ES2273861T3 - IMMUNIZATION OF MILK VACCINE LIVESTOCK WITH GAPC PROTEIN AGAINST STREPTOCOCCUS INFECTIONS. - Google Patents
IMMUNIZATION OF MILK VACCINE LIVESTOCK WITH GAPC PROTEIN AGAINST STREPTOCOCCUS INFECTIONS. Download PDFInfo
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Abstract
La utilización de una proteína GapC en la fabrica- ción de la composición de una vacuna de utilidad en el tra- tamiento o la prevención de la mastitis en un sujeto mamí- fero, en la que la proteína GapC se selecciona del grupo formado por: (a) una proteína GapC aislada de Sreptococcus dysga- lactiae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclu- sive, de las Figuras 1A-1B (ID. de SEC. núm.: 4) o una se- cuencia aminoacídica con una identidad de secuencia de al menos el 80 % con la anterior; (b) una proteína GapC aislada de Sreptococcus agalac- tiae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 2A-2B (ID. de SEC. núm.: 6) o una secuencia aminoacídica con una identidad de secuencia de al menos el 80 % con la anterior; (c) una proteína GapC aislada de Sreptococcus uberis que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 3A-3B (ID. de SEC. núm.: 8) o una secuencia aminoacídica con una identidad de secuencia de al menos el 80 % con la anterior; (d) una proteína GapC aislada de Sreptococcus paraube- ris que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 4A-4B (ID. de SEC. núm.: 10) o una secuencia aminoacídica con una identidad de secuencia de al menos el 80 % con la anterior; (e) una proteína GapC aislada de Sreptococcus iniae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 5A-5B (ID. de SEC. núm.: 12) o una secuencia aminoacídica con una identidad de secuencia de al menos el 80 % con la anterior.The use of a GapC protein in the manufacture of the composition of a vaccine useful in the treatment or prevention of mastitis in a mammalian subject, in which the GapC protein is selected from the group consisting of: (a) a GapC protein isolated from Sreptococcus dysgalactiae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, both inclusive, of Figures 1A-1B (SEQ ID NO: No. 4) or an amino acid sequence with a sequence identity of at least 80% with the previous one; (b) a GapC protein isolated from Sreptococcus agalactiae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 2A-2B (SEQ ID NO: 6) or an amino acid sequence with a sequence identity of at least 80% with the previous one; (c) a GapC protein isolated from Sreptococcus uberis consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 3A-3B (SEQ ID NO: 8) or a amino acid sequence with a sequence identity of at least 80% with the previous one; (d) a GapC protein isolated from Sreptococcus parauberant consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 4A-4B (SEQ ID NO: 10) or an amino acid sequence with a sequence identity of at least 80% with the previous one; (e) a GapC protein isolated from Sreptococcus iniae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 5A-5B (SEQ ID NO: 12) or a amino acid sequence with a sequence identity of at least 80% with the previous one.
Description
Inmunización de ganado vacuno lechero con proteína GapC frente a infecciones por Streptococcus.Immunization of dairy cattle with GapC protein against Streptococcus infections.
La presente invención se refiere, en términos generales, a antígenos bacterianos y a los genes que codifican los mismos. Más concretamente, la presente invención se refiere a la clonación, expresión y caracterización de las proteínas GapC de unión a plasmina procedentes de Streptococcus dysgalactiae, Streptococcus agalactiae, Streptococcus uberis, Streptococcus parauberis y Streptococcus inicie, y a la utilización de las mismas en la composición de vacunas.The present invention relates, in general terms, to bacterial antigens and to the genes encoding them. More specifically, the present invention relates to the cloning, expression and characterization of the plasmin-binding GapC proteins from Streptococcus dysgalactiae, Streptococcus agalactiae, Streptococcus uberis, Streptococcus parauberis and Streptococcus initie , and their use in the composition composition vaccines
La mastitis es una infección de la glándula mamaria provocada generalmente por bacterias y hongos. La respuesta inflamatoria que se produce tras la infección provoca una disminución en el rendimiento y la calidad de la producción de leche y provoca anualmente pérdidas económicas considerables a la industria lechera.Mastitis is an infection of the gland Breast usually caused by bacteria and fungi. The answer inflammatory that occurs after infection causes a decrease in yield and production quality of milk and causes considerable economic losses annually to the dairy industry.
Entre las especies bacterianas que se asocian habitualmente con la mastitis se encuentran 20 especies del género Streptococcus, incluyendo Streptococcus aureus, Streptococcus uberis (sin tipificar), Streptococcus agalactiae (grupo B de Lancefield), Streptococcus dysgalactiae (grupo C de Lancefield), Streptococcus zooepidemicus, y los estreptococos de los grupos de Lancefield D, G, L y N. Algunas de estas especies son enfermedades infecciosas (p. ej. S. agalactiae), mientras que otras se consideran patógenos ambientales (p. ej. S. dysgalactiae y S. uberis).Among the bacterial species most commonly associated with mastitis 20 species of the genus Streptococcus, including Streptococcus aureus, Streptococcus uberis (without typing), Streptococcus agalactiae (Lancefield group B), Streptococcus dysgalactiae (Lancefield group C), Streptococcus zooepidemicus are , and streptococci of the Lancefield D, G, L and N groups. Some of these species are infectious diseases (eg S. agalactiae ), while others are considered environmental pathogens (eg S. dysgalactiae and S. uberis ).
El patógeno ambiental S. uberis es el responsable de alrededor del 20% de todos los casos clínicos de mastitis (Bramley, A.J. y Dodd, F.H. [1984] J. Dairy Res. 51:481-512; Bramley, A.J. [1987] Animal Health Nutrition 42:12-16; Watts, J.L. [1988] J. Dairy Sci. 71:1616-1624); es el microorganismo aislado predominantemente de las glándulas mamarias durante los periodos no lactantes (Bramley, A.J. [1984] Br. Vet. J. 140:328-335; Bramley y Dodd [1984] J. Dairy Res. 51:481-512; Oliver, S.P. [1988] Am. Vet. Res. 49:1789-1793).The environmental pathogen S. uberis is responsible for about 20% of all clinical cases of mastitis (Bramley, AJ and Dodd, FH [1984] J. Dairy Res. 51 : 481-512; Bramley, AJ [1987] Animal Health Nutrition 42 : 12-16; Watts, JL [1988] J. Dairy Sci . 71 : 1616-1624); it is the microorganism predominantly isolated from the mammary glands during non-lactating periods (Bramley, AJ [1984] Br. Vet. J. 140 : 328-335; Bramley and Dodd [1984] J. Dairy Res. 51 : 481-512; Oliver, SP [1988] Am. Vet. Res. 49 : 1789-1793).
Normalmente, la mastitis que se produce como resultado de una infección por S. uberis es subclínica y se caracteriza por la producción de una leche aparentemente normal pero que presenta un incremento en el recuento de células somáticas debido a la afluencia de leucocitos. La composición química de la leche cambia debido a la supresión de la secreción, con una transferencia de cloruro sódico y bicarbonato de la sangre a la leche que provoca un cambio hacia un pH más alcalino. La mastitis por S. uberis también adopta la forma de un trastorno clínico agudo con signos evidentes de enfermedad como presencia de coágulos y cambio de coloración en la leche e inflamación y endurecimiento de la glándula mamaria. Algunos casos de esta enfermedad con manifestación clínica pueden ser graves y puede presentarse pirexia. Para una revisión de las manifestaciones clínicas de la mastitis por S. uberis consúltense: Bramley (1991) Mastitis: physiology or pathology, pp. 3-9, en C. Burvenich, G. Vandeputte-van Messom y A. W. Hill (ed.), New insights into the pathogenesis of mastitis, Rijksuniversiteit Gent, Bélgica; y Schalm et al. (1971) The mastitis complex - A brief summary, pp. 1-3, en Bovine Mastitis, Lea & Febiger, Philadelphia.Normally, the mastitis that occurs as a result of an infection with S. uberis is subclinical and is characterized by the production of a seemingly normal milk but which presents an increase in the somatic cell count due to the influx of leukocytes. The chemical composition of milk changes due to the suppression of secretion, with a transfer of sodium chloride and bicarbonate from the blood to the milk that causes a change towards a more alkaline pH. S. uberis mastitis also takes the form of an acute clinical disorder with obvious signs of disease such as the presence of clots and change of color in the milk and inflammation and hardening of the mammary gland. Some cases of this disease with clinical manifestation can be serious and pyrexia may occur. For a review of the clinical manifestations of mastitis by S. uberis, see: Bramley (1991) Mastitis: physiology or pathology , pp. 3-9, in C. Burvenich, G. Vandeputte-van Messom and AW Hill (ed.), New insights into the pathogenesis of mastitis , Rijksuniversiteit Gent, Belgium; and Schalm et al. (1971) The mastitis complex - A brief summary, pp. 1-3, in Bovine Mastitis , Lea & Febiger, Philadelphia.
Los métodos convencionales de control antibacteriano como la desinfección de pezones postordeño y el tratamiento con antibióticos son eficaces en el control de muchos tipos de mastitis contagiosa, pero los microorganismos presentes en el ambiente que se encuentran habitualmente en los establos del ganado suelen ser resistentes a esas medidas. Por tanto, la vacunación es una estrategia interesante que previene las infecciones de las glándulas mamarias y ha demostrado ser beneficiosa en el caso de algunos patógenos contagiosos causantes de mastitis.Conventional control methods antibacterial such as disinfection of post-milking nipples and the Antibiotic treatment are effective in controlling many types of contagious mastitis, but the microorganisms present in the environment usually found in the stables of the cattle are usually resistant to these measures. Therefore, the Vaccination is an interesting strategy that prevents mammary gland infections and has proven to be beneficial in the case of some contagious pathogens that cause mastitis.
Existe una literatura limitada en referencia a estudios de vacunación con S. dysgalactiae y S. uberis y se ha observado resultados variables. En algunos casos, la inmunización ha resultado en un aumento de la vulnerabilidad al microorganismo específico y, en otros casos, se ha obtenido protección frente a una cepa específica.There is limited literature in reference to vaccination studies with S. dysgalactiae and S. uberis and variable results have been observed. In some cases, immunization has resulted in increased vulnerability to the specific microorganism and, in other cases, protection against a specific strain has been obtained.
Por ejemplo, en estudios previos se ha demostrado que la infección primaria con S. uberis puede reducir considerablemente la tasa de infección tras una segunda prueba de provocación con la misma cepa (Hill, A.W. [1988] Res. Vet. Sci. 44:386-387). La vacunación local con microorganismos muertos de S. uberis protege a la glándula mamaria frente a la infección con la cepa homóloga (Finch et al. (1994) Infect. Immun. 62:3599-3603). De forma similar, se ha demostrado que la vacunación subcutánea con microorganismos vivos de S. uberis provoca una modificación dramática de la patogenia de la mastitis causada por la misma cepa (Hill et al. [1994] FEMS Immunol. Med. Microbiol. 8:109-118). Los animales vacunados de este modo producen leche con una menor cantidad de bacterias y muchos animales se mantienen libres de infección.For example, in previous studies it has been shown that primary infection with S. uberis can significantly reduce the infection rate following a second challenge test with the same strain (Hill, AW [1988] Res. Vet. Sci. 44 : 386 -387). Local vaccination with dead microorganisms of S. uberis protects the mammary gland against infection with the homologous strain (Finch et al. (1994) Infect. Immun. 62 : 3599-3603). Similarly, it has been shown that subcutaneous vaccination with live microorganisms of S. uberis causes a dramatic modification of the pathogenesis of mastitis caused by the same strain (Hill et al. [1994] FEMS Immunol. Med. Microbiol. 8 : 109-118). Animals vaccinated in this way produce milk with a smaller amount of bacteria and many animals remain free of infection.
Sin embargo, la vacunación con cepas vivas o atenuadas puede suponer un riesgo para el animal receptor. Además, es evidente que las vacunas convencionales de microorganismos muertos no son, en general, nada efectivas frente a S. uberis y S. agalactiae, o por su falta de antígenos protectores en células in vitro o por el enmascaramiento de dichos antígenos mediante mimetismo molecular.However, vaccination with live or attenuated strains may pose a risk to the recipient animal. In addition, it is clear that conventional vaccines of dead microorganisms are, in general, not at all effective against S. uberis and S. agalactiae , or because of their lack of protective antigens in cells in vitro or by masking said antigens by molecular mimicry .
La falta actual de vacunas para mastitis provocadas por S. agalactiae y cepas infecciosas de estreptococos se debe, al menos en parte, a una falta de conocimientos respecto a los determinantes de virulencia y los antígenos protectores producidos por aquellos microorganismos que están implicados en la invasión y la protección de la glándula mamaria (Collins et al. [1988] J. Dairy Res. 55:25-32; Leigh et al. [1990] Res. Vet. Sci. 49:85-87; Marshall et al. (1986) J. Dairy Res. 53:507-514).The current lack of vaccines for mastitis caused by S. agalactiae and infectious streptococcal strains is due, at least in part, to a lack of knowledge regarding virulence determinants and protective antigens produced by those microorganisms that are involved in the invasion and protection of the mammary gland (Collins et al. [1988] J. Dairy Res. 55 : 25-32; Leigh et al. [1990] Res. Vet. Sci. 49 : 85-87; Marshall et al. ( 1986) J. Dairy Res. 53 : 507-514).
Se sabe que S. dysgalactiae se une a varias proteínas plasmáticas como la fibronectina, el fibrinógeno, el colágeno, la alfa-II-macroglobulina, las IgG, la albúmina y otros compuestos. El microorganismo también produce hialuronidasa y fibrinolisina y es capaz de adherirse a las células epiteliales de las glándulas mamarias e invadirlas. No obstante, no se conocen los papeles exactos desempeñados por estos componentes bacterianos responsables de estos fenotipos en la patogenia.It is known that S. dysgalactiae binds to several plasma proteins such as fibronectin, fibrinogen, collagen, alpha-II-macroglobulin, IgG, albumin and other compounds. The microorganism also produces hyaluronidase and fibrinolysin and is able to adhere to the epithelial cells of the mammary glands and invade them. However, the exact roles played by these bacterial components responsible for these phenotypes in the pathogenesis are unknown.
De forma similar, se conoce muy poco sobre la patogenia de la infección por S. uberis. Además, no está bien definida la influencia de los factores de virulencia de S. uberis en los mecanismos de defensa y en la fisiología de la glándula mamaria. Entre los factores de virulencia asociados con S. uberis se encuentran la cápsula de ácido hialurónico (Hill, A.W. [1988] Res. Vet. Sci. 45:400-404), la hialuronidasa (Schaufuss et al. [1989] Zentralbl. Bakteriol. Ser. A 271:46-53), la proteína tipo-R (Groschup, M.H. y Timoney, J.F. [1993] Res. Vet. Sci. 54:124-126) y una cohemolisina, el factor CAMP, también conocido como el factor UBERIS (Skalka, B. y Smola, J. (1981) Zentralbl. Bakteriol. Ser. A 249:190-194), la proteína tipo-R, el activador de plasminógeno y el factor CAMP. Sin embargo, se conoce muy poco de sus funciones en la patogenicidad.Similarly, very little is known about the pathogenesis of S. uberis infection. In addition, the influence of virulence factors of S. uberis on defense mechanisms and the physiology of the mammary gland is not well defined. Among the virulence factors associated with S. uberis are the hyaluronic acid capsule (Hill, AW [1988] Res. Vet. Sci. 45 : 400-404), hyaluronidase (Schaufuss et al. [1989] Zentralbl. Bakteriol Ser. A 271 : 46-53), the R-type protein (Groschup, MH and Timoney, JF [1993] Res. Vet. Sci. 54 : 124-126) and a cohemolysin, the CAMP factor, also known as UBERIS factor (Skalka, B. and Smola, J. (1981) Zentralbl. Bakteriol. Ser. A 249 : 190-194), R-type protein, plasminogen activator and CAMP factor. However, very little is known of its functions in pathogenicity.
Se ha propuesto la utilización de determinantes de virulencia de Streptococcus como agentes inmunogénicos. Por ejemplo, se ha demostrado que el factor CAMP de S. uberis protege a organismos vertebrados frente a la infección por este microorganismo (Jiang, Patente estadounidense núm. 5 863 543).The use of Streptococcus virulence determinants as immunogenic agents has been proposed. For example, it has been shown that the S. uberis CAMP factor protects vertebrate organisms against infection by this microorganism (Jiang, US Patent No. 5,863,553).
El antígeno \gamma de la cepa A909 (núm. ATCC 27591) de estreptococos del grupo B es un componente del complejo marcador de la proteína C, que consta adicionalmente de una subunidad \alpha y una \beta (Boyle, Patente estadounidense núm. 5 721 339). Se ha descrito que subpoblaciones de los serotipos Ia, II y prácticamente todos los tipos celulares del subtipo Ib de los estroptococos del grupo B expresan componentes de la proteína C. Se ha propuesto la utilización de subunidades \gamma como agentes inmunogénicos frente a las infecciones por estreptococos del grupo B de Lancefield. No obstante, no se ha estudiado su uso en la prevención y el tratamiento de infecciones en animales, entre ellas la mastitis en el ganado vacuno.The γ antigen of strain A909 (No. ATCC 27591) Group B streptococcus is a component of the complex protein C marker, which additionally consists of a α subunit and a β (Boyle, US Pat. no. 5 721 339). It has been described that subpopulations of serotypes Ia, II and practically all cell types of subtype Ib of group B stroptococci express protein components C. The use of γ subunits has been proposed as immunogenic agents against streptococcal infections from group B of Lancefield. However, its use in prevention and treatment of infections in animals, between they mastitis in cattle.
Se considera a la proteína M de los estreptococos del grupo A como uno de los factores de virulencia principales de este microorganismo debido a su capacidad para impedir el ataque de los fagocitos humanos (Lancefield, R.C. [1962] J. Immunol. 89:307-313). Las bacterias persisten en el tejido infectado hasta que se producen los anticuerpos frente a la molécula M. Los anticuerpos específicos para la proteína M son capaces de revertir el efecto antifagocítico de la molécula y permiten la eliminación del microorganismo invasor.The M protein of group A streptococci is considered one of the main virulence factors of this microorganism due to its ability to prevent the attack of human phagocytes (Lancefield, RC [1962] J. Immunol. 89 : 307- 313). Bacteria persist in infected tissue until antibodies against the M molecule are produced. Antibodies specific to the M protein are capable of reversing the antifagocytic effect of the molecule and allow the elimination of the invading microorganism.
Las proteínas M son uno de los factores de virulencia clave de Streptococcus pyogenes, debido al papel que desempeñan interviniendo en la resistencia a la fagocitosis (Kehoe, M.A. [1991] Vaccine 9:797-806) y a su capacidad para inducir respuestas inmunitarias dañinas del huésped a través de su superantigenicidad y su capacidad para inducir reacciones cruzadas entre anticuerpos (Bisno, A.L. [1991] New Engl. J. Med. 325:783-793; Froude et al. [1989] Curr. Top. Microbiol. Immunol. 145:5-26; Stollerman, G.H. [1991] Clin. Immunol. Immunopathol. 61:131-142).M proteins are one of the key virulence factors of Streptococcus pyogenes , due to the role they play in intervening in phagocytosis resistance (Kehoe, MA [1991] Vaccine 9 : 797-806) and their ability to induce harmful immune responses of host through its superantigenicity and its ability to induce cross-reactions between antibodies (Bisno, AL [1991] New Engl. J. Med. 325 : 783-793; Froude et al. [1989] Curr. Top. Microbiol. Immunol. 145 : 5-26; Stollerman, GH [1991] Clin. Immunol. Immunopathol. 61 : 131-142).
Sin embargo, existen obstáculos en la utilización como vacunas de las proteínas M intactas. Los epítopos opsónicos de la proteína son extremadamente específicos por lo que confieren una protección específica muy acotada. Además, algunas proteínas M contienen epítopos que provocan una reacción cruzada con tejidos del individuo inmunizado, conduciendo a una respuesta autoinmunitaria dañina (Véanse p. ej., Dale, J.L. y Beached, G.H. [1982] J. Exp. Med. 156:1165-1176; Dale, J.L. y Beached, G.H. [1985] J. Exp. Med. 161:113-122; Baird, R.W., Bronze, M.S., Drabs, W., Hill, H.R., Veasey, L.G. y Dale, J.L. [1991] J. Immun. 146:3132-3137; Bronze, M.S. y Dale, J.L. [1993] J. Immun. 151:2820-2328; Cunningham, M.W. y Russell, S.M. [1983] Infect. Immun. 42:531-538).However, there are obstacles in the use of intact M proteins as vaccines. The opsonic epitopes of the protein are extremely specific, so they provide a very limited specific protection. In addition, some M proteins contain epitopes that cause a cross-reaction with tissues of the immunized individual, leading to a harmful autoimmune response (See eg, Dale, JL and Beached, GH [1982] J. Exp. Med. 156 : 1165 -1176; Dale, JL and Beached, GH [1985] J. Exp. Med. 161 : 113-122; Baird, RW, Bronze, MS, Drabs, W., Hill, HR, Veasey, LG and Dale, JL [ 1991] J. Immun. 146 : 3132-3137; Bronze, MS and Dale, JL [1993] J. Immun. 151 : 2820-2328; Cunningham, MW and Russell, SM [1983] Infect. Immun. 42 : 531- 538).
Se han expresado proteínas quiméricas que contienen tres dominios diferentes de unión a fibronectina derivados de las proteínas de unión a fibronectina de S. dysgalactiae y Staphylococcus aureus en la superficie de células de Staph. carnosus. En el caso de una de esas proteínas, las inmunizaciones intranasales con células vivas de Staph. carnosus recombinantes que expresaban la proteína quimérica en su superficie resultaron en una mejora de la respuesta de anticuerpos frente a un inmunógeno modelo presente en la proteína quimérica de superficie.Chimeric proteins containing three different fibronectin binding domains derived from the fibronectin binding proteins of S. dysgalactiae and Staphylococcus aureus have been expressed on the surface of Staph cells . carnosus In the case of one of those proteins, intranasal immunizations with live Staph cells . Recombinant carnosus expressing the chimeric protein on its surface resulted in an improvement in the antibody response against a model immunogen present in the surface chimeric protein.
Con anterioridad se ha identificado y caracterizado una proteína GapC de unión a plasmina de una cepa del grupo A de Streptococcus y se ha descrito su utilización en tratamientos trombolíticos (Boyle, et al., Patente estadounidense núm. 5 237 050; Boyle, et al., Patente estadounidense núm. 5 328 996).Previously, a plasmin-binding GapC protein from a Streptococcus group A strain has been identified and characterized and its use has been described in thrombolytic treatments (Boyle, et al. , U.S. Patent No. 5,237,050; Boyle, et al. . , US Patent No. 5 328 996).
Sin embargo, hasta el momento no se ha estudiado ni la capacidad protectora de GapC ni se han aislado ni caracterizado las proteínas GapC de Streptococcus dysgalactiae, Streptococcus agalactiae, Streptococcus uberis, Streptococcus parauberis o Streptococcus iniae.However, to date neither the protective capacity of GapC has been studied nor the GapC proteins of Streptococcus dysgalactiae, Streptococcus agalactiae, Streptococcus uberis, Streptococcus parauberis or Streptococcus iniae have been isolated or characterized.
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Por consiguiente, la presente invención proporciona un uso novedoso de la proteína GapC en la fabricación de la composición de una vacuna útil para el tratamiento y la prevención de la mastitis en mamíferos; en este proceso la proteína GapC se selecciona a partir del siguiente grupo:Accordingly, the present invention provides a novel use of GapC protein in manufacturing of the composition of a vaccine useful for treatment and prevention of mastitis in mammals; in this process the protein GapC is selected from the following group:
(a) Una proteína GapC aislada de Streptococcus dysgalactiae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 1A-1B (ID. de SEC. núm.: 4) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(a) A GapC protein isolated from Streptococcus dysgalactiae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 1A-1B (SEQ ID NO: 4) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(b) Una proteína GapC aislada de Streptococcus agalactiae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 2A-2B (ID. de SEC. núm.: 6) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(b) A GapC protein isolated from Streptococcus agalactiae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 2A-2B (SEQ ID NO: 6) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(c) Una proteína GapC aislada de Streptococcus uberis que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 3A-3B (ID. de SEC. núm.: 8) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(c) A GapC protein isolated from Streptococcus uberis consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 3A-3B (SEQ ID NO: 8) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(d) Una proteína GapC aislada de Streptococcus parauberis que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 4A-4B (ID. de SEC. núm.: 10) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(d) A GapC protein isolated from Streptococcus parauberis consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 4A-4B (SEQ ID NO: 10) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(e) Una proteína GapC aislada de Streptococcus iniae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 5A-5B (ID. de SEC. núm.: 12).(e) A GapC protein isolated from Streptococcus iniae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 5A-5B (SEQ ID NO: 12).
En otra realización, la invención se refiere a la utilización de un polinucleótido que consta de una secuencia de la proteína GapC para la fabricación de la composición de una vacuna útil para el tratamiento y la prevención de mastitis en mamíferos; en la que la proteína GapC se selecciona a partir del siguiente grupo:In another embodiment, the invention relates to the use of a polynucleotide consisting of a sequence of GapC protein for the manufacture of a vaccine composition useful for the treatment and prevention of mastitis in mammals; in which the GapC protein is selected from the following group:
(a) Una proteína GapC aislada de Streptococcus dysgalactiae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 1A-1B (ID. de SEC. núm.: 4) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(a) A GapC protein isolated from Streptococcus dysgalactiae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 1A-1B (SEQ ID NO: 4) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(b) Una proteína GapC aislada de Streptococcus agalactiae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 2A-2B (ID. de SEC. núm.: 6) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(b) A GapC protein isolated from Streptococcus agalactiae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 2A-2B (SEQ ID NO: 6) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(c) Una proteína GapC aislada de Streptococcus uberis que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 3A-3B (ID. de SEC. núm.: 8) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(c) A GapC protein isolated from Streptococcus uberis consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 3A-3B (SEQ ID NO: 8) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(d) Una proteína GapC aislada de Streptococcus parauberis que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 4A-4B (ID. de SEC. núm.: 10) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(d) A GapC protein isolated from Streptococcus parauberis consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 4A-4B (SEQ ID NO: 10) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
(e) Una proteína GapC aislada de Streptococcus iniae que consta de la secuencia de aminoácidos mostrada en las posiciones de los aminoácidos 1 a 336, ambos inclusive, de las Figuras 5A-5B (ID. de SEC. núm.: 12) o una secuencia de aminoácidos con, al menos, un 80% de similitud con la misma.(e) A GapC protein isolated from Streptococcus iniae consisting of the amino acid sequence shown at amino acid positions 1 to 336, inclusive, of Figures 5A-5B (SEQ ID NO: 12) or a amino acid sequence with at least 80% similarity to it.
Además la composición de la vacuna debe contener un adyuvante.In addition the vaccine composition must contain an adjuvant.
Las Figuras 1A-1B muestran las secuencias de nucleótidos aisladas y las secuencias de aminoácidos deducidas del gen gapC de S. dysgalactiae (ID. de SEC. núm.: 3 e ID. de SEC. núm.: 4).Figures 1A-1B show the isolated nucleotide sequences and deduced amino acid sequences of the gapC gene of S. dysgalactiae (SEQ ID NO : 3 and SEQ ID NO : 4).
Las Figuras 2A-2B muestran las secuencias de nucleótidos aisladas y las secuencias de aminoácidos deducidas del gen gapC de S. agalactiae (ID. de SEC. núm.: 5 e ID. de SEC. núm.: 6).Figures 2A-2B show the isolated nucleotide sequences and deduced amino acid sequences of the gapC gene of S. agalactiae (SEQ ID NO : 5 and SEQ ID NO : 6).
Las Figuras 3A-3B muestran las secuencias de nucleótidos aisladas y las secuencias de aminoácidos deducidas del gen gapC de S. uberis (ID. de SEC. núm.: 7 e ID. de SEC. núm.: 8).Figures 3A-3B show the isolated nucleotide sequences and deduced amino acid sequences of the S. uberis gapC gene (SEQ ID NO : 7 and SEQ ID NO : 8).
