JP7366057B2 - 合成ｒｉｇ－ｉ様受容体アゴニスト - Google Patents

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０１８年４月１９日に出願された米国仮出願第６２／６５９，９９９号の利益を主張する。上述の出願の内容全体は、この参照により本明細書に組み込まれる。
細胞に入り込んだ外因性核酸、特に、ウイルス核酸は、自然免疫応答を誘導し、特に、インターフェロン（ＩＦＮ）産生および細胞死といった事象を引き起こす。ウイルスＲＮＡを感知すると、ＲＩＧ－Ｉ様受容体は、Ｉ型インターフェロン（ＩＦＮ）分泌を誘導し、感染した細胞および隣接細胞において、抗ウイルス性ＩＦＮ誘導タンパク質のアップレギュレーションを引き起こし、ウイルス複製を抑制する。さらなる下流の事象は、免疫細胞を引き寄せ、適応免疫応答の引き金となる。これに加え、ＲＩＧ－Ｉリガンドは、多くの異なる種類の腫瘍細胞のアポトーシスを誘導するが、正常細胞のアポトーシスは誘導しないことが報告されている。
免疫調節タンパク質の活性を調節するためのさらなる改良された組成物および方法が依然として必要である。このような薬剤は、癌の免疫療法および他の状態（例えば、慢性感染）の治療に使用することができる。多様な治療免疫調節用途のための改良されたＲＩＧ－Ｉ様受容体リガンドを開発することが必要である。
本開示は、少なくとも部分的に、ＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニストとして機能する合成ＲＮＡ分子の発見に基づく。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与える、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、第１のポリヌクレオチドは、配列モチーフを含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下：
（ｉ）ＧＴリピートモチーフ、
（ｉｉ）ＧＡリピートモチーフ、
（ｉｉｉ）ＡＵＣＧリピートモチーフ、
（ｉｖ）ＡＵリピートモチーフ、
（ｖ）ジピリミジンモチーフ、
（ｖｉ）ジプリンモチーフ、
（ｖｉｉ）ピリミジントリプレットモチーフ、
（ｖｉｉｉ）プリントリプレットモチーフ、
（ｉｘ）回文配列モチーフ、および
（ｘ）（ｉ）～（ｉｘ）のいずれかの組み合わせからなる群から選択される配列モチーフを含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、配列モチーフの組み合わせは、ＧＴリピートモチーフとプリントリプレットモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフの組み合わせは、ＡＵＣＧリピートモチーフとジピリミジンモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフの組み合わせは、ＡＵＧＣリピートモチーフとジプリンモチーフである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、少なくとも１つの改良された生体活性は、
（ｉ）ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、
（ｉｉ）インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、
（ｉｉｉ）ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、
（ｉｖ）ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および
（ｖ）（ｉ）～（ｉｖ）のいずれかの組み合わせから選択される。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介されるＩ型インターフェロン（例えば、ＩＦＮ－α、ＩＦＮ－β）産生を増加させる。いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介されるＩＬ－１β産生を増加させる。いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介されるＩＰ１０産生を増加させる。いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介されるＩＬ－６、ＩＬ－１２ｐ７０、ＭＣＰ－１および／またはＭＩＰ－１β産生を増加させる。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約５～１０個、約５個、約４個、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびチミンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフ（例えば、ＧＴＧＴＧＴ）である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１９個未満のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１５～１８個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１５個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１０～１５個未満のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１０個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約５～１０個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約５個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約４個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの態様において、ＧＴリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびチミンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１８個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１６個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１４個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１２個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１０個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、８個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、６個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、４個のグアニンおよびチミンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、ＧＴリピートモチーフであり、ＧＴリピートモチーフは、［ＧＴ］ｎであり、式中、ｎ＝２～９、３～７または４～８である。いくつかの態様において、ＧＴリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する（作動可能に連結する）第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、第１のポリヌクレオチドは、この配列モチーフを含み、この配列モチーフは、約１４個のグアニンおよびチミンヌクレオチドの配列を含むＧＴリピートモチーフである、ＲＬＲアゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＧＴリピートモチーフであり、ＧＴリピートモチーフは、［ＧＴ］７である。いくつかの態様において、改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、第１のポリヌクレオチドは、この配列モチーフを含み、この配列モチーフは、６個のグアニンおよびチミンヌクレオチドの配列を含むＧＴリピートモチーフである、ＲＬＲアゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＧＴリピートモチーフであり、ＧＴリピートモチーフは、［ＧＴ］３である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＧＴリピートモチーフであり、ＧＴリピートモチーフは、［ＧＴ］３であり、ＧＴリピートモチーフの後が、それぞれプリントリプレットモチーフおよびＵＣＧである。いくつかの実施形態において、プリントリプレットは、ＧＧＡである。いくつかの態様において、改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約５～１０個、約５個、約４個、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフ（例えば、ＧＡＧＡＧＡ）である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１９個未満のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１５～１８個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１５個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１０～１５個未満のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１０個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約５～１０個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約５個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの態様において、ＧＡリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１８個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１６個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１２個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、８個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、６個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドまたはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、ＧＡリピートモチーフであり、ＧＡリピートモチーフは、［ＧＡ］ｎであり、式中、ｎ＝２～９、３～７または４～８である。いくつかの態様において、ＧＡリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、第１のポリヌクレオチドは、この配列モチーフを含み、この配列モチーフは、約１４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドの配列を含むＧＡリピートモチーフである、ＲＬＲアゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＧＡリピートモチーフであり、ＧＡリピートモチーフは、［ＧＡ］７である。いくつかの態様において、ＧＡリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１９個未満、約１６個、約１２～１６個、約１２個、約８～１２個、約６個、１６、１２、８個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフ（例えば、ＡＵＣＧＡＵＣＧ）である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１９個未満のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１６個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１２～１６個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１２個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチドの配列、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約８～１２個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約６個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１６個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１２個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、８個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。いくつかの態様において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、ＡＵＣＧリピートモチーフであり、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］ｎであり、式中、ｎ＝２から４または２、３または４である。いくつかの態様において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、第１のポリヌクレオチドは、この配列モチーフを含み、この配列モチーフは、約１２個のグアニンおよびアデニンヌクレオチドの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである、ＲＬＲアゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３である。いくつかの態様において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、ＲＬＲアゴニストにおいて改良された生体活性を与え、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、このモチーフの前にＣＧまたはジピリミジンモチーフが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＧが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、このモチーフの前にＣＧが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、このモチーフの前にジピリミジンモチーフＣＣが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、このモチーフの前にジプリンモチーフが存在する。いくつかの実施形態において、ジプリンモチーフは、ＧＡである。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、このモチーフの前にジプリンモチーフＧＡが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にジプリンモチーフＩＩが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、１つ以上のウリジンヌクレオシド（Ｕ）は、改変ヌクレオシドで置換される。いくつかの実施形態において、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）である。いくつかの実施形態において、ＡＵＧＣリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、ＡＵＣＧリピートモチーフを構成する１つ以上のウリジンヌクレオシド（Ｕ）は、改変ヌクレオシドで置換され、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）である。いくつかの実施形態において、ＡＵＧＣリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、ＡＵＣＧリピートモチーフを構成する１つ以上のウリジンヌクレオシド（Ｕ）は、改変ヌクレオシドで置換され、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）であり、ＡＵＧＣリピートモチーフの前にＧＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、１つ以上のグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、改変ヌクレオシドで置換される。いくつかの実施形態において、改変ヌクレオシドは、イノシン（Ｉ）である。いくつかの実施形態において、ＡＵＧＣリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、ＡＵＣＧリピートモチーフを構成する１つ以上のグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、改変ヌクレオシドで置換され、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）であり、ＡＵＧＣリピートモチーフの前にＧＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、このモチーフの前にＩＧが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、このモチーフの前にＩＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートを含み、１つ以上のグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、イノシン（Ｉ）で置換され、ＡＵＣＧリピートの前にイノシン（Ｉ）が存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートを構成するグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、イノシン（Ｉ）で置換され、ＡＵＣＧリピートの前にイノシン（Ｉ）が存在し、第１のポリヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、イノシン（Ｉ）を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＡＵＣＧリピートモチーフであり、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２であり、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にジプリンモチーフが存在する。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＡＵＣＧリピートモチーフであり、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２であり、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にジプリンモチーフが存在し、ジプリンモチーフはＧＧである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２であり、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にプリントリプレットモチーフが存在する。いくつかの実施形態において、プリントリプレットモチーフは、ＧＧＧである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＡＵＣＧリピートモチーフであり、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２であり、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にプリントリプレットモチーフが存在し、プリントリプレットモチーフは、ＧＧＧである。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＡＵＣＧリピートモチーフであり、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２であり、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＣＣＣＣＧが存在する。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、ＡＵＣＧリピートモチーフであり、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２であり、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＴＣＧＵＣＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１９個未満のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１５～１８個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１５個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、回文を生成する任意の順序で連結した回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１０～１５個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、約１０個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１８個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１７個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１６個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１５個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１４個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１３個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１２個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１１個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１０個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、９個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、８個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、７個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、６個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、５個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。いくつかの実施形態において、配列モチーフは、４個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する、回文配列である。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、リンカーを含み、このリンカーはＡＵに隣接している。いくつかの実施形態において、リンカーは、ＡＵリピートモチーフに隣接しており、ＡＵリピートモチーフは、［ＡＵ］ｎであり、式中、ｎ＝２～３である。いくつかの実施形態において、ＡＵリピートモチーフは、［ＡＵ］２である。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
式中、Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４のうちの少なくとも１つはイノシンであり、および／またはＸ１および／またはＸ２のうちの少なくとも１つは、少なくとも１つのイノシンヌクレオシドを含み、イノシンヌクレオシドは、ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成する。いくつかの態様において、本開示のＲＬＲアゴニストは、改良された生体活性を有し、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを共有結合する非ヌクレオチドリンカーであり、
イノシンは、存在する場合、シチジンと塩基対を形成する。いくつかの態様において、本開示のＲＬＲアゴニストは、改良された生体活性を有し、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、Ｎ１はイノシンを含み、Ｎ４はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はイノシンを含み、Ｎ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２は、それぞれ１２ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、Ｎ１はシチジンを含み、Ｎ４はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はイノシンを含み、Ｎ３はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はシチジンを含み、Ｎ３はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はイノシンを含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを共有結合する非ヌクレオチドリンカーであり、
イノシンは、存在する場合、シチジンと塩基対を形成し、Ｎ１がイノシンを含み、Ｎ４がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はイノシンを含み、Ｎ３はシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの態様において、本開示のＲＬＲアゴニストは、改良された生体活性を有し、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを共有結合する非ヌクレオチドリンカーであり、
イノシンは、存在する場合、シチジンと塩基対を形成し、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はイノシンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの態様において、本開示のＲＬＲアゴニストは、改良された生体活性を有し、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチドであり、１、２、３または４個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１３ヌクレオチドであり、１、２、３、４または５個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１４ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５または６個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１５ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５、６または７個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１６ヌクレオチドであり、それぞれ１、２、３、４、５、６、７または８個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１２ヌクレオチドであり、少なくとも１０％、２０％、３０％または４０％のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの態様において、本開示のＲＬＲアゴニストは、改良された生体活性を有し、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１は、配列モチーフ［ＡＵＣＮ５］ｘを含み、式中、Ｎ５は、グアノシンまたはイノシンを含み、ｘは、その値が配列モチーフの数を示す整数であり、ｘ＝３または４であり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ２は、配列モチーフ［ＣＮ６ＡＵ］ｙを含み、式中、Ｎ６は、グアノシンまたはイノシンを含み、ｙは、その値が配列モチーフの数を示す整数であり、ｙ＝３または４であり、
（ｉｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
場合により、Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３、およびＮ４のうちの少なくとも１つがイノシンであり、イノシンヌクレオシドが、ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成する。
いくつかの実施形態において、Ｎ５はイノシンを含み、Ｎ６はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ５はグアノシンを含み、Ｎ６はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ５はイノシンを含み、Ｎ６はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ５はグアノシン（Ｇ）を含み、Ｎ６はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、ｘ＝３およびｙ＝３である。いくつかの実施形態において、ｘ＝４およびｙ＝４である。いくつかの実施形態において、Ｎ１はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ４はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ３はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ３はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ２はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ４はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ１はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシン（Ｇ）を含み、Ｎ３およびＮ４はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジン（Ｃ）を含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ３およびＮ４はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジン（Ｃ）を含み、Ｎ３およびＮ４はイノシン（Ｉ）を含む。いくつかの態様において、本開示のＲＬＲアゴニストは、改良された生体活性を有し、この改良された生体活性は、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および上述のいずれかの組み合わせである。
本開示のＲＬＲアゴニストのいくつかの実施形態において、リンカーを含み、リンカーはヌクレオチドリンカーまたは非ヌクレオチドリンカーである。いくつかの実施形態において、リンカーは、非ヌクレオチドリンカーである。いくつかの実施形態において、リンカーは、ヌクレオチドリンカーである。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、テトラループを含み、テトラループのヌクレオチド配列は、以下：
（ａ）ＵＮＣＧ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、Ｇ、またはＵである）、
（ｂ）ＧＮＲＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｒ＝ＡまたはＧである）、
（ｃ）ＡＮＹＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｄ）ＣＵＹＧ（式中、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｅ）ＵＭＡＣ（式中、Ｍ＝ＡまたはＣである）、および
（ｆ）ＣＵＵＧからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、テトラループの配列は、ＵＵＣＧである。いくつかの実施形態において、テトラループの配列は、ＧＡＵＣである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ヌクレオチドリンカーを含み、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵまたはＵＧＵＵＵを含む。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵを含む。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＧＵＵＵを含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含み、非ヌクレオチドリンカーは、以下：
（ａ）エチレングリコールリンカー、および
（ｂ）アルキルリンカーからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、非ヌクレオチドリンカーは、ヘキサエチレングリコールリンカーである。いくつかの実施形態において、非ヌクレオチドリンカーは、Ｃ９アルキルリンカーである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、５’ジホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む。いくつかの実施形態において、アゴニストは、５’トリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む。いくつかの実施形態において、その誘導体もしくはアナログは、ホスフェート生物学的等価体を含み、ホスフェート生物学的等価体は、ホスホネート、チオホスホネート、ホスホロチオエート、サルフェート、スルホネート、スルファメート、チアゾリジノン、カルボキシレート、マロネート、ボロン酸、ベンゾオキサボロール、ボラノホスフェート、スクアラミドから選択される。
いくつかの実施形態において、アゴニストは、改変ヌクレオチド、改変ヌクレオシドもしくは改変核酸塩基、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、アゴニストは、ヌクレオチド間結合またはポリヌクレオチド骨格に対する改変を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下の特性：
（ａ）１つ以上のＲＬＲ（例えば、ＲＩＧ－１、ＭＤＡ５および／またはＬＧＰ２）に特異的に結合する、
（ｂ）ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させる、
（ｃ）インターフェロン誘導遺伝子（ＩＳＧ）のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる、
（ｄ）ＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる、
（ｅ）二本鎖の安定性を高める、
（ｆ）ＲＬＲに対する結合アフィニティを増加させる、
（ｇ）標的外結合を減らす、
（ｈ）生物学的半減期を長くする、
（ｉ）生体内分布とバイオアベイラビリティを高める、
（ｊ）細胞および／または組織への取り込みを増加させ、および／または増強する、
（ｋ）免疫原性を低下させる、および
（ｌ）（ａ）～（ｋ）のいずれかの組み合わせのうちの１つ以上を示す。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
Ｎ１およびＮ２は、それぞれグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はそれぞれシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長であり、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンヌクレオシドを含み、イノシンヌクレオシドは、ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成し、Ｌは、テトラループを含むヌクレオチドリンカーを含み、テトラループのヌクレオチド配列は、ＵＵＣＧである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
Ｎ１はイノシンを含み、Ｎ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はそれぞれシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長であり、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンヌクレオシドを含み、イノシンヌクレオシドは、ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成し、Ｌは、テトラループを含むヌクレオチドリンカーを含み、テトラループのヌクレオチド配列は、ＵＵＣＧである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
Ｎ１およびＮ２は、イノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長であり、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンヌクレオシドを含み、イノシンヌクレオシドは、ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成し、Ｌは、テトラループを含むヌクレオチドリンカーを含み、テトラループのヌクレオチド配列は、ＵＵＣＧである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを共有結合する非ヌクレオチドリンカーであり、
Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長であり、非ヌクレオチドリンカーは、Ｃ９アルキルリンカーである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを共有結合する非ヌクレオチドリンカーであり、
Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ１２ヌクレオチド長であり、非ヌクレオチドリンカーは、ヘキサエチレングリコールリンカーである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５および３６からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、ＲＬＲアゴニストを提供する。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、第１のポリヌクレオチドおよび第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３７および６８、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号３８および６９、
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号３９および７０、
（ｉｖ）それぞれ、配列番号４０および７１、
（ｖ）それぞれ、配列番号４１および７２、
（ｖｉ）それぞれ、配列番号４２および７３、
（ｖｉｉ）それぞれ、配列番号４３および７４、
（ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号４４および７５、
（ｉｘ）それぞれ、配列番号４５および７６、
（ｘ）それぞれ、配列番号４６および７７、
（ｘｉ）それぞれ、配列番号４７および７８、
（ｘｉｉ）それぞれ、配列番号４８および７９、
（ｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号４９および８０、
（ｘｉｖ）それぞれ、配列番号５０および８１、
（ｘｖ）それぞれ、配列番号５１および８２、
（ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５２および８３、
（ｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号５３および８４、
（ｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号５４および８５、
（ｘｉｘ）それぞれ、配列番号５５および８６、
（ｘｘ）それぞれ、配列番号５６および８７、
（ｘｘｉ）それぞれ、配列番号５７および８８、
（ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、
（ｘｘｉｖ）それぞれ、配列番号６０および９０、
（ｘｘｖ）それぞれ、配列番号６１および９１、
（ｘｘｖｉ）それぞれ、配列番号６２および９２、
（ｘｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９１、
（ｘｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号６４および９３、
（ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号６５および９４、
（ｘｘｘ）それぞれ、配列番号６６および９５、
（ｘｘｘｉ）それぞれ、配列番号６７および９６、および
（ｘｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９７からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストが、シチジンと塩基対を形成するイノシンを含む少なくとも１つ以上のヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストが、配列番号２２、２３および２５からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、ＲＬＲアゴニストを提供する。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、シチジンと塩基対を形成するイノシンを含む少なくとも１つ以上のヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、式５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、第１のポリヌクレオチドを含み、（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、第２のポリヌクレオチドを含み、第１のポリヌクレオチドおよび第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、および
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１および９１からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、式５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、第１のポリヌクレオチドを含み、（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、第２のポリヌクレオチドを含み、第１のポリヌクレオチドおよび第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３７および６８、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号３８および６９、
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号３９および７０、
（ｉｖ）それぞれ、配列番号４０および７１、
（ｖ）それぞれ、配列番号４１および７２、
（ｖｉ）それぞれ、配列番号４２および７３、
（ｖｉｉ）それぞれ、配列番号４３および７４、
（ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号４４および７５、
（ｉｘ）それぞれ、配列番号４５および７６、
（ｘ）それぞれ、配列番号４６および７７、
（ｘｉ）それぞれ、配列番号４７および７８、
（ｘｉｉ）それぞれ、配列番号４８および７９、
（ｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号４９および８０、
（ｘｉｖ）それぞれ、配列番号５０および８１、
（ｘｖ）それぞれ、配列番号５１および８２、
（ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５２および８３、
（ｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号５３および８４、
（ｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号５４および８５、
（ｘｉｘ）それぞれ、配列番号５５および８６、
（ｘｘ）それぞれ、配列番号５６および８７、
（ｘｘｉ）それぞれ、配列番号５７および８８、
（ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、
（ｘｘｉｖ）それぞれ、配列番号６０および９０、
（ｘｘｖ）それぞれ、配列番号６１および９１、
（ｘｘｖｉ）それぞれ、配列番号６２および９２、
（ｘｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９１、
（ｘｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号６４および９３、
（ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号６５および９４、
（ｘｘｘ）それぞれ、配列番号６６および９５、
（ｘｘｘｉ）それぞれ、配列番号６７および９６、および
（ｘｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９７からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストのいくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストを含むヌクレオチド配列は、ゲノムＤＮＡ配列またはｍＲＮＡ配列に対して相補性ではなく、ＲＬＲアゴニストは、ＲＮＡ干渉に関与せず、ＲＬＲアゴニストは、遺伝子発現をサイレンシングしない。
いくつかの態様において、本開示は、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を減らすか、または阻害することを必要とする対象においてそれを行うための医薬組成物であって、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストと、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）担体中で製剤化される。いくつかの実施形態において、ＰＥＩ担体は、ＪｅｔＰＥＩ（登録商標）である。
いくつかの態様において、本開示は、細胞における１つ以上のサイトカインのＲＬＲによって媒介される産生を増加させる方法であって、本方法が、細胞と、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストとを接触させることを含み、ＲＬＲアゴニストが、細胞におけるＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させる、方法を提供する。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、細胞におけるＲＬＲによって媒介されるＩ型インターフェロン（例えば、ＩＦＮ－α、ＩＦＮ－β）産生を増加させる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、細胞におけるＲＬＲによって媒介されるＩＬ－１β産生を増加させる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、細胞におけるＲＬＲによって媒介されるＩＰ－１０産生を増加させる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、細胞におけるＲＬＲによって媒介されるＩＬ－６、ＩＬ－１２ｐ７０、ＭＣＰ－１および／またはＭＩＰ－１β産生を増加させる。
いくつかの態様において、本開示は、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる方法であって、本方法が、細胞と、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストとを接触させることを含み、アゴニストが、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、細胞におけるＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる方法であって、本方法が、細胞と、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストとを接触させることを含み、アゴニストが、ＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において免疫応答を刺激する方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において癌を治療するかもしくは進行を遅らせる方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、腫瘍成長を減らすか、または阻害することを必要とする対象においてそれを行う方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を阻害することを必要とする対象においてそれを行う方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物を投与することを含み、アゴニストまたは医薬組成物が、細胞における１つ以上のサイトカインのＲＬＲによって媒介される産生を増加させ、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させ、かつ／または細胞におけるＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させ、それによって、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍の成長を阻害する、方法を提供する。
本開示によって提供される方法のいくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて投与され、１つ以上のさらなる治療薬剤は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬、細胞死誘発剤、オプソニン化剤（例えば、オプソニン化抗体）、細胞毒性薬剤、免疫系療法、サイトカイン、共刺激分子のアクチベータまたはアゴニスト、阻害分子の阻害剤、ワクチン、細胞免疫療法、またはこれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤の投与の前もしくは後に投与されるか、または１つ以上のさらなる治療薬剤が、アゴニストもしくは医薬組成物の投与と同時、投与より前もしくは後に投与される。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト、ＴＩＭ－３アンタゴニスト、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、ＢＴＬＡアンタゴニスト、ＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、ＫＩＲアンタゴニスト、ＬＡＧ－３アンタゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤＲ００１、ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）（ペンブロリズマブ）、ＯＰＤＩＶＯ（登録商標）（ニボルマブ）、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１およびＡＭＰ－２２４からなる群から選択される。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＦＡＺ０５３、ＴＥＮＣＥＮＴＲＩＱ（登録商標）（アテゾリズマブ）、ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標）（アベルマブ）、ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）（デュルバルマブ）およびＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＴＩＭ－３アンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＶＩＳＴＡアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＢＴＬＡアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＴＬＡ－４アンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＩＤＯアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＫＩＲアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＬＡＧ－３アンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニストである。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ３アゴニストは、ポリイノシン酸：ポリシチジル酸（ポリＩ：Ｃ）である。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ３アゴニストは、ＨＩＬＴＯＮＯＬ（登録商標）（ポリＩＣＬＣ）である。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ３アゴニストは、ポリアデニル酸－ポリウリジル酸（ポリＡ：Ｕ）である。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ３アゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＩＭ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）１００）である。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ３アゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＯＮ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０バイオコンジュゲート）である。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ３アゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＯＬ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０）である。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニストである。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ７アゴニストは、ＧＳ－９６２０（ベサトリモド）である。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ７アゴニストは、イミキモド（ＡＬＤＡＲＡ（商標））である。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ７アゴニストは、レシキモド（Ｒ－８４８）である。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである。いくつかの実施形態において、ＴＬＲ９アゴニストは、ＣｐＧオリゴデオキシヌクレオチド（ＣｐＧ ＯＤＮ）である。いくつかの実施形態において、ＣｐＧ ＯＤＮは、クラスＡ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ａ ＯＤＮ）である。いくつかの実施形態において、ＣｐＧ ＯＤＮは、クラスＢ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｂ ＯＤＮ）である。いくつかの実施形態において、ＣｐＧ ＯＤＮは、クラスＣ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｃ ＯＤＮ）である。
いくつかの態様において、本開示は、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を阻害することを必要とする対象においてそれを行うための、場合により、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて使用するための、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物の使用を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を阻害することを必要とする対象においてそれを行うための、場合により、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて使用するための医薬の製造における、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物の使用を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物と、対象における免疫応答を刺激し、または癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または対象における腫瘍成長を阻害する際の使用のための指示書と、場合により１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて使用するための指示書とを含む、キットを提供する。
本開示によって提供される使用またはキットのいくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて投与され、１つ以上のさらなる治療薬剤は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬、細胞死誘発剤、オプソニン化剤（例えば、オプソニン化抗体）、細胞毒性薬剤、免疫系療法、サイトカイン、共刺激分子のアクチベータ、阻害分子の阻害剤、ワクチン、細胞免疫療法、またはこれらの組み合わせからなる群から選択される。
本開示によって提供される使用またはキットのいくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤の投与の前もしくは後に投与されるか、または１つ以上のさらなる治療薬剤が、アゴニストもしくは医薬組成物の投与と同時、投与より前もしくは後に投与される。
本開示によって提供される使用またはキットのいくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト、ＴＩＭ－３アンタゴニスト、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、ＢＴＬＡアンタゴニスト、ＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、ＫＩＲアンタゴニスト、ＬＡＧ－３アンタゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである。
本開示によって提供される使用またはキットのいくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである。
本開示によって提供される使用またはキットのいくつかの実施形態において、本開示１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである。
特許または出願ファイルには、カラーで作成された少なくとも１つの図面が含まれている。カラーの図面を含む、この特許または特許出願公開のコピーは、請求と必要な費用の支払いをすれば、官庁から与えられるだろう。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
(項目１)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、前記第１のポリヌクレオチドは、前記第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、前記二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、前記アゴニストは、配列モチーフを含み、前記配列モチーフは、前記配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、前記ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与える、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目２)
前記配列モチーフが、
（ｉ）ＧＴリピートモチーフ、
（ｉｉ）ＧＡリピートモチーフ、
（ｉｉｉ）ＡＵＣＧリピートモチーフ、
（ｉｖ）ＡＵリピートモチーフ、
（ｖ）ジピリミジンモチーフ、
（ｖｉ）ジプリンモチーフ、
（ｖｉｉ）ピリミジントリプレットモチーフ、
（ｖｉｉｉ）プリントリプレットモチーフ、
（ｉｘ）回文配列モチーフ、および
（ｘ）（ｉ）～（ｉｘ）のいずれかの組み合わせからなる群から選択される、項目１に記載のアゴニスト。
(項目３)
前記少なくとも１つの改良された生体活性が、
（ｉ）ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、
（ｉｉ）インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、
（ｉｉｉ）ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、
（ｉｖ）ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および
（ｖ）（ｉ）～（ｉｖ）のいずれかの組み合わせから選択される、項目１および２に記載のアゴニスト。
(項目４)
前記配列モチーフが、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約５～１０個、約５個、約４個、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびチミンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである、項目１～３に記載のアゴニスト。
(項目５)
前記ＧＴリピートモチーフが［ＧＴ］ ｎ であり、式中、ｎ＝２～９である、項目４に記載のアゴニスト。
(項目６)
前記ＧＴリピートモチーフが［ＧＴ］ ７ である、項目４および５に記載のアゴニスト。
(項目７)
前記ＧＴリピートモチーフが［ＧＴ］ ３ であり、前記ＧＴリピートモチーフの後に、プリントリプレットモチーフおよびＵＣＧのそれぞれが続く、項目４および５に記載のアゴニスト。
(項目８)
前記プリントリプレットモチーフがＧＧＡである、項目７に記載のアゴニスト。
(項目９)
前記配列モチーフが、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約５～１０個、約５個、約４個、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである、項目１～３に記載のアゴニスト。
(項目１０)
前記ＧＡリピートモチーフが［ＧＡ］ ｎ であり、式中、ｎ＝２～９である、項目９に記載のアゴニスト。
(項目１１)
前記ＧＡリピートモチーフが［ＧＡ］ ７ である、項目１０に記載のアゴニスト。
(項目１２)
前記配列モチーフが、１９個未満、約１６個、約１２～１６個、約１２個、約８～１２個、約６個、１６、１２、８個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである、項目１～３に記載のアゴニスト。
(項目１３)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフが［ＡＵＣＧ］ ｎ であり、式中、ｎ＝２～４である、項目１２に記載のアゴニスト。
(項目１４)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフが［ＡＵＣＧ］ ３ である、項目１３に記載のアゴニスト。
(項目１５)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＧまたはジピリミジンモチーフが存在する、項目１２～１４に記載のアゴニスト。
(項目１６)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＧが存在する、項目１５に記載のアゴニスト。
(項目１７)
前記ジピリミジンモチーフがＣＣである、項目１５に記載のアゴニスト。
(項目１８)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にジプリンモチーフが存在する、項目１２～１４に記載のアゴニスト。
(項目１９)
前記ジプリンモチーフがＧＡである、項目１８に記載のアゴニスト。
(項目２０)
前記ジプリンモチーフがＩＩである、項目１８に記載のアゴニスト。
(項目２１)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフを構成するＵが、改変ヌクレオシドで置換されている、項目１２～２０のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目２２)
前記改変ヌクレオシドがリボチミジン（Ｔ）である、項目２１に記載のアゴニスト。
(項目２３)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフを構成するＧが、改変ヌクレオシドで置換されている、項目１２～２０のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目２４)
前記改変ヌクレオシドがイノシン（Ｉ）である、項目２３に記載のアゴニスト。
(項目２５)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＩＧが存在する、項目１２～１４に記載のアゴニスト。
(項目２６)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフを構成するＧがイノシン（Ｉ）で置換され、前記ＡＵＣＧリピートの前にイノシン（Ｉ）が存在する、項目１２～１４に記載のアゴニスト。
(項目２７)
前記第１のポリヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドがイノシン（Ｉ）である、項目２６に記載のアゴニスト。
(項目２８)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフが［ＡＵＣＧ］ ２ である、項目１２および１３に記載のアゴニスト。
(項目２９)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にジプリンモチーフが存在する、項目２８に記載のアゴニスト。
(項目３０)
前記ジプリンモチーフがＧＧである、項目２９に記載のアゴニスト。
(項目３１)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にプリントリプレットが存在する、項目２８に記載のアゴニスト。
(項目３２)
前記プリントリプレットがＧＧＧである、項目３１に記載のアゴニスト。
(項目３３)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＣＣＣＣＧが存在する、項目２８に記載のアゴニスト。
(項目３４)
前記ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＴＣＧＵＣＧが存在する、項目２８に記載のアゴニスト。
(項目３５)
前記配列モチーフが、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５もしくは４個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、回文を生成する任意の順序で連結した回文配列である、項目１～３に記載のアゴニスト。
(項目３６)
前記リンカーがＡＵに隣接している、項目１～３５のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目３７)
前記リンカーが、ＡＵリピートモチーフに隣接しており、前記ＡＵリピートモチーフが［ＡＵ］ ｎ であり、式中、ｎ＝２～３である、項目１～３６のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目３８)
前記ＡＵリピートモチーフが［ＡＵ］ ２ である、項目３７に記載のアゴニスト。
(項目３９)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストが、以下の式：
５’－（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）－Ｌ－（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）は、連結したヌクレオチドＮ １ 、Ｎ ２ およびＸ １ を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）は、連結したヌクレオチドＸ ２ 、Ｎ ３ およびＮ ４ を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ １ 、Ｎ ２ 、Ｎ ３ およびＮ ４ は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ １ はＮ ４ と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ ２ はＮ ３ と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ １ は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ １ およびＸ ２ は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ １ は、Ｘ ２ に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ １ およびＸ ２ は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、前記第１のポリヌクレオチドと前記第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
式中、Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４のうちの少なくとも１つはイノシンであり、および／またはＸ１および／またはＸ２のうちの少なくとも１つは、少なくとも１つのイノシンヌクレオシドを含み、前記イノシンヌクレオシドは、前記ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成する、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目４０)
Ｎ１がイノシンを含み、Ｎ４がシチジンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４１)
Ｎ１がシチジンを含み、Ｎ４がイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４２)
Ｎ２がイノシンを含み、Ｎ３がシチジンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４３)
Ｎ２がシチジンを含み、Ｎ３がイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４４)
Ｎ１がグアノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４５)
Ｎ２がグアノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４６)
Ｎ１がシチジンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４７)
Ｎ２がシチジンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４８)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目４９)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がグアノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５０)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５１)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５２)
Ｎ１がイノシンを含み、Ｎ４がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５３)
Ｎ２がイノシンを含み、Ｎ３がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５４)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５５)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５６)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５７)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５８)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目５９)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６０)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６１)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がイノシンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６２)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６３)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２がイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６４)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１２ヌクレオチドであり、１、２、３または４個のイノシンヌクレオシドを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６５)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１３ヌクレオチドであり、１、２、３、４または５個のイノシンヌクレオシドを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６６)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１４ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５または６個のイノシンヌクレオシドを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６７)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１５ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５、６または７個のイノシンヌクレオシドを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６８)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１６ヌクレオチドであり、それぞれが１、２、３、４、５、６、７または８個のイノシンヌクレオシドを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目６９)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１２ヌクレオチドであり、少なくとも１０％、２０％、３０％または４０％のイノシンヌクレオシドを含む、項目３９に記載のアゴニスト。
(項目７０)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストが、以下の式：
５’－（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）－Ｌ－（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）は、連結したヌクレオチドＮ １ 、Ｎ ２ およびＸ １ を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）は、連結したヌクレオチドＸ ２ 、Ｎ ３ およびＮ ４ を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ １ 、Ｎ ２ 、Ｎ ３ およびＮ ４ は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ １ はＮ ４ と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ ２ はＮ ３ と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ １ は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ １ は、配列モチーフ［ＡＵＣＮ ５ ］ ｘ を含み、式中、Ｎ ５ は、グアノシンまたはイノシンを含み、ｘは、その値が配列モチーフの数を示す整数であり、ｘ＝３または４であり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ ２ は、配列モチーフ［ＣＮ ６ ＡＵ］ ｙ を含み、式中、Ｎ６は、グアノシンまたはイノシンを含み、ｙは、その値が配列モチーフの数を示す整数であり、ｙ＝３または４であり、
（ｉｘ）Ｌは、前記第１のポリヌクレオチドと前記第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
場合により、Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３、およびＮ４のうちの少なくとも１つがイノシンであり、前記イノシンヌクレオシドが、前記ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成する、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目７１)
Ｎ５がイノシンを含み、Ｎ６がイノシンを含む、項目７０に記載のアゴニスト。
(項目７２)
Ｎ５がグアノシンを含み、Ｎ６がイノシンを含む、項目７１に記載のアゴニスト。
(項目７３)
Ｎ５がイノシンを含み、Ｎ６がグアノシンを含む、項目７２に記載のアゴニスト。
(項目７４)
Ｎ５がグアノシン（Ｇ）を含み、Ｎ６がグアノシン（Ｇ）を含む、項目７３に記載のアゴニスト。
(項目７５)
ｘ＝３およびｙ＝３である、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目７６)
ｘ＝４およびｙ＝４である、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目７７)
Ｎ１がイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ４がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目７８)
Ｎ２がイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ３がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目７９)
Ｎ３がイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ２がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８０)
Ｎ４がイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ１がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８１)
Ｎ１がグアノシン（Ｇ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８２)
Ｎ２がグアノシン（Ｇ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８３)
Ｎ１がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８４)
Ｎ２がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８５)
Ｎ１およびＮ２がグアノシン（Ｇ）を含み、Ｎ３およびＮ４がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８６)
Ｎ１およびＮ２がシチジン（Ｃ）を含み、Ｎ３およびＮ４がグアノシン（Ｇ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８７)
Ｎ１およびＮ２がイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ３およびＮ４がシチジン（Ｃ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８８)
Ｎ１およびＮ２がシチジン（Ｃ）を含み、Ｎ３およびＮ４がイノシン（Ｉ）を含む、項目７０～７４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目８９)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストが、非ヌクレオチドリンカーを含む、平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、前記アゴニストが、以下の式：
