BR122024025431B1 - Use of an anti-CCR8 antibody in simultaneous, separate, or sequential combination with one or more additional therapeutically active compounds to induce ADCP in a human patient with a tumor. - Google Patents
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Abstract
ANTICORPOS DE CCR8 PARA APLICAÇÕES TERAPÊUTICAS, SEU USO E MÉTODO DE PRODUÇÃO, CONJUGADO, COMPOSIÇÃO FARMACÊUTICA, POLINUCLEOTÍDEO, VETOR, CÉLULA ISOLADA E KIT. A presente invenção refere-se a ferramentas e métodos para gerar anticorpos que se ligam especificamente a receptores de quimiocinas, tais como receptores de quimiocinas CC ou CXC. São fornecidos polipeptídeos sulfatados isolados e seus conjugados, que podem ser usados, por exemplo, como antígenos ou para panning fora do alvo para facilitar a geração de anticorpos receptores de quimiocina anti-humano, anticinomolgo e/ou anticamundongo, por exemplo para a geração de anticorpos com CDRs totalmente humanas e/ou outras propriedades favo-ráveis para uso terapêutico. Além disso, a invenção refere-se a anticorpos e seus conjugados que podem ser obtidos pela aplicação de tais ferramentas e métodos. São fornecidos anticorpos que se ligam especificamente ao CCR8 humano, cinomolgo e/ou murino com propriedades favoráveis para uso terapêutico, tais como anticorpos de reação cruzada, anticorpos totalmente humanos, anticorpos de baixa internalização (incluindo não internalizantes) e anticorpos que induzem eficazmente ADCC e/ou ADCP em células Treg. Também são fornecidos usos médicos dos anticorpos ou conjugados inventivos e/ou métodos de tratamento compreendendo a administração dos anticorpos a um paciente ou (...).CCR8 ANTIBODIES FOR THERAPEUTIC APPLICATIONS, THEIR USE AND PRODUCTION METHOD, CONJUGATE, PHARMACEUTICAL COMPOSITION, POLYNUCLEOTIDE, VECTOR, ISOLATED CELL AND KIT. The present invention relates to tools and methods for generating antibodies that bind specifically to chemokine receptors, such as CC or CXC chemokine receptors. Isolated sulfated polypeptides and their conjugates are provided, which can be used, for example, as antigens or for off-target panning to facilitate the generation of anti-human, anti-cynomolgus and/or anti-mouse chemokine receptor antibodies, for example for the generation of antibodies with fully human CDRs and/or other properties favorable for therapeutic use. Furthermore, the invention relates to antibodies and their conjugates that can be obtained by applying such tools and methods. Antibodies that bind specifically to human, cynomolgus, and/or murine CCR8 with properties favorable for therapeutic use are provided, such as cross-reacting antibodies, fully human antibodies, low internalization antibodies (including non-internalizing antibodies), and antibodies that effectively induce ADCC and/or ADCP in Treg cells. Medical uses of the inventive antibodies or conjugates and/or treatment methods comprising administering the antibodies to a patient or (...) are also provided.
Description
[001] A presente invenção refere-se a ferramentas e métodos para a geração de anticorpos que se ligam especificamente aos receptores de quimiocina, tais como receptores de quimiocina CC ou CXC. São fornecidos polipeptídeos sulfatados isolados e conjugados dos mesmos, que podem ser usados, por exemplo, como antígenos ou para panning fora do alvo para facilitar a geração de anticorpos de receptor de quimiocina anti-humano, anticinomolgo e/ou anticamundongo, por exemplo para a geração de anticorpos com CDRs totalmente humanas e/ou outras propriedades favoráveis para uso terapêutico.[001] The present invention relates to tools and methods for generating antibodies that bind specifically to chemokine receptors, such as CC or CXC chemokine receptors. Isolated and conjugated sulfated polypeptides are provided, which can be used, for example, as antigens or for off-target panning to facilitate the generation of anti-human, anti-cynomolgus and/or anti-mouse chemokine receptor antibodies, for example for the generation of antibodies with fully human CDRs and/or other properties favorable for therapeutic use.
[002] Além disso, a presente invenção refere-se a anticorpos econjugados dos mesmos que podem ser obtidos pela aplicação das ferramentas e métodos acima mencionados. São fornecidos anticorpos que se ligam especificamente a CCR8 humano, cinomolgo e/ou murino com propriedades favoráveis para uso terapêutico, tais como anticorpos de reação cruzada, anticorpos totalmente humanos, anticorpos de baixa internalização (incluindo não internalizantes) e anticorpos que induzem eficazmente ADCC e/ou ADCP em células Treg.[002] In addition, the present invention relates to antibody conjugates thereof that can be obtained by applying the tools and methods mentioned above. Antibodies are provided that bind specifically to human, cynomolgus and/or murine CCR8 with properties favorable for therapeutic use, such as cross-reacting antibodies, fully human antibodies, low internalization antibodies (including non-internalizing) and antibodies that effectively induce ADCC and/or ADCP in Treg cells.
[003] São também fornecidos usos médicos dos anticorpos ouconjugados inventivos e/ou métodos de tratamento compreendendo a administração desses anticorpos a um paciente ou indivíduo, sozinho ou em combinação. Biomarcadores, métodos de estratificação e métodos de diagnóstico são finalmente fornecidos para prever ou avaliar a capacidade de resposta à monoterapia ou terapia combinada de anticorpos anti-CCR8.[003] Medical uses of the inventive antibodies or conjugates and/or treatment methods comprising administering these antibodies to a patient or individual, alone or in combination, are also provided. Biomarkers, stratification methods and diagnostic methods are finally provided to predict or assess responsiveness to monotherapy or combination therapy of anti-CCR8 antibodies.
[004] Além disso, a invenção fornece ferramentas e métodos para produzir os anticorpos anteriores, composições farmacêuticas, usos diagnósticos dos anticorpos e kits com instruções de uso.[004] In addition, the invention provides tools and methods for producing the aforementioned antibodies, pharmaceutical compositions, diagnostic uses of the antibodies, and kits with instructions for use.
[005] Os receptores de quimiocinas CXC e CC são receptoresespecíficos acoplados à proteína G de sete transmembranas que medeiam a migração celular em gradientes quimiotáticos. Os receptores de quimiocinas são uma classe alvo desafiadora para a geração de anticorpos devido às suas propriedades estruturais, biofísicas e biológicas inerentes. Existem várias razões para as dificuldades em obter anticorpos ideais contra receptores de quimiocinas que serão discutidas de forma exemplar, com ênfase no CCR8 humano.[005] CXC and CC chemokine receptors are seven-transmembrane G protein-coupled specific receptors that mediate cell migration in chemotactic gradients. Chemokine receptors are a challenging target class for antibody generation due to their inherent structural, biophysical, and biological properties. There are several reasons for the difficulties in obtaining ideal antibodies against chemokine receptors, which will be discussed in an exemplary manner, with emphasis on human CCR8.
[006] Os receptores de quimiocinas são caracterizados por setedomínios embutidos na membrana celular e, portanto, não podem ser facilmente purificados em sua confirmação nativa. Um receptor de quimiocina nativo purificado terá sido removido do ambiente da membrana e, portanto, é provável que seja conformacionalmente comprometido. Essas estruturas corrompidas geralmente não são adequadas para a geração de anticorpos, porque os anticorpos são necessários para reconhecer o antígeno intacto conforme ele é apresentado na superfície da célula. Embora alguns receptores de quimiocinas, como CXCR4 e CCR5, possuam alguma estabilidade inerente que permite a purificação em detergentes suaves, isso não se aplica à maioria dos receptores de quimiocinas (Hutchings, Catherine J., et al. "Opportunities for therapeutic antibodies directed at G-protein-coupled receptors." Nature reviews Drug discovery 16.11 (2017): 787.). Isso é enfatizado pelo fato de que até hoje nenhuma estrutura cristalina de raios X está disponível para CCR8 no Protein Data Bank PDB (rcsb.org).[006] Chemokine receptors are characterized by seven domains embedded in the cell membrane and therefore cannot be easily purified into their native conformation. A purified native chemokine receptor will have been removed from the membrane environment and is therefore likely to be conformationally compromised. These corrupted structures are generally unsuitable for antibody generation because antibodies are required to recognize the intact antigen as it is presented on the cell surface. Although some chemokine receptors, such as CXCR4 and CCR5, possess some inherent stability that allows purification in mild detergents, this does not apply to most chemokine receptors (Hutchings, Catherine J., et al. "Opportunities for therapeutic antibodies directed at G-protein-coupled receptors." Nature reviews Drug discovery 16.11 (2017): 787.). This is emphasized by the fact that to date no X-ray crystal structure is available for CCR8 in the Protein Data Bank PDB (rcsb.org).
[007] Em consequência, a solubilização para obter as quantidades necessárias de proteína na conformação nativa, bem como a orientação e dobramento corretos para uso como imunógeno, é difícil para os receptores de quimiocinas (conforme, Klarenbeek, Alex et al. "Targeting chemokines and chemokine receptors with antibodies." Drug Discovery Today: Technologies 9.4 (2012): e237-e244.).[007] Consequently, solubilization to obtain the necessary amounts of protein in the native conformation, as well as the correct orientation and folding for use as an immunogen, is difficult for chemokine receptors (as per, Klarenbeek, Alex et al. "Targeting chemokines and chemokine receptors with antibodies." Drug Discovery Today: Technologies 9.4 (2012): e237-e244.).
[008] Uma representação esquemática da estrutura geral doCCR8 humano é mostrada na Fig. 2b. Dos 355 aminoácidos, os resíduos 1 a 35 (N term), 94 a 107 (ECL1), 172 a 202 (ECL2) e 264 a 280 (ECL3) foram previstos como domínios extracelulares (uniprot.org). Assume-se que esses domínios extracelulares adotem uma estrutura terciária, estabilizada por ligações de dissulfeto. Em média, menos de 30% de um receptor de quimiocina é desse modo exposto na superfície da célula. Em consequência, os receptores de quimiocinas e parti-cularmente CCR8 não são facilmente acessíveis para ligação de anticorpos, como descrito também no WO200744756.[008] A schematic representation of the general structure of human CCR8 is shown in Fig. 2b. Of the 355 amino acids, residues 1 to 35 (N term), 94 to 107 (ECL1), 172 to 202 (ECL2), and 264 to 280 (ECL3) have been predicted to be extracellular domains (uniprot.org). These extracellular domains are assumed to adopt a tertiary structure, stabilized by disulfide bonds. On average, less than 30% of a chemokine receptor is thus exposed on the cell surface. Consequently, chemokine receptors, and particularly CCR8, are not readily accessible for antibody binding, as also described in WO200744756.
[009] Além disso, anticorpos gerados contra peptídeos correspondentes aos domínios extracelulares de receptores de quimiocinas muitas vezes não reconhecem o receptor intacto na célula, possivelmente devido às diferenças na estrutura secundária. Em consequência, os pesquisadores neste campo tiveram uma baixa taxa de sucesso no desenvolvimento de anticorpos (Tschammer, Nuska, ed. Che- mokines: chemokines and their receivers in drug discovery. Vol. 14. Springer, 2015, Capítulo por JE Pease & R. Horuk, seção 6, página 12, 2° parágrafo).[009] Furthermore, antibodies generated against peptides corresponding to the extracellular domains of chemokine receptors often fail to recognize the intact receptor on the cell, possibly due to differences in secondary structure. Consequently, researchers in this field have had a low success rate in developing antibodies (Tschammer, Nuska, ed. Chemokines: chemokines and their receivers in drug discovery. Vol. 14. Springer, 2015, Chapter by JE Pease & R. Horuk, section 6, page 12, 2nd paragraph).
[0010] A geração de anticorpos para obter anticorpos de CCR8antimurino parece um pouco menos difícil e abordagens convencionais como a descrita por Kremer e Márquez podem ser reproduzidas pelos inventores (D'Ambrosio, Daniele and Francesco Sinigaglia. Cell Migra- tion in Inflammation and Immunity. Springer, 2004., Capítulo de Kremer and Márquez p. 243 - 260). CCR8 de murino e humano têm uma identidade de sequência de ~ 70%, que é ainda menor para os domínios extracelulares, como descrito em mais detalhes no Exemplo 2. No entanto, Kremer e Márquez discutem que a produção de anticorpos mo- noclonais de receptor de quimiocinas anticamundongo é um desafio exigente e que os anticorpos contra receptores de quimiocinas muri- nos são comparativamente escassos, apesar do tempo que passou desde que suas sequências de aminoácidos foram reportadas pela primeira vez.[0010] Generating antibodies to obtain antimurine CCR8 antibodies seems somewhat less difficult, and conventional approaches such as that described by Kremer and Márquez can be reproduced by the inventors (D'Ambrosio, Daniele and Francesco Sinigaglia. Cell Migration in Inflammation and Immunity. Springer, 2004., Chapter by Kremer and Márquez pp. 243-260). Murine and human CCR8 have a sequence identity of ~70%, which is even lower for the extracellular domains, as described in more detail in Example 2. However, Kremer and Márquez discuss that producing monoclonal antimouse chemokine receptor antibodies is a demanding challenge and that antibodies against murine chemokine receptors are comparatively scarce, despite the time that has passed since their amino acid sequences were first reported.
[0011] Apesar das dificuldades associadas à sua geração, os anticorpos direcionados aos receptores de quimiocinas CC têm sido sugeridos como ferramentas terapêuticas promissoras em várias doenças, por exemplo, com base em insights mecanicistas em doenças com envolvimento de células imunes ou em várias indicações de câncer caracterizadas por expressão aberrante de receptores de quimiocinas.[0011] Despite the difficulties associated with their generation, antibodies targeting CC chemokine receptors have been suggested as promising therapeutic tools in several diseases, for example, based on mechanistic insights in diseases involving immune cells or in various cancer indications characterized by aberrant expression of chemokine receptors.
[0012] Em 2004, Curiel et al. poderia mostrar para as células T re-gulatórias CD4+CD25+FOXP3+ (células Tregs ou Tregs) em 104 indivíduos afetados com carcinoma ovariano, que as células Treg tumo- rais humanas suprimem a imunidade das células T específicas do tumor e contribuem para o crescimento de tumores humanos in vivo (Curiel, Tyler J., et al., "Specific recruitment of regulatory T cells in ovarian carcinoma fosters immune privilege and predicts reduced survival." Nature medicine 10.9 (2004): 942-949.)[0012] In 2004, Curiel et al. were able to show for CD4+CD25+FOXP3+ regulatory T cells (Tregs or Tregs) in 104 individuals affected with ovarian carcinoma, that human tumor Treg cells suppress tumor-specific T cell immunity and contribute to the growth of human tumors in vivo (Curiel, Tyler J., et al., "Specific recruitment of regulatory T cells in ovarian carcinoma fosters immune privilege and predicts reduced survival." Nature medicine 10.9 (2004): 942-949.)
[0013] As células tumorais e os macrófagos microambientais produzem quimiocinas, tal como a CCL22 que medeia o tráfego de células Treg para o tumor. Altos níveis de Tregs no microambiente tumoral não estão apenas associados a um prognóstico ruim em muitos cânceres, tais como câncer de ovário, mama, rim e pâncreas, mas causam a supressão da resposta imune contra esses cânceres, por exemplo, suprimindo a ação do células efetoras do sistema imunológico. Esse recrutamento específico de células Treg representa, portanto, um mecanismo pelo qual os tumores podem promover o privilégio imunológi- co. Portanto, foi sugerido bloquear a migração ou função das células Treg para derrotar o câncer humano.[0013] Tumor cells and microenvironmental macrophages produce chemokines, such as CCL22, which mediates the trafficking of Treg cells to the tumor. High levels of Tregs in the tumor microenvironment are not only associated with a poor prognosis in many cancers, such as ovarian, breast, kidney, and pancreatic cancer, but also cause suppression of the immune response against these cancers, for example, by suppressing the action of effector cells of the immune system. This specific recruitment of Treg cells therefore represents a mechanism by which tumors can promote immunological privilege. Therefore, it has been suggested that blocking the migration or function of Treg cells can defeat human cancer.
[0014] Estando cientes da descoberta de Curiel, duas equipes independentes em torno de Plitas/Rudensky e De Simo- ne/Abrignani/Pagani descobriram que células Treg infiltrantes tumorais são caracterizadas pela expressão seletiva de CCR8. De fato, a seletividade da depleção de células Treg para as Tregs que infiltram o tumor é importante porque a depleção sistêmica de células Treg pode causar autoimunidade grave (Nishikawa, Hiroyoshi, and Shimon Saka- guchi. "Regulatory T cells in tumor immunity." International journal of cancer 127.4 (2010): 759-767.). A busca por um marcador Treg específico é complicada pelo fato de que as células Treg apresentam um padrão molecular que se assemelha aos linfócitos efetores, confrome o Exemplo 11.2. Tanto as Tregs periféricas quanto as células efetoras específicas do tumor não devem sofrer fogo amigo durante a depleção das Tregs intratumorais, porque as Tregs periféricas são importantes para evitar a autoimunidade, enquanto as células efetoras específicas do tumor ajudam a manter o tumor sob controle.[0014] Aware of Curiel's discovery, two independent teams around Plitas/Rudensky and De Simone/Abrignani/Pagani discovered that tumor-infiltrating Treg cells are characterized by the selective expression of CCR8. In fact, the selectivity of Treg cell depletion for tumor-infiltrating Tregs is important because systemic depletion of Treg cells can cause severe autoimmunity (Nishikawa, Hiroyoshi, and Shimon Sakaguchi. "Regulatory T cells in tumor immunity." International journal of cancer 127.4 (2010): 759-767.). The search for a specific Treg marker is complicated by the fact that Treg cells exhibit a molecular pattern that resembles effector lymphocytes, as shown in Example 11.2. Neither peripheral Tregs nor tumor-specific effector cells should suffer friendly fire during the depletion of intratumoral Tregs, because peripheral Tregs are important for preventing autoimmunity, while tumor-specific effector cells help keep the tumor under control.
[0015] Com base nesses achados, várias equipes sugeriram o usode anticorpos de CCR8 para a depleção seletiva de células T regulató- rias infiltrantes de tumor. Embora alguns tenham apresentado dados confirmando a redução do tumor em modelos tumorais usando anticorpos de CCR4 antimurino ou CCR8 antimurino, confirmando assim o conceito mecanicista de depleção de Treg, há uma necessidade de anticorpos terapêuticos CCR8 anti-humanos, por exemplo, com propriedades superiores em formulários.[0015] Based on these findings, several teams have suggested the use of CCR8 antibodies for the selective depletion of tumor-infiltrating regulatory T cells. Although some have presented data confirming tumor reduction in tumor models using anti-murine CCR4 or anti-murine CCR8 antibodies, thus confirming the mechanistic concept of Treg depletion, there is a need for therapeutic anti-human CCR8 antibodies, for example, with superior properties in formulations.
[0016] A seleção de um antígeno na geração de anticorpos é crucial para as propriedades dos anticorpos resultantes e pode apresentar sérios problemas, como descrito em outro lugar aqui, para receptores de quimiocina, tal como CCR8. Em alguns casos, os anticorpos foram obtidos usando células inteiras como antígenos, que foram projetados para superexpressão de receptores de quimiocinas. Pelo menos para alguns receptores de quimiocinas, essas abordagens parecem sofrer de baixo número de ligantes resultantes. Além disso, os anticorpos obtidos com esses antígenos são frequentemente caracterizados por ligação fora do alvo e baixa especificidade para o receptor de quimioci- na. Se células inteiras são usadas como antígenos, epítopos imuno- dominantes podem mascarar outros menos antigênicos, onde os menos antigênicos teriam o potencial de gerar os anticorpos seletivos e específicos desejados.[0016] The selection of an antigen in antibody generation is crucial for the properties of the resulting antibodies and can present serious problems, as described elsewhere here, for chemokine receptors such as CCR8. In some cases, antibodies have been obtained using whole cells as antigens, which were engineered for overexpression of chemokine receptors. At least for some chemokine receptors, these approaches appear to suffer from low ligand counts. Furthermore, antibodies obtained with these antigens are often characterized by off-target binding and low specificity for the chemokine receptor. If whole cells are used as antigens, immunodominant epitopes can mask other less antigenic ones, where the less antigenic ones would have the potential to generate the desired selective and specific antibodies.
[0017] Para CCR8, uma abordagem de "célula inteira" bem-sucedida foi descrita no WO2007044756 (ICOS). Em resumo, os anticorpos monoclonais anti-CCR8 foram desenvolvidos imunizando camundongos Balb/c com células irradiadas transfectadas com CCR8 que tinham altos níveis de CCR8 expressos na superfície celular. As células do baço desses camundongos foram fundidas por métodos padrão para criar hibridomas que produzem os anticorpos. Os pools positivos foram identificados por FACS e foram clonados por diluição limitante. Dois dos anticorpos, 433H e 459M, mostraram uma reativi- dade específica ao CCR8 humano na imuno-histoquímica. O anticorpo 433H ainda está disponível e pode ser adquirido na BD.[0017] For CCR8, a successful "whole cell" approach was described in WO2007044756 (ICOS). In summary, anti-CCR8 monoclonal antibodies were developed by immunizing Balb/c mice with irradiated cells transfected with CCR8 that had high levels of CCR8 expressed on the cell surface. Spleen cells from these mice were fused by standard methods to create hybridomas that produce the antibodies. Positive pools were identified by FACS and cloned by limiting dilution. Two of the antibodies, 433H and 459M, showed specific reactivity to human CCR8 in immunohistochemistry. The 433H antibody is still available and can be purchased from BD.
[0018] A Biolegend distribui o clone L263G8, um anticorpo deCCR8 anti-humano de IgG2a de camundongo purificado que foi gerado usando transfectantes de CCR8 humanos como imunógeno.[0018] Biolegend distributes the L263G8 clone, a purified mouse IgG2a anti-human CCR8 antibody that was generated using human CCR8 transfectants as an immunogen.
[0019] Kremer e Márquez descreveram a geração de anticorposmonoclonais contra o CCR8 de murino (D'Ambrosio, Daniele and Francesco Sinigaglia. Cell Migration in Inflammation and Immunity. Springer, 2004., Capítulo de Kremer e Márquez p. 243 - 260). Em re-sumo, Kremer e Márquez descrevem o uso de peptídeos derivados dos domínios extracelulares do CCR8 de murino como imunógenos, mas não sugerem a sulfatação das tirosinas. De fato, os inventores descobriram que a abordagem descrita por Kremer e Márquez pode ser aplicada com sucesso para anticorpos que reconhecem CCR8 de murino, mas tem baixas taxas de sucesso para anticorpos que reconhecem CCR8 humano.[0019] Kremer and Márquez described the generation of monoclonal antibodies against murine CCR8 (D'Ambrosio, Daniele and Francesco Sinigaglia. Cell Migration in Inflammation and Immunity. Springer, 2004., Chapter by Kremer and Márquez p. 243 - 260). In summary, Kremer and Márquez describe the use of peptides derived from the extracellular domains of murine CCR8 as immunogens, but do not suggest sulfation of tyrosines. In fact, the inventors found that the approach described by Kremer and Márquez can be successfully applied to antibodies that recognize murine CCR8, but has low success rates for antibodies that recognize human CCR8.
[0020] Schaerli et al. geraram anticorpos CCR8 anti-humanosimunizando coelhos com um conjugado de peptídeo CCR8 humano, correspondendo às posições 1 a 34 da região N-terminal de CCR8 acoplada a KLH ou BSA, mas, novamente, não sugerem sulfatação das tirosinas (Schaerli, Patrick, et al., "A skin-selective homing mechanism for human immune surveillance T cells."[0020] Schaerli et al. generated anti-human CCR8 antibodies by immunizing rabbits with a human CCR8 peptide conjugate, corresponding to positions 1 to 34 of the N-terminal region of CCR8 coupled to KLH or BSA, but, again, they do not suggest sulfation of the tyrosines (Schaerli, Patrick, et al., "A skin-selective homing mechanism for human immune surveillance T cells."
[0021] Um anticorpo monoclonal murino que se liga a um peptídeocontendo 26 aminoácidos da porção N-terminal extracelular de CCR8 foi descrito por Haque et al. (Haque, Nasreen S., et al. "The chemokine receptor CCR8 mediates human endothelial cell chemotaxis induced by I-309 and Kaposi sarcoma herpesvirus-encoded vMIP-I and by lipoprotein (a)-stimulated endothelial cell conditioned medium." Blood, The Journal of the American Society of Hematology 97.1 (2001): 39-45.).[0021] A murine monoclonal antibody that binds to a 26-amino acid-containing peptide from the extracellular N-terminal portion of CCR8 was described by Haque et al. (Haque, Nasreen S., et al. "The chemokine receptor CCR8 mediates human endothelial cell chemotaxis induced by I-309 and Kaposi sarcoma herpesvirus-encoded vMIP-I and by lipoprotein (a)-stimulated endothelial cell conditioned medium." Blood, The Journal of the American Society of Hematology 97.1 (2001): 39-45.).
[0022] Nenhum desses métodos para geração de anticorpos usaum polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de quimiocina ou proteína transmem- branar como antígeno. O uso de um polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo o TRD de um receptor de quimiocina ou proteína transmembranar como antígeno influencia as características estrutu- rais e funcionais do conjunto de anticorpos obtidos, como descrito em outro lugar aqui.[0022] None of these methods for generating antibodies uses an isolated sulfated polypeptide comprising the tyrosine-rich domain (TRD) of a chemokine receptor or transmembrane protein as an antigen. The use of an isolated sulfated polypeptide comprising the TRD of a chemokine receptor or transmembrane protein as an antigen influences the structural and functional characteristics of the antibody set obtained, as described elsewhere herein.
[0023] Em consequência, assume-se que os anticorpos de acordocom a presente invenção se desviam em estrutura e função dos anticorpos da técnica anterior acima mencionados, por exemplo, pelo menos em sua afinidade por CCR8 sulfatado, em sua afinidade por CCR8 não sulfatado, em sua forma e grau de modulação do receptor sinalização, em seu comportamento de internalização, em reatividade cruzada, em clearace e comportamento farmacocinético e finalmente em depleção de Treg e/ou eficácia para aplicações terapêuticas.[0023] Consequently, it is assumed that the antibodies according to the present invention deviate in structure and function from the antibodies of the prior art mentioned above, for example, at least in their affinity for sulfated CCR8, in their affinity for non-sulfated CCR8, in their shape and degree of modulation of the signaling receptor, in their internalization behavior, in cross-reactivity, in clearance and pharmacokinetic behavior and finally in Treg depletion and/or efficacy for therapeutic applications.
[0024] Além disso, o uso dos antígenos descritos aqui permitiu ageração de anticorpos totalmente humanos. Ao contrário, os anticorpos descritos da técnica anterior para CCR8 são de origem não humana e se desviam de alguns dos anticorpos inventivos pelo menos porque não compreendem CDRs humanas.[0024] Furthermore, the use of the antigens described herein allowed the generation of fully human antibodies. In contrast, the antibodies described in the prior art for CCR8 are of non-human origin and deviate from some of the inventive antibodies at least because they do not comprise human CDRs.
[0025] A imunoterapia contra o câncer envolve o uso do sistemaimunológico de um indivíduo para tratar ou prevenir o câncer. As imu- noterapias normalmente exploram o fato de que as células cancerígenas geralmente têm moléculas sutilmente diferentes em sua superfície que podem ser detectadas pelo sistema imunológico, os antígenos do câncer. A imunoterapia, portanto, envolve a provocação do sistema imunológico para atacar as células tumorais por meio desses antíge- nos cancerígenos. No entanto, alguns cânceres, tais como tumores sólidos ou cânceres hematológicos, podem escapar da vigilância imu- nológica. Por exemplo, a infiltração tumoral por células T regulatórias (células Treg ou Tregs) e, mais especificamente, a baixa relação de células T efetoras (Teff) para Tregs foram propostas como fatores críticos para esconder o tumor do sistema imunológico (Smyth, Mark J., Shin Foong Ngiow, and Michele WL Teng. "Targeting regulatory T cells in tumor immunotherapy." Immunology and cell biology 92.6 (2014): 473-474.).[0025] Cancer immunotherapy involves using an individual's immune system to treat or prevent cancer. Immunotherapies typically exploit the fact that cancer cells often have subtly different molecules on their surface that can be detected by the immune system—cancer antigens. Immunotherapy, therefore, involves provoking the immune system to attack tumor cells using these cancer antigens. However, some cancers, such as solid tumors or hematological cancers, may escape immune surveillance. For example, tumor infiltration by regulatory T cells (Treg cells or Tregs) and, more specifically, the low ratio of effector T cells (Teff) to Tregs have been proposed as critical factors in hiding the tumor from the immune system (Smyth, Mark J., Shin Foong Ngiow, and Michele WL Teng. "Targeting regulatory T cells in tumor immunotherapy." Immunology and cell biology 92.6 (2014): 473-474.).
[0026] Células T regulatórias que expressam Foxp3, que são indispensáveis para prevenir a autoimunidade, são conhecidas por suprimir eficazmente a imunidade tumoral. As células Treg infiltram-se abundantemente nos tecidos tumorais, o que muitas vezes está associado a um mau prognóstico em pacientes com câncer. A remoção de células Treg aumenta as respostas imunes antitumorais, mas também pode provocar autoimunidade. Uma questão chave para adaptar a imunoterapia contra o câncer com alvo Treg reside na depleção específica de células Treg que se infiltram nos tecidos tumorais sem afetar as células T efetoras reativas ao tumor, enquanto suprime a autoimu- nidade.[0026] Regulatory T cells expressing Foxp3, which are essential for preventing autoimmunity, are known to effectively suppress tumor immunity. Treg cells infiltrate tumor tissues abundantly, which is often associated with a poor prognosis in cancer patients. Removing Treg cells increases antitumor immune responses but can also trigger autoimmunity. A key issue in adapting Treg-targeted cancer immunotherapy lies in the specific depletion of Treg cells that infiltrate tumor tissues without affecting tumor-reactive effector T cells, while suppressing autoimmunity.
[0027] Em 2010, vários grupos já haviam investigado que a remoção de Treg, por exemplo, por depleção com anticorpos anti-CD25, poderia melhorar a imunidade antitumoral em camundongos. Foi demonstrado que a depleção de Tregs antes da inoculação de células tumorais levou à sua rejeição eficiente, enquanto a depleção de Treg ocorrendo simultaneamente ou após a inoculação do tumor não resultou em regressão do tumor. Além disso, foi sugerido que isso se deve ao fato de que os anticorpos depletores administrados também removeram as células T efetoras que expressam CD25, enquanto as Tregs CD25-Foxp3+ persistiram (Klages, Katjana, et al. "Selective depletion of Foxp3+ regulatory T cells improves effective therapeutic vaccination against established melanoma." Cancer research 70.20 (2010): 77887799.).[0027] In 2010, several groups had already investigated that the removal of Tregs, for example, by depletion with anti-CD25 antibodies, could improve antitumor immunity in mice. It was demonstrated that depletion of Tregs before inoculation of tumor cells led to their efficient rejection, while Treg depletion occurring simultaneously with or after tumor inoculation did not result in tumor regression. Furthermore, it was suggested that this is due to the fact that the administered depleting antibodies also removed effector T cells expressing CD25, while CD25-Foxp3+ Tregs persisted (Klages, Katjana, et al. "Selective depletion of Foxp3+ regulatory T cells improves effective therapeutic vaccination against established melanoma." Cancer research 70.20 (2010): 77887799.).
