된 샘플의 정규화된 분석된 유전자의 ΔCT에서 미처리된 샘플의 동일한 유전자의 ΔCT(캘리브레이터)를 뺀 값이다.
무엇보다도 ETD1928-1930 시리즈는 티라민에 부착된 12-16개의 탄소를 가진 다양한 소수성 기의 유용성을 보여준다. 소수성 기는 센스 가닥의 5' 말단에서 포스포로티오에이트 없이 접합되었다.
[표 7]
실시예 10: 뇌실 내 주사
마우스는 1.0 L/min의 산소로 증발시킨 1.2% 이소플루란을 사용하여 유도 챔버에서 마취 상태로 유도한 다음 마스크를 통해 0.8% 이소플루란으로 마취 상태를 유지하면서 정위 프레임으로 옮겨 고정시켰다. 두개골을 노출시키고 마우스용 표준 U-프레임 정위 장치(Harvard Apparatus 75-1808)와 마취 마스크가 있는 정위 마취 어댑터(Harvard Apparatus 75-1856)를 사용하여 바늘을 브레그마로부터 다음 좌표: 전후 -0.2 mm, 중외측 0.8 mm 및 배복 -2.5 mm에 배치한 후 500 nl min-1로 단일 뇌실 내 주사(5 ㎕, 인공 뇌척수액을 비히클로 사용)을 수행하였다.
[표 8]
마우스는 주사 후 제14일에 안락사시켰다. 각 동물의 뇌를 수거하여 우반구와 좌반구로 절개하였다.
균질화된 조직으로부터 총 RNA를 추출하여 First-Strand III cDNA 합성 키트를 사용하여 cDNA로 역전사시켰다. 형광 표지된 TaqMan 프로브/선택된 유전자(MTRES1, MYOC, COL1A1, COL5A1, VCAN, FN1, 및 PPIA)의 프라이머 세트를 사용하여 실시간 TaqMan PCR에 의해 정규화된 cDNA 정량화를 수행하였다. 반응은 ABI Prism 7500 Fast Real-Time PCR System Sequence Detection System에서 실행되는 TaqMan Universal PCR Master Mix No AmpErase UNG를 사용하여 20 ㎕ 분액에서 수행하고 7500 System 소프트웨어로 분석하였다. 처리된 샘플과 미처리된 샘플 간의 상대 정량화(RQ) 값을 2-ΔΔCT 공식으로 계산하였다. 여기서 CT는 임계값에서의 사이클(자동 측정값)이며, ΔCT는 분석된 유전자의 CT에서 내인성 대조군(PPIA)의 CT를 뺀 값이며, ΔΔCT는 처리된 샘플의 정규화된 분석된 유전자의 ΔCT에서 미처리된 샘플의 동일한 유전자의 ΔCT(캘리브레이터)를 뺀 값이었다.
[표 9]
실시예 11: 래트 척수강 내 주사
siRNA의 척수강 내(IT) 주사에 수컷 Sprague Dawley 래트(n=2)를 사용하였다. 이중체 ETD02273은 인공 뇌척수액(aCSF)에 30 mg ml-1로 제제화하였고, 래트의 척추 등쪽 부위 L3-L5 척추 공간 사이에 요추 천자를 통해 30 ㎕ IT 주사로 투여하였다. 이중체 ETD02210은 인공 뇌척수액(aCSF)에 9 mg ml-1로 제제화하였고, 래트의 척추 등쪽 부위 L3-L5 척추 공간 사이에 요추 천자를 통해 100 ㎕ IT 주사로 투여하였다.
래트를 이소플루란으로 마취한 후, 래트를 따뜻한 가열 패드에 눕혔다. IT 주사 부위를 면도하고 소독하였다. 절개하고 척주를 노출시켰다. 30 게이지 인슐린 주사기로 siRNA를 투여하였다. 바늘의 적절한 위치는 바늘 허브에서 뇌척수액 역류와 꼬리 흔들기를 통해 확인하였다. siRNA 투여가 완료되면 플런저에 30초 동안 부드럽게 일정한 압력을 가하였다. 절개 부위를 봉합하고 조직 접착제로 고정하였다. 래트는 회복될 때까지 가열 패드 위에 흉골 횡와위로 두었다.