５’－（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）－Ｌ－（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）は、連結したヌクレオチドＮ １ 、Ｎ ２ およびＸ １ を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）は、連結したヌクレオチドＸ ２ 、Ｎ ３ およびＮ ４ を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ １ 、Ｎ ２ 、Ｎ ３ およびＮ ４ は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ １ はＮ ４ と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ ２ はＮ ３ と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ １ は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ １ およびＸ ２ は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ １ は、Ｘ ２ に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ １ およびＸ ２ は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、前記第１のポリヌクレオチドと前記第２のポリヌクレオチドを共有結合する非ヌクレオチドリンカーであり、
イノシンは、存在する場合、シチジンと塩基対を形成する、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目９０)
Ｎ１がイノシンを含み、Ｎ４がシチジンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９１)
Ｎ１がシチジンを含み、Ｎ４がイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９２)
Ｎ２がイノシンを含み、Ｎ３がシチジンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９３)
Ｎ２がシチジンを含み、Ｎ３がイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９４)
Ｎ１がグアノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９５)
Ｎ２がグアノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９６)
Ｎ１がシチジンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９７)
Ｎ２がシチジンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９８)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目９９)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がグアノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１００)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０１)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０２)
Ｎ１がイノシンを含み、Ｎ４がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０３)
Ｎ２がイノシンを含み、Ｎ３がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０４)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０５)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０６)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０７)
Ｎ１およびＮ２がグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０８)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１０９)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１０)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１１)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がイノシンを含み、Ｘ１および／またはＸ２がそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１２)
Ｎ１およびＮ２がイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４がシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２がイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１３)
Ｎ１およびＮ２がシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４がイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２がイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１４)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１２ヌクレオチドであり、１、２、３または４個のイノシンヌクレオシドを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１５)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１３ヌクレオチドであり、１、２、３、４または５個のイノシンヌクレオシドを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１６)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１４ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５または６個のイノシンヌクレオシドを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１７)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１５ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５、６または７個のイノシンヌクレオシドを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１８)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１６ヌクレオチドであり、それぞれが１、２、３、４、５、６、７または８個のイノシンヌクレオシドを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１１９)
Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１２ヌクレオチドであり、少なくとも１０％、２０％、３０％または４０％のイノシンヌクレオシドを含む、項目８９に記載のアゴニスト。
(項目１２０)
前記リンカーが、ヌクレオチドリンカーまたは非ヌクレオチドリンカーである、項目１～８８のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１２１)
前記リンカーが、非ヌクレオチドリンカーである、項目１２０に記載のアゴニスト。
(項目１２２)
前記リンカーが、ヌクレオチドリンカーである、項目１２０に記載のアゴニスト。
(項目１２３)
前記ヌクレオチドリンカーが、テトラループを含み、前記テトラループのヌクレオチド配列が、以下：
（ａ）ＵＮＣＧ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、Ｇ、またはＵである）、
（ｂ）ＧＮＲＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｒ＝ＡまたはＧである）、
（ｃ）ＡＮＹＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｄ）ＣＵＹＧ（式中、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｅ）ＵＭＡＣ（式中、Ｍ＝ＡまたはＣである）、および
（ｆ）ＣＵＵＧからなる群から選択される、項目１２２に記載のアゴニスト。
(項目１２４)
前記ヌクレオチドリンカーが、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵまたはＵＧＵＵＵを含む、項目１２２に記載のアゴニスト。
(項目１２５)
前記テトラループの配列がＵＵＣＧである、項目１２３に記載のアゴニスト。
(項目１２６)
前記テトラループの配列がＧＡＵＣである、項目１２３に記載のアゴニスト。
(項目１２７)
前記ヌクレオチドリンカーが、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵを含む、項目１２４に記載のアゴニスト。
(項目１２８)
前記ヌクレオチドリンカーが、ヌクレオチド配列ＵＧＵＵＵを含む、項目１２４に記載のアゴニスト。
(項目１２９)
前記非ヌクレオチドリンカーが、
（ａ）エチレングリコールリンカー、および
（ｂ）アルキルリンカーからなる群から選択される、項目１２１または項目８９～１１９のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１３０)
前記非ヌクレオチドリンカーが、ヘキサエチレングリコールリンカーである、項目１２９に記載のアゴニスト。
(項目１３１)
前記非ヌクレオチドリンカーが、Ｃ９アルキルリンカーである、項目１２９に記載のアゴニスト。
(項目１３２)
前記アゴニストが、５’ジホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む、項目１～１３１のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１３３)
前記アゴニストが、５’トリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む、項目１～１３１のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１３４)
前記その誘導体もしくはアナログが、ホスフェート生物学的等価体を含み、前記ホスフェート生物学的等価体が、ホスホネート、チオホスホネート、ホスホロチオエート、サルフェート、スルホネート、スルファメート、チアゾリジノン、カルボキシレート、マロネート、ボロン酸、ベンゾオキサボロール、ボラノホスフェート、スクアラミドから選択される、項目１３２または１３３に記載のアゴニスト。
(項目１３５)
前記アゴニストが、改変ヌクレオチド、改変ヌクレオシドもしくは改変核酸塩基、またはこれらの組み合わせを含む、項目１～１３４のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１３６)
前記アゴニストが、ヌクレオチド間結合またはポリヌクレオチド骨格に対する改変を含む、項目１～１３５のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１３７)
前記アゴニストが、以下の特性：
（ａ）１つ以上のＲＬＲ（例えば、ＲＩＧ－１、ＭＤＡ５および／またはＬＧＰ２）に対して特異的に結合する、
（ｂ）ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させる、
（ｃ）インターフェロン誘導遺伝子（ＩＳＧ）のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる、
（ｄ）ＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる、
（ｅ）二本鎖の安定性を高める、
（ｆ）ＲＬＲに対する結合アフィニティを増加させる、
（ｇ）標的外結合を減らす、
（ｈ）生物学的半減期を長くする、
（ｉ）生体内分布とバイオアベイラビリティを高める、
（ｊ）細胞および／または組織への取り込みを増加させ、および／または増強する、
（ｋ）免疫原性を低下させる、および
（ｌ）（ａ）～（ｋ）のいずれかの組み合わせのうちの少なくとも１つ以上を示す、項目１～１３６のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１３８)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、前記アゴニストは、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５および３６からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目１３９)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、前記第１のポリヌクレオチドは、前記第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、前記二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、前記アゴニストは、配列モチーフを含み、前記配列モチーフは、前記配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、前記ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、前記第１のポリヌクレオチドおよび前記第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３７および６８、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号３８および６９、
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号３９および７０、
（ｉｖ）それぞれ、配列番号４０および７１、
（ｖ）それぞれ、配列番号４１および７２、
（ｖｉ）それぞれ、配列番号４２および７３、
（ｖｉｉ）それぞれ、配列番号４３および７４、
（ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号４４および７５、
（ｉｘ）それぞれ、配列番号４５および７６、
（ｘ）それぞれ、配列番号４６および７７、
（ｘｉ）それぞれ、配列番号４７および７８、
（ｘｉｉ）それぞれ、配列番号４８および７９、
（ｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号４９および８０、
（ｘｉｖ）それぞれ、配列番号５０および８１、
（ｘｖ）それぞれ、配列番号５１および８２、
（ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５２および８３、
（ｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号５３および８４、
（ｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号５４および８５、
（ｘｉｘ）それぞれ、配列番号５５および８６、
（ｘｘ）それぞれ、配列番号５６および８７、
（ｘｘｉ）それぞれ、配列番号５７および８８、
（ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、
（ｘｘｉｖ）それぞれ、配列番号６０および９０、
（ｘｘｖ）それぞれ、配列番号６１および９１、
（ｘｘｖｉ）それぞれ、配列番号６２および９２、
（ｘｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９１、
（ｘｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号６４および９３、
（ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号６５および９４、
（ｘｘｘ）それぞれ、配列番号６６および９５、
（ｘｘｘｉ）それぞれ、配列番号６７および９６、および
（ｘｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９７からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目１４０)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストが、シチジンと塩基対を形成するイノシンを含む少なくとも１つ以上のヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、前記アゴニストが、配列番号２２、２３および２５からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目１４１)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストは、シチジンと塩基対を形成するイノシンを含む少なくとも１つ以上のヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、前記アゴニストは、式５’－（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）－Ｌ－（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）－３’を含み、式中、（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）は、第１のポリヌクレオチドを含み、（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）は、第２のポリヌクレオチドを含み、前記第１のポリヌクレオチドおよび前記第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、および
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１および９１からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目１４２)
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、前記アゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、前記アゴニストは、式５’－（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）－Ｌ－（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）－３’を含み、式中、（Ｎ １ －Ｎ ２ －Ｘ １ ）は、第１のポリヌクレオチドを含み、（Ｘ ２ －Ｎ ３ －Ｎ ４ ）は、第２のポリヌクレオチドを含み、前記第１のポリヌクレオチドおよび前記第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３７および６８、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号３８および６９、
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号３９および７０、
（ｉｖ）それぞれ、配列番号４０および７１、
（ｖ）それぞれ、配列番号４１および７２、
（ｖｉ）それぞれ、配列番号４２および７３、
（ｖｉｉ）それぞれ、配列番号４３および７４、
（ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号４４および７５、
（ｉｘ）それぞれ、配列番号４５および７６、
（ｘ）それぞれ、配列番号４６および７７、
（ｘｉ）それぞれ、配列番号４７および７８、
（ｘｉｉ）それぞれ、配列番号４８および７９、
（ｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号４９および８０、
（ｘｉｖ）それぞれ、配列番号５０および８１、
（ｘｖ）それぞれ、配列番号５１および８２、
（ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５２および８３、
（ｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号５３および８４、
（ｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号５４および８５、
（ｘｉｘ）それぞれ、配列番号５５および８６、
（ｘｘ）それぞれ、配列番号５６および８７、
（ｘｘｉ）それぞれ、配列番号５７および８８、
（ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、
（ｘｘｉｖ）それぞれ、配列番号６０および９０、
（ｘｘｖ）それぞれ、配列番号６１および９１、
（ｘｘｖｉ）それぞれ、配列番号６２および９２、
（ｘｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９１、
（ｘｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号６４および９３、
（ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号６５および９４、
（ｘｘｘ）それぞれ、配列番号６６および９５、
（ｘｘｘｉ）それぞれ、配列番号６７および９６、および
（ｘｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９７からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
(項目１４３)
前記アゴニストは、前記アゴニストを含む前記ヌクレオチド配列は、ゲノムＤＮＡ配列またはｍＲＮＡ配列に対して相補性ではなく、前記ＲＬＲアゴニストは、ＲＮＡ干渉に関与せず、前記ＲＬＲアゴニストは、遺伝子発現をサイレンシングしない、項目１～１４２のいずれか一項に記載のアゴニスト。
(項目１４４)
免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を減らすか、または阻害することを必要とする対象においてそれを行うための医薬組成物であって、項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストと、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
(項目１４５)
前記アゴニストが、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）担体中で製剤化される、項目１４４に記載の医薬組成物。
(項目１４６)
前記ＰＥＩ担体が、ＪｅｔＰＥＩ（登録商標）である、項目１４５に記載の医薬組成物。
(項目１４７)
細胞における１つ以上のサイトカインのＲＬＲによって媒介される産生を増加させる方法であって、前記方法が、前記細胞と、項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストとを接触させることを含み、前記アゴニストが、細胞におけるＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させる、方法。
(項目１４８)
細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる方法であって、前記方法が、前記細胞と、項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストとを接触させることを含み、前記アゴニストが、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる、方法。
(項目１４９)
細胞におけるＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる方法であって、前記方法が、前記細胞と、項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストとを接触させることを含み、前記アゴニストが、ＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる、方法。
(項目１５０)
対象において免疫応答を刺激する方法であって、前記方法が、前記対象に、有効量の項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストまたは項目１４４～１４６のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
(項目１５１)
対象において癌を治療するかまたは進行を遅らせる方法であって、前記方法が、前記対象に、有効量の項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストまたは項目１４４～１４６のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
(項目１５２)
腫瘍成長を減らすか、または阻害することを必要とする対象においてそれを行う方法であって、前記方法が、前記対象に、有効量の項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストまたは項目１４４～１４６のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
(項目１５３)
免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を阻害することを必要とする対象においてそれを行う方法であって、前記方法が、前記対象に、有効量の項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストまたは項目１４４～１４６のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記アゴニストまたは前記医薬組成物が、細胞における１つ以上のサイトカインのＲＬＲによって媒介される産生を増加させ、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させ、かつ／または細胞におけるＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させ、それによって、前記免疫応答を刺激し、前記癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または前記腫瘍の成長を阻害する、方法。
(項目１５４)
前記アゴニストまたは医薬組成物が、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて投与され、前記１つ以上のさらなる治療薬剤は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬、細胞死誘発剤、オプソニン化剤（例えば、オプソニン化抗体）、細胞毒性薬剤、免疫系療法、サイトカイン、共刺激分子のアクチベータまたはアゴニスト、阻害分子の阻害剤、ワクチン、細胞免疫療法、またはこれらの組み合わせからなる群から選択される、項目１５０～１５３のいずれか一項に記載の方法。
(項目１５５)
前記アゴニストまたは医薬組成物が、前記１つ以上のさらなる治療薬剤の投与の前もしくは後に投与されるか、または前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、前記アゴニストもしくは医薬組成物の投与と同時、投与より前もしくは後に投与される、項目１５４に記載の方法。
(項目１５６)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト、ＴＩＭ－３アンタゴニスト、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、ＢＴＬＡアンタゴニスト、ＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、ＫＩＲアンタゴニスト、ＬＡＧ－３アンタゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである、項目１５４または１５５に記載の方法。
(項目１５７)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである、項目１５４または１５５に記載の方法。
(項目１５８)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである、項目１５４または１５５に記載の方法。
(項目１５９)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６０)
前記ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストが、ＰＤＲ００１、ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）（ペンブロリズマブ）、ＯＰＤＩＶＯ（登録商標）（ニボルマブ）、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１およびＡＭＰ－２２４からなる群から選択される、項目１５９に記載の方法。
(項目１６１)
前記ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストが、ＦＡＺ０５３、ＴＥＮＣＥＮＴＲＩＱ（登録商標）（アテゾリズマブ）、ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標）（アベルマブ）、ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）（デュルバルマブ）およびＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される、項目１５９に記載の方法。
(項目１６２)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＴＩＭ－３アンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６３)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＶＩＳＴＡアンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６４)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６５)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６６)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６７)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＢＴＬＡアンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６８)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＣＴＬＡ－４アンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１６９)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＩＤＯアンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１７０)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＫＩＲアンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１７１)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＬＡＧ－３アンタゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１７２)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１７３)
前記ＴＬＲ３アゴニストは、ポリイノシン酸：ポリシチジル酸（ポリＩ：Ｃ）である、項目１７２に記載の方法。
(項目１７４)
前記ＴＬＲ３アゴニストは、ＨＩＬＴＯＮＯＬ（登録商標）（ポリＩＣＬＣ）である、項目１７２に記載の方法。
(項目１７５)
前記ＴＬＲ３アゴニストは、ポリアデニル酸－ポリウリジル酸（ポリＡ：Ｕ）である、項目１７２に記載の方法。
(項目１７６)
前記ＴＬＲ３アゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＩＭ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）１００）である、項目１７２に記載の方法。
(項目１７７)
前記ＴＬＲ３アゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＯＮ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０バイオコンジュゲート）である、項目１７２に記載の方法。
(項目１７８)
前記ＴＬＲ３アゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＯＬ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０）である、項目１７２に記載の方法。
(項目１７９)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１８０)
前記ＴＬＲ７アゴニストは、ＧＳ－９６２０（ベサトリモド）である、項目１７９に記載の方法。
(項目１８１)
前記ＴＬＲ７アゴニストは、イミキモド（ＡＬＤＡＲＡ（商標））である、項目１７９に記載の方法。
(項目１８２)
前記ＴＬＲ７アゴニストは、レシキモド（Ｒ－８４８）である、項目１７９に記載の方法。
(項目１８３)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである、項目１５６に記載の方法。
(項目１８４)
前記ＴＬＲ９アゴニストは、ＣｐＧオリゴデオキシヌクレオチド（ＣｐＧ ＯＤＮ）である、項目１８３に記載の方法。
(項目１８５)
前記ＣｐＧ ＯＤＮが、クラスＡ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ａ ＯＤＮ）である、項目１８４に記載の方法。
(項目１８６)
前記ＣｐＧ ＯＤＮが、クラスＢ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｂ ＯＤＮ）である、項目１８４に記載の方法。
(項目１８７)
前記ＣｐＧ ＯＤＮが、クラスＣ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｃ ＯＤＮ）である、項目１８４に記載の方法。
(項目１８８)
免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を阻害することを必要とする対象においてそれを行うための、場合により、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて使用するための、項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストまたは項目１４４～１４６のいずれか一項に記載の医薬組成物の使用。
(項目１８９)
免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を阻害することを必要とする対象においてそれを行うための、場合により、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて使用するための医薬の製造における、項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストまたは項目１４４～１４６のいずれか一項に記載の医薬組成物の使用。
(項目１９０)
項目１～１４３のいずれか一項に記載のアゴニストまたは項目１４４～１４６のいずれか一項に記載の医薬組成物と、対象における免疫応答を刺激し、または癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または対象における腫瘍成長を阻害する際の使用のための指示書と、場合により１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて使用するための指示書とを含む、キット。
(項目１９１)
前記アゴニストまたは医薬組成物が、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて投与され、前記１つ以上のさらなる治療薬剤は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬、細胞死誘発剤、オプソニン化剤（例えば、オプソニン化抗体）、細胞毒性薬剤、免疫系療法、サイトカイン、共刺激分子のアクチベータ、阻害分子の阻害剤、ワクチン、細胞免疫療法、またはこれらの組み合わせからなる群から選択される、項目１８８に記載の使用または項目１９０に記載のキット。
(項目１９２)
前記アゴニストまたは医薬組成物が、前記１つ以上のさらなる治療薬剤の投与の前もしくは後に投与されるか、または前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、前記アゴニストもしくは医薬組成物の投与と同時、投与より前もしくは後に投与される、項目１９１に記載の使用またはキット。
(項目１９３)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト、ＴＩＭ－３アンタゴニスト、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、ＢＴＬＡアンタゴニスト、ＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、ＫＩＲアンタゴニスト、ＬＡＧ－３アンタゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである、項目１８８、１８９、１９１または１９２のいずれか一項に記載の使用または項目１９０～１９２に記載のキット。
(項目１９４)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである、項目１８８、１８９、１９１または１９２のいずれか一項に記載の使用または項目１９０～１９２に記載のキット。
(項目１９５)
前記１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである、項目１８８、１８９、１９１または１９２のいずれか一項に記載の使用または項目１９０～１９２に記載のキット。
３つの異なる濃度の種々の改変を含むＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニストで処理されたヒトＰＢＭＣからのＩＦＮ－ａ分泌の定量化を示す棒グラフを提供する。
概要
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）は、ウイルスＲＮＡを検出し、自然免疫応答を開始するのに不可欠な細胞質パターン認識受容体のファミリーである。ＲＬＲファミリーには、レチノイン酸誘導遺伝子Ｉ（Ｒｅｔｉｎｏｉｃ ａｃｉｄ－ｉｎｄｕｃｉｂｌｅ ｇｅｎｅ Ｉ：ＲＩＧ－Ｉ）、メラノーマ分化関連遺伝子５（Ｍｅｌａｎｏｍａ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ－ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｇｅｎｅ ５：ＭＤＡ５）およびラボラトリー・オブ・ジェネティクス・アンド・フィジオロジー２（Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ ２：ＬＧＰ２）の３種類のメンバーが含まれる。これらの受容体は、免疫細胞型および非免疫細胞型の両方で発現し、Ｉ型およびＩＩＩ型のインターフェロン（ＩＦＮ）のＩＲＦ３依存性発現、ＩＲＦ７依存性発現、炎症性サイトカインのＮＦ－κＢ依存性発現を促進するシグナル伝達経路を調節する。
３種類のＲＬＲファミリー受容体は全て、ＡＴＰａｓｅ活性を有するＤＥｘＤ／ＨボックスＲＮＡヘリカーゼドメインを有する。このドメインは、隣接するＣ末端ドメインと共に、ＲＮＡ結合に必要である。これに加え、ＲＩＧ－ＩおよびＬＧＰ２のＣ末端ドメインは、抑制ドメインとして作用することが示されており、この受容体が活性化ＲＮＡに結合するまでは不活性な構成を維持するのを確実にする。
本開示は、二本鎖ｄｓＲＮＡを形成するように折り畳まれ、１つ以上の改良された生体活性を与える１つ以上の配列モチーフを含む合成ＲＮＡ分子を含むＲＬＲアゴニストを提供する。
定義
特許請求の範囲および明細書で使用される用語は、特に指定のない限り、以下に示すように定義される。親の仮特許出願で使用される用語と直接的に矛盾する場合には、本出願で使用される用語が優先する。
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」および「その（ｔｈｅ）」は、その内容が明確に他の意味であることを示していない限り、複数の指示対象物を含むことを注記しなければならない。さらに、文脈で特に必要とされない限り、単数形の用語は、複数形を含み、複数形の用語は、単数形を含むものとする。
約：本明細書で使用される場合、「約」（または「およそ」）という用語は、当業者によって理解され、使用される文脈に応じて、ある程度まで変化する。使用される文脈を考慮して、当業者にとって明確ではない用語を使用する場合、「約」は、特定の値の±１０％までを意味する。