[0028] Em 2015, o anticorpo monoclonal CCR4 antimurino humanizado não fucosilado, mogamulizumab (KW-0761), foi avaliado em um estudo clínico para pacientes com cânceres positivos para CCR4 (Kurose, Koji, et al. "Phase Ia study of FoxP3+ CD4 Treg depletion by infusion of a humanized anti-CCR4 antibody, KW-0761, in cancer patients." Clinical Cancer Research 21.19 (2015): 4327-4336.). O CCR4 é expresso em células T regulatórias. De fato, o mogamulizumabe esgotou eficazmente as células Treg e foi observado um aumento ou indução de respostas imunes específicas aos antígenos de câncer. No entanto, o mogamulizumab tem como alvo tanto Tregs periféricas quanto intratumorais e outras polulações de células efetoras, levando a efeitos colaterais imunológicos, tais como erupções cutâneas ou sín- drome de Stevens Johnson.[0028] In 2015, the non-fucosylated humanized anti-murine CCR4 monoclonal antibody, mogamulizumab (KW-0761), was evaluated in a clinical study for patients with CCR4-positive cancers (Kurose, Koji, et al. "Phase Ia study of FoxP3+ CD4 Treg depletion by infusion of a humanized anti-CCR4 antibody, KW-0761, in cancer patients." Clinical Cancer Research 21.19 (2015): 4327-4336.). CCR4 is expressed on regulatory T cells. In fact, mogamulizumab effectively depleted Treg cells and an increase or induction of specific immune responses to cancer antigens was observed. However, mogamulizumab targets both peripheral and intratumoral Tregs and other effector cell populations, leading to immunological side effects such as skin rashes or Stevens-Johnson syndrome.
[0029] Desse modo, embora o grande potencial para a depleçãode Tregs em terapias contra o câncer fosse óbvio, faltava um conceito para direcionar seletivamente as Tregs e evitar a autoimunidade evidente. Isso foi alterado com o trabalho de duas equipes em torno de Plitas/Rudensky e De Simone/Abrignani/Pagani em 2015 e 2016.[0029] Thus, although the great potential for Treg depletion in cancer therapies was obvious, a concept for selectively targeting Tregs and avoiding overt autoimmunity was lacking. This was changed with the work of two teams around Plitas/Rudensky and De Simone/Abrignani/Pagani in 2015 and 2016.
[0030] Plitas et al. demonstraram que CCR8 é expresso seletivamente por células Treg infiltradas de câncer de mama humano e imediatamente concluíram que direcionar o CCR8 representa uma abordagem imunoterapêutica promissora para o tratamento de pacientes com câncer de mama e outros tumores (Plitas, G., et al. "Abstract P404-11: A expressão preferida do receptor de quimiocina 8 (CCR8) em células T regulatórias (Treg) que inflitram o câncer de mama humano representa um novo alvo imunoterapêutico."(2016): P4-04.; Plitas, George, et al. "Regulatory T cells exhibit distinct features in human breast cancer." Immunity 45.5 (2016): 1122-1134.; US10087259).[0030] Plitas et al. demonstrated that CCR8 is selectively expressed by Treg cells infiltrating human breast cancer and immediately concluded that targeting CCR8 represents a promising immunotherapeutic approach for the treatment of patients with breast cancer and other tumors (Plitas, G., et al. "Abstract P404-11: Preferred expression of chemokine receptor 8 (CCR8) on regulatory T cells (Treg) infiltrating human breast cancer represents a novel immunotherapeutic target."(2016): P4-04.; Plitas, George, et al. "Regulatory T cells exhibit distinct features in human breast cancer." Immunity 45.5 (2016): 1122-1134.; US10087259).
[0031] Apenas logo após a publicação do trabalho inicial de Plitaset al., De Simone et al. publicaram uma análise sobre a paisagem transcricional de células T regulatórias infiltrantes de tumor e descobriram que as células Treg infiltrantes de tumor eram altamente imunos- supressoras e expressavam CCR8 em sua superfície celular como uma molécula de assinatura específica (De Simone, Marco, et al. "Transcriptional landscape of human tissue lymphocytes unveils uniqueness of tumor-infiltrating T regulatory cells." Immunity 45.5 (2016): 1135-1147., WO2017198631). Os autores descreveram que o CCR8 se correlacionou com mau prognóstico e concluíram que o CCR8 poderia ser um alvo terapêutico interessante para inibir o tráfego de células Treg para os sítios tumorais, sem perturbar o recrutamento de outras células T efetoras que não expressam CCR8.[0031] Just after the publication of Plitase et al.'s initial work, De Simone et al. published an analysis of the transcriptional landscape of tumor-infiltrating regulatory T cells and found that tumor-infiltrating Treg cells were highly immunosuppressive and expressed CCR8 on their cell surface as a specific signature molecule (De Simone, Marco, et al. "Transcriptional landscape of human tissue lymphocytes unveils uniqueness of tumor-infiltrating T regulatory cells." Immunity 45.5 (2016): 1135-1147., WO2017198631). The authors described that CCR8 correlated with poor prognosis and concluded that CCR8 could be an interesting therapeutic target for inhibiting Treg cell trafficking to tumor sites without disrupting the recruitment of other effector T cells that do not express CCR8.
[0032] O WO2018112032 e WO2018112033 descrevem métodospara diminuir o número ou atividade de células T regulatórias de infiltração tumoral (TITR) em um tumor compreendendo a administração de um agente que induz citotoxicidade em células que expressam um produto de um gene, por exemplo, CCR8.[0032] WO2018112032 and WO2018112033 describe methods for decreasing the number or activity of tumor infiltrating regulatory T cells (TITR) in a tumor comprising administering an agent that induces cytotoxicity in cells expressing a gene product, for example, CCR8.
[0033] O WO2018112033 e EP3431105 descrevem uma moléculaque pode modular a expressão e/ou função de pelo menos um marcador que é seletivamente desregulado em células T regulatórias infil- trantes de tumor para uso na prevenção e/ou tratamento deste tumor.[0033] WO2018112033 and EP3431105 describe a molecule that can modulate the expression and/or function of at least one marker that is selectively downregulated in tumor-infiltrating regulatory T cells for use in the prevention and/or treatment of this tumor.
[0034] O WO2018181425 refere-se a um anticorpo contra CCR8com atividade ADCC, para uso em um método de tratamento de um câncer, em que o anticorpo contra CCR8 é um anticorpo neutralizante de CCR8. O WO2018181425 não revela sequências de anticorpos específicas, mas refere-se ao clone CCR8 anticamundongo de rato SA214G2 distribuído pela BioLegend sob Cat. No. 150302. Este anticorpo foi usado como um anticorpo ferramenta para recapitular os efeitos antitumorigênicos previamente descritos da depleção de Treg em camundongos.[0034] WO2018181425 refers to an antibody against CCR8 with ADCC activity, for use in a cancer treatment method, wherein the antibody against CCR8 is a CCR8-neutralizing antibody. WO2018181425 does not disclose specific antibody sequences, but refers to the mouse anti-mouse CCR8 clone SA214G2 distributed by BioLegend under Cat. No. 150302. This antibody was used as a tool antibody to recapitulate the previously described antitumorigenic effects of Treg depletion in mice.
[0035] De acordo com a presente invenção, é fornecido um método que facilita a geração de anticorpos anti-CCR8 e produz anticorpos com propriedades superiores para usos terapêuticos. Os anticorpos de acordo com a presente invenção foram comparados com os anticorpos da técnica anterior e foram encontrados desvios na estrutura, função e eficácia terapêutica, como descrito em outro lugar aqui.[0035] According to the present invention, a method is provided that facilitates the generation of anti-CCR8 antibodies and produces antibodies with superior properties for therapeutic uses. The antibodies according to the present invention were compared with antibodies of the prior art and deviations in structure, function and therapeutic efficacy were found, as described elsewhere herein.
[0036] Visto que as abordagens da técnica anterior para gerar anticorpos para receptores de quimiocinas CC sofrem de baixas taxas de sucesso e os anticorpos resultantes geralmente mostram um desempenho ruim (conforme, por exemplo, o Exemplo 3), os inventores desenvolveram um novo método para gerar anticorpos para receptores de quimiocinas em geral e, em particular, para gerar anticorpos anti- CCR8.[0036] Since prior art approaches to generating antibodies to CC chemokine receptors suffer from low success rates and the resulting antibodies generally show poor performance (as, for example, in Example 3), the inventors developed a new method to generate antibodies to chemokine receptors in general and, in particular, to generate anti-CCR8 antibodies.
[0037] O uso de um polipeptídeo isolado especificamente modificado como antígeno para a seleção de anticorpos humanos CCR8 anti-humanos resolveu o problema para fornecer um método melhorado para geração de anticorpos contra receptores de quimiocinas CC e CXC, de modo que, por exemplo, os anticorpos anti-CCR8 totalmente humanos pudessem ser obtidos pela primeira vez, conforme o Exemplo 6. Em maiores detalhes, um polipeptídeo compreendendo o domínio rico em tirosina de CCR8 humano, opcionalmente incluindo o domínio LID, foi modificado pela introdução de modificações de sulfato em posições específicas para formar o antígeno, conforme o Exemplo 4, Tabela 4.1. Uma abordagem de exibição de fagos foi opcionalmente usada em conjunto com este antígeno especificamente modificado para selecionar os anticorpos CCR8 anti-humanos totalmente humanos. Em alternativa, os antigénios sulfatados podem ser utilizados em vários outros métodos, por exemplo em abordagens de imunização convencionais.[0037] The use of a specifically modified isolated polypeptide as an antigen for the selection of human anti-human CCR8 antibodies solved the problem of providing an improved method for generating antibodies against CC and CXC chemokine receptors, so that, for example, fully human anti-CCR8 antibodies could be obtained for the first time, as per Example 6. In greater detail, a polypeptide comprising the tyrosine-rich domain of human CCR8, optionally including the LID domain, was modified by introducing sulfate modifications at specific positions to form the antigen, as per Example 4, Table 4.1. A phage display approach was optionally used in conjunction with this specifically modified antigen to select fully human anti-human CCR8 antibodies. Alternatively, sulfated antigens can be used in several other methods, for example in conventional immunization approaches.
[0038] Os anticorpos obtidos mostraram um excelente perfil de ligação para o antígeno sulfatado e o alvo biológico expresso em condições fisiológicas, conforme os Exemplos 6, 10.1.1, mas uma afinidade comparativamente baixa ou nenhuma para o antígeno não modificado, conforme o Exemplo 10.1.2, Exemplo 10.1.3, demonstrando que os resíduos sulfatados eram realmente cruciais para a ligação do anticorpo ao antígeno. Além disso, os anticorpos inventivos mostraram uma ligação excelente e também específica em linhagens celulares projetadas para expressar CCR8 humano, cinomolgo ou murino, e também em Tregs humanos ativados, conforme o Exemplo 10.1.1.[0038] The antibodies obtained showed an excellent binding profile for the sulfated antigen and the biological target expressed under physiological conditions, as per Examples 6, 10.1.1, but a comparatively low or no affinity for the unmodified antigen, as per Examples 10.1.2, 10.1.3, demonstrating that the sulfated residues were indeed crucial for antibody-antigen binding. Furthermore, the inventive antibodies showed excellent and specific binding to cell lines engineered to express human, cynomolgus, or murine CCR8, and also to activated human Tregs, as per Example 10.1.1.
[0039] Das seis alças de CDR de um anticorpo, a alça H3 mostra amaior diversidade estrutural e está localizada no centro do sítio de ligação. Ele também ganha mais mutações por maturação de afinidade e tem em média o maior número de contatos com o antígeno. Portanto, desempenha um papel crucial na ligação ao antígeno. Após análise da estrutura específica dos anticorpos obtidos com o método de acordo com a presente invenção, verificou-se surpreendentemente que a composição da HCDR3 era estruturalmente diferente dos domínios HCDR3 humanos usuais, conforme o exemplo 9. Em particular, os domínios HCDR3 dos anticorpos com as propriedades terapeutica- mente mais benéficas e ligação específica ao CCR8 foram caracterizados por uma frequência média de ~ 21% de resíduos de tirosina e um teor médio de histidina de ~ 10%, enfatizando um impacto benéfico desses resíduos sobre o reconhecimento do antígeno sulfatado específico (conforme a Tabela 9.2).[0039] Of the six CDR loops of an antibody, the H3 loop shows the greatest structural diversity and is located in the center of the binding site. It also acquires more mutations through affinity maturation and has, on average, the highest number of contacts with the antigen. Therefore, it plays a crucial role in antigen binding. After analysis of the specific structure of antibodies obtained using the method according to the present invention, it was surprisingly found that the composition of HCDR3 was structurally different from the usual human HCDR3 domains, as shown in Example 9. In particular, the HCDR3 domains of antibodies with the most therapeutically beneficial properties and specific binding to CCR8 were characterized by an average frequency of ~21% tyrosine residues and an average histidine content of ~10%, emphasizing a beneficial impact of these residues on the recognition of the specific sulfated antigen (as shown in Table 9.2).
[0040] Sem estarem limitados pela teoria, os inventores acreditamque essas características estruturais se traduzem em certas características funcionais que tornam os anticorpos obtidos mais adequados para aplicações terapêuticas. Por exemplo, e ao contrário dos anticorpos da técnica anterior testados, vários anticorpos de acordo com a invenção bloqueiam a sinalização dependente da proteína G, conforme o Exemplo 10.4.3, mas não afeta as vias independentes da proteína G, conforme os Exemplos 10.4, 10.4.1, 10.4.2, e não internalizam substancialmente em células com expressão endógena do receptor de quimiocina alvo, conforme o Exemplo 10.5. Além disso, os anticorpos particularmente preferidos de acordo com a presente invenção eram específicos para o receptor alvo e células alvo, conforme o Exemplo 10.2, 11, e são especialmente adequadas/demonstraram propriedades superiores em métodos de tratamento de câncer, conforme os Exemplos 12 e segs. Além disso, o uso destes polipeptídeos sintéticos quer como antígenos quer para panning fora do alvo facilitou ou permitiu a geração de anticorpos de reação cruzada, tais como anticorpos que se ligam especificamente a CCR8 humano e/ou CCR8 de cinomolgo, conforme o Exemplo 10.1.1.[0040] Without being limited by theory, the inventors believe that these structural characteristics translate into certain functional characteristics that make the obtained antibodies more suitable for therapeutic applications. For example, and unlike the prior art antibodies tested, several antibodies according to the invention block G protein-dependent signaling, as per Example 10.4.3, but do not affect G protein-independent pathways, as per Examples 10.4, 10.4.1, 10.4.2, and do not substantially internalize into cells with endogenous expression of the target chemokine receptor, as per Example 10.5. Furthermore, the particularly preferred antibodies according to the present invention were specific to the target receptor and target cells, as per Examples 10.2, 11, and are especially suitable/have demonstrated superior properties in cancer treatment methods, as per Examples 12 et seq. Furthermore, the use of these synthetic polypeptides, either as antigens or for off-target panning, facilitated or enabled the generation of cross-reacting antibodies, such as antibodies that bind specifically to human CCR8 and/or cynomolgus CCR8, as per Example 10.1.1.
[0041] Embora a humanização de anticorpos com CDRs de murinopossa melhorar a imunogenicidade de um anticorpo, a imunogenicida- de residual reside nas regiões CDR (Harding, Fiona A., et al. "The immunogenicity of humanized e fully human antibodies: residual immunogenicity resides in the CDR regions." MAbs. Vol. 2. No. 3. Taylor & Francis, 2010.). Os anticorpos que compreendem CDRs humanas são, portanto, assumidos como tendo uma adequação superior como agentes terapêuticos para humanos em comparação com os anticorpos que compreendem as CDRs de outras espécies.[0041] Although humanization of antibodies with murine CDRs may improve the immunogenicity of an antibody, residual immunogenicity resides in the CDR regions (Harding, Fiona A., et al. "The immunogenicity of humanized and fully human antibodies: residual immunogenicity resides in the CDR regions." MAbs. Vol. 2. No. 3. Taylor & Francis, 2010.). Antibodies comprising human CDRs are therefore assumed to have superior suitability as therapeutic agents for humans compared to antibodies comprising CDRs from other species.
[0042] Por exemplo, os anticorpos com CDRs humanas podem serproduzidos por meio de tecnologias de exibição de fagos ou usando animais transgênicos capazes de gerar anticorpos totalmente humanos. No entanto, nem sempre é trivial obter anticorpos totalmente hu-manos. Enquanto, em teoria, a diversidade de regiões HCDR3 é quase ilimitada, na prática, a geração da diversidade de repertório de anticor- pos parece ser cuidadosamente regulada por múltiplos mecanismos, que produzem um repertório in vivo que é restrito em sua diversidade e restrito em sua gama de sítios de ligação ao antígeno. Este também é o caso de bibliotecas de exibição de fagos humanos, que são frequentemente projetadas para refletir o repertório in vivo. Assim, em alguns casos, os requisitos estruturais de um antígeno "complicado" podem ser atendidos por CDRs de roedores, enquanto a mesma estrutura não pode ser prontamente reconhecida por CDRs humanos. Com base na observação de que a representação da tirosina é, em média, aproximadamente 50% menor na HCDR3 humana do que na HCDR3 de murino, pode-se supor que é claramente mais desafiador encontrar um anticorpo humano anti-humano nos casos em que as habilidades únicas de ligação da tirosina e histidina são necessários para permitir a ligação ao alvo. De fato, os inventores não estão cientes de anticorpos CCR8 anti-humanos totalmente humanos da técnica anterior. de acordo com a presente invenção, são fornecidos anticorpos CCR8 compreendendo CDRs derivadas de humanos, e também anticorpos totalmente humanos, conforme os Exemplos 6, 7, 8.[0042] For example, antibodies with human CDRs can be produced through phage display technologies or using transgenic animals capable of generating fully human antibodies. However, obtaining fully human antibodies is not always trivial. While, in theory, the diversity of HCDR3 regions is almost unlimited, in practice, the generation of antibody repertoire diversity appears to be carefully regulated by multiple mechanisms, which produce an in vivo repertoire that is restricted in its diversity and restricted in its range of antigen-binding sites. This is also the case for human phage display libraries, which are often designed to reflect the in vivo repertoire. Thus, in some cases, the structural requirements of a "complicated" antigen may be met by rodent CDRs, while the same structure may not be readily recognized by human CDRs. Based on the observation that tyrosine representation is, on average, approximately 50% lower in human CCR3 than in murine CCR3, it can be assumed that it is clearly more challenging to find a human anti-human antibody in cases where the unique binding abilities of tyrosine and histidine are required to enable binding to the target. In fact, the inventors are not aware of fully human anti-human CCR8 antibodies of the prior art. According to the present invention, CCR8 antibodies comprising human-derived CDRs are provided, as well as fully human antibodies, as per Examples 6, 7, 8.
[0043] Anticorpos receptor antiquimiocina de reação cruzada, talcomo anticorpos anti-CCR8 de reação cruzada, são vantajosos para o desenvolvimento de um anticorpo terapêutico, pois podem ser usados em modelos animais não humanos para caracterizar os agentes terapêuticos quanto aos dados farmacológicos e de segurança, antes dos anticorpos serem administrados a humanos. No entanto, anticorpos de reação cruzada, por exemplo, com comportamento de ligação semelhante em duas espécies, são difíceis de gerar e não podem ser facil-mente maturados por afinidade, por exemplo, porque as partes extra- celulares de receptores de quimiocina, tal como CCR8, têm baixa ho- mologia entre espécies (veja, exemplo 2). de acordo com a presente invenção, os anticorpos de reação cruzada para CCR8 podem ser gerados, em particular, usando pequenos motifs contendo tirosina sulfatada que têm uma maior conservação entre espécies, de modo que os anticorpos de reação cruzada que se ligam a um receptor de quimioci- na, tal como CCR8 de duas ou mais espécies, por exemplo com afinidades da mesma ordem de grandeza possam ser obtidos de forma fácil e conveniente, conforme os Exemplos 6, 7, 10.1.1.[0043] Cross-reacting anti-chemokine receptor antibodies, such as cross-reacting anti-CCR8 antibodies, are advantageous for the development of a therapeutic antibody because they can be used in non-human animal models to characterize therapeutic agents with respect to pharmacological and safety data before the antibodies are administered to humans. However, cross-reacting antibodies, for example, with similar binding behavior in two species, are difficult to generate and cannot be easily matured by affinity, for example, because the extracellular parts of chemokine receptors, such as CCR8, have low homology between species (see example 2). According to the present invention, cross-reacting antibodies to CCR8 can be generated, in particular, using small motifs containing sulfated tyrosine that have greater conservation between species, so that cross-reacting antibodies that bind to a chemokine receptor, such as CCR8, of two or more species, for example with affinities of the same order of magnitude, can be obtained easily and conveniently, as per Examples 6, 7, 10.1.1.
[0044] Para induzir a morte de células que expressam um receptorde quimiocina alvo ou CCR8, vários modos de ação podem ser previstos. Um modo de ação é a conjugação de um anticorpo que tem como alvo o receptor de quimiocina ou CCR8 a um fármaco na forma de um conjugado anticorpo-fármaco (ADC). Outros modos de ação possíveis são a indução de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC), fagocitose celular dependente de anticorpos (ADCP) e/ou ci- totoxicidade dependente de complemento (CDC). Para ADCC, CDC e ADCP, um mecanismo de duas etapas está envolvido: por um lado, o anticorpo ou fragmento é necessário para se ligar eficazmente à célula alvo, por exemplo, a Treg por meio de CCR8, por outro lado, a parte FC do anticorpo (ou uma porção de ligação alternativa que pode ser conjugada com o anticorpo ou fragmento como descrito em outro lugar aqui) tem que se ligar a uma célula efetora, que então mediará a morte da célula alvo. Para ADCP, a ligação a macrófagos como células efe- toras ocorre tipicamente através da interação da parte FC dos anticorpos com FcYRIIa (CD32a) expresso por macrófagos. Ao contrário, ADCC é mediado através da interação do anticorpo ou fragmento com FcYRIIIa. Em humanos, FCYRIII existe em duas formas diferentes: FcYRIIIa (CD16a) e FcYRIIIb (CD16b). Enquanto o FcYRIIIa é expresso em mastócitos, macrófagos e células exterminadoras naturais como um receptor transmembranar, o FcYRIIIb é expresso apenas em neu- trófilos. Esses receptores se ligam à porção Fc dos anticorpos IgG, que então ativa a citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) mediada pelas células efetoras humanas.[0044] To induce the death of cells expressing a target chemokine receptor or CCR8, several modes of action can be predicted. One mode of action is the conjugation of an antibody targeting the chemokine receptor or CCR8 to a drug in the form of an antibody-drug conjugate (ADC). Other possible modes of action are the induction of antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC), antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP), and/or complement-dependent cytotoxicity (CDC). For ADCC, CDC, and ADCP, a two-step mechanism is involved: on the one hand, the antibody or fragment is required to bind effectively to the target cell, for example, Treg via CCR8; on the other hand, the FC portion of the antibody (or an alternative binding portion that may be conjugated to the antibody or fragment as described elsewhere here) has to bind to an effector cell, which will then mediate the death of the target cell. For ADCP, binding to macrophages as effector cells typically occurs through the interaction of the Fc portion of antibodies with FcYRIIIa (CD32a) expressed by macrophages. In contrast, ADCC is mediated through the interaction of the antibody or fragment with FcYRIIIa. In humans, FcYRIII exists in two different forms: FcYRIIIa (CD16a) and FcYRIIIb (CD16b). While FcYRIIIa is expressed on mast cells, macrophages, and natural killer cells as a transmembrane receptor, FcYRIIIb is expressed only on neutrophils. These receptors bind to the Fc portion of IgG antibodies, which then activates antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) mediated by human effector cells.
[0045] Quando os inventores analisaram anticorpos CCR8 anti-humanos da técnica anterior, eles descobriram que esses anticorpos prontamente internalizados em uma célula com expressão alvo endógena, mas não residiam na superfície da célula por longos períodos de tempo. O comportamento de internalização de um anticorpo não influencia apenas sua clearance e comportamento farmacológico, mas também sua adequação a um modo de ação específico para usos terapêuticos.[0045] When the inventors analyzed anti-human CCR8 antibodies from the prior art, they found that these antibodies readily internalized into a cell with endogenous target expression, but did not reside on the cell surface for extended periods of time. The internalization behavior of an antibody influences not only its clearance and pharmacological behavior, but also its suitability for a specific mode of action for therapeutic uses.
[0046] Embora a alta internalização seja desejável para a geraçãode certos conjugados anticorpo-fármaco, é indesejável para a deple- ção de células tumorais ou células Treg induzida por ADCC. Mais detalhadamente, um conjugado de fármaco de anticorpo é necessário para transportar o fármaco para dentro da célula para alcançar uma depleção eficiente e específica da célula alvo. Ao contrário, o modo de ação ADCC requer a exposição do anticorpo e seu domínio Fc na parte externa da célula alvo, onde as células efetoras imunes podem se ligar ao domínio FC para a lise da célula alvo. Uma taxa de internaliza- ção baixa ou mesmo ausente aumenta desse modo o tempo de efeito para um anticorpo indutor de ADCC/ADCP.[0046] Although high internalization is desirable for the generation of certain antibody-drug conjugates, it is undesirable for ADCC-induced depletion of tumor cells or Treg cells. More specifically, an antibody-drug conjugate is necessary to transport the drug into the cell to achieve efficient and specific depletion of the target cell. In contrast, the ADCC mode of action requires exposure of the antibody and its Fc domain on the outer part of the target cell, where immune effector cells can bind to the Fc domain for lysis of the target cell. A low or even absent internalization rate thus increases the time of effect for an ADCC/ADCP-inducing antibody.
[0047] Após a caracterização dos anticorpos obtidos com o novométodo, os inventores descobriram surpreendentemente que vários dos anticorpos de acordo com a presente invenção mostraram um perfil de internalização particularmente baixo ou mesmo ausente em célu- las com níveis de expressão endógenos de CCR8, conforme o Exemplo 10.5, enquanto os anticorpos da técnica anterior que reconhecem o mesmo alvo tinham uma taxa de internalização mais alta. Por exemplo, os anticorpos 433H e L263G8 da técnica anterior são prontamente internalizados na célula alvo e não residem na superfície da célula por longos períodos de tempo. Devido às suas baixas propriedades de in- ternalização, alguns dos anticorpos de acordo com a presente invenção são, portanto, particularmente úteis em uma abordagem ADCC, ADCP, CDC ou mista, tal como uma abordagem combinada ADCC/ADCP.[0047] After characterizing the antibodies obtained with the new method, the inventors surprisingly discovered that several of the antibodies according to the present invention showed a particularly low or even absent internalization profile in cells with endogenous CCR8 expression levels, as per Example 10.5, while prior art antibodies recognizing the same target had a higher internalization rate. For example, the 433H and L263G8 antibodies of the prior art are readily internalized into the target cell and do not reside on the cell surface for long periods of time. Due to their low internalization properties, some of the antibodies according to the present invention are therefore particularly useful in an ADCC, ADCP, CDC, or mixed approach, such as a combined ADCC/ADCP approach.
[0048] Normalmente, a seleção de um alvo é um fator importanteque influencia fortemente a internalização de um anticorpo em uma célula. de acordo com Islam SA et al, a ligação do ligante CCL1 induz o fluxo de Ca2+ e a internalização rápida do receptor de CCR8 (Islam, Sabina A., et al. "Identification of human CCR8 as a CCL18 recep- torCCR8 is a CCL18 receptor." The Journal of experimental medicine 210.10 (2013): 1889-1898.). Os inventores acharam surpreendenteque o próprio anticorpo fosse capaz de influenciar as propriedades de internalização em um grau tão substancial. No entanto, quando eles caracterizaram a capacidade dos anticorpos inventivos para modular as vias de sinalização independentes da proteína G de seu receptor de quimiocina alvo, eles descobriram que todos os anticorpos testados da técnica anterior não apenas bloquearam a sinalização dependente da proteína G, mas também a sinalização independente da proteína G modulada, conforme os Exemplos 10.4 e segs.. A sinalização independente da proteína G foi previamente ligada ao comportamento de internalização, conforme Fox, James M., et al. "Structure/function relationships of CCR8 agonists e antagonists: Amino-terminal extension of CCL1 by a single amino acid generates a partial agonist." Journal of Biological Chemistry 281.48 (2006): 36652-36661.[0048] Typically, target selection is an important factor that strongly influences antibody internalization into a cell. According to Islam SA et al., CCL1 ligand binding induces Ca2+ influx and rapid internalization of the CCR8 receptor (Islam, Sabina A., et al. "Identification of human CCR8 as a CCL18 receptor. CCR8 is a CCL18 receptor." The Journal of experimental medicine 210.10 (2013): 1889-1898). The inventors found it surprising that the antibody itself was able to influence internalization properties to such a substantial degree. However, when they characterized the ability of the inventive antibodies to modulate the G protein-independent signaling pathways of their target chemokine receptor, they found that all antibodies tested from the prior technique not only blocked G protein-dependent signaling but also modulated G protein-independent signaling, as per Examples 10.4 et seq. G protein-independent signaling has previously been linked to internalization behavior, as per Fox, James M., et al. "Structure/function relationships of CCR8 agonists and antagonists: Amino-terminal extension of CCL1 by a single amino acid generates a partial agonist." Journal of Biological Chemistry 281.48 (2006): 36652-36661.
[0049] Existem várias maneiras diferentes de como um anticorpopode modular um receptor de quimiocina. Por exemplo, um anticorpo podea) bloquear a sinalização independente da proteína G, b) bloquear a sinalização dependente da proteína G, c) bloquear a sinalização dependente da proteína G e independente da proteína G,d) aumentar a sinalização independente da proteína G, e) aumentar a sinalização dependente da proteína G, f) aumentar a sinalização dependente da proteína G e independente da proteína G.[0049] There are several different ways in which an antibody can modulate a chemokine receptor. For example, an antibody can a) block G protein-independent signaling, b) block G protein-dependent signaling, c) block both G protein-dependent and G protein-independent signaling, d) increase G protein-independent signaling, e) increase G protein-dependent signaling, f) increase both G protein-dependent and G protein-independent signaling.
[0050] Sem estarem limitados pela teoria, os inventores levantama hipótese de que o TRD sulfatado do respectivo receptor de quimioci- na pode ser relevante para a sinalização induzida por ligante do receptor de quimiocina. Interessantemente, a maioria dos anticorpos inventivos bloqueou eficazmente a sinalização dependente da proteína G induzida pelo ligante, mas não influenciou a sinalização independente da proteína G, conforme os Exemplos 10.4 e segs. Ao contrário, todos os anticorpos da técnica anterior também bloquearam a sinalização dependente da proteína G induzida pelo ligante, mas agonizou a sinalização independente da proteína G. Sem estar limitado pela teoria, essas diferenças podem contribuir para as diferenças no comporta-mento de internalização.[0050] Without being constrained by theory, the inventors hypothesize that the sulfated TRD of the respective chemokine receptor may be relevant to ligand-induced signaling of the chemokine receptor. Interestingly, most of the inventive antibodies effectively blocked ligand-induced G protein-dependent signaling but did not influence G protein-independent signaling, as shown in Examples 10.4 et seq. In contrast, all prior art antibodies also blocked ligand-induced G protein-dependent signaling but agonized G protein-independent signaling. Without being constrained by theory, these differences may contribute to the differences in internalization behavior.
[0051] Evitar a indução da sinalização independente da proteína Gpor um anticorpo terapêutico também pode ser vantajoso, porque a sinalização inespecífica pode resultar em efeitos a jusante incontrolá- veis, tal como uma proliferação celular aumentada, conforme Hutchings, Catherine J., et al. (2017); Webb, David R., et al. "Opportunities for functional selectivity in GPCR antibodies." Biochemical pharmacology 85.2 (2013): 147-152.; Fox, James M., et al. (2006).[0051] Avoiding the induction of G-protein-independent signaling by a therapeutic antibody may also be advantageous, because nonspecific signaling can result in uncontrollable downstream effects, such as increased cell proliferation, as per Hutchings, Catherine J., et al. (2017); Webb, David R., et al. "Opportunities for functional selectivity in GPCR antibodies." Biochemical pharmacology 85.2 (2013): 147-152.; Fox, James M., et al. (2006).