Las Figuras 4A-4B muestran las secuencias de nucleótidos aisladas y las secuencias de aminoácidos deducidas del gen gapC de S. parauberis (ID. de SEC. núm.: 9 e ID. de SEC. núm.: 10).Figures 4A-4B show the isolated nucleotide sequences and deduced amino acid sequences of the gapC gene of S. parauberis (SEQ ID NO : 9 and SEQ ID NO : 10).
Las Figuras 5A-5B muestran las secuencias de nucleótidos aisladas y las secuencias de aminoácidos deducidas del gen gapC de S. iniae (ID. de SEC. núm.: 11 e ID. de SEC. núm.: 12).Figures 5A-5B show the isolated nucleotide sequences and deduced amino acid sequences of the gapC gene of S. iniae (SEQ ID NO : 11 and SEQ ID NO : 12).
Las Figuras 6A-6E muestran una alineación de DNA creada por PileUp y mostrada por Pretty software (un componente del GCG Wisconsin Package, versión 10, suministrado por el paquete de análisis de secuencias SeqWeb, versión 1.1, de la Canadian Bioinformatics Resource). La figura muestra las secuencias de nucleótidos aisladas de los genes gapC de S. dysgalactiae (DysGapC, Check 9344), S. agalactiae (AgalGapC, Check 2895), S. uberis (UberGapC, Check 5966), S. parauberis (PUberGapC, Check 9672) y S. iniae (IniaeGapC, Check 990). También se incluyen las secuencias previamente conocidas de S. equisimilis (SeqGapC, Check 5841), S. pyogenes (SpyGapC, Check 4037) y una proteína GAPDH bovina (BovGapC, check 5059). Los parámetros de longitud y peso y son los mismos para todas las secuencias (1018 y 1,00; respectivamente). Los parámetros utilizados para la comparación de secuencias de DNA fueron los siguientes: Plurality-2,00; Threshold-1; AveWeight-1,00; AveMatch-1,00; AvMisMatch-0,00; Symbol comparison table-pileupdna.cmp; CompCheck-6876; GapWeight-5; GapLengthWeight-1; PileUp MSF-10l8; Type-N; Check-3804. En la figura, las rayas representan nucleótidos idénticos; los puntos representan gaps introducidos por el software utilizado para generar el diagrama de alineación; y las tildes (\sim) representan regiones no incluidas en la alineación total debido a diferencias en la longitud de la secuencia génica.Figures 6A-6E show a DNA alignment created by PileUp and displayed by Pretty software (a component of the GCG Wisconsin Package, version 10, supplied by the SeqWeb sequence analysis package, version 1.1, of the Canadian Bioinformatics Resource). The figure shows the nucleotide sequences isolated from the gapC genes of S. dysgalactiae (DysGapC, Check 9344), S. agalactiae (AgalGapC, Check 2895), S. uberis (UberGapC, Check 5966), S. parauberis (PUberGapC, Check 9672) and S. iniae (IniaeGapC, Check 990). Also included are the previously known sequences of S. equisimilis (SeqGapC, Check 5841), S. pyogenes (SpyGapC, Check 4037) and a bovine GAPDH protein (BovGapC, check 5059). The parameters of length and weight and are the same for all sequences (1018 and 1.00; respectively). The parameters used for the comparison of DNA sequences were the following: Plurality-2.00; Threshold-1; AveWeight-1.00; AveMatch-1.00; AvMisMatch-0.00; Symbol comparison table-pileupdna.cmp; CompCheck-6876; GapWeight-5; GapLengthWeight-1; PileUp MSF-10l8; Type-N; Check-3804 In the figure, the stripes represent identical nucleotides; the points represent gaps introduced by the software used to generate the alignment diagram; and the tildes (\ sim) represent regions not included in the total alignment due to differences in the length of the gene sequence.
Las Figuras 7A-7B muestran una alineación de una secuencia de aminoácidos creada por PileUp y mostrada por Pretty (igual que la Figura anterior) que muestran las secuencias de aminoácidos deducidas a partir de las proteínas GapC de S. dysgalactiae (DysGapC, Check 6731) , S. agalactiae (AgalGapC, Check 1229), S. uberis (UberGapC, Check 8229), S. parauberis (PUberGapC, Check 8889) y S. iniae (IniaeGapC, check 8785). También se incluyen las secuencias ya conocidas de S. equisimilis (SeqGapC, Check 8252), S. pyogenes (SpyGapC, Check 6626) y una proteína GAPDH bovina (BovGapC, Check 8479). En la figura, las rayas representan residuos idénticos de aminoácidos; los puntos representan gaps introducidos por el software PileUp; y las tildes (\sim) representan regiones no incluidas en la alineación total debido a diferencias en la longitud de las secuencias génicas.Figures 7A-7B show an alignment of an amino acid sequence created by PileUp and shown by Pretty (same as the previous Figure) showing the amino acid sequences deduced from GapC proteins of S. dysgalactiae (DysGapC, Check 6731) , S. agalactiae (AgalGapC, Check 1229), S. uberis (UberGapC, Check 8229), S. parauberis (PUberGapC, Check 8889) and S. iniae (IniaeGapC, check 8785). Also known are the sequences of S. equisimilis (SeqGapC, Check 8252), S. pyogenes (SpyGapC, Check 6626) and a bovine GAPDH protein (BovGapC, Check 8479). In the figure, the stripes represent identical amino acid residues; the dots represent gaps introduced by the PileUp software; and the tildes (\ sim) represent regions not included in the total alignment due to differences in the length of the gene sequences.
La Figura 8 muestra los diagramas de hidropatía en la escala de Kyte-Doolittle (media sobre una ventana de 7), diagramas de probabilidad de superficie de Emini, diagramas de flexibilidad de la cadena de Karplus-Schulz, diagramas del índice de antigenicidad de Jameson-Wolf y diagramas de la estructura secundaria Chou-Fasman y Garnier-Osguthorpe-Robson para la proteína GapC aislada de S. dysgalactiae.Figure 8 shows the hydropathy diagrams on the Kyte-Doolittle scale (mean over a window of 7), Emini surface probability diagrams, Karplus-Schulz chain flexibility diagrams, Jameson antigenicity index diagrams -Wolf and diagrams Chou-Fasman the Garnier-Osguthorpe and-Robson secondary structure plots for the GapC protein isolated from S. dysgalactiae.
La Figura 9 muestra los diagramas de hidropatía en la escala de Kyte-Doolittle (media sobre una ventana de 7), diagramas de probabilidad de superficie de Emini, diagramas de flexibilidad de la cadena de Karplus-Schulz, diagramas del índice de antigenicidad de Jameson-Wolf y diagramas de la estructura secundaria Chou-Fasman y Garnier-Osguthorpe-Robson para la proteína GapC aislada de S. agalactiae.Figure 9 shows the hydropathy diagrams on the Kyte-Doolittle scale (average over a window of 7), Emini surface probability diagrams, Karplus-Schulz chain flexibility diagrams, Jameson antigenicity index diagrams -Wolf and diagrams of the secondary structure Chou-Fasman and Garnier-Osguthorpe-Robson for GapC protein isolated from S. agalactiae .
La Figura 10 muestra los diagramas de hidropatía en la escala de Kyte-Doolittle (media sobre una ventana de 7), diagramas de probabilidad de superficie de Emini, diagramas de flexibilidad de la cadena de Karplus-Schulz, diagramas del índice de antigenicidad de Jameson-Wolf y diagramas de la estructura secundaria Chou-Fasman y Garnier-Osguthorpe-Robson para la proteína GapC aislada de S. uberis.Figure 10 shows the hydropathy diagrams on the Kyte-Doolittle scale (average over a window of 7), Emini surface probability diagrams, Karplus-Schulz chain flexibility diagrams, Jameson antigenicity index diagrams -Wolf and diagrams of the secondary structure Chou-Fasman and Garnier-Osguthorpe-Robson for GapC protein isolated from S. uberis .
La Figura 11 muestra los diagramas de hidropatía en la escala de Kyte-Doolittle (media sobre una ventana de 7), diagramas de probabilidad de superficie de Emini, diagramas de flexibilidad de la cadena de Karplus-Schulz, diagramas del índice de antigenicidad de Jameson-Wolf y diagramas de la estructura secundaria Chou-Fasman y Garnier-Osguthorpe-Robson para la proteína GapC aislada de S. parauberis.Figure 11 shows the hydropathy diagrams on the Kyte-Doolittle scale (average over a window of 7), Emini surface probability diagrams, Karplus-Schulz chain flexibility diagrams, Jameson antigenicity index diagrams -Wolf and diagrams of the secondary structure Chou-Fasman and Garnier-Osguthorpe-Robson for GapC protein isolated from S. parauberis .
La Figura 12 muestra los diagramas de hidropatía en la escala de Kyte-Doolittle (media sobre una ventana de 7), diagramas de probabilidad de superficie de Emini, diagramas de flexibilidad de la cadena de Karplus-Schulz, diagramas del índice de antigenicidad de Jameson-Wolf y diagramas de la estructura secundaria Chou-Fasman y Garnier-Osguthorpe-Robson para la proteína GapC aislada de S. iniae.Figure 12 shows the hydropathy diagrams on the Kyte-Doolittle scale (average over a window of 7), Emini surface probability diagrams, Karplus-Schulz chain flexibility diagrams, Jameson antigenicity index diagrams -Wolf and diagrams of the secondary structure Chou-Fasman and Garnier-Osguthorpe-Robson for GapC protein isolated from S. iniae .
La Figura 13 es una representación gráfica de los diagramas Chou-Fasman de estructura secundaria para la proteína GapC aislada de S. dysgal.Figure 13 is a graphical representation of the secondary structure Chou-Fasman diagrams for GapC protein isolated from S. dysgal .
La Figura 14 es una representación gráfica de los diagramas Chou-Fasman de estructura secundaria para la proteína GapC aislada de S. agalactiae.Figure 14 is a graphical representation of the secondary structure Chou-Fasman diagrams for GapC protein isolated from S. agalactiae .
La Figura 15 es una representación gráfica de los diagramas Chou-Fasman de estructura secundaria para la proteína GapC aislada de S. uberis.Figure 15 is a graphical representation of the secondary structure Chou-Fasman diagrams for GapC protein isolated from S. uberis .
La Figura 16 es una representación gráfica de los diagramas Chou-Fasman de estructura secundaria para la proteína GapC aislada de S. parauberis.Figure 16 is a graphical representation of the secondary structure Chou-Fasman diagrams for GapC protein isolated from S. parauberis .
La Figura 17 es una representación gráfica de los diagramas Chou-Fasman de estructura secundaria para la proteína GapC aislada de S. iniae.Figure 17 is a graphical representation of the secondary structure Chou-Fasman diagrams for GapC protein isolated from S. iniae .
La Figura 18 muestra los resultados de una electroforesis en gel de SDS-poliacrilamida de la proteína GapC recombinante de S. dysgalactiae producida en E. coli DE3. Carril 1, marcador de peso molecular (20,5 - 103 kDa; BioRad, Emeryville, CA); carril 2, proteína GapC recombinante soluble de S. dysgalactiae purificada por cromatografía de afinidad en Ni-NTA. Los números a la izquierda de la figura indican las posiciones de los marcadores de peso molecular (en KDa).Figure 18 shows the results of an SDS-polyacrylamide gel electrophoresis of the recombinant S. dysgalactiae GapC protein produced in E. coli DE3. Lane 1, molecular weight marker (20.5-103 kDa; BioRad, Emeryville, CA); lane 2, soluble recombinant GapC protein of S. dysgalactiae purified by affinity chromatography in Ni-NTA. The numbers to the left of the figure indicate the positions of the molecular weight markers (in KDa).
La Figura 19 es un histograma que compara la actividad enzimática de: la plasmina bovina unida a células intactas de S. dysgalactiae, la plasmina bovina unida a proteína GapC recombinante de S. dysgalactiae purificada por cromatografía de afinidad y de células de S. dysgalactiae intactas, proteína GapC recombinante de S. dysgalactiae purificada por cromatografía de afinidad y plasmina bovina, las tres por separado. La actividad enzimática se midió mediante los aumentos de absorbancia a 405 nm tras la liberación de paranitroanilida de su sustrato sintético Chromozym-PL (Roche Diagnostics, Laval, Quebec, Canadá). Los resultados representan la media de tres ensayos independientes.Figure 19 is a histogram comparing the enzymatic activity of: bovine plasmin bound to intact S. dysgalactiae cells, bovine plasmin bound to recombinant S. dysgalactiae GapC protein purified by affinity chromatography and intact S. dysgalactiae cells , recombinant S. dysgalactiae GapC protein purified by affinity chromatography and bovine plasmin, all three separately. Enzymatic activity was measured by absorbance increases at 405 nm after the release of paranitroanilide from its synthetic substrate Chromozym-PL (Roche Diagnostics, Laval, Quebec, Canada). The results represent the average of three independent trials.
En la Figura 20 se comparan los cambios en el porcentaje de cuartos de las ubres infectados por S. dysgalactiae durante un periodo de siete días en tres grupos experimentales: (1) animales control sin vacunar; (2) animales vacunados con proteína Mig de unión a Fc; y (3) animales vacunados con GapC. La infección se definió como la aparición de >500 ufc de S. dysgalactiae por ml en la leche secretada.The changes in the percentage of quarters of udders infected by S. dysgalactiae over a period of seven days in three experimental groups are compared in Figure 20: (1) control animals without vaccinations; (2) animals vaccinated with Fc binding Mig protein; and (3) animals vaccinated with GapC. Infection was defined as the appearance of> 500 cfu of S. dysgalactiae per ml in secreted milk.
La Figura 21 representa el número máximo de S. dysgalactiae en cualquier cuarto de ubre frente a la titulación de anticuerpos anti-GapC séricos (expresada como el recíproco a la dilución que muestra actividad por encima de los niveles basales). Los títulos de anti-GapC se correlacionaron con el número máximo de ufc recuperadas de las glándulas mamarias r^{2}=0,74, calculado con la aplicación informática GraphPadPrism, v. 2.01, de GraphPad Software, Inc., San Diego, CA).Figure 21 represents the maximum number of S. dysgalactiae in any quarter of udder versus titration of serum anti-GapC antibodies (expressed as the reciprocal at dilution showing activity above baseline levels). The anti-GapC titers were correlated with the maximum number of cfu recovered from the mammary glands r2 = 0.74, calculated with the GraphPadPrism computer application, v. 2.01, from GraphPad Software, Inc., San Diego, CA).
La Figura 22 representa el número acumulado de cuartos mamarios afectados frente a la titulación de anticuerpos (de nuevo expresada como el recíproco a la dilución que muestra actividad por encima de los niveles basales). Se observó una correlación muy buena entre los niveles de anticuerpos séricos anti-GapC y el número total de cuartos infectados.Figure 22 represents the cumulative number of affected mammary quarters against antibody titration (again expressed as the reciprocal of the dilution it shows activity above baseline levels). One was observed very good correlation between serum antibody levels anti-GapC and the total number of rooms infected.
La Figura 23 ilustra la presencia de bacterias en animales inmunizados con GapC; cada punto representa el número medio de bacterias presentes por ml de leche respecto al tiempo (en días tras la provocación). En la Figura 20, los diamantes (-\blacklozenge-) representan los animales no vacunados; los cuadrados (-\blacksquare-) representan los animales con un título bajo (es decir, los animales que muestran la peor respuesta frente a GapC en función de su título de anticuerpos), y los triángulos (-\Delta-) representan los animales con un título elevado (es decir, el resto de animales).Figure 23 illustrates the presence of bacteria in animals immunized with GapC; each point represents the number medium of bacteria present per ml of milk with respect to time (in days after provocation). In Figure 20, diamonds (- \ blacklozenge-) represent unvaccinated animals; the squares (- \ blacksquare-) represent animals with a title low (i.e. animals that show the worst response against to GapC based on its antibody titer), and the triangles (- \ Delta-) represent animals with a high titer (it is say, the rest of animals).
La Figura 24 muestra la presencia de S. dysgalactiae en animales inmunizados con GapC, representados como el porcentaje de cuartos mamarios infectados frente al tiempo en días tras la provocación. En la figura, las barras punteadas representan los animales no vacunados; las barras con rayas diagonales representan los animales con títulos bajos (es decir, los animales que muestran la peor respuesta frente a GapC en función de su título de anticuerpos); y las barras blancas representan los animales con títulos elevados (es decir, el resto de animales).Figure 24 shows the presence of S. dysgalactiae in animals immunized with GapC, represented as the percentage of infected breast rooms versus time in days after provocation. In the figure, the dotted bars represent the unvaccinated animals; the bars with diagonal stripes represent the animals with low titers (that is, the animals that show the worst response against GapC based on their antibody titer); and the white bars represent the animals with high titles (that is, the rest of the animals).
La Figura 25 muestra las respuestas inflamatorias observadas causadas por la infección con S. dysgalactiae, representadas como los recuentos medios de células somáticas (RCS) para cada grupo experimental frente al tiempo en días tras la provocación. En la figura, los diamantes (-\blacklozenge-) representan los cuartos sin vacuna ni provocación; los cuadrados (-\blacksquare-) representan animales no vacunados a los que se ha realizado una provocación; los triángulos (-\Delta-) representan los animales vacunados con Mig y sometidos a provocación; y las x (-X-) representan los animales vacunados con GapC y sometidos a provocación.Figure 25 shows the observed inflammatory responses caused by infection with S. dysgalactiae , represented as the mean somatic cell counts (RCS) for each experimental group versus time in days after provocation. In the figure, diamonds (- \ blacklozenge-) represent the rooms without vaccine or provocation; the squares (- \ blacksquare-) represent unvaccinated animals to which a provocation has been made; the triangles (- Δ-) represent the animals vaccinated with Mig and subjected to provocation; and the x (-X-) represent the animals vaccinated with GapC and subjected to provocation.
La Figura 26 ilustra los recuentos de células somáticas por cuarto en el día 1 tras la provocación. En la figura, la barra representa la media para cada grupo. Los cuadrados representan (-\blacksquare-) los animales no vacunados; los triángulos representan (-\ding{115}-) los animales vacunados con GapC; y los triángulos invertidos (-\ding{116}-) los animales vacunados con Mig.Figure 26 illustrates cell counts somatic per room on day 1 after provocation. In the figure, The bar represents the average for each group. The squares represent (- \ blacksquare-) unvaccinated animals; the triangles represent (- \ ding {115} -) animals vaccinated with GapC; and inverted triangles (- \ ding {116} -) animals vaccinated with Mig.
La Figura 27 muestra los recuentos de células somáticas de animales con títulos elevados no vacunados, sin provocación e inmunizados con GapC (es decir, los cuatro animales que presentaron los títulos de anticuerpos más elevados de los ocho animales de cada grupo) durante un periodo de siete días tras la provocación, representado como el log_{10} de los recuentos medios de células somáticas por ml de leche respecto al tiempo en días tras la provocación. los diamantes (-\blacklozenge-) representan los animales sin vacuna ni provocación; los cuadrados (-\blacksquare-) representan los animales no vacunados a los que se ha realizado una provocación; los triángulos (-\Delta-) representan los animales vacunados con GapC y sometidos a provocación.Figure 27 shows cell counts somatic animals with high levels not vaccinated, without provocation and immunized with GapC (i.e., the four animals who presented the highest antibody titers of the eight animals of each group) for a period of seven days after provocation, represented as the log_ {10} of the counts somatic cell media per ml of milk with respect to time in days after provocation. the diamonds (- \ blacklozenge-) they represent animals without vaccine or provocation; the squares (- \ blacksquare-) represent unvaccinated animals that a provocation has been made; the triangles (- \ Delta-) represent animals vaccinated with GapC and subjected to provocation.
La puesta en práctica de la presente invención utilizará, a menos que se indique lo contrario, técnicas convencionales de biología molecular, microbiología, tecnología del DNA recombinante e inmunología, que se encuentran entre las técnicas de cada campo. Dichas técnicas se encuentran ampliamente descritas en la literatura. Véanse, p. ej., Sambrook, Fritsch & Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Vols. I, II y III, Segunda edición (1989); Perbal, B., A Practical Guide to Molecular Cloning (1984); las series, Methods In Enzymology (S. Colowick y N. Kaplan eds., Academic Press, Inc.); y Handbook of Experimental Immunology, Vols. I-IV (D.M. Weir y C.C. Blackwell eds., 1986, Blackwell Scientific Publications).The implementation of the present invention will use, unless otherwise indicated, conventional techniques of molecular biology, microbiology, recombinant DNA technology and immunology, which are among the techniques of each field. These techniques are widely described in the literature. See, p. eg, Sambrook, Fritsch & Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual , Vols. I, II and III, Second Edition (1989); Perbal, B., A Practical Guide to Molecular Cloning (1984); the series, Methods In Enzymology (S. Colowick and N. Kaplan eds., Academic Press, Inc.); and Handbook of Experimental Immunology , Vols. I-IV (DM Weir and CC Blackwell eds., 1986, Blackwell Scientific Publications).
A lo largo de todo el texto se utilizarán las siguientes abreviaciones de los aminoácidos:Throughout the text, the following abbreviations of amino acids:
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En la descripción de la presente invención, se utilizarán los siguientes términos que se definen como se indica más adelante.In the description of the present invention, they will use the following terms that are defined as indicated later.
Cabe destacar que, tal como se usa en esta especificación y en las reivindicaciones anexas, las formas singulares "un/una" y "él/la" incluyen referentes plurales a menos que se especifique claramente lo contrario. Así, por ejemplo, la referencia a la "proteína GapC de Streptococcus" incluye una mezcla formada por dos o más de dichas proteínas, etcétera.It should be noted that, as used in this specification and in the appended claims, the singular forms "a / a" and "he / she" include plural referents unless clearly stated otherwise. Thus, for example, the reference to " Streptococcus GapC protein" includes a mixture formed by two or more of said proteins, and so on.
Los términos "proteína GapC" y "proteína GapC de unión a plasmina" (que se utilizan de forma intercambiable en este documento) o una secuencia de nucleótidos que codifica la misma, se refieren a una proteína o secuencia de nucleótidos, respectivamente, que derivan del gen GapC presente en una variedad de especies de Streptococcus, que incluyen, sin limitación, ciertas cepas de los estreptococos del grupo A (Lottenbery, R., et al. [1987] Infect. Immun. 55:1914-1918). En las figuras se muestra la secuencia de nucleótidos de los genes gapC representativos de Streptococcus y las correspondientes secuencias de aminoácidos de las proteínas GapC que codifican esos genes. En particular, las figuras de la 1 a la 5 muestran las secuencias de nucleótidos y las secuencias de aminoácidos aisladas de S. dysgalactiae (ID. de SEC. núm.: 3 e ID. de SEC. núm.: 4, respectivamente), S. agalactiae (ID. de SEC. núm.: 5 e ID. de SEC. núm.: 6, respectivamente), S. uberis (ID. de SEC. núm.: 7 e ID. de SEC. núm.: 8, respectivamente), S. parauberis (ID. de SEC. núm.: 9 e ID. de SEC. núm.: 10, respectivamente) y S. iniae (ID. de SEC. núm.: 11 e ID. de SEC. núm.: 12, respectivamente). No obstante, una proteína GapC tal como se describe en este documento no se limita a las secuencias mostradas, ya que se conocen subtipos de cada una de esas especies de Streptococcus y existirán variaciones entre ellas.The terms "GapC protein" and "plasmin-binding GapC protein" (which are used interchangeably herein) or a nucleotide sequence encoding it, refer to a protein or nucleotide sequence, respectively, that derive of the GapC gene present in a variety of Streptococcus species, including, without limitation, certain strains of group A streptococci (Lottenbery, R., et al. [1987] Infect. Immun . 55 : 1914-1918). The figures show the nucleotide sequence of the Streptococcus representative gapC genes and the corresponding amino acid sequences of the GapC proteins that encode those genes. In particular, Figures 1 through 5 show the nucleotide sequences and amino acid sequences isolated from S. dysgalactiae (SEQ ID NO : 3 and SEQ ID NO : 4, respectively), S. agalactiae (SEC ID No.: 5 and SEC ID No.: 6, respectively), S. uberis (SEC ID No.: 7 and SEC ID No.: 8 , respectively), S. parauberis (SEQ ID No. 9: and SEQ ID No. 10, respectively) and S. iniae (SEQ ID No. 11 and SEC ID. No.: 12, respectively). However, a GapC protein as described herein is not limited to the sequences shown, since subtypes of each of those Streptococcus species are known and variations will exist between them.
Se encuentran genes gapC representativos, derivados de S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis y S. parauberis, en los plásmidos pETl5bgapC (núm. ATCC), pMF52lc (núm. ATCC), pMF52la (núm. ATCC), pMF52ld (núm. ATCC) y pMF52le (núm. ATCC), respectivamente.Representative gapC genes, derived from S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis and S. parauberis , are found in plasmids pETl5bgapC (No. ATCC), pMF52lc (No. ATCC), pMF52la (No. ATCC), pMF52ld ( ATCC No.) and pMF52le (ATCC No.), respectively.
Además, las secuencias proteicas o nucleotídicas derivadas no tienen que proceder necesariamente del gen descrito anteriormente, sino que pueden producirse mediante cualquier otro método como, p. ej., síntesis química, aislamiento (p. ej. de S. dysgalactiae) o por producción en sistemas recombinantes, basados en la información que se presenta en este documento. Además, el término está destinado a proteínas que poseen secuencias de aminoácidos con una homología sustancial (como se define posteriormente) respecto a las secuencias de aminoácidos contiguas codificadas por los genes que proporcionan actividad inmunológica o de unión a plasmina.In addition, the derived protein or nucleotide sequences do not necessarily have to come from the gene described above, but can be produced by any other method such as, e.g. eg chemical synthesis, isolation (eg from S. dysgalactiae ) or by production in recombinant systems, based on the information presented in this document. In addition, the term is intended for proteins that possess amino acid sequences with substantial homology (as defined below) with respect to contiguous amino acid sequences encoded by genes that provide immunological or plasmin binding activity.
Así, los términos están destinados tanto a secuencias completas como a secuencias parciales, truncadas e inmunogénicas; así como a las formas precursoras y los análogos activos de la proteína. También se incluyen en el término fragmentos nucleotídicos del gen que poseen, como mínimo, alrededor de ocho pares de bases contiguas; se prefiere más un mínimo de entre 10 y 20; y, aún más, un mínimo de entre 25 y 50 (o más) pares de bases contiguas del gen, o cualquier entero entre esos valores. Dichos fragmentos son útiles como sondas en los métodos de diagnóstico que se comentarán en detalle más adelante.Thus, the terms are intended for both complete sequences such as partial sequences, truncated and immunogenic; as well as precursor forms and analogues protein active They are also included in the term nucleotide fragments of the gene that have at least about of eight adjacent base pairs; a minimum of more is preferred between 10 and 20; and, even more, a minimum of between 25 and 50 (or more) pairs of contiguous bases of the gene, or any integer between those values. Such fragments are useful as probes in the methods of diagnosis that will be discussed in detail later.
Los términos también incluyen aquellas formas que poseen, así como las que no, una secuencia señal si es que esta está presente, además de las secuencias de ácidos nucleicos que la codifican. Además, el término está destinado a las formas proteicas de GapC que no presentan una región de anclaje a la membrana y a las secuencias de nucleótidos que codifican las proteínas con dichas deleciones. Estas deleciones pueden ser apropiadas en sistemas que no permiten la secreción de la proteína. Además, los dominios de unión a plasmina de la proteína pueden estar presentes o no estarlo. Así, por ejemplo, si la proteína GapC de unión a plasmina se usa para purificar plasmina, generalmente se conservará el dominio de unión a plasmina. Si la proteína se utiliza en las composiciones de vacunas, estarán presentes los epítopos inmunogénicos, que pueden incluir los dominios de unión a plasmina o no incluirlos.The terms also include those forms that have, as well as those that do not, a signal sequence if this it is present, in addition to the nucleic acid sequences that the encode In addition, the term is intended for protein forms of GapC that do not have an anchoring region to the membrane and to the nucleotide sequences encoding proteins with said deletions These deletions may be appropriate in systems that They do not allow protein secretion. In addition, the domains of protein plasmin binding may be present or not be Thus, for example, if the plasmin-binding GapC protein it is used to purify plasmin, generally the plasmin binding domain. If the protein is used in vaccine compositions, epitopes will be present immunogenic, which may include plasmin binding domains or not include them.