アゴニスト：本明細書で使用される場合、「アゴニスト」という用語は、その最も広い意味で使用され、本明細書で開示される天然ポリペプチドの生体活性を部分的または完全に促進し、誘導し、増加させ、および／または活性化する任意の分子または化合物を包含する。本開示のアゴニスト分子は、核酸（例えば、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド）、抗体または抗原結合フラグメント、天然ポリペプチドのフラグメントまたはアミノ酸配列バリアント、ペプチド、オリゴヌクレオチド、脂質、炭水化物および低分子有機分子を含んでいてもよい。いくつかの実施形態において、アゴニスト存在下での活性化は、用量に依存する様式で観察される。いくつかの実施形態において、測定されたシグナル（例えば、生体活性）は、同等の条件下で陰性対照を用いて測定されたシグナルよりも少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％または少なくとも約１００％大きい。本明細書では、本開示の方法で使用するのに適したアゴニストを特定する方法も開示される。例えば、これらの方法としては、限定されないが、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、Ｆｏｒｔｅ Ｂｉｏ（著作権）システム、蛍光偏光（ＦＰ）アッセイおよびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）などの結合アッセイが挙げられる。これらのアッセイは、アゴニストが目的のポリペプチド（例えば、受容体またはリガンド）に結合する能力を決定し、したがって、アゴニストがそのポリペプチドの活性を促進するか、増加させるか、または活性化する能力を示す。アゴニストの有効性は、機能アッセイを用いても決定することができる（例えば、アゴニストがポリペプチドの機能を活性化するか、または促進する能力）。例えば、機能アッセイは、ポリペプチドと候補アゴニスト分子とを接触させることと、そのポリペプチドに通常関連する１つ以上の生体活性の検出可能な変化を測定することとを含んでいてもよい。アゴニストの効力は、通常、そのＥＣ５０値（アゴニスト応答の５０％を活性化するために必要な濃度）によって定義される。ＥＣ５０値が小さいほど、アゴニストの効力は大きくなり、最大生体応答を活性化するために必要な濃度は小さくなる。
改良する：本明細書で使用される場合、「改良する（ａｍｅｌｉｏｒａｔｉｎｇ）」という用語は、予防、重篤度または進行を軽減する、寛解または治癒を含む、ある疾患状態（例えば、癌）の治療における任意の治療に有益な結果を指す。
アミノ酸：本明細書で使用される場合、「アミノ酸」という用語は、天然に存在するアミノ酸および合成アミノ酸だけではなく、天然に存在するアミノ酸と類似した様式で機能するアミノ酸アナログおよびアミノ酸模倣物を指す。天然に存在するアミノ酸は、遺伝子コードによってコードされるものだけではなく、その後に改変されるアミノ酸、例えば、ヒドロキシプロリン、γ－カルボキシグルタミン酸およびＯ－ホスホセリンである。アミノ酸アナログは、天然に存在するアミノ酸と同じ基本化学構造（すなわち、水素に結合する炭素、カルボキシル基、アミノ基およびＲ基）を有する化合物、例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニンスルホキシド、メチオニンメチルスルホニウムを指す。このようなアナログは、改変Ｒ基（例えば、ノルロイシン）または改変ペプチド骨格を有するが、天然に存在するアミノ酸と同じ基本化学構造を保持している。アミノ酸模倣物は、アミノ酸の一般的な化学構造とは異なる構造を有するが、天然に存在するアミノ酸と同様の様式で機能する化学化合物を指す。
アミノ酸は、本明細書では、その一般的に知られている３文字の記号によって、またはＩＵＰＡＣ－ＩＵＢ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎによって推奨される１文字の記号のいずれかによって参照されてもよい。同様に、ヌクレオチドは、一般的に受け入れられている１文字コードによって参照されてもよい。
アミノ酸置換：本明細書で使用される場合、「アミノ酸置換」は、所定のアミノ酸配列（開始ポリペプチドのアミノ酸配列）中の少なくとも１つの存在するアミノ酸残基を、第２の異なる「置き換え」アミノ酸残基と置き換えることを指す。「アミノ酸挿入」は、所定のアミノ酸配列への少なくとも１つのさらなるアミノ酸の組み込みを指す。挿入は、通常、１個または２個のアミノ酸残基の挿入からなるが、より大きな「ペプチド挿入」、例えば、約３～約５個、または約１０、１５または２０個までのアミノ酸残基の挿入を行うこともできる。挿入される残基は、上に開示するように、天然に存在するものであってもよく、または天然に存在しないものであってもよい。「アミノ酸欠失」は、所定のアミノ酸配列からの少なくとも１つのさらなるアミノ酸の除去を指す。
塩基組成：本明細書で使用される場合、「塩基組成」という用語は、グアニン（またはヒポキサンチン）＋シトシンおよび／またはウラシル（またはチミン）＋アデニン核酸塩基からなる核酸（例えば、ＲＮＡ）の全ヌクレオチドの割合を指す。
塩基対：本明細書で使用される場合、「塩基対」という用語は、特定の水素結合の形成を介して相互作用する、対向する相補的なポリヌクレオチド鎖上の２つの核酸塩基、または同じ鎖の領域を指す。本明細書で使用される場合、「ワトソンクリック塩基対形成」という用語は、「相補的な塩基対形成」と相互に置き換え可能に使用され、一連の塩基対形成規則を指し、ＤＮＡ分子において、核酸塩基アデニン（Ａ）がチミン（Ｔ）と相補的な塩基対を形成し、グアニン（Ｇ）がシトシン（Ｃ）と相補的な塩基対を形成するように、プリンは常にピリミジンと結合する。ＲＮＡ分子において、チミンは、ウラシル（Ｕ）によって置き換えられ、ウラシル（Ｕ）は、チミン（Ｔ）と同様に、アデニン（Ａ）と相補的な塩基対を形成する。相補的な塩基対は、水素結合によって結合されており、水素結合の数は、塩基対ごとに異なる。当該技術分野で知られているように、グアニン（Ｇ）－シトシン（Ｃ）塩基対は、３個の水素結合によって結合しており、アデニン（Ａ）－チミン（Ｔ）またはウラシル（Ｕ）塩基対は、２個の水素結合によって結合している。
これらの規則に従わない塩基対形成相互作用によって、天然、非天然および合成の核酸が生じる可能性があり、これらは本明細書では「非ワトソンクリック塩基対形成」またはこれに代えて「非カノニカル塩基対形成」と呼ばれる。「ゆらぎ塩基対」は、ワトソンクリック塩基対規則に従わない、ＲＮＡ分子中の２つの核酸塩基間の対形成である。例えば、イノシンは、グアノシンと構造的に類似したヌクレオシドであるが、２－アミノ基を欠いている。イノシンは、上述の４種類の核酸塩基それぞれと２個の水素結合を形成することができ（Ｏｄａら、（１９９１）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ １９：５２６３－５２６７）、研究者らによって「普遍的な」塩基として使用されることが多く、このことは、全ての天然に存在する塩基またはカノニカル塩基と塩基対形成が可能であることを意味している。４種類の主なゆらぎ塩基対は、グアニン－ウラシル（Ｇ－Ｕ）塩基対、ヒポキサンチン－ウラシル（Ｉ－Ｕ）塩基対、ヒポキサンチン－アデニン（Ｉ－Ａ）塩基対およびヒポキサンチン－シトシン（Ｉ－Ｃ）塩基対である。核酸の命名法の一貫性を維持するために、ヒポキサンチンはイノシンの核酸塩基であるため、ヒポキサンチンには「Ｉ」が使用され、その他の命名法は、核酸塩基とその対応するヌクレオシドの名称に従う（例えば、グアニンおよびグアノシンだけではなく、デオキシグアノシンも「Ｇ」）。ゆらぎ塩基対の熱力学的安定性は、ワトソンクリック塩基対の熱力学的安定性と同等である。ゆらぎ塩基対は、ＲＮＡ分子の二次構造の形成において、役割を果たす。
一態様において、本開示は、１つ以上のＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）をアゴナイズするか、または活性化する合成ＲＮＡ分子であって、イノシンを、シチジンと塩基対（Ｉ－Ｃ塩基対）を形成する位置にのみ挿入することができ、すなわち、イノシンは、グアノシンを置換することができるが、他のヌクレオシドを置換することができない、合成ＲＮＡ分子を提供する。
生物学的に活性：本明細書で使用される場合、「生物学的に活性」という句は、生体系および／または生物において活性を有する任意の物質の特徴を指す。例えば、生物に投与されたときに、その生物に対して生物学的効果を有し、したがって、「生体活性」を有する物質は、生物学的に活性であるとみなされる。特定の実施形態において、核酸が生物学的に活性である場合、核酸全体の少なくとも１つの生体活性を共有するその核酸の一部は、典型的には、「生物学的に活性」な部分と呼ばれる。
共有結合する：本明細書で使用される場合、「共有結合する」（これに代えて、「コンジュゲーションする」、「連結する」、「接続する」、「融合する」または「つなぎ止められる」）という用語は、２つ以上の部分に関して使用される場合、その部分が、化学共役、組換え技術または酵素活性を含む何らかの手段によって、直接的に、または連結剤として機能する１つ以上のさらなる部分を介し、物理的に会合するか、または互いに接続して、その構造が使用される条件（例えば、生理学的条件）下でその部分が物理的に会合したままであるように十分に安定な構造を形成することを意味する。
相補的：本明細書で使用される場合、「相補的」または「相補性」という用語は、２つのポリヌクレオチド鎖を含むヌクレオチドの配列、または同じポリヌクレオチド鎖の複数の領域、およびその鎖または領域を含む二本鎖の生成の間の関係を指し、２本の鎖または領域の間の連続した塩基対形成の程度は、二本鎖構造の生成にとって十分なものである。アデニン（Ａ）は、チミン（Ｔ）またはウラシル（Ｕ）と共に特定の水素結合または「塩基対」を形成することが知られている。同様に、シトシン（Ｃ）は、グアニン（Ｇ）と塩基対を形成することが知られている。非カノニカル核酸塩基（例えば、イノシン）は、天然の塩基と水素結合をすることができることも知られている。ポリヌクレオチドの第１の鎖、またはある領域、またはその一部もしくはフラグメントを含むヌクレオチドの配列は、同じかまたは異なる核酸の第２の鎖、またはある領域、またはその一部もしくはフラグメントを含むヌクレオチドの配列に対して、第１および第２の鎖が、逆平行の様式で整列しており、この２本の鎖間の塩基対形成の程度が、この二本鎖構造が使用される条件（例えば、細胞における生理学的条件）下で二本鎖構造を維持するものである場合、「十分に相補性」であるといわれる。ポリヌクレオチドの相補性鎖または領域は、非相補性のいくつかの塩基対を含んでいてもよいことを理解すべきである。相補性は、「部分的」であってもよく、この場合、ポリヌクレオチドを含む核酸塩基の一部のみが、塩基対形成規則に従ってマッチングされる。または、核酸間に「完全な」または「全体的な」相補性があってもよい。ポリヌクレオチド鎖または領域の間の相補性の程度は、その鎖または領域の間のハイブリダイゼーションの効率および強度に大きな影響を与えるが、２つの相補性ポリヌクレオチドが全てのヌクレオチド位置で塩基対を形成する必要はない。いくつかの実施形態において、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して１００％または「完全に」相補性であり、したがって、全てのヌクレオチド位置で塩基対を形成する。いくつかの実施形態において、第１のポリヌクレオチドは、１００％相補性ではなく（例えば、９０％、または８０％または７０％相補性であり）、１つ以上のヌクレオチド位置にミスマッチしたヌクレオチドを含む。完全な相補性が望まれることが多いが、いくつかの実施形態は、１個以上、ただし好ましくは６、５、４、３、２または１個のミスマッチを含んでいてもよい。
接触させる：本明細書で使用される場合、「接触させる」という用語は、２つ以上のエンティティ間の物理的な接続を確立することを意味する。例えば、細胞と、ある薬剤（例えば、ＲＮＡ、脂質ナノ粒子組成物、または本開示の他の医薬組成物）とを接触させることは、その細胞と薬剤が、物理的な接続を共有するように作られることを意味する。インビボ、インビトロおよびエクスビボの全てで、細胞と外部エンティティとを接触させる方法は、生物学分野でよく知られている。本開示の例示的な実施形態において、哺乳動物細胞と、ある組成物（例えば、単離されたＲＮＡ、ナノ粒子、または本開示の医薬組成物）とを接触させる工程は、インビボで行われる。例えば、脂質ナノ粒子組成物と、生物（例えば、哺乳動物）内に配置され得る細胞（例えば、哺乳動物細胞）とを接触させることは、任意の適切な投与経路（例えば、静脈内、筋肉内、皮内および皮下投与を含む、生物に対する非経口投与）によって行われてもよい。インビトロで存在する細胞について、ある組成物（例えば、脂質ナノ粒子または単離されたＲＮＡ）と細胞は、例えば、組成物を、細胞の培地に加えることによって接触させてもよく、トランスフェクションを含んでいてもよく、または結果としてトランスフェクションしてもよい。さらに、２以上の細胞が、薬剤と接触してもよい。
変性：本明細書で使用される場合、「変性」という用語は、核酸中の塩基対を形成したヌクレオチド間の水素結合が破壊され、二次および／または三次核酸構造が失われる（例えば、既にアニーリングした鎖の分離）プロセスを指す。変性は、核酸に対する外来物質、エネルギーまたは生化学プロセスの適用によって起こることがある。
抗原提示細胞：「抗原提示細胞」または「ＡＰＣ」という用語は、ＭＨＣと複合体を形成する外来抗原をその表面で提示する細胞である。Ｔ細胞は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）を用い、この複合体を認識する。ＡＰＣの例としては、限定されないが、樹状細胞（ＤＣ）、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、単球（例えばＴＨＰ－１）、Ｂリンパ芽球細胞（例えば、Ｃ１Ｒ．Ａ２、１５１８ Ｂ－ＬＣＬ）および単球由来樹状細胞（ＤＣ）が挙げられる。いくつかのＡＰＣは、食作用によって、または受容体が媒介するエンドサイトーシスによって、抗原をインターナリゼーションする。
アポトーシス：本明細書で使用される場合、「アポトーシス」という用語は、多細胞生物（例えば、ヒト）で起こるプログラムされた細胞死のプロセスを指す。アポトーシスを引き起こす高度に制御された生化学事象および分子事象は、膜ブレブ形成、細胞体積の縮小、染色体ＤＮＡの凝縮およびフラグメント化、ならびにｍＲＮＡの崩壊を含め、細胞に対して観測可能で特徴的な形態学的変化をもたらすことがある。アポトーシスを起こしている細胞（Ｔ細胞を含む）を特定する一般的な方法は、細胞を、フルオロフォアがコンジュゲーションしたタンパク質（アネキシンＶ）に曝露することである。アネキシンＶは、原形質膜の外葉にあるホスファチジルセリンに結合する能力によってアポトーシス細胞を検出するために一般的に使用され、細胞がアポトーシスのプロセスを受けていることの初期の指標である。
平滑末端：本明細書で使用される場合、「平滑末端」、「平滑末端化された」という用語は、二重になっているかまたは二本鎖を形成する核酸の末端の構造を指し、二本鎖を含む両方の相補性鎖が、少なくとも一方の末端で、塩基対で終結する。したがって、二本鎖を構成するどちらの鎖も、もう一方よりも末端からさらに延びていない。
癌抗原：本明細書で使用される場合、「癌抗原」は、（ｉ）腫瘍特異的抗原、例えばネオ抗原、（ｉｉ）腫瘍関連抗原、（ｉｉｉ）腫瘍特異的抗原を発現する細胞、（ｉｖ）腫瘍関連抗原を発現する細胞、（ｖ）腫瘍上の胎児性抗原、（ｖｉ）自己腫瘍細胞、（ｖｉｉ）腫瘍特異的膜抗原、（ｖｉｉｉ）腫瘍関連膜抗原、（ｉｘ）成長因子受容体、（ｘ）成長因子リガンド、および（ｘｉ）癌に関連する任意の他の種類の抗原または抗原提示細胞または物質を指す。
癌腫：本明細書で使用する場合、「癌腫」という用語は、当技術分野で認識されており、呼吸器系癌腫、消化器系癌腫、泌尿生殖器癌腫、精巣癌腫、乳癌腫、前立腺癌腫、内分泌系癌腫および黒色腫を含む、上皮組織または内分泌組織の悪性腫瘍を指す。本明細書に記載のＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを使用して、腎臓癌腫または黒色腫を含む任意の種類の癌を有するか、有することが疑われるか、または癌が進行するリスクが高い可能性がある患者を治療することができる。例示的な癌腫としては、子宮頸部、肺、前立腺、乳房、頭頸部、結腸および卵巣の組織から形成されるものが挙げられる。この用語には、癌性肉腫も含まれ、癌性肉腫には、癌性組織および肉腫性組織から構成される悪性腫瘍が含まれる。「腺癌」は、腺組織に由来する癌腫、または腫瘍細胞が認識可能な腺腔構造を形成するものを指す。
細胞障害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答：本明細書で使用される場合、「細胞障害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答」という用語は、細胞障害性Ｔ細胞によって誘導される免疫応答を指す。ＣＴＬ応答は、ＣＤ８＋Ｔ細胞によって主に媒介される。
二本鎖：本明細書で使用する場合、「二本鎖」という用語は、二本鎖ポリヌクレオチドの相補性鎖、または自身で折り畳まれる一本鎖ポリヌクレオチドの相補性領域によって作られる構造を指す。核酸の二本鎖構造は、相補性ヌクレオチド配列が一緒に結合するか、または塩基対相互作用によってハイブリダイズする結果として生じる。
ＥＣ５０：本明細書で使用される場合、「ＥＣ５０」という用語は、インビトロアッセイまたはインビボアッセイのいずれかにおいて、最大応答の５０％である、すなわち、最大応答とベースラインとの間の中間である、アゴニストの濃度を指す。
有効用量：本明細書で使用する場合、「有効用量」または「有効投薬量」という用語は、所望な効果を達成するか、または少なくとも部分的に達成するのに十分な量として定義される。
ヘアピンＲＮＡ：本明細書で使用される場合、「ヘアピンＲＮＡ」または「ＲＮＡヘアピン」という用語は、塩基対形成して、対になっていないヌクレオチドを含む、対になっていないヌクレオチドのループ（例えば、テトラループ）を含むヌクレオチドリンカーの一方の末端で、または柔軟な化学部分（例えば、エチレングリコール）を含む非ヌクレオチドリンカーで終結し、そのいずれかが相補性ヌクレオチド鎖と接続する二本鎖を形成する相補性ヌクレオチド鎖で構成される二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）ステムを含む、自己相補性ＲＮＡを指す。ＲＮＡヘアピンは、ステムの長さ、ループおよび／またはリンカーの大きさおよび／または組成、ステム内の塩基対ミスマッチの数、および実際のヌクレオチド配列が異なっている場合がある。ＲＮＡヘアピンは、限定されないが、ヘアピンを含むＲＮＡ分子の全体的な折り畳みを導くこと、リボザイム中の相互作用を決定すること、メッセンジャーＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）を変性から保護すること、ＲＮＡ結合タンパク質についての認識モチーフまたは構造として機能すること、および酵素反応の基質として作用することを含め、１つ以上の機能を与えてもよい。ＲＮＡヘアピン構造および機能のさらなる記載は、ＳｖｏｂｏｄａおよびＤｉ Ｃａｒａ（２００６）Ｃｅｌｌ Ｍｏｌ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ ６３（７－８）：９０１－９０８、およびその中に含まれる参考文献の中に見出すことができる。いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストを含むヘアピンＲＮＡのステム領域は、５’トリホスフェートまたはジホスフェートを有する平滑末端で終結する。
必要とする：本明細書で使用される場合、「予防を必要とする」、「治療を必要とする」または「～を必要とする」対象は、適切な医療従事者（例えば、ヒトの場合には医者、看護師、または看護従事者、非ヒト哺乳動物の場合には獣医）の判断によって、所与の治療（例えば、ＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニストを含む組成物を用いた治療）から合理的に利益を受ける対象を指す。
リンカー：本明細書で使用される場合、「リンカー」（これに代えて、「テザー」または「スペーサー」）という用語は、２つのポリヌクレオチド鎖または領域を一緒に共有結合し、付着し、またはカップリングする部分を指す。本明細書中で使用される場合、ヌクレオチドを含むリンカーは、「ヌクレオチドリンカー」（例えば、テトラループ）と呼ばれる。本明細書で使用される場合、「非ヌクレオチドリンカー」という用語は、化学部分を含み、ヌクレオチドを含まないリンカーを指す。非ヌクレオチドリンカーの非限定的な例としては、エチレングリコール（例えば、ヘキサエチレングリコール）、アルキル鎖（例えば、Ｃ９アルキルリンカー）およびスチルベンジエーテルを含むリンカーが挙げられる。リンカーのさらなる記載は、Ｐａｒｅｄｅｓら、（２０１１）Ｍｅｔｈｏｄｓ ５４：２５１－２５９の中に見出すことができ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ＬＧＰ２：本明細書で使用される場合、「ＬＧＰ２」という用語は、ラボラトリー・オブ・ジェネティクス・アンド・フィジオロジー２（Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ ２）ポリペプチドを指し、ＲＩＧ－Ｉ様受容体ファミリーの具体的なメンバーであり、ヒトではＤＨＸ５８遺伝子によってコードされる。当該技術分野において、ＬＧＰ２の代替名称および頭字語としては、ＤＨＸ５８、Ｄ１１ＬＧＰ２、Ｄ１１Ｉｇｐ２ｅおよびＲＬＲ－３が挙げられる。全長ヒトＬＧＰ２の例示的なアミノ酸配列は、表４（配列番号１００）およびここに示されている。
MELRSYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRAAAYVAKRHLETVDGAKVVVLVNRVHLVTQHGEEFRRMLDGRWTVTTLSGDMGPRAGFGHLARCHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELTVFSLIVVDECHHTHKDTVYNVIMSQYLELKLQRAQPLPQVLGLTASPGTGGASKLDGAINHVLQLCANLDTWCIMSPQNCCPQLQEHSQQPCKQYNLCHRRSQDPFGDLLKKLMDQIHDHLEMPELSRKFGTQMYEQQVVKLSEAAALAGLQEQRVYALHLRRYNDALLIHDTVRAVDALAALQDFYHREHVTKTQILCAERRLLALFDDRKNELAHLATHGPENPKLEMLEKILQRQFSSSNSPRGIIFTRTRQSAHSLLLWLQQQQGLQTVDIRAQLLIGAGNSSQSTHMTQRDQQEVIQKFQDGTLNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARADQSVYAFVATEGSRELKRELINEALETLMEQAVAAVQKMDQAEYQAKIRDLQQAALTKRAAQAAQRENQRQQFPVEHVQLLCINCMVAVGHGSDLRKVEGTHHVNVNPNFSNYYNVSRDPVVINKVFKDWKPGGVISCRNCGEVWGLQMIYKSVKLPVLKVRSMLLETPQGRIQAKKWSRVPFSVPDFDFLQHCAENLSDLSLD
（ＮＣＢＰ寄託番号：ＮＰ＿０７７０２４．２）。
局所投与：本明細書で使用される場合、「局所投与」または「局所送達」は、血管系を介して組成物または薬剤をその意図する標的組織または部位に運ぶことに依存しない送達を指す。例えば、組成物は、組成物または薬剤の注射または移植によって、または組成物または薬剤を含むデバイスの注射または移植によって送達されてもよい。標的組織または部位の近傍に局所投与した後、組成物または薬剤、またはその１つ以上の成分は、意図した標的組織または部位に拡散してもよい。
ＭＤＡ５：本明細書で使用される場合、「ＭＤＡ５」という用語は、メラノーマ分化関連タンパク質５（Ｍｅｌａｎｏｍａ Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ－Ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ ５）ポリペプチドを指し、ＲＩＧ－Ｉ様受容体ファミリーの具体的なメンバーであり、ヒトではＩＦＩＨ１遺伝子によってコードされる。当該技術分野において、ＭＤＡ５の代替名称および頭字語としては、ＡＧＳ７、Ｈｌｃｄ、ＩＤＤＭ１９、ＭＤＡ－５、ＲＬＲ－２、ＳＧＭＲＴ１、およびヘリカーゼＣドメイン１で誘導されたインターフェロンが挙げられる。全長ヒトＭＤＡ５の例示的なアミノ酸配列は、表４（配列番号９９）およびここに示されている。
MSNGYSTDENFRYLISCFRARVKMYIQVEPVLDYLTFLPAEVKEQIQRTVATSGNMQAVELLLSTLEKGVWHLGWTREFVEALRRTGSPLAARYMNPELTDLPSPSFENAHDEYLQLLNLLQPTLVDKLLVRDVLDKCMEEELLTIEDRNRIAAAENNGNESGVRELLKRIVQKENWFSAFLNVLRQTGNNELVQELTGSDCSESNAEIENLSQVDGPQVEEQLLSTTVQPNLEKEVWGMENNSSESSFADSSVVSESDTSLAEGSVSCLDESLGHNSNMGSDSGTMGSDSDEENVAARASPEPELQLRPYQMEVAQPALEGKNIIICLPTGSGKTRVAVYIAKDHLDKKKKASEPGKVIVLVNKVLLVEQLFRKEFQPFLKKWYRVIGLSGDTQLKISFPEVVKSCDIIISTAQILENSLLNLENGEDAGVQLSDFSLIIIDECHHTNKEAVYNNIMRHYLMQKLKNNRLKKENKPVIPLPQILGLTASPGVGGATKQAKAEEHILKLCANLDAFTIKTVKENLDQLKNQIQEPCKKFAIADATREDPFKEKLLEIMTRIQTYCQMSPMSDFGTQPYEQWAIQMEKKAAKEGNRKERVCAEHLRKYNEALQINDTIRMIDAYTHLETFYNEEKDKKFAVIEDDSDEGGDDEYCDGDEDEDDLKKPLKLDETDRFLMTLFFENNKMLKRLAENPEYENEKLTKLRNTIMEQYTRTEESARGIIFTKTRQSAYALSQWITENEKFAEVGVKAHHLIGAGHSSEFKPMTQNEQKEVISKFRTGKINLLIATTVAEEGLDIKECNIVIRYGLVTNEIAMVQARGRARADESTYVLVAHSGSGVIEHETVNDFREKMMYKAIHCVQNMKPEEYAHKILELQMQSIMEKKMKTKRNIAKHYKNNPSLITFLCKNCSVLACSGEDIHVIEKMHHVNMTPEFKELYIVRENKALQKKCADYQINGEIICKCGQAWGTMMVHKGLDLPCLKIRNFVVVFKNNSTKKQYKKWVELPITFPNLDYSECCLFSDED
（ＮＣＢＩ寄託番号：ＮＰ＿０７１４５１．２）。
改変：本明細書で使用される場合、「改変された」または「改変」は、ポリヌクレオチド（例えば、ＲＮＡ）の改変から生じる構造中の変化した状態または変化を指す。ポリヌクレオチドは、化学的、構造的および／または機能的なものを含め、種々の様式で改変されてもよい。例えば、本開示のＲＮＡ分子は、機能性配列または二次構造を含む、生体活性を与える非天然塩基または配列モチーフの組み込みによって改変されてもよい。一実施形態において、ＲＮＡは、例えば、天然リボヌクレオチドＡ、Ｕ、ＧおよびＣに関連するように、非天然塩基または化学改変された塩基、ヌクレオシドおよび／またはヌクレオチドの導入によって改変される。
天然に存在する：本明細書で使用される場合、ある物体に適用される「天然に存在する」という用語は、ある物体が自然界で見つけることができるという事実を指す。例えば、天然の供給源から単離することができる生物（ウイルスを含む）中に存在し、実験室で人工的に意図的に改変されていないポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列、またはその成分、例えば、アミノ酸またはヌクレオチドは、天然に存在する。
核酸：本明細書で使用される場合、「核酸」という用語は、一本鎖または二本鎖のいずれかの形態のデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド、およびそれらのポリマーまたはオリゴマーを指す。特に限定しない限り、この用語は、参照核酸と同様の結合特性を有し、天然に存在するヌクレオチドと同様の方法で代謝される、天然ヌクレオチドの既知のアナログを含む核酸を包含する。ヌクレオチドのポリマーは、「ポリヌクレオチド」と呼ばれる。本開示の例示的な核酸またはポリヌクレオチドとしては、限定されないが、リボ核酸（ＲＮＡ）、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、ＤＮＡ－ＲＮＡハイブリッド、ＲＮＡｉ誘導剤、ＲＮＡｉ剤、ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、アンチセンスＲＮＡ、リボザイム、触媒ＤＮＡ、三重らせん形成を誘導するＲＮＡ、トレオース核酸（ＴＮＡ）、グリコール核酸（ＧＮＡ）、ペプチド核酸（ＰＮＡ）、ロックド核酸（ＬＮＡ、β－Ｄ－リボ構成を有するＬＮＡ、α－Ｌ－リボ配置（ＬＮＡのジアステレオマー）を有するα－ＬＮＡ、２’－アミノ官能基を有する２’－アミノ－ＬＮＡ、および２’－アミノ官能基を有する２’－アミノ－α－ＬＮＡ）、またはこれらのハイブリッドが挙げられる。
本明細書で使用されるポリヌクレオチドは、任意のポリリボヌクレオチドまたはポリデオキシリボヌクレオチドで構成されていてもよく、非改変ＲＮＡまたはＤＮＡ、または改変ＲＮＡまたはＤＮＡであってもよい。例えば、ポリヌクレオチドは、一本鎖および二本鎖のＤＮＡ、一本鎖領域と二本鎖領域の混合物であるＤＮＡ、一本鎖および二本鎖のＲＮＡ、一本鎖領域と二本鎖領域の混合物であるＲＮＡ、一本鎖であってもよく、またはより典型的には、二本鎖、または一本鎖領域と二本鎖領域の混合物であってもよいＤＮＡとＲＮＡとを含むハイブリッド分子で構成されていてもよい。これに加えて、ポリヌクレオチドは、ＲＮＡまたはＤＮＡ、またはＲＮＡとＤＮＡの両方を含む三本鎖領域で構成されていてもよい。ポリヌクレオチドは、安定性またはその他の理由のために改変された１つ以上の改変塩基またはＤＮＡもしくはＲＮＡ骨格も含んでいてもよい。「改変」塩基としては、例えば、トリチル化塩基が挙げられる。「改変ヌクレオシド」としては、例えば、イノシンおよびチミンが挙げられ、後者のチミンは、ＲＮＡ中に見出されるか、またはＲＮＡを構成する。種々の改変がＤＮＡおよびＲＮＡに対してなされていてもよく、したがって、「ポリヌクレオチド」は、化学的、酵素的または代謝的に改変された形態を包含する。
核酸構造：本明細書で使用される場合、「核酸構造」という用語は、核酸（例えば、ＲＮＡ）を含む核酸塩基の原子、化学成分、要素、モチーフおよび／または配列の配置または組織化を指し、および／または核酸の二次元または三次元の状態を指していてもよい。したがって、「ＲＮＡ構造」という用語は、ＲＮＡ分子（例えば、ｍＲＮＡ）を含む核酸塩基の原子、化学成分、要素、モチーフおよび／または配列の配置または組織化を指し、および／またはＲＮＡ分子の二次元および／または三次元の状態を指していてもよい。核酸構造は、組織化の複雑さが増すことに基づいて、「分子構造」、「一次構造」、「二次構造」および「三次構造」と本明細書で呼ばれる４つの組織化カテゴリーにさらに分けることができる。
核酸塩基：本明細書で使用される場合、「核酸塩基」（これに代えて「ヌクレオチド塩基」または「窒素塩基」）という用語は、核酸またはその一部もしくはセグメントに対して改良された特性（例えば、結合アフィニティ、ヌクレアーゼ耐性、化学安定性）を付与する、天然に存在するプリンおよびピリミジンの任意の誘導体またはアナログを含む、核酸中に見出されるプリンおよびピリミジンヘテロ環化合物を指す。アデニン、シトシン、グアニン、チミンおよびウラシルは、天然の核酸中に主に見出される主要な核酸塩基または標準的な核酸塩基である。他の天然、非天然、非カノニカルおよび／または合成核酸塩基は、核酸（例えば、本明細書に開示されるもの）に組み込むことができる。
ヌクレオシド／ヌクレオチド：本明細書で使用される場合、「ヌクレオシド」という用語は、核酸塩基（例えば、プリンもしくはピリミジン）、またはその誘導体もしくはアナログ（本明細書では「核酸塩基」とも呼ばれる）に共有結合する、糖分子（例えば、ＲＮＡ中のリボースもしくはＤＮＡ中のデオキシリボース）、またはその誘導体もしくはアナログを含む化合物を指す。本明細書で使用される場合、「ヌクレオチド」という用語は、リン酸基に共有結合したヌクレオシドを指す。本明細書で使用される場合、「リボヌクレオシド」という用語は、リボースおよび核酸塩基（例えば、アデノシン（Ａ）、シチジン（Ｃ）、グアノシン（Ｇ）、５－メチルウリジン（ｍ５Ｕ）、ウリジン（Ｕ）またはイノシン（Ｉ））を含むヌクレオシドを指す。
作動可能に連結される：本明細書で使用される場合、核酸、またはそのフラグメントもしくは一部、例えば、ポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドは、別の核酸配列、またはそのフラグメントもしくは一部と機能的関係におかれる場合、「作動可能に連結される」。
ポリヌクレオチド／オリゴヌクレオチド：本明細書で使用される場合、「ポリヌクレオチド」および「オリゴヌクレオチド」という用語は、相互に置き換え可能に使用され、天然に存在する塩基、糖および糖間（骨格）結合からなるヌクレオチドまたはヌクレオシドモノマーの一本鎖または二本鎖のポリマーまたはオリゴマーを指す。「ポリヌクレオチド」および「オリゴヌクレオチド」という用語は、同様に機能する、天然に存在しない塩基、糖および糖間（骨格）結合を含むポリマーおよびオリゴマー、またはその一部も含む。「ポリヌクレオチド」という用語は、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態を包含するため、ポリヌクレオチドは、任意の特定の長さのヌクレオチド配列に限定されない。短いポリヌクレオチドは、典型的には、当該技術分野では「オリゴヌクレオチド」と呼ばれる。本開示の内容において、このような改変または置換されたポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドは、その改変が、限定されないが、サイトカイン産生の増加、細胞への取り込みの向上および／またはヌクレアーゼ存在下での安定性の増加を含め、１つ以上の望ましいかまたは有益な生体特性または活性を高めるため、天然形態よりも好ましいことが多い。いくつかの実施形態において、本開示のアゴニストは、１つ以上の有益な特性を付与するか、または生体活性を高める（例えば、ヌクレアーゼ耐性の増加、細胞への取り込みの増加、二本鎖安定性の増加、標的ポリペプチドに対する結合アフィニティの増加）改変ヌクレオチドの少なくとも１つの領域を含むポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドを含む。
回文配列：本明細書中で使用される場合、「回文配列」（または「回文」）という用語は、自己相補性であるヌクレオチドの配列を指す。５’から３’方向へのヌクレオチドの配列は、５’から３’に読み取ったときに、相補性鎖を含むヌクレオチドの配列と同じである。例えば、配列５’－ＡＣＣＴＡＧＧＴ－３’は、その相補性配列３’－ＴＧＧＡＴＣＣＡ－５’が、５’から３’方向に読み取ったときに、元々の配列と同じであるため、回文配列である。これとは対照的に、配列５’－ＡＧＴＧＧＣＴＧ－３’は、その相補性配列３’－ＴＣＡＣＣＧＡＣ－５’が、５’から３’方向に読み取ったときに、元々の配列と同じではないため、回文配列ではない。
一実施形態では、アゴニストは、第１のオリゴヌクレオチドで構成され、第１のオリゴヌクレオチドの配列は、回文配列である。別の実施形態では、アゴニストは、第１のオリゴヌクレオチドで構成され、第１のオリゴヌクレオチドは、回文配列を含む。
本発明の好ましいオリゴヌクレオチドにおける回文配列は、好ましくは、オリゴヌクレオチドの５’末端とオリゴヌクレオチドの３’末端を両方とも含み、したがって、平滑末端を形成する。本発明の一実施形態において、オリゴヌクレオチドは、単一の回文配列を含み、本発明の別のより好ましい実施形態において、オリゴヌクレオチドは、平滑末端を有するヘアピン二本鎖を形成するように、１または２の異なるオリゴヌクレオチド中の２つの回文を接続する介在配列、スペーサーまたはリンカーによって中断された２個の相補性回文を含む。
非経口投与：本明細書で使用される場合、「非経口投与」、「非経口で投与される」、および他の文法的に同等の語句は、経腸および局所投与を除く他の投与態様、通常は注射によるものを指し、限定されないが、静脈内、鼻腔内、眼内、筋肉内、動脈内、髄腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、くも膜下、脊髄内、硬膜外、脳内、頭蓋内、頸動脈内および胸骨内への注射および注入が挙げられる。
患者：本明細書で使用される場合、「患者」という用語は、予防的処置または治療的処置を受けるヒトおよび他の哺乳動物対象を含む。
同一性パーセント：本明細書で使用される場合、「同一性パーセント」という用語は、２つ以上の核酸またはポリペプチド配列の文脈において、以下に記載する配列比較アルゴリズムの１つを使用して（たとえば、ＢＬＡＳＴＰおよびＢＬＡＳＴＮまたは当業者が利用可能な他のアルゴリズム）、または目視検査によって測定したときに、最大一致について非核し、アラインメントした場合に、同じであるヌクレオチドまたはアミノ酸残基の特定された割合を有する２つ以上の配列または部分配列を指す。その用途に応じて、「同一性パーセント」は、比較される配列の領域にわたって、例えば、機能ドメインにわたって存在していてもよく、またはこれに代えて、比較される２つの配列の全長にわたって存在していてもよい。配列比較のために、典型的には、１つの配列が参照配列として作用し、この配列に対して、試験配列が比較される。配列比較アルゴリズムを使用する場合、試験配列および参照配列がコンピュータに入力され、必要な場合には、部分配列座標が指定され、配列アルゴリズムプログラムパラメータが指定される。次に、配列比較アルゴリズムは、指定されたプログラムパラメータに基づき、参照配列に対する試験配列の配列同一性パーセントを計算する。２つの配列間の同一性パーセントは、２つの配列の最適アラインメントを導入するために必要なギャップの数および各ギャップの長さを考慮した、これらの配列が共有する同一の位置の数の関数である（すなわち、ホモロジー％＝同一の位置の数／位置の合計数×１００）。配列の比較および２つの配列間の同一性パーセントの決定は、以下の非限定的な例に記載されるように、数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。
比較のための配列の最適なアラインメントは、例えば、Ｓｍｉｔｈ＆Ｗａｔｅｒｍａｎ、Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２（１９８１）の局所的なホモロジーアルゴリズムによって、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ＆Ｗｕｎｓｃｈ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３（１９７０）のホモロジアラインメントアルゴリズムによって、Ｐｅａｒｓｏｎ＆Ｌｉｐｍａｎ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５：２４４４（１９８８）の類似法のためのサーチによって、これらのアルゴリズムのコンピュータによる実施（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ中のＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡおよびＴＦＡＳＴＡ、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ、５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒ．、Ｍａｄｉｓｏｎ、Ｗｉｓ．）によって、または視覚観察（一般的に、Ａｕｓｕｂｅｌら、以下を参照）によって行われてもよい。
配列同一性パーセントおよび配列類似性を決定するのに適したアルゴリズムの一例は、ＢＬＡＳＴアルゴリズムであり、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－４１０（１９９０）に記載されている。ＢＬＡＳＴ分析を行うためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎのウェブサイトから公的に入手可能である。２つのヌクレオチド間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムを用い、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰマトリックス、ギャップ重み付け４０、５０、６０、７０または８０、および長さ重み付け１、２、３、４、５または６を用いて、決定することができる（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｃｇ．ｃｏｍで入手可能）。２つのヌクレオチドまたはアミノ酸配列の間の同一性パーセントは、ＡＬＩＧＮアルゴリズム（バージョン２．０）に組み込まれたＥ．ＭｅｙｅｒｓおよびＷ．Ｍｉｌｌｅｒ（ＣＡＢＩＯＳ，４：１１－１７（１９８９））のアルゴリズムを用い、ＰＡＭ１２０重み付け残基表、ギャップ長さペナルティ１２およびギャップペナルティ４を用いても決定することができる。これに加えて、２つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｃｇ．ｃｏｍで入手可能）中のＧＡＰプログラムに組み込まれたＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．（４８）：４４４－４５３（１９７０））アルゴリズムを用い、Ｂｌｏｓｓｕｍ ６２マトリックスまたはＰＡＭ２５０マトリックス、ギャップ重み付け１６、１４、１２、１０、８、６または４および長さ重み付け１、２、３、４、５または６を用いて、決定することができる。
本開示の核酸およびタンパク質配列は、さらに、公的なデータベースに対する検索を実行するための「クエリ配列」として使用して、例えば、関連する配列を特定することができる。このような検索は、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（１９９０）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－１０のＮＢＬＡＳＴおよびＸＢＬＡＳＴプログラム（バージョン２．０）を用いて行うことができる。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索は、ＮＢＬＡＳＴプログラムを用い、スコア＝１００、ワード長さ＝１２で行われ、本発明の核酸分子に対して相同性のヌクレオチド配列を得ることができる。ＢＬＡＳＴタンパク質検索は、ＸＢＬＡＳＴプログラムを用い、スコア＝５０、ワード長さ＝３で行われ、本発明のタンパク質分子に対して相同性のアミノ酸配列を得ることができる。比較目的でギャップを加えたアラインメントを得るために、Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴを、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５（１７）：３３８９－３４０２に記載されているように利用することができる。ＢＬＡＳＴおよびＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを利用する場合、それぞれのプログラムのデフォルトパラメータ（例えば、ＸＢＬＡＳＴおよびＮＢＬＡＳＴ）を使用することができる。ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ．を参照。
薬学的に許容される：本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される」という用語は、妥当な医学的判断の範囲内で、過剰な毒性、刺激、アレルギー反応、または合理的な利益リスク比に見合ったその他の問題または合併症がない、ヒトおよび動物の組織、臓器および／または体液と接触させて使用するのに適した、化合物、材料、組成物および／または投薬形態を指す。