[0052] Os anticorpos de acordo com a presente invenção são caracterizados por uma indução superior de ADCC e ADCP, como mostrado, por exemplo, nos Exemplo 10.3.3, 10.3.4. Em algumas modalidades preferidas, os anticorpos foram manipulados por eliminação da fucose em N297 (afucosilação) para obter as altas taxas de ADCC, conforme o Exemplos 10.3.1. Interessantemente, muitos dos anticorpos anti-CCR8 inventivos pareciam induzir a depleção de células alvo por meio de um modo de ação combinado usando ambos os mecanismos, isto é, ADCC e ADCP.[0052] The antibodies according to the present invention are characterized by a superior induction of ADCC and ADCP, as shown, for example, in Examples 10.3.3, 10.3.4. In some preferred embodiments, the antibodies were manipulated by fucose elimination in N297 (afucosylation) to obtain the high ADCC rates, as per Example 10.3.1. Interestingly, many of the inventive anti-CCR8 antibodies appeared to induce target cell depletion through a combined mode of action using both mechanisms, i.e., ADCC and ADCP.
[0053] Embora tenha sido sugerido por vários grupos de pesquisao uso de anticorpos que ligam CCR8 em métodos de tratamento com base em insights mecanicistas, o caminho para o fornecimento de anticorpos com propriedades terapêuticas ideais tem sido tedioso. Ao fornecer um método para geração de anticorpos de acordo com a presente invenção, anticorpos para receptores de quimiocinas com propriedades terapêuticas superiores podem agora ser facilmente obtidos. de acordo com a presente invenção, vários anticorpos definidos por sequência com propriedades favoráveis são descritos, que podem ser usados em um método de tratamento, por exemplo, como parte de um conjugado, em uma abordagem baseada em ADCC, em uma abordagem baseada em ADCP, em uma abordagem baseada em CDC, ou em uma abordagem mista baseada em ADCC/ADCP. Os Exemplos 12 e segs., mostram eficácias notáveis na depleção de Treg, taxa de resposta global e relação tumor-controle para anticorpos substitutos gerados com um método de acordo com a presente invenção.[0053] Although the use of CCR8-binding antibodies in treatment methods based on mechanistic insights has been suggested by several research groups, the path to providing antibodies with ideal therapeutic properties has been tedious. By providing a method for generating antibodies according to the present invention, antibodies to chemokine receptors with superior therapeutic properties can now be easily obtained. According to the present invention, several sequence-defined antibodies with favorable properties are described, which can be used in a treatment method, for example, as part of a conjugate, in an ADCC-based approach, in an ADCP-based approach, in a CDC-based approach, or in a mixed ADCC/ADCP-based approach. Examples 12 et seq. show remarkable efficacies in Treg depletion, overall response rate, and tumor-control ratio for surrogate antibodies generated with a method according to the present invention.
[0054] Embora taxas de resposta notáveis tenham sido obtidas emmonoterapia com os anticorpos anti-CCR8 inventivos, foi surpreendentemente descoberto que o benefício terapêutico poderia ser aumentado ainda mais combinando os anticorpos com inibidores de ponto de verificação imunológica, com outras terapias direcionadas e mesmo com quimioterapia ou radioterapia inespecífica. Esses tratamentos combinados foram particularmente benéficos em modelos de tumor desafiadores. Em particular, um esquema de tratamento de combinação específico foi considerado eficaz, onde o segundo agente terapêutico ou terapia foi administrado somente após o anticorpo anti-CCR8 ter causado depleção substancial de Treg (veja os Exemplos 12.6 e seguintes). Além disso, observou-se que mesmo um único tratamento com anticorpo anti-CCR8 mostrou um efeito terapêutico substancial (veja o Exemplo 12.4.2).[0054] Although remarkable response rates have been obtained in monotherapy with the inventive anti-CCR8 antibodies, it has been surprisingly discovered that the therapeutic benefit could be further enhanced by combining the antibodies with immune checkpoint inhibitors, with other targeted therapies, and even with nonspecific chemotherapy or radiotherapy. These combined treatments have been particularly beneficial in challenging tumor models. In particular, one specific combination treatment regimen has been found effective where the second therapeutic agent or therapy was administered only after the anti-CCR8 antibody has caused substantial Treg depletion (see Examples 12.6 and following). Furthermore, even a single treatment with anti-CCR8 antibody has been observed to show a substantial therapeutic effect (see Example 12.4.2).
[0055] Ao avaliar a capacidade de resposta de diferentes modelosde camundongos singênicos ao tratamento com anticorpo anti-CCR8, os inventores puderam identificar vários mecanismos, biomarcadores e combinações de biomarcadores que eram preditivos para a eficácia do tratamento e a resposta geral. Por exemplo, descobriu-se surpreendentemente que o grau de responsividade aos inibidores de ponto de verificação imunológica, tais como anticorpos PD-1, PD-L1 ou CTLA4, também foi preditivo para a resposta ao tratamento com anticorpo anti- CCR8. Como a expressão de PD-L1 às vezes é usada como um marcador substituto para prever a capacidade de resposta para inibidores de ponto de verificação imunológica, os inventores avaliaram se PD-L1 também poderia ser usado para prever a capacidade de resposta para o tratamento com anticorpo anti-CCR8. Esta hipótese pode finalmente ser confirmada por dados de correlação, veja o Exemplo 12.7.1. Em uma outra tentativa de identificar os indivíduos que provavelmente se beneficiariam do tratamento anti-CCR8, outros genes marcadores, tais como células imunes e marcadores Treg, foram avaliados como bio- marcadores (veja os Exemplos 12.1.2., 12.7.2, 12.8).[0055] By evaluating the responsiveness of different syngeneic mouse models to anti-CCR8 antibody treatment, the inventors were able to identify several mechanisms, biomarkers, and biomarker combinations that were predictive of treatment efficacy and overall response. For example, it was surprisingly found that the degree of responsiveness to immune checkpoint inhibitors, such as PD-1, PD-L1, or CTLA4 antibodies, was also predictive of response to anti-CCR8 antibody treatment. Since PD-L1 expression is sometimes used as a surrogate marker to predict responsiveness to immune checkpoint inhibitors, the inventors evaluated whether PD-L1 could also be used to predict responsiveness to anti-CCR8 antibody treatment. This hypothesis can ultimately be confirmed by correlation data, see Example 12.7.1. In another attempt to identify individuals who would likely benefit from anti-CCR8 treatment, other marker genes, such as immune cell and Treg markers, were evaluated as biomarkers (see Examples 12.1.2, 12.7.2, 12.8).
[0056] Fig. 1: Alinhamento de receptores humanos de quimiocinasCC e receptores de quimiocinas CXC.[0056] Fig. 1: Alignment of human CC chemokine receptors and CXC chemokine receptors.
[0057] Figura 2: uma. As sequências de CCR8 humano, CCR8cinomolgo e CCR8 de murino foram recuperadas de Uniprot e alinhadas com Clustal Omega. b. Representação esquemática da estrutura do receptor CCR8 que contém 7 domínios transmembranares (caixas pretas), três alças extracelulares (ECL), várias pontes de dissulfeto (SS) e uma parte C-terminal intracelular, bem como o domínio N- terminal extracelular composto pelo "LID" e o domínio rico em tirosina (TRD).[0057] Figure 2: a. Human CCR8, cynomolgus CCR8, and murine CCR8 sequences were retrieved from Uniprot and aligned with Clustal Omega. b. Schematic representation of the CCR8 receptor structure containing 7 transmembrane domains (black boxes), three extracellular loops (ECL), several disulfide bridges (SS), and an intracellular C-terminal portion, as well as the extracellular N-terminal domain composed of the "LID" and the tyrosine-rich domain (TRD).
[0058] Fig. 3: Avaliação de três anticorpos da técnica anterior porcoloração FACS em células alvo positivas para CCR8. Nenhum dos anticorpos da técnica anterior mostrados mostrou um desvio na coloração FACS em comparação com o controle de isotipo. O hAP-0068 e MAB1429-100 foram testados em células 293T estavelmente transfec- tadas com CCR8 humano enquanto MAB8324 foi testado em Células BW5147.3 expressando CCR8 de murino.[0058] Fig. 3: Evaluation of three antibodies from the prior technique by FACS staining in CCR8-positive target cells. None of the prior technique antibodies shown exhibited a deviation in FACS staining compared to the isotype control. hAP-0068 and MAB1429-100 were tested in 293T cells stably transfected with human CCR8, while MAB8324 was tested in BW5147.3 cells expressing murine CCR8.
[0059] Fig. 4: Estratégia de panning para descoberta de chumbo:Duas estratégias principais para seleções em peptídeos sulfatados estão representadas. Em todas as estratégias, antes de cada rodada de seleção, uma etapa de depleção de uma proteína biotinilada relevante ou irrelevante foi incluída.[0059] Fig. 4: Panning strategy for lead discovery: Two main strategies for selection in sulfated peptides are represented. In all strategies, before each round of selection, a depletion step of a relevant or irrelevant biotinylated protein was included.
[0060] Fig. 5: Estratégia de panning para obter anticorpos CCR8antimurino: A principal estratégia de seleção com base em uma mistura de peptídeos sulfatados/não sulfatados é descrita. Antes de cada rodada de seleção, uma etapa de depleção de uma proteína biotinilada relevante foi realizada.[0060] Fig. 5: Panning strategy to obtain CCR8 antimurine antibodies: The main selection strategy based on a mixture of sulfated/non-sulfated peptides is described. Before each selection round, a depletion step of a relevant biotinylated protein was performed.
[0061] Fig. 6: Dados FACS de anticorpos inventivos que se ligamàs células CHO expressando CCR8 humano.[0061] Fig. 6: FACS data of inventive antibodies that bind to CHO cells expressing human CCR8.
[0062] Fig. 7: Dados FACS de anticorpos inventivos que se ligamàs células CHO expressando CCR8 de cinomolgo.[0062] Fig. 7: FACS data of inventive antibodies that bind to CHO cells expressing cynomolgus CCR8.
[0063] Fig. 8: Dados FACS de candidatos que se ligam a Tregshumanas ativadas (doador 1). Lado direito: Porcentagem da expressão de CCR8 determinada usando BioLegend Clone L263G8.[0063] Fig. 8: FACS data from candidates that bind to activated human Tregs (donor 1). Right side: Percentage of CCR8 expression determined using BioLegend Clone L263G8.
[0064] Fig. 9: Dados FACS de anticorpos inventivos TPP-21181 eTPP-23411 que se ligam às células CHO que expressam CCR8 humano.[0064] Fig. 9: FACS data of inventive antibodies TPP-21181 and TPP-23411 that bind to CHO cells expressing human CCR8.
[0065] Fig. 10: Dados FACS de anticorpos inventivos TPP-21181e TPP-23411 que se ligam às células CHO que expressam CCR8 de cinomolgo.[0065] Fig. 10: FACS data of inventive antibodies TPP-21181 and TPP-23411 that bind to CHO cells expressing cynomolgus CCR8.
[0066] Fig. 11: Ligação de TPP-21360, L263G8 e 433H às célulasCHO que expressam CCR8 humano.[0066] Fig. 11: Binding of TPP-21360, L263G8 and 433H to CHO cells expressing human CCR8.
[0067] Fig. 12: Ligação de TPP-21360, L263G8 e 433H a célulasCHO que expressam CCR8 de cinomolgo. Os anticorpos da técnica anterior mostraram apenas uma ligação global muito baixa a CCR8 de cinomolgo (baixa saturação). No entanto, os valores de EC50 puderam ser determinados para cada anticorpo.[0067] Fig. 12: Binding of TPP-21360, L263G8 and 433H to CYNOMLOCs CCR8-expressing CHO cells. The antibodies from the previous technique showed only very low overall binding to CYNOMLOCs CCR8 (low saturation). However, EC50 values could be determined for each antibody.
[0068] Fig. 13: Coloração de Treg humana ativada com anticorpoinventivo TPP-23411, estratégia de gating. Células classificadas CD4+ e CD25+ de células mononucleares de sangue periférico (PBMC) foram ativadas com contas anti-CD3 e anti-CD28 (kit de expansão Treg, Miltenyi). Painel central: células que são CD4+ CD25+CD127low e Foxp3+. Painel inferior: expressão de CCR8 em Tregs após coloração com TPP-23411 ou L263G8.[0068] Fig. 13: Staining of human Tregs activated with the inventive antibody TPP-23411, gating strategy. Classified CD4+ and CD25+ peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were activated with anti-CD3 and anti-CD28 beads (Treg expansion kit, Miltenyi). Center panel: cells that are CD4+ CD25+ CD127low and Foxp3+. Bottom panel: CCR8 expression in Tregs after staining with TPP-23411 or L263G8.
[0069] Fig. 14: Ligação de TPP-21360 às células CHO com trans- fectantes simulados. Nenhuma ligação inespecífica foi observada.[0069] Fig. 14: Binding of TPP-21360 to CHO cells with simulated transfectants. No nonspecific binding was observed.
[0070] Fig. 15: Ligação fora do alvo em células HEK transfectadastransitoriamente com CCR1 humano. A maioria dos candidatos inventivos mostrou apenas baixa ligação ao alvo para CCR1.[0070] Fig. 15: Off-target binding in HEK cells transiently transfected with human CCR1. Most inventive candidates showed only low target binding for CCR1.
[0071] Fig. 16: Ligação fora do alvo em células HEK transfectadastransitoriamente com CCR4 humano. A maioria dos candidatos inventivos mostrou apenas baixa ligação ao alvo para CCR4.[0071] Fig. 16: Off-target binding in HEK cells transiently transfected with human CCR4. Most inventive candidates showed only low target binding for CCR4.
[0072] Figura 17: Coloração para expressão de CCR8 em diferentes populações de células imunes de PBMCs de doadores saudáveis (células T CD4+, células T CD8+, células B marcadas pela expressão de CD19+, células mieloides marcadas pela expressão de CD11b+, células T CD4 ativadas com anti-CD3 e contas anti-CD28 por 4 dias, células T CD8+ ativadas com contas anti-CD3 e anti-CD28 por 4 dias).[0072] Figure 17: Staining for CCR8 expression in different immune cell populations of PBMCs from healthy donors (CD4+ T cells, CD8+ T cells, B cells labeled for CD19+ expression, myeloid cells labeled for CD11b+ expression, CD4+ T cells activated with anti-CD3 and anti-CD28 beads for 4 days, CD8+ T cells activated with anti-CD3 and anti-CD28 beads for 4 days).
[0073] Figura 18: CCR8 é regulado positivamente nas Tregs humanas após a ativação. Após a ativação, a porcentagem de células CCR8+ aumentou significativamente em células CD4+CD25+ purificadas com MFI aumentado enquanto a % de células CCR8+ aumentou ligeiramente na população de PBMC. O anticorpo anti-CR8 da BioLegend foi usado para esses experimentos. N=4 doadores.[0073] Figure 18: CCR8 is upregulated in human Tregs after activation. After activation, the percentage of CCR8+ cells increased significantly in purified CD4+CD25+ cells with increased MFI, while the percentage of CCR8+ cells increased slightly in the PBMC population. BioLegend anti-CR8 antibody was used for these experiments. N=4 donors.
[0074] Fig. 19: ADCC induzido por anticorpos inventivos de tiposelvagem ou não fucosilados TPP-19546, TPP-21360 ou TPP-23411 em células HEK que expressam CCR8 humano como células alvo. Controle de isotipo: TPP-9808.[0074] Fig. 19: ADCC induced by inventive wild-type or non-fucosylated antibodies TPP-19546, TPP-21360 or TPP-23411 in HEK cells expressing human CCR8 as target cells. Isotype control: TPP-9808.
[0075] Fig. 20: Esquerda: Porcentagem de expressão de CCR8+no dia 3 para Tregs humanas ativadas como células-alvo. Direita: ADCC induzido pelo anticorpo inventivo TPP-21360, TPP-23411 do tipo selvagem ou não fucosilado em Tregs humanos ativados como células alvo. Controle de isotipo: TPP-9808. Os resultados foram reprodutíveis em diferentes doadores (dados não mostrados).[0075] Fig. 20: Left: Percentage of CCR8+ expression on day 3 for activated human Tregs as target cells. Right: ADCC induced by the inventive antibody TPP-21360, wild-type or non-fucosylated TPP-23411 in activated human Tregs as target cells. Isotype control: TPP-9808. Results were reproducible in different donors (data not shown).
[0076] Fig. 21: Protocolo para ensaio ADCP.[0076] Fig. 21: Protocol for ADCP test.
[0077] Fig. 22: O ensaio ADCP para versões de tipo selvagem enão fucosiladas de anticorpos inventivos mostra a indução de fagocito- se em células HEK que expressam CCR8 humano como células alvo com macrófagos M2c diferenciados in vitro como células efetoras. Versões de tipo selvagem e não fucosiladas de anticorpos inventivos TPP-19546, TPP-21360 e TPP-23411 induziram ADCP. TPP-9808 é o controle de isotipo. O mogamulizumab é um anticorpo anti-CCR4 comercializado.[0077] Fig. 22: The ADCP assay for wild-type and non-fucosylated versions of inventive antibodies shows the induction of phagocytosis in HEK cells expressing human CCR8 as target cells with in vitro differentiated M2c macrophages as effector cells. Wild-type and non-fucosylated versions of inventive antibodies TPP-19546, TPP-21360, and TPP-23411 induced ADCP. TPP-9808 is the isotype control. Mogamulizumab is a commercially available anti-CCR4 antibody.
[0078] Fig. 23: O ensaio de ADCP para versões de tipo selvageme não fucosiladas de anticorpos inventivos TPP-21360 e TPP-23411 mostra indução de fagocitose em Tregs humanas ativadas de dois doadores diferentes como células alvo (painel superior ou inferior) e ma- crófagos M2c como células efetoras. TPP-9808 é o controle de isotipo.[0078] Fig. 23: The ADCP assay for wild-type and non-fucosylated versions of inventive antibodies TPP-21360 and TPP-23411 shows induction of phagocytosis in activated human Tregs from two different donors as target cells (upper or lower panel) and M2c macrophages as effector cells. TPP-9808 is the isotype control.
[0079] Fig. 24: O ensaio ADCP para versões de tipo selvagem enão fucosiladas de anticorpos inventivos TPP-21360 e TPP-23411 mostra a indução de fagocitose em Tregs humanas ativadas como células alvo e macrófagos M1 como células efetoras.[0079] Fig. 24: The ADCP assay for wild-type and non-fucosylated versions of inventive antibodies TPP-21360 and TPP-23411 shows the induction of phagocytosis in activated human Tregs as target cells and M1 macrophages as effector cells.
[0080] Fig. 25: Ativação da sinalização de β-arrestina medida como ensaio DiscoverX para CCL1, TPP-23411, L263G8 ou 433H em células CHO que coexpressam CCR8 humano marcado com ProLink e EA. Como esperado, o ligante CCR8 CCL1 (humano) induz a sinalização de β-arrestina. Um ponto de tempo extra foi analisado para TPP- 23411 para garantir que nenhuma ativação de β-arrestina acontecesse em pontos de tempo anteriores. Nenhum dos anticorpos analisados induziu a ativação da sinalização de β-arrestina.[0080] Fig. 25: Activation of β-arrestin signaling measured as a DiscoverX assay for CCL1, TPP-23411, L263G8, or 433H in CHO cells co-expressing ProLink-labeled human CCR8 and EA. As expected, the CCR8 CCL1 (human) ligand induces β-arrestin signaling. An extra time point was analyzed for TPP-23411 to ensure that no β-arrestin activation occurred at earlier time points. None of the antibodies analyzed induced β-arrestin signaling activation.
[0081] Fig. 26: Avaliação do bloqueio da sinalização de β-arrestinainduzida por CCL1 por TP-23411, L263G8 ou 433H, medido com o ensaio DiscoverX. CCL1 foi usado em seu EC80 (20 ng/ml). Os anticorpos da técnica anterior L263G8 e 433H bloquearam a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1 em baixa concentração de anticorpo, enquanto o anticorpo inventivo TPP-23411 não mostrou efeito nessas concentrações. Foi sugerido que a sinalização de β-arrestina desempenha um papel na internalização.[0081] Fig. 26: Evaluation of the blockade of CCL1-induced β-arrestin signaling by TP-23411, L263G8, or 433H, measured with the DiscoverX assay. CCL1 was used at its EC80 (20 ng/ml). The prior art antibodies L263G8 and 433H blocked CCL1-induced β-arrestin signaling at low antibody concentrations, while the inventive antibody TPP-23411 showed no effect at these concentrations. It has been suggested that β-arrestin signaling plays a role in internalization.
[0082] Fig. 27: Ensaio Phospho Erk1/2 ELISA. Células CHO expressando CCR8 humano foram tratadas com CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8 ou anticorpo BD 433H e os lisados celulares foram coletados no respectivo ponto de tempo.[0082] Fig. 27: Phospho Erk1/2 ELISA assay. CHO cells expressing human CCR8 were treated with CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8 or BD 433H antibody and cell lysates were collected at the respective time point.
[0083] Fig. 28: Ensaio Phospho Erk 1/2 ELISA. Células Treg humanas ativadas expressando CCR8 foram tratadas com CCL1, TPP- 23411, Biolegend L263G8 ou anticorpo BD 433H e os lisados celulares foram coletados no respectivo ponto de tempo. Os anticorpos da técnica anterior Biolegend L263G8 e o anticorpo BD 433H induziram um aumento significativo dos níveis de Erk1/2 fosforilados, por exemplo, após 15 minutos em Tregs humanas ativadas, enquanto este não foi o caso do anticorpo inventivo.[0083] Fig. 28: Phospho Erk 1/2 ELISA assay. Activated human Treg cells expressing CCR8 were treated with CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8 or BD 433H antibody and cell lysates were collected at the respective time point. The antibodies from the prior technique, Biolegend L263G8 and BD 433H antibody, induced a significant increase in phosphorylated Erk1/2 levels, for example, after 15 minutes in activated human Tregs, while this was not the case for the inventive antibody.
[0084] Fig. 29: Ensaio Phospho AKT ELISA. Células CHO expressando CCR8 humano foram tratadas com CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8 ou anticorpo BD 433H e os lisados celulares foram coletados no respectivo ponto de tempo.[0084] Fig. 29: Phospho AKT ELISA assay. CHO cells expressing human CCR8 were treated with CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8 or BD 433H antibody and cell lysates were collected at the respective time point.
[0085] Fig. 30: Ensaio Phospho AKT ELISA. Células Treg humanas ativadas expressando CCR8 foram tratadas com CCL1, TPP- 23411, Biolegend L263G8 ou anticorpo BD 433H e os lisados celulares foram coletados no respectivo ponto de tempo. Os anticorpos da técnica anterior Biolegend L263G8 e BD 433H induziram um aumento significativo dos níveis de fosfo AKT em Tregs humanos ativados, por exemplo, após 15 minutos, enquanto este não foi o caso dos anticorpos inventivos.[0085] Fig. 30: Phospho AKT ELISA assay. Activated human Treg cells expressing CCR8 were treated with CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8 or BD 433H antibody and cell lysates were collected at the respective time point. The prior technique antibodies Biolegend L263G8 and BD 433H induced a significant increase in phospho AKT levels in activated human Tregs, for example, after 15 minutes, while this was not the case for the inventive antibodies.
[0086] Fig. 31: Estudos de internalização. a. Análise FACS de anticorpos comerciais CCR8 anti-humanos Biolegend L263G8 ou anticorpo BD 433H com linhagem celular HuT78 que expressa endoge- namente CCR8. b. Estudos de internalização de anticorpos comerciais CCR8 anti-humanos com linhagem celular HuT78 que expressa endo- genamente CCR8 com base em manchas de intensidade citoplasmáti- ca. TPP-5657: Controle de isotipo.[0086] Fig. 31: Internalization studies. a. FACS analysis of commercial anti-human CCR8 antibodies Biolegend L263G8 or BD 433H antibody with the HuT78 cell line that endogenously expresses CCR8. b. Internalization studies of commercial anti-human CCR8 antibodies with the HuT78 cell line that endogenously expresses CCR8 based on cytoplasmic intensity staining. TPP-5657: Isotype control.
[0087] Fig. 32: Estudos de internalização. a. Análise FACS do anticorpo comercial CCR8 antimurino SA214G2 com a linhagem celular BW5147.3 que expressa endogenamente CCR8 de murino. b. Estudo de internalização do anticorpo comercial CCR8 antimurino SA214G2 com linhagem celular BW5147.3 que expressa endogenamente CCR8 de murino. O anticorpo CCR8 antimurino da técnica anterior SA214G2 induz a internalização.[0087] Fig. 32: Internalization studies. a. FACS analysis of the commercial anti-murine CCR8 antibody SA214G2 with the BW5147.3 cell line that endogenously expresses murine CCR8. b. Internalization study of the commercial anti-murine CCR8 antibody SA214G2 with the BW5147.3 cell line that endogenously expresses murine CCR8. The anti-murine CCR8 antibody from the previous technique SA214G2 induces internalization.
[0088] Fig. 33: Estudo de internalização de anticorpos CCR8 anti-humanos inventivos TPP-21360 e TPP-23411 com linhagens celulares que expressam CCR8 endogenamente TALL-1 (a) e HuT78 (b). Ambos os anticorpos revelam comportamento de internalização idêntico, comparável com o controle de isotipo TPP-5657.[0088] Fig. 33: Internalization study of inventive anti-human CCR8 antibodies TPP-21360 and TPP-23411 with cell lines that endogenously express CCR8 TALL-1 (a) and HuT78 (b). Both antibodies reveal identical internalization behavior, comparable to the TPP-5657 isotype control.
[0089] Fig. 34: Análise FACS de anticorpos CCR8 anti-humanosinventivos TPP-21360 e TPP-23411 com linhagens celulares que expressam CCR8 endogenamente TALL-1 (a) e HuT78 (b). Ambos os anticorpos revelam a mesma potência de ligação às linhagens celulares.[0089] Fig. 34: FACS analysis of inventive anti-human CCR8 antibodies TPP-21360 and TPP-23411 with cell lines that endogenously express CCR8 TALL-1 (a) and HuT78 (b). Both antibodies show the same binding potency to the cell lines.
[0090] Fig. 35: Expressão de mRNA de CCR8 em 11642 amostrasrepresentando um conjunto abrangente de tecidos humanos e tipos de células medidos pela sonda affymetrix 208059_at. Todas as amostras foram conormalizadas usando o método refRMA (Katz, Simon, et al. "A summarization approach for Affymetrix Genechip data using a reference training set from a large, biologically diverse database." BMC bioinformatics 7.1 (2006): 1-11.). A coloração da caixa cinza escuro indica que a amostra mediana no grupo correspondente tem uma intensidade de sinal de sonda significativamente acima do ruído de fun- do (conforme estimado pelo algoritmo MAS5 do affymetrix, conforme Pepper, Stuart D., et al. "The utility of MAS5 expression summary and detection call algorithms." BMC bioinformatics 8.1 (2007): 1-12.). A expressão mediana de CCR8 significativamente acima do ruído de fundo é observada apenas em células T regulatórias ativadas, bem como em linfócitos infiltrantes de tumor. Os grupos são classificados com base na expressão média decrescente.[0090] Fig. 35: CCR8 mRNA expression in 11642 samples representing a comprehensive set of human tissues and cell types measured by the affymetrix 208059_at probe. All samples were conormalized using the refRMA method (Katz, Simon, et al. "A summarization approach for Affymetrix Genechip data using a reference training set from a large, biologically diverse database." BMC bioinformatics 7.1 (2006): 1-11.). The dark gray box coloring indicates that the median sample in the corresponding group has a probe signal intensity significantly above the background noise (as estimated by the affymetrix MAS5 algorithm, as per Pepper, Stuart D., et al. "The utility of MAS5 expression summary and detection call algorithms." BMC bioinformatics 8.1 (2007): 1-12.). Median CCR8 expression significantly above background noise is observed only in activated regulatory T cells, as well as in tumor-infiltrating lymphocytes. Groups are classified based on decreasing mean expression.
[0091] Fig. 36: Expressão de mRNA de CCR8, medida por RNA-seq, em 50 diferentes indicações de tumor de TCGA (https://www.cancer.gov/tcga) (caixas cinza escuro), tecidos normais correspondentes (caixas brancas), bem como como em todo o painel de linhagem de células tumorais CCLE (Barretina, Jordi, et al. "The Cancer Cell Line Encyclopedia permite a modelagem preditiva da sensibilidade a fármacos anticancerígenos." Nature 483.7391 (2012): 603-607.) também agrupado por indicações de tumor (cinza claro caixas). Os grupos são classificados com base na expressão média. As indicações com maior expressão de CCR8 são câncer de mama, adenocarcinoma de pulmão (ADC) e carcinoma de células escamosas (CEC), neoplasias malignas de cabeça e pescoço, bem como tumores de esôfago. Em todas as indicações, exceto adenocarcinoma pancreático e melanoma, a expressão parece maior no tumor em comparação com o tecido normal correspondente. Pouca ou nenhuma expressão é observada em linhagens de células tumorais correspondentes de origem epitelial, indicando que CCR8 não é expresso por células tumorais, mas exclusivamente por células T infiltrantes de tumor. Em princípio, cada indicação de tumor com infiltração de células Treg CCR8+ deve ser elegível para tratamento com anticorpos anti-CCR8.[0091] Fig. 36: CCR8 mRNA expression, measured by RNA-seq, in 50 different TCGA tumor indications (https://www.cancer.gov/tcga) (dark gray boxes), corresponding normal tissues (white boxes), as well as across the entire CCLE tumor cell line panel (Barretina, Jordi, et al. "The Cancer Cell Line Encyclopedia enables predictive modeling of anticancer drug sensitivity." Nature 483.7391 (2012): 603-607.) also grouped by tumor indications (light gray boxes). Groups are ranked based on mean expression. Indications with the highest CCR8 expression are breast cancer, lung adenocarcinoma (ADC) and squamous cell carcinoma (SCC), head and neck malignancies, as well as esophageal tumors. In all indications except pancreatic adenocarcinoma and melanoma, expression appears higher in the tumor compared to the corresponding normal tissue. Little or no expression is observed in corresponding tumor cell lines of epithelial origin, indicating that CCR8 is not expressed by tumor cells, but exclusively by tumor-infiltrating T cells. In principle, every indication of tumor with CCR8+ Treg cell infiltration should be eligible for treatment with anti-CCR8 antibodies.
[0092] Fig. 37: Imuno-histoquímica com coloração de marcadoresTreg FOXP3 e CCR8 (clone 433H) em tecido de câncer de pulmão de não pequenas células (NSCLC) humano ou tecido de melanoma hu- mano.[0092] Fig. 37: Immunohistochemistry with Treg FOXP3 and CCR8 (clone 433H) marker staining in human non-small cell lung cancer (NSCLC) tissue or human melanoma tissue.
[0093] Fig. 38: Coloração de populações de células T classificadas por FACS com base em CCR4, CCR8, OX40, GITR e CD25. Apenas CCR8 é específico para Tregs ativados. OX40, GITR e CD25 são significativamente expressos em células CD8+ Teff estimuladas e células T CD4+ (CD4+CD25+Foxp3-). Cinza escuro: controle de isotipo, cinza claro: coloração alvo.[0093] Fig. 38: Staining of T cell populations classified by FACS based on CCR4, CCR8, OX40, GITR, and CD25. Only CCR8 is specific for activated Tregs. OX40, GITR, and CD25 are significantly expressed in stimulated CD8+ Teff cells and CD4+ T cells (CD4+CD25+Foxp3-). Dark gray: isotype control, light gray: target staining.