래트는 주사 후 제14일에 안락사시켰다. 각 래트의 간, 우/좌(R/L) 전두엽 피질, R/L 측두엽 피질, 해마, 소뇌 및 척수 샘플을 수집하여 처리할 때까지 RNAlater(ThermoFisher 카탈로그 번호 AM7020)에 두었다.
5000 rpm에 설정된 Percellys 24 조직 균질화기(Bertin Instruments)를 2회 10초 주기로 사용하여 하여 균질화 완충액(Maxwell RSC simplyRNA Tissue Kit)에서 간 조직을 균질화하여 간의 총 RNA를 준비하였다. 용해물로부터 얻은 총 RNA는 제조업체의 권장 사항에 따라 Maxwell RSC 48 플랫폼(Promega Corporation)에서 정제하였다. cDNA 준비는 제조업체의 지침에 따라 Quanta qScript cDNA SuperMix(VWR, 카탈로그 번호 95048-500)를 사용하여 수행하였다.
간 MTRES1 mRNA의 상대적 수준은 래트 MTRES1(ThermoFisher, 분석 번호 Rn01441122_m1) 및 래트 항존 유전자 PPIA(ThermoFisher, 분석 번호 Rn03302269_gH)에 대한 TaqMan 분석 및 PerfeCTa® qPCR FastMix®, Low ROX™(VWR, 카탈로그 번호 101419-222)을 사용하여 QuantStudio™ 6 Pro Real-Time PCR System에서 3회 중복하여 RT-qPCR을 통해 평가하였다.
데이터는 처리 받지 않은 동물의 평균 MTRES1 mRNA 수준에 대해 정규화하였다. 결과는 아래 표 10 및 표 11에 나타낸다.
[표 10]
[표 11]
본 발명의 바람직한 실시 양태가 본원에 제시되고 기재되었지만, 이러한 실시 양태가 단지 예시로 제공된다는 것은 당업자에게 명백할 것이다. 이제 당업자는 본 발명에서 벗어나지 않고도 수많은 변형, 변경 및 대체를 생각해 낼 수 있을 것이다. 본원에 기재된 본 발명의 실시 양태에 대한 다양한 대안이 본 발명을 실시하는 데 사용될 수 있음을 이해해야 한다. 다음 청구항은 본 발명의 범위를 정의하고 이러한 청구항의 범위 내의 방법 및 조성물과 그 등가물이 이에 포함되도록 의도한다.
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Claims (58)

  1. 센스 가닥, 안티센스 가닥, 및 센스 또는 안티센스 가닥의 말단에 연결된 지질 모이어티를 포함하는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함하는 조성물로서,
    지질 모이어티는 페닐 또는 시클로헥사닐 링커를 포함하며, 링커는 지질과 센스 또는 안티센스 가닥의 말단에 연결된 것인 조성물.
  2. 제1항에 있어서, 지질과 센스 또는 안티센스 가닥의 말단은 1,4; 1,3; 또는 1,2 치환 패턴으로 페닐 또는 시클로헥사닐 링커에 연결된 것인 조성물.
  3. 제1항에 있어서, 지질과 센스 또는 안티센스 가닥의 말단은 1,4 치환 패턴으로 페닐 또는 시클로헥사닐 링커에 연결된 것인 조성물.
  4. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타내되, 단, R은 옥탄이 아니다.
  5. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다.
  6. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타내고, n은 0-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다.
  7. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타낸다.
  8. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 표 1에 도시된 지질 모이어티를 포함하는 것인 조성물.
  9. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 5' 말단에 연결된 것인 조성물.
  10. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 포스페이트를 통해 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 5' 말단에 연결된 것인 조성물.
  11. 제1항에 있어서, 지질 모이어티는 센스 가닥의 말단에 연결된 것인 조성물.
  12. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥은 5' 비닐 포스포네이트를 포함하는 것인 조성물.