Los términos también incluyen proteínas en su forma neutra o en su forma de sales de adición ácidas y básicas dependiendo del modo de preparación. Dichas sales de adición ácidas pueden formarse con grupos amino y dichas sales básicas con carboxilos libres. Más adelante se comentarán en detalle las sales de adición ácidas y básicas farmacéuticamente aceptables. Además, las proteínas se pueden modificar mediante la combinación con otros materiales biológicos, como lípidos (tanto los que aparecen de forma natural con la molécula como otros lípidos que no destruyen la respuesta inmunitaria) y polisacáridos; o mediante modificación de las cadenas laterales, como la acetilación de grupos amino, la fosforilación de cadenas laterales hidroxilo, la oxidación de grupos sulfhidrilo, la glicosilación de residuos de aminoácidos, así como otras modificaciones de la secuencia primaria codificada.The terms also include proteins in their neutral form or in the form of acidic and basic addition salts Depending on the mode of preparation. Said acid addition salts they can be formed with amino groups and said basic salts with free carboxyls. Salts will be discussed in detail later Acid and basic pharmaceutically acceptable additions. Further, proteins can be modified by combining with others biological materials, such as lipids (both those that appear in shape natural with the molecule like other lipids that don't destroy the immune response) and polysaccharides; or by modification of the side chains, such as the acetylation of amino groups, the phosphorylation of hydroxyl side chains, oxidation groups sulfhydryl, glycosylation of amino acid residues, as well as other modifications of the coded primary sequence.
El término, por tanto, está destinado a deleciones, adiciones y sustituciones en la secuencia, siempre y cuando el polipéptido sea capaz de producir una respuesta inmunitaria tal como se define en este documento. En ese sentido, las sustituciones que se prefieren especialmente serán, en general, de naturaleza conservadora, es decir, dichas sustituciones tendrán lugar dentro de una familia de aminoácidos. Por ejemplo, los aminoácidos se dividen generalmente en cuatro familias: (1) ácidos -glutamato y aspartato; (2) básicos -lisina, arginina e histidina; (3) apolares -alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina y triftófano; y (4) apolares sin carga -glicina, asparagina, glutamina, cistina, serina, treonina y tirosina. La fenilalanina, el triptófano y la tirosina se clasifican, a veces, como aminoácidos aromáticos. Por ejemplo, es razonable predecir que el remplazo aislado de leucina por isoleucina o valina, y viceversa; un aspartato por glutamato, y viceversa; una treonina por una serina, y viceversa; o un remplazo conservador similar de un aminoácido por otro aminoácido estructuralmente relacionado, no suponga un efecto importante en la actividad biológica. Por tanto, las proteínas que poseen una secuencia de aminoácidos sustancialmente similar a la molécula de referencia, pero que poseen sustituciones sin importancia de aminoácidos que no afectan sustancialmente a la inmunogenicidad o la afinidad de la proteína para unirse a plasmina, se encuentran dentro de la definición del polipéptido de referencia.The term, therefore, is intended to deletions, additions and substitutions in the sequence, provided and when the polypeptide is able to produce a response immune as defined in this document. In that sense, the substitutions that are especially preferred will be, in general, conservative in nature, that is, these substitutions will have place within a family of amino acids. For example, the Amino acids are generally divided into four families: (1) acids -glutamate and aspartate; (2) basic -lisin, arginine and histidine; (3) apolar-alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, phenylalanine, methionine and tryptophan; and (4) apolar without load -glycine, asparagine, glutamine, cystine, serine, threonine and tyrosine Phenylalanine, tryptophan and tyrosine are sometimes classified as aromatic amino acids. For example, it is reasonable to predict that isolated leucine replacement by isoleucine or valine, and vice versa; an aspartate by glutamate, and vice versa; a threonine for a serine, and vice versa; or a replacement similar conservative of one amino acid to another amino acid structurally related, do not imply an important effect on the biological activity Therefore, proteins that possess a amino acid sequence substantially similar to the molecule of reference, but that have unimportant substitutions of amino acids that do not substantially affect immunogenicity or protein affinity to bind plasmin, they are found within the definition of the reference polypeptide.
Por ejemplo, el polipéptido de interés puede incluir hasta un máximo de entre 5 y 10 sustituciones conservadoras o no conservadoras de aminoácidos, o incluso hasta un máximo de entre 15 y 25 o 20 y 50 sustituciones conservadoras o no conservadoras, o cualquier número entero entre esos valores, siempre y cuando la función de la molécula se mantenga intacta.For example, the polypeptide of interest may include up to 5 to 10 conservative substitutions or non-conservative amino acids, or even up to a maximum of between 15 and 25 or 20 and 50 conservative substitutions or not conservative, or any integer between those values, always and when the function of the molecule remains intact.
En ese sentido, las proteínas GapC aisladas de estreptococos muestran varias regiones variables en sus secuencias de aminoácidos, localizadas en las posiciones de la 62 a la 81; de la 102 a la 112; de la 165 a la 172; de la 248 a la 271; y de la 286 a la 305.In that sense, GapC proteins isolated from streptococci show several variable regions in their sequences of amino acids, located at positions 62 through 81; from 102 to 112; from 165 to 172; from 248 to 271; and of the 286 to 305.
Estas regiones, que en S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae muestran sustituciones en los aminoácidos del 1 al 9, son susceptibles de presentar variación sin que afecte sustancialmente a la función enzimática o inmunogénica.These regions, which in S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis and S. iniae show substitutions in amino acids 1 to 9, are susceptible to variation without substantially affecting the enzyme or immunogenic function.
Asimismo, las sustituciones que suceden en el dominio de unión transmembrana, si está presente, y en la secuencia señal, si está presente, normalmente no afectan a la inmunogenicidad. Un experto en la materia puede determinar fácilmente otras regiones de la molécula de interés que puedan tolerar cambios en referencia a la estructura de la proteína mostrada en las figuras de la 8 a la 17 presentes en este documento.Also, the substitutions that happen in the transmembrane binding domain, if present, and in the sequence signal, if present, normally does not affect the immunogenicity A person skilled in the art can determine easily other regions of the molecule of interest that can tolerate changes in reference to protein structure shown in figures 8 through 17 present in this document.
El término "proteína GapC estreptocócica" está destinado a proteínas de unión a plasmina, tal como se ha definido anteriormente, que derivan de especies de estreptococos que producen la misma. Entre ellas, aunque no están limitadas a las mismas, se encuentran las siguientes especies: S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae. Por ejemplo, una "proteína GapC de S. dysgalactiae" es una proteína GapC de unión a plasmina, tal como se ha definido anteriormente, que deriva de S. dysgalactiae. Asimismo, una "proteína GapC de S. agalactiae" se refiere a una proteína de unión GapC que deriva de S. agalactiae.The term "streptococcal GapC protein" is intended for plasmin binding proteins, as defined above, which are derived from streptococcus species that produce it. Among them, although they are not limited to them, are the following species: S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis and S. iniae . For example, a " S. dysgalactiae GapC protein" is a plasmin-binding GapC protein, as defined above, which is derived from S. dysgalactiae . Also, a "GapC protein of S. agalactiae " refers to a GapC binding protein that is derived from S. agalactiae .
Los términos proteínas "salvajes" o "nativas" se refieren a proteínas o polipéptidos aislados de la fuente en la cual las proteínas aparecen de forma natural. Los polipéptidos "recombinantes" son aquellos polipéptidos producidos mediante técnicas del DNA recombinante; es decir, producidas a partir de células transformadas por un constructo de DNA exógeno que codifica el polipéptido deseado. Los polipéptidos "sintéticos" son aquellos que se preparan mediante síntesis química.The terms "wild" proteins or "native" refers to proteins or polypeptides isolated from the source in which proteins appear naturally. The "recombinant" polypeptides are those polypeptides produced by recombinant DNA techniques; that is to say, produced from cells transformed by a construct of Exogenous DNA encoding the desired polypeptide. Polypeptides "synthetics" are those that are prepared by synthesis chemistry.
El término proteína o polipéptido "aislado" se refiere a una molécula de proteína o polipéptido que está separada y diferenciada del organismo completo en el que se encuentra la molécula de forma natural; o una proteína o polipéptido desprovisto, total o parcialmente, de secuencias normalmente asociadas con él de forma natural; o una secuencia en su forma natural, pero que posee secuencias heterólogas (tal como se definen más adelante) en asociación con ella.The term "isolated" protein or polypeptide refers to a protein or polypeptide molecule that is separated and differentiated from the whole organism in which it find the molecule naturally; or a protein or polypeptide devoid, totally or partially, of sequences normally associated with it naturally; or a sequence in its natural form, but it has heterologous sequences (as defined below) in association with it.
El término "funcionalmente equivalente" se refiere a una secuencia de aminoácidos de una proteína GapC de unión a plasmina que desencadena una respuesta inmunitaria sustancialmente equivalente o mejorada, como se ha definido anteriormente, comparada con la respuesta desencadenada por la proteína GapC de unión a plasmina que sea igual a la proteína GapC de unión a plasmina de referencia o una porción inmunogénica de la misma.The term "functionally equivalent" is refers to an amino acid sequence of a GapC protein of plasmin binding that triggers an immune response substantially equivalent or improved, as defined previously, compared to the response triggered by the plasmin binding GapC protein that is equal to GapC protein binding to reference plasmin or an immunogenic portion of the same.
El término "epítopo" se refiere al lugar del antígeno o hapteno al cual los linfocitos B o T específicos responden. El término también es intercambiable por "determinante antigénico" o "sitio antigénico". Se pueden identificar los anticuerpos que se unen al mismo epítopo a través de un inmunoensayo que tenga la capacidad de que un anticuerpo bloquee la unión de otro anticuerpo mediante su unión a un antígeno diana.The term "epitope" refers to the place of the antigen or hapten to which specific B or T lymphocytes respond. The term is also interchangeable for "determinant. antigenic "or" antigenic site. " antibodies that bind to the same epitope through an immunoassay that has the ability of an antibody to block the binding of another antibody by binding to a target antigen.
El término proteína o polipéptido "inmunogénico" se refiere a una secuencia de aminoácidos que desencadena una respuesta inmunológica tal como se ha descrito anteriormente. Una proteína o un polipéptido "inmunogénico", tal como se usan en el presente documento, incluyen la secuencia completa de la proteína GapC de unión a plasmina en cuestión con cualquiera o ninguno de la secuencia señal, el dominio de unión a membrana, el dominio de unión a plasmina y análogos o fragmentos inmunogénicos de los mismos. El término "fragmento inmunogénico" se refiere a un fragmento de la proteína GapC de unión a plasmina que incluye uno o más epítopos y, así, desencadena la respuesta inmunitaria descrita anteriormente. Se pueden identificar dichos fragmentos utilizando diferentes técnicas muy conocidas en el campo para mapear epítopos. Véase, p. ej., Epitope Mapping Protocols en Methods in Molecular Biology, Vol. 66 (Glenn E. Monis, Ed., 1996) Humana Press, Totowa, New Jersey. Por ejemplo, se pueden determinar los epítopos lineales mediante, p. ej., la síntesis simultánea de un gran número de péptidos en soportes sólidos, siendo péptidos que corresponden a porciones de la molécula proteica, y haciendo reaccionar dichos péptidos con los anticuerpos mientras los primeros se encuentran todavía unidos al soporte. Dichas técnicas se conocen en el campo y están descritas en, p. ej., la Patente estadounidense núm. 4 708 871; Geysen et al. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:3998-4002; Geysen et al. (1986) Molec. Immunol. 23:709-715. De forma similar, los epítopos conformacionales se identifican fácilmente a través de la determinación de la conformación espacial de los aminoácidos mediante, p. ej., la cristalografía de rayos X o la resonancia magnética nuclear en dos dimensiones. Véase, p. ej., Epitope Mapping Protocols, supra. También se pueden identificar regiones antigénicas de las proteínas utilizando diagramas estándar de antigenicidad e hidropatía, calculados con, p. ej., el programa Omiga versión 1.0 disponible en Oxford Molecular Group. Esta aplicación informática utiliza el método Hopp/Woods (Hopp et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA [1981] 78:3824-3828) para determinar los perfiles de antigenicidad, y la técnica Kyte-Doolittle (Kyte et al, J. Mol. Biol. [1982] 157:105-132) para los diagramas de hidropatía. Las figuras de la 8 a la 12 presentes en este documento muestran los perfiles Kyte-Doolittle de las proteínas representativas incluidas en la invención.The term "immunogenic" protein or polypeptide refers to an amino acid sequence that triggers an immune response as described above. An "immunogenic" protein or polypeptide, as used herein, includes the complete sequence of the plasmid-binding GapC protein in question with any or none of the signal sequence, the membrane-binding domain, the domain. of plasmin binding and analogs or immunogenic fragments thereof. The term "immunogenic fragment" refers to a fragment of the plasmin-binding GapC protein that includes one or more epitopes and thus triggers the immune response described above. Such fragments can be identified using different techniques well known in the field for mapping epitopes. See, p. eg, Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, Vol. 66 (Glenn E. Monis, Ed., 1996) Humana Press, Totowa, New Jersey. For example, linear epitopes can be determined by, e.g. eg, the simultaneous synthesis of a large number of peptides on solid supports, peptides corresponding to portions of the protein molecule, and reacting said peptides with the antibodies while the former are still bound to the support. Such techniques are known in the field and are described in, e.g. eg, U.S. Patent No. 4 708 871; Geysen et al. (1984) Proc. Natl Acad. Sci. USA 81 : 3998-4002; Geysen et al. (1986) Molec. Immunol 23 : 709-715. Similarly, conformational epitopes are easily identified through the determination of the spatial conformation of amino acids by, e.g. eg, X-ray crystallography or two-dimensional nuclear magnetic resonance. See, p. eg, Epitope Mapping Protocols, supra . Antigenic regions of the proteins can also be identified using standard antigenicity and hydropathy diagrams, calculated with, e.g. eg, the Omiga version 1.0 program available at Oxford Molecular Group. This computer application uses the Hopp / Woods method (Hopp et al. , Proc. Natl. Acad. Sci USA [1981] 78 : 3824-3828) to determine antigenicity profiles, and the Kyte-Doolittle technique (Kyte et al , J. Mol. Biol. [1982] 157 : 105-132) for hydropathy diagrams. Figures 8 through 12 present in this document show the Kyte-Doolittle profiles of the representative proteins included in the invention.
Para los objetivos de la presente invención, los fragmentos inmunogénicos incluirán de forma general al menos tres aminoácidos, preferentemente al menos cinco aminoácidos, más preferentemente un mínimo aproximado de entre 10 y 15 aminoácidos, y, aún más preferentemente, 25 o más aminoácidos de la molécula correspondiente a la proteína parental GapC de unión a plasmina. No existe un límite superior crítico en la longitud del fragmento, que puede comprender cerca de toda la secuencia de la proteína o incluso ser una proteína de fusión que conste de dos o más epítopos de GapC.For the purposes of the present invention, the immunogenic fragments will generally include at least three amino acids, preferably at least five amino acids, plus preferably an approximate minimum of between 10 and 15 amino acids, and, even more preferably, 25 or more amino acids of the molecule corresponding to the plasmatic binding GapC parental protein. Do not there is a critical upper limit on the length of the fragment, which can comprise close to the entire protein sequence or even be a fusion protein consisting of two or more epitopes of GapC
Una "composición inmunogénica" es una composición que consta de una molécula antigénica que cuando se administra a un sujeto provoca el desarrollo en dicho sujeto de una respuesta inmunitaria humoral o celular a la molécula antigénica de interés.An "immunogenic composition" is a composition that consists of an antigenic molecule that when administers to a subject causes the development in said subject of a humoral or cellular immune response to the antigenic molecule of interest.
El término "composición con subunidades de la vacuna" se refiere a una composición que contiene al menos un polipéptido inmunogénico, pero no todos los antígenos, derivado de un antígeno o de un análogo procedente del patógeno de interés. Dicha composición se encuentra sustancialmente libre de células o partículas intactas del patógeno, o del lisado de dichas células o partículas. Así, una "composición con subunidades de la vacuna" se prepara a partir de polipéptidos purificados al menos parcialmente (de forma preferente, purificados en su totalidad) del patógeno o de análogos recombinantes del mismo. Una composición con subunidades de la vacuna puede contener la subunidad antigénica o los antígenos de interés sustancialmente libres de otros antígenos o polipéptidos del patógeno.The term "composition with subunits of the vaccine "refers to a composition that contains at least one immunogenic polypeptide, but not all antigens, derived from an antigen or an analogue from the pathogen of interest. Said composition is substantially free of cells or intact particles of the pathogen, or of the lysate of said cells or particles Thus, a "composition with vaccine subunits" is prepared from purified polypeptides at least partially (preferably, fully purified) of the pathogen or recombinant analogues thereof. A composition with vaccine subunits may contain the antigenic subunit or the antigens of interest substantially free of other antigens or pathogen polypeptides.
Se entiende por "farmacéuticamente aceptable" o "farmacológicamente aceptable" un material que no es biológicamente, ni de ningún otro modo, no deseado; es decir, el material debe administrarse a un individuo en una formulación o composición que no cause ningún efecto biológico no deseado y que no interaccione de una manera dañina con cualquiera de los componentes de la composición que lo contiene.It is understood by "pharmaceutically acceptable "or" pharmacologically acceptable "a material that it is not biologically, or in any other way, unwanted; that is to say, the material must be administered to an individual in a formulation or composition that does not cause any unwanted biological effect and that does not interact in a harmful way with any of the components of the composition that contains it.
Una "respuesta inmunitaria" a una composición o vacuna se refiere al desarrollo en el huésped de una respuesta inmunitaria celular y mediada por anticuerpos a la composición o vacuna de interés. Generalmente, una "respuesta inmunitaria" incluye uno o más de los siguientes efectos, aunque no está limitada a ellos: producción de anticuerpos, linfocitos B, linfocitos T colaboradores, linfocitos T supresores y linfocitos T citotóxicos o linfocitos T \gamma\delta; dirigidos específicamente al antígeno o antígenos presentes en la composición de la vacuna de interés. Preferentemente, el huésped desencadenará una respuesta inmunitaria protectora o terapéutica de modo que se mejorará la resistencia de la glándula mamaria a una nueva infección o se reducirá la gravedad clínica de la enfermedad. Dicha protección se demostrará tanto por la reducción como por la falta de los síntomas que aparecen normalmente en el huésped infectado o mediante una reducción del tiempo necesario para la recuperación.An "immune response" to a composition or vaccine refers to the development in the host of a cellular and antibody-mediated immune response to composition or vaccine of interest. Generally, an "answer immune "includes one or more of the following effects, although is not limited to them: production of antibodies, B lymphocytes, helper T lymphocytes, suppressor T lymphocytes and T lymphocytes cytotoxic or T γ lymphocytes; directed specifically to the antigen or antigens present in the composition of the vaccine of interest. Preferably, the host will trigger a protective or therapeutic immune response so that it improve the resistance of the mammary gland to a new infection or the clinical severity of the disease will be reduced. Bliss protection will be demonstrated both by the reduction and by the lack of the symptoms that normally appear in the infected host or by reducing the time needed for Recovery.
La "inmunización por ácidos nucleicos" se refiere a la introducción en una célula huésped de una molécula de ácidos nucleicos que codifica uno o más antígenos seleccionados para la expresión in vivo de un antígeno, antígenos, un epítopo o epítopos. La molécula de ácidos nucleicos se puede introducir directamente en el sujeto mediante inyección, inhalación; mediante administración por vía oral, intranasal, mucosal o similar; o puede introducirse ex vivo, en las células que han sido extraídas del huésped. En el último caso, las células transformadas se reintroducen en el sujeto en el que puede desencadenarse una respuesta inmunitaria frente al antígeno codificado en la molécula de ácidos nucleicos."Nucleic acid immunization" refers to the introduction into a host cell of a nucleic acid molecule that encodes one or more antigens selected for in vivo expression of an antigen, antigens, an epitope or epitopes. The nucleic acid molecule can be introduced directly into the subject by injection, inhalation; by oral, intranasal, mucosal or similar administration; or it can be introduced ex vivo , into cells that have been removed from the host. In the latter case, the transformed cells are reintroduced into the subject in which an immune response can be triggered against the antigen encoded in the nucleic acid molecule.
El término "tratamiento", tal como se usa en este documento, se refiere tanto a la prevención de la infección o de la reinfección (profilaxis), como a la reducción o eliminación de los síntomas de la enfermedad de interés (tratamiento).The term "treatment", as used In this document, it refers both to the prevention of infection or reinfection (prophylaxis), such as reduction or elimination of the symptoms of the disease of interest (treatment).
El término "mastitis" se refiere a la inflamación de las glándulas mamarias de mamíferos, incluyendo vacas, ovejas, cabras, cerdas, yeguas y similares, causada por la presencia de S. uberis. La infección se manifiesta por la infiltración de células fagocíticas en la glándula. Generalmente, se reconocen cuatro tipos clínicos distintos de mastitis: (1) sobreaguda, asociada con edema, calor, dolor, secreción anormal de la glándula acompañada de fiebre y otros signos de alteración sistémica, como depresión notable, pulso rápido y débil, ojos hundidos, debilidad y anorexia completa; (2) aguda, con cambios en la glándula similares a los descritos anteriormente pero con fiebre, anorexia y depresión entre leve y moderada; (3) subaguda, no se producen cambios sistémicos y los cambios en la glándula y en su secreción son menos marcados; y (4) subclínica, la reacción inflamatoria se detecta únicamente mediante pruebas estándar para la mastitis.The term "mastitis" refers to the inflammation of the mammary glands of mammals, including cows, sheep, goats, sows, mares and the like, caused by the presence of S. uberis . The infection is manifested by the infiltration of phagocytic cells in the gland. Generally, four distinct clinical types of mastitis are recognized: (1) over-acute, associated with edema, heat, pain, abnormal secretion of the gland accompanied by fever and other signs of systemic alteration, such as noticeable depression, rapid and weak pulse, sunken eyes , weakness and complete anorexia; (2) acute, with changes in the gland similar to those described above but with fever, anorexia and depression between mild and moderate; (3) subacute, systemic changes do not occur and changes in the gland and its secretion are less marked; and (4) subclinical, the inflammatory reaction is detected only by standard tests for mastitis.
Entre las pruebas estándar para la detección de mastitis se encuentran las siguientes, aunque no se limitan a ellas: el ensayo de California para la detección de mastitis, el ensayo Wisconsin para la detección de mastitis, el ensayo Nagase, el recuento electrónico de células y el recuento de células somáticas utilizados para detectar la persistencia de un contenido elevado de leucocitos en la leche. En general, un recuento de células somáticas de alrededor de entre 300.000 y 500.000 células por ml, o superior, en la leche es indicativo de la presencia de infección. Así, una vacuna se considera efectiva en el tratamiento o la prevención de mastitis cuando, p. ej., el recuento de células somáticas en la leche se mantiene por debajo de 500.000 células por ml. Para una discusión de la mastitis y del diagnóstico de la misma véase, p. ej., The Merck Veterinary Manual: A Handbook of Diagnosis, Therapy, and Disease Prevention and Control for the Veterinarian, Merck and Co., Rahway, New Jersey, 1991.Standard tests for mastitis detection include the following, but are not limited to: the California mastitis test, the Wisconsin mastitis test, the Nagase test, the electronic cell count and the somatic cell count used to detect the persistence of a high leukocyte content in milk. In general, a somatic cell count of about 300,000 to 500,000 cells per ml, or higher, in milk is indicative of the presence of infection. Thus, a vaccine is considered effective in the treatment or prevention of mastitis when, e.g. For example, the somatic cell count in milk is kept below 500,000 cells per ml. For a discussion of mastitis and its diagnosis see, p. eg, The Merck Veterinary Manual: A Handbook of Diagnosis, Therapy, and Disease Prevention and Control for the Veterinarian , Merck and Co., Rahway, New Jersey, 1991.
Los términos "vertebrado", "sujeto" o "sujeto vertebrado" se refieren a cualquier miembro del subfilum de los cordados e incluyen, sin limitación alguna, los siguientes: mamíferos, como vacas, ovejas, cerdos, cabras, caballos, humanos y animales domésticos como perros y gatos; aves, incluyendo las domésticas, las salvajes y las de caza, como gallos, gallinas, patos, pavos y otras aves gallináceas; y peces. El término no denota ninguna edad en particular. Así, se pretende abarcar tanto animales adultos como recién nacidos, así como a fetos.The terms "vertebrate", "subject" or "vertebrate subject" refers to any member of the subfilum of the ropes and include, without limitation, the following: mammals, such as cows, sheep, pigs, goats, horses, humans and pets such as dogs and cats; birds, including domestic, wild and hunting, like roosters, chickens, ducks, turkeys and other chicken birds; and fish The term It does not denote any particular age. Thus, it is intended to cover both adult and newborn animals, as well as fetuses.
Una molécula de "ácidos nucleicos" puede incluir, aunque no se limita a ello, lo siguiente: secuencias procarióticas, mRNA eucariótico, cDNA procedente de mRNA eucariótic, secuencias genómicas de DNA eucariótico (p.ej. de mamíferos) o, incluso, secuencias sintéticas de DNA. El término también incluye secuencias que consten de cualquiera de los análogos de bases de DNA o RNA.A molecule of "nucleic acids" can include, but is not limited to, the following: sequences prokaryotic, eukaryotic mRNA, cDNA from mRNA eukaryotic, eukaryotic DNA genomic sequences (e.g. from mammals) or even synthetic DNA sequences. The term it also includes sequences that consist of any of the DNA or RNA base analogs.
Una molécula de ácido nucleico "aislada" es una molécula de ácido nucleido separada y diferenciada del microorganismo completo en el que se encuentra de forma natural; o un ácido nucleico desprovisto total o parcialmente de las secuencias asociadas normalmente a él de forma natural; o a una secuencia en la forma que existe en la naturaleza, pero que posee secuencias heterólogas (tal como se definirán más adelante) en asociación a ella. El término "aislado" aplicado a los polinucleótidos se refiere a que el polinucleótido se aísla del cromosoma al que se asocia normalmente y se aísla de la secuencia genómica completa en la que aparece normalmente.An "isolated" nucleic acid molecule is a nucleic acid molecule separated and differentiated from complete microorganism in which it is found naturally; or a nucleic acid totally or partially devoid of sequences normally associated with it naturally; or one sequence in the form that exists in nature, but which has heterologous sequences (as defined below) in association with her. The term "isolated" applied to polynucleotides refers to the polynucleotide being isolated from chromosome with which it is normally associated and isolated from the sequence Complete genomics in which it appears normally.
Un "polinucleótido purificado" se refiere a un polinucleótido de interés o a un fragmento del mismo que se encuentra esencialmente libre, es decir, contiene menos de alrededor de un 50%, preferentemente menos de alrededor de un 70% y más preferentemente menos de alrededor de un 90% de la proteína a la cual se asocia de forma natural dicho polinucleótido. Las técnicas de purificación de polinucleótidos de interés se conocen ampliamente en el campo e incluyen, por ejemplo, la lisis de la célula que contiene el polinucleótido con un agente caotrópico, y la separación del polinucleótido, o polinucleótidos, y las proteínas mediante cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de afinidad y sedimentación en función de la densidad.A "purified polynucleotide" refers to a polynucleotide of interest or a fragment thereof that is found essentially free, that is, it contains less than around 50%, preferably less than about 70% and more preferably less than about 90% of the protein at which naturally associates said polynucleotide. The techniques Purification of polynucleotides of interest are known widely in the field and include, for example, the lysis of the cell containing the polynucleotide with a chaotropic agent, and separation of the polynucleotide, or polynucleotides, and proteins by ion exchange chromatography, chromatography of affinity and sedimentation based on density.