薬学的に許容される担体：本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」という用語は、生理学的に適合するありとあらゆる溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などを指し、これらを含む。本組成物は、薬学的に許容される塩、例えば、酸付加塩または塩基付加塩を含んでいてもよい（例えば、Ｂｅｒｇｅら（１９７７）Ｊ Ｐｈａｒｍ Ｓｃｉ ６６：１－１９を参照）。
ホスフェート：本明細書で使用される「ホスフェート」という用語は、リン酸の塩またはエステルを意味する。ポリホスフェートは、酸素原子を共有することによって一緒に連結する四面体ＰＯ４（ホスフェート）構造単位から形成されるポリマーオキシアニオンの塩またはエステルである。本明細書で使用される場合、「ジホスフェート」という用語は、２個のホスフェート構造単位を含むポリホスフェートを指す。本明細書で使用される場合、「トリホスフェート」という用語は、３個のホスフェート構造単位を含むポリホスフェートを指す。いくつかの実施形態において、本開示は、５’末端に連結したジホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含むＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、本開示は、５’末端に連結したトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含むＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、その誘導体もしくは類似体は、ホスフェート生物学的等価体である。
ホスフェート生物学的等価体：本明細書で使用される場合、「ホスフェート生物学的等価体」（または「ホスフェート模倣物」）という用語は、ホスフェートに類似の物理特性または化学特性を有し、ビホスフェートおよびトリホスフェート部分を含め、ホスフェートに広範囲に類似した生体特性を提供する化学置換基または基を指す。薬物設計において、ある生物学的等価体を別の生物学的等価体と置き換える目的は、化学構造に大きな変化を加えることなく、ある化合物の所望な生体特性または物理特性を向上させることである。生物学的等価体の使用は、医薬品開発で広く使用されており、例えば、親化合物またはリード化合物の毒性を下げ、バイオアベイラビリティを変えるか、または活性または代謝を変更するために使用される（例えば、Ｒｙｅ ａｎｄ Ｂａｅｌｌ（２００５）Ｃｕｒｒ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ １２（２６）：３１２７－３１４１；Ｅｌｌｉｏｔら、（２０１２）ＭｅｄＣｈｅｍＣｏｍ ３（７）：７３５－７５１を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）。
ポリペプチド：本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」、「ペプチド」および「タンパク質」という用語は、アミノ酸残基のポリマーを指すために相互に置き換え可能に使用される。この用語は、１つ以上のアミノ酸残基が、対応する天然に存在するアミノ酸の人工的な化学模倣物である、アミノ酸ポリマー、ならびに天然に存在するアミノ酸ポリマーおよび天然に存在しないアミノ酸ポリマーに適用する。
予防する：本明細書で使用される場合、ある状態に関連して使用される場合、「予防する」という用語は、ある組成物を摂取しない対象と比較して、対象において、ある医学的状態の頻度を減らすか、または症状の発症を遅らせる組成物の投与を指す。
精製される：本明細書で使用される場合、本明細書に記載のタンパク質（抗体またはフラグメント）のいずれかに適用される場合、「精製される」または「単離される」という用語は、天然で伴われる成分（例えば、タンパク質または他の天然に存在する生体分子または有機分子）、例えば、そのタンパク質を発現する原核生物中の他のタンパク質、脂質および核酸から分離または精製されたペプチドを指す。典型的には、ポリペプチドは、サンプル中の総タンパク質の少なくとも６０（例えば、少なくとも６５、７０、７５、８０、８５、９０、９２、９５、９７または９９）重量％を構成するときに、精製される。
参照リガンド：本明細書で使用される場合、「参照リガンド」（「参照アゴニスト」と相互に置き換え可能に使用される）または「参照分子」という用語は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体リガンドを指し、これを使用して、それ自体と、１つ以上の別個のＲＩＧ－Ｉ様受容体リガンドとの間の関係を確立し、この関係は、参照リガンドと１つ以上の別個のＲＩＧ－Ｉ様受容体リガンドの相対的なアゴニスト効果である。本明細書で使用される場合、この用語は、本明細書に記載されているものなどの試験またはアッセイ（例えば、ＩＦＮ誘導アッセイ）に競合物質として有用なＲＩＧ－Ｉ様受容体リガンドまたはアゴニストを暗示し、このアッセイは、ＲＩＧ－Ｉ様受容体に結合する１つ以上の別個のアゴニストの発見、特定または開発に有用である。
ＲＩＧ－Ｉ：本明細書で使用される場合、「ＲＩＧ－Ｉ」という用語は、レチノイン酸誘導遺伝子Ｉ（Ｒｅｔｉｎｏｉｃ Ａｃｉｄ－Ｉｎｄｕｃｉｂｌｅ Ｇｅｎｅ Ｉ ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）ポリペプチドを指し、ＲＩＧ－Ｉ様受容体ファミリーの特定のメンバーであり、ヒトではＤＤＸ５８遺伝子によってコードされる。当該技術分野において、ＲＩＧ－Ｉの代替名称および頭字語としては、ＤＥＡＤボックスポリペプチド５８、ＲＩＧＩ、ＲＬＲ－１、ＳＧＭＲＴ２およびＤＥＸＤ／Ｈ－ボックスヘリカーゼ５８が挙げられる。全長ヒトＲＩＧ－Ｉの例示的なアミノ酸配列は、表４（配列番号９８）およびここに示されている。
MTTEQRRSLQAFQDYIRKTLDPTYILSYMAPWFREEEVQYIQAEKNNKGPMEAATLFLKFLLELQEEGWFRGFLDALDHAGYSGLYEAIESWDFKKIEKLEEYRLLLKRLQPEFKTRIIPTDIISDLSECLINQECEEILQICSTKGMMAGAEKLVECLLRSDKENWPKTLKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSDIQIFYQEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSPFKPRNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIIILTPQILVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSGPLPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQIQNREFGTQKYEQWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESVSRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKFIRDSQEKPKPVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPKPKQFSSFEKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATGVQTLYSKWKDFHFEKIPFDPAEMSK
（ＮＣＢＩ寄託番号：ＮＰ＿０５５１２９．２）。
ＲＩＧ－Ｉ様受容体：本明細書で使用される場合、「ＲＩＧ－Ｉ様受容体」（「ＲＬＲ」と略される）という用語は、典型的にはウイルスＲＮＡ中に見出される病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）の細胞質パターン認識センサとして機能するＤＥｘＤ／ＨボックスＲＮＡヘリカーゼのファミリーの任意のメンバーを指す。リガンドが結合すると、ＲＬＲは、下流の転写因子の活性化にシグナルを伝達し、ウイルス感染を制御するための細胞内免疫応答を誘発する１型インターフェロン（ＩＦＮ）産生および抗ウイルス遺伝子発現を駆動する。ＲＩＧ－Ｉ（レチノイン酸誘導遺伝子Ｉ）、ＭＤＡ５（メラノーマ分化関連遺伝子５）およびＬＧＰ２（ラボラトリー・オブ・ジェネティクス・アンド・フィジオロジー２およびマウスＤ１１ｌｇｐ２のホモログ）といった３つのＲＬＲメンバーが特定されている（ＬｏｏおよびＧａｌｅ（２０１１）Ｉｍｍｕｎｉｔｙ ３４（５）：６８０－６９２）。
ＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニスト：本明細書で使用される場合、「ＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニスト」という用語（「ＲＬＲアゴニスト」という用語と相互に置き換え可能に使用される）は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に結合し、生体活性、応答、および／またはＲＬＲシグナル伝達によって媒介される下流の経路、または他のＲＬＲが媒介する機能を部分的または完全に促進し、誘導し、増加させ、および／または活性化する核酸（例えば、ＲＮＡ）を指す。ＲＩＧ－Ｉ受容体アゴニストの例は、本明細書で提供される。
安定なＲＮＡ二次構造：本明細書で使用される場合、「安定なＲＮＡ二次構造」という用語は、生理学的条件で持続的に維持され、低い自由エネルギー状態を特徴とする、ＲＮＡ分子によって採用される構造、折り畳みまたはコンフォメーション、またはその局所的なセグメントまたは一部を指す。安定なＲＮＡ二次構造の典型的な例としては、二重鎖、ヘアピンおよびステムループが挙げられる。安定なＲＮＡ二次構造は、種々の生体活性を示すことが当該技術分野で知られている。ポリヌクレオチド二本鎖を参照しつつ使用される「安定な」という用語は、二本鎖が、生理学的条件下で、または核酸の診断または治療用途で使用される典型的な塩および温度の条件下で、二本鎖の形態で本質的に排他的にハイブリダイズされ、構造化され、またはアニーリングされたままであることを意味する。
対象：本明細書で使用される場合、「対象」という用語には、任意のヒトまたは非ヒト動物が含まれる。例えば、本発明の方法および組成物を使用して、免疫障害を有する対象を治療することができる。「非ヒト動物」という用語は、全ての脊椎動物、例えば、哺乳動物および非哺乳動物、例えば、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ニワトリ、両生類、爬虫類などを含む。
Ｔ細胞：「Ｔ細胞」という用語は、細胞表面にＴ細胞受容体が存在することによって、他の白血球細胞から区別することができる種類の白血球細胞を指す。Ｔ細胞にはいくつかのサブセットが存在し、限定されないが、Ｔヘルパー細胞（ＴＨ細胞またはＣＤ４＋Ｔ細胞としても知られる）およびサブタイプ、ＴＨ１、ＴＨ２、ＴＨ３、ＴＨ１７、ＴＨ９およびＴＦＨ細胞を含む、細胞障害性Ｔ細胞（ＴＣ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、細胞障害性Ｔリンパ球、Ｔ－キラー細胞、キラーＴ細胞）、メモリーＴ細胞およびサブタイプ、セントラルメモリーＴ細胞（ＴＣＭ細胞）、エフェクターメモリーＴ細胞（ＴＥＭおよびＴＥＭＲＡ細胞）およびレジデントメモリーＴ細胞（ＴＲＭ細胞）を含む、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ細胞またはサプレッサーＴ細胞としても知られる）およびサブタイプ、ＣＤ４＋ＦＯＸＰ３＋Ｔｒｅｇ細胞、ＣＤ４＋ＦＯＸＰ３－Ｔｒｅｇ細胞、Ｔｒ１細胞、Ｔｈ３細胞およびＴｒｅｇ１７細胞を含み、ナチュラルキラーＴ細胞（ＮＫＴ細胞としても知られる）、粘膜関連インバリアントＴ細胞（ＭＡＩＴ）、およびガンマデルタＴ細胞（γδＴ細胞）、Ｖγ９／Ｖδ２Ｔ細胞を含む、が挙げられる。上述のＴ細胞または述べられていないＴ細胞のいずれか１つ以上が、本発明の使用方法のための標的細胞型であってもよい。
Ｔ細胞の活性化：本明細書で使用される場合、「Ｔ細胞活性化」または「Ｔ細胞の活性化」という用語は、表面で抗原特異的Ｔ細胞受容体を発現する成熟Ｔ細胞が、その同族抗原を認識し、細胞周期に入り込み、サイトカインまたは溶解酵素を分泌し、細胞に基づくエフェクター機能の実施を開始するか、または競合物になることによって応答する細胞プロセスを指す。Ｔ細胞の活性化には、完全に活性化するために少なくとも２つのシグナルが必要である。１つ目のシグナルは、抗原主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）によるＴ細胞抗原特異的受容体（ＴＣＲ）の関与後に発生し、２つ目のシグナルは、共刺激分子（例えば、ＣＤ２８）のその後の関与によって発生する。これらのシグナルは、核に伝えられ、Ｔ細胞のクローン増殖、細胞表面での活性化マーカーのアップレギュレーション、エフェクター細胞への分化、細胞毒性の誘導またはサイトカインの分泌、アポトーシスの誘導、またはこれらの組み合わせが起こる。
Ｔ細胞が媒介する応答：本明細書で使用される場合、「Ｔ細胞が媒介する応答」という用語は、限定されないが、エフェクターＴ細胞（例えば、ＣＤ８＋細胞）およびヘルパーＴ細胞（例えば、ＣＤ４＋細胞）を含む、Ｔ細胞によって媒介される任意の応答を指す。Ｔ細胞が媒介する応答としては、例えば、Ｔ細胞の細胞毒性および増殖が挙げられる。
テトラループ：本明細書で使用される場合、「テトラループ」という用語は、片方の端で二本鎖をキャップし、二本鎖を構成する２つの鎖を連結し、ヘアピン構造に安定性を与える、ヘアピンまたはステムループＲＮＡ二次構造中に見出される４塩基ループモチーフの一種を指す。
治療薬剤：本明細書で使用される場合、「治療薬剤」という用語は、対象に投与されると、治療、診断および／または予防効果を有し、および／または所望な生物学的効果および／または薬理学的効果を誘発する、任意の薬剤を指す。
治療に有効な量：本明細書で使用される場合、「治療に有効な量」、「治療に有効な用量」という用語、または本明細書で使用される同様の用語は、所望な生体応答または医学的応答、例えば、疾患を既に患っている患者における、状態または疾患およびその合併症を治癒するか、または少なくとも部分的に抑えること（例えば、癌の１つ以上の症状の改善）を誘発する薬剤（例えば、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体アゴニスト）の量を意味することを意図している。この使用に有効な量は、治療される疾患の重篤度および患者自身の免疫系の全体的な状態に依存する。
治療する：本明細書で使用される場合、「治療する」、「治療すること」および「治療」という用語は、本明細書に記載されている治療措置または予防措置を指す。「治療」の方法は、このような治療を必要とする対象に、例えば、特定の抗原に対する免疫応答を向上させる必要がある対象に、またはこのような障害を最終的に獲得し得る対象に、障害または再発性障害の１つ以上の症状を予防し、治癒し、遅らせ、重篤度を下げ、または改良するために、またはこのような治療のない状態で予想されるよりも対象の生存を延ばすために、本開示のヒト抗体を投与することを使用する。
腫瘍微小環境：本明細書で使用される場合、「腫瘍微小環境」（または「癌環境」、ＴＭＥと略される）という用語は、細胞環境、または周囲の血管、および限定されないが、免疫脂肪、線維芽細胞、骨髄由来炎症細胞およびリンパ球を含む非癌性細胞を含め、腫瘍または新生物が存在する周囲の状況を指す。シグナル伝達分子および細胞外マトリックスも、ＴＭＥを構成する。腫瘍および周囲の微小環境は、密接に関係しており、常に相互作用している。腫瘍は、細胞外シグナルを放出し、腫瘍の血管新生を促進し、末梢性免疫寛容を誘導することにより、微小環境に影響を与えることができ、一方、微小環境中の免疫細胞は、腫瘍細胞の成長および進化に影響を与えることができる。
特に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、この開示が関係する当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。好ましい方法および材料を以下に記載するが、本明細書に記載されるものと同様または均等の方法および材料は、現在開示されている方法および組成物の実施または試験においても使用することができる。本明細書で言及される全ての刊行物、特許出願、特許およびその他の参考文献は、参照によりその全体が組み込まれる。
均等物および範囲
当業者は、本明細書に記載される特定の実施形態に対する多くの均等物を認識するか、または日常的な実験を超えない実験を用いて確認することができるだろう。本開示の範囲は、上述の説明に限定されるものではなく、添付の特許請求の範囲に記載されているとおりである。
特許請求の範囲において、「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」および「その（ｔｈｅ）」などの冠詞は、矛盾することが示されていない限り、または文脈から明らかでない限り、１つまたは１つより多くを意味する場合がある。ある群の１つ以上のメンバーの間に「または」を含む特許請求の範囲または説明は、矛盾することが示されていない限り、または文脈から明らかでない限り、その群のメンバーのうちの１つ、１つより多く、または全てが、所与の生成物またはプロセス中に存在するか、使用されるか、または他の様式で関連する場合に満たされているとみなされる。本開示は、その群のちょうど１つのメンバーが、所与の生成物またはプロセス中に存在するか、使用されるか、または他の様式で関連する実施形態を含む。本開示は、その群のメンバーのうちの１つより多く、または全てが、所与の生成物またはプロセス中に存在するか、使用されるか、または他の様式で関連する実施形態を含む。さらに、本開示は、列挙される請求項のうちの１つ以上からの１つ以上の制限、要素、節、記述用語などが別の請求項に導入される全ての変形、組み合わせおよび置き換えを包含することを理解すべきである。例えば、別の請求項に従属する任意の請求項は、同じ基本請求項に従属する任意の他の請求項中にみられる１つ以上の制限事項を含むように変更されてもよい。さらに、その請求項が組成物を引用する場合、他に示されない限り、または当業者に矛盾または不一致が生じることが明白でない限り、本明細書に開示される目的のいずれかのためにその組成物を使用する方法が含まれ、本明細書に開示される製造方法のいずれかまたは当該技術分野で知られている他の方法に従って、その組成物を製造する方法が含まれることを理解すべきである。
要素がリストとして、例えば、マーカッシュグループ形式で提示されている場合、その要素の各部分的な群も開示されており、任意の要素をその群から削除することができることを理解すべきである。一般に、本発明または本発明の態様が、特定の要素、特徴などを含むと称される場合、本発明の特定の実施形態または本発明の態様は、このような要素、特徴などからなるか、またはこれらから本質的になることを理解すべきである。単純化のために、これらの実施形態は、本明細書ではこれらの言葉で具体的に説明されていない。
また、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語は、包括的であることを意図しており、必要というわけではないが、さらなる要素または工程を含むことを許容することにも留意されたい。したがって、本明細書で「含む」という用語が使用される場合、「～からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｏｆ）」という用語も包含され、開示される。
範囲が与えられている場合、境界値が含まれる。さらに、特に示さない限り、または内容および当業者の理解から明白でない限り、範囲として表される値は、その内容が明確に他の内容を示していない限り、その範囲の下限の単位の１０分の１まで、本発明の異なる実施形態で述べられた範囲内の任意の特定の値または部分範囲を仮定することができることを理解すべきである。
これに加えて、先行技術に含まれる本発明の任意の特定の実施形態は、請求項のいずれか１つ以上から明示的に除外され得ることを理解すべきである。このような実施形態は当業者に知られているとみなされるので、その除外が本明細書で明示的に述べられていなくても、それらは除外され得る。本発明の組成物の任意の特定の実施形態（例えば、それによりコードされる任意の核酸またはタンパク質、任意の製造方法、任意の使用方法など）は、先行技術の存在に関連しているか、関連していないかにかかわらず、何らかの理由で、任意の１つ以上の請求項から除外することができる。
本明細書で引用されているすべての出典、例えば、参考文献、刊行物、データベース、データベースエントリ、および技術は、引用で明示的に述べられていなくても、参照により本出願に組み込まれる。引用された出典と本出願の記述が矛盾する場合は、本出願の記述が優先するものとする。
ＲＩＧ－Ｉ様受容体およびそのリガンド
本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合し、ＲＬＲをアゴナイズする合成ＲＮＡリガンド（ＲＬＲアゴニスト）を提供する。いくつかの態様において、本開示は、癌の治療に有用なＲＬＲアゴニストを提供する。いくつかの態様において、本開示は、感染症の治療に有用なＲＬＲアゴニストを提供する。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、サイトカイン産生を誘導する。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、腫瘍微小環境におけるＣＤ８＋ Ｔ細胞の数を増加させる。いくつかの実施態様において、ＲＬＲアゴニストは、保護的な抗腫瘍免疫を誘導する。
ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）の認識によって病原薬剤の存在を感知する細胞質パターン認識受容体（ＰＲＲ）として機能するＤＥｘＤ／ＨボックスＲＮＡヘリカーゼのファミリーを含む。特に、非自己（例えば、ウイルス）ＲＮＡの細胞内の存在は、ＲＬＲに対するＲＮＡの結合によって、感染細胞によって検知され、抗ウイルス性免疫の開始および調節が起こる。ほとんどのウイルスＲＮＡと同様に、内因性ｍＲＮＡおよびＲＮＡポリメラーゼＩＩＩ転写物も、５’－三リン酸化されているが、真核生物のｍＲＮＡは、ＲＩＧ－Ｉ活性化を防ぐＮ７でメチル化されたグアノシンに連結した５’キャップ構造を有する。ウイルスＲＮＡと自己ＲＮＡとの間のこれらの構造差は、細胞内局在化の違いと共に、ウイルスＲＮＡの優先的な検出によって、ウイルス感染に対する防御としてのＲＩＧ－Ｉの効果的な機能を可能にすると考えられる。ＲＬＲに対する非自己ＲＮＡリガンドの分子認識および結合は、１型インターフェロン（ＩＦＮ）産生および抗ウイルス遺伝子発現を駆動する転写因子の活性化に至る特定の細胞内シグナル事象を進行させる。ＲＬＲが媒介するＩＦＮの誘導および炎症性サイトカイン産生、ならびに抗ウイルス遺伝子発現は、ウイルス感染を制御する免疫応答を誘発する（Ｙｏｎｅｙａｍａら、（２０１５）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ ３２：４８－５３）。
最初のメンバーであり、ＲＬＲファミリーを最もよく特徴付けるＲＩＧ－Ｉ（レチノイン酸誘導遺伝子Ｉ）、ＭＤＡ５（メラノーマ分化関連遺伝子５）およびＬＧＰ２（ラボラトリー・オブ・ジェネティクス・アンド・フィジオロジー２およびマウスＤ１１ｌｇｐ２のホモログ）といった３つのＲＬＲファミリーメンバーが特定されている。ＲＩＧ－Ｉは、自然免疫系の重要な構成要素であり、ＲＮＡウイルスによる感染に対する防御に重要な役割を果たす。免疫細胞の一部のエンドソームにおいて核酸を検出するＴｏｌｌ様受容体ＴＬＲ３、ＴＬＲ７、ＴＬＲ８およびＴＬＲ９とは対照的に、ＲＩＧ－Ｉは、全ての細胞型において発現する細胞質自然免疫受容体である（Ｋａｔｏら、（２００６）Ｎａｔｕｒｅ ４４１（７０８９）：１０１－１０５；Ｌｏｏら、（２００８）Ｊ Ｖｉｒｏｌ ８２（１）：３３５－３４５）。２つの初期の研究は、ＲＩＧ－ＩがウイルスＲＮＡを特異的に検出し、ウイルスＲＮＡによって活性化されることを独自に確立した（Ｈｏｒｎｕｎｇら、（２００６）Ｓｃｉｅｎｃｅ ３１４（５８０１）：９９４－９９７；Ｐｉｃｈｌｍａｉｒら、（２００６）Ｓｃｉｅｎｃｅ ３１４（５８０１）：９９７－１００１）。
ＲＩＧ－Ｉ／リガンド複合体の高解像度の構造は、ＲＮＡリガンド、特に活性化リガンドである二本鎖５’－三リン酸化ＲＮＡ（ｐｐｐ－ｄｓＲＮＡ）へのＲＩＧ－Ｉの結合の分子詳細を提供している（Ｃｉｖｒｉｌら、（２０１１）ＥＭＢＯ Ｒｅｐｏｒｔｓ １２（１１）：１１２７－１１３４；Ｊｉａｎｇら、（２０１１）Ｎａｔｕｒｅ ４７９（７３７３）：４２３－４２７；Ｋｏｗａｌｉｎｓｋｉら、（２０１１）Ｃｅｌｌ １４７（２）：４２３－４３５；Ｌｕら、（２０１０）Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ １８（８）：１０３２－１０４３；Ｌｕｏら、（２０１１）Ｃｅｌｌ １４７（２）４０９－４２２；Ｗａｎｇら、（２０１０）Ｎａｔｕｒｅ Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ＆Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７（７）：７８１－７８７；Ｈｏｒｎｕｎｇら、（２００６）Ｓｃｉｅｎｃｅ ３１４（５８０１）：９９４－９９７；Ｐｉｃｈｌｍａｉｒら、（２００６）Ｓｃｉｅｎｃｅ ３１４（５８０１）：９９７－１００１；Ｓｃｈｌｅｅら、（２００９）Ｉｍｍｕｎｉｔｙ ３１（１）：２５－３４））。ＲＩＧ－Ｉ／ＲＮＡ複合体の結晶構造は、塩基ではなく骨格に対するタンパク質結合を示し、このことは、ＲＮＡ配列がＲＩＧ－Ｉ結合に影響を与え得ないこと、またはＲＮＡ配列がまだ特性決定されていない効果または活性を示し得ることを示唆している。今日まで、ＲＩＧ－Ｉ様受容体との配列に依存する異なる相互作用またはアフィニティおよびＲＩＧ－Ｉ様受容体の活性化の証拠は、当該技術分野で説明されていない（ＳｃｈｌｅｅおよびＨａｒｔｍａｎｎ（２０１０）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ １８（７）：１２５４－１２６２）。
したがって、本開示は、天然に存在しない合成および／または操作されたＲＬＲ ＲＮＡリガンドを含む合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供する。いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与える、ＲＬＲアゴニストを提供する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、以下：
（ｉ）ＧＴリピートモチーフ、
（ｉｉ）ＧＡリピートモチーフ、
（ｉｉｉ）ＡＵＣＧリピートモチーフ、
（ｉｖ）ＡＵリピートモチーフ、
（ｖ）ジピリミジンモチーフ、
（ｖｉ）ジプリンモチーフ、
（ｖｉｉ）ピリミジントリプレットモチーフ、
（ｖｉｉｉ）プリントリプレットモチーフ、
（ｉｘ）回文配列モチーフ、および
（ｘ）（ｉ）～（ｉｘ）のいずれかの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、少なくとも１つの改良された生体活性を含み、改良された生体活性は、以下：
（ｉ）ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生の増加、
（ｉｉ）インターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現の増加、
（ｉｉｉ）ＲＬＲによって媒介される細胞内シグナル伝達の増加、
（ｉｖ）ＲＬＲに対する結合アフィニティの増加、および
（ｖ）（ｉ）～（ｉｖ）のいずれかの組み合わせから選択される。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約５～１０個、約５個、約４個、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびチミンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＴリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、ＧＴリピートモチーフは［ＧＴ］ｎであり、式中、ｎ＝２～９である。いくつかの実施形態において、ＧＴリピートモチーフは、［ＧＴ］７である。いくつかの実施形態において、ＧＴリピートモチーフは、［ＧＴ］３であり、ＧＴリピートモチーフの後が、それぞれプリントリプレットおよびＵＣＧである。いくつかの実施形態において、プリントリプレットは、ＧＧＡである。
いくつかの実施形態において、配列モチーフは、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約５～１０個、約５個、約４個、約１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のグアニンおよびアデニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＧＡリピートモチーフである。いくつかの実施形態において、ＧＡリピートモチーフは［ＧＡ］ｎであり、式中、ｎ＝２～９である。いくつかの実施形態において、ＧＡリピートモチーフは、［ＧＡ］７である。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、配列モチーフを含み、配列モチーフは、１９個未満、約１６個、約１２～１６個、約１２個、約８～１２個、約６個、約１６、１２、８個のアデニン、ウラシル、シトシンおよびグアニンヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含むＡＵＣＧリピートモチーフである。
いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］ｎであり、式中、ｎ＝２～４である。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３である。
いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＧまたはジピリミジンモチーフが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＧが存在する。いくつかの実施形態において、ジピリミジンモチーフは、ＣＣである。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にジプリンモチーフが存在する。いくつかの実施形態において、ジプリンモチーフは、ＧＡである。いくつかの実施形態において、ジプリンモチーフは、ＧＧである。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、１つ以上のウリジンヌクレオシド（Ｕ）は、改変ヌクレオシドで置換される。いくつかの実施形態において、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）である。いくつかの実施形態において、ＡＵＧＣリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、ＡＵＣＧリピートモチーフを構成する１つ以上のウリジンヌクレオシド（Ｕ）は、改変ヌクレオシドで置換され、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）である。いくつかの実施形態において、ＡＵＧＣリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、ＡＵＣＧリピートモチーフを構成する１つ以上のウリジンヌクレオシド（Ｕ）は、改変ヌクレオシドで置換され、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）であり、ＡＵＧＣリピートモチーフの前にＧＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、１つ以上のグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、改変ヌクレオシドで置換される。いくつかの実施形態において、改変ヌクレオシドは、イノシン（Ｉ）である。いくつかの実施形態において、ＡＵＧＣリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、ＡＵＣＧリピートモチーフを構成する１つ以上のグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、改変ヌクレオシドで置換され、改変ヌクレオシドは、リボチミジン（Ｔ）であり、ＡＵＧＣリピートモチーフの前にＧＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートモチーフを含み、このモチーフの前にＩＧが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］３であり、このモチーフの前にＩＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピートを含み、１つ以上のグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、イノシン（Ｉ）で置換され、ＡＵＣＧリピートの前にイノシン（Ｉ）が存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートを構成するグアノシンヌクレオシド（Ｇ）は、イノシン（Ｉ）で置換され、ＡＵＣＧリピートの前にイノシン（Ｉ）が存在し、第１のポリヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、イノシン（Ｉ）を含む。
いくつかの実施形態において、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、イノシン（Ｉ）を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、ＡＵＣＧリピート配列モチーフを含み、ＡＵＣＧリピートモチーフは、［ＡＵＣＧ］２である。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にジプリンモチーフが存在する。いくつかの実施形態において、ジプリンモチーフは、ＧＧである。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にプリントリプレットが存在する。いくつかの実施形態において、プリントリプレットは、ＧＧＧである。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＣＣＣＣＣＧが存在する。いくつかの実施形態において、ＡＵＣＧリピートモチーフの前にＴＣＧＵＣＧが存在する。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、回文配列を含み、回文配列は、１９個未満、約１５～１８個、約１５個、約１０～１５個、約１０個、約１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５または４個のヌクレオチド、またはこれらの誘導体もしくはアナログの配列を含み、任意の順序で連結して回文を生成する。
いくつかの実施形態において、リンカーは、ＡＵに隣接している。いくつかの実施形態において、リンカーは、ＡＵリピートモチーフに隣接しており、ＡＵリピートモチーフは、［ＡＵ］ｎであり、式中、ｎ＝２～３である。いくつかの実施形態において、ＡＵリピートモチーフは、［ＡＵ］２である。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストを提供し、アゴニストが、シチジンと塩基対を形成するイノシンを含む少なくとも１つ以上のヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを共有結合するリンカーである。
他の態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供し、アゴニストが、非ヌクレオチドリンカーを含む、平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストが、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを共有結合する非ヌクレオチドリンカーである。
いくつかの実施形態において、イノシンは、ＲＬＲアゴニスト中に存在する場合、シチジンと塩基対を形成する。
いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は、ヌクレオチドリンカーまたは非ヌクレオチドリンカーである。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲに対して特異的に結合するＲＬＲアゴニストであって、アゴニストが、ヌクレオチドリンカーまたは非ヌクレオチドリンカーを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含む、ＲＬＲアゴニストを提供する。ＲＮＡヘアピンは、最も一般的なＲＮＡ二次構造要素の１つであり、ヘアピンのハイブリダイズされた部分または「ステム」は、ＲＮＡテトラループによって覆われていることが多い。ＲＮＡテトラループは、圧縮された安定な構造を形成する特徴的な４つのループヌクレオチドで構成されている。ＲＮＡテトラループは、多くの異なるヌクレオチド配列によって形成され得るが、ＵＮＣＧ（Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵ）、ＧＮＲＡ（Ｒ＝ＡまたはＧ）およびＣＵＵＧテトラループが、最も頻繁に見出される。テトラループは、通常、ＲＮＡ折り畳みプロセスを開始するのに役立ち、ＲＮＡ内またはＲＮＡ間の三次接触のための部位およびタンパク質結合のための部位を与え、それによって、リボ核タンパク質粒子の集合を促進する。テトラループのさらなる記載は、Ｃｈｅｏｎｇ，Ｈ．、Ｋｉｍ，Ｎ．およびＣｈｅｏｎｇ，Ｃ．（２０１５）．ＲＮＡ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ：Ｔｅｔｒａｌｏｏｐｓ．Ｉｎ ｅＬＳ、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｌｔｄ（編集）の中に見出すことができ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
したがって、いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、テトラループを含むヌクレオチドリンカーを含む。いくつかの実施形態において、テトラループのヌクレオチド配列は、以下：
（ａ）ＵＮＣＧ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、Ｇ、またはＵである）、
（ｂ）ＧＮＲＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｒ＝ＡまたはＧである）、
（ｃ）ＡＮＹＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｄ）ＣＵＹＧ（式中、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｅ）ＵＭＡＣ（式中、Ｍ＝ＡまたはＣである）、および
（ｆ）ＣＵＵＧからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵまたはＵＧＵＵＵを含む。いくつかの実施形態において、テトラループの配列は、ＵＵＣＧである。いくつかの実施形態において、テトラループの配列は、ＧＡＵＣである。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵを含む。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＧＵＵＵを含む。
他の態様において、本開示のＲＬＲアゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含む。本明細書に記載されるように、核酸ループ（例えば、テトラループ）は、核酸二次構造にみられる一般的な要素である。ヌクレオチドループは、鎖内二本鎖で発生する折り畳まれたドメイン中で生じる。非ヌクレオチド連結基（例えば、非ヌクレオチドリンカー）を含むヘアピンループを含むように設計された合成核酸は、折り畳まれた二本鎖構造を架橋するいくつかのヌクレオチドと置き換えることができる。非ヌクレオチド基は、折り畳まれていない構造中のリンカーとしても同様に使用されてきた。このような連結基は、天然のヌクレオチドリンカー（例えば、テトラループ）の有用な置き換え物であり得る。例えば、このような連結基は、１つの比較的長い非ヌクレオチド連結基を、天然でループを構成し得るいくつかの個々のヌクレオチドと置き換えるため、いくつかの工程による所望な二次構造を有する核酸の合成を短縮することができる。このような非天然ループまたはリンカー（例えば、非ヌクレオチドリンカー）は、生物学的状況（例えば、投与時の対象の細胞中または循環中）で天然のループ構造に対して通常作用するヌクレアーゼによる分解に対する耐性を与えることができる。非ヌクレオチド連結基は、ヌクレオチドループおよび／またはリンカーを用いて生じるものよりも安定した折り畳まれた構造を与える可能性も有する。非ヌクレオチドリンカーのさらなる記載は、ＲｕｍｎｅｙおよびＫｏｏｌ（１９９５）Ｊ Ａｍ Ｃｈｅｍ Ｓｏｃ １１７：５６３５－５６４６の中に見出すことができ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
したがって、いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下：
（ａ）エチレングリコールリンカー、および
（ｂ）アルキルリンカーからなる群から選択される非ヌクレオチドリンカーを含む。
いくつかの実施形態において、非ヌクレオチドリンカーは、ヘキサエチレングリコールリンカーである。いくつかの実施形態において、非ヌクレオチドリンカーは、Ｃ９アルキルリンカーである。
いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、５’ジホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む。いくつかの実施形態において、アゴニストは、５’トリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む。いくつかの実施形態において、その誘導体もしくはアナログは、ホスフェート生物学的等価体を含み、ホスフェート生物学的等価体は、ホスホネート、チオホスホネート、ホスホロチオエート、サルフェート、スルホネート、スルファメート、チアゾリジノン、カルボキシレート、マロネート、ボロン酸、ベンゾオキサボロール、ボラノホスフェート、スクアラミドから選択される。
いくつかの実施形態において、アゴニストは、改変ヌクレオチド、改変ヌクレオシドもしくは改変核酸塩基、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、アゴニストは、ヌクレオチド間結合またはポリヌクレオチド骨格に対する改変を含む。
いくつかの態様では、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下の特性：
（ａ）１つ以上のＲＬＲ（例えば、ＲＩＧ－１、ＭＤＡ５および／またはＬＧＰ２）に特異的に結合する、