  13. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 것인 조성물.
  14. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥은 1개 또는 2개의 3' 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 것인 조성물.
  15. 제1항에 있어서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 것인 조성물.
  16. 제1항에 있어서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 5' 포스포로티오에이트 결합을 포함하지 않는 것인 조성물.
  17. 제1항에 있어서, 센스 가닥은 5' 포스페이트 결합을 포함하는 것인 조성물.
  18. 제1항에 있어서, 센스 가닥은 1개 또는 2개의 3' 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 것인 조성물.
  19. 제1항에 있어서, 센스 가닥과 관련하여 다음
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨;
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨;
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함;
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨;
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 또는
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함
    중 어느 하나가 성립하나,
    단, 상기의 어느 것에서나 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있는 것인 조성물.
  20. 제19항에 있어서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하는 것인 조성물.
  21. 제19항에 있어서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는 것인 조성물.
  22. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥과 관련하여 다음 중 어느 하나가 성립하는 것인 조성물:
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨;
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨;
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함;
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨;
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨; 또는
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함.
  23. 센스 가닥과 안티센스 가닥을 포함하는 소형 간섭 RNA(siRNA)를 포함하는 조성물로서,
    안티센스 가닥은 비닐 포스포네이트와 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며;
    센스 가닥은 소수성 모이어티를 포함하는 5' 말단, 및 2개의 포스포로티오에이트 결합을 포함하는 3' 말단을 포함하며;
    센스 가닥과 관련하여 다음
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨,
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨,
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함,
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨,
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함함
    중 어느 하나가 성립하나, 단, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함할 수 있으며;
    안티센스 가닥과 관련하여 다음
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨,
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨,
    모든 퓨린 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함,
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨,
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로 및 2'-O-메틸의 혼합물로 변형됨, 또는
    모든 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-O-메틸을 포함하고, 모든 퓨린 뉴클레오시드는 2' 플루오로를 포함함
    중 어느 하나가 성립하는 것인 조성물.
  24. 제23항에 있어서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하는 것인 조성물.
  25. 제23항에 있어서, 센스 가닥은 2' 데옥시 뉴클레오시드를 포함하지 않는 것인 조성물.
  26. 제23항에 있어서, 센스 가닥의 5' 말단은 포스페이트 결합을 통해 연결된 2개의 뉴클레오티드를 포함하고, 포스포로티오에이트 결합에 의한 것은 포함하지 않는 것인 조성물.
  27. 제23항에 있어서, 센스 가닥의 5' 말단은 1개 또는 2개의 포스포로티오에이트 결합을 추가로 포함하는 것인 조성물.
  28. 제23항에 있어서, 소수성 모이어티는 페닐 또는 시클로헥사닐 링커에 의해 센스 가닥의 5' 말단에 연결된 지질을 포함하는 것인 조성물.
  29. 제28항에 있어서, 지질과 센스 가닥의 5' 말단은 1,4; 1,3; 또는 1,2 치환 패턴으로 페닐 또는 시클로헥사닐 링커에 연결된 것인 조성물.
  30. 제28항에 있어서, 지질과 센스 가닥의 5' 말단은 1,4 치환 패턴으로 페닐 또는 시클로헥사닐 링커에 연결된 것인 조성물.
  31. 제28항에 있어서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타내고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이되, 단, R은 옥탄이 아니다.
  32. 제28항에 있어서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다.
  33. 제28항에 있어서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타내고, n은 1-3이고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다.
  34. 제28항에 있어서, 소수성 모이어티는 다음 구조를 포함하는 것인 조성물:
    ;
    여기서 점선은 센스 또는 안티센스 가닥의 말단과의 공유 연결을 나타내고, R은 4-18개의 탄소를 함유하는 알킬기이다.
  35. 제28항에 있어서, 소수성 모이어티는 표 1에 도시된 지질 모이어티를 포함하는 것인 조성물.
  36. 제1항 또는 제23항에 있어서, 센스 가닥과 안티센스 가닥은 이중체를 형성하는 것인 조성물.