Una "secuencia codificante" o una "secuencia de nucleótidos codificante" de una proteína en particular es una secuencia de nucleótidos que se transcribe y traduce in vivo en un polipéptido cuando se encuentra bajo los elementos reguladores apropiados. Los límites de la secuencia codificante se determinan por un codón de inicio en el extremo 5’ amino terminal y un codón de finalización en el extremo 3’ carboxi terminal. Las secuencias codificantes pueden, entre otros, ser: secuencias procarióticas, cDNA procedente de mRNA eucariótico, secuencias genómicas de DNA eucariótico (p. ej. de mamíferos) o, incluso, secuencias sintéticas de DNA. Una secuencia de finalización de la transcripción se localiza normalmente en el extremo 3’ de la secuencia codificante. Una secuencia "complementaria" es aquella en la que cada base nitrogenada en una posición nucleotídica concreta es la complementaria a la base nitrogenada que aparece en la misma posición de la secuencia de referencia. Para ilustrar esto, la base complementaria de la adenosina es la timina y viceversa; de forma similar, la citosina es la complementaria de la guanina y viceversa. Por tanto, la secuencia complementaria de la secuencia de referencia 5'-ATGCTGA-3' sería 3'-TACGACT-5'.A "coding sequence" or a "coding nucleotide sequence" of a particular protein is a nucleotide sequence that is transcribed and translated in vivo into a polypeptide when it is under the appropriate regulatory elements. The limits of the coding sequence are determined by a start codon at the 5 'amino terminal end and an end codon at the 3' carboxy terminal end. The coding sequences may, among others, be: prokaryotic sequences, cDNA from eukaryotic mRNA, genomic sequences of eukaryotic DNA (eg from mammals) or even synthetic DNA sequences. A transcription termination sequence is normally located at the 3 'end of the coding sequence. A "complementary" sequence is one in which each nitrogen base in a particular nucleotide position is complementary to the nitrogen base that appears in the same position of the reference sequence. To illustrate this, the complementary basis of adenosine is thymine and vice versa; Similarly, cytosine is complementary to guanine and vice versa. Therefore, the complementary sequence of the 5'-ATGCTGA-3 'reference sequence would be 3'-TACGACT-5'.
Una secuencia "salvaje" o "nativa", tal como se utiliza en este documento, se refiere a secuencias codificantes de polipéptidos que fundamentalmente son, como se encuentran en la naturaleza, por ejemplo, las secuencias que codifican la proteína GapC de S. dysgalactiae mostradas en las figuras 1A-1B (ID. de SEC. núm.: 4).A "wild" or "native" sequence, as used herein, refers to polypeptide coding sequences that are essentially, as found in nature, for example, the sequences encoding the S. dysgalactiae GapC protein . shown in Figures 1A-1B (SEQ ID NO: 4).
El término "recombinante", utilizado aquí para describir moléculas de ácidos nucleicos, se refiere a un polinucleótido de origen genómico, de cDNA, semisintético o sintético, que por su origen o su manipulación: (1) no se asocia con el polinucleótido con el que se asocia en la naturaleza o con un fragmento del mismo; y (2) se une a un polinucleótido distinto al que se asocia de forma natural. El término "recombinante", referido a una proteína o polipéptido, significa un polipéptido producido mediante la expresión de un polinucleótido recombinante. "Células huésped recombinantes", "células huésped", "células", "líneas celulares", "cultivos celulares" y otros términos de ese tipo que denotan líneas celulares de microorganismos procariotas o células eucariotas como entidades unicelulares, se usan de manera intercambiable y se refiere a células que pueden ser, o han sido, utilizadas como receptoras de vectores recombinantes o de otras transferencias de DNA e incluyen la progenie de las células originales que han sido transfectadas. Se entiende que la progenie de una única célula parental no tiene porqué ser completamente idéntica en su morfología o en el contenido genómico o total a la célula parental original debido a mutaciones accidentales o deliberadas. En esta definición se incluye la progenie que es lo suficientemente similar a la célula parental para mostrar la propiedad relevante, como es la presencia de una secuencia de nucleótidos que codifica el péptido deseado, y se encuentra englobada en los términos definidos anteriormente.The term "recombinant", used here to describe nucleic acid molecules, it refers to a polynucleotide of genomic origin, cDNA, semisynthetic or synthetic, which by its origin or its manipulation: (1) is not associated with the polynucleotide with which it is associated in nature or with a fragment thereof; and (2) binds to a polynucleotide other than which is associated naturally. The term "recombinant", referred to a protein or polypeptide, means a polypeptide produced by the expression of a recombinant polynucleotide. "Recombinant host cells", "host cells", "cells", "cell lines", "cell cultures" and other terms of that type denoting cell lines of prokaryotic microorganisms or eukaryotic cells as entities Unicellular, used interchangeably and refers to cells that can be, or have been, used as recipients of recombinant vectors or other DNA transfers and include the progeny of the original cells that have been transfected. It is understood that the progeny of a single parental cell does not have why be completely identical in its morphology or content Genomic or total to the original parental cell due to mutations accidental or deliberate. This definition includes the progeny that is similar enough to the parental cell to show the relevant property, such as the presence of a nucleotide sequence encoding the desired peptide, and it found encompassed in the terms defined above.
El término "homología" se refiere al porcentaje de identidad entre dos polinucleótidos o dos dominios de polipéptido. Dos secuencias polipeptídicas o dos secuencias de DNA son "sustancialmente homólogas" entre ellas cuando muestran, al menos aproximadamente, entre el 80 y el 85%, preferentemente al menos aproximadamente un 90%, y más preferiblemente, al menos aproximadamente, entre el 95 y el 98% de similitud en la secuencia a lo largo de la longitud definida de las moléculas. Tal como se usa en este documento, sustancialmente homólogo también se refiere a las secuencias que muestran la identidad completa de la secuencia polipeptídica o de DNA especificada.The term "homology" refers to the percent identity between two polynucleotides or two domains of polypeptide. Two polypeptide sequences or two DNA sequences they are "substantially homologous" to each other when they show, at least about 80 to 85%, preferably at less about 90%, and more preferably, at least approximately, between 95 and 98% similarity in the sequence to along the defined length of the molecules. As used in this document, substantially homologous also refers to the sequences that show the complete identity of the sequence specified polypeptide or DNA.
En general, el término "identidad" se refiere a la correspondencia exacta, aminoácido a aminoácido o nucleótido a nucleótido, de dos secuencias polipeptídicas o de DNA, respectivamente. El porcentaje de identidad se puede determinar a través de la comparación directa de la información de las secuencias de dos moléculas mediante la alineación de estas secuencias, contando el número exacto de correspondencias entre las dos secuencias alineadas, dividiendo entre la longitud de la secuencia más corta y multiplicando el resultado por 100. Se pueden utilizar programas informáticos fácilmente disponibles para ayudar en el análisis, como ALIGN, Dayhoff, M.O. en Atlas of Protein Sequence and Structure M.O. Dayhoff Ed., 5 Supl. 3:353-358, National Biomedical Research Foundation, Washington, DC, que adapta el algoritmo de homología local de Smith y Waterman (1981) Advances in Appl. Math. 2:482-489 para el análisis de péptidos. Hay programas para determinar la identidad de las secuencias de nucleótidos que están disponibles en el Wisconsin Sequence Analysis Package, Versión 8 (disponible en Genetics Computer Group, Madison, WI); por ejemplo, los programas BESTFIT, FASTA y GAP que también se basan en el algoritmo de Smith y Waterman. Dichos programas son de fácil manejo con los parámetros por defecto recomendados por el fabricante y descritos en el Wisconsin Sequence Analysis Package mencionado anteriormente. Por ejemplo, el porcentaje de identidad de una secuencia de nucleótidos respecto a una secuencia de referencia se puede determinar utilizando el algoritmo de homología de Smith y Waterman con una tabla de puntuación por defecto y una penalización por gap de seis posiciones nucleotídicas.In general, the term "identity" refers to the exact, amino acid to amino acid or nucleotide to nucleotide correspondence of two polypeptide or DNA sequences, respectively. The percentage of identity can be determined through the direct comparison of the sequence information of two molecules by aligning these sequences, counting the exact number of correspondences between the two aligned sequences, dividing by the length of the shortest sequence and multiplying the result by 100. Easily available computer programs can be used to assist in the analysis, such as ALIGN, Dayhoff, MO in Atlas of Protein Sequence and Structure MO Dayhoff Ed., 5 Suppl. 3 : 353-358, National Biomedical Research Foundation , Washington, DC, which adapts the local homology algorithm of Smith and Waterman (1981) Advances in Appl. Math 2 : 482-489 for peptide analysis. There are programs to determine the identity of the nucleotide sequences that are available in the Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 (available from Genetics Computer Group, Madison, WI); for example, the BESTFIT, FASTA and GAP programs that are also based on the Smith and Waterman algorithm. These programs are easy to use with the default parameters recommended by the manufacturer and described in the Wisconsin Sequence Analysis Package mentioned above. For example, the percent identity of a nucleotide sequence with respect to a reference sequence can be determined using the Smith and Waterman homology algorithm with a default score table and a penalty penalty of six nucleotide positions.
Otro método para el establecimiento del porcentaje de identidad en el contexto de la presente invención es la utilización del paquete informático MPSRCH, cuyos derechos de autor pertenecen a la Universidad de Edinburgo, que fue desarrollado por John F. Collins y Shane S. Sturrok y está distribuido por IntelliGenetics, Inc. (Mountain View, CA). Con estos paquetes se puede utilizar el algoritmo Smith-Waterman en el que los parámetros por defecto se utilizan para la tabla de puntuaciones (por ejemplo, penalización de 12 por apertura de gap, penalización de uno por extensión de gap y un gap de seis). De los datos generados el valor de "correspondencia" refleja la "identidad de la secuencia". Se conocen en el campo otros programas apropiados para calcular el porcentaje de identidad o similitud entre secuencias como, por ejemplo, BLAST, otro programa de alineación que se utiliza con parámetros por defecto. Por ejemplo, BLASTN y BLASTP se pueden utilizar empleando los siguientes parámetros por defecto: código genético estándar; sin filtros; hebras = las dos; punto de corte = 60; esperado = 10; Matriz = BLOSUM62; Descripciones = 50 secuencias; ordenado por = puntuación más elevada; Bases de datos = no redundantes; GenBank + EMBL + DDBJ + PDB + traducciones de las CDS de GenBank + Swiss protein + Spupdate + PIR. Los detalles sobre estos programas se pueden encontrar en la siguiente dirección de Internet: http://www.ncbi.nlm.gov/cgi-bin/BLAST.Another method for establishing percent identity in the context of the present invention is the use of the MPSRCH software package, whose rights to author belong to the University of Edinburgh which was developed by John F. Collins and Shane S. Sturrok and is distributed by IntelliGenetics, Inc. (Mountain View, CA). With these packages you can use the algorithm Smith-Waterman in which the default parameters are used for the score table (for example, penalty of 12 for opening of gap, penalty of one for extension of gap and a gap of six). From the data generated the value of "correspondence" reflects the "sequence identity". Other appropriate programs are known in the field for calculating the percent identity or similarity between sequences as, by example, BLAST, another alignment program that is used with default parameters. For example, BLASTN and BLASTP can be use using the following default parameters: code standard genetic; without filters; strands = both; cut point = 60; expected = 10; Matrix = BLOSUM62; Descriptions = 50 sequences; sorted by = highest score; Databases = not redundant; GenBank + EMBL + DDBJ + PDB + translations of GenSank + Swiss protein + Spupdate + PIR CDS. The details about These programs can be found at the following address Internet: http://www.ncbi.nlm.gov/cgi-bin/BLAST.
De manera alternativa, la homología se puede determinar mediante hibridación de polinucleótidos bajo condiciones en las que se forman moléculas bicatenarias entre regiones homólogas, seguida de la digestión con nucleasas específicas de regiones de cadena única y la determinación de la longitud de los fragmentos digeridos. Las secuencias de DNA que son sustancialmente homólogas se pueden identificar mediante un experimento de hibridación Southern bajo, p. ej., condiciones de astringencia tal como se definen para este sistema en particular. La definición de las condiciones apropiadas de hibridación se encuentra dentro de las habilidades del campo. Véase, p. ej., Sambrook et al, supra; DNA cloning, supra; Nucleic Acid Hybridization, supra.Alternatively, homology can be determined by hybridization of polynucleotides under conditions in which double-stranded molecules are formed between homologous regions, followed by digestion with specific nucleases of single chain regions and the determination of the length of digested fragments. DNA sequences that are substantially homologous can be identified by a Southern Southern hybridization experiment, e.g. eg, astringency conditions as defined for this particular system. The definition of appropriate hybridization conditions is within the field's abilities. See, p. eg, Sambrook et al , supra ; DNA cloning , supra ; Nucleic Acid Hybridization , supra .
El término "variante degenerada" se refiere a un polinucleótido que contiene cambios en la secuencia de ácidos nucleicos del mismo, y que codifica un polipéptido que posee la misma secuencia de aminoácidos que el polipéptido codificado por el polinucleótido del cual deriva la variante degenerada.The term "degenerate variant" refers to to a polynucleotide that contains changes in the acid sequence nuclei thereof, and encoding a polypeptide that possesses the same amino acid sequence as the polypeptide encoded by the polynucleotide from which the degenerate variant is derived.
Las técnicas para determinar la "similitud" de la secuencia de aminoácidos se conocen bien en el campo. En general, "similitud" significa la comparación exacta aminoácido a aminoácido de dos o más polipéptidos en los lugares apropiados, donde los aminoácidos son idénticos o poseen propiedades físicas o químicas similares, como la carga o la hidrofobicidad. Así, se puede determinar lo que se denomina "porcentaje de similitud" entre las secuencias polipeptídicas comparadas. Las técnicas para determinar las secuencias de ácidos nucleicos y de aminoácidos también se conocen bien en el campo e incluyen la determinación de la secuencia nucleotídica de mRNA de ese gen (generalmente a través de un intermediario de cDNA) para determinar, de ese modo, la secuencia de aminoácidos codificada y comparar esta con una segunda secuencia de aminoácidos. En general, el término "identidad" se refiere a la correspondencia exacta, nucleótido a nucleótido o aminoácido a aminoácido, entre dos secuencias nucleotídicas o polipeptídicas, respectivamente.Techniques to determine "similarity" Amino acid sequence are well known in the field. In general, "similarity" means the exact amino acid comparison to amino acid of two or more polypeptides in the appropriate places, where the amino acids are identical or have physical properties or similar chemicals, such as loading or hydrophobicity. Thus can determine what is called "percentage of similarity" between the polypeptide sequences compared. The techniques for determine the nucleic acid and amino acid sequences they also know each other well in the field and include the determination of the mRNA nucleotide sequence of that gene (usually through of a cDNA intermediary) to determine, in this way, the encoded amino acid sequence and compare this with a second amino acid sequence In general, the term "identity" refers to the exact correspondence, nucleotide to nucleotide or amino acid to amino acid, between two nucleotide sequences or polypeptide, respectively.
Una región "heteróloga" de un constructo de DNA es un segmento identificable de DNA situado dentro de otra molécula de DNA, o unido a ella, que de forma natural no se encuentra en asociación con la otra molécula. Así, cuando la región heteróloga codifica un gen bacteriano, el gen generalmente está flanqueado por DNA que no flanquea ese gen bacteriano en el genoma de la bacteria de la que procede. Otro ejemplo de secuencia codificante heteróloga es un constructo donde la secuencia codificante en sí misma no se encuentra de forma natural (p. ej., secuencias sintéticas que poseen codones distintos a los del gen nativo). Las variantes alélicas o las mutaciones que ocurren de forma natural no ocasionan la aparición de regiones heterólogas de DNA, tal como se utilizan en este documento.A "heterologous" region of a construct of DNA is an identifiable segment of DNA located within another DNA molecule, or attached to it, that naturally does not found in association with the other molecule. So when the region heterologous encodes a bacterial gene, the gene is usually flanked by DNA that does not flank that bacterial gene in the genome of the bacteria it comes from. Another example sequence heterologous coding is a construct where the sequence coding itself is not found naturally (e.g., synthetic sequences that have codons other than those of the gene native). Allelic variants or mutations that occur from naturally they do not cause the appearance of heterologous regions of DNA, as used herein.
Un "vector" es un replicón, como un plásmido, un fago o un cósmido, al cual se une un segmento de DNA para provocar la replicación de ese segmento unido. Un vector es capaz de transferir secuencias génicas a células diana (p. ej., vectores del tipo plásmido bacteriano, vectores víricos, vectores no víricos, transportadores particulados y liposomas).A "vector" is a replicon, like a plasmid, a phage or a cosmid, to which a segment of DNA binds to cause replication of that joined segment. A vector is capable of transferring gene sequences to target cells (e.g., bacterial plasmid type vectors, viral vectors, non-vectors viral, particulate transporters and liposomes).
Típicamente, todos los términos siguientes: "constructo del vector", "vector de expresión", "vector de expresión génica", "vector de liberación de genes", "vector de transferencia génica" y "casete de expresión"; se refieren a un montaje que es capaz de dirigir la expresión de una secuencia o gen de interés. Así, el término incluye vehículos de clonación y expresión, así como vectores víricos.Typically, all of the following terms: "vector construct", "expression vector", "vector gene expression "," gene release vector ", "gene transfer vector" and "expression cassette"; they refer to a montage that is capable of directing the expression of a sequence or gene of interest. Thus, the term includes vehicles of cloning and expression, as well as viral vectors.
Estos montajes constan de un promotor que se encuentra unido funcionalmente a las secuencias o genes de interés. Asimismo, pueden estar presentes otros elementos de control. Los casetes de expresión descritos en este documento pueden estar contenidos en un constructo plasmídico. Además de los componentes del casete de expresión, el constructo plasmídico también puede incluir un origen de replicación bacteriano, uno o más marcadores de selección, una señal que permita al constructo plasmídico existir como DNA monocatenario (p. ej., un origen de replicación M13), un lugar de clonación múltiple y un origen de replicación de "mamífero" (p. ej., un origen de replicación de un adenovirus o de SV40).These assemblies consist of a promoter that It is functionally linked to the sequences or genes of interest. Also, other control elements may be present. The Expression cassettes described in this document may be contained in a plasmid construct. In addition to the components of the expression cassette, the plasmid construct can also include an origin of bacterial replication, one or more markers of selection, a signal that allows the plasmid construct to exist as single stranded DNA (e.g., an M13 origin of replication), a multiple cloning site and an origin of replication of "mammal" (eg, an origin of replication of an adenovirus or from SV40).
Los "elementos de control" del DNA se refieren, en conjunto, a promotores de la transcripción, elementos estimuladores de la transcripción, secuencias de finalización de la transcripción, secuencias de poliadenilación (localizadas en el extremo 3’ del codón de finalización de la traducción), secuencias para la optimización del inicio de la traducción (localizadas en el extremo 5’ de la secuencia codificante), secuencias de finalización de la traducción, dominios de regulación en 5’, sitios de unión de ribosomas y similares; que, en conjunto, permiten la transcripción y traducción de una secuencia codificante en la célula huésped. Véanse, p. ej., McCaughan et al. (1995) PNAS USA 92:5431-5435; o Kochetov et al. (1998) FEBS Letts. 440:351-355. No siempre son necesarias todas esas secuencias de control en el vector recombinante, siempre y cuando sea posible la transcripción y traducción del gen en cuestión.The "control elements" of the DNA refer, together, to transcription promoters, transcription stimulating elements, transcription termination sequences, polyadenylation sequences (located at the 3 'end of the translation termination codon ), sequences for optimization of translation initiation (located at the 5 'end of the coding sequence), translation termination sequences, 5' regulation domains, ribosome binding sites and the like; which, together, allow transcription and translation of a coding sequence in the host cell. See, p. eg, McCaughan et al. (1995) PNAS USA 92 : 5431-5435; or Kochetov et al. (1998) FEBS Letts. 440 : 351-355. Not all of these control sequences are always necessary in the recombinant vector, as long as transcription and translation of the gene in question is possible.
El término "unido funcionalmente" se refiere a una disposición de los elementos de manera que los componentes así descritos están configurados para realizar sus funciones habituales. Así, los elementos de control unidos funcionalmente a una secuencia codificante son capaces de llevar a cabo la expresión de las secuencias codificantes. No es necesario que los elementos de control sean contiguos a la secuencia codificante, siempre y cuando dirijan la expresión de la misma. Así, por ejemplo, entre el promotor y la secuencia codificante pueden existir secuencias intermedias transcritas pero no traducidas, y el promotor todavía puede considerarse "funcionalmente unido" a la secuencia codificante. De forma similar, "los elementos de control compatibles con la expresión en un sujeto" son aquellos que son capaces de llevar a cabo la expresión de la secuencia codificante en dicho sujeto.The term "functionally linked" is refers to an arrangement of the elements so that the components thus described are configured to perform their usual functions. Thus, the united control elements functionally to a coding sequence are able to lead to carry out the expression of the coding sequences. It is not necessary that the control elements are contiguous to the sequence coding, as long as they direct the expression of it. Thus, for example, between the promoter and the coding sequence intermediate transcribed sequences may exist but no translated, and the promoter can still be considered "functionally linked" to the coding sequence. So similar, "the control elements compatible with the expression in a subject "are those who are able to carry out the expression of the coding sequence in said subject.
Un elemento de control, como un promotor, "dirige la transcripción" de una secuencia codificante en una célula cuando la RNA polimerasa se une al promotor y transcribe la secuencia codificante en un mRNA, que a su vez se traduce en la secuencia polipeptídica codificada en la secuencia codificante.A control element, such as a promoter, "directs the transcription" of a coding sequence in a cell when RNA polymerase binds to the promoter and transcribes the coding sequence in an mRNA, which in turn translates into the polypeptide sequence encoded in the coding sequence.
Una "célula huésped" es una célula que ha sido transformada, o es capaz de serlo, por una molécula exógena de ácidos nucleicos.A "host cell" is a cell that has been transformed, or is capable of being, by an exogenous molecule of nucleic acids.
Una célula ha sido "transformada" por un DNA exógeno cuando dicho DNA exógeno se introduce dentro de la membrana celular. El DNA exógeno puede estar integrado (unido covalentemente) o no en el DNA cromosómico y formar parte del genoma de la célula. En procariotas y levaduras, por ejemplo, se puede mantener el DNA exógeno en un elemento episómico como un plásmido. En cuanto a las células eucariotas, una célula transformada estable es aquella en la que el DNA exógeno se ha integrado en el cromosoma, de manera que las células hijas lo heredan a través de la replicación cromosómica. Esta estabilidad se demuestra por la capacidad de las células eucariotas de establecer líneas celulares o clones con una población de células hijas que contengan el DNA exógeno.A cell has been "transformed" by a Exogenous DNA when said exogenous DNA is introduced into the cellular membrane. The exogenous DNA can be integrated (linked covalently) or not in the chromosomal DNA and be part of the cell genome In prokaryotes and yeasts, for example, can keep exogenous DNA in an episomic element as a plasmid As for eukaryotic cells, a cell stable transform is one in which exogenous DNA has been integrated into the chromosome, so that the daughter cells inherit through chromosomal replication. This stability is demonstrates by the ability of eukaryotic cells to establish cell lines or clones with a population of daughter cells that contain exogenous DNA.
Tal como se utiliza en este documento, una "muestra biológica" se refiere a una muestra de tejido o de fluido aislado de un sujeto, que incluye los siguientes elementos, aunque no se limita a ellos: sangre, plasma, suero, materia fecal, orina, médula ósea, bilis, líquido cefalorraquídeo, líquido linfático, muestras de piel, secreciones externas de la piel, de las vías respiratorias, del tubo digestivo y del sistema genitourinario, lágrimas, saliva, leche, células sanguíneas, órganos, biopsias y también muestras de constituyentes de cultivo celular in vitro que incluyen, entre otros, los siguiente elementos: medio condicionado resultante del crecimiento celular y tisular en medio de cultivo, p. ej., células recombinantes y componentes celulares.As used herein, a "biological sample" refers to a sample of tissue or fluid isolated from a subject, which includes the following elements, although not limited to them: blood, plasma, serum, stool, urine, bone marrow, bile, cerebrospinal fluid, lymphatic fluid, skin samples, external secretions of the skin, respiratory tract, digestive tract and genitourinary system, tears, saliva, milk, blood cells, organs, biopsies and also samples of in vitro cell culture constituents that include, among others, the following elements: conditioned medium resulting from cell and tissue growth in culture medium, e.g. eg, recombinant cells and cellular components.
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Tal como se utiliza en este documento, el término "marcador" o "marcador detectable" se refiere a una molécula capaz de detectarse e incluye las siguientes, aunque sin estar limitado a las mismas: isotopos radiactivos, moléculas fluorescentes, moléculas quimioluminiscentes, enzimas, sustratos enzimáticos, cofactores enzimáticos, inhibidores enzimáticos, cromóforos, colorantes, iones metálicos, ligandos (p. ej., biotina o haptenos) y similares. El término "molécula fluorescente" se refiere a una sustancia o a una porción de la misma que es capaz de emitir fluorescencia en un rango detectable. Algunos ejemplos particulares de marcadores que pueden utilizarse en esta invención son la fluoresceína, la rodamina, el dansil, la umbeliferona, el rojo de Texas, el luminol, el NADPH y la \alpha-\beta-galactosidasa.As used in this document, the term "marker" or "detectable marker" refers to a molecule capable of being detected and includes the following, although without being limited to them: radioactive isotopes, molecules fluorescent, chemiluminescent molecules, enzymes, substrates enzymatic, enzymatic cofactors, enzymatic inhibitors, chromophores, dyes, metal ions, ligands (e.g., biotin or haptens) and the like. The term "fluorescent molecule" is refers to a substance or a portion thereof that is capable of emit fluorescence in a detectable range. Some examples particular of markers that can be used in this invention they are fluorescein, rhodamine, dansil, umbeliferone, Texas red, luminol, NADPH and α-? -galactosidase.
Antes de describir la presente invención en detalle, cabe aclarar que esta invención no se limita a una formulación o unos parámetros de proceso particulares dado que los mismos pueden variar. También es importante aclarar que la terminología utilizada en este documento tiene el objetivo de describir únicamente las realizaciones particulares de la invención y no pretende ser limitante.Before describing the present invention in detail, it should be clarified that this invention is not limited to one formulation or particular process parameters since the They may vary. It is also important to clarify that the terminology used in this document aims to describe only the particular embodiments of the invention and does not pretend to be limiting.
Aunque ya existen una serie de métodos y materiales similares o equivalentes a los aquí descritos que se pueden utilizar en la puesta en práctica de la presente invención, en este documento se describen los materiales y métodos preferidos.Although there are already a number of methods and materials similar or equivalent to those described here that they can use in the practice of the present invention, this document describes the materials and methods preferred.
Una cuestión muy importante en la presente invención es el descubrimiento de que la proteína GapC es capaz de desencadenar una respuesta inmunitaria en un sujeto vertebrado. En particular, se han aislado, secuenciado y caracterizado los genes de la proteína GapC en S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae, y a partir de ellas se han deducido las secuencias proteicas de dichos genes. Las secuencias de DNA completas de dichos genes y sus correspondientes secuencias de aminoácidos se muestran en las Figuras de la 1 a la 5.A very important issue in the present invention is the discovery that the GapC protein is capable of triggering an immune response in a vertebrate subject. In particular, the genes of the GapC protein have been isolated, sequenced and characterized in S. dysgalactiae, S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis and S. iniae , and from them the protein sequences of said genes have been deduced . The complete DNA sequences of said genes and their corresponding amino acid sequences are shown in Figures 1 through 5.
Tal como se describe en los ejemplos, el gen completo gapC de S. dysgalactiae, que se muestra en las posiciones de la 1 a la 1011, ambas inclusive, de las figuras 1A-1B, codifica la proteína completa GapC de S. dysgalactiae de 336 aminoácidos, mostrada como los aminoácidos del 1 al 336 de la misma figura. La proteína GapC de S. dysgalactiae tiene un peso molecular esperado de unos 36 kDa (calculado mediante el programa Peptide Sort del GCG Wisconsin Package, versión 10, suministrado con el paquete de análisis de secuencias SeqWeb, versión 1.1 de Canadian Bioinformatics Resource). De forma similar, los genes gapC aislados de S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae se muestran en las Figuras de la 2 a la 5. Cada uno de ellos codifica una proteína GapC de 336 aminoácidos también con un peso molecular esperado de 36 kDa. Ninguna de las secuencias incluye un péptido señal o una región de anclaje a la membrana.As described in the examples, the complete gapC gene of S. dysgalactiae , shown at positions 1 through 1011, both inclusive, of Figures 1A-1B, encodes the complete GapC protein of S. dysgalactiae from 336 amino acids, shown as amino acids 1 to 336 of the same figure. The S. dysgalactiae GapC protein has an expected molecular weight of about 36 kDa (calculated using the GCG Wisconsin Package Peptide Sort program, version 10, supplied with the SeqWeb sequence analysis package, version 1.1 of the Canadian Bioinformatics Resource). Similarly, the gapC genes isolated from S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis and S. iniae are shown in Figures 2 through 5. Each of them encodes a GapC protein of 336 amino acids also with a expected molecular weight of 36 kDa. None of the sequences include a signal peptide or a membrane anchor region.