[0094] Fig. 39: Expressão de CCR8 em diferentes subconjuntosde células T extraídas de diferentes entidades tumorais, conforme medido por RNA-seq de célula única. Para esses tumores, a expressão de mRNA de CCR8 é amplamente restrita às células T regulatórias (caixas cinza claro) que residem no tecido tumoral, enquanto em grande parte está ausente em células T regulatórias de tecidos normais, bem como de células T citotóxicas CD4 auxiliares e CD8 (médias e escuras caixas cinzas, respectivamente). Painel superior: Tecido tumoral colorretal (Tumor) ou tecido normal adjacente (Normal). Painel do meio: Tecido de câncer de fígado (Tumor) ou tecido normal adjacente (Normal). Painel inferior: tecido de câncer de pulmão (tumor) ou tecido pulmonar normal adjacente e sangue periférico (normal). Tamanhos de amostra, N, indicam o número de células em cada categoria. As células foram designadas como células T regulatórias, célu-las T auxiliares ou células T citotóxicas com base na expressão dos genes marcadores FOXP3, CD4 (mas não FOXP3) e CD8A/B, respectivamente.[0094] Fig. 39: CCR8 expression in different subsets of T cells extracted from different tumor entities, as measured by single-cell RNA-seq. For these tumors, CCR8 mRNA expression is largely restricted to regulatory T cells (light gray boxes) residing in tumor tissue, while it is largely absent in regulatory T cells from normal tissues, as well as from CD4 helper and CD8 cytotoxic T cells (medium and dark gray boxes, respectively). Top panel: Colorectal tumor tissue (Tumor) or adjacent normal tissue (Normal). Middle panel: Liver cancer tissue (Tumor) or adjacent normal tissue (Normal). Bottom panel: Lung cancer tissue (tumor) or adjacent normal lung tissue and peripheral blood (normal). Sample sizes, N, indicate the number of cells in each category. The cells were designated as regulatory T cells, helper T cells, or cytotoxic T cells based on the expression of the marker genes FOXP3, CD4 (but not FOXP3), and CD8A/B, respectively.
[0095] Fig. 40: Tregs, macrófagos, células T ou populações decélulas tumorais de NSCLC, CRC (câncer colorretal) ou RCC (carcinoma renal) foram coradas com anticorpo anti-CCR8 ou controle de isotipo e foram analisadas por citometria de fluxo. Eixo X: Desloca-mento de log até 105; Eixo Y: Intensidade normalizada para o modo. Cinza mais claro: controle de isotipo. Cinza mais escuro: CCR8. A ex- pressão específica de CCR8 em Tregs humanas intratumorais é indicada por setas.[0095] Fig. 40: Tregs, macrophages, T cells, or tumor cell populations from NSCLC, CRC (colorectal cancer), or RCC (renal carcinoma) were stained with anti-CCR8 antibody or isotype control and analyzed by flow cytometry. X-axis: Log shift up to 105; Y-axis: Intensity normalized to the mode. Lighter gray: Isotype control. Darker gray: CCR8. The specific expression of CCR8 in intratumoral human Tregs is indicated by arrows.
[0096] Fig. 41: Crescimento do tumor CT26 após tratamento comdiferentes doses de anticorpos anti-CCR8 ou anticorpo anti-PDL1.[0096] Fig. 41: Growth of CT26 tumor after treatment with different doses of anti-CCR8 antibodies or anti-PDL1 antibody.
[0097] Fig. 42: Gráficos aranha de camundongos portadores detumor CT26 após tratamento com diferentes doses de anticorpos anti- CCR8, anticorpo anti-PDL1 ou controles de isotipo.[0097] Fig. 42: Spider graphs of mice carrying CT26 tumor after treatment with different doses of anti-CCR8 antibodies, anti-PDL1 antibody or isotype controls.
[0098] Fig. 43: Análise FACS de células imunes intratumorais 24horas após o tratamento com o segundo anticorpo. Análise de Tregs intratumorais. O anticorpo anti-CCR8 TPP15285 leva a uma diminuição média das Tregs intratumorais para 13%, 33% ou 47% das Tregs no controle de isotipo, para 10 mg/kg, 1 mg/kg ou 0,1 mg/kg, respectivamente. O anticorpo anti-CCR8 TPP15286 leva a uma diminuição média das Tregs intratumorais para 10%, 9% ou 14% das Tregs no controle de isotipo, para 10 mg/kg, 1 mg/kg ou 0,1 mg/kg, respectivamente, conforme a Tabela 12.2.1. Análise de células T CD8+ intratu- morais. O aumento médio em % de controle de isotipo é mostrado na Tabela 12.2.1. Análise da proporção de células T CD8+ para células Treg. O anticorpo anti-CCR8 TPP15286 leva a um aumento médio da relação entre células CD8+ e células Treg de 44 (10 mg/kg), 87 (1 mg/kg) ou 68 (0,1 mg/kg). O anticorpo anti-CCR8 TPP15285 leva a um aumento médio da relação entre células CD8+ e células Treg de 64 (10 mg/kg), 16 (1 mg/kg) ou 10 (0,1 mg/kg). Análise da relação de células T CD4+ conv para células Treg.[0098] Fig. 43: FACS analysis of intratumoral immune cells 24 hours after treatment with the second antibody. Analysis of intratumoral Tregs. The anti-CCR8 antibody TPP15285 leads to an average decrease in intratumoral Tregs to 13%, 33%, or 47% of Tregs in the isotype control, for 10 mg/kg, 1 mg/kg, or 0.1 mg/kg, respectively. The anti-CCR8 antibody TPP15286 leads to an average decrease in intratumoral Tregs to 10%, 9%, or 14% of Tregs in the isotype control, for 10 mg/kg, 1 mg/kg, or 0.1 mg/kg, respectively, as shown in Table 12.2.1. Analysis of intratumoral CD8+ T cells. The average % increase in isotype control is shown in Table 12.2.1. Analysis of the ratio of CD8+ T cells to Treg cells. The anti-CCR8 antibody TPP15286 leads to an average increase in the ratio of CD8+ cells to Treg cells of 44 (10 mg/kg), 87 (1 mg/kg), or 68 (0.1 mg/kg). The anti-CCR8 antibody TPP15285 leads to an average increase in the ratio of CD8+ cells to Treg cells of 64 (10 mg/kg), 16 (1 mg/kg), or 10 (0.1 mg/kg). Analysis of the ratio of converting CD4+ T cells to Treg cells.
[0099] Fig. 44: Crescimento do tumor CT26 após tratamento comanticorpos anti-CCR8 glicosilados (TPP-14095, TPP-14099, TPP-15285, TPP-15286) ou aglicosilados (TPP-18208, TPP-18209). A agli- cosilação aboliu amplamente o efeito antitumoral.[0099] Fig. 44: CT26 tumor growth after treatment with glycosylated (TPP-14095, TPP-14099, TPP-15285, TPP-15286) or aglycosylated (TPP-18208, TPP-18209) anti-CCR8 antibodies. Aglycosylation largely abolished the antitumor effect.
[00100] Fig. 45: Gráficos aranha de camundongos portadores de tumor CT26 após tratamento com anticorpos anti-CCR8 glicosilados (TPP-14095, TPP-14099, TPP-15285, TPP-15286) ou aglicosilados(TPP-18208, TPP-18209). A aglicosilação aboliu amplamente o efeito antitumoral, sugerindo um mecanismo dependente de ADCC/ADCP de eficácia antitumoral.[00100] Fig. 45: Spider plots of mice bearing CT26 tumor after treatment with glycosylated (TPP-14095, TPP-14099, TPP-15285, TPP-15286) or aglycosylated (TPP-18208, TPP-18209) anti-CCR8 antibodies. Aglycosylation largely abolished the antitumor effect, suggesting an ADCC/ADCP-dependent mechanism of antitumor efficacy.
[00101] Fig. 46: Análise FACS de células imunes 24 horas após o tratamento com o segundo anticorpo. Números absolutos de células CD45+ intratumorais. Números absolutos de células T CD45+CD8+ intratumorais. Números absolutos de células T CD8+ intratumorais. Números absolutos de células CD4+ intratumorais conv. Análise da depleção de Treg intratumoral por citometria de fluxo mostrando números absolutos de células. A porcentagem média de Tregs residuais em relação ao respectivo controle de isotipo após a administração do anticorpo foi de 15,6% para TPP-14095, 28,2% para TPP-14099, 8,7% para TPP-15285 e 36,5% para TPP-15286. Para os anticorpos aglico- silados não foi observada redução nas Tregs. % de células T CD8+ de células CD45+ intratumorais. Relação de células T CD8+:Treg. Taxa de conversão de CD4+:Treg. Porcentagem de células Treg de células T CD4+. Números absolutos de células Treg 4-1BB+ intratumorais. Números absolutos de células 4-1BB+ CD4+ intratumorais conv.[00101] Fig. 46: FACS analysis of immune cells 24 hours after treatment with the second antibody. Absolute numbers of intratumoral CD45+ cells. Absolute numbers of intratumoral CD45+CD8+ T cells. Absolute numbers of intratumoral CD8+ T cells. Absolute numbers of conventional intratumoral CD4+ cells. Analysis of intratumoral Treg depletion by flow cytometry showing absolute cell numbers. The mean percentage of residual Tregs relative to the respective isotype control after antibody administration was 15.6% for TPP-14095, 28.2% for TPP-14099, 8.7% for TPP-15285, and 36.5% for TPP-15286. No reduction in Tregs was observed for the non-glycosylated antibodies. % of intratumoral CD8+ T cells of CD45+ cells. CD8+:Treg T cell ratio. CD4+:Treg conversion rate. Percentage of Treg cells to CD4+ T cells. Absolute number of intratumoral 4-1BB+ Treg cells. Absolute number of intratumoral 4-1BB+ CD4+ cells converted.
[00102] Fig. 47: Crescimento do tumor EMT6 após tratamento com diferentes doses de anticorpo anti-CCR8 TPP-15285. A significância foi determinada por 1-Way ANOVA mais pós-teste de Sidak após transformação logarítmica.[00102] Fig. 47: EMT6 tumor growth after treatment with different doses of anti-CCR8 antibody TPP-15285. Significance was determined by 1-Way ANOVA plus Sidak's post-hoc test after logarithmic transformation.
[00103] Fig. 48: Crescimento do tumor EMT6 no dia 19 após tratamento com diferentes doses de anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 ou anticorpo anti-CTLA4.[00103] Fig. 48: EMT6 tumor growth on day 19 after treatment with different doses of anti-CCR8 antibody TPP-15285 or anti-CTLA4 antibody.
[00104] Fig. 49: Gráficos aranha de camundongos portadores de tumor EMT6 após tratamento com diferentes doses de anticorpo anti- CCR8 TPP-15285 ou anticorpo anti-CTLA4.[00104] Fig. 49: Spider graphs of mice bearing EMT6 tumor after treatment with different doses of anti-CCR8 TPP-15285 antibody or anti-CTLA4 antibody.
[00105] Fig. 50: Análise FACS de células imunes de camundongos portadores de tumor EMT6 após tratamento com diferentes doses de anticorpo CCR8 TPP-15285 ou anticorpo anti-CTLA4, 24 horas após o segundo tratamento ou no final do estudo. Números absolutos de células Treg intratumorais. Foram observadas diferenças significativas, por exemplo, para 10 mg/kg de anticorpo anti-CCR8 em ambos os pontos de tempo. Relação de células CD8 positivas para Treg. Células CD4+ conv para relação Treg. Porcentagem de células Treg de células T CD4+.[00105] Fig. 50: FACS analysis of immune cells from mice bearing EMT6 tumor after treatment with different doses of CCR8 TPP-15285 antibody or anti-CTLA4 antibody, 24 hours after the second treatment or at the end of the study. Absolute numbers of intratumoral Treg cells. Significant differences were observed, for example, for 10 mg/kg of anti-CCR8 antibody at both time points. Ratio of CD8-positive cells to Treg cells. CD4+ cells converting to Treg cells. Percentage of Treg cells to CD4+ T cells.
[00106] Fig. 51: Análise FACS de células imunes de camundongos portadores de tumor EMT6 após tratamento com diferentes doses de anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 ou anticorpo anti-CTLA4, 24 horas após o segundo tratamento ou no final do estudo. Números absolutos de células CD45+ intratumorais. Números absolutos de células CD4+ intratumorais conv. Números absolutos de células T CD4+ intratumo- rais. Números absolutos de células T CD8+ ativadas intratumorais. Números absolutos de células NK intratumorais. Números absolutos de células T CD8+ intratumorais. Foram observadas diferenças, por exemplo, para 10 mg/kg de anticorpo anti-CCR8 no final do estudo.[00106] Fig. 51: FACS analysis of immune cells from mice bearing EMT6 tumors after treatment with different doses of anti-CCR8 antibody TPP-15285 or anti-CTLA4 antibody, 24 hours after the second treatment or at the end of the study. Absolute numbers of intratumoral CD45+ cells. Absolute numbers of intratumoral CD4+ cells. Absolute numbers of intratumoral CD4+ T cells. Absolute numbers of intratumoral activated CD8+ T cells. Absolute numbers of intratumoral NK cells. Absolute numbers of intratumoral CD8+ T cells. Differences were observed, for example, for 10 mg/kg of anti-CCR8 antibody at the end of the study.
[00107] Fig. 52: Crescimento do tumor F9 após tratamento com diferentes doses de anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 ou anticorpo anti- PDL1.[00107] Fig. 52: Growth of F9 tumor after treatment with different doses of anti-CCR8 antibody TPP-15285 or anti-PDL1 antibody.
[00108] Fig. 53: Volume do tumor F9 no dia 16 após o início do tratamento com diferentes doses de anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 ou anticorpo anti-PDL1. Melhora significativa foi observada pelo menos para uma dose de anticorpo de 10 mg/kg.[00108] Fig. 53: Tumor volume F9 on day 16 after the start of treatment with different doses of anti-CCR8 antibody TPP-15285 or anti-PDL1 antibody. Significant improvement was observed at least for an antibody dose of 10 mg/kg.
[00109] Fig. 54: Gráficos aranha de camundongos portadores de tumor F9 após tratamento com diferentes doses de anticorpos anti- CCR8 ou anticorpo anti-PDL1.[00109] Fig. 54: Spider graphs of mice bearing F9 tumor after treatment with different doses of anti-CCR8 antibodies or anti-PDL1 antibody.
[00110] Fig. 55: Efeitos de anticorpos anti-CCR8 ou anticorpo anti- PDL1 em populações de células imunes e suas relações em tumores F9 analisados por FACS 24 horas após o tratamento com o segundo anticorpo. O anticorpo anti-CCR8 aumentou o número absoluto de células T CD45+ intratumorais, células T CD4+ intratumorais, células T CD8+ intratumorais, células T CD4+conv intratumorais e células NK intratumorais em comparação com o controle de isotipo correspondente. O anticorpo anti-CCR8 a 10 mg/kg diminuiu o número absoluto de células Treg intratumorais (CD4+, CD25+, FoxP3+).[00110] Fig. 55: Effects of anti-CCR8 or anti-PDL1 antibodies on immune cell populations and their relationships in F9 tumors analyzed by FACS 24 hours after treatment with the second antibody. The anti-CCR8 antibody increased the absolute number of intratumoral CD45+ T cells, intratumoral CD4+ T cells, intratumoral CD8+ T cells, intratumoral CD4+conv T cells, and intratumoral NK cells compared to the matched isotype control. The anti-CCR8 antibody at 10 mg/kg decreased the absolute number of intratumoral Treg cells (CD4+, CD25+, FoxP3+).
[00111] Fig. 56: Efeitos de anticorpos anti-CCR8 ou anticorpo anti- PDL1 em populações de células imunes e suas razões em tumores F9 analisados por FACS 24 horas após o segundo tratamento plotado como relação de células T CD8+ para Treg, frequência de células Treg para células T CD4+, frequência de células 4-1BB+ de células T CD8+, frequência de células 4-1BB+ de células Tregs e frequência de células 4-1BB+ de células T CD4+ convencionais. A 10 mg/kg de anticorpo anti-CCR8 aumentou a relação entre células CD8+ e células Treg para aproximadamente 54 ou superior, conforme a Tabela 12.5.1.[00111] Fig. 56: Effects of anti-CCR8 or anti-PDL1 antibodies on immune cell populations and their ratios in F9 tumors analyzed by FACS 24 hours after the second treatment plotted as CD8+ T cell to Treg ratio, Treg to CD4+ T cell frequency, 4-1BB+ CD8+ T cell frequency, 4-1BB+ Treg cell frequency, and 4-1BB+ conventional CD4+ T cell frequency. 10 mg/kg of anti-CCR8 antibody increased the CD8+ to Treg cell ratio to approximately 54 or higher, as shown in Table 12.5.1.
[00112] Fig. 57: Eficácia de tratamentos de combinação em camundongos portadores de tumor C38. a. Crescimento do tumor C38 após tratamento com anticorpos substitutos anti-CCR8 TPP-14099 ou TPP-15285 ou anticorpo anti-PD-L1 ou após tratamento de combinação com 3 mg/kg de anticorpo anti-PDL1, 10 mg/kg de TPP-15285. Significância determinada por 1-Way ANOVA mais pós-teste de Sidak após transformação de log. b. Gráfico de sobrevivência de camundongos portadores de tumor C38 após tratamento com anticorpo CCR8 antimurino TPP-15285 (10 mg/kg), anticorpo PD-L1 antimurino (PDL1, 3 mg/kg) ou uma combinação de TPP-15285 (10 mg/kg) e anticorpo PD-1 antimurino (3 mg/kg).[00112] Fig. 57: Efficacy of combination treatments in C38 tumor-bearing mice. a. C38 tumor growth after treatment with anti-CCR8 surrogate antibodies TPP-14099 or TPP-15285 or anti-PD-L1 antibody or after combination treatment with 3 mg/kg of anti-PDL1 antibody, 10 mg/kg of TPP-15285. Significance determined by 1-Way ANOVA plus Sidak's post-hoc test after log transformation. b. Survival graph of C38 tumor-bearing mice after treatment with antimurine CCR8 antibody TPP-15285 (10 mg/kg), antimurine PD-L1 antibody (PDL1, 3 mg/kg) or a combination of TPP-15285 (10 mg/kg) and antimurine PD-L1 antibody (3 mg/kg).
[00113] Fig. 58: Análise de depleção de Treg tumoral em tumores C38 por citometria de fluxo (amostragem 24 horas após o tratamento com o segundo anticorpo). Camundongos portadores de tumor C38 foram tratados com anticorpos substitutos anti-CCR8 TPP-14099 ou TPP-15285 ou anticorpo anti-PD-L1 em monoterapia, ou com TPP- 15285 em combinação com anticorpo anti-PD-L1. Depleção absoluta de Tregs. Relações de células T CD8+/células Treg.[00113] Fig. 58: Analysis of tumor Treg depletion in C38 tumors by flow cytometry (sampling 24 hours after treatment with the second antibody). Mice bearing C38 tumors were treated with anti-CCR8 surrogate antibodies TPP-14099 or TPP-15285 or anti-PD-L1 antibody in monotherapy, or with TPP-15285 in combination with anti-PD-L1 antibody. Absolute Treg depletion. CD8+ T cell/Treg cell ratios.
[00114] Fig. 59: Macrófagos CD11+ F4/80+ em tumores C38 conforme analisado por citometria de fluxo (amostragem no final do estudo).[00114] Fig. 59: CD11+ F4/80+ macrophages in C38 tumors as analyzed by flow cytometry (sampling at the end of the study).
[00115] Fig. 60: Crescimento do tumor B16F10-OVA após tratamento com TPP-15285, anticorpo anti-CTLA4 ou ambos.[00115] Fig. 60: Growth of B16F10-OVA tumor after treatment with TPP-15285, anti-CTLA4 antibody or both.
[00116] Fig. 61: Crescimento tumoral EMT-6 após tratamento com anticorpo CCR8 antimurino TPP-15285 (1 mg/kg), anticorpo PD-1 an- timurino (CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) ou uma combinação de TPP- 15285 (1 mg/kg) e anticorpo PD-1 antimurino (10 mg/kg), (duas vezes por semana ip). Média com desvio padrão.[00116] Fig. 61: EMT-6 tumor growth after treatment with CCR8 antimurine antibody TPP-15285 (1 mg/kg), PD-1 antimurine antibody (CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) or a combination of TPP-15285 (1 mg/kg) and PD-1 antimurine antibody (10 mg/kg), (twice weekly i.p.). Mean with standard deviation.
[00117] Fig. 62: Análise FACS de populações de células imunes em tumores EMT-6 analisados por citometria de fluxo, amostragem 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo. Células T CD4+, Tregs, células T CD8+, células NK, relações de células T CD8+ para Tregs. Caixa e bigodes, min a máx com mediana (GraphPad).[00117] Fig. 62: FACS analysis of immune cell populations in EMT-6 tumors analyzed by flow cytometry, sampling 24 hours after the second antibody treatment. CD4+ T cells, Tregs, CD8+ T cells, NK cells, CD8+ T cell to Treg ratios. Box and whiskers, min to max with median (GraphPad).
[00118] Fig. 63: uma. Análise de camundongos portadores de tumor C38 após tratamento com anticorpo CCR8 antimurino TPP-15285 (5 mg/kg), anticorpo PD-1 antimurino (CDRs: atezolizumab, 5 mg/kg) ou uma combinação de TPP-15285 (5 mg/kg) e anticorpo PD-1 anti- murino (5 mg/kg), (cada duas vezes por semana ip). a. Volume do tumor. Média com desvio padrão. b. Gráfico de sobrevivência.[00118] Fig. 63: a. Analysis of C38 tumor-bearing mice after treatment with anti-murine CCR8 antibody TPP-15285 (5 mg/kg), anti-murine PD-1 antibody (CDRs: atezolizumab, 5 mg/kg) or a combination of TPP-15285 (5 mg/kg) and anti-murine PD-1 antibody (5 mg/kg), (twice weekly i.p.). a. Tumor volume. Mean with standard deviation. b. Survival graph.
[00119] Fig. 64: Análise de células T CD4+ tumorais, Tregs, células T CD8+, células NK ou relações de células T CD8+ para Tregs em tumores C38 por citometria de fluxo (amostragem 24 horas após o se-gundo tratamento com anticorpo).[00119] Fig. 64: Analysis of tumor CD4+ T cells, Tregs, CD8+ T cells, NK cells or CD8+ T cell to Treg ratios in C38 tumors by flow cytometry (sampled 24 hours after the second antibody treatment).
[00120] Fig. 65: Crescimento tumoral MB49 após tratamento com anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 (10 mg/kg) sozinho, anticorpo anti- PD-1 (aPD-1, CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) sozinho ou tratamento de combinação sequencial de TPP-15285 (10 mg/kg) e anticorpo anti- PD-1 (10 mg/kg) (ambos duas vezes por semana ip).[00120] Fig. 65: MB49 tumor growth after treatment with anti-CCR8 antibody TPP-15285 (10 mg/kg) alone, anti-PD-1 antibody (aPD-1, CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) alone or sequential combination treatment of TPP-15285 (10 mg/kg) and anti-PD-1 antibody (10 mg/kg) (both twice weekly i.p.).
[00121] Fig. 66: Análise de células tumorais CD45+, Tregs, células T CD8+, células NK e relação de CD8 para Tregs em tumores MB49 por citometria de fluxo (amostragem no final do estudo).[00121] Fig. 66: Analysis of CD45+ tumor cells, Tregs, CD8+ T cells, NK cells and CD8 to Treg ratio in MB49 tumors by flow cytometry (sampling at the end of the study).
[00122] Fig. 67: Crescimento tumoral EMT-6 após tratamento com anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 (5 mg/kg, q3/4d ip), Oxaliplatina (5 mg/kg, q4d ip), Doxorrubicina (6 mg/kg, iv SD), Docetaxel (10 mg/kg, q2dx5, iv) ou uma combinação de TPP-15285 com Oxaliplatina, Doxor- rubicina ou Docetaxel.[00122] Fig. 67: EMT-6 tumor growth after treatment with anti-CCR8 antibody TPP-15285 (5 mg/kg, q3/4d ip), Oxaliplatin (5 mg/kg, q4d ip), Doxorubicin (6 mg/kg, iv SD), Docetaxel (10 mg/kg, q2dx5, iv) or a combination of TPP-15285 with Oxaliplatin, Doxorubicin or Docetaxel.
[00123] Fig. 68: Crescimento do tumor MB49 após tratamento com anticorpo anti-CCR8 TPP-15285, gencitabina ou uma combinação de TPP-15285 com gencitabina.[00123] Fig. 68: Growth of MB49 tumor after treatment with anti-CCR8 antibody TPP-15285, gemcitabine or a combination of TPP-15285 with gemcitabine.
[00124] Fig. 69: Crescimento de tumor de pulmão de Lewis após tratamento com anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 (10 mg/kg) sozinho, anticorpo anti-PD-1 (aPD-1, CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) sozinho, anticorpo anti-PD-L1 (10 mg/kg) sozinho, anticorpo anti-CTLA4 sozinho, TPP-15285 (10 mg/kg) e anticorpo PD-1 antimurino (10 mg/kg) em combinação, ou TPP-15285 (10 mg/kg) e anticorpo anti-PD-L1 (10 mg/kg) em combinação.[00124] Fig. 69: Growth of Lewis lung tumor after treatment with anti-CCR8 antibody TPP-15285 (10 mg/kg) alone, anti-PD-1 antibody (aPD-1, CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) alone, anti-PD-L1 antibody (10 mg/kg) alone, anti-CTLA4 antibody alone, TPP-15285 (10 mg/kg) and anti-murine PD-1 antibody (10 mg/kg) in combination, or TPP-15285 (10 mg/kg) and anti-PD-L1 antibody (10 mg/kg) in combination.
[00125] Fig. 70: Crescimento do tumor EMT-6 após tratamento com anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 (3 mg/kg) ou radioterapia (RT, 3 x 2 Gy) sozinho ou em combinação. A significância foi determinada por 1-Way ANOVA mais pós-teste de Sidak após transformação logarítmica.[00125] Fig. 70: Growth of EMT-6 tumor after treatment with anti-CCR8 antibody TPP-15285 (3 mg/kg) or radiotherapy (RT, 3 x 2 Gy) alone or in combination. Significance was determined by 1-Way ANOVA plus Sidak's post-hoc test after logarithmic transformation.
[00126] Fig. 71: Níveis de expressão de mRNA de diferentes marcadores de células imunes em diferentes modelos de tumores singêni- cos tratados com controle de isotipo (TPP-9809) ou anticorpo anti- CCR8 (TPP-14099). A expressão mediana nos grupos de controle tra- tados com isotipo é definida como zero. A expressão gênica é medida em transcritos por milhão (TPM) conforme estimado pelo algoritmo RSEM. Marcador Treg Foxp3. Níveis de Foxp3 significativamente mais altos são observados nos modelos CT26, H22, Hepa1-6 e RM1 tratados com TPP-14099, indicando aumento da infiltração de Treg, após a administração de pelo menos três doses de TPP-14099.[00126] Fig. 71: mRNA expression levels of different immune cell markers in different syngeneic tumor models treated with isotype control (TPP-9809) or anti-CCR8 antibody (TPP-14099). Median expression in isotype-treated control groups is defined as zero. Gene expression is measured in transcripts per million (TPM) as estimated by the RSEM algorithm. Treg Foxp3 marker. Significantly higher Foxp3 levels are observed in CT26, H22, Hepa1-6, and RM1 models treated with TPP-14099, indicating increased Treg infiltration after administration of at least three doses of TPP-14099.
[00127] Fig. 72: Marcador de inflamação lfng. Níveis de lfng significativamente mais altos são observados nos modelos H22, CT26 e RM1 tratados com TPP-14099 apontando para uma forte atividade pró-inflamatória induzida por TPP-14099.[00127] Fig. 72: Inflammation marker lfng. Significantly higher lfng levels are observed in the H22, CT26, and RM1 models treated with TPP-14099, pointing to strong pro-inflammatory activity induced by TPP-14099.
[00128] Fig. 73: Marcador de macrófago Ms4a7. Níveis significativamente mais altos de Ms4a7 são observados nos modelos CT26, H22 e Hepa1-6 tratados com TPP-14099, indicando aumento da infil-tração de macrófagos causada por TPP-14099.[00128] Fig. 73: Macrophage marker Ms4a7. Significantly higher levels of Ms4a7 are observed in CT26, H22, and Hepa1-6 models treated with TPP-14099, indicating increased macrophage infiltration caused by TPP-14099.
[00129] Fig. 74: Marcadores de células T citotóxicas Cd8a e Cd8b1. Níveis de células T citotóxicas significativamente mais elevados são observados nos modelos CT26, H22, RM1 e Hepa1-6 tratados com TPP-14099, indicando a indução de infiltração e/ou proliferação de células T citotóxicas por TPP-14099.[00129] Fig. 74: Cytotoxic T cell markers Cd8a and Cd8b1. Significantly higher levels of cytotoxic T cells are observed in CT26, H22, RM1 and Hepa1-6 models treated with TPP-14099, indicating the induction of cytotoxic T cell infiltration and/or proliferation by TPP-14099.
[00130] Fig. 75: Marcador de células exterminadoras naturais (NK) Ncr1. Níveis de células NK significativamente mais altos são observados nos modelos CT26, H22 e Hepa1-6 tratados com TPP-14099.[00130] Fig. 75: Natural killer (NK) cell marker Ncr1. Significantly higher NK cell levels are observed in CT26, H22, and Hepa1-6 models treated with TPP-14099.
[00131] Fig. 76: Marcadores de células Pan T Cd3e/d/g. Níveis de células T significativamente mais altos são observados nos modelos CT26, H22 e Hepa1-6 tratados com TPP-14099.[00131] Fig. 76: Pan T cell markers Cd3e/d/g. Significantly higher T cell levels are observed in CT26, H22, and Hepa1-6 models treated with TPP-14099.
[00132] Fig. 77: Marcador Treg ativado e anticorpo alvo Ccr8. Níveis significativamente mais altos de Ccr8 são observados nos modelos CT26, H22 e Hepa1-6 tratados com TPP-14099.[00132] Fig. 77: Activated Treg marker and target antibody Ccr8. Significantly higher levels of Ccr8 are observed in CT26, H22, and Hepa1-6 models treated with TPP-14099.
[00133] Fig. 78: Marcador de macrófago M1 pró-inflamatório altamente específico Acod1 (a) e marcador de macrófago M2 anti- inflamatório altamente específico Mrc1 (b). Níveis de macrófagos M1 marcadamente mais altos são observados nos modelos CT26, 4T1, H22, Hepa1-6 e RM1 tratados com TPP-14099, enquanto não são observados níveis de macrófagos M2 marcadamente mais altos em todos os modelos tratados com TPP-14099.[00133] Fig. 78: Highly specific pro-inflammatory M1 macrophage marker Acod1 (a) and highly specific anti-inflammatory M2 macrophage marker Mrc1 (b). Markedly higher M1 macrophage levels are observed in the CT26, 4T1, H22, Hepa1-6, and RM1 models treated with TPP-14099, while markedly higher M2 macrophage levels are not observed in any of the TPP-14099-treated models.
[00134] Fig. 79: Relação de marcador de macrófago M1 pró- inflamatório altamente específico Acod1 e marcador de macrófago M2 anti-inflamatório altamente específico Mrc1. Tomadas em conjunto, múltiplas doses de anticorpo anti-CCR8 TPP-14099 aumentaram a relação de macrófagos M1/M2 nestes modelos de tumor.[00134] Fig. 79: Ratio of highly specific pro-inflammatory M1 macrophage marker Acod1 and highly specific anti-inflammatory M2 macrophage marker Mrc1. Taken together, multiple doses of anti-CCR8 antibody TPP-14099 increased the M1/M2 macrophage ratio in these tumor models.
[00135] Fig. 80: Marcadores de células B Cd19 e Cd22. Níveis de células B acentuadamente mais altos são observados nos modelos CT26, H22, RM1 e Hepa1-6 tratados com TPP-14099. O anticorpo an- ti-CCR8 parece recrutar células B para o tumor. Sem estar limitado pela teoria, o recrutamento de células B pode afetar a resposta antitu- moral induzida por TPP-14099.[00135] Fig. 80: B cell markers Cd19 and Cd22. Markedly higher B cell levels are observed in CT26, H22, RM1, and Hepa1-6 models treated with TPP-14099. The anti-CCR8 antibody appears to recruit B cells to the tumor. Without being limited by theory, B cell recruitment may affect the antitumor response induced by TPP-14099.