（ｂ）ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させる、
（ｃ）インターフェロン誘導遺伝子（ＩＳＧ）のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる、
（ｄ）ＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる、
（ｅ）二本鎖の安定性を高める、
（ｆ）ＲＬＲに対する結合アフィニティを増加させる、
（ｇ）標的外結合を減らす、
（ｈ）生物学的半減期を長くする、
（ｉ）生体内分布とバイオアベイラビリティを高める、
（ｊ）細胞および／または組織への取り込みを増加させ、および／または増強する、
（ｋ）免疫原性を低下させる、および
（ｌ）（ａ）～（ｋ）のいずれかの組み合わせのうちの少なくとも１つ以上を示す。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供し、アゴニストが、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドであり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ１は、Ｘ２に対して相補性であり、
（ｉｘ）Ｘ１およびＸ２は、それぞれ、１２ヌクレオチド長～１６ヌクレオチド長であり、同じ長さであり、
（ｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
式中、Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４のうちの少なくとも１つはイノシンであり、および／またはＸ１および／またはＸ２のうちの少なくとも１つは、少なくとも１つのイノシンヌクレオシドを含み、イノシンヌクレオシドは、ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成する。
いくつかの実施形態において、Ｎ１はイノシンを含み、Ｎ４はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はシチジンを含み、Ｎ４はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はイノシンを含み、Ｎ３はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はシチジンを含み、Ｎ３はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はイノシンを含み、Ｎ４はシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はイノシンを含み、Ｎ３はシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はイノシンを含み、Ｘ１および／またはＸ２はそれぞれ少なくとも１つのイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシンを含み、Ｎ３およびＮ４はシチジンを含み、Ｘ１およびＸ２はイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジンを含み、Ｎ３およびＮ４はイノシンを含み、Ｘ１およびＸ２はイノシンを含み、グアノシンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１２ヌクレオチドであり、１、２、３、４個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１３ヌクレオチドであり、１、２、３、４または５個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１４ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５または６個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１５ヌクレオチドであり、１、２、３、４、５、６または７個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１６ヌクレオチドであり、それぞれ１、２、３、４、５、６、７または８個のイノシンヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、Ｘ１およびＸ２がそれぞれ１２ヌクレオチドであり、少なくとも１０％、２０％、３０％または４０％のイノシンヌクレオシドを含む。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供し、アゴニストが、以下の式：
５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、式中、
（ｉ）（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、連結したヌクレオチドＮ１、Ｎ２およびＸ１を含む第１のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉ）（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、連結したヌクレオチドＸ２、Ｎ３およびＮ４を含む第２のポリヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４は、それぞれ、アデノシン、グアノシン、シチジン、５－メチルウリジン、ウリジンおよびイノシンからなる群から選択されるヌクレオシドを含む単一ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）Ｎ１はＮ４と塩基対を形成し、
（ｖ）Ｎ２はＮ３と塩基対を形成し、
（ｖｉ）Ｎ１は、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
（ｖｉｉ）Ｘ１は、配列モチーフ［ＡＵＣＮ５］ｘを含み、ここで、Ｎ５は、グアノシンまたはイノシンを含み、ｘは、その値が配列モチーフの数を示す整数であり、ｘ＝３または４であり、
（ｖｉｉｉ）Ｘ２は、配列モチーフ［ＣＮ６ＡＵ］ｙを含み、式中、Ｎ６は、グアノシンまたはイノシンを含み、ｙは、その値が配列モチーフの数を示す整数であり、ｙ＝３または４であり、
（ｉｘ）Ｌは、第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドを作動可能に連結するリンカーであり、
場合により、Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３、およびＮ４のうちの少なくとも１つがイノシンであり、イノシンヌクレオシドが、ヘアピンＲＮＡ中のシチジンと塩基対を形成する。いくつかの実施形態において、Ｎ５はイノシンを含み、Ｎ６はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ５はグアノシンを含み、Ｎ６はイノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ５はイノシンを含み、Ｎ６はグアノシンを含む。いくつかの実施形態において、Ｎ５はグアノシン（Ｇ）を含み、Ｎ６はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、ｘ＝３およびｙ＝３である。いくつかの実施形態において、ｘ＝４およびｙ＝４である。いくつかの実施形態において、Ｎ１はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ４はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ３はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ３はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ２はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ４はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ１はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ２はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はグアノシン（Ｇ）を含み、Ｎ３およびＮ４はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジン（Ｃ）を含み、Ｎ３およびＮ４はグアノシン（Ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はイノシン（Ｉ）を含み、Ｎ３およびＮ４はシチジン（Ｃ）を含む。いくつかの実施形態において、Ｎ１およびＮ２はシチジン（Ｃ）を含み、Ｎ３およびＮ４はイノシン（Ｉ）を含む。
いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は、ヌクレオチドリンカーまたは非ヌクレオチドリンカーである。いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は、テトラループを含むヌクレオチドリンカーであり、テトラループのヌクレオチド配列は、以下：
（ａ）ＵＮＣＧ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、Ｇ、またはＵである）、
（ｂ）ＧＮＲＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｒ＝ＡまたはＧである）、
（ｃ）ＡＮＹＡ（式中、Ｎ＝Ａ、Ｃ、ＧまたはＵであり、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｄ）ＣＵＹＧ（式中、Ｙ＝ＣまたはＴである）、
（ｅ）ＵＭＡＣ（式中、Ｍ＝ＡまたはＣである）、および
（ｆ）ＣＵＵＧからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵまたはＵＧＵＵＵを含むヌクレオチドリンカーである。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＵＵＧＡＵを含む。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドリンカーは、ヌクレオチド配列ＵＧＵＵＵを含む。
いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は、テトラループを含むヌクレオチドリンカーであり、テトラループの配列はＵＵＣＧである。いくつかの実施形態において、テトラループの配列は、ＧＡＵＣである。
いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は、以下：
（ａ）エチレングリコールリンカー、および
（ｂ）アルキルリンカーからなる群から選択される非ヌクレオチドリンカーである。
いくつかの実施形態において、非ヌクレオチドリンカーは、ヘキサエチレングリコールリンカーである。いくつかの実施形態において、非ヌクレオチドリンカーは、Ｃ９アルキルリンカーである。
いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、５’ジホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む。いくつかの実施形態において、アゴニストは、５’トリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含む。いくつかの実施形態において、その誘導体もしくはアナログは、ホスフェート生物学的等価体を含み、ホスフェート生物学的等価体は、ホスホネート、チオホスホネート、ホスホロチオエート、サルフェート、スルホネート、スルファメート、チアゾリジノン、カルボキシレート、マロネート、ボロン酸、ベンゾオキサボロール、ボラノホスフェート、スクアラミドから選択される。
いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、改変ヌクレオチド、改変ヌクレオシドもしくは改変核酸塩基、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、アゴニストは、ヌクレオチド間結合またはポリヌクレオチド骨格に対する改変を含む。
いくつかの態様では、本開示のＲＬＲアゴニストは、以下の特性：
（ａ）１つ以上のＲＬＲ（例えば、ＲＩＧ－１、ＭＤＡ５および／またはＬＧＰ２）に特異的に結合する、
（ｂ）ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させる、
（ｃ）インターフェロン誘導遺伝子（ＩＳＧ）のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる、
（ｄ）ＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる、
（ｅ）二本鎖の安定性を高める、
（ｆ）ＲＬＲに対する結合アフィニティを増加させる、
（ｇ）標的外結合を減らす、
（ｈ）生物学的半減期を長くする、
（ｉ）生体内分布とバイオアベイラビリティを高める、
（ｊ）細胞および／または組織への取り込みを増加させ、および／または増強する、
（ｋ）免疫原性を低下させる、および
（ｌ）（ａ）～（ｋ）のいずれかの組み合わせのうちの少なくとも１つ以上を示す。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、アゴニストは、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５および３６からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供する。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供し、アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、第１のポリヌクレオチドは、第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、二本鎖を形成し、二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、アゴニストは、配列モチーフを含み、この配列モチーフは、この配列モチーフを含まないアゴニストと比較して、ＲＬＲによって媒介される少なくとも１つの改良された生体活性を与え、第１のポリヌクレオチドおよび前記第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３７および６８、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号３８および６９、
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号３９および７０、
（ｉｖ）それぞれ、配列番号４０および７１、
（ｖ）それぞれ、配列番号４１および７２、
（ｖｉ）それぞれ、配列番号４２および７３、
（ｖｉｉ）それぞれ、配列番号４３および７４、
（ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号４４および７５、
（ｉｘ）それぞれ、配列番号４５および７６、
（ｘ）それぞれ、配列番号４６および７７、
（ｘｉ）それぞれ、配列番号４７および７８、
（ｘｉｉ）それぞれ、配列番号４８および７９、
（ｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号４９および８０、
（ｘｉｖ）それぞれ、配列番号５０および８１、
（ｘｖ）それぞれ、配列番号５１および８２、
（ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５２および８３、
（ｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号５３および８４、
（ｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号５４および８５、
（ｘｉｘ）それぞれ、配列番号５５および８６、
（ｘｘ）それぞれ、配列番号５６および８７、
（ｘｘｉ）それぞれ、配列番号５７および８８、
（ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、
（ｘｘｉｖ）それぞれ、配列番号６０および９０、
（ｘｘｖ）それぞれ、配列番号６１および９１、
（ｘｘｖｉ）それぞれ、配列番号６２および９２、
（ｘｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９１、
（ｘｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号６４および９３、
（ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号６５および９４、
（ｘｘｘ）それぞれ、配列番号６６および９５、
（ｘｘｘｉ）それぞれ、配列番号６７および９６、および
（ｘｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９７からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、アゴニストが、シチジンと塩基対を形成するイノシンを含む少なくとも１つ以上のヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストが、配列番号２２、２３および２５からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供する。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供し、アゴニストは、シチジンと塩基対を形成するイノシンを含む少なくとも１つ以上のヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、式５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、第１のポリヌクレオチドを含み、（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、第２のポリヌクレオチドを含み、第１のポリヌクレオチドおよび第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、および
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１および９１からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストを提供し、アゴニストは、非ヌクレオチドリンカーを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、アゴニストは、式５’－（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）－Ｌ－（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）－３’を含み、式中、（Ｎ１－Ｎ２－Ｘ１）は、第１のポリヌクレオチドを含み、（Ｘ２－Ｎ３－Ｎ４）は、第２のポリヌクレオチドを含み、第１のポリヌクレオチドおよび第２のポリヌクレオチドは、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３７および６８、
（ｉｉ）それぞれ、配列番号３８および６９、
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号３９および７０、
（ｉｖ）それぞれ、配列番号４０および７１、
（ｖ）それぞれ、配列番号４１および７２、
（ｖｉ）それぞれ、配列番号４２および７３、
（ｖｉｉ）それぞれ、配列番号４３および７４、
（ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号４４および７５、
（ｉｘ）それぞれ、配列番号４５および７６、
（ｘ）それぞれ、配列番号４６および７７、
（ｘｉ）それぞれ、配列番号４７および７８、
（ｘｉｉ）それぞれ、配列番号４８および７９、
（ｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号４９および８０、
（ｘｉｖ）それぞれ、配列番号５０および８１、
（ｘｖ）それぞれ、配列番号５１および８２、
（ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５２および８３、
（ｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号５３および８４、
（ｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号５４および８５、
（ｘｉｘ）それぞれ、配列番号５５および８６、
（ｘｘ）それぞれ、配列番号５６および８７、
（ｘｘｉ）それぞれ、配列番号５７および８８、
（ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号５８および８９、
（ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９および８９、
（ｘｘｉｖ）それぞれ、配列番号６０および９０、
（ｘｘｖ）それぞれ、配列番号６１および９１、
（ｘｘｖｉ）それぞれ、配列番号６２および９２、
（ｘｘｖｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９１、
（ｘｘｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号６４および９３、
（ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号６５および９４、
（ｘｘｘ）それぞれ、配列番号６６および９５、
（ｘｘｘｉ）それぞれ、配列番号６７および９６、および
（ｘｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号６３および９７からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかの態様において、本開示は、ＲＬＲアゴニストであって、アゴニストを含むヌクレオチド配列が、ゲノムＤＮＡ配列またはｍＲＮＡ配列に対して相補性ではなく、ＲＬＲアゴニストが、ＲＮＡ干渉に関与せず、ＲＬＲアゴニストが、遺伝子発現をサイレンシングしない、ＲＬＲアゴニストを提供する。
改変核酸塩基、ヌクレオシドまたはヌクレオチドを含むＲＬＲアゴニスト
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、１つ以上の改変核酸塩基、ヌクレオシドまたはヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、改変ＲＬＲアゴニストは、参照となる非改変ＲＬＲアゴニストと比較して、ＲＬＲアゴニストが導入される細胞の安定性の向上、細胞内保持、標的結合の向上および／または自然免疫応答の増加を含め、有用な特性を有していてもよい。したがって、改変ＲＬＲアゴニストの使用は、低下した免疫原性を有するだけではなく、標的結合、核酸の細胞内保持の効率を高め得る。一実施形態において、本開示によって提供されるアゴニストは、標的結合アフィニティを高めるように改変された少なくとも１つの領域を含む、１つ以上のオリゴヌクレオチドで構成される。標的ポリペプチド（例えば、ＲＬＲ受容体）に対するオリゴヌクレオチドのアフィニティは、例えば、蛍光標識されたオリゴヌクレオチドがその標的に結合したときの蛍光偏光（ＦＰ）の程度を測定することによって決定することができる（Ｍｏｅｒｋｅ（２００９）Ｃｕｒｒ Ｐｒｏｔｏｃ Ｃｈｅｍ Ｂｉｏｌ １（１）：１－１５）。
別の実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、二本鎖の安定性を高める少なくとも１つの改変核酸塩基、ヌクレオシドまたはヌクレオチドを含む少なくとも１つの領域を含む、少なくとも１つのオリゴヌクレオチドで構成される。二重鎖の安定性は、二本鎖を構成する２つのオリゴヌクレオチド鎖が解離する温度である二本鎖のＴｍを測定することによって、日常的に決定することができ、解離は、分光光度法で検出される。Ｔｍが高いほど、二本鎖の安定性は高い。
一実施形態において、二本鎖の安定性を高めるために改変されるオリゴヌクレオチドの領域は、糖の２’位に改変された少なくとも１つのヌクレオチドを含み、最も好ましくは、２’－Ｏ－アルキル、２’－Ｏ－アルキル－Ｏ－アルキルまたは２’－フルオロ改変されたヌクレオチドを含む。別の実施形態において、ＲＬＲアゴニストを構成するオリゴヌクレオチドはまた、ヌクレアーゼ耐性を向上させるために改変される。細胞は、核酸を分解し得るさまざまなエキソヌクレアーゼおよびエンドヌクレアーゼを含む。多くのヌクレオチドおよびヌクレオシドの改変は、組み込まれるオリゴヌクレオチドを、非改変オリゴヌクレオチドよりもヌクレアーゼ消化への耐性を高くすることが示されている。ヌクレアーゼ耐性は、細胞抽出物または単離されたヌクレアーゼ溶液と共にオリゴヌクレオチドをインキュベートし、通常はゲル電気泳動によって経時的に残った無傷のオリゴヌクレオチドの程度を測定することによって、日常的に測定される。ヌクレアーゼ耐性を向上させるように改変されたオリゴヌクレオチドは、非改変オリゴヌクレオチドよりも長時間にわたり、無傷で存続する。ヌクレアーゼ耐性を向上させるか、または付与する種々のオリゴヌクレオチド改変が示されている。現在、少なくとも１つのホスホロチオエート改変を含むオリゴヌクレオチドが、より好ましい。ある場合に、標的結合アフィニティを向上させるオリゴヌクレオチド改変は、独立して、ヌクレアーゼ耐性を向上させることもできる（Ｄｅ Ｍｅｓｍａｅｋｅｒら、１９９５、Ａｃｃ．Ｃｈｅｍ．Ｒｅｓ．２８：３６６－３７４）。
本発明について想定されるいくつかの好ましいオリゴヌクレオチドの具体例としては、例えば、ホスホロチオエート、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、短鎖アルキルまたはシクロアルキル糖間結合または短鎖ヘテロ原子またはヘテロ環糖間結合などの改変骨格を含むものが挙げられる。最も好ましいのは、ホスホロチオエート骨格を有するオリゴヌクレオチド（立体特異的な様式で合成されたものを含む）およびヘテロ原子骨格を有するもの、特に、ＣＨ２－ＮＨ－Ｏ－ＣＨ２、ＣＨ２－Ｎ（ＣＨ３）－Ｏ－ＣＨ２［メチレン（メチルイミノ）またはＭＭＩ骨格として知られている］、ＣＨ２－Ｏ－Ｎ（ＣＨ３）－ＣＨ２、ＣＨ２－Ｎ（ＣＨ３）－Ｎ（ＣＨ３）－ＣＨ２およびＯ－Ｎ（ＣＨ３）－ＣＨ２－ＣＨ２骨格（式中、天然のホスホジエステル骨格はＯ－Ｐ－Ｏ－ＣＨ２として表される）が挙げられる。Ｄｅ Ｍｅｓｍａｅｋｅｒら（１９９５、Ａｃｃ．Ｃｈｅｍ．Ｒｅｓ．２８：３６６－３７４）によって開示されるアミド骨格も好ましい。オリゴヌクレオチドは、１つ以上の置換糖部分も含んでいてもよい。好ましいオリゴヌクレオチドは、２’位に以下のうちの１つを含む。ＯＨ、ＳＨ、ＳＣＨ３、Ｆ、ＯＣＮ、ＯＣＨ３ＯＣＨ３、ＯＣＨ３Ｏ（ＣＨ２）ｎＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＮＨ２またはＯ（ＣＨ２）ｎＣＨ３（式中、ｎは１～約１０である）；Ｃ１～Ｃ１０低級アルキル、アルコキシアルコキシ（当該技術分野ではＯ－アルキル－Ｏ－アルキルとしても知られている）、置換低級アルキル、アルカリールまたはアラルキル；Ｃｌ；Ｂｒ；ＣＮ；ＣＦ３；ＯＣＦ３；Ｏ－、Ｓ－またはＮ－アルキル；Ｏ－、Ｓ－またはＮ－アルケニル；ＳＯＣＨ３；ＳＯ２ＣＨ３；ＯＮＯ２；ＮＯ２；Ｎ３；ＮＨ２；ヘテロシクロアルキル；ヘテロシクロアルカリール；アミノアルキルアミノ；ポリアルキルアミノ；置換シリル；ＲＮＡ開裂基；レポーター基；インターカレーター；オリゴヌクレオチドの薬物動態特性を改善するための基；またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改善するための基および同様の特性を有する他の置換基。好ましい改変としては、２’－メトキシエトキシ［２’－Ｏ－ＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、２’－Ｏ－（２－メトキシエチル）または２’－ＭＯＥとしても知られている］が挙げられる（Ｍａｒｔｉｎら、Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ、１９９５、７８、４８６）。他の好ましい改変としては、２’－メトキシ（２’－Ｏ－ＣＨ３）、２’－プロポキシ（２’－ＯＣＨ２ＣＨ２ＣＨ３）および２’－フルオロ（２’－Ｆ）が挙げられる。同様の改変も、オリゴヌクレオチド上の他の位置、特に、３’末端ヌクレオチド上の糖の３’位および５’末端ヌクレオチドの５’位で行われてもよい。オリゴヌクレオチドは、ペントフラノシル基の代わりに、シクロブチルなどの糖模倣物も有していてもよい。
オリゴヌクレオチドは、これに加えて、またはこれに代えて、核酸塩基（当該技術分野では単に「塩基」と呼ばれることが多い）の改変または置換も含んでいてもよい。本明細書で使用される場合、「非改変」または「天然」の核酸塩基は、アデニン（Ａ）、グアニン（Ｇ）、チミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）およびウラシル（Ｕ）を含む。改変核酸塩基としては、天然核酸中に稀に、または一時的にしかみられない核酸塩基、例えば、ヒポキサンチン、６－メチルアデニン、５－ｍｅピリミジン、特に、５－メチルシトシン（５－メチル－２’－デオキシシトシンとも呼ばれ、当該技術分野では５－ｍｅ－Ｃと呼ばれることが多い）、５－ヒドロキシメチルシトシン（ＨＭＣ）、グリコシルＨＭＣおよびゲントビオシルＨＭＣ、ならびに合成核酸塩基、例えば、２－アミノアデニン、２－チオウラシル、２－チオチミン、５－ブロモウラシル、５－ヒドロキシメチルウラシル、８－アザグアニン、７－デアザグアニン、Ｎ６（６－アミノヘキシル）アデニンおよび２，６－ジアミノプリンが挙げられる。Ｋｏｒｎｂｅｒｇ，Ａ．、ＤＮＡ Ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ、Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ＆Ｃｏ．、Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ、１９８０、ｐｐ７５－７７；Ｇｅｂｅｙｅｈｕ，Ｇ．ら、１９８７、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１５：４５１３）。当該技術分野で知られている「普遍的な」塩基、例えば、イノシンが含まれていてもよい。５－ｍｅ－Ｃ置換は、核酸二本鎖の安定性を０．６～１．２℃高めることが示されており（Ｓａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．、Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．およびＬｅｂｌｅｕ，Ｂ．編集、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ、ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ、Ｂｏｃａ Ｒａｔｏｎ、１９９３、ｐｐ．２７６－２７８）、現時点で好ましい塩基置換である。
本発明のオリゴヌクレオチドの別の改変は、オリゴヌクレオチドの活性または細胞への取り込みを向上させる１つ以上の部分またはコンジュゲートをオリゴヌクレオチドに化学的に連結することを伴う。このような部分としては、限定されないが、脂質部分、例えば、コレステロール部分、コレステリル部分（Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、１９８９、８６、６５５３）、コール酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎら、Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．、１９９４、４、１０５３）、チオエーテル、例えば、ヘキシル－Ｓ－トリチルチオール（Ｍａｎｏｈａｒａｎら、Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．、１９９２、６６０、３０６；Ｍａｎｏｈａｒａｎら、Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．、１９９３、３、２７６５）、チオコレステロール（Ｏｂｅｒｈａｕｓｅｒら、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．、１９９２、２０、５３３）、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオールまたはウンデシル残基（Ｓａｉｓｏｎ－Ｂｅｈｍｏａｒａｓら、ＥＭＢＯ Ｊ．、１９９１、１０、１１１；Ｋａｂａｎｏｖら、ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ．、１９９０、２５９、３２７；Ｓｖｉｎａｒｃｈｕｋら、Ｂｉｏｃｈｉｍｉｅ、１９９３、７５、４９）、リン脂質、ポリアミドまたはポリエチレングリコール鎖（Ｍａｎｏｈａｒａｎら、Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ＆Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ、１９９５、１４、９６９）、またはアダマンタン酢酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎら、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．、１９９５、３６、３６５１）が挙げられる。親油性部分を含むオリゴヌクレオチド、およびこのようなオリゴヌクレオチドを調製するための方法は、当該技術分野で、例えば、米国特許第５，１３８，０４５号、同第５，２１８，１０５号および同第５，４５９，２５５号で知られている。
本発明のオリゴヌクレオチドは、プロドラッグとして提供されてもよく、プロドラッグは、一般的には体内で切断され、活性なオリゴヌクレオチドを生成する１つ以上の部分を含む。プロドラッグ手法の一例は、Ｉｍｂａｃｈらにより、ＷＯ公開第９４／２６７６４号に記載されている。
所与のオリゴヌクレオチド中の全ての位置について均一に改変される必要はなく、実際には、上述の改変の１つより多くが、単一のオリゴヌクレオチドに組み込まれてもよく、またはあるオリゴヌクレオチド中の単一ヌクレオシド内に組み込まれる場合さえある。
本発明のオリゴヌクレオチドは、好ましくは、約８～約５０ヌクレオチド長である。本発明の内容において、このことは、本明細書で上に記載した、８～５０個のモノマーを含む天然に存在しないオリゴマーを包含することが理解される。
本発明に従って使用されるオリゴヌクレオチドは、簡便かつ日常的に、固相合成のよく知られた技術によって製造されてもよい。このような合成のための機器は、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓを含む数社の供給業者によって販売される。このような合成のための任意の他の手段も使用可能であり、オリゴヌクレオチドの実際の合成は、十分に当業者の知識および能力の範囲内である。同様の技術を使用して、ホスホロチオエートおよびアルキル化誘導体などの他のオリゴヌクレオチドを調製することもよく知られている。同様の技術および市販の改変アミダイトおよび孔径が制御されたガラス（ＣＰＧ）製品、例えば、ビオチン、フルオレセイン、アクリジンまたはソラレン改変されたアミダイトおよび／またはＣＰＧ（Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ、スターリング Ｖａ．から入手可能）を使用して、蛍光標識され、ビオチン化されるか、または他の改変オリゴヌクレオチド、例えば、コレステロール改変オリゴヌクレオチドを合成することもよく知られている。
いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、１つ以上（例えば、１、２、３または４個）の異なる改変核酸塩基、ヌクレオシドまたはヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００個、またはもっと多く）の異なる改変核酸塩基、ヌクレオシドまたはヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、改変ＲＬＲアゴニストは、対応する非改変ＲＬＲアゴニストと比較して、ＲＬＲアゴニストが導入される細胞における分解を減らし得る。
いくつかの実施形態において、改変核酸塩基は、改変ウラシルである。改変ウラシルを有する例示的な核酸塩基およびヌクレオシドとしては、プソイドウリジン（ψ）、ピリジン－４－オンリボヌクレオシド、５－アザ－ウリジン、６－アザ－ウリジン、２－チオ－５－アザ－ウリジン、２－チオ－ウリジン（ｓ２Ｕ）、４－チオ－ウリジン（ｓ４Ｕ）、４－チオ－プソイドウリジン、２－チオ－プソイドウリジン、５－ヒドロキシ－ウリジン（ｈｏ５Ｕ）、５－アミノアリル－ウリジン、５－ハロ－ウリジン（例えば、５－ヨード－ウリジンまたは５－ブロモ－ウリジン）、３－メチル－ウリジン（ｍ３Ｕ）、５－メトキシ－ウリジン（ｍｏ５Ｕ）、ウリジン ５－オキシ酢酸（ｃｍｏ５Ｕ）、ウリジン ５－オキシ酢酸メチルエステル（ｍｃｍｏ５Ｕ）、５－カルボキシメチル－ウリジン（ｃｍ５Ｕ）、１－カルボキシメチル－プソイドウリジン、５－カルボキシヒドロキシメチル－ウリジン（ｃｈｍ５Ｕ）、５－カルボキシヒドロキシメチル－ウリジンメチルエステル（ｍｃｈｍ５Ｕ）、５－メトキシカルボニルメチル－ウリジン（ｍｃｍ５Ｕ）、５－メトキシカルボニルメチル－２－チオ－ウリジン（ｍｃｍ５ｓ２Ｕ）、５－アミノメチル－２－チオ－ウリジン（ｎｍ５ｓ２Ｕ）、５－メチルアミノメチル－ウリジン（ｍｎｍ５Ｕ）、５－メチルアミノメチル－２－チオ－ウリジン（ｍｎｍ５ｓ２Ｕ）、５－メチルアミノメチル－２－セレノ－ウリジン（ｍｎｍ５ｓｅ２Ｕ）、５－カルバモイルメチル－ウリジン（ｎｃｍ５Ｕ）、５－カルボキシメチルアミノメチル－ウリジン（ｃｍｎｍ５Ｕ）、５－カルボキシメチルアミノメチル－２－チオ－ウリジン（ｃｍｎｍ５ｓ２Ｕ）、５－プロピニル－ウリジン、１－プロピニル－プソイドウリジン、５－タウリノメチル－ウリジン（τｍ５Ｕ）、１－タウリノメチル－プソイドウリジン、５－タウリノメチル－２－チオ－ウリジン（τｍ５ｓ２Ｕ）、１－タウリノメチル－４－チオ－プソイドウリジン、５－メチル－ウリジン（ｍ５Ｕ、すなわち、核酸塩基デオキシチミンを有する）、１－メチル－プソイドウリジン（ｍ１ψ）、５－メチル－２－チオ－ウリジン（ｍ５ｓ２Ｕ）、１－メチル－４－チオ－プソイドウリジン（ｍ１ｓ４ψ）、４－チオ－１－メチル－プソイドウリジン、３－メチル－プソイドウリジン（ｍ３ψ）、２－チオ－１－メチル－プソイドウリジン、１－メチル－１－デアザ－プソイドウリジン、２－チオ－１－メチル－１－デアザ－プソイドウリジン、ジヒドロウリジン（Ｄ）、ジヒドロプソイドウリジン、５，６－ジヒドロウリジン、５－メチル－ジヒドロウリジン（ｍ５Ｄ）、２－チオ－ジヒドロウリジン、２－チオ－ジヒドロプソイドウリジン、２－メトキシ－ウリジン、２－メトキシ－４－チオ－ウリジン、４－メトキシ－プソイドウリジン、４－メトキシ－２－チオ－プソイドウリジン、Ｎ１－メチル－プソイドウリジン、３－（３－アミノ－３－カルボキシプロピル）ウリジン（ａｃｐ３Ｕ）、１－メチル－３－（３－アミノ－３－カルボキシプロピル）プソイドウリジン（ａｃｐ３ ψ）、５－（イソペンテニルアミノメチル）ウリジン（ｉｎｍ５Ｕ）、５－（イソペンテニルアミノメチル）－２－チオ－ウリジン（ｉｎｍ５ｓ２Ｕ）、α－チオ－ウリジン、２’－Ｏ－メチル－ウリジン（Ｕｍ）、５，２’－Ｏ－ジメチル－ウリジン（ｍ５Ｕｍ）、２’－Ｏ－メチル－プソイドウリジン（ψｍ）、２－チオ－２’－Ｏ－メチル－ウリジン（ｓ２Ｕｍ）、５－メトキシカルボニルメチル－２’－Ｏ－メチル－ウリジン（ｍｃｍ５Ｕｍ）、５－カルバモイルメチル－２’－Ｏ－メチル－ウリジン（ｎｃｍ５Ｕｍ）、５－カルボキシメチルアミノメチル－２’－Ｏ－メチル－ウリジン（ｃｍｎｍ５Ｕｍ）、３，２’－Ｏ－ジメチル－ウリジン（ｍ３Ｕｍ）および５－（イソペンテニルアミノメチル）－２’－Ｏ－メチル－ウリジン（ｉｎｍ５Ｕｍ）、１－チオ－ウリジン、デオキシチミジン、２’－Ｆ－アラ－ウリジン、２’－Ｆ－ウリジン、２’－ＯＨ－アラ－ウリジン、５－（２－カルボメトキシビニル）ウリジン、および５－［３－（１－Ｅ－プロペニルアミノ）］ウリジンが挙げられる。
いくつかの実施形態において、改変核酸塩基は、改変シトシンである。改変シトシンを有する例示的な核酸塩基およびヌクレオシドとしては、５－アザ－シチジン、６－アザ－シチジン、プソイドイソシチジン、３－メチル－シチジン（ｍ３Ｃ）、Ｎ４－アセチル－シチジン（ａｃ４Ｃ）、５－ホルミル－シチジン（ｆ５Ｃ）、Ｎ４－メチル－シチジン（ｍ４Ｃ）、５－メチル－シチジン（ｍ５Ｃ）、５－ハロ－シチジン（例えば、５－ヨード－シチジン）、５－ヒドロキシメチル－シチジン（ｈｍ５Ｃ）、１－メチル－プソイドイソシチジン、ピロロ－シチジン、ピロロ－プソイドイソシチジン、２－チオ－シチジン（ｓ２Ｃ）、２－チオ－５－メチル－シチジン、４－チオ－プソイドイソシチジン、４－チオ－１－メチル－プソイドイソシチジン、４－チオ－１－メチル－１－デアザ－プソイドイソシチジン、１－メチル－１－デアザ－プソイドイソシチジン、ゼブラリン、５－アザ－ゼブラリン、５－メチル－ゼブラリン、５－アザ－２－チオ－ゼブラリン、２－チオ－ゼブラリン、２－メトキシ－シチジン、２－メトキシ－５－メチル－シチジン、４－メトキシ－プソイドイソシチジン、４－メトキシ－１－メチル－プソイドイソシチジン、リシジン（ｋ２Ｃ）、α－チオ－シチジン、２’－Ｏ－メチル－シチジン（Ｃｍ）、５，２’－Ｏ－ジメチル－シチジン（ｍ５Ｃｍ）、Ｎ４－アセチル－２’－Ｏ－メチル－シチジン（ａｃ４Ｃｍ）、Ｎ４，２’－Ｏ－ジメチル－シチジン（ｍ４Ｃｍ）、５－ホルミル－２’－Ｏ－メチル－シチジン（ｆ５Ｃｍ）、Ｎ４，Ｎ４，２’－Ｏ－トリメチル－シチジン（ｍ４ ２Ｃｍ）、１－チオ－シチジン、２’－Ｆ－アラ－シチジン、２’－Ｆ－シチジンおよび２’－ＯＨ－アラ－シチジンが挙げられる。