Las Figuras 6 y 7 presentan la alineación de secuencias de DNA o de aminoácidos, respectivamente, que muestra las regiones de homología y de variabilidad existentes entre las proteínas GapC de diferentes cepas de estreptococos. En particular, en las posiciones de los aminoácidos del 62 al 81, del 102 al 112, del 165 al 172, del 248 al 271 y del 286 al 305 se localizan diversas regiones variables. Dichas regiones variables son típicamente más susceptibles de cambio. Por tanto, es más probable que se toleren los cambios, como sustituciones, adiciones y deleciones, en los aminoácidos de estas regiones.Figures 6 and 7 show the alignment of DNA or amino acid sequences, respectively, showing the regions of homology and variability between the GapC proteins from different strains of streptococci. In particular, in amino acid positions 62 to 81, 102 to 112, from 165 to 172, from 248 to 271 and from 286 to 305 are located Various variable regions. These variable regions are typically more susceptible to change. Therefore, it is more likely that changes, such as substitutions, additions and deletions, in the amino acids of these regions.
Las Figuras de la 8 a la 12 muestran los diagramas de las siguientes características para cada una de las proteínas GapC de la presente invención: hidropatía según la escala de Kyte-Doolittle (media sobre una ventana de 7); probabilidad de superficie según Emini; flexibilidad de la cadena según Karplus-Schulz; índice de antigenicidad según Jameson-Wolf; estructura secundaria según Garnier-Osguthorpe-Robson; estructura secundaria según Chou-Fasman; y lugares de glicosilación esperados. Las figuras de la 13 a la 17 muestran los valores de estructura secundaria según Chou-Fasman para cada una de las proteínas GapC de la presente invención. Cualquier experto en la materia podrá utilizar fácilmente la información presentada en las Figuras de la 8 a la 17 para determinar las regiones inmunogénicas de la proteína con el fin de utilizarlas en la composición de vacunas.Figures 8 through 12 show the diagrams of the following characteristics for each of the GapC proteins of the present invention: hydropathy according to the scale Kyte-Doolittle (average over a window of 7); surface probability according to Emini; chain flexibility according to Karplus-Schulz; antigenicity index according Jameson-Wolf; secondary structure according Garnier-Osguthorpe-Robson; secondary structure according to Chou-Fasman; and places of glycosylation expected. The figures from 13 to 17 show Secondary structure values according to Chou-Fasman for each of the GapC proteins of The present invention. Any expert in the field may easily use the information presented in Figures 8 at 17 to determine the immunogenic regions of the protein in order to use them in the vaccine composition.
La proteína GapC de unión a plasmina de S. dysgalactiae, fragmentos inmunogénicos de la misma o proteínas quiméricas que la incluyan, pueden suministrarse como composiciones de subunidades de vacuna. Además de su utilización en la composición de vacunas, las proteínas o los anticuerpos de estas pueden utilizarse como reactivos de diagnóstico para detectar la presencia de infección en un sujeto vertebrado. De forma similar, los genes que codifican las proteínas pueden clonarse y utilizarse para diseñar sondas que detecten y aíslen genes homólogos en otras cepas bacterianas. Por ejemplo, los fragmentos que constan de al menos entre 15 y 20 nucleótidos, más preferentemente al menos alrededor de 20 y 50 nucleótidos, y aún más preferentemente alrededor de 60 y 100 nucleótidos, o cualquier entero entre esos valores, podrán ser empleados en estas realizaciones.Plasma-binding GapC protein of S. dysgalactiae , immunogenic fragments thereof or chimeric proteins that include it, can be supplied as vaccine subunit compositions. In addition to their use in the vaccine composition, their proteins or antibodies can be used as diagnostic reagents to detect the presence of infection in a vertebrate subject. Similarly, the genes encoding proteins can be cloned and used to design probes that detect and isolate homologous genes in other bacterial strains. For example, fragments consisting of at least between 15 and 20 nucleotides, more preferably at least about 20 and 50 nucleotides, and even more preferably about 60 and 100 nucleotides, or any integer between those values, may be employed in these realizations
Las composiciones de las vacunas de la presente invención se pueden utilizar para tratar o prevenir una amplia variedad de infecciones bacterianas en sujetos vertebrados. Por ejemplo, las composiciones de vacunas que contienen las proteínas GapC de unión a plasmina de S. dysgalactiae, S. uberis, S. parauberis, S. iniae o de los estreptococos del grupo B (SGB) como S. agalactiae, se pueden utilizar para tratar infecciones por estreptococos en sujetos vertebrados que estén causadas por estas u otras especies. En particular, S. uberis y S. agalactiae son patógenos bacterianos comunes asociados a la mastitis en bóvidos, équidos, óvidos y especies caprinas. Adicionalmente, se sabe que el grupo B de los estreptococos, como S. agalactiae, causan un gran número de otras infecciones en vertebrados como septicemia, meningitis, bacteriemia, impétigo, artritis, infecciones del aparato urinario, abscesos, aborto espontáneo, etc. Por tanto, las composiciones de vacunas que contienen proteínas GapC de unión a plasmina estreptocócicas serán útiles en el tratamiento y la prevención de una amplia variedad de infecciones estreptocócicas.The vaccine compositions of the present invention can be used to treat or prevent a wide variety of bacterial infections in vertebrate subjects. For example, vaccine compositions containing the plasmin-binding GapC proteins of S. dysgalactiae, S. uberis, S. parauberis, S. iniae or group B streptococci (SGB) such as S. agalactiae , can be used to treat streptococcal infections in vertebrate subjects that are caused by these or other species. In particular, S. uberis and S. agalactiae are common bacterial pathogens associated with mastitis in bovids, equidae, ovines and goat species. Additionally, it is known that group B streptococci, such as S. agalactiae , cause a large number of other vertebrate infections such as septicemia, meningitis, bacteraemia, impetigo, arthritis, urinary tract infections, abscesses, spontaneous abortion, etc. Therefore, vaccine compositions containing streptococcal plasmid-binding GapC proteins will be useful in the treatment and prevention of a wide variety of streptococcal infections.
De forma similar, las proteínas GapC de unión a plasmina derivadas de otros géneros bacterianos como Staphylococcus, Mycobacterium, Escherichia, Pseudomonas, Nocardia, Pasteurella, Clostridium y Mycoplasma serán útiles para el tratamiento de infecciones bacterianas causadas por especies que pertenecen a esos géneros. Así, resulta muy evidente que las proteínas GapC de unión a plasmina se pueden utilizar para tratar o prevenir una amplia variedad de infecciones bacterianas provocadas por numerosas especies.Similarly, plasmin-binding GapC proteins derived from other bacterial genera such as Staphylococcus, Mycobacterium, Escherichia, Pseudomonas, Nocardia, Pasteurella, Clostridium and Mycoplasma will be useful for the treatment of bacterial infections caused by species belonging to those genera. Thus, it is very clear that plasmin-binding GapC proteins can be used to treat or prevent a wide variety of bacterial infections caused by numerous species.
Las proteínas GapC de unión a plasmina estreptocócicas de la presente invención se pueden utilizar en composiciones de vacunas de forma independiente o en combinación con otros antígenos bacterianos, fúngicos, víricos o de protozoos. Estos antígenos se pueden suministrar por separado o como proteínas de fusión que consten de uno o más epítopos de la proteína GapC de unión a plasmina fusionados con uno o más de dichos antígenos. Por ejemplo, otras proteínas inmunogénicas de S. uberis, como el factor CAMP, la cápsula de ácido hialurónico, la hialuronidasa, la proteína tipo R y el activador de plasminógeno, se pueden administrar con la proteína GapC. Adicionalmente, proteínas inmunogénicas de otros microorganismos implicados en la mastitis, como los del género Staphylococcus, Corynebacterium, Pseudomonas, Nocardia, Clostridium, Mycobacterium, Mycoplasma, Pasteurella, Prototheca, otros estreptococos, bacterias coliformes, así como levaduras, se pueden administrar junto con las proteínas GapC de unión a plasmina descritas en este documento para proporcionar un espectro amplio de protección. Así, por ejemplo, las proteínas inmunogénicas de Staphylococcus aureus, Str. agalactiae, Str. dysgalactiae, Str. zooepidemicus, Corynebacterium pyogenes, Pseudomonas aeruginosa, Nocardia asteroides, Clostridiunm perfringens, Escherichia coli, Enterobacter aerogenes y Klebsiella spp. se pueden suministrar junto con las proteínas GapC de unión a plasmina de la presente invención.The streptococcal plasmid-binding GapC proteins of the present invention can be used in vaccine compositions independently or in combination with other bacterial, fungal, viral or protozoan antigens. These antigens can be supplied separately or as fusion proteins consisting of one or more epitopes of the plasmin-binding GapC protein fused with one or more of said antigens. For example, other S. uberis immunogenic proteins, such as the CAMP factor, the hyaluronic acid capsule, the hyaluronidase, the R-type protein and the plasminogen activator, can be administered with the GapC protein. Additionally, immunogenic proteins of other microorganisms involved in mastitis, such as those of the genus Staphylococcus, Corynebacterium, Pseudomonas, Nocardia, Clostridium, Mycobacterium, Mycoplasma, Pasteurella, Prototheca , other streptococci, coliform bacteria, as well as yeasts, can be administered together with GapC plasmin binding proteins described herein to provide a broad spectrum of protection. For example, immunogenic proteins from Staphylococcus aureus, Str. Agalactiae, Str. Dysgalactiae, Str. Zooepidemicus, Corynebacterium pyogenes, Pseudomonas aeruginosa, Nocardia asteroides, Clostridiunm perfringens, Escherichia coli, Enterobacter aerogenes and Klebsiella spp. they can be supplied together with the plasmin-binding GapC proteins of the present invention.
Adicionalmente, las proteínas GapC de diferentes especies estroptocócicas se pueden utilizar conjuntamente en composiciones de vacunas de la presente invención. En esta realización, las múltiples proteínas GapC se pueden suministrar como proteínas de fusión o como antígenos discretos, en la misma composición de vacuna o en otra diferente.Additionally, GapC proteins of different stroptococcal species can be used together in vaccine compositions of the present invention. In this embodiment, multiple GapC proteins can be supplied as fusion proteins or as discrete antigens, in the same vaccine composition or in a different one.
Las proteínas de unión a plasmina descritas anteriormente y sus fragmentos activos, proteínas análogas o quiméricas derivadas de las mismas, se pueden producir mediante una diversidad de métodos. En particular, las proteínas GapC de unión a plasmina se pueden aislar directamente de las bacterias que la expresan. Esto se consigue, generalmente, mediante la preparación, en primer lugar, de un extracto crudo que no presente componentes celulares ni varias proteínas foráneas. Las proteínas deseadas se pueden purificar posteriormente de la fracción del lisado celular mediante, p. ej., cromatografía en columna, HPLC, técnicas inmunosorbentes u otros métodos convencionales muy conocidos en el campo.The plasmin binding proteins described previously and its active fragments, analogous proteins or chimeric derived from them, can be produced by a diversity of methods In particular, GapC-binding proteins plasmin can be isolated directly from the bacteria that the express. This is generally achieved by preparation, first of all, of a crude extract that has no components Cellular or several foreign proteins. The desired proteins are can subsequently purify the cell lysate fraction by, p. eg, column chromatography, HPLC, techniques immunosorbents or other conventional methods well known in the countryside.
Más concretamente, se han descrito técnicas de aislamiento de proteínas GapC de unión a plasmina. Por ejemplo, la proteína GapC de S. pyogenes se purificó de un extracto celular crudo mediante precipitación con sulfato amónico seguido de dos ciclos de cromatografía a través de una columna Mono FPLC, y ciclos únicos a través de FPLC en superosa 12 y columnas TSK-fenol de HPLC (Pancholi, V. y Fischetti, VA [1992] J. Exptl. Med. 76:415-426). Existe otra técnica que implica la utilización de columnas de afinidad NAD^{+}-agarosa para purificar GapC de protoplastos lisados de la cepa 64/14 de S. pyogenes (Winram, SB y Lottenberg, R [1996] Microbiol. 142:2311-2320).More specifically, techniques for isolating GapC proteins from plasmin binding have been described. For example, the S. pyogenes GapC protein was purified from a crude cell extract by precipitation with ammonium sulfate followed by two cycles of chromatography through a Mono FPLC column, and single cycles through FPLC in super 12 and TSK- columns. HPLC phenol (Pancholi, V. and Fischetti, VA [1992] J. Exptl. Med. 76 : 415-426). There is another technique that involves the use of NAD +-agarose affinity columns to purify GapC from lysate protoplasts of S. pyogenes strain 64/14 (Winram, SB and Lottenberg, R [1996] Microbiol. 142 : 2311 -2320).
Alternativamente, las proteínas se pueden producir de forma recombinante como se describe en este documento. Tal como se ha explicado anteriormente, estos productos recombinantes pueden adoptar la forma de secuencias parciales de proteínas, secuencias completas, formas precursoras que incluyen secuencias señal, formas maduras sin secuencias señal, o incluso proteínas de fusión (p. ej., con una secuencia líder apropiada para el huésped recombinante o con secuencias de subunidades antigénicas de Streptococcus o de otro patógeno).Alternatively, proteins can be produced recombinantly as described herein. As explained above, these recombinant products can take the form of partial protein sequences, complete sequences, precursor forms that include signal sequences, mature forms without signal sequences, or even fusion proteins (e.g., with a sequence appropriate leader for the recombinant host or with sequences of antigenic subunits of Streptococcus or another pathogen).
En una realización de la presente invención, las proteínas GapC se fusionan con una cola de histidina producida mediante métodos recombinantes y se purifican, entonces, de la fracción del lisado celular utilizando cromatografía de afinidad. Véase el Ejemplo 1A-E, infra.In one embodiment of the present invention, GapC proteins are fused with a histidine tail produced by recombinant methods and then purified from the cell lysate fraction using affinity chromatography. See Example 1A-E, infra .
Las proteínas GapC de unión a plasmina de la presente invención se pueden aislar, gracias a la capacidad del producto proteico de unirse a plasmina, mediante los ensayos de unión a plasmina descritos más adelante. Véase, p. ej., el método descrito en la sección F.3 del Ejemplo 1, infra. Así, se pueden construir genotecas y se pueden utilizar los clones resultantes para transformar a las células huésped apropiadas. Las colonias se pueden juntar y cribar para la búsqueda de clones que posean actividad de unión a plasmina. Las colonias también se pueden cribar utilizando sueros policlonales o anticuerpos monoclonales frente a la proteína de unión a plasmina.The plasmin-binding GapC proteins of the present invention can be isolated, thanks to the ability of the protein product to bind plasmin, by the plasmin binding assays described below. See, p. eg, the method described in section F.3 of Example 1, infra . Thus, libraries can be constructed and the resulting clones can be used to transform the appropriate host cells. Colonies can be pooled and screened for clones that possess plasmin binding activity. Colonies can also be screened using polyclonal sera or monoclonal antibodies against plasmin binding protein.
Alternativamente, una vez que se han determinado las secuencias de aminoácidos, se pueden utilizar sondas de oligonucleótidos que contienen los codones de una porción de la secuencia de aminoácidos determinada para cribar genotecas de cDNA o genotecas de DNA genómico y buscar los genes de las proteínas en cuestión. Las estrategias básicas para la preparación de sondas de oligonucleótidos y genotecas, así como para su cribado mediante hibridación de ácidos nucleicos, son técnicas que los expertos en la materia conocen bien. Véanse, p. ej., DNA Cloning: Vol. 11, supra; Nucleic Acid Hybridization, supra; Oligonucleotide Synthesis, supra; Sambrook et al., supra. Una vez que se ha identificado por hibridación positiva un clon de la biblioteca cribada, se puede confirmar que ese inserto en particular de la biblioteca contiene el gen de la proteína GapC de unión a plasmina o un homólogo del mismo mediante análisis con enzimas de restricción y secuenciación de DNA. Los genes pueden aislarse posteriormente utilizando técnicas estándar y, si se desea, técnicas de PCR o de enzimas de restricción utilizadas para eliminar porciones de la secuencia completa.Alternatively, once the amino acid sequences have been determined, oligonucleotide probes containing the codons of a portion of the determined amino acid sequence can be used to screen cDNA libraries or genomic DNA libraries and search for protein genes in question. The basic strategies for the preparation of oligonucleotide and library probes, as well as for their screening by nucleic acid hybridization, are techniques that are well known to those skilled in the art. See, p. eg, DNA Cloning : Vol. 11, supra; Nucleic Acid Hybridization, supra; Oligonucleotide Synthesis, supra ; Sambrook et al. supra Once a clone of the screened library has been identified by positive hybridization, it can be confirmed that that particular insert of the library contains the plasmin-binding GapC protein gene or a homologue thereof by restriction enzyme analysis and DNA sequencing The genes can be subsequently isolated using standard techniques and, if desired, PCR or restriction enzyme techniques used to remove portions of the entire sequence.
De forma similar, los genes se pueden aislar directamente de las bacterias utilizando técnicas conocidas, como la extracción con fenol, y posteriormente se puede manipular la secuencia para producir cualquier alteración deseada. Véase, p. ej., Sambrook et al., supra, para una descripción de las técnicas utilizadas en el aislamiento de DNA.Similarly, genes can be isolated directly from bacteria using known techniques, such as phenol extraction, and then the sequence can be manipulated to produce any desired alteration. See, p. eg, Sambrook et al. , supra , for a description of the techniques used in DNA isolation.
De forma alternativa, las secuencias de DNA que codifican las proteínas de interés se pueden preparar sintéticamente en vez de clonarlas. Las secuencias de DNA se pueden diseñar con los codones apropiados para cada secuencia de aminoácidos en particular. En general, se seleccionan los codones preferidos para las células huésped si la secuencia va a ser utilizada para su expresión. La secuencia completa se compone de oligonucleótidos solapados preparados mediante métodos estándar y combinados para formar una secuencia codificante completa. Véanse, p. ej., Edge (1981) Nature 292:756; Nambair et al. (1984) Science 223:1299; o Jay et al. (1984) J. Biol. Chem. 259:6311.Alternatively, the DNA sequences encoding the proteins of interest can be prepared synthetically instead of cloning them. DNA sequences can be designed with the appropriate codons for each particular amino acid sequence. In general, preferred codons for host cells are selected if the sequence is to be used for expression. The complete sequence is composed of overlapping oligonucleotides prepared by standard and combined methods to form a complete coding sequence. See, p. eg, Edge (1981) Nature 292 : 756; Nambair et al. (1984) Science 223 : 1299; or Jay et al. (1984) J. Biol. Chem. 259 : 6311.
Una vez que las secuencias codificantes para las proteínas deseadas se han preparado o aislado, pueden clonarse en cualquier vector o replicón apropiado. Los expertos en la materia conocen numerosos vectores de clonación y la selección de un vector de clonación apropiado es una cuestión de elección personal. Entre los ejemplos de vectores de DNA recombinante para la clonación, y de células huésped que estos pueden transformar, se encuentran los siguientes: bacteriófago \lambda (E. coli), pBR322 (E. coli), pACYC177 (E. coli), pKT23O (bacterias gramnegativas), pGV1106 (bacterias gramnegativas), pLAFR1 (bacterias gramnegativas), pME290 (bacterias gramnegativas que no son E. coli), phv14 (E. coli y Bacillus subtilis), pBD9 (Bacillus), pIJ61 (Streptomyces), pUC6 (Streptomyces), YIp5 (Saccharomyces), YCp19 (Saccharomyces) y virus del papiloma bovino (células de mamífero). Véanse, Sambrook et al., supra; DNA Cloning, supra; o B. Perbal, supra.Once the coding sequences for the desired proteins have been prepared or isolated, they can be cloned into any appropriate vector or replicon. Those skilled in the art know numerous cloning vectors and the selection of an appropriate cloning vector is a matter of personal choice. Examples of vectors for cloning recombinant DNA, and host cells they can transform, include the following: bacteriophage \ lambda (E. coli), pBR322 (E. coli), pACYC177 (E. coli), pKT23O (gram-negative bacteria), pGV1106 (gram-negative bacteria), pLAFR1 (gram-negative bacteria), pME290 (gram-negative bacteria that are not E. coli ), phv14 ( E. coli and Bacillus subtilis ), pBD9 ( Bacillus ), pIJ61 ( Streptomyces ), pUC6 ( Streptomyces ), YIp5 ( Saccharomyces ), YCp19 ( Saccharomyces ) and bovine papillomavirus (mammalian cells). See, Sambrook et al. , supra ; DNA Cloning, supra ; or B. Perbal, supra .
El gen se puede colocar bajo el control de un promotor, un lugar de unión a ribosomas (para la expresión en bacterias) y, opcionalmente, un operador (en este documento, todos en conjunto se refieren a elementos de "control"), de manera que la secuencia de DNA que codifica la proteína de interés se transcribe en un RNA en la célula huésped transformada por un vector que contiene esta construcción de expresión de proteínas. La secuencia codificante puede contener un péptido señal y una secuencia líder, o no contenerlos. Si se incluye una secuencia señal, esta puede ser la secuencia nativa homóloga o una secuencia heteróloga. Por ejemplo, la secuencia señal de la proteína GapC de unión a plasmina de S. dysgalactiae se puede utilizar para la secreción de la misma, así como un número de otras secuencias muy conocidas en el campo. El huésped puede eliminar las secuencias líder durante el procesamiento postraduccional. Véanse, p. ej., las Patentes estadounidenses núm. 4 431 739, 4 425 437 y 4 338 397.The gene can be placed under the control of a promoter, a ribosome binding site (for expression in bacteria) and, optionally, an operator (in this document, all together refer to "control" elements), of such that the DNA sequence encoding the protein of interest is transcribed into an RNA in the host cell transformed by a vector containing this protein expression construct. The coding sequence may contain a signal peptide and a leader sequence, or not contain them. If a signal sequence is included, this may be the homologous native sequence or a heterologous sequence. For example, the signal sequence of the plasmid-binding GapC protein of S. dysgalactiae can be used for secretion thereof, as well as a number of other sequences well known in the field. The host can eliminate the leader sequences during post-translational processing. See, p. eg, U.S. Patent Nos. 4 431 739, 4 425 437 and 4 338 397.
Otras secuencias reguladoras también pueden ser de interés cuando permiten la regulación de la expresión de la secuencia proteica en función del crecimiento de la célula huésped. Los expertos en la materia conocen bien esas secuencias reguladoras y entre los ejemplos de dichas secuencias se encuentran aquellas que activan o inhiben la expresión de un gen en respuesta a un estímulo químico o físico, incluyendo la presencia de un compuesto regulador. También pueden estar presentes en el vector otros tipos de elementos reguladores, por ejemplo, secuencias estimuladoras.Other regulatory sequences can also be of interest when they allow the regulation of the expression of the protein sequence as a function of host cell growth. Those skilled in the art know these regulatory sequences well. and among the examples of these sequences are those that activate or inhibit the expression of a gene in response to a stimulus chemical or physical, including the presence of a compound regulator. Other types may also be present in the vector. of regulatory elements, for example, sequences Stimulators
Las secuencias control y otras secuencias reguladoras pueden unirse a la secuencia codificante antes de su inserción en el vector, como los vectores de clonación descritos anteriormente. De forma alternativa, la secuencia codificante puede clonarse directamente en un vector de expresión que ya contenga las secuencias de control y un lugar de restricción apropiado.Control sequences and other sequences regulators can join the coding sequence before their insertion into the vector, as described cloning vectors previously. Alternatively, the coding sequence can clone directly into an expression vector that already contains the control sequences and an appropriate restriction site.
En algunos casos, puede ser necesario modificar la secuencia codificante de manera que se unan a las secuencias control con la orientación apropiada, es decir, para mantener la pauta de lectura apropiada. También sería deseable producir mutantes o análogos de la proteína GapC de unión a plasmina. Es posible preparar mutantes o análogos mediante la deleción de una porción de la secuencia que codifica la proteína, mediante la inserción de una secuencia o mediante la sustitución de uno o más nucleótidos dentro de la misma secuencia. Las técnicas de modificación de secuencias nucleotídicas, como la mutagénesis dirigida, están descritas, por ejemplo, en Sambrook et al., supra; DNA Cloning, supra; Nucleic Acid Hybridization, supra.In some cases, it may be necessary to modify the coding sequence so that they bind to the control sequences with the appropriate orientation, that is, to maintain the appropriate reading pattern. It would also be desirable to produce mutants or analogs of the plasmin-binding GapC protein. It is possible to prepare mutants or analogs by deleting a portion of the sequence encoding the protein, by inserting a sequence or by replacing one or more nucleotides within the same sequence. Nucleotide sequence modification techniques, such as directed mutagenesis, are described, for example, in Sambrook et al. , supra ; DNA Cloning, supra ; Nucleic Acid Hybridization , supra .
A continuación se utiliza el vector de expresión
para transformar una célula huésped apropiada. En el campo se
conocen una serie de líneas celulares de mamífero que incluyen
líneas celulares inmortalizadas disponibles en la Colección
Americana de Cultivos Tipo (ATCC), algunas de las cuales son, entre
otras, células de ovario de hámster chino (CHO), células HeLa,
células renales de crías de hámster (BHK), células renales de mono
(COS), células de carcinoma hepatocelular humano (p. ej. Hep G2),
células de riñón bovino Madin-Darby ("MDBK") y
similares. De forma similar, las células bacterianas huésped como
E. coli, Bacillus subtilis y Streptococcus
spp., también se podrán utilizar con los presentes constructos
de expresión. Las levaduras huésped de utilidad en la presente
invención incluyen, entre otros, Saccharomyces cerevisiae,
Candida albicans, Candida maltosa, Hansenula polymorpha,
Kluyveromyces fragilis, Kluyveromyces lactis, Pichia guillerimondii,
Pichia pastoris, Schizosaccharomyces pombe y Yarrowia
lipolytica. Las células de insecto que se pueden utilizar con
los vectores de expresión de baculovirus incluyen, entre otros,
Aedes aegypti, Autographa californica, Bombyx mori, Drosophila
melanogaster, Spodoptera frugiperda y
Trichoplusia
ni.The expression vector is then used to transform an appropriate host cell. A number of mammalian cell lines that include immortalized cell lines available in the American Type Culture Collection (ATCC) are known in the field, some of which are, among others, Chinese hamster ovary (CHO) cells, HeLa cells , hamster calf kidney cells (BHK), monkey kidney cells (COS), human hepatocellular carcinoma cells (eg Hep G2), Madin-Darby bovine kidney cells ("MDBK") and the like. Similarly, host bacterial cells such as E. coli , Bacillus subtilis and Streptococcus spp. , may also be used with the present expression constructs. Host yeasts useful in the present invention include, among others, Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida maltose, Hansenula polymorpha, Kluyveromyces fragilis, Kluyveromyces lactis, Pichia guillerimondii, Pichia pastoris, Schizosaccharomyces pombe and Yarrowia lipolytica . Insect cells that can be used with baculovirus expression vectors include, among others, Aedes aegypti, Autographa californica, Bombyx mori, Drosophila melanogaster, Spodoptera frugiperda and
Trichoplusia ni .
En función del sistema de expresión y del huésped escogidos, las proteínas de la presente invención se producen mediante el cultivo de células huésped transformadas por un vector de expresión descrito anteriormente bajo las condiciones en que se expresa la proteína de interés. A continuación, se aísla la proteína de las células huésped y se purifica. Si el sistema de expresión secreta la proteína en el medio de cultivo, la proteína puede purificarse directamente del medio. Si la proteína no es secretada, se aísla de los lisados celulares. La selección de las condiciones de cultivo y los métodos de recuperación apropiados se encuentran dentro de las técnicas del ámbito.Depending on the expression system and the chosen host, the proteins of the present invention are produced by culturing host cells transformed by an expression vector described above under the conditions in which the protein of interest is expressed. Then it is isolated the protein of the host cells and is purified. If the system secret expression of the protein in the culture medium, the protein It can be purified directly from the medium. If the protein is not secreted, it is isolated from cell lysates. The selection of culture conditions and appropriate recovery methods are found within the field techniques.