[00136] Fig. 81: Níveis de expressão para LTta/b bem como Cxcr5 e seu ligante Cxcl13. Esses marcadores são cruciais para o desenvolvimento de gânglios linfáticos, bem como estruturas linfoides terciárias (conforme Cyster, Jason G. "Blown away: the unexpected role of lym- photoxin in lymphoid organ development." The Journal of Immunology 192.5 (2014): 2007-2009., e Cupedo, Tom, et al. "Induction of secondary and tertiary lymphoid structures in the skin." Immunity 21.5 (2004): 655-667.) que são os principais impulsionadores de um efeito antitu- moral em humanos (conforme Dieu-Nosjean, Marie-Caroline, et al. "Tertiary lymphoid structures, drivers of the anti-tumor responses in human cancers." Immunological reviews 271.1 (2016). Todas as três publicações são aqui incorporadas por referência na sua totalidade.[00136] Fig. 81: Expression levels for LTta/b as well as Cxcr5 and its ligand Cxcl13. These markers are crucial for the development of lymph nodes, as well as tertiary lymphoid structures (as per Cyster, Jason G. "Blown away: the unexpected role of lym-photoxin in lymphoid organ development." The Journal of Immunology 192.5 (2014): 2007-2009., and Cupedo, Tom, et al. "Induction of secondary and tertiary lymphoid structures in the skin." Immunity 21.5 (2004): 655-667.) which are the main drivers of an antitumor effect in humans (as per Dieu-Nosjean, Marie-Caroline, et al. "Tertiary lymphoid structures, drivers of the anti-tumor responses in human cancers." Immunological reviews 271.1 (2016). All three publications are incorporated here by reference in their entirety.
[00137] Fig. 82: Gráficos aranha de crescimento tumoral (medido em mm3) ao longo do tempo no grupo de tratamento TPP-14099 (mos- trado como triângulos) e grupo tratado de controle de isotipo (mostrado como círculos) para diferentes modelos de tumor. Os níveis de infiltração de células T no final do estudo, conforme julgado pelos níveis de mRNA de Cd8a em amostras de tumor em massa correspondentes, são indicados por tons de cinza (preto e cinza claro correspondem aos níveis mais altos e mais baixos de Cd8a, respectivamente). Em H22 e CT26, o tamanho do tumor mostrou uma excelente anticorrelação com os níveis de Cd8a.[00137] Fig. 82: Spider plots of tumor growth (measured in mm3) over time in the TPP-14099 treatment group (shown as triangles) and isotype-treated control group (shown as circles) for different tumor models. T-cell infiltration levels at the end of the study, as judged by Cd8a mRNA levels in corresponding mass tumor samples, are indicated by shades of gray (black and light gray correspond to the highest and lowest Cd8a levels, respectively). In H22 and CT26, tumor size showed an excellent anticorrelation with Cd8a levels.
[00138] Fig. 83: Correlação entre a infiltração do tumor por diferentes populações de células imunes conforme julgado pelos níveis de mRNA de diferentes marcadores de células imunes e tamanho do tu-mor. Os tumores tratados com TPP-14099 são mostrados como triângulos e os tumores tratados com isotipo são mostrados como círculos. O tamanho do tumor é medido em mm3. Forte correlação negativa entre infiltração de células T citotóxicas (conforme avaliado pelos níveis de mRNA de Cd8a+Cd8b1) e tamanhos de tumor CT26. Os tumores tratados com TPP-14099 são menores em tamanho e mostram níveis mais altos de infiltração de células T Cd8a+Cd8b1 do que os controles, indicando que o aumento da infiltração de células T após o tratamento com TPP-14099 causa um crescimento tumoral reduzido. Forte correlação negativa entre a infiltração de células T (conforme medido pelos níveis de mRNA de Cd3) e os tamanhos dos tumores CT26 nos tumores tratados com TPP-14099. Os tumores tratados com TPP-14099 são menores em tamanho e apresentam níveis mais altos de infiltração de células T, isto é, quanto maior o nível de mRNA de Cd3, menores são os tumores. Correlação negativa entre a infiltração de células NK (conforme avaliado pela expressão do marcador NK Ncr1) e os tamanhos do tumor CT26. Os tumores tratados com TPP-14099 são menores em tamanho e apresentam maior infiltração de células NK. O tamanho do tumor está fortemente correlacionado negativamente com a infiltração de NK, quanto maior o nível de NK, menores os tumores. Correlação entre a indução postulada de estruturas linfóides terciárias conforme julgado pelos níveis de mRNA de Lta/Ltb/Cxcr5 e Cxcl13 e tamanhos de tumor CT26 nos tumores tratados com TPP-14099. Para cada um dos quatro marcadores, o nível é fortemente aumentado após o tratamento com TPP-14099 e o tamanho do tumor está fortemente correlacionado negativamente com o nível de expressão, indicando que o aumento da formação de estruturas linfoides terciárias após o tratamento com TPP-14099 causa um crescimento tumoral reduzido.[00138] Fig. 83: Correlation between tumor infiltration by different immune cell populations as judged by mRNA levels of different immune cell markers and tumor size. Tumors treated with TPP-14099 are shown as triangles and tumors treated with the isotype are shown as circles. Tumor size is measured in mm3. Strong negative correlation between cytotoxic T cell infiltration (as assessed by Cd8a+Cd8b1 mRNA levels) and CT26 tumor sizes. Tumors treated with TPP-14099 are smaller in size and show higher levels of Cd8a+Cd8b1 T cell infiltration than controls, indicating that increased T cell infiltration after TPP-14099 treatment causes reduced tumor growth. Strong negative correlation between T cell infiltration (as measured by Cd3 mRNA levels) and CT26 tumor sizes in tumors treated with TPP-14099. Tumors treated with TPP-14099 are smaller in size and exhibit higher levels of T cell infiltration; that is, the higher the Cd3 mRNA level, the smaller the tumors. Negative correlation between NK cell infiltration (as assessed by the expression of the NK marker Ncr1) and CT26 tumor sizes. Tumors treated with TPP-14099 are smaller in size and exhibit greater NK cell infiltration. Tumor size is strongly negatively correlated with NK infiltration; the higher the NK level, the smaller the tumors. Correlation between the postulated induction of tertiary lymphoid structures as judged by Lta/Ltb/Cxcr5 and Cxcl13 mRNA levels and CT26 tumor sizes in tumors treated with TPP-14099. For each of the four markers, the level is strongly increased after treatment with TPP-14099, and tumor size is strongly negatively correlated with the expression level, indicating that the increased formation of tertiary lymphoid structures after treatment with TPP-14099 causes reduced tumor growth.
[00139] Fig. 84: Correlação entre os níveis de infiltração de Cd8a, conforme julgado pela expressão de mRNA de Cd8a, e tamanhos de tumor nos tumores tratados com TPP-14099 (mostrados como triângu-los) e no grupo controle tratado com isotipo (mostrados como círculos) para diferentes modelos de tumor. Os tumores tratados com TPP- 14099 são menores em tamanho e mostram níveis mais altos de infiltração de Cd8a. O tamanho do tumor está fortemente correlacionado negativamente com a infiltração de Cd8a, quanto maior o nível de Cd8a, menores os tumores.[00139] Fig. 84: Correlation between Cd8a infiltration levels, as judged by Cd8a mRNA expression, and tumor sizes in tumors treated with TPP-14099 (shown as triangles) and in the isotype-treated control group (shown as circles) for different tumor models. Tumors treated with TPP-14099 are smaller in size and show higher levels of Cd8a infiltration. Tumor size is strongly negatively correlated with Cd8a infiltration; the higher the Cd8a level, the smaller the tumors.
[00140] Fig. 85: Eficácia do anticorpo CCR8 TPP-15285 em camundongos portadores de tumor EMT6 tratados com quatro esquemas de tratamento diferentes: tratamento único, tratamento duas vezes BIW, tratamento três vezes BIW ou tratamento quatro vezes BIW. Cada grupo foi tratado com controle de veículo ou 0,1 mg/kg, 1 mg/kg ou 5 mg/kg de TPP-15285.[00140] Fig. 85: Efficacy of the CCR8 antibody TPP-15285 in EMT6 tumor-bearing mice treated with four different treatment regimens: single treatment, twice-BIW treatment, three times-BIW treatment, or four times-BIW treatment. Each group was treated with vehicle control or 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, or 5 mg/kg of TPP-15285.
[00141] Fig. 86: Eficácias terapêuticas do anticorpo anti-CCR8 inventivo, anticorpo anti-PD-1, anticorpo anti-PD-L1 ou Paclitaxel testado sozinho ou em combinação em camundongos portadores de tumor singênico MBT2 como mostrado na Tabela 12.6.9.1.[00141] Fig. 86: Therapeutic efficacies of the inventive anti-CCR8 antibody, anti-PD-1 antibody, anti-PD-L1 antibody or Paclitaxel tested alone or in combination in MBT2 syngeneic tumor-bearing mice as shown in Table 12.6.9.1.
[00142] Fig. 87: Eficácia terapêutica do anticorpo anti-CCR8 inventivo após depleção quantitativa da expressão de CD8a+ em camun- dongos DTR tratados com toxina da difteria. A depleção de células T Cd8+ anula o efeito de crescimento antitumoral de TPP15825 (conforme grupo 02b vs grupo 01b).[00142] Fig. 87: Therapeutic efficacy of the inventive anti-CCR8 antibody after quantitative depletion of CD8a+ expression in DTR mice treated with diphtheria toxin. Depletion of CD8+ T cells abolishes the antitumor growth effect of TPP15825 (as per group 02b vs group 01b).
[00143] Fig. 88: Eficácia terapêutica do anticorpo anti-CCR8 inventivo após depleção quantitativa da expressão de CD19+ em camundongos DTR tratados com toxina da difteria. A depleção de células B Cd19+ aumenta o efeito de crescimento antitumoral de TPP15825 (conforme grupo 02b vs grupo 01b).[00143] Fig. 88: Therapeutic efficacy of the inventive anti-CCR8 antibody after quantitative depletion of CD19+ expression in DTR mice treated with diphtheria toxin. Depletion of CD19+ B cells increases the antitumor growth effect of TPP15825 (as per group 02b vs group 01b).
[00144] Fig. 89: Curvas de internalização para vários anticorpos anti-CCR8 inventivos em células HUVEC. Um anticorpo anti-CD71 com perfil de internalização conhecido foi usado como controle positivo. Os dados correspondentes são mostrados na Tabela 10.5.2. Nenhum dos anticorpos obtidos com um método de acordo com a presente invenção mostrou internalização substancial, tornando-os particularmente úteis para abordagens baseadas em ADCC/ADCP.[00144] Fig. 89: Internalization curves for several inventive anti-CCR8 antibodies in HUVEC cells. An anti-CD71 antibody with a known internalization profile was used as a positive control. The corresponding data are shown in Table 10.5.2. None of the antibodies obtained with a method according to the present invention showed substantial internalization, making them particularly useful for ADCC/ADCP-based approaches.
[00145] A listagem de sequência fornecida com o pedido por meio de arquivamento eletrônico está incluída aqui em sua totalidade. SEQ ID NO:1 a SEQ ID NO:108 e SEQ ID NO:157 a SEQ ID NO:168 referem-se aos polipeptídeos isolados que podem ser usados como antí- genos ou para panning fora do alvo. SEQ ID NO:109 a SEQ ID NO:156 referem-se às proteínas receptoras de quimiocinas de diferen-tes espécies. SEQ ID NO: 201 a SEQ ID NO: 965 referem-se aos anticorpos inventivos. A coluna de sulfações é fornecida apenas por conveniência e não se destina a restringir a respectiva sequência de forma alguma. [00145] The sequence listing provided with the application via electronic filing is included herein in its entirety. SEQ ID NO:1 to SEQ ID NO:108 and SEQ ID NO:157 to SEQ ID NO:168 refer to isolated polypeptides that can be used as antigens or for off-target panning. SEQ ID NO:109 to SEQ ID NO:156 refer to chemokine receptor proteins of different species. SEQ ID NO:201 to SEQ ID NO:965 refer to inventive antibodies. The sulfation column is provided for convenience only and is not intended to restrict the respective sequence in any way.
[00146] A menos que definido de outra forma, todos os termos científicos e técnicos usados na descrição, figuras e reivindicações têm seu significado comum como comumente entendido por alguém versado na técnica. Todas as publicações, pedidos de patentes, patentes e outras referências mencionadas aqui são incorporadas por referência em sua totalidade. Em caso de conflito, prevalecerá a presente especificação, incluindo definições. Se dois ou mais documentos incorporados por referência incluírem informações conflitantes e/ou inconsistentes entre si, então o documento com a data de vigência posterior deverá controlar. Quando for feita referência a uma base de dados, os dados efetivos serão o número da versão aplicável 26.05.2021, a menos que indicado de outro modo. Os materiais, métodos e Exemplos são apenas ilustrativos e não se destinam a ser limitativos. A menos que indicado de outro modo, os seguintes termos usados aqui, incluindo a descrição e as reivindicações, têm as definições fornecidas abaixo.[00146] Unless otherwise defined, all scientific and technical terms used in the description, figures, and claims have their common meaning as commonly understood by one skilled in the art. All publications, patent applications, patents, and other references mentioned herein are incorporated by reference in their entirety. In case of conflict, this specification, including definitions, shall prevail. If two or more documents incorporated by reference contain conflicting and/or inconsistent information, then the document with the later effective date shall control. When a database is referenced, the effective date is the applicable version number 26.05.2021, unless otherwise indicated. Materials, methods, and examples are for illustrative purposes only and are not intended to be limiting. Unless otherwise indicated, the following terms used herein, including the description and claims, have the definitions provided below.
[00147] A expressão "cerca de" ou "~", como usada aqui, refere-se a um valor que está dentro de uma faixa de erro aceitável para o valor específico determinado por alguém versado na técnica, que dependerá em parte de como o valor é medido ou determinado, isto é, sobre as limitações do sistema de medição. Por exemplo, "cerca de" pode significar dentro de 1 ou mais de 1 desvio padrão, de acordo com a prática na técnica. O termo "cerca de" também é usado para indicar que a quantia ou valor em questão pode ser o valor designado ou algum outro valor aproximadamente igual. A frase destina-se a transmitir que valores semelhantes promovem resultados ou efeitos equivalentes, tal como descritos aqui. Neste contexto, "cerca de" pode referir-se a uma faixa acima e/ou abaixo de até 10%. Sempre que o termo "cerca de" for especificado para um determinado ensaio ou modalidade, essa de-finição prevalecerá para o contexto específico.[00147] The expression "about" or "~", as used herein, refers to a value that is within an acceptable error range for the specific value determined by someone skilled in the art, which will depend in part on how the value is measured or determined, i.e., on the limitations of the measurement system. For example, "about" may mean within 1 or more than 1 standard deviation, according to practice in the art. The term "about" is also used to indicate that the quantity or value in question may be the designated value or some other approximately equal value. The phrase is intended to convey that similar values promote equivalent results or effects, as described herein. In this context, "about" may refer to a range above and/or below up to 10%. Whenever the term "about" is specified for a particular assay or embodiment, that definition shall prevail for the specific context.
[00148] Os termos "compreendendo", "incluindo", "contendo","possuindo" etc. devem ser lidos de forma expansiva ou aberta e sem limitação. O termo compreendendo quando usado no relatório descritivo inclui "consistindo em".[00148] The terms "comprising", "including", "containing", "possessing", etc. should be read in an expansive or open-ended manner and without limitation. The term comprising, when used in the descriptive report, includes "consisting of".
[00149] Formas singulares como "um, uma (a)", "um, uma (an)" ou "o, a" incluem referências no plural, a menos que o contexto indique claramente o contrário. Assim, por exemplo, a referência a "um anticorpo monoclonal" inclui um único anticorpo monoclonal, bem como uma pluralidade de anticorpos monoclonais, iguais ou diferentes.[00149] Singular forms such as "a", "an", or "the" include plural references unless the context clearly indicates otherwise. Thus, for example, the reference to "a monoclonal antibody" includes a single monoclonal antibody as well as a plurality of monoclonal antibodies, whether the same or different.
[00150] Similarmente, a referência à "célula" inclui uma única célula, bem como uma pluralidade de células.[00150] Similarly, the reference to "cell" includes a single cell as well as a plurality of cells.
[00151] A menos que de outro indicado, o termo "pelo menos" que precede uma série de elementos deve ser entendido como se referindo a todos os elementos da série. Os termos "pelo menos um" e "pelo menos um de" incluem, por exemplo, um, dois, três, quatro, cinco ou mais elementos.[00151] Unless otherwise indicated, the term "at least" preceding a series of elements should be understood as referring to all elements of the series. The terms "at least one" and "at least one of" include, for example, one, two, three, four, five or more elements.
[00152] Além disso, entende-se que pequenas variações acima e abaixo de uma faixa indicada podem ser usadas para alcançar substancialmente os mesmos resultados que um valor dentro da faixa. Além disso, a menos que indicado de outra forma, a descrição de faixas pretende ser uma faixa contínua incluindo todos os valores entre os valores mínimo e máximo.[00152] Furthermore, it is understood that small variations above and below a given range may be used to achieve substantially the same results as a value within the range. Additionally, unless otherwise indicated, the description of ranges is intended to be a continuous range including all values between the minimum and maximum values.
[00153] O termo "aminoácido" ou "resíduo de aminoácido", como usado aqui, refere-se tipicamente a um aminoácido de ocorrência natural. O código de uma letra é usado aqui para se referir ao respectivo aminoácido. Como usado aqui, um "aminoácido carregado" é um aminoácido que é carregado negativamente ou carregado positivamente. Os "aminoácidos carregados negativamente" são o ácido aspártico (D) e o ácido glutâmico (E). "Aminoácidos carregados positivamente" são arginina (R), lisina (K) e histidina (H). "Aminoácidos polares" são todos os aminoácidos que formam ligações de hidrogênio como doadores ou aceitadores. Estes são todos os aminoácidos carregados e asparagina (N), glutamina (Q), serina (S), treonina (T), tirosina (Y) e cisteína (C). "Aminoácidos polares não carregados" são asparagina (N), glutamina (Q), serina (S), treonina (T), tirosina (Y) e cisteína (C). Os "aminoácidos anfifáticos" são triptofano (W), tiro- sina (Y) e metionina (M). Os "aminoácidos aromáticos" são fenilala- nina (F), tirosina (Y) e triptofano (W). "Aminoácidos hidrofóbicos" são glicina (G), alanina (A), valina (V), leucina (L), isoleucina (I), prolina (P), fenilalanina (F), metionina (M) e cisteína. "Aminoácidos pequenos" são glicina (G), alanina (A), serina (S), prolina (P), treonina (T), ácido aspártico (D) e asparagina (N).[00153] The term "amino acid" or "amino acid residue," as used herein, typically refers to a naturally occurring amino acid. The one-letter code is used herein to refer to the respective amino acid. As used herein, a "charged amino acid" is an amino acid that is negatively charged or positively charged. The "negatively charged amino acids" are aspartic acid (D) and glutamic acid (E). "Positively charged amino acids" are arginine (R), lysine (K), and histidine (H). "Polar amino acids" are all amino acids that form hydrogen bonds as donors or acceptors. These are all the charged amino acids and asparagine (N), glutamine (Q), serine (S), threonine (T), tyrosine (Y), and cysteine (C). "Uncharged polar amino acids" are asparagine (N), glutamine (Q), serine (S), threonine (T), tyrosine (Y), and cysteine (C). "Amphiphatic amino acids" are tryptophan (W), tyrosine (Y), and methionine (M). "Aromatic amino acids" are phenylalanine (F), tyrosine (Y), and tryptophan (W). "Hydrophobic amino acids" are glycine (G), alanine (A), valine (V), leucine (L), isoleucine (I), proline (P), phenylalanine (F), methionine (M), and cysteine. "Small amino acids" are glycine (G), alanine (A), serine (S), proline (P), threonine (T), aspartic acid (D), and asparagine (N).
[00154] Como usado aqui, os termos "peptídeo", "polipeptídeo" e "proteína" são usados de intercambiavelmente e referem-se a um composto constituído por resíduos de aminoácidos ligados covalente- mente por ligações peptídicas. Uma proteína ou peptídeo deve conter pelo menos dois aminoácidos e nenhuma limitação é colocada no número máximo de aminoácidos. Polipeptídeos incluem qualquer peptí- deo ou proteína compreendendo dois ou mais aminoácidos unidos entre si por ligações peptídicas. Como usado aqui, o termo refere-se tanto a cadeias curtas, que também são comumente referidas na técnica como peptídeos, oligopeptídeos e oligômeros, por exemplo, quanto a cadeias mais longas, que geralmente são referidas na técnica como proteínas, das quais existem são muitos tipos.[00154] As used herein, the terms "peptide," "polypeptide," and "protein" are used interchangeably and refer to a compound consisting of amino acid residues covalently linked by peptide bonds. A protein or peptide must contain at least two amino acids, and no limitation is placed on the maximum number of amino acids. Polypeptides include any peptide or protein comprising two or more amino acids linked together by peptide bonds. As used herein, the term refers both to short chains, which are also commonly referred to in the art as peptides, oligopeptides, and oligomers, for example, and to longer chains, which are generally referred to in the art as proteins, of which there are many types.
[00155] "Polipeptídeos" incluem, por exemplo, fragmentos biologi- camente ativos, polipeptídeos substancialmente homólogos, oligopep- tídeos, homodímeros, heterodímeros, variantes de polipeptídeos, poli- peptídeos modificados, derivados, análogos, proteínas de fusão, entre outros. Os polipeptídeos incluem peptídeos naturais, peptídeos re- combinantes, peptídeos sintéticos ou uma combinação destes.[00155] "Polypeptides" include, for example, biologically active fragments, substantially homologous polypeptides, oligopeptides, homodimers, heterodimers, polypeptide variants, modified polypeptides, derivatives, analogs, fusion proteins, among others. Polypeptides include natural peptides, recombinant peptides, synthetic peptides, or a combination thereof.
[00156] Quando for feita referência genérica a um gene ou proteína de uma certa espécie, tal como camundongo, o análogo de humano deve ser entendido similarmente, a menos que de outro indicado ou obviamente incompatível. Isso vale em particular no contexto de bio- marcadores.[00156] When generic reference is made to a gene or protein of a certain species, such as a mouse, the human analogue should be understood similarly, unless otherwise indicated or obviously incompatible. This is particularly true in the context of biomarkers.
[00157] O termo "isolado" quando aplicado a um ácido nucleico, polipeptídeo, proteína ou anticorpo, denota que o ácido nucleico, poli- peptídeo, proteína ou anticorpo está essencialmente livre de outros componentes celulares com os quais está associado no estado natural. Está preferivelmente em um estado homogêneo. Pode ser em solução seca ou aquosa. Pureza e homogeneidade são tipicamente determinadas usando técnicas de química analítica, tais como eletroforese em gel de poliacrilamida ou cromatografia líquida de alta performance. Uma proteína, polipeptídeo ou anticorpo que é a espécie predominante presente em uma preparação é substancialmente purificado. Em particular, um gene isolado é separado de quadros de leitura abertos que flanqueiam o gene e codificam uma proteína diferente do gene de interesse. No entanto, um polipeptídeo isolado pode ser imobilizado, por exemplo, em contas ou partículas, por exemplo, através de um ligante adequado.[00157] The term "isolate" when applied to a nucleic acid, polypeptide, protein, or antibody, denotes that the nucleic acid, polypeptide, protein, or antibody is essentially free from other cellular components with which it is associated in the natural state. It is preferably in a homogeneous state. It may be in dry or aqueous solution. Purity and homogeneity are typically determined using analytical chemistry techniques, such as polyacrylamide gel electrophoresis or high-performance liquid chromatography. A protein, polypeptide, or antibody that is the predominant species present in a preparation is substantially purified. In particular, an isolated gene is separated from open reading frames that flank the gene and encode a protein different from the gene of interest. However, an isolated polypeptide can be immobilized, for example, on beads or particles, for example, by means of a suitable ligand.
[00158] O termo "purificado" denota que um ácido nucleico ou proteína dá origem essencialmente a uma banda em um gel eletroforético. Particularmente, significa que o ácido nucleico ou proteína é pelo menos 85% puro, mais preferivelmente pelo menos 95% puro e mais preferivelmente pelo menos 99% puro.[00158] The term "purified" denotes that a nucleic acid or protein essentially gives rise to a band on an electrophoretic gel. In particular, it means that the nucleic acid or protein is at least 85% pure, more preferably at least 95% pure, and most preferably at least 99% pure.
[00159] Como usado aqui, o termo "sintético", com referência a, por exemplo, uma molécula de ácido nucleico sintético ou um gene sintético ou um peptídeo sintético refere-se a uma molécula de ácido nucleico ou molécula de polipeptídeo que é produzida por métodos recombinantes e/ou por métodos de síntese. Como usado aqui, a produção por meios recombinantes usando métodos de DNA recombinan- te significa o uso de métodos bem conhecidos de biologia molecular para expressar proteínas codificadas por DNA clonado.[00159] As used herein, the term "synthetic," with reference to, for example, a synthetic nucleic acid molecule or a synthetic gene or a synthetic peptide, refers to a nucleic acid molecule or polypeptide molecule that is produced by recombinant methods and/or by synthetic methods. As used herein, production by recombinant means using recombinant DNA methods means the use of well-known molecular biology methods to express proteins encoded by cloned DNA.
[00160] "Modificação(ões) pós-tradução" (PTM) refere-se à(s)modificação(ões) covalente(s) de peptídeos ou proteínas, que são introduzidas após a biossíntese de proteínas em condições naturais. O termo inclui, sem limitação, glicosilação, fosforilação, acilação, adeni- lação, farnesilação, ubiquitinação e sulfatação. Modificações pós- traducionais podem influenciar a atividade de peptídeos ou proteínas.[00160] "Post-translational modification(s)" (PTM) refers to the covalent modification(s) of peptides or proteins that are introduced after protein biosynthesis under natural conditions. The term includes, without limitation, glycosylation, phosphorylation, acylation, adenylation, farnesylation, ubiquitination, and sulfation. Post-translational modifications can influence the activity of peptides or proteins.
[00161] Em 2004, Gutierrez et al. descreveram o estado de sulfata- ção e glicosilação do receptor de quimiocina CCR8 de murino e a maneira pela qual essas modificações pós-traducionais afetam a atividade de CCR8. Eles sugerem que as tirosinas nas posições 14 e 15 no CCR8 de camundongo são resíduos de aminoácidos sulfatados, enquanto a asparagina 8 e as treoninas 10 e 12 são glicosiladas. Além disso, eles mostram que as sulfações são importantes para a atividade de CCR8 (Gutiérrez, Julio, et al. "Analysis of post-translational CCR8 modifications and their influence on receptor activity." Journal of Biological Chemistry 279.15 (2004): 14726-14733.).[00161] In 2004, Gutierrez et al. described the sulfation and glycosylation state of the murine CCR8 chemokine receptor and the way in which these post-translational modifications affect CCR8 activity. They suggest that the tyrosines at positions 14 and 15 in mouse CCR8 are sulfated amino acid residues, while asparagine 8 and threonines 10 and 12 are glycosylated. Furthermore, they show that sulfations are important for CCR8 activity (Gutiérrez, Julio, et al. "Analysis of post-translational CCR8 modifications and their influence on receptor activity." Journal of Biological Chemistry 279.15 (2004): 14726-14733.).
[00162] Uma "sulfatação" é uma modificação pós-traducional em que um grupo sulfato é adicionado a um aminoácido, tal como um resíduo de tirosina de um polipeptídeo ou proteína. Sulfatação de tirosi- na ocorre em todos os organismos multicelulares. Em condições fisio-lógicas, é catalisada pelas tirosilproteínas sulfotransferases (TPSTs) 1 e 2, enzimas residentes em Golgi que transferem o sulfato do cofator PAPS (3'-fosfoadenosina 5'-fosfosulfato) para uma tirosina dependente de contexto em um substrato proteico. A sulfatação sintética da tirosi- na pode ser realizada com uma técnica conhecida na técnica, por exemplo, como descrito em Bunschoten, Anton, et al. "A general se-quence independent solid phase method for the site specific synthesis of multiple sulfated-tyrosine containing peptides." Chemical Communications 21 (2009): 2999-3001. Um polipeptídeo sulfatado é um polipep- tídeo compreendendo pelo menos uma sulfatação. Um polipeptídeo não sulfatado é um polipeptídeo que não compreende sulfatação.[00162] A "sulfation" is a post-translational modification in which a sulfate group is added to an amino acid, such as a tyrosine residue of a polypeptide or protein. Tyrosine sulfation occurs in all multicellular organisms. Under physiological conditions, it is catalyzed by tyrosylprotein sulfotransferases (TPSTs) 1 and 2, Golgi-resident enzymes that transfer sulfate from the cofactor PAPS (3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate) to a context-dependent tyrosine on a protein substrate. Synthetic tyrosine sulfation can be performed using a technique known in the art, for example, as described in Bunschoten, Anton, et al. "A general sequence-independent solid phase method for the site-specific synthesis of multiple sulfated-tyrosine-containing peptides." Chemical Communications 21 (2009): 2999-3001. A sulfated polypeptide is a polypeptide comprising at least one sulfation. A non-sulfated polypeptide is a polypeptide that does not comprise sulfation.
[00163] Um "domínio rico em tirosina" (TRD) é um domínio conservado que caracteriza sete proteínas transmembranares, tais como os receptores de quimiocinas CXC e CC. O TRD está tipicamente localizado no N-terminal do receptor de quimiocina e está tipicamente ligado a um domínio LID através de uma cisteína, como a Fig. 2b. Desse modo, como aqui usado, o termo TRD refere-se à sequência de aminoácidos ou proteína de um receptor de quimiocina CXC ou CC que está localizado no N-terminal da primeira cisteína contada a partir do N-terminal. O TRD pode ou não compreender um peptídeo sinal. O TRD pode ou não ser modificado. Além da tirosina, um TRD geralmente compreende resíduos de aminoácidos carregados negativamente, tal como ácido aspártico. TRDs foram propostos como estruturas importantes para a interação de receptores de quimiocinas com seus li- gantes endógenos. Sob condições fisiológicas, os resíduos de tirosina em um TRD podem ser sulfatados, não sulfatados ou parcialmente sul-fatados. As sequências específicas para os TRDs dos respectivos receptores de quimiocinas são fornecidas na Tabela 4.1.[00163] A "tyrosine-rich domain" (TRD) is a conserved domain that characterizes seven transmembrane proteins, such as the CXC and CC chemokine receptors. The TRD is typically located at the N-terminus of the chemokine receptor and is typically linked to a LID domain via a cysteine, as in Fig. 2b. Thus, as used herein, the term TRD refers to the amino acid sequence or protein of a CXC or CC chemokine receptor that is located at the N-terminus of the first cysteine counted from the N-terminus. The TRD may or may not comprise a signal peptide. The TRD may or may not be modified. In addition to tyrosine, a TRD generally comprises negatively charged amino acid residues, such as aspartic acid. TRDs have been proposed as important structures for the interaction of chemokine receptors with their endogenous ligands. Under physiological conditions, tyrosine residues in a TRD can be sulfated, non-sulfated, or partially sulfated. The specific sequences for the TRDs of the respective chemokine receptors are provided in Table 4.1.
[00164] No entanto, é óbvio que as mutações podem ser introduzidas na sequência de TRD sem alterar a carga geral e o padrão de interação. Preferivelmente, um TRD tem pelo menos 90%, 95% ou 99% de identidade de sequência ou similaridade de sequência com pelo menos uma sequência de TRD de acordo com a Tabela 4.1.[00164] However, it is obvious that mutations can be introduced into the TRD sequence without altering the overall loading and interaction pattern. Preferably, a TRD has at least 90%, 95%, or 99% sequence identity or sequence similarity with at least one TRD sequence according to Table 4.1.