いくつかの実施形態において、改変核酸塩基は、改変アデニンである。改変アデニンを有する例示的な核酸塩基およびヌクレオシドとしては、α－チオ－アデノシン、２－アミノ－プリン、２，６－ジアミノプリン、２－アミノ－６－ハロ－プリン（例えば、２－アミノ－６－クロロ－プリン）、６－ハロ－プリン（例えば、６－クロロ－プリン）、２－アミノ－６－メチル－プリン、８－アジド－アデノシン、７－デアザ－アデニン、７－デアザ－８－アザ－アデニン、７－デアザ－２－アミノ－プリン、７－デアザ－８－アザ－２－アミノ－プリン、７－デアザ－２，６－ジアミノプリン、７－デアザ－８－アザ－２，６－ジアミノプリン、１－メチル－アデノシン（ｍ１Ａ）、２－メチル－アデニン（ｍ２Ａ）、Ｎ６－メチル－アデノシン（ｍ６Ａ）、２－メチルチオ－Ｎ６－メチル－アデノシン（ｍｓ２ｍ６Ａ）、Ｎ６－イソペンテニル－アデノシン（ｉ６Ａ）、２－メチルチオ－Ｎ６－イソペンテニル－アデノシン（ｍｓ２ｉ６Ａ）、Ｎ６－（ｃｉｓ－ヒドロキシイソペンテニル）アデノシン（ｉｏ６Ａ）、２－メチルチオ－Ｎ６－（ｃｉｓ－ヒドロキシイソペンテニル）アデノシン（ｍｓ２ｉｏ６Ａ）、Ｎ６－グリシニルカルバモイル－アデノシン（ｇ６Ａ）、Ｎ６－トレオニルカルバモイル－アデノシン（ｔ６Ａ）、Ｎ６－メチル－Ｎ６－トレオニルカルバモイル－アデノシン（ｍ６ｔ６Ａ）、２－メチルチオ－Ｎ６－トレオニルカルバモイル－アデノシン（ｍｓ２ｇ６Ａ）、Ｎ６，Ｎ６－ジメチル－アデノシン（ｍ６ ２Ａ）、Ｎ６－ヒドロキシノバリルカルバモイル－アデノシン（ｈｎ６Ａ）、２－メチルチオ－Ｎ６－ヒドロキシノバリルカルバモイル－アデノシン（ｍｓ２ｈｎ６Ａ）、Ｎ６－アセチル－アデノシン（ａｃ６Ａ）、７－メチル－アデニン、２－メチルチオ－アデニン、２－メトキシ－アデニン、α－チオ－アデノシン、２’－Ｏ－メチル－アデノシン（Ａｍ）、Ｎ６，２’－Ｏ－ジメチル－アデノシン（ｍ６Ａｍ）、Ｎ６，Ｎ６，２’－Ｏ－トリメチル－アデノシン（ｍ６ ２Ａｍ）、１，２’－Ｏ－ジメチル－アデノシン（ｍ１Ａｍ）、２’－Ｏ－リボシルアデノシン（ホスフェート）（Ａｒ（ｐ））、２－アミノ－Ｎ６－メチル－プリン、１－チオ－アデノシン、８－アジド－アデノシン、２’－Ｆ－アラ－アデノシン、２’－Ｆ－アデノシン、２’－ＯＨ－アラ－アデノシンおよびＮ６－（１９－アミノ－ペンタオキサノナデシル）－アデノシンが挙げられる。
いくつかの実施形態において、改変核酸塩基は、改変グアニンである。改変グアニンを有する例示的な核酸塩基およびヌクレオシドとしては、α－チオ－グアノシン、イノシン（Ｉ）、１－メチル－イノシン（ｍ１Ｉ）、ワイオシン（ｉｍＧ）、メチルワイオシン（ｍｉｍＧ）、４－デメチル－ワイオシン（ｉｍＧ－１４）、イソワイオシン（ｉｍＧ２）、ワイブトシン（ｙＷ）、ペルオキシワイブトシン（ｏ２ｙＷ）、ヒドロキシワイブトシン（ＯｈｙＷ）、非改変ヒドロキシワイブトシン（ＯｈｙＷ＊）、７－デアザ－グアノシン、クオシン（Ｑ）、エポキシクオシン（ｏＱ）、ガラクトシル－クオシン（ｇａｌＱ）、マンノシル－クオシン（ｍａｎＱ）、７－シアノ－７－デアザ－グアノシン（ｐｒｅＱ０）、７－アミノメチル－７－デアザ－グアノシン（ｐｒｅＱ１）、アルケオシン（Ｇ＋）、７－デアザ－８－アザ－グアノシン、６－チオ－グアノシン、６－チオ－７－デアザ－グアノシン、６－チオ－７－デアザ－８－アザ－グアノシン、７－メチル－グアノシン（ｍ７Ｇ）、６－チオ－７－メチル－グアノシン、７－メチル－イノシン、６－メトキシ－グアノシン、１－メチル－グアノシン（ｍ１Ｇ）、Ｎ２－メチル－グアノシン（ｍ２Ｇ）、Ｎ２，Ｎ２－ジメチル－グアノシン（ｍ２ ２Ｇ）、Ｎ２，７－ジメチル－グアノシン（ｍ２，７Ｇ）、Ｎ２，Ｎ２，７－ジメチル－グアノシン（ｍ２，２，７Ｇ）、８－オキソ－グアノシン、７－メチル－８－オキソ－グアノシン、１－メチル－６－チオ－グアノシン、Ｎ２－メチル－６－チオ－グアノシン、Ｎ２，Ｎ２－ジメチル－６－チオ－グアノシン、α－チオ－グアノシン、２’－Ｏ－メチル－グアノシン（Ｇｍ）、Ｎ２－メチル－２’－Ｏ－メチル－グアノシン（ｍ２Ｇｍ）、Ｎ２，Ｎ２－ジメチル－２’－Ｏ－メチル－グアノシン（ｍ２ ２Ｇｍ）、１－メチル－２’－Ｏ－メチル－グアノシン（ｍ１Ｇｍ）、Ｎ２，７－ジメチル－２’－Ｏ－メチル－グアノシン（ｍ２，７Ｇｍ）、２’－Ｏ－メチル－イノシン（Ｉｍ）、１，２’－Ｏ－ジメチル－イノシン（ｍ１Ｉｍ）、２’－Ｏ－リボシルグアノシン（ホスフェート）（Ｇｒ（ｐ））、１－チオ－グアノシン、Ｏ６－メチル－グアノシン、２’－Ｆ－アラ－グアノシンおよび２’－Ｆ－グアノシンが挙げられる。
いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、上述の改変核酸塩基の１個以上の組み合わせ（例えば、上述の改変核酸塩基のうちの２、３または４個の組み合わせ）を含む。
特定の実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、特定の改変について、均一に改変される（すなわち、完全に改変され、配列全体にわたって改変される）。例えば、ＲＬＲアゴニストは、５－メチル－シチジン（ｍ５Ｃ）で均一に改変されてもよく、このことは、ｍＲＮＡ配列中の全てのシトシン残基が、５－メチル－シチジン（ｍ５Ｃ）で置き換えられることを意味する。同様に、本開示のＲＬＲアゴニストは、上に記載したものなどの改変残基と置き換えることによって、その配列中に存在する任意の種類のヌクレオシド残基について均一に改変されてもよい。
本開示のＲＬＲアゴニスト中に存在し得るヌクレオシド改変およびその組み合わせの例としては、限定されないが、ＰＣＴ特許出願公開第２０１２／０４５０７５号、第２０１４／０８１５０７号、第２０１４／０９３９２４号、第２０１４／１６４２５３号および第２０１４／１５９８１３号に記載されるものが挙げられる。
本開示のＲＬＲアゴニストは、糖、核酸塩基および／またはヌクレオシド間結合に対する改変の組み合わせを含んでいてもよい。これらの組み合わせは、本明細書に記載される任意の１つ以上の改変を含んでいてもよい。
改変ヌクレオシドと、改変ヌクレオシドの組み合わせの例を、以下の表１および表２に示す。改変ヌクレオチドのこれらの組み合わせを使用して、本開示のＲＬＲアゴニストを形成することができる。特定の実施形態において、改変ヌクレオシドは、本開示のＲＬＲアゴニストの天然ヌクレオチドを部分的または完全に置換してもよい。非限定的な例として、天然ヌクレオチドであるウリジンは、本明細書に記載される改変ヌクレオシドで置換されてもよい。別の非限定的な例において、天然ヌクレオシドであるウリジンは、本明細書に開示される改変ヌクレオシドのうちの少なくとも１つを用い、部分的に置換されてもよい（例えば、天然ウリジンの約０．１％、１％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９９．９％）。
本開示によれば、本開示のポリヌクレオチドは、表１または表２の組み合わせまたは単一の改変を含むように合成されてもよい。
単一の改変が列挙されている場合、その列挙されているヌクレオシドまたはヌクレオチドは、改変されたＡ、Ｕ、ＧまたはＣヌクレオチドまたはヌクレオシドが１００％であることを表す。割合が列挙されている場合、それらは、存在するＡ、Ｕ、ＧまたはＣトリホスフェートの合計量に対する特定のＡ、Ｕ、ＧまたはＣ核酸塩基トリホスフェートの割合を表す。例えば、以下の組み合わせ：２５％５－アミノアリル－ＣＴＰ＋７５％ＣＴＰ／２５％５－メトキシ－ＵＴＰ＋７５％ＵＴＰは、シトシントリホスフェートの２５％が５－アミノアリル－ＣＴＰである一方、シトシンの７５％がＣＴＰであり、一方、ウラシルの２５％が５－メトキシ－ＵＴＰである一方、ウラシルの７５％がＵＴＰである、ポリヌクレオチドを指す。改変ＵＴＰが列挙されていない場合、ポリヌクレオチド中でみられるヌクレオチドの部位の１００％で、天然に存在するＡＴＰ、ＵＴＰ、ＧＴＰおよび／またはＣＴＰが使用される。この例において、ＧＴＰとＡＴＰヌクレオチドは全て、改変されないままである。
ＲＬＲアゴニストを製造する方法
本開示のＲＬＲアゴニストは、限定されないが、インビトロ転写（ＩＶＴ）および合成方法を含む、当技術分野で利用可能な手段によって生成されてもよい。酵素（ＩＶＴ）、固相、液相、合成法の組み合わせ、小領域合成およびライゲーション方法を利用してもよい。一実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ＩＶＴ酵素合成方法を使用して作製される。ＩＶＴによってポリヌクレオチドを作製する方法は、当該技術分野で知られており、国際出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１３／３００６２号に記載されており、その内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。したがって、本開示は、本明細書に記載のＲＬＲアゴニストをインビトロで転写するために使用可能なポリヌクレオチド、例えば、ＤＮＡ、構築物およびベクターも含む。
非天然改変核酸塩基は、合成中または合成後に、ポリヌクレオチド（例えば、ＲＮＡ）に導入されてもよい。特定の実施形態において、改変は、ヌクレオシド間結合、プリンまたはピリミジン塩基、または糖に対してなされてもよい。特定の実施形態において、改変は、化学合成またはポリメラーゼ酵素を用い、ポリヌクレオチド鎖の末端またはポリヌクレオチド鎖中の他のどこかに導入されてもよい。改変核酸およびそれらの合成の例は、ＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１２／０５８５１９号に開示される。改変ポリヌクレオチドの合成は、ＶｅｒｍａおよびＥｃｋｓｔｅｉｎ、Ａｎｎｕａｌ Ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、ｖｏｌ．７６、９９－１３４（１９９８）にも記載される。
酵素または化学的なライゲーション方法のいずれかを用いて、ポリヌクレオチドまたはその領域を、異なる機能性部分、例えば、標的化剤または送達剤、蛍光標識、脂質、ナノ粒子などとコンジュゲーションしてもよい。ポリヌクレオチドおよび改変ポリヌクレオチドのコンジュゲートは、Ｇｏｏｄｃｈｉｌｄ、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、ｖｏｌ．１（３）、１６５－１８７（１９９０）にまとめられている。
オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチドの合成、およびこれらのコンジュゲーションおよびライゲーションは、Ｔａｓｋｏｖａら、（２０１７）Ｃｈｅｍｂｉｏｃｈｅｍ １８（１７）：１６７１－１６８２；Ｇｏｏｄｉｎｇら、（２０１６）Ｅｕｒ Ｊ Ｐｈａｒｍ Ｂｉｏｐｈａｒｍ １０７：３２１－４０；Ｍｅｎｚｉら、（２０１５）Ｆｕｔｕｒｅ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ７（１３）：１７３３－４９；Ｗｉｎｋｌｅｒ Ｊ．、（２０１３）Ｔｈｅｒ Ｄｅｌｉｖ．（７）：７９１－８０９；Ｓｉｎｇｈら、（２０１０）Ｃｈｅｍ Ｓｏｃ Ｒｅｖ ３９（６）：２０５４－７０；およびＬｕら、（２０１０）Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ Ｃｈｅｍ ２１（２）：１８７－２０２にさらに記載される。
医薬組成物および製剤
特定の実施形態において、本発明は、薬学的に許容される希釈剤、担体、可溶化剤、乳化剤、保存剤および／またはアジュバントと共にＲＬＲアゴニストを含む医薬組成物を提供する。
特定の実施形態において、許容される製剤材料は、好ましくは、使用される投薬量および濃度で、レシピエントに対して無毒である。特定の実施形態において、製剤材料は、皮下投与および／または静脈内投与のためのものである。特定の実施形態において、医薬組成物は、例えば、組成物のｐＨ、浸透圧、粘度、透明度、色、等張性、臭気、無菌性、安定性、溶解または放出の速度、吸着または浸透を改変し、維持するか、または保存するための製剤材料を含んでいてもよい。特定の実施形態において、適切な製剤材料としては、限定されないが、アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニンまたはリジン）；抗菌剤；酸化防止剤（例えば、アスコルビン酸、亜硫酸ナトリウムまたは亜硫酸水素ナトリウム）；バッファー（例えば、ホウ酸塩、重炭酸塩、Ｔｒｉｓ－ＨＣｌ、クエン酸塩、リン酸塩、その他の有機酸）；増量剤（例えば、マンニトールまたはグリシン）；キレート剤（例えば、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ））；錯化剤（例えば、カフェイン、ポリビニルピロリドン、β－シクロデキストリンまたはヒドロキシプロピル－β－シクロデキストリン）；フィラー；単糖類；二糖類；および他の炭水化物（例えば、グルコース、マンノースまたはデキストリン）；タンパク質（例えば、血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン）；着色剤、香味剤および希釈剤；乳化剤；親水性ポリマー（例えば、ポリビニルピロリドン）；低分子量ポリペプチド；塩を形成する対イオン（例えば、ナトリウム）；保存料（例えば、塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン、ソルビン酸または過酸化水素）；溶媒（例えば、グリセリン、プロピレングリコールまたはポリエチレングリコール）；糖アルコール（例えば、マンニトールまたはソルビトール）；懸濁剤；界面活性剤または湿潤剤（例えば、プルロニック（登録商標）、ＰＥＧ、ソルビタンエステル、ポリソルベート、例えば、ポリソルベート２０、ポリソルベート８０、トリトン、トロメタミン、レシチン、コレステロール、チロキサパル）；安定性向上剤（例えば、スクロースまたはソルビトール）；張性向上剤（例えば、アルカリ金属ハロゲン化物、好ましくは塩化ナトリウムまたは塩化カリウム、マンニトールソルビトール）；送達ビヒクル；希釈剤；賦形剤および／または医薬品アジュバントが挙げられる。（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、１８ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ、Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ編集、Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ（１９９５）。特定の実施形態において、製剤は、ＰＢＳ；２０ｍＭ ＮａＯＡＣ、ｐＨ５．２、５０ｍＭ ＮａＣｌ；および／または１０ｍＭ ＮＡＯＡＣ、ｐＨ５．２、９％スクロースを含む。特定の実施形態において、最適な医薬組成物は、例えば、意図した投与経路、送達形式および所望な投薬量に基づいて、当業者によって決定されるだろう。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（前出）を参照。特定の実施形態において、このような組成物は、ＲＬＲアゴニストの物理的状態、安定性、インビボでの放出速度および／またはインビボでの排泄速度に影響を及ぼす場合がある。
特定の実施形態において、医薬組成物中の主要なビヒクルまたは担体は、本質的に水性または非水性のいずれかであってもよい。例えば、特定の実施形態において、適切なビヒクルまたは担体は、注射用水、生理食塩水溶液または人工脳脊髄液であってもよく、おそらく、非経口投与用の組成物に一般的な他の物質が追加されている。特定の実施形態において、生理食塩水は、等張リン酸緩衝生理食塩水を含む。特定の実施態様において、中性緩衝生理食塩水または血清アルブミンと混合された生理食塩水は、さらなる例示的なビヒクルである。特定の実施形態において、医薬組成物は、ｐＨ約７．０～８．５のＴｒｉｓバッファー、またはｐＨ約４．０～５．５の酢酸バッファーを含み、これらはさらに、ソルビトールまたはそのための適切な代替物質を含んでいてもよい。特定の実施形態において、ＲＬＲアゴニストを含む組成物は、所望な純度を有する選択された組成物と、最適な製剤化薬剤（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、前出）とを凍結乾燥ケーキまたは水溶液の形態で混合することによって、貯蔵のために調製することができる。さらに、特定の実施形態において、ＲＬＲアゴニストを含む組成物は、スクロースなどの適切な賦形剤を使用して、凍結乾燥物として製剤化されてもよい。
特定の実施形態において、医薬組成物は、非経口送達のために選択することができる。特定の実施形態において、本組成物は、吸入用または経口などの消化管を介した送達用に選択することができる。このような薬学的に許容される組成物の調製は、当業者の能力の範囲内である。
特定の実施形態において、製剤成分は、投与部位に許容される濃度で存在する。特定の実施形態において、バッファーを使用して、組成物を生理学的ｐＨまたはわずかに低いｐＨ、典型的には約５～約８のｐＨ範囲内に維持する。
特定の実施形態において、非経口投与が想定される場合、治療組成物は、薬学的に許容されるビヒクル中にＲＬＲアゴニストを含む、発熱物質を含まない非経口的に許容される水溶液の形態であってもよい。特定の実施形態において、非経口注射用のビヒクルは、ＲＬＲアゴニストが無菌等張溶液として製剤化され、適切に保存される、無菌蒸留水である。特定の実施形態において、調製は、送達ビヒクルまたは薬剤、例えば、その後にデポー注射を介して送達可能な製品の制御放出または徐放を行うことができる、注射可能なミクロスフェア、生体内分解性粒子、ポリマー化合物（例えば、ポリ乳酸、ポリグリコール酸またはポリエチレンイミン（例えば、ＪｅｔＰＥＩ（登録商標）））、ビーズまたはリポソームを用いた、所望な分子の製剤化を伴っていてもよい。特定の実施形態において、ヒアルロン酸も使用することができ、循環中の持続期間を促進する効果を有することができる。特定の実施形態において、移植可能な薬物送達デバイスを使用して、所望な分子を導入することができる。
特定の実施形態において、医薬組成物は、吸入のために製剤化することができる。特定の実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、吸入のための乾燥粉末として製剤化することができる。特定の実施形態において、ＲＬＲアゴニストを含む吸入溶液は、エアロゾル送達用の噴射剤と共に製剤化されてもよい。特定の実施形態において、溶液を噴霧してもよい。肺投与は、ＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＵＳ９４／００１８７５号にさらに記載されており、化学修飾されたタンパク質の肺送達が記載されている。
特定の実施形態において、製剤を経口投与してもよいことが想定される。特定の実施形態において、この様式で投与されるＲＬＲアゴニストは、錠剤およびカプセルなどの固体剤形の配合において慣習的に使用される担体を用いて、または用いずに製剤化されてもよい。特定の実施形態において、カプセルは、バイオアベイラビリティが最大化され、前全身性分解が最小化されるときに、胃腸管中、ある時点で製剤の活性部分を放出するように設計することができる。特定の実施形態において、ＲＬＲアゴニストの吸収を促進するために、少なくとも１つのさらなる薬剤を含んでいてもよい。特定の実施形態において、希釈剤、香味料、低融点ワックス、植物油、滑沢剤、懸濁剤、錠剤崩壊剤およびバインダーも使用することができる。
特定の実施形態において、医薬組成物は、錠剤の製造に適した非毒性の賦形剤との混合物中に有効量のＲＬＲアゴニストを含むことができる。特定の実施形態において、錠剤を滅菌水または別の適切なビヒクルに溶解することにより、溶液を単位用量形態で調製することができる。特定の実施形態において、適切な賦形剤としては、限定されないが、不活性希釈剤、例えば、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウムまたは炭酸水素ナトリウム、ラクトース、またはリン酸カルシウム；または結合剤、例えば、デンプン、ゼラチンまたはアカシア；または潤滑剤、例えば、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸またはタルクが挙げられる。
徐放性製剤または制御送達製剤にＲＬＲアゴニストを含む製剤を含め、さらなる医薬組成物が当業者には明らかであろう。特定の実施形態において、種々の他の徐放手段または制御送達手段を製剤化するための技術、例えば、リポソーム担体、生体侵食性微粒子または多孔性ビーズおよびデポー注射も、当業者に知られている。例えば、医薬組成物を送達するための多孔質ポリマー微粒子の制御放出を記載するＰＣＴ出願番号第ＰＣＴ／ＵＳ９３／００８２９号を参照。特定の実施形態において、徐放性調製物は、成形品、例えばフィルムまたはマイクロカプセルの形態の半透過性ポリマーマトリックスを含んでいてもよい。徐放性マトリックスとしては、ポリエステル、ヒドロゲル、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号およびＥＰ０５８，４８１）、Ｌ－グルタミン酸およびガンマエチル－Ｌ－グルタメートのコポリマー（Ｓｉｄｍａｎら、Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ、２２：５４７－５５６（１９８３））、ポリ（２－ヒドロキシエチル－メタクリレート）（Ｌａｎｇｅｒら、Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｍａｔｅｒ．Ｒｅｓ．、１５：１６７－２７７（１９８１）およびＬａｎｇｅｒ、Ｃｈｅｍ．Ｔｅｃｈ．、１２：９８－１０５（１９８２））、エチレン酢酸ビニル（Ｌａｎｇｅｒら、前出）またはポリ－Ｄ（－）－３－ヒドロキシ酪酸（ＥＰ１３３，９８８）を挙げることができる。特定の実施形態において、徐放性組成物は、当該技術分野で公知のいくつかの方法のいずれかによって調製され得るリポソームも含んでいてもよい。例えば、Ｅｐｐｓｔｅｉｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、８２：３６８８－３６９２（１９８５）；ＥＰ ０３６，６７６；ＥＰ ０８８，０４６およびＥＰ １４３，９４９を参照。
インビボ投与に使用される医薬組成物は、典型的には、無菌である。特定の実施形態において、このことは、滅菌濾過膜による濾過によって達成することができる。特定の実施形態において、組成物が凍結乾燥される場合、この方法を使用する滅菌は、凍結乾燥および再構成の前または後のいずれかに行うことができる。特定の実施形態において、非経口投与用の組成物は、凍結乾燥形態または溶液で保存することができる。特定の実施形態において、非経口組成物は、一般に、無菌アクセスポートを有する容器、例えば、皮下注射針によって貫通可能なストッパーを有する静脈内溶液バッグまたはバイアルに入れられる。
特定の実施形態において、医薬組成物が製剤化されると、溶液、懸濁液、ゲル、エマルション、固体として、または脱水粉末もしくは凍結乾燥粉末として無菌バイアル中で保存することができる。特定の実施形態において、このような製剤は、すぐに使用できる形態または投与前に再構成される形態（例えば、凍結乾燥されたもの）のいずれかで保存することができる。
特定の実施形態において、単回投薬の投与単位を製造するためのキットが提供される。特定の実施形態において、キットは、乾燥タンパク質を有する第１の容器および水性製剤を有する第２の容器の両方を含んでいてもよい。特定の実施形態において、シングルチャンバおよびマルチチャンバのあらかじめ充填されたシリンジ（例えば、液体シリンジおよびリオシリンジ（ｌｙｏｓｙｒｉｎｇｅ））を含むキットが含まれる。
特定の実施形態において、治療的に使用されるＲＬＲアゴニストを含む医薬組成物の有効な量は、例えば、治療の内容および目的に依存するだろう。当業者は、特定の実施形態に従って、治療のための適切な投薬量レベルが、部分的に、送達される分子、ＲＬＲアゴニストが使用される適応症、投与経路、および患者の体格（体重、体表または臓器の大きさ）および／または状態（年齢および全体的な健康状態）に応じて変わり得ることを理解するだろう。特定の実施形態において、臨床医は、投薬量を滴定し、投与経路を変更して、最適な治療効果を得ることができる。
特定の実施形態において、投薬頻度は、使用される製剤中のＲＬＲアゴニストの薬物動態パラメータを考慮するだろう。特定の実施形態において、臨床医は、所望の効果を達成する投与量に到達するまで、組成物を投与する。したがって、特定の実施形態において、本組成物は、単回投与または２回以上の投与（同じ量の所望な分子を含んでいてもよく、または含まなくてもよい）として経時的に、または移植デバイスまたはカテーテルを介した持続注入として投与されてもよい。適切な投薬量のさらなる微調整は、当業者によって日常的に行われ、それらによって日常的に実行される作業の範囲内である。特定の実施形態において、適切な用量反応データを使用することにより、適切な投薬量を確認することができる。
特定の実施形態において、医薬組成物の投与経路は、既知の方法、例えば、経口によって、静脈内、腹腔内、脳内（実質内）、脳室内、筋肉内、皮下、眼内、動脈内、門脈内または病変内経路による注射によって、徐放システムによって、または移植デバイスによるものである。特定の実施形態において、本組成物は、ボーラス注射によって、または注入によって連続的に、または移植デバイスによって投与することができる。特定の実施形態において、併用療法の個々の要素は、異なる経路によって投与されてもよい。
特定の実施形態において、本組成物は、所望な分子が吸収またはカプセル化されている膜、スポンジまたは別の適切な材料の移植によって、局所的に投与されてもよい。特定の実施形態において、移植デバイスが使用される場合、このデバイスは、任意の適切な組織または器官に移植されてもよく、所望な分子の送達は、拡散、時限放出型ボーラス、または連続投与によるものであってもよい。特定の実施形態において、ＲＬＲアゴニストを含む医薬組成物をエキソビボで使用することが望ましい場合がある。このような例では、患者から取り出された細胞、組織、および／または器官は、ＲＬＲアゴニストを含む医薬組成物に曝露され、その後、その細胞、組織および／または器官が、続いて患者に移植により戻される。
特定の実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、アゴニストを発現し、分泌するために、本明細書に記載されるような方法を使用して、遺伝子操作された特定の細胞を移植することにより送達されてもよい。特定の実施形態において、このような細胞は、動物またはヒトの細胞であってもよく、自己、自己由来の異種、または異種であってもよい。特定の実施形態において、細胞は、不死化することができる。特定の実施形態において、免疫学的応答の機会を減少させるために、細胞をカプセル化して、周囲の組織の浸潤を回避することができる。特定の実施形態において、封入材料は、典型的には、タンパク質産物の放出を可能にするが、患者の免疫系による、または周囲組織からの他の有害な因子による細胞の破壊を防ぐ、生体適合性、半透過性のポリマー包接物または膜である。
いくつかの態様において、本開示は、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を減らすか、または阻害することを必要とする対象においてそれを行うための医薬組成物であって、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストと、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）担体中で製剤化される。いくつかの実施形態において、ＰＥＩ担体は、ＪｅｔＰＥＩ（登録商標）である。
用途
本明細書に記載の組成物は、診断および治療用途で使用することができる。例えば、検出可能に標識されたＲＬＲアゴニストは、サンプル（例えば、生体サンプル）中の標的タンパク質の存在または量を検出するためのアッセイに使用することができる。本組成物は、標的機能（例えば、ＲＬＲが媒介する細胞シグナル伝達または応答）の阻害を研究するためのインビトロアッセイで使用することができる。いくつかの実施形態において、例えば、本組成物が、標的（例えばタンパク質またはポリペプチド）に結合し、標的を活性化する場合、本組成物は、標的タンパク質またはポリペプチドの活性も誘導するさらなる新規化合物を特定するように設計されたアッセイにおいて陽性対照として使用することができ、および／またはその他、標的タンパク質またはポリペプチドと関連する障害の治療にも有用である。例えば、ＲＬＲを活性化する組成物は、ＲＬＲ機能を誘導し、増加させ、または刺激するさらなる化合物（例えば、低分子、アプタマーまたは抗体）を特定するためのアッセイにおいて陽性対照として使用することができる。本組成物は、以下に詳述されるように、治療方法に使用することもできる。
キット
キットは、本明細書に開示されるＲＬＲアゴニストと、使用のための指示書とを含んでいてもよい。キットは、適切な容器中に、ＲＬＲアゴニストと、１つ以上の対照と、種々のバッファー、試薬、酵素および当該技術分野でよく知られている他の標準的な成分を含んでいてもよい。
容器は、少なくとも１つのバイアル、ウェル、試験管、フラスコ、瓶、シリンジ、または他の容器手段を含んでいてもよく、その中に、ＲＬＲアゴニストが入れられ、ある場合には、適切に等分されていてもよい。さらなる構成要素が与えられる場合、キットは、この構成要素を入れることが可能なさらなる容器を含んでいてもよい。キットは、商業的に販売するために厳重に封じ込めた状態で、ＲＬＲアゴニストおよび任意の他の試薬容器を含むための手段も含んでいてもよい。このような容器は、射出成形またはブロー成形されたプラスチック容器を含んでいてもよく、その中に所望なバイアルが保持される。容器および／またはキットには、使用のための指示書および／または警告が記載されたラベルを含んでいてもよい。
いくつかの態様において、本開示は、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニスト、または本開示によって提供される医薬組成物と、対象における免疫応答を刺激し、または癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または対象における腫瘍成長を阻害する際の使用のための指示書と、場合により１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて使用するための指示書とを含む、キットを提供する。
いくつかの実施形態において、アゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて投与され、１つ以上のさらなる治療薬剤は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬、細胞死誘発剤、オプソニン化剤（例えば、オプソニン化抗体）、細胞毒性薬剤、免疫系療法、サイトカイン、共刺激分子のアクチベータ、阻害分子の阻害剤、ワクチン、細胞免疫療法、またはこれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤の投与の前または後に投与されるか、または１つ以上のさらなる治療薬剤が、ＲＬＲアゴニストもしくは医薬組成物の投与と同時、投与より前または後に投与される。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト、ＴＩＭ－３アンタゴニスト、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、ＢＴＬＡアンタゴニスト、ＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、ＫＩＲアンタゴニスト、ＬＡＧ－３アンタゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストである。
使用方法
本発明の組成物は、ＲＬＲの検出および／または定量化、および／またはＲＬＲ機能のアゴニズムを含む多数のインビトロおよびインビボでの有用性を有する。
上述の組成物は、特に、対象における様々な癌または感染症を治療または予防するための方法において有用である。本組成物は、投与経路に部分的に依存する様々な方法を使用して、対象（例えば、ヒト対象）に投与することができる。経路は、例えば、静脈内注射または注入（ＩＶ）、皮下注射（ＳＣ）、皮内注射（ＩＤ）、腹腔内（ＩＰ）注射、筋肉内注射（ＩＭ）、腫瘍内注射（ＩＴ）または髄腔内注射であってもよい。注射は、ボーラスまたは連続注入で行われてもよい。
投与は、例えば、局所注入、注射によって、またはインプラントによって達成することができる。インプラントは、多孔性、非多孔性、またはゼラチン状の材料で作られていてもよく、これには、弾性膜などの膜、または繊維が含まれる。インプラントは、対象への組成物の持続的または周期的な放出のために構成されてもよい。例えば、米国特許出願公開第２００８０２４１２２３号、米国特許第５，５０１，８５６号、同第４，８６３，４５７号および同第３，７１０，７９５号、ＥＰ４８８４０１およびＥＰ４３０５３９を参照、それぞれの開示内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。本組成物は、例えば、拡散、侵食または対流システム、例えば、浸透圧ポンプ、生分解性インプラント、電気拡散システム、電気浸透システム、蒸気圧ポンプ、電解ポンプ、発泡性ポンプ、圧電ポンプ、侵食に基づくシステム、または電気機械システムに基づく移植可能なデバイスによって、対象に送達することができる。
いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、局所投与によって対象に治療的に送達される。
本明細書に記載されるＲＬＲアゴニストの適切な用量であって、対象の癌を治療または予防することができる用量は、例えば、治療される対象の年齢、性別および体重、ならびに使用される特定の阻害剤化合物を含め、種々の因子に基づいていてもよい。対象に投与される用量に影響を与える他の要因としては、例えば、癌または感染症の種類または重症度が挙げられる。例えば、転移性黒色腫を有する対象は、膠芽腫を有する対象とは異なる投薬量のＲＬＲアゴニストの投与を必要とする場合がある。他の要因としては、例えば、対象が現在影響を受けているか、または以前影響を受けていた他の医学的障害、対象の全体的な健康状態、対象の遺伝的素質、食事、投与時間、排泄速度、薬物の組み合わせ、および被験体に行われる任意の他のさらなる療法を挙げることができる。任意の特定の対象に対する特定の投薬量および治療レジメンも、治療する医療従事者（例えば、医者または看護師）の判断に基づくことも理解されるべきである。適切な投薬量は、本明細書に記載されている。
医薬組成物は、治療に有効な量の本明細書に記載のＲＬＲアゴニストを含んでいてもよい。このような有効な量は、部分的には、投与されるＲＬＲアゴニストの効果、または１種類より多い薬剤が使用される場合には、ＲＬＲアゴニストと１つ以上のさらなる活性薬剤を組み合わせた効果に基づいて、当業者によって容易に決定され得る。本明細書に記載のＲＬＲアゴニストの治療に有効な量は、個体の疾患の状態、年齢、性別および体重、アゴニスト（および１つ以上のさらなる活性薬剤）が個体において所望な応答を誘発する能力、例えば、腫瘍増殖の減少などの因子に従って変動し得る。例えば、治療に有効な量のＲＬＲアゴニストは、特定の障害、および／または当該技術分野で知られているか、本明細書に記載の特定の障害の症状のうちのいずれか１つを抑制する（重篤度を下げるか、または発症をなくす）か、および／または防ぐことができる。治療に有効な量は、組成物の毒性または有害な影響よりも、治療に有益な効果が上回る量でもある。
本明細書に記載されるＲＬＲアゴニストのいずれかの適切なヒト用量は、例えば、第Ｉ相の用量漸増研究において、さらに評価されてもよい。例えば、ｖａｎ Ｇｕｒｐら（２００８）Ａｍ Ｊ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ ８（８）：１７１１－１７１８；Ｈａｎｏｕｓｋａら（２００７）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ １３（２、ｐａｒｔ １）：５２３－５３１；およびＨｅｔｈｅｒｉｎｇｔｏｎら（２００６）Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ Ａｇｅｎｔｓ ａｎｄ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ ５０（１０）：３４９９－３５００を参照。
いくつかの実施形態において、本組成物が全体として治療に有効であるように、本組成物は、本明細書に記載のＲＬＲアゴニストのいずれかと、１つ以上（例えば、２、３、４、５、６、７、８、９、１０または１１、またはもっと多い）さらなる治療薬剤とを含む。例えば、組成物は、本明細書に記載のＲＬＲアゴニストとアルキル化剤とを含んでいてもよく、このアゴニストとアルキル化剤は、それぞれ、組み合わされたときに対象における癌（例えば、黒色腫）を治療または予防するための治療に有効である濃度である。
このような組成物の毒性および治療有効性は、細胞培養物または実験動物（例えば、本明細書に記載のいずれかの癌の動物モデル）における既知の医薬手順によって決定することができる。これらの手順は、例えば、ＬＤ５０（集合体の５０％に致命的な用量）およびＥＤ５０（集合体の５０％において治療に有効な用量）を決定するために使用されてもよい。毒性と治療有効性との間の用量比は、治療指数であり、比率ＬＤ５０／ＥＤ５０として表すことができる。高い治療指数を示すＲＬＲアゴニストが好ましい。毒性の副作用を示す組成物を使用してもよいが、このような化合物が罹患した組織の部位を標的とする送達系を設計し、正常細胞に対する損傷の可能性を最小限に抑え、それによって副作用を減らすことに注意をはらうべきである。
細胞培養アッセイおよび動物実験から得られたデータは、ヒトで使用するための投薬量の範囲を考える際に使用することができる。本明細書に記載されるＲＬＲアゴニストについて、治療に有効な用量は、細胞培養アッセイから最初に推定することができる。細胞培養物で決定されるＥＣ５０（すなわち、症状の最大の半分の阻害を達成するアゴニストの濃度）を含む循環血漿濃度範囲を達成するために、動物モデルにおいて、ある用量を処方することができる。このような情報を使用して、ヒトにおける有用な用量をより正確に決定することができる。血漿中のレベルは、例えば、高速液体クロマトグラフィーによって測定することができる。いくつかの実施形態において、例えば、局所投与（例えば、眼または関節への投与）が望ましい場合、細胞培養または動物モデリングを使用して、局所部位内で治療に有効な濃度を達成するのに必要な用量を決定することができる。
いくつかの実施形態において、本方法は、癌または感染症のための他の療法と併せて実施することができる。例えば、本組成物は、放射線、手術、標的化または細胞傷害性化学療法、化学放射線療法、ホルモン療法、免疫療法、遺伝子療法、細胞移植療法、精密医療、ゲノム編集療法、または他の薬物療法と同時に、その前または後に、対象に投与することができる。
上述のように、本明細書に記載の組成物（例えば、ＲＬＲアゴニスト組成物）を使用して、種々の癌を治療することができ、種々の癌は、例えば、限定されないが、カポジ肉腫、白血病、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、骨髄芽球前骨髄球骨髄単球性赤血球性白血病、慢性白血病、慢性骨髄性（顆粒球）白血病、慢性リンパ性白血病、マントル細胞リンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、バーキットリンパ腫、辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、真性多血症、ホジキン病、非ホジキン病、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、重鎖病、固形腫瘍、肉腫および癌腫、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、骨肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、滑膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸肉腫、大腸癌腫、膵臓癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮癌腫、基底細胞癌腫、腺癌、汗腺癌腫、皮脂腺癌腫、乳頭癌腫、乳頭腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌腫、気管支癌腫、腎細胞癌腫、肝細胞癌、胆管癌腫、絨毛癌、セミノーマ、胚性癌腫、ウィルムス腫瘍、子宮頸癌、子宮癌、精巣腫瘍、肺癌腫、小細胞肺癌腫、非小細胞肺癌腫、膀胱癌腫、上皮性癌腫、神経膠腫、星状細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽腫、聴神経腫、乏突起神経膠腫、メナンギオーマ、黒色腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、上咽頭癌腫、食道癌腫、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳および中枢神経系（ＣＮＳ）の癌、子宮頸癌、絨毛癌、大腸癌、結合組織癌、消化器系の癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部癌、胃癌、上皮内新生物、腎臓癌、喉頭癌、肝臓癌、肺癌（小細胞、大細胞）、黒色腫、神経芽細胞腫、口腔癌（例えば、唇、舌、口および咽頭）、卵巣癌、膵臓癌、直腸癌、呼吸器系の癌、肉腫、皮膚癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌および泌尿器系の癌が挙げられる。
いくつかの態様において、本開示は、細胞における１つ以上のサイトカインのＲＬＲによって媒介される産生を増加させる方法であって、本方法が、細胞と、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストとを接触させることを含み、アゴニストが、細胞におけるＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させる、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる方法であって、本方法が、細胞と、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストとを接触させることを含み、アゴニストが、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させる、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、細胞におけるＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる方法であって、本方法が、細胞と、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストとを接触させることを含み、アゴニストが、ＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させる、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において免疫応答を刺激する方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは本開示によって提供される医薬組成物を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において癌を治療するかもしくは進行を遅らせる方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは本開示によって提供される医薬組成物を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、腫瘍成長を減らすか、または阻害することを必要とする対象においてそれを行う方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは本開示によって提供される医薬組成物を投与することを含む、方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍成長を阻害することを必要とする対象においてそれを行う方法であって、本方法が、対象に、有効量の本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたは本開示によって提供される医薬組成物を投与することを含み、アゴニストまたは医薬組成物が、細胞における１つ以上のサイトカインのＲＬＲによって媒介される産生を増加させ、細胞における１つ以上のインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させ、かつ／または細胞におけるＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させ、それによって、免疫応答を刺激し、癌を治療するかもしくは進行を遅らせ、または腫瘍の成長を阻害する、方法を提供する。