Las proteínas de la presente invención también pueden producirse mediante síntesis química, como la síntesis peptídica en fase sólida, utilizando secuencias aminoacídicas conocidas o secuencias aminoacídicas derivadas de la secuencia de DNA de los genes de interés. Estos métodos son conocidos por los expertos en la materia. Véanse, p. ej., J. M. Stewart y J. D. Young, Solid Phase Peptide Synthesis, 2ª Ed., Pierce Chemical Co., Rockford, IL (1984) y G. Barany y R. B. Merrifield, The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, editores E. Gross and J. Meienhofer, Vol. 2, Academic Press, New York, (1980), pp. 3-254, para las técnicas de síntesis peptídica en fase sólida; y M. Bodansky, Principles of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Berlín (1984) y E. Gross y J. Meienhofer, Eds., The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, supra, Vol. 1, para síntesis clásica en solución. La síntesis química de péptidos quizás sea preferible en el caso de que un fragmento pequeño del antígeno en cuestión tenga la capacidad de provocar una respuesta inmunitaria en el sujeto de interés.The proteins of the present invention can also be produced by chemical synthesis, such as solid phase peptide synthesis, using known amino acid sequences or amino acid sequences derived from the DNA sequence of the genes of interest. These methods are known to those skilled in the art. See, p. eg, JM Stewart and JD Young, Solid Phase Peptide Synthesis , 2nd Ed., Pierce Chemical Co., Rockford, IL (1984) and G. Barany and RB Merrifield, The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology , editors E. Gross and J. Meienhofer, Vol. 2, Academic Press, New York, (1980), pp. 3-254, for solid phase peptide synthesis techniques; and M. Bodansky, Principles of Peptide Synthesis , Springer-Verlag, Berlin (1984) and E. Gross and J. Meienhofer, Eds., The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, supra , Vol. 1, for classical synthesis in solution . The chemical synthesis of peptides may be preferable if a small fragment of the antigen in question has the ability to elicit an immune response in the subject of interest.
Las proteínas GapC de unión a plasmina de la presente invención, o sus fragmentos, pueden utilizarse para producir anticuerpos, tanto policlonales como monoclonales. Si se escogen los policlonales, se inmuniza un mamífero seleccionado (p. ej. un ratón, conejo, cabra, caballo, etc.) con un antígeno de la presente invención, un fragmento del mismo o un antígeno mutado. Se recoge suero del animal inmunizado y se trata de acuerdo con los procedimientos conocidos. Véase, p. ej. Jurgens et al. (1985) J. Chrom. 384:363-370. En caso de utilizar suero que contiene anticuerpos policlonales, los anticuerpos policlonales pueden purificarse mediante cromatografía de inmunoafinidad utilizando procedimientos estándar.The plasmin-binding GapC proteins of the present invention, or their fragments, can be used to produce antibodies, both polyclonal and monoclonal. If polyclonal ones are chosen, a selected mammal (eg, a mouse, rabbit, goat, horse, etc.) is immunized with an antigen of the present invention, a fragment thereof or a mutated antigen. Serum is collected from the immunized animal and treated according to known procedures. See, p. ex. Jurgens et al. (1985) J. Chrom. 384 : 363-370. If serum containing polyclonal antibodies is used, polyclonal antibodies can be purified by immunoaffinity chromatography using standard procedures.
Un experto en la materia también puede producir fácilmente anticuerpos monoclonales frente a las proteínas GapC de unión a plasmina y a los fragmentos de estas. La metodología general de producción de anticuerpos monoclonales mediante la tecnología del hibridoma es ampliamente conocida. Se puede crear líneas celulares inmortales productoras de anticuerpos mediante fusión celular, y también mediante otras técnicas como la transformación directa de linfocitos B con DNA oncogénico o la transfección con virus de Epstein-Barr. Véanse, p. ej., M. Schreier et al., Hybridoma Techniques (1980); Hammerling et al., Monoclonal Antibodies and T-cell Hybridomas (1981); Kennett et al., Monoclonal Antibodies (1980); véanse también las Patentes Estadounidenses núm. 4 341 761; 4 399 121; 4 427 783; 4 444 887; 4 452 570; 4 466 917; 4 472 500, 4 491 632; y 4 493 890. Se pueden analizar perfiles de anticuerpos monoclonales producidos frente a las proteínas GapC de unión a plasmina, o fragmentos de los mismos, en busca de diversas propiedades; es decir, de isotipo, epítopo, afinidad, etc. Los anticuerpos monoclonales sirven para la purificación, mediante técnicas de inmunoafinidad, de los antígenos individuales frente a los que están dirigidos. Tanto los anticuerpos policlonales como los monoclonales también pueden utilizarse para la inmunización pasiva o pueden combinarse con preparaciones con subunidades de vacuna para potenciar la respuesta inmunitaria. Los anticuerpos policonales y los monoclonales también sirven para fines diagnósticos.One skilled in the art can also easily produce monoclonal antibodies against GapC plasmin-binding proteins and fragments thereof. The general methodology for producing monoclonal antibodies using hybridoma technology is widely known. Immortal antibody-producing cell lines can be created by cell fusion, and also by other techniques such as direct transformation of B lymphocytes with oncogenic DNA or transfection with Epstein-Barr virus. See, p. eg, M. Schreier et al. , Hybridoma Techniques (1980); Hammerling et al. , Monoclonal Antibodies and T-cell Hybridomas (1981); Kennett et al. , Monoclonal Antibodies (1980); see also US Patents no. 4,341,761; 4 399 121; 4 427 783; 4,444,887; 4 452 570; 4 466 917; 4 472 500, 4 491 632; and 4,493,890. Monoclonal antibody profiles produced against the plasmin-binding GapC proteins, or fragments thereof, can be analyzed for various properties; that is, isotype, epitope, affinity, etc. Monoclonal antibodies serve for the purification, by immunoaffinity techniques, of the individual antigens against which they are directed. Both polyclonal and monoclonal antibodies can also be used for passive immunization or can be combined with preparations with vaccine subunits to enhance the immune response. Polyclonal and monoclonal antibodies also serve diagnostic purposes.
Las proteínas GapC de unión a plasmina de la presente invención se pueden formular en forma de composiciones de vacunas, individualmente o en combinación con otros antígenos, para su uso en la inmunización de sujetos que se describe más adelante. En Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Easton, Pennsylvania, 18ª Edición, 1990, por ejemplo, se describen métodos de preparación de formulaciones de este tipo. Normalmente las vacunas de la presente invención se preparan en forma inyectable, como soluciones o suspensiones líquidas. También se pueden preparar formas sólidas adecuadas para la solución o la suspensión en vehículos líquidos previamente a la inyección. También puede emulsionarse la preparación o encapsularse el ingrediente activo en vehículos liposómicos. El ingrediente inmunogénico activo generalmente se mezcla con un vehículo farmacéutico compatible, como por ejemplo agua, solución salina, dextrosa, glicerol, etanol o similares, o con combinaciones de los mismos. Además, si se desea el vehículo puede contener cantidades menores de sustancias adyuvantes como agentes humectantes o emulsionantes y agentes tamponadores del pH.The plasmin-binding GapC proteins of the present invention can be formulated in the form of vaccine compositions, individually or in combination with other antigens, for use in the immunization of subjects described below. Remington's Pharmaceutical Sciences , Mack Publishing Company, Easton, Pennsylvania, 18th Edition, 1990, for example, describes methods for preparing formulations of this type. Normally the vaccines of the present invention are prepared in injectable form, as liquid solutions or suspensions. Solid forms suitable for solution or suspension in liquid vehicles prior to injection can also be prepared. The preparation can also be emulsified or the active ingredient encapsulated in liposomal vehicles. The active immunogenic ingredient is generally mixed with a compatible pharmaceutical carrier, such as water, saline, dextrose, glycerol, ethanol or the like, or with combinations thereof. In addition, if desired, the vehicle may contain smaller amounts of adjuvant substances such as wetting or emulsifying agents and pH buffering agents.
Los adyuvantes que potencian la efectividad de la vacuna también pueden añadirse a la formulación. Estos pueden ser, por ejemplo: muramil dipéptidos, avridina, hidróxido de aluminio, bromuro de dimetildioctadecil amonio (DDA), aceites, emulsiones de aceite en agua, saponinas, citocinas u otras sustancias conocidas en el ámbito.The adjuvants that enhance the effectiveness of The vaccine can also be added to the formulation. These can be, for example: muramyl dipeptides, avridine, hydroxide aluminum, dimethyldioctadecyl ammonium bromide (DDA), oils, oil emulsions in water, saponins, cytokines or others substances known in the field.
La proteína de unión a plasmina puede estar unida a un transportador con el fin de aumentar la inmunogenicidad de la misma. Son transportadores adecuados las moléculas grandes de metabolización lenta como las proteínas. Estos incluyen: albúminas séricas, hemocianina de lapa californiana, moléculas de inmunoglobulina, tiroglobulina, ovoalbúmina y otras proteínas bien conocidas por los expertos en la materia; polisacáridos como la sefarosa, agarosa, celulosa, microesferas de celulosa y similares; aminoácidos poliméricos como el ácido glutámico, la polilisina y similares; copolímeros de aminoácidos; y partículas víricas inactivas.The plasmin binding protein may be attached to a transporter in order to increase immunogenicity Of the same. Suitable transporters are large molecules of Slow metabolism like proteins. These include: albumins serum, California limpet hemocyanin, molecules of immunoglobulin, thyroglobulin, ovalbumin and other proteins well known to those skilled in the art; polysaccharides like the sepharose, agarose, cellulose, cellulose microspheres and the like; polymeric amino acids such as glutamic acid, polylysine and Similar; amino acid copolymers; and viral particles inactive
Las proteínas GapC de unión a plasmina pueden utilizarse en su forma nativa o bien puede modificarse el contenido de su grupo funcional mediante, por ejemplo, succinilación de residuos de resina o mediante la reacción con Cys-tiolactona. También es posible incorporar en el transportador (o el antígeno) un grupo sulfhidrilo mediante, por ejemplo, la reacción de las funciones amino con 2-iminotiolano o el N-hidroxisuccinimida éster del propionato de 3-(4-ditiopiridil propionato. También se pueden modificar los transportadores adecuados para incorporar ramas espaciadoras (como diamina de hexametileno u otras moléculas bifuncionales de tamaño similar) que permitan la unión de los péptidos.GapC plasmin binding proteins can be used in its native form or the content can be modified of its functional group by, for example, succinylation of resin residues or by reaction with Cys-thiolactone. It is also possible to incorporate in the transporter (or antigen) a sulfhydryl group by, by example, the reaction of amino functions with 2-iminothiolane or the N-hydroxysuccinimide ester of propionate 3- (4-Dithiopyridyl propionate. You can also modify the appropriate conveyors to incorporate branches spacers (such as hexamethylene diamine or other molecules bifunctional of similar size) that allow the union of the peptides
Otros transportadores adecuados para las proteínas GapC de unión a plasmina de la presente invención incluyen polipéptidos VP6 de los rotavirus, o fragmentos funcionales de los mismos, que están descritos en la Patente Estadounidense núm. 5 071 651. También es posible emplear un producto de fusión de una proteína vírica y los inmunógenos del sujeto, llevada a cabo mediante métodos que están descritos en la Patente Estadounidense núm. 4 722 840. Aún otros transportadores incluyen células como los linfocitos, ya que esta forma de presentación imita el modo natural de presentación en el sujeto, lo cual genera el estado inmunizado. Alternativamente, las proteínas de la presente invención pueden estar acopladas a eritrocitos, preferiblemente los eritrocitos propios del sujeto. Los expertos en la materia conocen los métodos de acoplamiento de péptidos a proteínas o células.Other conveyors suitable for GapC plasmin binding proteins of the present invention include VP6 polypeptides of rotavirus, or functional fragments of same, which are described in US Patent No. 5,071 651. It is also possible to use a fusion product of a viral protein and the subject's immunogens, carried out by methods that are described in US Pat. no. 4 722 840. Still other carriers include cells such as lymphocytes, since this form of presentation mimics the natural way of presentation in the subject, which generates the immunized state. Alternatively, the proteins of the present invention can be coupled to erythrocytes, preferably erythrocytes subject's own. Those skilled in the art know the methods of coupling peptides to proteins or cells.
Además, las proteínas GapC de unión a plasmina (o complejos de las mismas) se pueden formular en composiciones de vacunas en su forma natural o bien en forma de sal. Las sales farmacéuticamente aceptables incluyen las sales de adición ácida (formadas con los grupos amino libres de los polipéptidos activos) que están formadas con ácidos inorgánicos como, por ejemplo, ácidos clorhídrico o fosfórico, o ácidos orgánicos como el acético, oxálico, tartárico, mandélico y similares. Las sales formadas a partir de grupos carboxilo libres también pueden proceder de bases inorgánicas como, por ejemplo, hidróxidos sódico, potásico, amónico, cálcico o férrico, y bases orgánicas como isopropilamina, trimetilamina, 2-etilaminoetanol, histidina, procaína y similares.In addition, plasmin binding GapC proteins (or complexes thereof) can be formulated in compositions of vaccines in their natural form or in the form of salt. Salts Pharmaceutically acceptable include acid addition salts (formed with the free amino groups of the active polypeptides) which are formed with inorganic acids such as acids hydrochloric or phosphoric, or organic acids such as acetic acid, oxalic, tartaric, mandelic and the like. The salts formed to from free carboxyl groups they can also come from bases inorganic, such as sodium, potassium, ammonium hydroxides, calcium or ferric, and organic bases such as isopropylamine, trimethylamine, 2-ethylaminoethanol, histidine, Procaine and the like.
Las formulaciones para vacunas deben contener una "cantidad terapéuticamente efectiva" del ingrediente activo, que es una cantidad suficiente para proporcionar una respuesta inmunitaria en el sujeto al que se administra la composición. En el tratamiento y la prevención de la mastitis, por ejemplo, una "cantidad terapéuticamente efectiva" sería preferiblemente una cantidad que mejore la resistencia de la glándula mamaria a una nueva infección o que reduzca la gravedad clínica de la enfermedad. Esta protección quedará demostrada por una reducción o falta de los síntomas mostrados normalmente por un huésped infectado, por un menor tiempo de recuperación o por un menor recuento de células somáticas en la leche del cuarto infectado. A modo de ejemplo, la capacidad de la composición para mantener el recuento de células somáticas (RCS) en la leche en unas 500.000 células por ml o llevarlo hasta esa cifra, el valor umbral determinado por la Federación Internacional de Lechería por encima del cual se considera que los animales padecen mastitis clínica, debe ser indicativo de un efecto terapéutico.Vaccine formulations must contain a "therapeutically effective amount" of the ingredient asset, which is an amount sufficient to provide a immune response in the subject to whom the composition. In the treatment and prevention of mastitis, by example, a "therapeutically effective amount" would be preferably an amount that improves the strength of the mammary gland to a new infection or to reduce the severity disease clinic. This protection will be demonstrated by a reduction or lack of symptoms normally shown by a infected host, for a shorter recovery time or for a lower somatic cell count in fourth milk infected. As an example, the ability of the composition to keep somatic cell count (RCS) in milk in a 500,000 cells per ml or take it to that figure, the threshold value determined by the International Dairy Federation above which animals are considered to have clinical mastitis, It should be indicative of a therapeutic effect.
La cantidad exacta puede determinarla un experto en la materia utilizando pruebas estándar. La concentración de proteína GapC de unión a plasmina suele oscilar entre un 1 y un 95% (p/p) de la composición, o incluso valores mayores o menores en los casos que se estime necesario. Con las presentes formulaciones para vacunas, de 5 a 500 \mug de ingrediente activo por ml de solución infectada deben ser suficientes para generar una respuesta inmunitaria cuando se ha administrado una dosis de 1 a 3 ml por animal.The exact amount can be determined by an expert in the matter using standard tests. The concentration of GapC plasmin binding protein usually ranges from 1 to 95% (p / p) of the composition, or even higher or lower values in the cases deemed necessary. With the present formulations for vaccines, 5 to 500 µg of active ingredient per ml of solution infected should be sufficient to generate a response immune when a dose of 1 to 3 ml has been administered per animal.
Para inmunizar a un sujeto, la vacuna se administra generalmente por vía parenteral, normalmente mediante inyección intramuscular. Sin embargo, otros modos de administración, como la inyección subcutánea, intraperitoneal e intramuscular, también son aceptables. La cantidad a administrar depende del animal a tratar, de la capacidad del sistema inmunitario del animal para sintetizar anticuerpos y del grado de protección deseado. Las dosis efectivas puede establecerlas cualquier experto en la materia mediante ensayos rutinarios estableciendo curvas de respuesta a la dosis. La inmunización del sujeto se realiza administrando la vacuna en una dosis al menos, y preferiblemente en dos. Además, al animal se le pueden administrar tantas dosis como sea necesario para mantener un estado de inmunidad frente a la infección.To immunize a subject, the vaccine is generally administered parenterally, usually by intramuscular injection. However, other modes of administration, such as subcutaneous, intraperitoneal and intramuscular injection, They are also acceptable. The amount to be administered depends on the animal to deal with, the ability of the animal's immune system to synthesize antibodies and the degree of protection desired. The dose effective can be established by any expert in the field through routine tests establishing response curves to the dose. Immunization of the subject is performed by administering the vaccine. in one dose at least, and preferably in two. In addition, to the animal You may be given as many doses as necessary to maintain a state of immunity against infection.
Otras formulaciones adicionales adecuadas para otros modos de administración incluyen supositorios y, en algunos casos, aerosoles, formulaciones de administración intranasal u oral, y formulaciones de liberación controlada. En el caso de los supositorios, la composición del vehículo incluirá aglutinantes tradicionales y transportadores, como glicoles polialcalinos o triglicéridos. Estos supositorios se pueden formar a partir de mezclas que contengan el ingrediente activo en un margen aproximado de entre un 0,5 y un 10% (p/p) o, preferiblemente, entre un 1 y un 2%. Los vehículos orales incluyen excipientes utilizados habitualmente como son, por ejemplo, cantidades farmacéuticamente deseables de: manitol, lactosa, almidón, estearato de magnesio, celulosa, sacarina sódica, carbonato de magnesio y similares. Estas composiciones orales para vacunas se pueden administrar en forma de soluciones, suspensiones, comprimidos, píldoras, cápsulas, formulaciones de liberación controlada o polvos, y pueden contener entre un 10 y un 95% del ingrediente activo, preferiblemente entre un 25 y un 70%.Other additional formulations suitable for other modes of administration include suppositories and, in some cases, aerosols, intranasal or oral administration formulations, and controlled release formulations. In the case of suppositories, the composition of the vehicle will include binders traditional and transporters, such as polyalkaline glycols or triglycerides These suppositories can be formed from mixtures containing the active ingredient in an approximate range between 0.5 and 10% (w / w) or, preferably, between 1 and 1 2%. Oral vehicles include excipients used usually as are, for example, pharmaceutically amounts Desirable of: mannitol, lactose, starch, magnesium stearate, cellulose, sodium saccharin, magnesium carbonate and the like. These oral vaccine compositions can be administered in the form of solutions, suspensions, tablets, pills, capsules, controlled release formulations or powders, and may contain between 10 and 95% of the active ingredient, preferably between 25 and 70%.
Las formulaciones intranasales han de incluir normalmente vehículos que no causen irritación en la mucosa nasal y que no alteren de forma significativa la función ciliar. Con la presente invención es posible utilizar diluyentes como agua, solución salina acuosa u otras sustancias conocidas. Las formulaciones nasales también pueden contener conservantes como, por ejemplo, clorobutanol y cloruro de benzalconio. Se puede añadir un tensioactivo para mejorar la absorción de las proteínas en cuestión por la mucosa nasal.Intranasal formulations must include normally vehicles that do not cause irritation in the nasal mucosa and that do not significantly alter the ciliary function. With the present invention it is possible to use diluents such as water, aqueous saline solution or other known substances. The Nasal formulations may also contain preservatives such as, for example, chlorobutanol and benzalkonium chloride. Can it be added a surfactant to improve the absorption of proteins in issue for the nasal mucosa.
Las formulaciones de liberación controlada o sostenida se producen incorporando la proteína a transportadores o vehículos como los siguientes: liposomas, polímeros no reabsorbibles impermeables como copolímeros de acetato de etilenovinilo y copolímeros de Hytrel®, polímeros hinchables como los hidrogeles, o polímeros reabsorbibles como el colágeno y ciertos poliácidos o poliésteres como los utilizados para realizar suturas reabsorbibles. Las proteínas GapC de unión a plasmina también se pueden administrar mediante minibombas implantadas, ampliamente conocidas en el campo.The controlled release formulations or Sustained are produced by incorporating protein into transporters or vehicles such as the following: liposomes, non-absorbable polymers waterproof as copolymers of ethylene vinyl acetate and Hytrel® copolymers, swellable polymers such as hydrogels, or resorbable polymers such as collagen and certain polyacids or polyesters such as those used to make absorbable sutures. GapC plasmin binding proteins can also be administer by widely used implanted mini pumps in the countryside.
Las proteínas GapC de unión a plasmina de la invención que nos ocupa también pueden administrase a través de un virus transportador que exprese estas proteínas. Los virus transportadores que son de utilidad en la presente invención incluyen, entre otros, virus vaccinia y otros virus de la viruela, adenovirus y virus del herpes. A modo de ejemplo, se pueden construir recombinantes del virus vaccinia que expresen las nuevas proteínas de la siguiente manera. El DNA que codifica la proteína en particular se inserta, en primer lugar, de forma que esté adyacente a un promotor vaccinia y a secuencias de DNA de vaccinia flanqueantes, como la secuencia que codifica la timidina quinasa (TK). Este vector se utiliza a continuación para transfectar células que son infectadas de forma simultánea con vaccinia. La recombinación homóloga sirve para inserir el promotor de vaccinia más el gen que codifica la proteína en cuestión dentro del genoma vírico. El recombinante de TK resultante puede seleccionarse mediante el cultivo de las células en presencia de 5-bromodesoxiuridina y la selección de las calvas víricas resistentes a la misma.The plasmin-binding GapC proteins of the invention that concerns us can also be administered through a transporter virus that expresses these proteins. The virus conveyors that are useful in the present invention they include, among others, vaccinia virus and other smallpox viruses, adenovirus and herpes virus. As an example, you can build recombinant vaccinia virus that express the new proteins as follows. The DNA that encodes the protein in particular it is inserted first so that it is adjacent to a vaccinia promoter and vaccinia DNA sequences flanking agents, such as the sequence encoding thymidine kinase (TK) This vector is then used to transfect cells. which are infected simultaneously with vaccinia. The homologous recombination serves to insert the vaccinia promoter plus the gene that encodes the protein in question within the genome viral. The resulting TK recombinant can be selected by culturing the cells in the presence of 5-Bromodeoxyuridine and bald selection viral resistant to it.
Una vía de administración alternativa implica la terapia génica o la inmunización genética. Por lo tanto, las secuencias nucleotídicas (y los elementos reguladores que las acompañan) que codifiquen las proteínas GapC de unión a plasmina de interés pueden administrarse directamente a un sujeto para la traducción in vivo de las mismas. Contrariamente, la transferencia génica puede realizarse transfectando las células o los tejidos del sujeto ex vivo y reintroduciendo el material transformado dentro del huésped. El DNA puede introducirse directamente en el microorganismo huésped, es decir, mediante inyección (véanse la Publicación Internacional núm. WO/90/11092; y Wolff et al. [1990] Science 247:1465-1468). La transferencia génica mediada por liposomas también puede conseguirse utilizando métodos conocidos. Véanse, por ejemplo, Hazinski et al. (1991) Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 4:206-209; Brigham et al. (1989) Am. J. Med. Sci. 298:278-281; Canonico et al. (1991) Clin. Res. 39:219A; y Nabel et al. (1990) Science 249:1285-1288. Agentes dirigidos, como anticuerpos dirigidos hacia antígenos de superficie expresados en tipos celulares específicos, pueden conjugarse de forma covalente a la superficie liposómica de modo que el ácido nucleico puede liberarse en tejidos y células específicos vulnerables a la infección.An alternative route of administration involves gene therapy or genetic immunization. Therefore, the nucleotide sequences (and the accompanying regulatory elements) encoding the plasmid-binding GapC proteins of interest can be directly administered to a subject for in vivo translation thereof. In contrast, gene transfer can be performed by transfecting the cells or tissues of the ex vivo subject and reintroducing the transformed material into the host. DNA can be introduced directly into the host microorganism, that is, by injection (see International Publication No. WO / 90/11092; and Wolff et al. [1990] Science 247 : 1465-1468). Liposome-mediated gene transfer can also be achieved using known methods. See, for example, Hazinski et al. (1991) Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 4 : 206-209; Brigham et al. (1989) Am. J. Med. Sci. 298 : 278-281; Canonico et al. (1991) Clin. Res. 39 : 219A; and Nabel et al. (1990) Science 249 : 1285-1288. Targeted agents, such as antibodies directed to surface antigens expressed in specific cell types, can be covalently conjugated to the liposomal surface so that the nucleic acid can be released into specific tissues and cells vulnerable to infection.
Tal como se ha explicado anteriormente, las proteínas GapC de unión a plasmina de la presente invención también pueden utilizarse como medio diagnóstico para detectar la presencia de anticuerpos reactivos a estreptococos, por ejemplo a S. dysgalactiae, en una muestra biológica con la finalidad de determinar la existencia de infección por estreptococos. Por ejemplo, la presencia de anticuerpos reactivos a las proteínas GapC de unión a plasmina puede detectarse mediante técnicas de electroforesis y de inmunodiagnóstico estándar, incluyendo inmunoensayos como los ensayos de tipo competitivo, de reacción directa o de tipo sándwich. Estos ensayos incluyen, entre otros: transferencias Western (Western blots), ensayos de aglutinación, inmunoensayos de marcaje con enzimas o mediados por enzimas (como el ELISA), ensayos de tipo biotina/avidina, radioinmunoensayos, inmunoelectroforesis, inmunoprecipitación, etc. Las reacciones incluyen generalmente la manifestación de marcajes de tipo fluorescente, quimioluminiscente, radiactivo o enzimático, o moléculas de tinción, o bien otros métodos para detectar la formación de un complejo entre el antígeno y el anticuerpo o anticuerpos con los que reacciona.As explained above, the plasmin-binding GapC proteins of the present invention can also be used as a diagnostic means to detect the presence of streptococcal reactive antibodies, for example to S. dysgalactiae , in a biological sample for the purpose of determining the existence of streptococcal infection. For example, the presence of antibodies reactive to plasmid-binding GapC proteins can be detected by standard electrophoresis and immunodiagnostic techniques, including immunoassays such as competitive-type, direct-reaction or sandwich-type assays. These tests include, among others: Western blots, agglutination assays, enzyme-labeled or enzyme-mediated immunoassays (such as ELISA), biotin / avidin-type assays, radioimmunoassays, immunoelectrophoresis, immunoprecipitation, etc. The reactions generally include the manifestation of fluorescent, chemiluminescent, radioactive or enzymatic labels, or staining molecules, or other methods to detect the formation of a complex between the antigen and the antibody or antibodies with which it reacts.
Estos ensayos mencionados generalmente implican la separación del anticuerpo no unido en una fase líquida a partir de un soporte en fase sólida al que están unidos los complejos antígeno-anticuerpo. Los soportes sólidos que se pueden utilizar en la práctica de la invención incluyen sustratos como la nitrocelulosa (p. ej. en forma de membrana o pocillo de microtitulación), el cloruro de polivinilo (p. ej. láminas o pocillos de microtitulación), látex de poliestireno (p. ej. microesferas o placas de microtitulación), fluoruro de polivinilidina, papel diazotizado, membranas de nylon, microesferas activadas, microesferas de atracción magnética y similares.These mentioned tests generally involve the separation of the unbound antibody in a liquid phase from a solid phase support to which the antigen-antibody complexes are attached. Solid supports that can be used in the practice of the invention include substrates such as nitrocellulose (eg in the form of a membrane or microtiter well), polyvinyl chloride (eg sheets or microtiter wells), latex of polystyrene (eg microspheres or microtiter plates), polyvinylidine fluoride, diazotized paper, nylon membranes, activated microspheres, magnetic attraction microspheres and the like.