[00165] O termo "N-terminal" ou "N termo" de um receptor de quimiocina, como usado aqui, refere-se aos aminoácidos do N-terminal do receptor de quimiocina compreendendo pelo menos o TRD. Quando um polipeptídeo ou proteína compreende um peptídeo sinal, o N- terminal também pode se referir à sequência do N-terminal atrás do sítio de clivagem natural do polipeptídeo ou proteína. de acordo com algumas modalidades preferidas, o N-terminal compreende o domínio LID e o domínio TRD de um receptor de quimiocina, mas não compre-ende a cisteína natural entre esses dois domínios. Em vez disso, a cis- teína pode ser removida ou substituída por um aminoácido diferente.[00165] The term "N-terminal" or "N-term" of a chemokine receptor, as used herein, refers to the N-terminal amino acids of the chemokine receptor comprising at least the TRD. When a polypeptide or protein comprises a signal peptide, the N-terminal may also refer to the N-terminal sequence behind the natural cleavage site of the polypeptide or protein. According to some preferred embodiments, the N-terminal comprises the LID domain and the TRD domain of a chemokine receptor, but does not comprise the natural cysteine between these two domains. Instead, the cysteine may be removed or replaced with a different amino acid.
[00166] O domínio "LID" de um receptor de quimiocina, como usado aqui, refere-se a uma sequência de aminoácidos localizada no terminal C do TRD do receptor de quimiocina. Os domínios TRD e LID são normalmente separados por uma única cisteína.[00166] The "LID" domain of a chemokine receptor, as used herein, refers to an amino acid sequence located at the C-terminus of the chemokine receptor's TRD. The TRD and LID domains are normally separated by a single cysteine.
[00167] "Identidade de sequência" ou "identidade percentual" é um número que descreve o quão semelhante uma sequência de consulta é a uma sequência de destino, mais precisamente quantos caracteres em cada sequência são idênticos após o alinhamento. A ferra-menta mais popular para calcular a identidade de sequências é o BLAST (ferramenta básica de pesquisa de alinhamento local, https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/), que realiza comparações entre pares de sequências, buscando regiões de similaridade local. Métodos de alinhamento adequados são conhecidos na técnica, por exemplo, algoritmo Needleman-Wunsch para alinhamento global-global, usando a matriz BLOSUM62, com penalidade de abertura de lacuna de 11 e uma penalidade de extensão de lacuna de 1. Depois, os pares de resíduos idênticos alinhados podem ser contados e em seguida, dividido pelo comprimento total do alinhamento (incluindo lacunas, internas e externas) para chegar ao valor de identidade percentual.[00167] "Sequence identity" or "percent identity" is a number that describes how similar a query sequence is to a target sequence, more precisely how many characters in each sequence are identical after alignment. The most popular tool for calculating sequence identity is BLAST (Basic Local Alignment Search Tool, https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/), which performs pairwise comparisons of sequences, searching for regions of local similarity. Suitable alignment methods are known in the art, for example, the Needleman-Wunsch algorithm for global-global alignment, using the BLOSUM62 matrix, with a gap opening penalty of 11 and a gap extension penalty of 1. Then, the aligned identical residue pairs can be counted and then divided by the total length of the alignment (including gaps, internal and external) to arrive at the percent identity value.
[00168] Para valores de "% de similaridade" ou "similaridade de sequência", a mesma abordagem dos valores percentuais de identidade pode ser usada, exceto que o que é contado, em vez de pares de resíduos idênticos, são os pares de resíduos alinhados com valores de BLOSUM62 que não são negativos (isto é, >0).[00168] For "% similarity" or "sequence similarity" values, the same approach as for percent identity values can be used, except that what is counted, instead of identical residual pairs, are the residual pairs aligned with BLOSUM62 values that are not negative (i.e., >0).
[00169] "Receptor de sete transmembranas" (receptores 7-TM) são proteínas integrais de membrana que contêm sete hélices trans- membranares. Tal como aqui usado, os receptores 7-TM são receptores acoplados à proteína G.[00169] "Seven-transmembrane receptors" (7-TM receptors) are integral membrane proteins that contain seven transmembrane helices. As used herein, 7-TM receptors are G protein-coupled receptors.
[00170] "Receptores de quimiocinas" são receptor de sete trans- membranas. A família de receptores de quimiocinas contém 24 membros em humanos e pode ser subdividida, com base na classe de qui- miocinas que se ligam, em quatro subfamílias: CX3CR, CXCR, CCR e XCR, todas elas ativadoras de proteínas G, e ACKR, contendo 6 receptores atípicos, incapaz de ativar as proteínas G após a ligação do ligante.[00170] "Chemokine receptors" are seven-transmembrane receptors. The chemokine receptor family contains 24 members in humans and can be subdivided, based on the class of chemokines they bind to, into four subfamilies: CX3CR, CXCR, CCR, and XCR, all of which are G protein activators, and ACKR, containing 6 atypical receptors, incapable of activating G proteins after ligand binding.
[00171] "Receptores de quimiocinas CXC" (CXCR) são proteínas integrais de membrana que se ligam e respondem especificamente às citocinas da família de quimiocinas CXC. Eles representam uma sub- família de receptores de quimiocinas, uma grande família de receptores ligados à proteína G que são conhecidos como sete proteínas transmembrana (7-TM), uma vez que atravessam a membrana celular sete vezes. Existem atualmente sete receptores de quimiocinas CXC conhecidos em mamíferos, denominados CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 e CXCR6. O CXCR6 está mais intimamente relacionado em estrutura aos receptores de quimiocinas CC do que a outros receptores de quimiocinas CXC.[00171] "CXC chemokine receptors" (CXCRs) are integral membrane proteins that bind to and respond specifically to cytokines of the CXC chemokine family. They represent a subfamily of chemokine receptors, a large family of G protein-coupled receptors known as seven-transmembrane proteins (7-TMs) because they span the cell membrane seven times. There are currently seven known CXC chemokine receptors in mammals, designated CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, and CXCR6. CXCR6 is more closely related structurally to CC chemokine receptors than to other CXC chemokine receptors.
[00172] "Receptores de quimiocinas CC" (CCR, também receptores de quimiocinas beta) são proteínas integrais de membrana que se ligam e respondem especificamente às citocinas da família de quimio- cinas CC. Eles representam uma subfamília de receptores de quimio- cinas, uma grande família de receptores ligados à proteína G que são conhecidos como sete proteínas transmembranares (7-TM), uma vez que atravessam a membrana celular sete vezes. A subfamília dos receptores de quimiocinas CC compreende CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 e CCR10.[00172] "CC chemokine receptors" (CCRs, also beta chemokine receptors) are integral membrane proteins that bind to and respond specifically to cytokines of the CC chemokine family. They represent a subfamily of chemokine receptors, a large family of G protein-coupled receptors known as seven transmembrane proteins (7-TMs) because they cross the cell membrane seven times. The CC chemokine receptor subfamily comprises CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, and CCR10.
[00173] O termo "CCR8" refere-se ao receptor de quimiocina CC tipo 8. A proteína CCR8 é codificada pelo gene CCR8 (gene NCBI ID 1237). Sinônimos para CCR8 são, inter alia, CC-CKR-8, CCR-8, CDw198, CKRL1, CMKBR8, CMKBRL2, GPRCY6, CY6, TER1. A proteína CCR8 compreende humanos, murinos, ratos, macacos rhesus e outros homólogos de mamíferos e não mamíferos. A(s) sequência(s) para o CCR8 humano são acessíveis através do Identificador UniProt P51685 (CCR8_HUMAN), por exemplo, isoforma humana P51685-1 ou P51685-2 (UniProt, 29 de novembro de 2019).[00173] The term "CCR8" refers to the CC chemokine receptor type 8. The CCR8 protein is encoded by the CCR8 gene (NCBI gene ID 1237). Synonyms for CCR8 are, inter alia, CC-CKR-8, CCR-8, CDw198, CKRL1, CMKBR8, CMKBRL2, GPRCY6, CY6, TER1. The CCR8 protein comprises humans, mice, rats, rhesus monkeys, and other mammalian and non-mammalian homologs. The sequence(s) for human CCR8 are accessible through the UniProt identifier P51685 (CCR8_HUMAN), for example, human isoform P51685-1 or P51685-2 (UniProt, November 29, 2019).
[00174] A(s) sequência(s) para CCR8 de murino são acessíveis através do Identificador UniProt P56484 (CCR8_MOUSE). A(s) se- quência(s) para o macaco Rhesus CCR8 são acessíveis através do identificador UniProt O97665 (CCR8_MACMU). Diferentes isoformas e variantes podem existir para as diferentes espécies e são todas compreendidas pelo termo CCR8. Também estão compreendidas as moléculas CCR8 antes e após a maturação, isto é, independente da clivagem de um ou mais pró-domínios. Além disso, variantes sintéticas da proteína CCR8 podem ser geradas e são compreendidas pelo termo CCR8. A proteína CCR8 pode ainda estar sujeita a várias modificações, por exemplo, modificações sintéticas ou naturais, tais como modificações pós-traducionais. O CCR8 humano recombinante está comercialmente disponível ou pode ser fabricado como conhecido na técnica. CCR8 é um receptor para a quimiocina CCL1/SCYA1/I-309. Barington et al., reportaram a importância de pontes de dissulfeto ex- tracelulares conservadas e resíduos aromáticos na alça extracelular 2 (ECL-2) para a ligação e ativação do ligante no receptor de quimiocina CCR8 (Barington, Line, et al. "Role of conserved disulfide bridges and aromatic residues in extracellular loop 2 of chemokine receptor CCR8 for chemokine and small molecule binding." Journal of Biological Chemistry 291.31 (2016): 16208-16220.). Além disso, eles descobriramque dois resíduos aromáticos distintos em ECL-2, Tyr184 (Cys + 1) e Tyr187 (Cys + 4), foram cruciais para a ligação das quimiocinas CC CCL1 (agonista) e MC148 (antagonista), respectivamente, mas não para ligação de moléculas pequenas.[00174] The sequence(s) for murine CCR8 are accessible via UniProt identifier P56484 (CCR8_MOUSE). The sequence(s) for rhesus monkey CCR8 are accessible via UniProt identifier O97665 (CCR8_MACMU). Different isoforms and variants may exist for different species and are all encompassed by the term CCR8. Also included are CCR8 molecules before and after maturation, i.e., independent of the cleavage of one or more prodomains. In addition, synthetic variants of the CCR8 protein can be generated and are encompassed by the term CCR8. The CCR8 protein may also be subject to various modifications, for example, synthetic or natural modifications, such as post-translational modifications. Recombinant human CCR8 is commercially available or can be manufactured as known in the art. CCR8 is a receptor for the chemokine CCL1/SCYA1/I-309. Barington et al. reported the importance of conserved extracellular disulfide bridges and aromatic residues in extracellular loop 2 (ECL-2) for ligand binding and activation at the CCR8 chemokine receptor (Barington, Line, et al. "Role of conserved disulfide bridges and aromatic residues in extracellular loop 2 of chemokine receptor CCR8 for chemokine and small molecule binding." Journal of Biological Chemistry 291.31 (2016): 16208-16220.). Furthermore, they discovered that two distinct aromatic residues in ECL-2, Tyr184 (Cys + 1) and Tyr187 (Cys + 4), were crucial for the binding of the chemokines CC CCL1 (agonist) and MC148 (antagonist), respectively, but not for the binding of small molecules.
[00175] "Morte Programada 1 (PD-1)" refere-se a um receptor imunoinibidor pertencente à família CD28. PD-1 é expressa predominantemente em células T previamente ativadas in vivo e se liga a dois ligantes, PD-L1 e PD-L2. O termo "PD-1", como usado aqui, inclui, sem limitação, PD-1 humano (hPD-1), variantes, isoformas e homólogos de espécies de hPD-1 e análogos com pelo menos um epítopo comum com hPD-1. A sequência completa de hPD-1 pode ser encontrada sob o número de acesso GenBank U64863 (29 de novembro de 2019).[00175] "Programmed Death 1 (PD-1)" refers to an immunoinhibitory receptor belonging to the CD28 family. PD-1 is predominantly expressed on previously activated T cells in vivo and binds to two ligands, PD-L1 and PD-L2. The term "PD-1," as used herein, includes, without limitation, human PD-1 (hPD-1), variants, isoforms, and species homologs of hPD-1, and analogs with at least one epitope in common with hPD-1. The complete sequence of hPD-1 can be found under GenBank accession number U64863 (November 29, 2019).
[00176] "Ligante de Morte Programada-1 (PD-L1)" é um dos dois ligantes de glicoproteína de superfície celular para PD-1 (o outro sendo PD-L2) que regulam negativamente a ativação de células T e a secreção de citocinas após a ligação à PD-1. O termo "PD-L1", como usado aqui, inclui, sem limitação, PD-L1 humano (hPDL1), variantes, isoformas e homólogos de espécies de hPD-L1 e análogos com pelo menos um epítopo comum com hPD-L1. A sequência completa de hPD-L1 pode ser encontrada no GenBank Acesso No. Q9NZQ7 (29 de novembro de 2019).[00176] "Programmed Death Ligand-1 (PD-L1)" is one of two cell surface glycoprotein ligands for PD-1 (the other being PD-L2) that negatively regulate T cell activation and cytokine secretion upon binding to PD-1. The term "PD-L1," as used herein, includes, without limitation, human PD-L1 (hPDL1), variants, isoforms, and species homologs of hPD-L1, and analogs with at least one epitope in common with hPD-L1. The complete sequence of hPD-L1 can be found in GenBank Accession No. Q9NZQ7 (November 29, 2019).
[00177] "Pontuação de Proporção de Tumor" (TPS) é a porcentagem de células tumorais viáveis que apresentam coloração parcial ou completa da membrana em qualquer intensidade. Por exemplo, uma amostra deve ser considerada como tendo expressão de PD-L1 se TPS > 1% e alta expressão de PDL1 se TPS > 50%. Por exemplo, a expressão da proteína PD-L1 em NSCLC é geralmente determinada usando Pontuação de Proporção de Tumor (TPS).[00177] "Tumor Proportion Score" (TPS) is the percentage of viable tumor cells that exhibit partial or complete membrane staining at any intensity. For example, a sample should be considered to have PD-L1 expression if TPS > 1% and high PD-L1 expression if TPS > 50%. For example, PD-L1 protein expression in NSCLC is commonly determined using Tumor Proportion Score (TPS).
[00178] "Pontuação Positiva Combinada" (CPS) é o número de células de coloração (células tumorais, linfócitos, macrófagos) dividido pelo número total de células tumorais viáveis, multiplicado por 100. Por exemplo, uma amostra deve ser considerada como tendo expressão de PD-L1 se CPS > 1 e ter alta expressão de PD-L1 se CPS > 10. A FDA aprovou o uso do ensaio PD-L1 IHC 22C3 pharmDx para determinar a elegibilidade de um paciente para o anticorpo terapêutico pembrolizumab.[00178] "Combined Positive Score" (CPS) is the number of staining cells (tumor cells, lymphocytes, macrophages) divided by the total number of viable tumor cells, multiplied by 100. For example, a sample should be considered to have PD-L1 expression if CPS > 1 and to have high PD-L1 expression if CPS > 10. The FDA has approved the use of the PD-L1 IHC 22C3 pharmDx assay to determine a patient's eligibility for the therapeutic antibody pembrolizumab.
[00179] "FOXP3" é um fator de transcrição de 50-55 kD, também conhecido como proteína de caixa Forkhead P3, Scurfin, JM2 ou IPEX. Propõe-se ser um gene regulador mestre e um marcador mais específico de células T regulatórias do que a maioria dos marcadores de su-perfície celular. Foi demonstrado que a expressão transduzida de FOXP3 em células CD4+/CD25 induz GITR, CD103, e CTLA4 e confere um fenótipo de célula T reguladora. Os clones de anticorpo Biolegend 206D e 259D reconhecem um epítopo humano de FOXP3 na re-gião dos aminoácidos 105 a 235. Poly6238 reconhece FOXP3 humano e de camundongo e foi criado contra a porção N-terminal de FOXP3.[00179] "FOXP3" is a 50-55 kD transcription factor, also known as Forkhead Box Protein P3, Scurfin, JM2, or IPEX. It is proposed to be a master regulatory gene and a more specific marker of regulatory T cells than most cell surface markers. Transduced expression of FOXP3 in CD4+/CD25 cells has been shown to induce GITR, CD103, and CTLA4 and confer a regulatory T cell phenotype. The antibody clones Biolegend 206D and 259D recognize a human epitope of FOXP3 in the amino acid region 105 to 235. Poly6238 recognizes human and mouse FOXP3 and was engineered against the N-terminal portion of FOXP3.
[00180] O termo "modulação" refere-se a qualquer alteração de um processo ou comportamento existente, tal como bloqueio (antagonismo) e indução (agonismo). Por exemplo, a modulação da sinalização independente da proteína G refere-se a qualquer alteração signifi-cativa da sinalização independente da proteína G.[00180] The term "modulation" refers to any alteration of an existing process or behavior, such as blocking (antagonism) and induction (agonism). For example, modulation of G protein-independent signaling refers to any significant alteration of G protein-independent signaling.
[00181] O termo "internalização" de um anticorpo, fragmento ou conjugado refere-se à absorção do anticorpo, fragmento ou conjugado em uma célula. Preferivelmente, a internalização é determinada para uma linhagem celular com expressão alvo endógena, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui para CCR8 humano ou murino. Preferivelmente, a internalização é determinada medindo a intensidade de fluorescência internalizada total por célula e é quantificada em relação a um controle de isotipo, por exemplo, como descrito no Exemplo 10.5. Em resumo, o anticorpo, fragmento ou conjugado e um controle de isotipo correspondente são marcados com um corante e a fluorescência internalizada é determinada e quantificada para o anticorpo, fragmento ou conjugado em relação ao controle de isotipo.[00181] The term "internalization" of an antibody, fragment, or conjugate refers to the uptake of the antibody, fragment, or conjugate into a cell. Preferably, internalization is determined for a cell line with endogenous target expression, for example, as described elsewhere herein for human or murine CCR8. Preferably, internalization is determined by measuring the total internalized fluorescence intensity per cell and is quantified relative to an isotype control, for example, as described in Example 10.5. In summary, the antibody, fragment, or conjugate and a corresponding isotype control are labeled with a dye, and the internalized fluorescence is determined and quantified for the antibody, fragment, or conjugate relative to the isotype control.
[00182] Um "anticorpo não internalizante" é definido como um anticorpo que mostra substancialmente a mesma internalização que um controle de isotipo correspondente. Um "anticorpo de baixa in- ternalização" é definido como um anticorpo que mostra uma internali- zação que é igual ou menor do que 10 vezes a internalização do controle de isotipo, preferivelmente menor do que 9, 8, 7, 6, 5 , 4, 3, 2, 1,5, 1,4, 1,3, 1,2, ou 1,1 vezes a internalização do controle de isotipo. Um "anticorpo de internalização médio" é definido como um anticorpo que mostra uma internalização que é igual ou menor do que 21 vezes a internalização do controle de isotipo e maior do que 10 vezes a in- ternalização do controle de isotipo. Um "anticorpo de alta internali- zação" é definido como um anticorpo que mostra uma internalização que é maior do que 21 vezes a internalização do controle de isotipo.[00182] A "non-internalizing antibody" is defined as an antibody that shows substantially the same internalization as a matching isotype control. A "low internalizing antibody" is defined as an antibody that shows internalization that is equal to or less than 10 times the internalization of the isotype control, preferably less than 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1.5, 1.4, 1.3, 1.2, or 1.1 times the internalization of the isotype control. A "medium internalizing antibody" is defined as an antibody that shows internalization that is equal to or less than 21 times the internalization of the isotype control and greater than 10 times the internalization of the isotype control. A "high internalization antibody" is defined as an antibody that shows internalization that is more than 21 times the internalization of the isotype control.
[00183] Em alternativa, a internalização pode ainda ser quantificada com base em t(1/2), isto é, como o tempo até que metade da quantidade de anticorpo, fragmento ou conjugado tenha sido internalizada. Preferivelmente, os anticorpos de acordo com a presente invenção são caracterizados por um tempo até que metade da quantidade de anticorpo, fragmento ou conjugado tenha sido internalizada que é > 2 horas, preferivelmente > 4, > 5, > 6, > 7, > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20, > 21, > 22, > 23, > 24, > 26, > 28, > 30 ou > 48 horas. Mais preferivelmente, os anticorpos de acordo com a presente invenção não são internalizados, isto é, nenhum tempo pode ser definido até que metade da quantidade de anticorpo, fragmento ou conjugado tenha sido internalizada.[00183] Alternatively, internalization can also be quantified based on t(1/2), that is, as the time until half of the amount of antibody, fragment or conjugate has been internalized. Preferably, the antibodies according to the present invention are characterized by a time until half of the amount of antibody, fragment or conjugate has been internalized that is > 2 hours, preferably > 4, > 5, > 6, > 7, > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20, > 21, > 22, > 23, > 24, > 26, > 28, > 30 or > 48 hours. More preferably, the antibodies according to the present invention are not internalized, that is, no time can be defined until half of the quantity of antibody, fragment or conjugate has been internalized.
[00184] Um "controle de isotipo" é um anticorpo ou fragmento que não se liga a um alvo, mas tem a mesma classe e tipo que o anticorpo ou fragmento de referência que reconhece o alvo.[00184] An "isotype control" is an antibody or fragment that does not bind to a target but has the same class and type as the reference antibody or fragment that recognizes the target.
[00185] Um anticorpo ou fragmento é denominado "reativo cruzado (cross-reactive)" ou "reativo cruzado (cross reactive)" se o anticorpo ou fragmento se liga a um antígeno de duas ou mais espécies diferentes, por exemplo, com um valor de KD de 10 a 7 M ou menos, mais preferivelmente de menos de 10 a 8 M, ainda mais preferivelmente na faixa de 10 a 9 M a 10 a 11 M.[00185] An antibody or fragment is called "cross-reactive" or "cross-reactive" if the antibody or fragment binds to an antigen of two or more different species, for example, with a KD value of 10 to 7 M or less, more preferably less than 10 to 8 M, even more preferably in the range of 10 to 9 M to 10 to 11 M.
[00186] Pelo termo "liga-se especificamente" como usado aqui em relação a um anticorpo, entende-se um anticorpo que reconhece um antígeno específico, mas não reconhece ou se liga substancialmente a outras moléculas em uma amostra: Um anticorpo caracterizado por ligação inespecífica substancial não teria aplicabilidade terapêutica, de modo que essas modalidades sejam excluídas. No entanto, como é conhecido na técnica, a ligação específica de um anticorpo ou ligante não exclui necessariamente a ligação de um anticorpo ou ligante a outros antígenos/moléculas alvo. Um anticorpo que se liga especificamente a um antígeno de uma espécie também pode se ligar a esse antígeno de uma ou mais espécies adicionais. Essa reatividade entre espécies não altera por si só a classificação de um anticorpo como específico.[00186] By the term "specifically binds" as used herein in relation to an antibody, is meant an antibody that recognizes a specific antigen but does not substantially recognize or bind to other molecules in a sample: An antibody characterized by substantial nonspecific binding would not have therapeutic applicability, so these modalities are excluded. However, as is known in the art, specific binding of an antibody or ligand does not necessarily exclude binding of an antibody or ligand to other antigens/target molecules. An antibody that specifically binds to an antigen of one species may also bind to that antigen of one or more additional species. This cross-species reactivity does not in itself alter the classification of an antibody as specific.
[00187] Em alguns casos, os termos "ligação específica" ou "ligando especificamente" podem ser usados em referência à interação de um anticorpo, uma proteína ou um peptídeo com uma segunda es- pécie química, para significar que a interação depende da presença de uma estrutura particular (por exemplo, um determinante antigênico ou epítopo) na espécie química; por exemplo, um anticorpo reconhece e se liga a uma estrutura de proteína específica em vez de proteínas em geral. Se um anticorpo for específico para o epítopo "A", a presença de uma molécula contendo o epítopo A (ou A livre, não marcado), em uma reação contendo "A" marcado e o anticorpo, reduzirá a quantidade de A marcado ligado ao anticorpo.[00187] In some cases, the terms "specific binding" or "specifically ligand" may be used in reference to the interaction of an antibody, a protein, or a peptide with a second chemical species, to mean that the interaction depends on the presence of a particular structure (e.g., an antigenic determinant or epitope) in the chemical species; for example, an antibody recognizes and binds to a specific protein structure rather than proteins in general. If an antibody is specific for epitope "A", the presence of a molecule containing epitope A (or free, unlabeled A) in a reaction containing labeled "A" and the antibody will reduce the amount of labeled A bound to the antibody.
[00188] Em caso de dúvida, a ligação específica de um anticorpo ou ligante descreve preferivelmente a ligação de um anticorpo, fragmento de anticorpo ou ligante ao seu antígeno/alvo com uma afinidade de pelo menos 10 a 7 M (como valor KD; isto é, preferivelmente aqueles com valores KD menores do que 10 a 7 M), com o anticorpo ou ligante tendo uma afinidade pelo menos duas vezes menor para um antígeno não específico que não é o antígeno/molécula alvo predeterminado ou um antígeno/molécula alvo intimamente relacionado.[00188] In case of doubt, the specific binding of an antibody or ligand preferably describes the binding of an antibody, antibody fragment or ligand to its antigen/target with an affinity of at least 10 to 7 M (as KD value; that is, preferably those with KD values less than 10 to 7 M), with the antibody or ligand having at least half the affinity for a non-specific antigen that is not the predetermined target antigen/molecule or a closely related target antigen/molecule.
[00189] "Poliespecificidade", também "polirreatividade" ou "ligação inespecífica" refere-se à capacidade dos ligantes ou anticorpos de se ligar a um conjunto definido de antígenos não relacionados. A ligação inespecífica é substancial, se a aplicabilidade (terapêutica) do anticorpo estiver comprometida. A poliespecificidade para estruturas não proteicas incluindo, sem limitação, linhagens celulares ou tecidos negativos alvo, partícula de baculovírus (BVP), insulina ou DNA, pode ser avaliada como conhecido na técnica e como descrito aqui. Por exemplo, a ligação inespecífica às linhagens celulares humanas negativas alvo pode ser determinada, por exemplo, por análise FACS usando células CHO ou HEK transfectadas de forma simulada. Em um segundo exemplo, a ligação inespecífica a diferentes tecidos pode ser analisada por análise FACS de uma linhagem celular ou painel de linhagens celulares derivadas do respectivo tecido. Em um terceiro exemplo, a ligação inespecífica às populações de células imunes pode ser analisada por FACS após a classificação das populações de células imunes como conhecido na técnica. Em um quarto Exemplo, a ligação inespecífica a BVP, insulina ou DNA pode ser analisada usando ELISA, por exemplo, como descrito em Hotzel, Isidro, et al. "A strategy for risk mitigation of antibodies with fast clearance." MAbs. Vol. 4. No. 6. Taylor & Francis, 2012.; Avery, Lindsay B., et al. "Establishing in vitro, in vivo correlations to screen monoclonal antibodies for physico-chemical properties related to favorable human pharmacokinetics." MAbs. Vol. 10. No. 2. Taylor & Francis, 2018., e Jain, Tushar, et al. "Biophysical properties of the clinical-stage antibody landscape." Proceedings of the National Academy of Sciences 114.5 (2017): 944-949, incorporados aqui em sua totalidade e em particular no que diz respeito aos detalhes técnicos necessários para analisar e quantificar a ligação inespecífica. Um anticorpo sem ligação inespecífica substancial é preferivelmente caracterizado por uma ligação inespecífica que é inferior menor do que a ligação inespecífica do anticorpo de referência Gantenerumab (Roche) e mais preferivelmente menor do que a ligação inespecífica do anticorpo de referência Remicade (Janssen Biotech).[00189] "Polyspecificity," also "polyreactivity" or "nonspecific binding," refers to the ability of ligands or antibodies to bind to a defined set of unrelated antigens. Nonspecific binding is substantial if the (therapeutic) applicability of the antibody is compromised. Polyspecificity to nonprotein structures, including but not limited to negative target cell lines or tissues, baculovirus particle (BVP), insulin, or DNA, can be assessed as known in the art and as described herein. For example, nonspecific binding to negative target human cell lines can be determined, for example, by FACS analysis using sham-transfected CHO or HEK cells. In a second example, nonspecific binding to different tissues can be analyzed by FACS analysis of a cell line or panel of cell lines derived from the respective tissue. In a third example, nonspecific binding to immune cell populations can be analyzed by FACS after classifying immune cell populations as known in the art. In a fourth example, nonspecific binding to BVP, insulin, or DNA can be analyzed using ELISA, for example, as described in Hotzel, Isidro, et al. "A strategy for risk mitigation of antibodies with fast clearance." MAbs. Vol. 4. No. 6. Taylor & Francis, 2012; Avery, Lindsay B., et al. "Establishing in vitro, in vivo correlations to screen monoclonal antibodies for physico-chemical properties related to favorable human pharmacokinetics." MAbs. Vol. 10. No. 2. Taylor & Francis, 2018; and Jain, Tushar, et al. "Biophysical properties of the clinical-stage antibody landscape." Proceedings of the National Academy of Sciences 114.5 (2017): 944-949, incorporated herein in their entirety and in particular with respect to the technical details necessary to analyze and quantify nonspecific binding. An antibody without substantial nonspecific binding is preferably characterized by nonspecific binding that is less than the nonspecific binding of the reference antibody Gantenerumab (Roche) and more preferably less than the nonspecific binding of the reference antibody Remicade (Janssen Biotech).
[00190] O termo "ligação fora do alvo" refere-se à capacidade de um anticorpo de se ligar às proteínas individuais diferentes do alvo pretendido, por exemplo, proteínas da família de proteínas dos alvos. A ligação fora do alvo pode ser avaliada usando ensaios comerciais conhecidos na técnica, tal como o ensaio de perfil fora do alvo Retro- genix. Em resumo, os anticorpos são testados em microarrays contendo células HEK293 que expressam individualmente vários milhares de proteínas de membrana humana e proteínas secretadas. A ligação do anticorpo a um potencial fora do alvo deve ser confirmada por FACS usando células que superexpressam o potencial fora do alvo.[00190] The term "off-target binding" refers to the ability of an antibody to bind to individual proteins other than the intended target, for example, proteins from the target protein family. Off-target binding can be assessed using commercially known assays in the art, such as the Retrogenix off-target profiling assay. In summary, antibodies are tested on microarrays containing HEK293 cells that individually express several thousand human membrane proteins and secreted proteins. Antibody binding to an off-target potential must be confirmed by FACS using cells that overexpress the off-target potential.
[00191] O termo "afinidade" é um termo da técnica e descreve a força de ligação entre um ligante, anticorpo ou fragmento de anticorpo e um alvo. A "afinidade" de anticorpos e fragmentos dos mesmos para um alvo pode ser determinada usando técnicas bem conhecidas na técnica ou descritas aqui, por exemplo, por ensaios ELISA, calorimetria de titulação isotérmica (ITC), ressonância plasmônica de superfície (SPR), citometria de fluxo ou polarização fluorescente. Preferivelmente, a afinidade é fornecida como constante de dissociação KD.[00191] The term "affinity" is a term of the art and describes the binding strength between a ligand, antibody or antibody fragment and a target. The "affinity" of antibodies and antibody fragments for a target can be determined using techniques well known in the art or described herein, for example, by ELISA assays, isothermal titration calorimetry (ITC), surface plasmon resonance (SPR), flow cytometry or fluorescence polarization. Preferably, the affinity is given as the dissociation constant KD.
[00192] A "constante de dissociação" (KD) possui unidades molares (M) e corresponde à concentração do ligante/anticorpo na qual metade das proteínas alvo estão ocupadas em equilíbrio. Quanto menor for a constante de dissociação, maior será a afinidade entre o ligante ou anticorpo e seu alvo.[00192] The "dissociation constant" (KD) has molar units (M) and corresponds to the concentration of the ligand/antibody at which half of the target proteins are occupied in equilibrium. The smaller the dissociation constant, the greater the affinity between the ligand or antibody and its target.