ＲＬＲアゴニストとさらなる治療薬剤との組み合わせ
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のＲＬＲアゴニストは、単剤療法として対象に投与することができる。これに代えて、ＲＬＲアゴニストは、別の治療、例えば、癌のための別の治療との併用療法として対象に投与することができる。例えば、併用療法は、対象（例えば、ヒト患者）に、癌を有するか、または癌を発症するリスクがある対象に治療的利益を提供する１つ以上のさらなる薬剤を投与することを含んでいてもよい。
本開示によって提供される方法のいくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤と組み合わせて投与され、１つ以上のさらなる治療薬剤は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬、細胞死誘発剤、オプソニン化剤（例えば、オプソニン化抗体）、細胞毒性薬剤、免疫系療法、サイトカイン、共刺激分子のアクチベータまたはアゴニスト、阻害分子の阻害剤、ワクチン、細胞免疫療法、またはこれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストまたは医薬組成物は、１つ以上のさらなる治療薬剤の投与の前もしくは後に投与されるか、または１つ以上のさらなる治療薬剤が、アゴニストもしくは医薬組成物の投与と同時、投与より前もしくは後に投与される。
いくつかの実施形態において、１つ以上のさらなる治療薬剤は、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト、ＴＩＭ－３アンタゴニスト、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、ＢＴＬＡアンタゴニスト、ＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、ＫＩＲアンタゴニスト、ＬＡＧ－３アンタゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体３（ＴＬＲ３）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体７（ＴＬＲ７）アゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストである。
化学療法薬との組み合わせ
本発明の組成物との組み合わせおよび／または同時投与に適した化学療法剤としては、例えば、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントランシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１－デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロールおよびピューロマイシン、ならびにそれらのアナログまたはホモログが挙げられる。さらなる薬剤としては、例えば、代謝拮抗剤（例えば、メトトレキサート、６－メルカプトプリン、６－チオグアニン、シタラビン、５－フルオロウラシルデカルバジン）、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオＴＥＰＡ、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）、ロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、ｃｉｓ－ジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）、プロカルバジン、アルトレタミン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、サトラプラチンまたはトリプラチン四硝酸塩）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（以前はダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノミシン（以前はアクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシンおよびアントラマイシン（ＡＭＣ））、および抗有糸分裂剤（例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン）およびテモゾロミドが挙げられる。
ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストとの組み合わせ
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ヒトＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１に対して特異的に結合し、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１の生体活性および／または下流の経路および／またはヒトＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１シグナル伝達によって媒介され細胞プロセスまたは他のヒトＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１が媒介する機能を阻害する１つ以上のＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。
したがって、下流の経路および／またはＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１シグナル伝達によって媒介され細胞プロセス、例えば、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１に対する受容体の結合および／またはこれに対する細胞応答の誘発を含め、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１生体活性を直接的またはアロステリックに遮断し、アンタゴナイズし、抑制し、阻害し、または減らすＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストが本明細書で提供される。細胞または対象によって作られるヒトＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１の数値または量を減らすＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストも本明細書で提供される。
いくつかの実施形態において、本開示は、ヒトＰＤ－１に結合し、ＰＤ－１へのＰＤ－Ｌ１の結合を防止し、阻害するか、または低減するＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストを提供する。いくつかの態様において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１をコードするｍＲＮＡに結合し、翻訳を防ぐ。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１をコードするｍＲＮＡに結合し、分解および／またはターンオーバーを引き起こす。
いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－１シグナル伝達または機能を阻害する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、またはＰＤ－Ｌ１およびＰＤ－Ｌ２両方に対するＰＤ－１の結合を遮断する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１に対するＰＤ－１の結合を遮断する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ２に対するＰＤ－１の結合を遮断する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１およびＰＤ－Ｌ２に対するＰＤ－１の結合を遮断する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－１に特異的に結合する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１に特異的に結合する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ２に特異的に結合する。
いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、同族リガンドに対するＰＤ－１の結合を阻害する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１に対するＰＤ－１の結合、ＰＤ－Ｌ２に対するＰＤ－１の結合、またはＰＤ－Ｌ１およびＰＤ－Ｌ２両方に対するＰＤ－１の結合を阻害する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、同族リガンドに対するＰＤ－１の結合を阻害しない。
いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１に対して特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体（ｍＡｂ）またはその抗原結合フラグメントである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－１に対して特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－Ｌ１に対して特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－Ｌ１に結合し、ＰＤ－１に対するＰＤ－Ｌ１の結合を阻害する抗体またはその抗原結合フラグメントである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－１に結合し、ＰＤ－１に対するＰＤ－Ｌ１の結合を阻害する抗体またはその抗原結合フラグメントである。
ＰＤ－１と、そのリガンドＰＤ－Ｌ１およびＰＤ－Ｌ２の片方または両方のいずれかとの間の相互作用を阻害または破壊するいくつかの免疫チェックポイントアンタゴニストは、臨床開発中であるか、または癌を治療するために臨床医が現在利用可能である。
本開示によって提供される組成物、方法および使用のいずれかにおいてＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストを含んでいてもよい抗ヒトＰＤ－１モノクローナル抗体、またはその抗原結合フラグメントの例としては、限定されないが、ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）（ペンブロリズマブ、ＭＫ－３４７５、ｈ４０９Ａ１１；ＵＳ８９５２１３６、ＵＳ８３５４５０９、ＵＳ８９００５８７およびＥＰ２１７０９５９を参照、その全てが、その全体が参照により本明細書に含まれる；Ｍｅｒｃｋ）、ＯＰＤＩＶＯ（登録商標）（ニボルマブ、ＢＭＳ－９３６５５８、ＭＤＸ－１１０６、ＯＮＯ－４５３８；ＵＳ７５９５０４８、ＵＳ８７２８４７４、ＵＳ９０７３９９４、ＵＳ９０６７９９９、ＥＰ１５３７８７８、ＵＳ８００８４４９、ＵＳ８７７９１０５およびＥＰ２１６１３３６を参照、その全てが、その全体が参照により本明細書に含まれる；Ｂｒｉｓｔｏｌ Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）、ＭＥＤＩ０６８０（ＡＭＰ－５１４）、ＢＧＢ－Ａ３１７およびＢＧＢ－１０８（ＢｅｉＧｅｎｅ）、２４４Ｃ８および３８８Ｄ４（ＷＯ２０１６／１０６１５９を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる；Ｅｎｕｍｅｒａｌ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ）、ＰＤＲ００１（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）およびＲＥＧＮ２８１０（Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ）が挙げられる。したがって、いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ペンブロリズマブである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ニボルマブである。
本開示によって提供される組成物、方法および使用のいずれかにおいてＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストを含んでいてもよい抗ヒトＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体、またはその抗原結合フラグメントの例としては、限定されないが、ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標）（アベルマブ、ＭＳＢ００１０７１８Ｃ、ＷＯ２０１３／７９１７４を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる；Ｍｅｒｃｋ／Ｐｆｉｚｅｒ）、ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）（デュルバルマブ、ＭＥＤＩ４７３６）、ＴＥＣＥＮＴＲＩＱ（登録商標）（アテゾリズマブ、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＲＧ７４４６；ＷＯ２０１０／０７７６３４を参照、その全体が参照により本明細書に組み込まれる；Ｒｏｃｈｅ）、ＭＤＸ－１１０５（ＢＭＳ－９３６５５９、１２Ａ４；ＵＳ７９４３７４３およびＷＯ２０１３／１７３２２３を参照、その両方が、その全体が参照により本明細書に組み込まれる；Ｍｅｄａｒｅｘ／ＢＭＳ）、およびＦＡＺ０５３（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）が挙げられる。したがって、いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、アベルマブである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、デュルバルマブである。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、アテゾリズマブである。
いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－１またはヒトＰＤ－Ｌ１に対して特異的に結合するイムノアドヘシンであり、例えば、免疫グロブリン分子のＦｃ領域などの定常領域に融合するＰＤ－Ｌ１またはＰＤ－Ｌ２の細胞外またはＰＤ－１結合部分を含む融合タンパク質である。ＰＤ－１に対して特異的に結合するイムノアドヘシン分子の例は、ＷＯ２０１０／０２７８２７およびＷＯ２０１１／０６６３４２に記載されており、その両方が、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＡＭＰ－２２４（Ｂ７－ＤＣＩｇとしても知られる）であり、ヒトＰＤ－１に対して特異的に結合するＰＤ－Ｌ２－ＦＣ融合タンパク質である。
ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１に対して結合し、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１シグナル伝達経路を破壊する任意のＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、本明細書に開示される組成物、方法および使用に適していることが、当業者によって理解されるだろう。
いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、低分子、核酸、ペプチド、ペプチド模倣物、タンパク質、炭水化物、炭水化物誘導体、または糖ポリマーである。例示的な低分子ＰＤ－１阻害剤は、Ｚｈａｎら、（２０１６）Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ Ｔｏｄａｙ ２１（６）：１０２７－１０３６に記載されている。
本開示によって提供される方法のいくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストと組み合わされ、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＰＤＲ００１、ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）（ペンブロリズマブ）、ＯＰＤＩＶＯ（登録商標）（ニボルマブ）、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１およびＡＭＰ－２２４からなる群から選択される。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、ＦＡＺ０５３、ＴＥＮＣＥＮＴＲＩＱ（登録商標）（アテゾリズマブ）、ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標）（アベルマブ）、ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）（デュルバルマブ）およびＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される。
ＴＩＭ－３アンタゴニストとの組み合わせ
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ＴＩＭ－３アンタゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。ＴＩＭ－３アンタゴニストは、抗体、その抗原結合フラグメント、イムノアドヘシン、融合タンパク質またはオリゴペプチドであってもよい。いくつかの実施形態において、ＴＩＭ－３アンタゴニストは、ＭＧＢ４５３（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＴＳＲ－０２２（Ｔｅｓａｒｏ）またはＬＹ３３２１３６７（Ｅｌｉ Ｌｉｌｌｙ）から選択される。
ＬＡＧ－３アンタゴニストとの組み合わせ
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ＬＡＧ－３アンタゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。ＬＡＧ－３アンタゴニストは、抗体、その抗原結合フラグメント、イムノアドヘシン、融合タンパク質またはオリゴペプチドであってもよい。いくつかの実施形態において、ＬＡＧ－３阻害剤は、ＬＡＧ５２５（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＢＭＳ－９８６０１６（Ｂｒｉｓｔｏｌ－Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）、ＴＳＲ－０３３（Ｔｅｓａｒｏ）、ＭＫ－４２８０（Ｍｅｒｃｋ＆Ｃｏ）またはＲＥＧＮ３７６７ （Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ）から選択される。
Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニストとの組み合わせ
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ＴＬＲアンタゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。
Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）は、病原体の認識および自然免疫系の活性化を容易にする、生殖系列にコードされた膜貫通タンパク質のファミリーである。（Ｈｏｆｆｍａｎｎら、（１９９９）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２８４：１３１３－１３１８；Ｒｏｃｋら、（１９９８）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ９５：５８８－５９３）。ＴＬＲは、パターン認識受容体（ＰＲＲ）であり、自然免疫系の細胞によって発現される。ＴＬＲの既知のリガンドの例としては、グラム陽性菌（ＴＬＲ－２）、細菌内毒素（ＴＬＲ－４）、フラジェリンタンパク質（ＴＬＲ－５）、細菌ＤＮＡ（ＴＬＲ－９）、二本鎖ＲＮＡおよびポリＩ：Ｃ（ＴＬＲ－３）および酵母（ＴＬＲ－２）が挙げられる。ＴＬＲのインビボでの活性化は、特定のサイトカイン、ケモカインおよび成長因子を伴う自然免疫応答を開始する。全てのＴＬＲは、特定の細胞内シグナル伝達分子、例えば、核因子カッパベータ（ＮＦ－κＢ）および分裂促進因子活性化タンパク質キナーゼ（ＭＡＰキナーゼ）を活性化することができるが、放出される特定のサイトカインおよびケモカインのセットは、各ＴＬＲについて固有のようである。ＴＬＲ７、８および９は、樹状細胞および単球などの免疫細胞のエンドソームまたはリソソームコンパートメントに位置するＴＬＲのサブファミリーを含む。形質細胞様樹状細胞（ｐＤＣ）で高度に発現するＴＬＲ７および９とは対照的に、ＴＬＲ８は、主に骨髄ＤＣ（ｍＤＣ）および単球で発現される。このサブファミリーは、一本鎖ＲＮＡなどの微生物核酸の認識を媒介する。
プリンヌクレオチドのアデノシンおよびグアノシンに似ている、小さな低分子量（４００ダルトン未満）の合成イミダゾキノリン化合物は、特定された最初のＴＬＲ７およびＴＬＲ８アゴニストであった。これらの化合物の多くは、抗ウイルス特性および抗癌特性を示す。例えば、ＴＬＲ７アゴニストであるイミキモド（ＡＬＤＡＲＡ（商標）は、特定の株のヒトパピローマウイルスによって引き起こされる皮膚病変の治療のための局所薬剤として米国食品医薬品局によって承認された。イミキモドは、原発性皮膚癌および皮膚腫瘍、例えば、基底細胞癌、角化棘細胞腫、光線性角化症およびボーエン病の治療にも有用な場合がある。ＴＬＲ７／８アゴニストであるレシキモド（Ｒ－８４８）は、ヒト性器ヘルペスの治療のための局所薬剤として評価されている。
本開示のＴＬＲアゴニストは、任意のＴＬＲアゴニストであってもよい。例えば、ＴＬＲアゴニストは、天然または合成のＴＬＲリガンド、ＴＬＲリガンドのムテインまたは誘導体、ＴＬＲリガンドのペプチド模倣物、ＴＬＲリガンドの生体機能を模倣する低分子、またはＴＬＲ受容体を刺激する抗体を包含していてもよい。ＴＬＲリガンドは、ＴＬＲに結合する任意の分子である。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ＴＬＲアゴニストと組み合わされ、ＴＬＲアゴニストは、ＴＬＲ１アゴニスト、ＴＬＲ２アゴニスト、ＴＬＲ３アゴニスト、ＴＬＲ４アゴニスト、ＴＬＲ５アゴニスト、ＴＬＲ６アゴニスト、ＴＬＲ７アゴニスト、ＴＬＲ８アゴニスト、ＴＬＲ９アゴニスト、ＴＬＲ１０アゴニストおよびＴＬＲ１１アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、ＴＬＲ３アゴニストと組み合わせられる。ＴＬＲ３アゴニストは、ＴＬＲ３を介してシグナル伝達応答を引き起こすアゴニストである。例示的なＴＬＲ３アゴニストとしては、限定されないが、ポリイノシン酸：ポリシチジル酸（ポリＩ：Ｃ）、ＨＩＬＴＯＮＯＬ（登録商標）（ポリＩＣＬＣ）、ポリアデニル酸－ポリウリジル酸（ポリＡ：Ｕ）、ＲＩＢＯＸＸＩＭ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）１００）、ＲＩＢＯＸＸＯＮ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０バイオコンジュゲート）およびＲＩＢＯＸＸＯＬ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０）が挙げられる。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、ポリイノシン酸：ポリシチジル酸（ポリＩ：Ｃ）と組み合わせられる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ＨＩＬＴＯＮＯＬ（登録商標）（ポリＩＣＬＣ）と組み合わされる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ポリアデニル酸－ポリウリジル酸（ポリＡ：Ｕ）と組み合わされる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＩＭ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）１００）と組み合わされる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＯＮ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０バイオコンジュゲート）と組み合わされる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、ＲＩＢＯＸＸＯＬ（登録商標）（ＲＧＩＣ（登録商標）５０）と組み合わされる。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、ＴＬＲ７アゴニストと組み合わせられる。ＴＬＲ７アゴニストは、ＴＬＲ７を介してシグナル伝達応答を引き起こすアゴニストである。ＴＬＲ７アゴニストの非限定的な例としては、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）、ロキソリビン（Ｎ７位およびＣ８位で誘導体化されたグアノシンアナログ）、イミダゾキノリン化合物（例えば、イミキモドおよびレシキモド）、またはそれらの誘導体が含まれる。さらなる例示的なＴＬＲ７アゴニストとしては、限定されないが、ＧＳ－９６２０（ベサトリモド）、イミキモド（ＡＬＤＡＲＡ（商標））およびレシキモド（Ｒ－８４８）が挙げられる。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、ＧＳ－９６２０（ベサトリモド）と組み合わせられる。いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、イミキモド（ＡＬＤＡＲＡ（商標））と組み合わされる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストは、レシキモド（Ｒ－８４８）と組み合わされる。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、ＴＬＲ９アゴニストと組み合わせられる。ＴＬＲ９アゴニストは、ＴＬＲ９を介してシグナル伝達応答を引き起こすアゴニストである。例示的なＴＬＲ９アゴニストとしては、限定されないが、ＣｐＧオリゴデオキシヌクレオチド（ＧｐＧ ＯＤＮ）が挙げられる。いくつかの実施形態において、ＣｐＧ ＯＤＮは、クラスＡ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ａ ＯＤＮ）、クラスＢ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｂ ＯＤＮ）、またはクラスＣ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｃ ＯＤＮ）である。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストは、ＣｐＧオリゴデオキシヌクレオチド（ＣｐＧ ＯＤＮ）と組み合わせられる。いくつかの実施形態において、ＣｐＧ ＯＤＮは、クラスＡ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ａ ＯＤＮ）である。いくつかの実施形態において、ＣｐＧ ＯＤＮは、クラスＢ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｂ ＯＤＮ）である。いくつかの実施形態において、ＣｐＧ ＯＤＮは、クラスＣ ＣｐＧ ＯＤＮ（ＣｐＧ－Ｃ ＯＤＮ）である。
その他の組み合わせ
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、ＢＴＬＡアンタゴニスト、ＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、またはＫＩＲアンタゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。
いくつかの実施形態において、本開示によって提供されるＲＬＲアゴニストまたはその医薬組成物は、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）に対して特異的に結合するポリペプチド（例えば、抗体、またはその抗原結合部分）を含むアゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。
本明細書に記載されるＲＬＲアゴニストは、以前に、または現在行われている療法を置き換えることができ、または強化することができる。例えば、ＲＬＲアゴニストで治療すると、１つ以上のさらなる活性薬剤の投与は、停止するか、または減らすことができ、例えば、より低いレベルまたは投薬量で投与することができる。いくつかの実施形態において、以前の治療の投与を維持することができる。いくつかの実施形態において、ＲＬＲアゴニストのレベルが治療効果を提供するのに十分なレベルに達するまで、以前の治療が維持される。２つの療法を組み合わせて投与してもよい。
癌の改善について対象（例えば、ヒト患者）をモニタリングすることは、本明細書で定義されるように、疾患パラメータの変化、例えば、腫瘍増殖の減少について対象を評価することを意味する。いくつかの実施形態において、評価は、投与の後、少なくとも１時間、例えば、少なくとも２、４、６、８、１２、２４または４８時間、または少なくとも１日間、２日間、４日間、１０日間、１３日間、２０日間、またはもっと長く、または少なくとも１週間、２週間、４週間、１０週間、１３週間、２０週間、またはもっと長く行われる。対象は、以下の１つ以上の期間で評価することができる。治療が始まる前、治療中、または治療のうちの１つ以上の要素が投与された後。評価は、さらなる治療の必要性を評価すること、例えば、投与の投薬量、頻度、または治療の持続期間を変えるべきかどうかを評価することを含んでいてもよい。選択された治療法を追加するか、または削除する必要性を評価すること、例えば、本明細書に記載の癌の治療のいずれかを追加するか、または削除することも含んでいてもよい。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のＲＬＲアゴニストは、例えば、Ｔ細胞の活性化および／または増殖を増加させることにより、患者のＴ細胞応答を調節するために投与される。Ｔ細胞の増殖、ＩＦＮ産生および分泌、および／またはＴ細胞の細胞溶解活性の向上は、ある疾患または状態を治療するためにＴ細胞の増殖、ＩＦＮ産生および分泌、および／またはＴ細胞の細胞溶解活性の向上を必要とする患者にとって、有益である可能性がある。したがって、いくつかの実施形態において、本開示のＲＬＲアゴニストは、Ｔ細胞活性化を誘導するか、または増加させ、Ｔ細胞増殖を向上し、ＩＦＮの産生および／または分泌を誘導し、および／または細胞溶解性Ｔ細胞応答を誘導するために、これらを必要とする患者に投与される。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のＲＬＲアゴニストは、生体サンプル中のヒトＲＬＲの検出および／または定量化の方法で使用することができる。したがって、ＲＬＲアゴニストは、本明細書に記載される通り、患者における疾患（例えば、癌）の診断、予後および／または進行を決定するために使用される。
本開示は、その特定の実施形態を参照して説明されたが、本開示の真の趣旨および範囲から逸脱することなく、様々な変更が行われてもよく、均等物が代用されてもよいことが当業者によって理解されるべきである。これに加えて、特定の状況、材料、物質の組成、プロセス、プロセスの１つ以上の工程を、本開示の目的、趣旨および範囲に適合させるために、多くの改変を行うことができる。このような改変は全て、本開示の範囲内にあることが意図されている。
本開示は、以下の実施例を参照することにより、より完全に理解されるであろう。しかし、以下の実施例は、開示の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。本明細書に記載されている例および実施形態は、単に例示のためのものであり、その観点での種々の改変または変更が当業者に示唆され、本出願の趣旨および範囲と、添付の特許請求の範囲とに含まれることが理解される。
実施例１：ＲＬＲアゴニストを用いてＨｕＰＢＭＣをトランスフェクションすると、インビトロでサイトカイン産生を誘導する。
種々の改変を含むＲＬＲアゴニストがサイトカイン誘導に及ぼす効果を決定するために、ＲＬＲアゴニストがサイトカイン産生を誘導する能力をインビトロで評価した。ヒト末梢血単核細胞（ｈｕＰＢＭＣ）は、２人の健康なドナーから調製され、ウシ胎児血清（ＦＣＳ）、Ｌ－グルタミンおよびペニシリン／ストレプトアビジンを補充した１００μＬのＲＰＭＩ１６４０細胞培地中、標準９６ウェル組織培養プレートに、２×１０５細胞／ウェルの密度で播種された。図１に示すように、ＲＬＲアゴニストを用いたｈｕＰＢＭＣの独立したトランスフェクションは、トランスフェクション試薬としてＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ２０００を用いて行われた（直接的なインキュベーションが適用され、データが示されていないＧ１０およびＯＤＮ２２１６を除く）。加湿したインキュベータ内で、細胞を３７℃で２４時間インキュベートした後、細胞培養上清を回収した。上清をすぐに凍結し、－２０℃で保存した。Ｕ－Ｐｌｅｘ ＭＳＤプラットフォームを用い、製造業者の指示に従って、サイトカインＩＦＮ－α２ａ（図１）、およびＩＬ－１β、ＩＰ－１０、ＩＬ－６、ＩＬ－１２ｐ７０、ＭＣＰ－１およびＭＩＰ－１β（データは示していない）の分析のためにサンプルを一度解凍した。図１は、種々の改変および／または配列モチーフを含む新規な候補ＲＬＲアゴニストで処理されたヒトＰＢＭＣからのＩＦＮ－ａ分泌の用量に依存する誘導を示す。ＲＬＲアゴニストは、１０ｎＭ、２ｎＭまたは０．４ｎＭのいずれかで加えた。ＲＬＲアゴニストのトランスフェクションに応答して細胞によって放出されるＩＦＮ－α２ａの量は、ｐｇ／ｍＬで表示される。
表３および表４は、各ＲＬＲアゴニストの配列を示す。表３は、図１で試験された各化合物に対応する配列と番号も示す。例えば、図１の化合物Ｘ２５２２４は、「ＲＩＧ７」に対応し、配列番号７３を含む第２のオリゴヌクレオチドにリンカー「ＵＵＣＧ」を介して接続する配列番号４２を含む第１のオリゴヌクレオチドを含み、５’ジホスフェート部分を有する。ＲＩＧ７の配列は、表４に配列６としても示されている。

Claims (16)

  1. ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、
    前記アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、
    前記第１のポリヌクレオチドは、二本鎖を形成するほど前記第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、
    前記二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
    前記その誘導体もしくはアナログが、ホスホネート、チオホスホネート、ホスホロチオエート、サルフェート、スルホネート、スルファメート、チアゾリジノン、カルボキシレート、マロネート、ボロン酸、ベンゾオキサボロール、ボラノホスフェート、およびスクアラミドから選択されるホスフェート生物学的等価体であり、
    前記アゴニストは、［ＡＵＣＧ］ ｎ リピートモチーフを含み、式中、ｎ＝３であり、かつ５’最末端ＡＵＣＧリピートの前にＣＧが存在する、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
  2. ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、
    前記アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、
    前記第１のポリヌクレオチドは、二本鎖を形成するほど前記第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、
    前記二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
    前記その誘導体もしくはアナログが、ホスホネート、チオホスホネート、ホスホロチオエート、サルフェート、スルホネート、スルファメート、チアゾリジノン、カルボキシレート、マロネート、ボロン酸、ベンゾオキサボロール、ボラノホスフェート、およびスクアラミドから選択されるホスフェート生物学的等価体であり、
    前記アゴニストは、［ＡＵＣＧ］ ｎ リピートモチーフを含み、式中、ｎ＝３であり、かつ５’最末端ＡＵＣＧリピートの前にＩＧが存在する、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
  3. ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）に対して特異的に結合する合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニストであって、
    前記アゴニストが、リンカーによって第２のポリヌクレオチドに接続する第１のポリヌクレオチドを含む平滑末端化されたヘアピンＲＮＡを含み、
    前記第１のポリヌクレオチドは、二本鎖を形成するほど前記第２のポリヌクレオチドに対して十分に相補性であり、
    前記二本鎖は、１９個未満の塩基対を含み、第１のオリゴヌクレオチドの５’最末端ヌクレオチドは、５’ジホスフェートもしくはトリホスフェート部分、またはその誘導体もしくはアナログを含み、
    前記その誘導体もしくはアナログが、ホスホネート、チオホスホネート、ホスホロチオエート、サルフェート、スルホネート、スルファメート、チアゾリジノン、カルボキシレート、マロネート、ボロン酸、ベンゾオキサボロール、ボラノホスフェート、およびスクアラミドから選択されるホスフェート生物学的等価体であり、
    前記アゴニストは、［ＡＵＣＧ］ ｎ リピートモチーフを含み、式中、ｎ＝３であり、５’最末端ＡＵＣＧリピートの前にＧＧが存在し、かつ前記ＡＵＣＧモチーフ中の各Ｇがイノシンによって置換される、合成ＲＩＧ－Ｉ様受容体（ＲＬＲ）アゴニスト。
  4. 前記リンカーが、ヌクレオチドリンカーまたは非ヌクレオチドリンカーである、請求項１～３のいずれか一項に記載のアゴニスト。
  5. 前記ヌクレオチドリンカーが、配列ＵＵＣＧを含むテトラループを含む、請求項４に記載のアゴニスト。
  6. 前記非ヌクレオチドリンカーが、ヘキサエチレングリコールリンカーまたはＣ９アルキルリンカーから選択される、請求項４に記載のアゴニスト。
  7. 前記第１のポリヌクレオチドが配列番号５０を含み、かつ前記第２のポリヌクレオチドが配列番号８１を含む、請求項１に記載のアゴニスト。
  8. 前記第１のポリヌクレオチドが配列番号６１を含み、かつ前記第２のポリヌクレオチドが配列番号９１を含む、請求項２に記載のアゴニスト。
  9. 前記第１のポリヌクレオチドが配列番号５９を含み、かつ前記第２のポリヌクレオチドが配列番号８９を含む、請求項３に記載のアゴニスト。
  10. 前記リンカーが、ヌクレオチドリンカーまたは非ヌクレオチドリンカーである、請求項７～９のいずれか一項に記載のアゴニスト。
  11. 前記ヌクレオチドリンカーが、配列ＵＵＣＧを含むテトラループを含む、請求項１０に記載のアゴニスト。
  12. 前記非ヌクレオチドリンカーが、ヘキサエチレングリコールリンカーまたはＣ９アルキルリンカーから選択される、請求項１０に記載のアゴニスト。
  13. その必要のある対象において、免疫応答を刺激するか、癌を治療するかもしくは進行を遅らせるか、または腫瘍成長を減らすかもしくは阻害するための医薬組成物であって、請求項１～１２のいずれか一項に記載のアゴニストと、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
  14. 細胞における１つまたはそれより多くのサイトカインのＲＬＲによって媒介される産生を増加させることにおいて使用するための、細胞における１つまたはそれより多くのインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させることにおいて使用するための、または細胞におけるＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させることにおいて使用するための、請求項１～１２のいずれか一項に記載のアゴニストを含む組成物であって、
    前記細胞が前記アゴニストと接触され、それによって、前記細胞において、ＲＬＲによって媒介されるサイトカイン産生を増加させるか、１つまたはそれより多くのインターフェロン誘導遺伝子のＲＬＲによって媒介される発現を増加させるか、またはＲＬＲ依存性細胞内シグナル伝達を増加させるものである、組成物。
  15. それを必要とする対象において免疫応答を刺激する治療方法において使用するための、それを必要とする対象において癌を治療するかもしくは進行を遅らせる治療方法において使用するための、またはそれを必要とする対象において腫瘍成長を減らすかもしくは阻害する治療方法において使用するための、請求項１～１２のいずれか一項に記載のアゴニストを含む組成物、または請求項１３に記載の医薬組成物。
  16. 前記組成物または医薬組成物が、１つまたはそれより多くのさらなる治療薬剤と組み合わせて投与されるものであり、前記１つまたはそれより多くのさらなる治療薬剤は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬、細胞死誘発剤、オプソニン化剤（例えば、オプソニン化抗体）、細胞毒性薬剤、免疫系療法、サイトカイン、共刺激分子のアクチベータまたはアゴニスト、阻害分子の阻害剤、ワクチン、細胞免疫療法、またはこれらの組み合わせからなる群から選択され、
    前記組成物または医薬組成物が、前記１つまたはそれより多くのさらなる治療薬剤の投与の前もしくは後に投与されるか、または前記１つまたはそれより多くのさらなる治療薬剤が、前記組成物もしくは医薬組成物の投与と同時、投与より前もしくは後に投与されるものである、請求項１５に記載の使用のための組成物または医薬組成物。
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