  37. 제36항에 있어서, 이중체는 적어도 10개 염기쌍, 적어도 11개 염기쌍, 적어도 12개 염기쌍, 적어도 13개 염기쌍, 적어도 14개 염기쌍, 적어도 15개 염기쌍, 적어도 16개 염기쌍, 적어도 17개 염기쌍, 적어도 18개 염기쌍, 적어도 19개 염기쌍, 적어도 20개 염기쌍, 적어도 21개 염기쌍, 적어도 22개 염기쌍, 적어도 23개 염기쌍, 적어도 24개 염기쌍, 또는 적어도 25개 염기쌍을 포함하는 것인 조성물.
  38. 제36항에 있어서, 이중체는 19개 염기쌍을 포함하는 것인 조성물.
  39. 제36항에 있어서, 이중체는 센스 가닥 돌출부를 포함하는 것인 조성물.
  40. 제39항에 있어서, 센스 가닥 돌출부는 1-4개의 뉴클레오티드를 포함하는 것인 조성물.
  41. 제39항에 있어서, 센스 가닥 돌출부는 2개의 뉴클레오티드를 포함하는 것인 조성물.
  42. 제39항에 있어서, 센스 가닥 돌출부는 우라실을 포함하는 것인 조성물.
  43. 제39항에 있어서, 이중체는 안티센스 가닥 돌출부를 포함하는 것인 조성물.
  44. 제43항에 있어서, 안티센스 가닥 돌출부는 1-4개의 뉴클레오티드를 포함하는 것인 조성물.
  45. 제43항에 있어서, 안티센스 가닥 돌출부는 2개의 뉴클레오티드를 포함하는 것인 조성물.
  46. 제43항에 있어서, 안티센스 가닥 돌출부는 우라실을 포함하는 것인 조성물.
  47. 제23항에 있어서, 안티센스 가닥의 5' 말단은 2개의 포스포로티오에이트 결합으로 분리된 3개의 뉴클레오시드를 포함하는 것인 조성물.
  48. 제23항에 있어서, 안티센스 가닥의 3' 말단은 2개의 포스포로티오에이트 결합으로 분리된 3개의 뉴클레오시드를 포함하는 것인 조성물.
  49. 제1항 또는 제23항에 있어서, 약학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 포함하는 조성물.
  50. 치료를 필요로 하는 대상체에게 유효량의 제49항의 조성물을 투여하는 단계를 포함하는 치료 방법.
  51. 제50항에 있어서, 투여는 피하, 유리체 내, 척수강 내, 또는 뇌실 내 투여를 포함하는 것인 방법.
  52. 제50항에 있어서, siRNA는 대상체의 질병을 매개하는 단백질을 코딩하는 mRNA를 표적화하는 것인 방법.
  53. 제51항에 있어서, mRNA는 대상체의 조직에 있으며, 조직은 눈, 간, 지방, 뇌, 또는 척수를 포함하는 것인 방법.
  54. 세포에 제49항의 조성물을 투여하는 단계를 포함하는, 세포에서 표적 RNA 또는 RNA에 의해 코딩되는 단백질의 양을 감소시키는 방법으로서, 안티센스 가닥은 RNA에 상보적이고 RNA에 결합하는 서열을 포함하는 것인, 세포에서 표적 RNA 또는 RNA에 의해 코딩되는 단백질의 양을 감소시키는 방법.
  55. 제54항에 있어서, 세포에 조성물을 투여하는 단계는 세포를 포함하는 대상체에게 조성물을 투여하는 단계를 포함하는 것인 방법.
  56. 제55항에 있어서, 투여는 피하, 유리체 내, 척수강 내, 또는 뇌실 내 투여를 포함하는 것인 방법.
  57. 제54항에 있어서, 투여는 표적 RNA 또는 RNA에 의해 코딩된 단백질의 측정치를 기준선 측정치 또는 대조군에 비해 적어도 10% 감소시키는 것인 방법.
  58. 제54항에 있어서, 세포는 눈, 간, 지방, 뇌, 또는 척수 세포를 포함하는 것인 방법.
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