[00193] De acordo com a presente invenção, os anticorpos têm preferivelmente uma afinidade alvo de pelo menos 10 a 7 M (como valor KD), mais preferivelmente de pelo menos 10 a 8 M, ainda mais preferivelmente na faixa de 10 a 9 M a 10 a 11 M. Os valores de KD podem ser determinados preferivelmente por meio de espectroscopia de ressonância plasmônica de superfície, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui. Quando as condições do ensaio influenciarem a KD determinada, a configuração do ensaio com o menor desvio padrão deve ser usada.[00193] According to the present invention, the antibodies preferably have a target affinity of at least 10 to 7 M (as the KD value), more preferably at least 10 to 8 M, even more preferably in the range of 10 to 9 M to 10 to 11 M. The KD values can preferably be determined by surface plasmon resonance spectroscopy, for example, as described elsewhere herein. When assay conditions influence the determined KD, the assay setting with the lowest standard deviation should be used.
[00194] "Meia concentração máxima eficaz" (EC50) refere-se àconcentração de um fármaco, anticorpo, fragmento, conjugado ou molécula que induz uma resposta a meio caminho entre a linha de base e a máxima após um tempo de incubação especificado. No contexto da ligação do anticorpo, a EC50 reflete assim a concentração do anticorpo necessária para a ligação semimáxima. Uma EC50 pode ser determinada se um ponto de inflexão pode ser determinado por modelagem matemática (por exemplo, regressão não linear) da curva de resposta à dose descrevendo a relação entre o fármaco aplicado, anticorpo, fragmento, conjugado ou concentração de molécula e sinal. Por exemplo, se a curva de resposta à dose segue uma curva sigmoidal, uma EC50 pode ser determinada. Quando a resposta é uma inibição, a EC50 é denominada metade da concentração inibitória máxima (IC50). EC80 pode ser determinado mutatis mutandis.[00194] "Half-maximum effective concentration" (EC50) refers to the concentration of a drug, antibody, fragment, conjugate, or molecule that induces a response halfway between baseline and maximal after a specified incubation time. In the context of antibody binding, EC50 thus reflects the antibody concentration required for semi-maximal binding. An EC50 can be determined if an inflection point can be determined by mathematical modeling (e.g., nonlinear regression) of the dose-response curve describing the relationship between the applied drug, antibody, fragment, conjugate, or molecule concentration and signal. For example, if the dose-response curve follows a sigmoidal curve, an EC50 can be determined. When the response is an inhibition, the EC50 is termed half-maximum inhibitory concentration (IC50). EC80 can be determined mutatis mutandis.
[00195] O termo "anticorpo" (Ab) refere-se a uma molécula de imunoglobulina (por exemplo, sem limitação IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgD, IgE, IgA1, IgA2 humana, IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgG3, IgA, IgD, IgE ou IgM de camundongo, IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgA, IgD, IgE ou IgM de rato, IgA1, IgA2, IgA3, IgE, IgG, IgM de coelho, IgA, IgE, IgG1, IgG2, IgE, IgM de cabra ou IgY de galinha) que se liga especificamente a, ou é imunologicamente reativo com, um antígeno particular. Anticorpos ou fragmentos de anticorpos compreendem regiões determinantes de complementaridade (CDRs), também conhecidas como regiões hipervariáveis, nos domínios variáveis da cadeia leve e da cadeia pesada. As porções mais altamente conservadas dos domí-nios variáveis são chamadas de estruturas (framework) (FR). Como é conhecido na técnica, a posição/limite do aminoácido que delineia uma região hipervariável de um anticorpo pode variar, dependendo do contexto e das várias definições conhecidas na técnica. Como usado aqui, a numeração de resíduos de aminoácidos de imunoglobulina é feita de acordo com o sistema de numeração de resíduos de aminoácidos de imunoglobulina de Kabat et al. Os domínios variáveis de cadeias pesadas e leves nativas compreendem, cada qual, quatro regiões FR. As três CDRs em cada cadeia são mantidas juntas em estreita proximidade pelas regiões FR e, com as CDRs da outra cadeia, contribuem para a formação do sítio de ligação ao antígeno de anticorpos, veja Kabat, E. A., et al. "Sequences of Proteins of Immunological Interest (Natl. Inst. Health, Bethesda, MD), GPO Publ." No165-462 (1987). O termo anticorpo, como usado aqui, também se refere aos fragmentos de anticorpo, exceto quando explicitamente indicado de outra forma. Dependendo do respectivo contexto, o termo anticorpo também pode se referir a qualquer molécula de ligação proteica com função semelhante à imunoglobulina.[00195] The term "antibody" (Ab) refers to an immunoglobulin molecule (e.g., without limitation, human IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgD, IgE, IgA1, IgA2, mouse IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgG3, IgA, IgD, IgE or IgM, rat IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgA, IgD, IgE or IgM, rabbit IgA1, IgA2, IgA3, IgE, IgG, IgM, goat IgA, IgE, IgG1, IgG2, IgE, IgM or chicken IgY) that specifically binds to, or is immunologically reactive with, a particular antigen. Antibodies or antibody fragments comprise complementarity-determining regions (CDRs), also known as hypervariable regions, in the variable domains of the light and heavy chains. The most highly conserved portions of the variable domains are called frameworks (FRs). As is known in the art, the amino acid position/boundary that delineates a hypervariable region of an antibody can vary depending on the context and the various definitions known in the art. As used herein, the numbering of immunoglobulin amino acid residues is done according to the immunoglobulin amino acid residue numbering system of Kabat et al. The native heavy and light chain variable domains each comprise four FR regions. The three CDRs in each chain are held together in close proximity by the FR regions and, with the CDRs of the other chain, contribute to the formation of the antibody antigen-binding site, see Kabat, E. A., et al. "Sequences of Proteins of Immunological Interest (Natl. Inst. Health, Bethesda, MD), GPO Publ." No. 165-462 (1987). The term antibody, as used herein, also refers to antibody fragments, except where explicitly indicated otherwise. Depending on the context, the term antibody may also refer to any protein-binding molecule with immunoglobulin-like function.
[00196] O termo "CDR" refere-se à região determinante complementar do anticorpo. Como é conhecido na técnica, as regiões determinantes de complementaridade (CDRs) fazem parte das cadeias variáveis em anticorpos e receptores de células T. Um conjunto de CDRs constitui um paratopo. As CDRs são cruciais para a diversidade de especificidades do antígeno. Existem três CDRs (CDR1, CDR2 e CDR3), dispostas não consecutivamente na sequência de aminoácidos de um domínio variável de um receptor de antígeno. Uma vez que os receptores de antígeno são tipicamente compostos por dois domínios variáveis (em duas cadeias polipeptídicas diferentes, cadeia pesada e leve), geralmente existem seis CDRs para cada receptor de antígeno que podem entrar coletivamente em contato com o antígeno. As CDRs da cadeia leve são LCDR1, LCDR2 e LCDR3. As CDRs da cadeia pesada são denominadas HCDR1, HCDR2 e HCDR3. HCDR3 é a região determinante complementar mais variável (veja, por exemplo, Chothia, Chothia, Cyrus, and Arthur M. Lesk. "Canonical structures for the hypervariable regions of immunoglobulins." Journal of molecular biology 196.4 (1987): 901-917.; Kabat, E. A., et al. "Sequences of proteins of immunological interest. Bethesda, MD: US Department of Health and Human Services." Public Health Service, National Institutes of Health (1991): 103-511.).[00196] The term "CDR" refers to the complementary determinant region of the antibody. As is known in the art, complementarity-determining regions (CDRs) are part of the variable chains in antibodies and T-cell receptors. A set of CDRs constitutes a paratope. CDRs are crucial for the diversity of antigen specificities. There are three CDRs (CDR1, CDR2, and CDR3), arranged non-consecutively in the amino acid sequence of a variable domain of an antigen receptor. Since antigen receptors are typically composed of two variable domains (in two different polypeptide chains, heavy and light chain), there are generally six CDRs for each antigen receptor that can collectively come into contact with the antigen. The light chain CDRs are LCDR1, LCDR2, and LCDR3. The heavy chain CDRs are designated HCDR1, HCDR2, and HCDR3. HCDR3 is the most variable complementary determining region (see, for example, Chothia, Chothia, Cyrus, and Arthur M. Lesk. "Canonical structures for the hypervariable regions of immunoglobulins." Journal of molecular biology 196.4 (1987): 901-917.; Kabat, E. A., et al. "Sequences of proteins of immunological interest. Bethesda, MD: US Department of Health and Human Services." Public Health Service, National Institutes of Health (1991): 103-511.).
[00197] A "região constante" refere-se à porção da molécula de anticorpo que confere funções efetoras. A região constante da cadeia pesada pode ser selecionada a partir de qualquer um dos cinco isoti- pos: alfa (α), delta (δ), épsilon (ε), gama (g) ou mu (μ).[00197] The "constant region" refers to the portion of the antibody molecule that confers effector functions. The constant region of the heavy chain can be selected from any of the five isotypes: alpha (α), delta (δ), epsilon (ε), gamma (γ), or mu (μ).
[00198] O termo "domínio Fc", "região Fc" ou "parte Fc", como usado aqui, refere-se a uma região C-terminal de uma cadeia pesada de anticorpo que contém pelo menos uma porção da região constante. O termo inclui regiões Fc de sequência nativa e regiões Fc variantes. Por exemplo, uma região Fc de cadeia pesada de IgG humana pode se estender de Cys226, ou de Pro230, até o carboxil terminal da cadeia pesada.[00198] The term "Fc domain," "Fc region," or "Fc portion," as used herein, refers to a C-terminal region of an antibody heavy chain that contains at least a portion of the constant region. The term includes native sequence Fc regions and variant Fc regions. For example, a human IgG heavy chain Fc region may extend from Cys226, or from Pro230, to the carboxyl terminal of the heavy chain.
[00199] Anticorpos ou fragmentos de ligação de acordo com a presente invenção podem ter sido modificados para alterar pelo menos uma função efetora biológica mediada por região constante. Por exemplo, em algumas modalidades, um anticorpo pode ser modificado para reduzir ou aumentar pelo menos uma função efetora biológica mediada por região constante em relação ao anticorpo não modificado, por exemplo, ligação reduzida ou melhorada ao receptor Fc (FCYR). A ligação de FCYR pode ser reduzida, por exemplo, pela mutação do segmento da região constante de imunoglobulina do anticorpo em regiões específicas necessárias para interações de FcyR (veja, por exemplo, Canfield, Stephen M. e Sherie L. Morrison. "The binding affinity of human IgG for its high affinity Fc receptor is determined by multiple amino acids in the CH2 domain and is modulated by the hinge region." The Journal of experimental medicine 173.6 (1991): 1483-1491; e Lund, John, et al. "Human Fc gamma RI and Fc gamma RII interact with distinct but overlapping sites on human IgG." The Journal of Immunology 147.8 (1991): 2657-2662.). A ligação de FcyR pode ser aumentada, por exemplo, por afucosilação. A redução da ligação de FcyR também pode reduzir outras funções efetoras que dependem de interações de FcyR, tais como opsonização, fagocitose e citotoxicida- de celular dependente de antígeno ("ADCC").[00199] Antibodies or binding fragments according to the present invention may have been modified to alter at least one constant region-mediated biological effector function. For example, in some embodiments, an antibody may be modified to reduce or increase at least one constant region-mediated biological effector function relative to the unmodified antibody, for example, reduced or enhanced binding to the Fc receptor (FCYR). FcyR binding can be reduced, for example, by mutation of the immunoglobulin constant region segment of the antibody in specific regions required for FcyR interactions (see, for example, Canfield, Stephen M. and Sherie L. Morrison. "The binding affinity of human IgG for its high affinity Fc receptor is determined by multiple amino acids in the CH2 domain and is modulated by the hinge region." The Journal of Experimental Medicine 173.6 (1991): 1483-1491; and Lund, John, et al. "Human Fc gamma RI and Fc gamma RII interact with distinct but overlapping sites on human IgG." The Journal of Immunology 147.8 (1991): 2657-2662). FcyR binding can be increased, for example, by afucosylation. Reduced FcyR binding can also reduce other effector functions that depend on FcyR interactions, such as opsonization, phagocytosis, and antigen-dependent cellular cytotoxicity ("ADCC").
[00200] Além disso, abordar a interação de Fc com FcRn permite modular a meia a vida de anticorpos in vivo. A revogação da interação, por exemplo, pela introdução da mutação H435A leva a uma meia vida extremamente curta, uma vez que o anticorpo não está mais protegido da degradação lisossomal pela reciclagem de FcRn. Em algumas modalidades preferidas de acordo com todos os aspectos, o anticorpo de acordo com a presente invenção compreende a mutação H435A ou foi modificado para uma meia vida reduzida.[00200] Furthermore, addressing the Fc interaction with FcRn allows modulating the half-life of antibodies in vivo. Revoking the interaction, for example, by introducing the H435A mutation, leads to an extremely short half-life, since the antibody is no longer protected from lysosomal degradation by FcRn recycling. In some respectfully preferred embodiments, the antibody according to the present invention comprises the H435A mutation or has been modified for a reduced half-life.
[00201] Ao contrário, anticorpos que compreendem mutações "YTE" (M252Y/S254T/T256E) e/ou mutações equivalentes, tais como mutações "LS" (M428L/N434S) demonstraram prolongar significativamente a meia a vida pela reciclagem mais eficiente de endossomos em ambos espécies pré-clínicas, bem como humanos (Dall’Acqua, William F., et al. "Increasing the affinity of a human IgG1 for the neonatal Fc receptor: biological consequences." The Journal of Immunology 169.9 (2002): 5171-5180.; Zalevsky, Jonathan, et al. "Enhanced antibody half-life improves in vivo activity." Nature biotechnology 28.2 (2010): 157-159.). Em algumas modalidades preferidas de acordo com todos os aspectos, o anticorpo de acordo com a presente invenção compreende mutações YTE (M252Y/S254T/T256E) e/ou mutações equivalentes, tais como LS (M428L/N434S) ou foi projetado para uma meia vida melhorada. Abordagens de engenharia de Fc adequadas para extensão da meia vida podem ser encontradas em Haraya, Ken- ta, Tatsuhiko Tachibana e Tomoyuki Igawa. "Improvement of pharmacokinetic properties of therapeutic antibodies by antibody engineering." Drug metabolism e pharmacokinetics 34.1 (2019): 25-41., e/ou Lee, Chang-Han, et al. "An engineered human Fc domain that behaves like a pH-toggle switch for ultra-long circulation persistence." Nature communications 10.1 (2019): 1-11., ambos incorporados aqui por referência.[00201] Conversely, antibodies comprising "YTE" mutations (M252Y/S254T/T256E) and/or equivalent mutations, such as "LS" mutations (M428L/N434S), have been shown to significantly extend half-life through more efficient endosome recycling in both preclinical species and humans (Dall’Acqua, William F., et al. "Increasing the affinity of a human IgG1 for the neonatal Fc receptor: biological consequences." The Journal of Immunology 169.9 (2002): 5171-5180.; Zalevsky, Jonathan, et al. "Enhanced antibody half-life improves in vivo activity." Nature biotechnology 28.2 (2010): 157-159.). In some preferred embodiments in all respects, the antibody according to the present invention comprises YTE mutations (M252Y/S254T/T256E) and/or equivalent mutations, such as LS mutations (M428L/N434S), or has been engineered for an improved half-life. Suitable Fc engineering approaches for half-life extension can be found in Haraya, Kenta, Tatsuhiko Tachibana, and Tomoyuki Igawa, "Improvement of pharmacokinetic properties of therapeutic antibodies by antibody engineering," Drug Metabolism & Pharmacokinetics 34.1 (2019): 25-41, and/or Lee, Chang-Han, et al., "An engineered human Fc domain that behaves like a pH-toggle switch for ultra-long circulation persistence," Nature Communications 10.1 (2019): 1-11, both incorporated herein by reference.
[00202] "Não fucosilados" são anticorpos projetados de modo queos oligossacarídeos na região Fc do anticorpo não tenham unidades de açúcar fucose. A glicosilação de um anticorpo pode alterar sua função. Por exemplo, se a glicosilação em N297 no domínio CH2 de uma IgG for completamente eliminada, a ligação a FCYRS é perdida. No entanto, a modulação da composição específica de carboidratos em N297 pode ter o efeito oposto e aumentar a atividade ADCC do anticorpo. Em resumo, a afinidade de um anticorpo para os FCYRS de ativação depende da composição do oligossacarídeo N297 ligado a N. Existem 32 diferentes combinações possíveis de oligossacarídeos que podem ocorrer neste sítio. As IgG humanas de ocorrência natural e aquelas produzidas por hibridomas ou outros sistemas de expressão comuns são geralmente compostas por N-acetilglucosamina (GlcNAc) e três resíduos de manose que formam um carboidrato central. Este núcleo é ligado a dois grupos GlcNAc adicionais para formar ramificações biantenárias. A adição de galactose em cada ramo pode ocorrer, bem como a adição terminal de ácido siálico a essas moléculas de ga-lactose. A fucose é muitas vezes parte do núcleo GlcNAc. Esta fucose, por impedimento estérico, obstrui a interação do anticorpo com o FcyRIIIA. Desse modo, a eliminação desta molécula de fucose, mantendo outras formas de glicosilação neste sítio, aumenta a ligação do anticorpo aos FcyRs ativadores, aumentando sua capacidade de induzir ADCC e/ou ADCP (Almagro, Juan C., et al. "Progress and challenges in the design e clinical development of antibodies for cancer therapy." Frontiers in immunology 8 (2018): 1751.). Os métodos de preparação de anticorpos sem fucose incluem o crescimento em células de mieloma de rato YB2/0 (ATCC CRL 1662). As células YB2/0 expressam baixos níveis de mRNA de FUT8, que codifica α-1,6- fucosiltransferase, uma enzima necessária para a fucosilação de poli- peptídeos. Os anticorpos não fucosilados são preferidos para a presente invenção.[00202] "Non-fucosylated" antibodies are designed so that the oligosaccharides in the Fc region of the antibody do not have fucose sugar units. Glycosylation of an antibody can alter its function. For example, if glycosylation at N297 in the CH2 domain of an IgG is completely eliminated, binding to FCYRS is lost. However, modulation of the specific carbohydrate composition at N297 can have the opposite effect and increase the ADCC activity of the antibody. In summary, the affinity of an antibody for activating FCYRS depends on the composition of the N297-linked oligosaccharide. There are 32 different possible combinations of oligosaccharides that can occur at this site. Naturally occurring human IgGs and those produced by hybridomas or other common expression systems are generally composed of N-acetylglucosamine (GlcNAc) and three mannose residues that form a core carbohydrate. This core is linked to two additional GlcNAc groups to form biennial branches. The addition of galactose to each branch can occur, as well as the terminal addition of sialic acid to these galactose molecules. Fucose is often part of the GlcNAc core. This fucose, through steric hindrance, obstructs the interaction of the antibody with FcyRIIIA. Thus, the elimination of this fucose molecule, while maintaining other forms of glycosylation at this site, increases the binding of the antibody to activating FcyRs, increasing its ability to induce ADCC and/or ADCP (Almagro, Juan C., et al. "Progress and challenges in the design and clinical development of antibodies for cancer therapy." Frontiers in Immunology 8 (2018): 1751). Methods for preparing fucose-free antibodies include growth in YB2/0 mouse myeloma cells (ATCC CRL 1662). YB2/0 cells express low levels of FUT8 mRNA, which encodes α-1,6-fucosyltransferase, an enzyme required for the fucosylation of polypeptides. Non-fucosylated antibodies are preferred for the present invention.
[00203] "Citotoxicidade celular dependente de anticorpos" ("ADCC"), também conhecida como "citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos", é um mecanismo de defesa imunológi- ca mediada por células pelo qual uma célula imune lisa ativamente uma célula alvo, cujos antígenos da superfície de membrana foram ligados por anticorpos específicos. ADCC é mediado através da interação do anticorpo ou fragmento com FcYRIIIa. Em humanos, FCYRIII existe em duas formas diferentes: FcYRIIIa (CD16a) e FcYRIIIb (CD16b). Enquanto o FcYRIIIa é expresso em monócitos, neutrófilos, mastócitos, macrófagos e células exterminadoras naturais como um receptor transmembranar, o FcYRIIIb é expresso apenas em neutrófi- los. Esses receptores se ligam à porção Fc dos anticorpos IgG, que então ativa a citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) mediada pelas células efetoras humanas.[00203] "Antibody-dependent cellular cytotoxicity" ("ADCC"), also known as "antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity," is a cell-mediated immune defense mechanism whereby an immune cell actively lyses a target cell whose membrane surface antigens have been bound by specific antibodies. ADCC is mediated through the interaction of the antibody or fragment with FcYRIIIa. In humans, FcYRIII exists in two different forms: FcYRIIIa (CD16a) and FcYRIIIb (CD16b). While FcYRIIIa is expressed on monocytes, neutrophils, mast cells, macrophages, and natural killer cells as a transmembrane receptor, FcYRIIIb is expressed only on neutrophils. These receptors bind to the Fc portion of IgG antibodies, which then activates antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) mediated by human effector cells.
[00204] Diferentes sistemas de ensaio para determinar a indução de ADCC em seres humanos foram descritos na literatura e são adequados para a caracterização do assunto descrito aqui. Por exemplo, Yao-Te Hsieh et al. estudaram diferentes sistemas de ensaio ADCC, nomeadamente ensaios baseados em (i) células exterminadoras naturais de doadores humanos (FcYRIIIA + NK primário), (ii) células NK-92 manipuladas por FcYRIIIA e (iii) células Jurkat T manipuladas por FcYRIIIA/NFAT-RE/luc2 (Hsieh, Yao-Te, et al. "Characterization of FcYRIIIA effector cells used in in vitro ADCC bioassay: comparison of primary NK cells with engineered NK-92 e Jurkat T cells." Journal of Immunological Methods 441 (2017): 56-66, incorporado aqui na íntegra; em particular, referência à descrição do método para estes ensaios é feita). Em resumo, todos os três sistemas de células efetoras expressam diferencialmente FcYRIIIA e fornecem atividade da via ADCC dependente da dose, mas apenas células NK primárias e NK-92 manipuladas são capazes de induzir lise celular mediada por ADCC. Para avaliação funcional da atividade ADCC, as células primárias NK ou NK-92 (V-158) refletem melhor o mecanismo de ação ADCC fisiologi- camente relevante. Como uma linhagem de células modificadas, as células NK-92 podem se comportar de forma mais reprodutível do que as NK primárias e, portanto, é o sistema de ensaio preferido para determinar a resposta de ADCC em seres humanos, por exemplo, em caso de dúvida.[00204] Different assay systems for determining ADCC induction in humans have been described in the literature and are suitable for characterizing the subject described herein. For example, Yao-Te Hsieh et al. studied different ADCC assay systems, namely assays based on (i) natural killer cells from human donors (FcYRIIIA + primary NK), (ii) FcYRIIIA-manipulated NK-92 cells, and (iii) FcYRIIIA/NFAT-RE/luc2-manipulated Jurkat T cells (Hsieh, Yao-Te, et al. "Characterization of FcYRIIIA effector cells used in in vitro ADCC bioassay: comparison of primary NK cells with engineered NK-92 and Jurkat T cells." Journal of Immunological Methods 441 (2017): 56-66, incorporated herein in full; in particular, reference is made to the method description for these assays). In summary, all three effector cell systems differentially express FcYRIIIA and provide dose-dependent ADCC pathway activity, but only primary NK cells and engineered NK-92 cells are capable of inducing ADCC-mediated cell lysis. For functional assessment of ADCC activity, primary NK or NK-92 (V-158) cells best reflect the physiologically relevant ADCC mechanism of action. As a modified cell line, NK-92 cells can behave more reproducibly than primary NK cells and are therefore the preferred assay system for determining the ADCC response in humans, for example, in cases of doubt.
[00205] Um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno que induz ADCC é um anticorpo que pode induzir uma quantidade substancial de lise de células alvo na presença de células efetoras NK. Preferivelmente, a indução de ADCC resulta na lise de pelo menos 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% ou 99% das células alvo.[00205] An antibody or antigen-binding fragment that induces ADCC is an antibody that can induce a substantial amount of lysis of target cells in the presence of effector NK cells. Preferably, ADCC induction results in the lysis of at least 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% of target cells.
[00206] "Fagocitose celular dependente de anticorpos"("ADCP") é o mecanismo pelo qual as células alvo opsonizadas por anticorpos ativam os FCYRS na superfície dos macrófagos para induzir a fagocitose, resultando na internalização e degradação da célula alvo. Para ADCP, a ligação a macrófagos como células efetoras ocorre tipicamente através da interação da parte FC dos anticorpos com FcYRIIa (CD32a) expresso por macrófagos.[00206] "Antibody-dependent cellular phagocytosis" ("ADCP") is the mechanism by which antibody-opsonized target cells activate FcYRs on the surface of macrophages to induce phagocytosis, resulting in the internalization and degradation of the target cell. For ADCP, binding to macrophages as effector cells typically occurs through the interaction of the Fc portion of antibodies with FcYR1Ia (CD32a) expressed by macrophages.
[00207] Um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno que induz ADCP é um anticorpo que pode induzir uma quantidade substancial de fagocitose de células alvo na presença de macrófagos. Preferivelmente, a indução de ADCP resulta na fagocitose de pelo menos 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% ou 99% das células alvo.[00207] An antibody or antigen-binding fragment that induces ADCP is an antibody that can induce a substantial amount of phagocytosis of target cells in the presence of macrophages. Preferably, ADCP induction results in the phagocytosis of at least 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% of target cells.
[00208] "Citotoxicidade dependente de complemento" ("CDC") éuma função efetora de anticorpos IgG e IgM. Quando eles estão ligados a um antígeno de superfície em uma célula alvo (por exemplo, célula infectada por bactérias ou vírus), a via clássica do complemento é desencadeada pela ligação da proteína C1q a esses anticorpos, resul- tando na formação de um complexo de ataque à membrana (MAC) e lise da célula-alvo. O sistema complemento é eficazmente ativado por anticorpos humanos IgG1, IgG3 e IgM, fracamente por anticorpos IgG2 e não é ativado por anticorpos IgG4. É um mecanismo de ação pelo qual os anticorpos terapêuticos - além de modalidades específicas dos anticorpos de acordo com a presente invenção - podem atingir um efeito antitumoral. Existem vários métodos laboratoriais para determinar a eficácia do CDC e são conhecidos na técnica.[00208] "Complement-dependent cytotoxicity" ("CDC") is an effector function of IgG and IgM antibodies. When they are bound to a surface antigen on a target cell (e.g., a cell infected by bacteria or viruses), the classical complement pathway is triggered by the binding of the C1q protein to these antibodies, resulting in the formation of a membrane attack complex (MAC) and lysis of the target cell. The complement system is effectively activated by human IgG1, IgG3, and IgM antibodies, weakly by IgG2 antibodies, and not activated by IgG4 antibodies. It is a mechanism of action by which therapeutic antibodies—in addition to specific antibody modalities according to the present invention—can achieve an antitumor effect. Several laboratory methods exist to determine the effectiveness of CDC and are known in the art.
[00209] Um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno que induz CDC é um anticorpo que pode induzir uma quantidade substancial de formação de um complexo de ataque de membrana e lise de células alvo. Preferivelmente, a indução de CDC resulta na lise de pelo menos 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% ou 99% das células alvo.[00209] An antibody or antigen-binding fragment that induces CDC is an antibody that can induce a substantial amount of membrane attack complex formation and lysis of target cells. Preferably, CDC induction results in the lysis of at least 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% of target cells.
[00210] Os anticorpos compreendendo uma região Fc podem ou não compreender uma modificação que promove a associação da primeira e da segunda subunidade do domínio Fc.[00210] Antibodies comprising an Fc region may or may not comprise a modification that promotes the association of the first and second subunits of the Fc domain.
[00211] Uma "modificação que promove a associação da primeira e da segunda subunidade do domínio Fc" é uma manipulação da cadeia principal do peptídeo ou as modificações pós- traducionais de uma subunidade do domínio Fc que reduz ou previne a associação de um polipeptídeo compreendendo a subunidade do domínio Fc com um polipeptídeo idêntico para formar um homodímero. Os anticorpos compreendendo uma região Fc podem ou não compreender uma modificação que promove a associação da primeira e da segunda subunidade do domínio Fc. Uma associação promotora de modificação, como usada aqui, inclui particularmente modificações separadas feitas em cada uma das duas subunidades de domínio Fc desejadas para associar (isto é, a primeira e a segunda subunidade do domínio Fc), em que as modificações são complementares entre si de modo a promover a associação das duas subunidades do domínio Fc. Por exemplo, uma associação promotora de modificação pode alterar a estrutura ou carga de uma ou ambas as subunidades do domínio Fc de modo a tornar sua associação estereostática ou eletrostaticamente favorável. Desse modo, a (hetero)dimerização ocorre entre um poli- peptídeo compreendendo a primeira subunidade de domínio Fc e um polipeptídeo compreendendo a segunda subunidade de domínio Fc, que pode ser não idêntica, por exemplo, no sentido de que outros componentes fundidos a cada uma das subunidades (por exemplo, ligação ao antígeno metades) não são os mesmos. Em algumas mo-dalidades, a associação promotora de modificação compreende uma mutação de aminoácidos no domínio Fc, especificamente uma substituição de aminoácidos. Em uma modalidade particular, a associação promotora de modificação compreende uma mutação de aminoácido separada, especificamente uma substituição de aminoácido, em cada uma das duas subunidades do domínio Fc.[00211] A "modification that promotes the association of the first and second Fc domain subunits" is a manipulation of the peptide backbone or post-translational modifications of an Fc domain subunit that reduces or prevents the association of a polypeptide comprising the Fc domain subunit with an identical polypeptide to form a homodimer. Antibodies comprising an Fc region may or may not comprise a modification that promotes the association of the first and second Fc domain subunits. A modification-promoting association, as used herein, particularly includes separate modifications made to each of the two Fc domain subunits desired to associate (i.e., the first and second Fc domain subunits), wherein the modifications are complementary to each other so as to promote the association of the two Fc domain subunits. For example, a modification-promoting association may alter the structure or charge of one or both Fc domain subunits so as to make their association stereostatic or electrostatically favorable. Thus, (hetero)dimerization occurs between a polypeptide comprising the first Fc domain subunit and a polypeptide comprising the second Fc domain subunit, which may be non-identical, for example, in the sense that other components fused to each of the subunits (e.g., antigen-binding halves) are not the same. In some modalities, the modification-promoting association comprises an amino acid mutation in the Fc domain, specifically an amino acid substitution. In a particular embodiment, the modification-promoting association comprises a separate amino acid mutation, specifically an amino acid substitution, in each of the two Fc domain subunits.
[00212] Um "fragmento" de um anticorpo como aqui usado é necessário para reter substancialmente a afinidade desejada do anticorpo de comprimento total. Como tal, fragmentos adequados de um anticorpo anti-CCR8 humano manterão a capacidade de se ligar ao receptor de quimiocina alvo, por exemplo, de se ligar ao receptor de CCR8 humano. Os fragmentos de um anticorpo compreendem uma porção de um anticorpo de comprimento total, geralmente a ligação ao antí- geno ou sua região variável. Exemplos de fragmentos de anticorpo incluem, mas não estão limitados a, fragmentos Fab, Fab', F(ab')2 e Fv, moléculas de anticorpo de cadeia simples, diacorpos e anticorpos de domínio, veja, Holt, Lucy J., et al. "Domain antibodies: proteins for therapy." Trends in biotechnology 21.11 (2003): 484-490.[00212] An antibody "fragment" as used herein is necessary to retain substantially the desired affinity of the full-length antibody. As such, suitable fragments of a human anti-CCR8 antibody will retain the ability to bind to the target chemokine receptor, for example, to bind to the human CCR8 receptor. Antibody fragments comprise a portion of a full-length antibody, usually the antigen-binding site or its variable region. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fab, Fab', F(ab')2, and Fv fragments, single-chain antibody molecules, diabodies, and domain antibodies; see Holt, Lucy J., et al. "Domain antibodies: proteins for therapy." Trends in biotechnology 21.11 (2003): 484-490.