De forma característica, se hace reaccionar en primer lugar un soporte sólido con un componente en fase sólida (p. ej. una o más proteína GapC de unión a plasmina) bajo condiciones de unión adecuadas de forma que el componente esté suficientemente fijo al soporte. En ocasiones se puede potenciar la fijación del antígeno al soporte acoplando primero el antígeno a una proteína con mejores propiedades de unión. Algunas de las proteínas de acoplamiento adecuadas son macromoléculas del tipo: albúminas séricas como la albúmina sérica bovina (BSA), hemocianina de lapa californiana, moléculas de inmunoglobulina, tiroglobulina, ovoalbúmina y otras proteínas muy conocidas por los expertos en el campo. Otras moléculas que se pueden utilizar para unir los antígenos al soporte incluyen polisacáridos, ácidos polilácticos, ácidos poliglicólicos, aminoácidos poliméricos, copolímeros aminoacídicos y similares. Estas moléculas y métodos de acoplamiento de estas moléculas a los antígenos son bien conocidos por cualquier experto en el ámbito. Véanse, p. ej., Brinkley, M.A. Bioconjugate Chem. (1992) 3:2-13; Hashida et al., J. Appl. Biochem. (1984) 6:56-63; y Anjaneyulu and Staros, International J. of Peptide and Protein Res. (1987) 30: 117-124.Typically, a solid support is first reacted with a solid phase component (eg one or more plasmin-binding GapC protein) under suitable binding conditions so that the component is sufficiently fixed to the support. Sometimes the binding of the antigen to the support can be enhanced by first coupling the antigen to a protein with better binding properties. Some of the suitable coupling proteins are macromolecules of the type: serum albumin such as bovine serum albumin (BSA), Californian lapa hemocyanin, immunoglobulin molecules, thyroglobulin, ovalbumin, and other proteins well known to those skilled in the field. Other molecules that can be used to bind the antigens to the support include polysaccharides, polylactic acids, polyglycolic acids, polymeric amino acids, amino acid copolymers and the like. These molecules and methods of coupling these molecules to the antigens are well known to any expert in the field. See, p. eg, Brinkley, MA Bioconjugate Chem. (1992) 3 : 2-13; Hashida et al. , J. Appl. Biochem (1984) 6 : 56-63; and Anjaneyulu and Staros, International J. of Peptide and Protein Res. (1987) 30 : 117-124.
Una vez se ha hecho reaccionar el soporte sólido con el componente en fase sólida, se elimina mediante lavado cualquier componente en fase sólida no inmovilizado en el soporte, y a continuación el componente unido al soporte se pone en contacto con una muestra biológica de la que se sospecha contiene fracciones del ligando (p. ej. anticuerpos frente a los antígenos inmovilizados) bajo condiciones de unión adecuadas. Después del lavado para eliminar cualquier ligando no unido, se añade una fracción de unión secundaria bajo las condiciones adecuadas de unión, de modo que el enlazante secundario es capaz de asociarse de forma selectiva con el ligando unido. La presencia del enlazante secundario puede detectarse entonces utilizando las técnicas ampliamente conocidas en el campo.Once the solid support has been reacted with the solid phase component, it is removed by washing any solid phase component not immobilized on the support, and the component attached to the support is then contacted with a biological sample suspected of containing fractions of the ligand (eg antibodies against antigens immobilized) under suitable binding conditions. After the wash to remove any unbound ligand, a secondary binding fraction under the appropriate conditions of binding, so that the secondary binder is able to associate with Selectively with bound ligand. The presence of the linker secondary can then be detected using the techniques widely known in the field.
De forma más concreta, se puede utilizar un método ELISA en el que los pocillos de una placa de microtitulación se recubren con una proteína GapC de unión a plasmina. A continuación se añade a los pocillos recubiertos una muestra biológica que contiene, o de la que se sospecha que contiene, moléculas de inmunoglobulina anti-proteína GapC de unión a plasmina. Transcurrido un periodo de incubación suficiente para permitir la unión del anticuerpo al antígeno inmovilizado, la placa o placas pueden lavarse para eliminar las fracciones no unidas y se puede añadir una molécula de unión secundaria marcada de forma detectable. Se permite a la molécula de unión secundaria reaccionar con cualquier anticuerpo capturado de las muestras, se lava la placa y se detecta la presencia de la molécula de unión secundaria mediante métodos de sobra conocidos en el campo.More specifically, you can use a ELISA method in which the wells of a microtiter plate they are coated with a plasmin-binding GapC protein. TO a sample is then added to the coated wells biological that it contains, or suspected of containing, GapC anti-protein immunoglobulin molecules of plasmin binding. After a sufficient incubation period to allow the binding of the antibody to the immobilized antigen, the plate or plates can be washed to remove unbound fractions and a shapely labeled secondary binding molecule can be added detectable The secondary binding molecule is allowed to react with any antibody captured from the samples, the plate is washed and the presence of the secondary binding molecule is detected by surplus methods known in the field.
Por tanto, en una realización en particular, la presencia de ligandos unidos de antígeno anti-proteína GapC de unión a plasmina procedentes de una muestra biológica se puede detectar fácilmente utilizando un enlazante secundario que contenga un anticuerpo dirigido frente a los ligandos de anticuerpo. En el ámbito se conoce una serie de moléculas de inmunoglobulina (Ig) antibovina que permiten una conjugación rápida con un marcador enzimático detectable, como la peroxidasa de rábano picante, la fosfatasa alcalina o la ureasa, utilizando métodos conocidos por los expertos en la materia. Un sustrato enzimático apropiado se utiliza a continuación para generar una señal detectable. Otras realizaciones relacionadas admiten el uso de técnicas ELISA de tipo competitivo utilizando los métodos de sobra conocidos por los expertos.Therefore, in a particular embodiment, the presence of bound antigen ligands anti-plasmid binding GapC protein from of a biological sample can be easily detected using a secondary linker containing an antibody directed against antibody ligands. In the field a series of immunoglobulin (Ig) antibovin molecules that allow a rapid conjugation with a detectable enzyme marker, such as Horseradish peroxidase, alkaline phosphatase or urease, using methods known to those skilled in the art. A appropriate enzyme substrate is used below to Generate a detectable signal. Other related realizations support the use of competitive ELISA techniques using the surplus methods known to experts.
Los ensayos también se pueden llevar a cabo en solución, de modo que las proteínas y los anticuerpos específicos para estas proteínas formen complejos bajo condiciones de precipitación. En una realización en concreto, las proteínas GapC de unión a plasmina pueden unirse a una partícula en fase sólida (p. ej. una microesfera de agarosa o similar) utilizando las técnicas de acoplamiento estándar, como el acoplamiento químico directo o indirecto. Después se pone en contacto la partícula recubierta con antígenos bajo condiciones de unión con una muestra biológica de la que se sospecha que contiene anticuerpos para las proteínas GapC de unión a plasmina. El enlace cruzado entre anticuerpos unidos causa la formación de agregados de complejos partícula-antígeno-anticuerpo que se pueden precipitar y separar de la muestra mediante lavado o centrifugado. La mezcla de reacción se puede analizar para determinar la presencia o ausencia de complejos anticuerpo-antígeno utilizando cualquiera de los varios métodos estándar, como los métodos de inmunodiagnóstico descritos anteriormente.The tests can also be carried out in solution, so that specific proteins and antibodies for these proteins form complexes under conditions of precipitation. In a specific embodiment, GapC proteins Plasmin binding can bind to a solid phase particle (e.g. ex. an agarose microsphere or similar) using the techniques Standard coupling, such as direct chemical coupling or indirect. Then the coated particle is contacted with antigens under binding conditions with a biological sample of the suspected to contain antibodies to GapC proteins from plasmin binding. Cross linking between bound antibodies causes complex aggregate formation particle-antigen-antibody that they can be precipitated and separated from the sample by washing or centrifuged The reaction mixture can be analyzed for determine the presence or absence of complexes antibody-antigen using any of the several standard methods, such as immunodiagnostic methods described above.
En aún otra realización, se puede proporcionar una matriz de inmunoafinidad en la que se inmoviliza en un sustrato una población policlonal de anticuerpos procedentes de una muestra biológica sospechosa de contener moléculas anti-GapC de unión a plasmina. En ese sentido, es posible llevar a cabo una purificación inicial de la muestra por afinidad con antígenos inmovilizados. De este modo, la preparación de muestras resultante solamente contendrá fracciones antiestreptococos, evitando así posibles características de unión inespecíficas en el soporte de afinidad. En el campo se conocen varios métodos de inmovilización de inmunoglobulinas (intactas o en fragmentos específicos) con un rendimiento elevado y una buena retención de la actividad de unión antigénica. Sin estar limitado por cualquier método en particular, se puede utilizar proteína A o proteína G para inmovilizar inmunoglobulinas.In yet another embodiment, it can be provided an immunoaffinity matrix in which it is immobilized in a substrate a polyclonal population of antibodies from a sample biological suspect to contain molecules anti-GapC plasmin binding. In that sense, it is possible to carry out an initial purification of the sample by affinity with immobilized antigens. In this way, the preparation of resulting samples will only contain fractions anti-streptococci, thus avoiding possible binding characteristics unspecific in affinity support. In the field they know each other various immunoglobulin immobilization methods (intact or in specific fragments) with high performance and good retention of antigen binding activity. Without being limited by any particular method, protein A or G protein to immobilize immunoglobulins.
Consecuentemente, una vez estén inmovilizadas las moléculas de inmunoglobulina para proporcionar una matriz de inmunoafinidad, se ponen en contacto las proteínas GapC de unión a plasmina marcadas con los anticuerpos unidos bajo condiciones de unión adecuadas. Una vez se han lavado del soporte de inmunoafinidad todos los anticuerpos unidos de forma inespecífica, se puede determinar la presencia de antígeno unido valorando la presencia del marcador mediante los métodos conocidos.Consequently, once they are immobilized immunoglobulin molecules to provide a matrix of immunoaffinity, the GapC binding proteins are contacted plasmin labeled with antibodies bound under conditions of adequate union. Once they have washed the immunoaffinity support all antibodies bound nonspecifically, you can determine the presence of bound antigen by assessing the presence of the marker by known methods.
Además, los anticuerpos generados frente a las proteínas GapC de unión a plasmina, mejor que las propias proteínas GapC de unión a plasmina, pueden utilizarse en los ensayos antes descritos con el fin de detectar la presencia de anticuerpos para las proteínas en una muestra dada. Estos ensayos se realizan fundamentalmente del modo descrito anteriormente y son de conocimiento general en el ámbito.In addition, the antibodies generated against the GapC plasmin binding proteins, better than the proteins themselves Plasmin binding GapC, can be used in assays before described in order to detect the presence of antibodies to the proteins in a given sample. These tests are performed fundamentally in the manner described above and are of general knowledge in the field.
Los reactivos de los ensayos antes descritos, incluidas las proteínas GapC de unión a plasmina o los anticuerpos de las mismas, se pueden suministrar en equipos que lleven las instrucciones adecuadas y otros reactivos necesarios para llevar a cabo los inmunoensayos antes descritos. El equipo también puede contener, en función del inmunoensayo utilizado en cada caso, marcadores adecuados y otros reactivos y materiales envasados (es decir, tampones de lavado y similares). Los inmunoensayos estándar como los antes descritos se pueden realizar utilizando estos equipos.The reagents of the tests described above, including GapC plasmin binding proteins or antibodies of these, can be supplied in equipment that carry the proper instructions and other reagents necessary to carry perform the immunoassays described above. The team can also contain, depending on the immunoassay used in each case, suitable markers and other reagents and packaged materials (en say, wash buffers and the like). Standard immunoassays as described above can be done using these equipment.
Se realizó un depósito de cultivos biológicamente puros de las siguientes cepas en la Colección Americana de Cultivos Tipo, 10801 University Boulevard, Manassas, Virginia, bajo las directrices del Tratado de Budapest. El número de acceso indicado se asignó tras un análisis positivo de viabilidad, y se abonaron las tarifas requeridas. Los depósitos designados se mantendrán durante un periodo de treinta (30) años desde la fecha de depósito, o durante cinco (5) años después de la última petición para el depósito, el periodo de tiempo que sea más largo. En el caso de que un cultivo sea inviable o sea destruido de forma involuntaria, o que cepas que contengan plásmidos los pierdan, serán sustituidos por un cultivo o cultivos viables de la misma descripción taxonómica.A crop deposit was made Biologically pure of the following strains in the Collection Type Crop American, 10801 University Boulevard, Manassas, Virginia, under the guidelines of the Budapest Treaty. The number of indicated access was assigned after a positive analysis of viability, and the required fees were paid. Deposits Designated will be maintained for a period of thirty (30) years from the date of deposit, or for five (5) years after the Last request for deposit, the period of time that is longer long. In the event that a crop is unfeasible or destroyed from unintentionally, or strains containing plasmids the lose, will be replaced by a viable crop or crops of the Same taxonomic description.
Si se diera una discrepancia entre la secuencia presentada en la presente solicitud y la secuencia del gen de interés del plásmido depositado debido a errores rutinarios de secuenciación, la secuencia del plásmido depositado será la que prevalezca.If there were a discrepancy between the sequence presented in the present application and the gene sequence of plasmid interest deposited due to routine errors of sequencing, the sequence of the deposited plasmid will be the one prevail
A continuación se exponen ejemplos de realizaciones específicas para la realización de la presente invención. Los ejemplos se ofrecen solamente con una finalidad ilustrativa y no pretenden limitar el alcance de la presente invención de ninguna manera.The following are examples of specific embodiments for the realization of this invention. The examples are offered for one purpose only. illustrative and are not intended to limit the scope of this invention in any way.
Se han destinado esfuerzos a garantizar la precisión con respecto a los números utilizados (p. ej. cantidades, temperaturas, etc.), pero cabe la posibilidad de que existan alguna desviación o algún error experimentales.Efforts have been devoted to ensuring the accuracy with respect to the numbers used (eg quantities, temperatures, etc.), but it is possible that there are some experimental deviation or error.
Las enzimas se adquirieron de fuentes comerciales y se utilizaron siguiendo las instrucciones de los fabricantes.Enzymes were purchased from sources commercial and were used following the instructions of the Manufacturers
Para el aislamiento de fragmentos de DNA, excepto en los casos en los que se especifique lo contrario, todas las manipulaciones de DNA se realizaron según procedimientos estándar. Véase Sambrook et al., supra. Las enzimas de restricción T_{4} DNA ligasa, E. coli, DNA polimerasa II, fragmento Klenow y otros reactivos biológicos pueden adquirirse a partir de proveedores comerciales y utilizarse de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Los fragmentos de DNA de doble cadena se separaron en geles de agarosa.For the isolation of DNA fragments, except in cases where otherwise specified, all DNA manipulations were performed according to standard procedures. See Sambrook et al. supra The restriction enzymes T4 DNA ligase, E. coli , DNA polymerase II, Klenow fragment and other biological reagents can be purchased from commercial suppliers and used in accordance with the manufacturer's instructions. The double stranded DNA fragments were separated on agarose gels.
Las fuentes de reactivos químicos incluyen en general las siguientes: Sigma Chemical Company, St. Louis, MO; Alrich, Milwaukee, WI; Roche Molecular Biochemicals, Indianapolis, IN.Sources of chemical reagents include in General the following: Sigma Chemical Company, St. Louis, MO; Alrich, Milwaukee, WI; Roche Molecular Biochemicals, Indianapolis, IN.
Un aislado clínico de S. dysgalactiae proveniente de un caso de mastitis bovina (Núm. de Acceso a ATCC ATCC43078) se obtuvo a partir de la Colección Americana de (10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110-2209), y se empleó como fuente de DNA. El microorganismo se cultivó de forma rutinaria sobre placas de agar TSA y sangre bovina (PML Microbiologicals, Mississauga, Ontario) a 37ºC durante 18 horas, o en caldo de cultivo Tod&Hewitt (Oxoid Ltd., Hampshire, Inglaterra) complementado con 0,3% de extracto de levadura (THB-YE) a 37ºC y CO_{2} al 5%.A clinical isolate of S. dysgalactiae from a case of bovine mastitis (ATCC Access No. ATCC43078) was obtained from the American Collection of (10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110-2209), and was used as a source of DNA. The microorganism was routinely cultured on TSA agar plates and bovine blood (PML Microbiologicals, Mississauga, Ontario) at 37 ° C for 18 hours, or in Tod & Hewitt broth (Oxoid Ltd., Hampshire, England) supplemented with 0.3% of yeast extract (THB-YE) at 37 ° C and 5% CO2.
El DNA cromosómico se preparó a partir de S. dysgalactiae cultivado en 100 ml de THB-YE complementado con glicina 20 mM durante aproximadamente 6 horas, hasta alcanzar una A_{600} de 0,8 a 1,0. Las células se recogieron y se resuspendieron en EDTA 50 mM, Tris-HCl 50 mM y Tween-20® al 0,5% (Sigma, St. Louis, MO), y se complementaron con ribonucleasa A (200 mg/ml), proteinasa K (20 mg/ml), lisozima (100 mg/ml) y mutanolisina (100 mg/ml) (SIGMA, St. Louis, MO). Tras la lisis bacteriana durante 30 minutos a 37ºC con agitación vigorosa, se mezcló hidrocloruro de guanidina y Tween-20® a pH 5,5 con el lisado para conseguir una concentración final de 0,8 M y del 5%, respectivamente. Esta mezcla se incubó a 50ºC durante 30 minutos. Entonces se purificó el DNA cromosómico utilizando un equipo Qiagen genomic-tip 100 g (Qiagen, Santa Clarita, CA) y se precipitó utilizando 0,7 volúmenes de isopropanol. El precipitado resultante se lavó en etanol al 70% y se resuspendió en 0,5 ml de Tris-HCl 10 mM a pH 8,8.The chromosomal DNA was prepared from S. dysgalactiae grown in 100 ml of THB-YE supplemented with 20 mM glycine for approximately 6 hours, until an A 600 of 0.8 to 1.0 was reached. Cells were collected and resuspended in 50 mM EDTA, 50 mM Tris-HCl and 0.5% Tween-20® (Sigma, St. Louis, MO), and supplemented with ribonuclease A (200 mg / ml), Proteinase K (20 mg / ml), lysozyme (100 mg / ml) and mutanolisin (100 mg / ml) (SIGMA, St. Louis, MO). After bacterial lysis for 30 minutes at 37 ° C with vigorous stirring, guanidine hydrochloride and Tween-20® were mixed at pH 5.5 with the lysate to achieve a final concentration of 0.8 M and 5%, respectively. This mixture was incubated at 50 ° C for 30 minutes. The chromosomal DNA was then purified using a 100 g Qiagen genomic-tip kit (Qiagen, Santa Clarita, CA) and precipitated using 0.7 volumes of isopropanol. The resulting precipitate was washed in 70% ethanol and resuspended in 0.5 ml of 10 mM Tris-HCl at pH 8.8.
El gen gapC fue amplificado mediante PCR (véanse Mullis et al., Patente Estadounidense núm. 4 683 195; Mullis, Patente Estadounidense núm. 4 683 202). El cebador directo, gapC1, contenía una diana de restricción NdeI (ID. de SEC. núm.: 1, mostrado en la Tabla 1) y el cebador indirecto, gapC1r, contenía una diana BamHI (ID. de SEC. núm.: 2, mostrado en la Tabla 1). En las anteriores secuencias de cebadores, ilustradas en la Tabla 1, el subrayado indica los nucleótidos añadidos a la secuencia original, y la negrita indica la situación de los sitios de reconocimiento de la endonucleasa de restricción.The gapC gene was amplified by PCR (see Mullis et al, U.S. Patent No. 4,683,195,.. Mullis, US Patent No. 4,683,202.). The direct primer, gapC1 , contained a NdeI restriction target (SEQ ID NO : 1, shown in Table 1) and the indirect primer, gapC1r , contained a BamHI target (SEQ ID NO : 2 , shown in Table 1). In the previous primer sequences, illustrated in Table 1, the underline indicates the nucleotides added to the original sequence, and the bold type indicates the location of restriction endonuclease recognition sites.
La PCR se llevó a cabo utilizando la Vent DNA polimerasa (New England Biolabs, Mississauga, ON, Canadá). Se incubaron 0,7 \mug de DNA cromosómico de S. dysgalactiae en una mezcla de reacción que contenía 1 \muM de cada uno de los cebadores anteriores; 200 \muM de cada uno de los nucleótidos dATP, dTTP, dCTP y dGTP; MgSO_{4} 3 mM; 1x concentración de tampón Thermopol (New England Biolabs, Mississauga, ON, Canadá); y 2 unidades de Vent DNA polimerasa. Esta mezcla se incubó durante 3 ciclos de amplificación de 1 minuto a 94ºC, 3 minutos a 50ºC y 1 minuto, 10 segundos a 72ºC, luego durante 27 ciclos de amplificación de 15 segundos a 95ºC, 30 segundos a 55ºC, y 1 minuto a 72ºC, y finalmente durante 1 ciclo de 5 minutos a 72ºC.PCR was carried out using Vent DNA polymerase (New England Biolabs, Mississauga, ON, Canada). 0.7 µg of S. dysgalactiae chromosomal DNA was incubated in a reaction mixture containing 1 µM of each of the above primers; 200 µM of each of the nucleotides dATP, dTTP, dCTP and dGTP; 3 mM MgSO 4; 1x concentration of Thermopol buffer (New England Biolabs, Mississauga, ON, Canada); and 2 units of Vent DNA polymerase. This mixture was incubated for 3 amplification cycles of 1 minute at 94 ° C, 3 minutes at 50 ° C and 1 minute, 10 seconds at 72 ° C, then for 27 amplification cycles of 15 seconds at 95 ° C, 30 seconds at 55 ° C, and 1 minute at 72 ° C , and finally for 1 cycle of 5 minutes at 72 ° C.
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La gapC producto de PCR se clonó en un vector de expresión pET15B (Novagen, Madison, WI) que había sido digerido con BamHI y NdeI. La clonación del producto de PCR en este lugar provoca la adición a la secuencia codificante de gapC de una secuencia codificante dentro del patrón de lectura para una cola de seis histidinas. La posterior expresión produce una proteína completa que lleva la cola de histidinas, lo que permite la purificación de la proteína bajo condiciones no desnaturalizantes utilizando cromatografía de quelatos metálicos.The gapC PCR product was cloned into an expression vector pET15B (Novagen, Madison, WI) that had been digested with BamHI and NdeI . Cloning of the PCR product at this site causes the addition of a coding sequence into the reading pattern for a tail of six histidines to the gapC coding sequence. Subsequent expression produces a complete protein that carries the histidine tail, which allows purification of the protein under non-denaturing conditions using metal chelate chromatography.
Este constructo se utilizó para transformar E. coli BL21 DE3 (Life Technologies, Gaithersburg, MD). Esta cepa transformada se designó BL21 DE3 (PETl5bgapC) (Núm. ATCC).This construct was used to transform E. coli BL21 DE3 (Life Technologies, Gaithersburg, MD). This transformed strain was designated BL21 DE3 (PETl5bgapC) (No. ATCC).
El gen gapC se preparó a partir de otros aislados siguiendo fundamentalmente el modo antes descrito.The gapC gene was prepared from other isolates essentially following the manner described above.
El DNA cromosómico de S. agalactiae, S. uberis y S. parauberis se aisló de cepas obtenidas de la Colección Americana de Cultivos Tipo (10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110-2209; cepas designadas por ATCC 27541, 9927 y 13386, respectivamente). El DNA cromosómico de S. inicie se aisló de una cepa designada 9117 obtenida del Hospital Mount Sinai de Toronto.The chromosomal DNA of S. agalactiae , S. uberis and S. parauberis was isolated from strains obtained from the American Type Culture Collection (10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110-2209; strains designated by ATCC 27541, 9927 and 13386, respectively ). The chromosomal DNA of S. initie was isolated from a strain designated 9117 obtained from Mount Sinai Hospital in Toronto.
Los cebadores utilizados para amplificar los genes gapC de las cepas de Streptococcus antes expuestas fueron los mismos que los utilizados en el caso de S. dysgalactiae, es decir, el cebador gapC1 (ID. de SEC. núm.: 1) y el cebador gapC1r (ID. de SEC. núm.: 2).The primers used to amplify the gapC genes of the Streptococcus strains described above were the same as those used in the case of S. dysgalactiae , that is, the gapC1 primer (SEQ ID NO : 1) and the gapC1r primer (SEQ ID No. 2).
Una vez acabada la amplificación, el producto de PCR se clonó en cada caso dentro de un pPCR-Script, utilizando el protocolo de clonación descrito en el equipo PCR-Script Amp Cloning Kit (Stratagene, La Jolla, CA). A continuación, se cortó el inserto de producto de PCR utilizando NdeI y BamHI y se volvió a clonar dentro de esos sitios en pEl5b utilizando los protocolos de clonación convencionales (véase, p. ej., Sambrook et al., supra.). Los plásmidos que contenían S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae fueron designados como pMF521c (núm. ATCC), pMF521a (núm. ATCC), pMF521d (núm. de ATCC) y pMF521e (núm. de ATCC), respectivamente.Once the amplification was finished, the PCR product was cloned in each case into a pPCR-Script, using the cloning protocol described in the PCR-Script Amp Cloning Kit (Stratagene, La Jolla, CA). Then cut the PCR product insert using NdeI and BamHI and was recloned into those sites in pEl5b using conventional cloning protocols (see, e. G., Sambrook et al., Supra.). Plasmids containing S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis and S. iniae were designated as pMF521c (ATCC No.), pMF521a (ATCC No.), pMF521d (ATCC No.) and pMF521e (ATCC No. ), respectively.
Al secuenciar un gen de S. dysgalactiae unido pero no relacionado fue cuando se identificaron por primera vez las secuencias homólogas a gapC del homólogo de S. equisimilis (Gase, et al. [1996] European J. of Biochem. 239:42-51). Para obtener la secuencia completa del gen gapC de S. dysgalactiae, se empleó la PCR con los cebadores antes descritos, es decir, el cebador gapC1 y el cebador gapC1r.Sequencing a gene of S. dysgalactiae bound but not related was when the homologous sequences to gapC of the homologue of S. equisimilis were first identified (Gase, et al. [1996] European J. of Biochem. 239 : 42-51 ). To obtain the complete sequence of the gapC gene for S. dysgalactiae, PCR was employed with the primers described above, i.e., primer gapC1 and the primer gapC1r.
La secuencia se determinó en el Plant Biotechnology Institute (PBI, Saskatoon, Canadá) utilizando terminadores de cola marcados con fluorescencia en un secuenciador de DNA automático ABI 373 (Applied Biosystems, Emeryville, CA).The sequence was determined in the Plant Biotechnology Institute (PBI, Saskatoon, Canada) using fluorescently labeled tail terminators in a sequencer of automatic DNA ABI 373 (Applied Biosystems, Emeryville, CA).
Las secuencias de las proteínas GapC aisladas de S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae se determinaron por el mismo método.The sequences of GapC proteins isolated from S. agalactiae , S. uberis , S. parauberis and S. iniae were determined by the same method.
Las figuras de la 1 a la 5 muestran tanto las secuencias nucleotídicas como las secuencias aminoacídicas esperadas de la proteína GapC de S. dysgalactiae (DysgalGapC) (ID. de SEC. núm.: 3 y ID. de SEC. NÚM.: 4), así como las de las proteínas GapC de S. agalactiae (AgalGapC) (ID. de SEC. núm.: 5 e ID. de SEC. núm.: 6), S. uberis (UberGapC) (ID. de SEC. núm.: 7 e ID. de SEC. núm.: 8), S. parauberis (PUberGapC) (ID. de SEC. núm.: 9 e ID. de SEC. núm.: 10) y S. iniae (IniaeGapC) (ID. de SEC. núm.: 11 e ID. de SEC. núm.: 12), respectivamente.Figures 1 through 5 show both the nucleotide sequences and the expected amino acid sequences of the S. dysgalactiae GapC protein (DysgalGapC) (SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4) as well as for the GapC proteins of S. agalactiae (AgalGapC) (SEQ. ID. No .: 5 and SEQ. ID. No .: 6), S. uberis (UberGapC) (SEQ. ID. No. .: 7 and SEC ID No.: 8), S. parauberis (PUberGapC) (SEC ID No. 9: and SEQ ID No. 10) and S. iniae (IniaeGapC) ( SEC ID No. 11 and SEC ID No. 12), respectively.
El gen de la proteína GapC de S. dysgalactiae representado en las figuras 1A-1B codifica una proteína de 336 aminoácidos que no parece contener ni una secuencia señal ni un dominio de anclaje a membrana. Una búsqueda en la base de datos del GenBank realizada con el programa BLASTX reveló que el patrón abierto de lectura era homólogo en un 95,5% a la GapC de S. equisimilis (Núm. de acceso en GenBank X97788) y en un 99,4% a la GapC de S. pyogenes (Núm. de acceso en GenBank M95569). La secuencia aminoacídica predicha de la proteína GapC también mostró una identidad aminoacídica del 43% con la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa bovina (Núm. de acceso en GenBank U85042).Gene GapC protein S. dysgalactiae of depicted in Figures 1A-1B encoding a protein of 336 amino acids not appear to contain a signal sequence or a domain or membrane anchor. A search in the GenBank database conducted with the BLASTX program revealed that the open reading pattern was 95.5% homologous to the S. equisimilis GapC (GenBank accession number X97788) and in 99, 4% to the GapC of S. pyogenes (Accession no. In GenBank M95569). The predicted amino acid sequence of the GapC protein also showed a 43% amino acid identity with bovine glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (Accession No. in GenBank U85042).
De forma similar, no se observa presencia de secuencias señal ni dominios de anclaje a membrana en las secuencias de proteína GapC de S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae.Similarly, no presence of signal sequences or membrane anchor domains is observed in the GapC protein sequences of S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis and S. iniae .
Las homologías de las secuencias aparecen representadas en la Tabla 2.The sequence homologies appear represented in Table 2.
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La proteína GapC con una cola de polihistidinas (6 His) se expresó y purificó en condiciones no desnaturalizantes mediante cromatografía de afinidad de quelatos metálicos (Ni-NTA).GapC protein with a polyhistidine tail (6 His) was expressed and purified under non-denaturing conditions by affinity chromatography of metal chelates (Ni-NTA).
Se hizo crecer E. coli BL21 DE3 que contenía el plásmido recombinante en medio Luria Broth (LB) que contenía 100 \mug/ml de ampicilina hasta una A_{600} de aproximadamente 0,5. Entonces, se indujo la expresión de la proteína GapC mediante la adición de isopropil-\betaD-tiogalactósido 1 mM (IPTG) (Sigma, St. Louis, MO). Tras tres horas de incubación a 37ºC, se recogieron las células, se lavaron con el tampón de la columna (solución de fosfato sódico 50 mM, pH 8,0; NaCl 0,3 M; imidazol 10 mM) y se lisaron por sonicación. E. coli BL21 DE3 containing the recombinant plasmid was grown in Luria Broth medium (LB) containing 100 µg / ml ampicillin to an A 600 of about 0.5. Then, GapC protein expression was induced by the addition of 1 mM isopropyl-? D-thiogalactoside (IPTG) (Sigma, St. Louis, MO). After three hours of incubation at 37 ° C, the cells were collected, washed with the column buffer (50 mM sodium phosphate solution, pH 8.0; 0.3 M NaCl; 10 mM imidazole) and lysed by sonication.
Aproximadamente un 40% de la proteína recombinante se encontraba en la fracción soluble del lisado celular con un rendimiento aproximado de 50 mg de proteína recombinante por litro de cultivo, determinado mediante el Equipo de valoración de proteínas DC (Bio-Rad Laboratories, Mississauga, ON, Canadá) utilizando albúmina sérica bovina (Pierce, Rockford, IL) como estándar.Approximately 40% of the recombinant protein was in the soluble fraction of the cell lysate with an approximate yield of 50 mg of recombinant protein per liter of culture, determined by the DC Protein Valuation Equipment (Bio-Rad Laboratories, Mississauga, ON , Canada) using bovine serum albumin (Pierce, Rockford, IL) as standard.
Se limpió el lisado mediante centrifugación y la fracción soluble se pasó por una columna Ni-NTA (Qiagen), que se lavó posteriormente con 10 volúmenes de columna de tampón de la columna (igual que el anterior, excepto que contenía imidazol 20 mM). La proteína GapC con la cola de polihistidina se eluyó utilizando el tampón de la columna (igual que el anterior, excepto que contenía imidazol 250 mM) y dio como resultado una fracción homogénea de proteínas con una concentración de GapC de 10 a 15 mg/ml. Dicha fracción se dializó frente a 2000 volúmenes de PBSA (cloruro sódico 136 mM, cloruro potásico 2,6 mM, fosfato sódico dibásico 8,1 mM, fosfato potásico monobásico 1,46 mM).The lysate was cleaned by centrifugation and the soluble fraction was passed through a Ni-NTA column (Qiagen), which was subsequently washed with 10 column volumes of column buffer (same as above, except that it contained 20 mM imidazole). The GapC protein with the polyhistidine tail is eluted using the column buffer (same as above, except that it contained 250 mM imidazole) and resulted in a homogeneous protein fraction with a GapC concentration of 10 at 15 mg / ml. This fraction was dialyzed against 2000 volumes of PBSA (136 mM sodium chloride, 2.6 mM potassium chloride, sodium phosphate 8.1 mM dibasic, 1.46 mM monobasic potassium phosphate).
La expresión y la purificación de las proteínas recombinantes de esas especies de estreptococos se consigue mediante los mismos procedimientos descritos en el Ejemplo 1E antes mencionado. Las cepas bacterianas transformadas utilizadas para expresar las proteínas GapC recombinantes de S. agalactiae, S. uberis, S. parauberis y S. iniae se designaron como BL21 DE3 (pMF52lc) (núm. ATCC), BL21 DE3 (pMF521a) (núm. ATCC), BL21 DE3 (pMF52ld) (núm. ATCC) y BL21 DE3 (pMF521e) (núm. ATCC), respectivamente.The expression and purification of the recombinant proteins of these streptococcal species is achieved by the same procedures described in Example 1E mentioned above. Transformed bacterial strains used to express the recombinant GapC proteins of S. agalactiae , S. uberis , S. parauberis and S. iniae were designated BL21 DE3 (pMF52lc) (ATCC No.), BL21 DE3 (pMF521a) (ATCC No. ), BL21 DE3 (pMF52ld) (ATCC No.) and BL21 DE3 (pMF521e) (ATCC No.), respectively.
La electroforesis en gel de poliacrilamida-SDS se realizó con una muestra de la proteína eluida mediante el método descrito por Laemli (Laemli, U.K. [1970] Nature 227:680-685). Los resultados se presentan en la Figura 18: carril 1, marcadores de peso molecular (intervalo de 20,5 a 103 kDa; BioRad Laboratories, Emeryville, CA); carril 2, proteína GapC recombinante soluble de S. dysgalactiae, purificada mediante cromatografía de afinidad Ni-NTA.Polyacrylamide-SDS gel electrophoresis was performed with a sample of the eluted protein by the method described by Laemli (Laemli, UK [1970] Nature 227: 680-685). The results are presented in Figure 18: lane 1, molecular weight markers (range from 20.5 to 103 kDa; BioRad Laboratories, Emeryville, CA); lane 2, soluble recombinant GapC protein of S. dysgalactiae , purified by Ni-NTA affinity chromatography.
Los resultados muestran que la purificación por cromatografía de afinidad en columna Ni-NTA da como resultado una fracción proteica homogénea.The results show that purification by Ni-NTA column affinity chromatography gives as resulted in a homogeneous protein fraction.
La enzima GAPDH cataliza la fosforilación oxidativa de D-gliceraldehído-3-fosfato a 1,3-difosfoglicerato en presencia de NAD^{+} y fosfato inorgánico. El elevado grado de homología de GapC con la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa estreptocócica sugiere que GapC podría tener esa actividad enzimática.GAPDH enzyme catalyzes phosphorylation oxidative of D-glyceraldehyde-3-phosphate to 1,3-diphosphoglycerate in the presence of NAD + and inorganic phosphate The high degree of homology of GapC with the glyceraldehyde-3-phosphate streptococcal dehydrogenase suggests that GapC could have that enzymatic activity.
La actividad GAPDH de las células enteras de S. dysgalactiae (10^{10} UFC) y de la proteína GapC recombinante se determinó midiendo la reducción de NAD^{+} a NADH. El tampón del ensayo estaba compuesto de trietanolamina 40 mM, Na_{2}HPO_{4} 50 mM y EDTA 5 mM, pH 6,8. Se incubaron células de S. dysgalactiae o 5 mg de proteína recombinante GapC purificada en el tampón del ensayo que contenía gliceraldehído-3-fosfato (49 mg/ml; Sigma Chemical Company), 75 microlitros de NAD^{+} (15 mM; Sigma Chemical Company) hasta un volumen final de 1 ml. Como controles negativos se utilizaron muestras que no contenían gliceraldehído-3-fosfato o moléculas de proteína GapC recombinante/células de S. dysgalactiae. La reducción de NAD^{+} a NADH se controló espectrofotométricamente a una absorbancia de 340 nanómetros.The GAPDH activity of the entire S. dysgalactiae cells (10 10 CFU) and of the recombinant GapC protein was determined by measuring the reduction of NAD + to NADH. The assay buffer was composed of 40 mM triethanolamine, 50 mM Na 2 HPO 4 and 5 mM EDTA, pH 6.8. S. dysgalactiae cells or 5 mg of purified GapC recombinant protein were incubated in the assay buffer containing glyceraldehyde-3-phosphate (49 mg / ml; Sigma Chemical Company), 75 microliters of NAD + (15 mM; Sigma Chemical Company) to a final volume of 1 ml. Negative controls were samples that did not contain glyceraldehyde-3-phosphate or recombinant GapC protein molecules / S. dysgalactiae cells. The reduction of NAD + to NADH was monitored spectrophotometrically at an absorbance of 340 nanometers.
Los resultados indicaron que tanto la proteína recombinante como las células intactas de S. dysgalactiae de tipo salvaje poseían actividad enzimática (no se muestran estos resultados). Además, cuando se trataron las células de S. dysgalactiae con tripsina para digerir las proteínas de superficie, la actividad GAPDH desapareció. Así, la actividad enzimática observada en las células intactas de tipo salvaje no se debió a la GAPDH intracelular.The results indicated that both the recombinant protein and the intact cells of wild-type S. dysgalactiae possessed enzymatic activity (these results are not shown). In addition, when S. dysgalactiae cells were treated with trypsin to digest surface proteins, GAPDH activity disappeared. Thus, the enzymatic activity observed in intact wild-type cells was not due to intracellular GAPDH.
Estos datos sugieren que la proteína GapC se localiza en la superficie de la célula a pesar de la aparente falta de secuencias señal o de anclaje a membrana tanto en la secuencia de nucleótidos como en la de aminoácidos.These data suggest that the GapC protein is locates on the surface of the cell despite the apparent lack of signal or membrane anchor sequences both in the sequence of nucleotides as in amino acids.
Se utilizó un ensayo en microplaca para determinar si la proteína recombinante GapC tenía la capacidad de unirse a la plasmina bovina, y si dicha unión mantenía la actividad enzimática de la plasmina.A microplate assay was used to determine if the recombinant GapC protein had the ability to bind to bovine plasmin, and if said binding maintained activity enzymatic plasmin.
Se sembraron microplacas de 96 pocillos con 5 mg de proteína recombinante GapC purificada, se lavaron tres veces con 0,1% de gelatina-PBSA con 0,05% de TWEEN-20 (PBSGT).96-well microplates were seeded with 5 mg of purified GapC recombinant protein, washed three times with 0.1% gelatin-PBSA with 0.05% of TWEEN-20 (PBSGT).
Se bloquearon los pocillos durante una hora a 37ºC en la misma solución y se lavaron y se incubaron con 200 \mul de plasmina bovina (0,25 mg/ml, Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN) durante una hora a 37ºC. A continuación, se lavaron los pocillos ocho veces con PBSGT. Se añadieron 200 \mul del sustrato sintético Chromazym-PL (Tos-Gly-Pro-Lys-4-NA, 0,3 mg/ml) a los pocillos y se incubaron a 37ºC durante una hora. La presencia de actividad plasmina asociada se determinó mediante la medición de la cantidad de paranitroanilida (4-nitranilina) liberada en los sobrenadantes en función de su absorbancia a 405 nanómetros. Se utilizó un procedimiento similar para medir la actividad de unión a plasmina de las células intactas de S. dysgalactiae, con la excepción de que 10^{10} células se lavaron con PBSGT, se resuspendieron en 400 \mul de Chromazym-PL (0,3 mg/ml) y se incubaron durante una hora a 37ºC.The wells were blocked for one hour at 37 ° C in the same solution and washed and incubated with 200 µl of bovine plasmin (0.25 mg / ml, Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN) for one hour at 37 ° C. Then, the wells were washed eight times with PBSGT. 200 µL of the synthetic Chromazym-PL substrate (Tos-Gly-Pro-Lys-4-NA, 0.3 mg / ml) was added to the wells and incubated at 37 ° C for one hour. The presence of associated plasmin activity was determined by measuring the amount of paranitroanilide (4-nitraniline) released in the supernatants based on their absorbance at 405 nanometers. A similar procedure was used to measure the plasmin binding activity of intact S. dysgalactiae cells, with the exception that 10 10 cells were washed with PBSGT, resuspended in 400 µl of Chromazym-PL (0 , 3 mg / ml) and incubated for one hour at 37 ° C.
Los resultados, que se muestran en la Figura 19, demuestran que la proteína recombinante purificada presentó la capacidad de unirse a plasmina bovina enzimáticamente activa. Asimismo, cuando se utilizaron células intactas de S. dysgalactiae, se obtuvieron resultados similares. En la figura, los datos representan la media de tres ensayos independientes.The results, shown in Figure 19, demonstrate that the purified recombinant protein exhibited the ability to bind enzymatically active bovine plasmin. Likewise, when intact S. dysgalactiae cells were used, similar results were obtained. In the figure, the data represent the average of three independent trials.
Así, el receptor de plasmina está localizado en la superficie de S. dysgalactiae y la proteína purificada mantiene su actividad biológica.Thus, the plasmin receptor is located on the surface of S. dysgalactiae and the purified protein maintains its biological activity.
Las vacunas de formularon de tal manera que contenían 50 mg/ml de proteína GapC recombinante purificada por afinidad en adyuvante de base oleosa VSA3 (VIDO, Saskatoon, Saskatchewan, Canadá). VSA3 es una combinación de Emulsigen Plus^{TM} (MVP Laboratories, Ralston, Nebraska) y bromuro de dimetildioctadecil amonio (Kodak, Rochester, New York). En la Figura 18 se muestra la proteína GapC recombinante purificada por afinidad utilizada para la preparación de la vacuna.The vaccines were formulated in such a way that contained 50 mg / ml of recombinant GapC protein purified by affinity in oil-based adjuvant VSA3 (VIDO, Saskatoon, Saskatchewan, Canada). VSA3 is a combination of Emulsigen Plus? (MVP Laboratories, Ralston, Nebraska) and bromide dimethyldioctadecyl ammonium (Kodak, Rochester, New York). In the Figure 18 shows the recombinant GapC protein purified by affinity used for vaccine preparation.
Se obtuvieron 24 Holsteins no lactantes sin antecedentes de infección por S. dysgalactiae a partir de diferentes granjas de Saskatchewan, en Canadá. Una semana antes de la vacunación, se trataron todos los animales con Cepha-dry^{TM} (Ayerst Laboratories, Montreal, Canadá) (300 mg por cuarto) con el objetivo de eliminar cualquier infección de la ubre antes de la vacunación.24 non-lactating Holsteins with no history of S. dysgalactiae infection were obtained from different Saskatchewan farms in Canada. One week before vaccination, all animals were treated with Cepha-dry ™ (Ayerst Laboratories, Montreal, Canada) (300 mg per quarter) in order to eliminate any infection of the udder before vaccination.
Se inmunizaron grupos de ocho animales por vía subcutánea con dos dosis de vacuna que contenían proteína GapC de S. dysgalactiae, Mig (una proteína receptora para Fc aislada de S. dysgalactiae, que fue evaluada simultáneamente) o un placebo, con un intervalo de tres semanas entre inmunizaciones. Dos semanas después de la segunda inmunización, los animales fueron expuestos a 650 unidades formadoras de colonias de S. dysgalactiae administradas en tres de los cuartos con una cánula de infusión para ubres. El cuarto restante de cada animal se utilizó como un control sin infección.Groups of eight animals were immunized subcutaneously with two doses of vaccine containing GapC protein from S. dysgalactiae , Mig (a receptor protein for Fc isolated from S. dysgalactiae , which was evaluated simultaneously) or a placebo, with an interval of three weeks between immunizations. Two weeks after the second immunization, the animals were exposed to 650 colony forming units of S. dysgalactiae administered in three of the rooms with an udder infusion cannula. The remaining quarter of each animal was used as a control without infection.
Se examinó diariamente la aparición de signos clínicos de la enfermedad en todos los animales y se recogieron muestras de los cuartos de la ubre cada día. Se analizó la consistencia de las muestras y se realizó el recuento de células somáticas así como la determinación del número de bacterias.The appearance of signs was examined daily disease clinics in all animals and were collected samples of the udder quarters every day. The sample consistency and cell count was performed somatic as well as the determination of the number of bacteria.
Se determinaron los anticuerpos específicos de GapC en el suero bovino mediante un inmunoensayo en fase sólida (ELISA). Brevemente, se sembraron microplacas (NUNC, Naperville, Illinois) con 1 \mug por pocillo de antígeno recombinante purificado en tampón de carbonato sódico 50 mM, pH 9,6 y se incubaron durante toda la noche a 4ºC. Se retiró el líquido y se bloquearon los pocillos con una solución de albúmina sérica bovina al 3% durante 1 hora a 37ºC. Entonces, se añadieron diluciones seriadas de suero bovino (de 1:4 a 1:6400) a los pocillos y se incubaron durante dos horas a temperatura ambiente. Posteriormente, los pocillos se aspiraron, lavaron e incubaron con 100 \mul de anticuerpos de cabra anti-IgG bovina conjugados con fosfatasa alcalina (Kirkgaard & Perry Laboratories Inc., Gaithersburg, MD) durante una hora a temperatura ambiente. Se volvieron a lavar los pocillos y se añadieron 100 \mul de p-nitrofenol fosfato (SIGMA, St. Louis, MO) como sustrato para detectar la actividad de la fosfatasa alcalina. Se determinó la absorbancia a 405 nanómetros tras una hora de incubación con el sustrato a temperatura ambiente.The specific antibodies of GapC in bovine serum by a solid phase immunoassay (ELISA). Briefly, microplates were seeded (NUNC, Naperville, Illinois) with 1 µg per well of recombinant antigen purified in 50 mM sodium carbonate buffer, pH 9.6 and incubated overnight at 4 ° C. The liquid was removed and blocked the wells with a solution of bovine serum albumin at 3% for 1 hour at 37 ° C. Then, dilutions were added Serum bovine serum (from 1: 4 to 1: 6400) to the wells and incubated for two hours at room temperature. Later, wells were aspirated, washed and incubated with 100 µl of goat anti-bovine IgG antibodies conjugated with alkaline phosphatase (Kirkgaard & Perry Laboratories Inc., Gaithersburg, MD) for one hour at room temperature. Be the wells were washed again and 100 µl of p-nitrophenol phosphate (SIGMA, St. Louis, MO) as substrate to detect alkaline phosphatase activity. Be determined the absorbance at 405 nanometers after one hour of incubation with the substrate at room temperature.
Cuando se refiere a las figuras, el título de anticuerpos específicos como el recíproco de la dilución que mostraba actividad por encima de los niveles basales.When referring to the figures, the title of specific antibodies such as the reciprocal of the dilution that showed activity above baseline levels.
Se estableció el número de bacterias esparciendo diluciones seriadas (de 10^{0} a 10^{-3}) directamente en placas agar sangre de oveja TSA seguido de la incubación durante toda la noche a 37ºC y CO_{2} al 5%. La colonización se define como la recuperación de >500 ufc/ml del organismo infectado.The number of bacteria spreading was established serial dilutions (from 10 0 to 10 - 3) directly in TSA sheep blood agar plates followed by incubation during overnight at 37 ° C and 5% CO2. Colonization is defined as the recovery of> 500 cfu / ml of the infected organism.
Para confirmar que las bacterias recogidas de las secreciones de leche eran de S. dysgalactiae, se seleccionaron colonias recogidas de cada animal y se analizaron utilizando un ensayo API strep-20 (bioMerieux SA, Hazelwood, Missouri) según las instrucciones suministradas por el fabricante. Este ensayo es una técnica estandarizada que combina 20 ensayos bioquímicos para determinar la actividad enzimática y la fermentación de azúcares. Las reacciones se leen en función de una tabla de lectura y la identificación se obtiene tanto por el índice del perfil analítico como por una aplicación informática de identificación.To confirm that the bacteria collected from milk secretions were from S. dysgalactiae , colonies collected from each animal were selected and analyzed using an API strep-20 assay (bioMerieux SA, Hazelwood, Missouri) according to the manufacturer's instructions. This test is a standardized technique that combines 20 biochemical tests to determine the enzymatic activity and the fermentation of sugars. The reactions are read based on a reading table and the identification is obtained both by the index of the analytical profile and by a computer application of identification.
Tras la entrada en contacto con el microorganismo, los animales de todos los grupos mostraron colonización por S. dysgalactiae (Figura 20). Únicamente las vacas inmunizadas con GapC mostraron una reducción estadísticamente significativa en el número de cuartos infectados y en el número total de bacterias aisladas por cuarto. Por tanto, la inmunización con GapC redujo la colonización bacteriana tras la entrada en contacto con S. dysgalactiae.After contact with the microorganism, animals of all groups showed colonization by S. dysgalactiae (Figure 20). Only cows immunized with GapC showed a statistically significant reduction in the number of infected rooms and in the total number of bacteria isolated per quarter. Therefore, immunization with GapC reduced bacterial colonization after contact with S. dysgalactiae .
La relación entre el título de anti-GapC y la colonización bacteriana se muestra en las Figuras 21 y 22. Se observó una gran correlación entre los niveles séricos de anticuerpos anti-GapC y el número máximo de bacterias (expresado en UFC (log_{10)}/ml de leche) detectado en todos los cuartos (r = 0,74) (Figura 21), así como con el número total de cuartos infectados (r^{2} = 0,74) (Figura 22). La correlación se calculó utilizando el programa GraphPad Prism, versión 2.01 (GraphPad Software Inc., San Diego, California).The relationship between the title of anti-GapC and bacterial colonization is shown in Figures 21 and 22. A large correlation was observed between serum levels of anti-GapC antibodies and the number maximum bacteria (expressed in CFU (log 10) / ml of milk) detected in all rooms (r = 0.74) (Figure 21), as well as with The total number of infected rooms (R2 = 0.74) (Figure 22). The correlation was calculated using the GraphPad Prism program, version 2.01 (GraphPad Software Inc., San Diego, California).
Esta correlación también se ilustra en las Figuras 23 y 24 en las que el grupo inmunizado con GapC se subdivide en individuos con una respuesta elevada e individuos con una respuesta baja. En esas figuras, los "individuos de título bajo" se refiere a los cuatro animales con la peor respuesta frente a GapC, mientras que los "individuos de título elevado" se refiere al resto del grupo. En el grupo de título elevado no se produjo colonización, mientras que incluso el grupo de título bajo mostró un número reducido de bacterias recogidas después de tres días.This correlation is also illustrated in the Figures 23 and 24 in which the group immunized with GapC is subdivided in individuals with a high response and individuals with a low response In those figures, the "title individuals low "refers to the four animals with the worst response in front of GapC, while the "high-title individuals" It refers to the rest of the group. In the high title group you don't know produced colonization while even the low title group showed a reduced number of bacteria collected after three days.
La respuesta inflamatoria se midió en función del recuento de células somáticas (es decir, linfocitos, neutrófilos y monocitos). Los recuentos de células somáticas se llevaron a cabo en un aparato de recuento Coulter utilizando técnicas estándar, tal como recomienda el Agriculture and Agri-Food Canada Pamphlet IDF50B (1985) "Milk and Milk products-Methods of Sampling". Las muestras siempre se analizaron dentro de las primeras 48 horas tras su recogida y fijación, en los días 1 y 7 tras la provocación.The inflammatory response was measured based on the somatic cell count (i.e. lymphocytes, neutrophils and monocytes). Somatic cell counts were carried out in a Coulter counting apparatus using standard techniques, as recommended by Agriculture and Agri-Food Canada Pamphlet IDF50B (1985) "Milk and Milk products-Methods of Sampling" . Samples were always analyzed within the first 48 hours after collection and fixation, on days 1 and 7 after provocation.
Se determinó el número de células somáticas presentes en la glándula cada día tras la entrada en contacto con el microorganismo. En el cuarto no infectado, el recuento se mantuvo constante durante el estudio mientras que en el día 1, el grupo tratado con GapC obtuvo unos resultados inferiores que el grupo inmunizado con placebo (Figura 25). La diferencia entre los grupos GapC y placebo fue estadísticamente significativa. Los resultados individuales del día 1 se muestran en la Figura 26; los resultados de los animales tratados con GapC a lo largo de los siete días posteriores a la entrada en contacto con el microorganismo se muestran en la Figura 27. Las muestras de los cuartos de los animales inmunizados con GapC no podían distinguirse de los cuartos sin provocación.The number of somatic cells was determined present in the gland every day after contact with The microorganism In the uninfected room, the count remained constant during the study while on day 1, the group treated with GapC obtained lower results than the group immunized with placebo (Figure 25). The difference between the groups GapC and placebo was statistically significant. The results Day 1 individuals are shown in Figure 26; the results of animals treated with GapC over seven days after coming into contact with the microorganism it shown in Figure 27. Samples of the rooms of the animals immunized with GapC could not be distinguished from the rooms without provocation
Por lo tanto, la inmunización con GapC redujo la respuesta inflamatoria que sigue a la provocación con S. dysgalactiae. Therefore, immunization with GapC reduced the inflammatory response that follows provocation with S. dysgalactiae.
Durante los últimos 3 días del ensayo con las vacunas se recuperó una población mixta bacteriana de las secreciones de la glándula mamaria. Un análisis posterior con el ensayo API 20 Strep confirmó la identidad de las cepas presentes en la mezcla como S. dysgalactiae y S. uberis, representando el segundo de ellos una infección natural que tuvo lugar durante el ensayo. El grupo que fue inmunizado con GapC parecía mostrar una protección cruzada significativa frente a la colonización por S. uberis (véase la Figura 20), indicando que GapC quizás sea un antígeno con una amplia capacidad de protección cruzada frente a la infección por múltiples especies de estreptococos.During the last 3 days of the vaccine trial, a mixed bacterial population recovered from the secretions of the mammary gland. A subsequent analysis with the API 20 Strep test confirmed the identity of the strains present in the mixture as S. dysgalactiae and S. uberis , the second of them representing a natural infection that took place during the test. The group that was immunized with GapC appeared to show significant cross-protection against colonization by S. uberis (see Figure 20), indicating that GapC may be an antigen with a broad cross-protection ability against infection by multiple species of streptococci.
De esta forma, la vacunación con GapC de S. dysgalactiae es por tanto capaz de proporcionar protección cruzada frente a la infección por S. uberis.Thus, vaccination with GapC of S. dysgalactiae is therefore capable of providing cross protection against infection by S. uberis .
Así, se describe la clonación, expresión y caracterización de diversas proteínas GapC de unión a plasmina, así como métodos de utilización de las mismas.Thus, the cloning, expression and characterization of various plasmin-binding GapC proteins, as well as methods of using them.
<110> University of Saskatchewan<110> University of Saskatchewan
\hskip1cm Bolton, Alexandra J.Bolton, Alexandra J.
\hskip1cm Perez-Casal, JosePerez-Casal, Joseph
\hskip1cm Fontaine, Michael\ hskip1cm Fontaine, Michael
\hskip1cm Potter, Andrew A.Potter, Andrew A.
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<120> INMUNIZACIÓN DE GANADO VACUNO LECHERO CON PROTEÍNA GapC FRENTE A INFECCIONES POR Streptococcus <120> IMMUNIZATION OF MILK VACCINE LIVESTOCK WITH GapC PROTEIN AGAINST INFECTIONS BY Streptococcus
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<130> O8-891814WO<130> O8-891814WO
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<140><140>
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<141><141>
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<160> 12<160> 12
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<170> PatentIn Ver. 2.0<170> PatentIn Ver. 2.0
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<220><220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador gapC1<223> Sequence description artificial: gapC1 primer
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador gapC1r<223> Sequence description artificial: gapC1r primer
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