[00213] Um "fragmento Fab" contém o domínio constante da ca- deia leve e o primeiro domínio constante (CH2) da cadeia pesada.[00213] A "Fab fragment" contains the constant domain of the light chain and the first constant domain (CH2) of the heavy chain.
[00214] Os "fragmentos Fab'" diferem dos fragmentos Fab pela adição de alguns resíduos no carboxil terminal do domínio CH2 da cadeia pesada, incluindo uma ou mais cisteínas da região de dobradiça do anticorpo.[00214] “Fab fragments” differ from Fab fragments by the addition of some residues at the carboxyl terminal of the CH2 domain of the heavy chain, including one or more cysteines from the hinge region of the antibody.
[00215] Os "fragmentos F(ab')" são produzidos pela clivagem da ligação de dissulfeto nas cisteínas da dobradiça do produto de digestão da pepsina F(ab')2. Acoplamentos químicos adicionais de fragmentos de anticorpo são conhecidos por aqueles versados na técnica. Os fragmentos Fab e F(ab')2 não possuem o fragmento Fc do anticorpo intacto, são eliminados mais rapidamente da circulação de animais e podem ter menos ligação tecidual não específica do que um anticorpo intacto, veja, por exemplo, Wahl, Richard L., Charles W. Parker, e Gordon W. Philpott. "Improved radioimaging e tumor localization with monoclonal F (ab') 2." Journal of nuclear medicine: official publication, Society of Nuclear Medicine 24.4 (1983): 316-325.[00215] "F(ab') fragments" are produced by cleavage of the disulfide bond in the hinge cysteines of the pepsin digestion product F(ab')2. Additional chemical couplings of antibody fragments are known to those skilled in the art. Fab and F(ab')2 fragments lack the intact Fc fragment of the antibody, are cleared more rapidly from animal circulation, and may have less nonspecific tissue binding than an intact antibody; see, for example, Wahl, Richard L., Charles W. Parker, and Gordon W. Philpott. "Improved radioimaging and tumor localization with monoclonal F(ab')2." Journal of Nuclear Medicine: Official Publication, Society of Nuclear Medicine 24.4 (1983): 316-325.
[00216] Um "fragmento Fv" é o fragmento mínimo de um anticorpo que contém um reconhecimento alvo completo e um sítio de ligação. Esta região consiste em um dímero de um domínio variável de cadeia pesada e um domínio variável de cadeia leve em uma associação es-treita e não covalente (dímero VH-VL). É nesta configuração que as três CDRs de cada domínio variável interagem para definir um sítio de ligação ao antígeno na superfície do dímero VH-VL. Muitas vezes, as seis CDRs conferem especificidade de ligação ao antígeno ao anticorpo. No entanto, em alguns casos, mesmo um único domínio variável (ou metade de um Fv compreendendo apenas três CDRs específicos para um alvo) pode ter a capacidade de reconhecer e se ligar ao antí- geno, embora com uma afinidade menor do que todo o sítio de ligação.[00216] An "Fv fragment" is the smallest fragment of an antibody that contains a complete target recognition and binding site. This region consists of a dimer of a heavy chain variable domain and a light chain variable domain in a narrow, non-covalent association (VH-VL dimer). It is in this configuration that the three CDRs of each variable domain interact to define an antigen-binding site on the surface of the VH-VL dimer. Often, all six CDRs confer antigen-binding specificity to the antibody. However, in some cases, even a single variable domain (or half of an Fv comprising only three target-specific CDRs) may have the ability to recognize and bind to the antigen, albeit with a lower affinity than the entire binding site.
[00217] "Fv de cadeia simples" ou "scFv" compreendem os domí- nios VH e VL de um anticorpo em uma única cadeia polipeptídica. Geralmente, o polipeptídeo Fv compreende também um ligante polipeptí- dico entre os domínios VH e VL que permite que o scFv forme a estrutura desejada para ligação ao antígeno.[00217] "Single-chain Fv" or "scFv" comprises the VH and VL domains of an antibody in a single polypeptide chain. Generally, the Fv polypeptide also comprises a polypeptide linker between the VH and VL domains that allows the scFv to form the desired structure for antigen binding.
[00218] Os "anticorpos de domínio único" são compostos de domínios VH ou VL únicos que exibem afinidade suficiente para o alvo. Em uma modalidade específica, o anticorpo de domínio único é um anticorpo camelizado, veja, por exemplo, Riechmann, Lutz and Serge Muyldermans. "Single domain antibodies: comparison of camel VH e camelised human VH domains." Journal of immunological methods 231.1-2 (1999): 25-38.[00218] "Single domain antibodies" are composed of single VH or VL domains that exhibit sufficient affinity for the target. In one specific embodiment, the single domain antibody is a camelized antibody, see, for example, Riechmann, Lutz and Serge Muyldermans. "Single domain antibodies: comparison of camel VH and camelized human VH domains." Journal of immunological methods 231.1-2 (1999): 25-38.
[00219] "Anticorpos biespecíficos" são anticorpos monoclonaisque possuem especificidades de ligação para pelo menos dois epíto- pos diferentes no mesmo ou em antígenos diferentes. Na presente invenção, uma das especificidades de ligação pode ser direcionada para o receptor de quimiocina alvo, tal como CCR8, a outra pode ser para qualquer outro antígeno, por exemplo, sem limitação para uma proteína de superfície celular, receptor, subunidade de receptor, antígeno específico de tecido, proteína derivada de vírus, proteína de envelope codificada por vírus, proteína derivada de bactérias ou proteína de su-perfície bacteriana. Os construtos de anticorpos biespecíficos de acordo com a invenção também abrangem construtos de anticorpos multi- específicos compreendendo múltiplos domínios de ligação/sítios de ligação, tais como construtos de anticorpos triespecíficos, onde o construto compreende três domínios de ligação.[00219] "Bispecific antibodies" are monoclonal antibodies that possess binding specificities for at least two different epitopes on the same or different antigens. In the present invention, one of the binding specificities may be directed to the target chemokine receptor, such as CCR8, the other may be to any other antigen, for example, without limitation to a cell surface protein, receptor, receptor subunit, tissue-specific antigen, virus-derived protein, virus-encoded envelope protein, bacterial-derived protein, or bacterial surface protein. Bispecific antibody constructs according to the invention also encompass multispecific antibody constructs comprising multiple binding domains/binding sites, such as trispecific antibody constructs, where the construct comprises three binding domains.
[00220] Os "anticorpos derivados" são tipicamente modificados por glicosilação, acetilação, peguilação, fosforilação, sulfatação, ami- dação, derivatização por grupos de proteção/bloqueio conhecidos, clivagem proteolítica, ligação a um ligante celular ou outra proteína. Qualquer uma das inúmeras modificações químicas pode ser realizada por técnicas conhecidas, incluindo, mas não se limitando a, clivagem química específica, acetilação, formilação, síntese metabólica de tuni- camicina, etc. Além disso, o derivado pode conter um ou mais aminoá- cidos não naturais, por exemplo, usando a tecnologia ambrx, veja, por exemplo, Wolfson, Wendy. "Amber codon flashing ambrx augments proteins with unnatural amino acids." Chemistry & biology 13.10 (2006): 1011-1012. Os anticorpos de acordo com a presente invenção podem ser derivados, por exemplo, glicosilados ou sulfatados.[00220] "Derived antibodies" are typically modified by glycosylation, acetylation, pegylation, phosphorylation, sulfation, amidation, derivatization by known protecting/blocking groups, proteolytic cleavage, binding to a cellular ligand or other protein. Any of the numerous chemical modifications can be performed by known techniques, including, but not limited to, specific chemical cleavage, acetylation, formylation, metabolic synthesis of tunicamycin, etc. In addition, the derivative may contain one or more unnatural amino acids, for example, using ambrx technology, see, for example, Wolfson, Wendy. "Amber codon flashing ambrx augments proteins with unnatural amino acids." Chemistry & biology 13.10 (2006): 1011-1012. The antibodies according to the present invention may be derived, for example, glycosylated or sulfated.
[00221] "Anticorpos monoclonais" são populações substancialmente homogêneas de anticorpos que se ligam a um antígeno específico. As imunoglobulinas monoclonais podem ser obtidas por métodos bem conhecidos por aqueles versados na técnica (veja, por exemplo, Kohler, Georges, e Cesar Milstein. "Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity." nature 256.5517 (1975): 495-497., e Patente dos Estados Unidos No. 4.376.110). Uma imu- noglobulina ou fragmento de imunoglobulina com afinidade de ligação específica pode ser isolada, enriquecida ou purificada a partir de um organismo procariótico ou eucariótico. Os métodos de rotina conhecidos por aqueles versados na técnica permitem a produção de imuno- globulinas ou fragmentos de imunoglobulinas e moléculas de ligação proteica com funções semelhantes às imunoglobulinas, em organismos procarióticos e eucarióticos. Os anticorpos de acordo com a presente invenção são preferivelmente monoclonais.[00221] "Monoclonal antibodies" are substantially homogeneous populations of antibodies that bind to a specific antigen. Monoclonal immunoglobulins can be obtained by methods well known to those skilled in the art (see, for example, Kohler, Georges, and Cesar Milstein. "Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity." nature 256,5517 (1975): 495-497, and U.S. Patent No. 4,376,110). An immunoglobulin or immunoglobulin fragment with specific binding affinity can be isolated, enriched, or purified from a prokaryotic or eukaryotic organism. Routine methods known to those skilled in the art allow the production of immunoglobulins or immunoglobulin fragments and protein-binding molecules with immunoglobulin-like functions in prokaryotic and eukaryotic organisms. The antibodies according to the present invention are preferably monoclonal.
[00222] "Anticorpos humanizados" contêm regiões CDR derivadas de uma espécie não humana, tal como camundongo, que foram, por exemplo, enxertadas, juntamente com quaisquer mutações de estrutura necessárias, em regiões V derivadas de sequência humana. Desse modo, em sua maioria, os anticorpos humanizados são imuno- globulinas humanas (anticorpo receptor) em que os resíduos de uma região hipervariável do receptor são substituídos por resíduos de uma região hipervariável de uma espécie não humana (anticorpo doador), tal como camundongo, rato, coelho ou primata não humano com a especificidade, afinidade e capacidade desejadas. Veja, por exemplo, Patentes dos Estados Unidos 5.225.539; 5.585.089; 5.693.761;5.693.762; 5.859.205, cada qual incorporado aqui por referência. Em alguns casos, os resíduos estruturais da imunoglobulina humana são substituídos por resíduos não humanos correspondentes. Além disso, os anticorpos humanizados podem compreender resíduos que não são encontrados no anticorpo receptor ou no anticorpo doador. Essas modificações são feitas para refinar ainda mais o desempenho do anticorpo (por exemplo, para obter a afinidade desejada). Em geral, o anticorpo humanizado compreenderá substancialmente todos de pelo menos um e tipicamente dois domínios variáveis, em que todas ou substancialmente todas as regiões hipervariáveis correspondem àquelas de uma imunoglobulina não humana e todas ou substancialmente todas as regiões estruturais são os de uma sequência de imunoglobu- lina humana. O anticorpo humanizado compreende opcionalmente pelo menos uma porção de uma região constante de imunoglobulina (Fc), tipicamente a de uma imunoglobulina humana. Para mais detalhes, veja Jones, Peter T., et al. "Replacing the complementaritydetermining regions in a human antibody with those from a mouse." Nature 321.6069 (1986): 522-525.; Riechmann, Lutz, et al. "Reshaping human antibodies for therapy." Nature 332.6162 (1988): 323-327.; e Presta, Leonard G. "Antibody engineering." Current Opinion in Structural Biology 2.4 (1992): 593-596., cada qual incorporado aqui por referência.[00222] "Humanized antibodies" contain CDR regions derived from a non-human species, such as a mouse, which have been, for example, grafted, along with any necessary structural mutations, onto human sequence-derived V regions. Thus, most humanized antibodies are human immunoglobulins (receptor antibody) in which residues from a hypervariable region of the receptor are replaced by residues from a hypervariable region of a non-human species (donor antibody), such as a mouse, rat, rabbit, or non-human primate, with the desired specificity, affinity, and capability. See, for example, U.S. Patents 5,225,539; 5,585,089; 5,693,761; 5,693,762; 5,859,205, each incorporated herein by reference. In some cases, structural residues of the human immunoglobulin are replaced by corresponding non-human residues. Furthermore, humanized antibodies may comprise residues not found in the recipient antibody or the donor antibody. These modifications are made to further refine antibody performance (e.g., to obtain the desired affinity). In general, the humanized antibody will comprise substantially all of at least one and typically two variable domains, where all or substantially all hypervariable regions correspond to those of a non-human immunoglobulin and all or substantially all structural regions are those of a human immunoglobulin sequence. The humanized antibody optionally comprises at least a portion of an immunoglobulin constant (Fc) region, typically that of a human immunoglobulin. For more details, see Jones, Peter T., et al. "Replacing the complementarity-determining regions in a human antibody with those from a mouse." Nature 321.6069 (1986): 522-525.; Riechmann, Lutz, et al. "Reshaping human antibodies for therapy." Nature 332.6162 (1988): 323-327; and Presta, Leonard G. "Antibody engineering." Current Opinion in Structural Biology 2.4 (1992): 593-596, each incorporated herein by reference.
[00223] Os anticorpos totalmente humanos (anticorpos humanos) compreendem CDRs derivadas de humanos, isto é, CDRs de origem humana. Preferivelmente, um anticorpo totalmente humano de acordo com a presente invenção é um anticorpo com pelo menos 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% ou 100% de identidade de sequência com o gene da linhagem germinativa VH humana mais próximo (por exemplo, sequência extraída da lista recomendada e analisada em IMGT/Domain-gap-align).[00223] Fully human antibodies (human antibodies) comprise human-derived CDRs, i.e., CDRs of human origin. Preferably, a fully human antibody according to the present invention is an antibody with at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% or 100% sequence identity with the closest human germline VH gene (e.g., sequence extracted from the recommended list and analyzed in IMGT/Domain-gap-align).
[00224] Conforme aceito pelos sistemas de nomenclatura usuais, como o subsistema de espécies INN em vigor até 2017, os anticorpos totalmente humanos podem compreender um número baixo de desvios da linhagem germinativa em comparação com a referência da li-nhagem germinativa humana mais próxima determinada com base no banco de dados IMGT (http://www.imgt. org, 29 de novembro de 2019). Por exemplo, um anticorpo totalmente humano de acordo com a presente invenção pode compreender até 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 14 ou 15 desvios de linhagem germinativa nas CDRs em comparação com a referência mais próxima da linhagem germinativa humana. Anticorpos totalmente humanos podem ser desenvolvidos a partir de células B derivadas de humanos por técnicas de clonagem em combinação com uma etapa de enriquecimento celular ou imortali- zação. A maioria dos anticorpos totalmente humanos em uso clínico, no entanto, foram isolados de camundongos imunizados transgênicos para o locus IgG humano ou de bibliotecas combinatórias sofisticadas por exibição de fagos (Brüggemann, Marianne, et al. "Human antibody production in transgenic animals." Archivum immunologiae et therapiae experimentalis 63.2 (2015): 101-108.; Carter, Paul J. "Potent antibody therapeutics by design." Nature reviews immunology 6.5 (2006): 343-357.; Frenzel, André, Thomas Schirrmann, e Michael Hust. "Phage display-derived human antibodies in clinical development e therapy." MAbs. Vol. 8. No. 7. Taylor & Francis, 2016.; Nelson, Aaron L., Eugen Dhimolea, e Janice M. Reichert. "Development trends for human mon-oclonal antibody therapeutics." Nature reviews drug discovery 9.10 (2010): 767-774.).[00224] As accepted by usual nomenclature systems, such as the INN species subsystem in effect until 2017, fully human antibodies may comprise a low number of germline deviations compared to the nearest human germline reference determined based on the IMGT database (http://www.imgt.org, November 29, 2019). For example, a fully human antibody according to the present invention may comprise up to 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 14, or 15 germline deviations in the CDRs compared to the nearest human germline reference. Fully human antibodies may be developed from human-derived B cells by cloning techniques in combination with a cell enrichment or immortalization step. Most fully human antibodies in clinical use, however, have been isolated from transgenic immunized mice for the human IgG locus or from sophisticated combinatorial libraries by phage display (Brüggemann, Marianne, et al. "Human antibody production in transgenic animals." Archivum immunologiae et therapiae experimentalis 63.2 (2015): 101-108.; Carter, Paul J. "Potent antibody therapeutics by design." Nature reviews immunology 6.5 (2006): 343-357.; Frenzel, André, Thomas Schirrmann, and Michael Hust. "Phage display-derived human antibodies in clinical development and therapy." MAbs. Vol. 8. No. 7. Taylor & Francis, 2016.; Nelson, Aaron L., Eugen Dhimolea, and Janice M. Reichert. "Development trends for human monoclonal antibody therapeutics." Nature reviews drug discovery 9.10 (2010): 767-774.).
[00225] Várias técnicas estão disponíveis para gerar anticorpos totalmente humanos ou para gerar anticorpos compreendendo CDRs derivadas de humanos (conforme o WO2008112640). Cambridge Antibody Technologies (CAT) e Dyax obtiveram sequências de cDNA de anticorpo de células B periféricas isoladas de humanos imunizados e criaram bibliotecas de exibição de fagos para a identificação de sequências de região variável humana de uma especificidade particular. Em suma, as sequências da região variável do anticorpo são fundidas com a estrutura do Gene III ou do Gene VIII do bacteriófago M13. Estas sequências da região variável do anticorpo são expressas como estruturas Fab ou Fv de cadeia simples (scFv) na ponta do fago que transporta as respectivas sequências. Por meio de ciclos de um processo de panning usando diferentes níveis de condições de ligação ao antígeno (restrições), os fagos que expressam estruturas Fab ou scFv que são específicas para o antígeno de interesse podem ser selecionados e isolados. As sequências de cDNA da região variável do anticorpo de fagos selecionados podem então ser elucidadas usando procedimentos de sequenciamento padrão. Estas sequências podem então ser usadas para a reconstrução de um anticorpo completo com o isotipo desejado usando técnicas de engenharia de anticorpos estabelecidas. Os anticorpos construídos de acordo com este método são considerados anticorpos totalmente humanos (incluindo as CDRs). A fim de melhorar a imunorreatividade (afinidade e especificidade de li-gação ao antígeno) do anticorpo selecionado, um processo de maturação in vitro pode ser introduzido, incluindo uma associação combinatória de diferentes cadeias pesadas e leves, deleção/adição/mutação na CDR3 das cadeias pesada e leve (para imitar VJ e recombinação VDJ) e mutações aleatórias (para imitar hipermutação somática). Um Exemplo de um anticorpo "totalmente humano" gerado por este método é o anticorpo de fator α de necrose antitumoral, Humira (adalimumab).[00225] Several techniques are available for generating fully human antibodies or for generating antibodies comprising human-derived CDRs (as per WO2008112640). Cambridge Antibody Technologies (CAT) and Dyax have obtained antibody cDNA sequences from peripheral B cells isolated from immunized humans and created phage display libraries for the identification of human variable region sequences of a particular specificity. In short, the antibody variable region sequences are fused with the structure of Gene III or Gene VIII of bacteriophage M13. These antibody variable region sequences are expressed as single-stranded Fab or Fv (scFv) structures at the tip of the phage carrying the respective sequences. Through cycles of a panning process using different levels of antigen-binding conditions (constraints), phages expressing Fab or scFv structures that are specific for the antigen of interest can be selected and isolated. The cDNA sequences of the variable region of the selected phage antibody can then be elucidated using standard sequencing procedures. These sequences can then be used to reconstruct a complete antibody with the desired isotype using established antibody engineering techniques. Antibodies constructed according to this method are considered fully human antibodies (including CDRs). In order to improve the immunoreactivity (affinity and specificity of antigen binding) of the selected antibody, an in vitro maturation process can be introduced, including a combinatorial association of different heavy and light chains, deletion/addition/mutation in CDR3 of the heavy and light chains (to mimic VJ and VDJ recombination) and random mutations (to mimic somatic hypermutation). An example of a "fully human" antibody generated by this method is the antitumor necrosis factor α antibody, Humira (adalimumab).
[00226] O termo "polinucleotídeo" refere-se a um desoxirribonu- cleotídeo polimérico produzido de forma recombinante ou sintética ou análogo do mesmo, ou um polinucleotídeo modificado. O termo compreende DNA ou RNA de fita dupla e simples. O polinucleotídeo pode ser integrado, por exemplo, em minicírculos, plasmídeos, cosmídeos, minicromossomos ou cromossomos artificiais. O polinucleotídeo pode ser isolado ou integrado em outra molécula de ácido nucleico, por exemplo, em um vetor de expressão ou cromossomo de uma célula hospedeira eucariótica.[00226] The term "polynucleotide" refers to a recombinant or synthetically produced polymeric deoxyribonucleotide or an analog thereof, or a modified polynucleotide. The term includes double-stranded and single-stranded DNA or RNA. The polynucleotide may be integrated, for example, into minicircles, plasmids, cosmids, minichromosomes, or artificial chromosomes. The polynucleotide may be isolated or integrated into another nucleic acid molecule, for example, into an expression vector or chromosome of a eukaryotic host cell.
[00227] O termo "vetor", como usado aqui, refere-se a uma molécula de ácido nucleico capaz de propagar uma molécula de ácido nuclei- co à qual está ligada. O termo compreende também plasmídeos (não virais) e vetores virais. Certos vetores são capazes de direcionar a expressão de ácidos nucleicos ou polinucleotídeos aos quais estão operativamente ligados. Tais vetores são referidos aqui como "vetores de expressão". Os vetores de expressão para uso eucariótico podem ser construídos inserindo uma sequência polinucleotídica que codifica pelo menos uma proteína de interesse (POI) em uma estrutura de vetor adequada. A estrutura do vetor pode compreender os elementos necessários para garantir a manutenção do vetor e, se desejável, para fornecer amplificação dentro do hospedeiro. Para vetores virais, por exemplo, vetores lentivirais ou retrovirais, podem ser necessários outros elementos específicos de vírus, tais como elementos estruturais ou outros elementos, e são bem conhecidos na técnica. Esses elementos podem ser fornecidos, por exemplo, em cis (no mesmo plas- mídeo) ou em trans (em um plasmídeo separado). Os vetores virais podem exigir vírus auxiliares ou linhagens de empacotamento para transfecção em grande escala. Os vetores podem conter outros elementos, tais como, por exemplo, elementos intensificadores (por exemplo, virais, eucarióticos), íntrons e origens virais de replicação de plasmídeo para replicação em células de mamífero. de acordo com a presente invenção, os vetores de expressão têm tipicamente uma sequência promotora que impulsiona a expressão do POI. A expressão do POI e/ou proteína marcadora seletiva pode ser constitutiva ou regulada (por exemplo, induzível por adição ou remoção de indutores de moléculas pequenas). As sequências regulatórias preferidas para a expressão de células hospedeiras de mamíferos incluem elementos virais que direcionam altos níveis de expressão de um POI em células de mamíferos, tais como elementos reguladores, promotores e/ou po- tenciadores derivados de citomegalovírus (CMV), vírus símio 40 (SV40), adenovírus, (por exemplo, o promotor tardio principal Ad LP do adenovírus) ou polioma. Para descrição adicional de elementos reguladores virais e suas sequências, veja, por exemplo, US 5.168.062, US 4.510.245 e US 4.968.615.[00227] The term "vector," as used herein, refers to a nucleic acid molecule capable of propagating a nucleic acid molecule to which it is attached. The term also includes (non-viral) plasmids and viral vectors. Certain vectors are capable of directing the expression of nucleic acids or polynucleotides to which they are operatively attached. Such vectors are referred to herein as "expression vectors." Expression vectors for eukaryotic use can be constructed by inserting a polynucleotide sequence encoding at least one protein of interest (POI) into a suitable vector structure. The vector structure may comprise the elements necessary to ensure vector maintenance and, if desired, to provide amplification within the host. For viral vectors, for example, lentiviral or retroviral vectors, other virus-specific elements, such as structural elements or other elements, may be required and are well known in the art. These elements may be provided, for example, in cis (in the same plasmid) or in trans (in a separate plasmid). Viral vectors may require helper viruses or packaging strains for large-scale transfection. Vectors may contain other elements, such as, for example, enhancer elements (e.g., viral, eukaryotic), introns, and viral plasmid replication origins for replication in mammalian cells. According to the present invention, expression vectors typically have a promoter sequence that drives POI expression. POI and/or selective marker protein expression may be constitutive or regulated (e.g., inducible by the addition or removal of small molecule inducers). Preferred regulatory sequences for mammalian host cell expression include viral elements that direct high levels of POI expression in mammalian cells, such as regulatory elements, promoters, and/or enhancers derived from cytomegalovirus (CMV), simian virus 40 (SV40), adenovirus (e.g., the adenovirus late major Ad LP promoter), or polyoma. For further description of viral regulatory elements and their sequences, see, for example, US 5,168,062, US 4,510,245, and US 4,968,615.
[00228] O termo "ligante" ou "espaçador", como usado aqui, refere-se a qualquer molécula que permite uma conexão topológica direta entre duas porções. Uma porção pode ser, inter alia, um polipeptídeo, uma proteína, um anticorpo, um fragmento de anticorpo, uma porção citotóxica, uma porção de ligação, uma porção para detecção, tal como um fluoróforo, uma porção para imobilização ou recuperação, tal como contas ou contas magnéticas, uma porção reativa, ou qualquer outra molécula. As duas porções podem ser do mesmo tipo ou diferentes. Os ligantes podem fazer parte de conjugados e podem até contribuir para sua função. Por exemplo, para um conjugado compreendendo um polipeptídeo e uma biotina, a presença de um espaçador de aproximadamente 4 Â (~5 átomos) entre o grupo carbóxi da biotina e o 1° aminoácido volumoso do peptídeo permite que a biotina alcance o (bolso de ligação estrept)avidina. Vários ligantes são conhecidos na técnica e podem ser selecionados com base nas porções que devem ser conectadas. O comprimento do ligante normalmente varia entre 4 átomos e mais de 200 átomos. Os ligantes que excedem 60 átomos de comprimento geralmente compreendem uma população de compostos com um comprimento médio.[00228] The term "ligand" or "spacer," as used herein, refers to any molecule that allows a direct topological connection between two portions. A portion may be, inter alia, a polypeptide, a protein, an antibody, an antibody fragment, a cytotoxic portion, a binding portion, a detection portion, such as a fluorophore, an immobilization or retrieval portion, such as beads or magnetic beads, a reactive portion, or any other molecule. The two portions may be of the same type or different. Ligands may form part of conjugates and may even contribute to their function. For example, for a conjugate comprising a polypeptide and biotin, the presence of a spacer of approximately 4 Å (~5 atoms) between the carboxy group of biotin and the bulky first amino acid of the peptide allows biotin to reach the (strept)avidin binding pocket. Several ligands are known in the art and can be selected based on the portions that need to be connected. The ligand length typically ranges from 4 atoms to over 200 atoms. Ligands exceeding 60 atoms in length generally comprise a population of compounds with an average length.
[00229] "Ligantes para polipeptídeos" podem ser ligados através de uma ligação amida ou qualquer outro resíduo funcional. Os ligantes para polipeptídeos podem ser ligados ao N-terminal ou ao terminal C do polipeptídeo ou podem ser ligados através de um grupo funcional reativo ou cadeia lateral de aminoácidos. Os polipeptídeos podem ser acoplados, por exemplo, à biotina, proteínas como albumina de soro humano (HSA), proteínas transportadoras como hemocianina de lapa (KLH), ovalbumina (OVA) ou albumina de soro bovino (BSA), corantes fluorescentes, sequências de aminoácidos curtas, tais como como marcador Flag, marcador HA, marcador Myc ou marcador His, marcadores reativos, tais como maleimidas, iodoacetamidas, haletos de alquila, ácido de 3-mercaptopropila ou 4-azidobutírico, ou a várias outras porções adequadas. Exemplos não limitativos para ligantes adequados, por exemplo, para conjugação de polipeptídeos, incluem beta- alanina, ácido 4-aminobutírico (GABA), ácido (2-aminoetóxi) acético (AEA), ácido 5-aminovalérico (Ava), ácido 6-amino-hexanoico (Ahx), espaçador PEG2 (ácido 8-amino-3,6-dioxaoctanoico), espaçador PEG3 (ácido 12-amino-4,7,10-trioxadodecanoico), espaçador PEG4 (ácido 15-amino-4,7,10,13-tetraoxapenta-decanoico) e Ttds (ácido trioxapenta-succinâmico). Em alguns casos, o ligante pode ser derivado de uma porção reativa, por exemplo, maleimidas, iodoacetamidas, haletos de alquila, 3-mercaptopropila ou ácido 4-azidobutírico. Em alguns casos, o ligante pode compreender polietilenoglicol (PEG), poli- propilenoglicol, polioxialquilenos ou copolímeros de polietilenoglicol ou polipropilenoglicol.[00229] "Polypeptide ligands" can be linked via an amide linkage or any other functional residue. Polypeptide ligands can be linked to the N-terminus or C-terminus of the polypeptide or can be linked via a reactive functional group or amino acid side chain. Polypeptides can be coupled, for example, to biotin, proteins such as human serum albumin (HSA), carrier proteins such as limpet hemocyanin (KLH), ovalbumin (OVA) or bovine serum albumin (BSA), fluorescent dyes, short amino acid sequences such as Flag marker, HA marker, Myc marker or His marker, reactive markers such as maleimides, iodoacetamides, alkyl halides, 3-mercaptopropyl or 4-azidobutyric acid, or various other suitable moieties. Non-limiting examples of suitable ligands, for example, for polypeptide conjugation, include beta-alanine, 4-aminobutyric acid (GABA), (2-aminoethoxy)acetic acid (AEA), 5-aminovaleric acid (Ava), 6-aminohexanoic acid (Ahx), PEG2 spacer (8-amino-3,6-dioxaoctanoic acid), PEG3 spacer (12-amino-4,7,10-trioxadodecanoic acid), PEG4 spacer (15-amino-4,7,10,13-tetraoxapentadecanoic acid), and Ttds (trioxapentasuccinamic acid). In some cases, the ligand may be derived from a reactive moiety, for example, maleimides, iodoacetamides, alkyl halides, 3-mercaptopropyl, or 4-azidobutyric acid. In some cases, the binder may comprise polyethylene glycol (PEG), polypropylene glycol, polyoxyalkylenes, or copolymers of polyethylene glycol or polypropylene glycol.
[00230] "Ligantes para anticorpos" são ligantes que estabelecemuma conexão covalente entre diferentes porções de anticorpos e in- cluem ligantes peptídicos e polímeros não proteináceos, incluindo, mas não se limitando a, polietilenoglicol (PEG), polipropilenoglicol, po- lioxialquilenos ou copolímeros de polietilenoglicol, polipropilenoglicol.[00230] "Antibody ligands" are ligands that establish a covalent connection between different portions of antibodies and include peptide ligands and non-proteinaceous polymers, including, but not limited to, polyethylene glycol (PEG), polypropylene glycol, polyoxyalkylenes or copolymers of polyethylene glycol, polypropylene glycol.
[00231] "Tratar" uma doença em um indivíduo ou "tratando" um indivíduo com uma doença refere-se a submeter o indivíduo a um tratamento farmacêutico, por exemplo, a administração de um medicamento, de modo que pelo menos um sintoma da doença seja diminuído ou impedido de piorar.[00231] "Treating" a disease in an individual or "treating" an individual with a disease refers to subjecting the individual to pharmaceutical treatment, for example, the administration of a medication, so that at least one symptom of the disease is reduced or prevented from worsening.
[00232] Os termos "prevenir", "prevenindo", "prevenção" e semelhantes referem-se à redução da probabilidade de desenvolver uma doença, distúrbio ou condição em um indivíduo que não tem, mas está em risco ou suscetível a desenvolver uma doença, desordem ou con-dição.[00232] The terms "prevent", "preventing", "prevention" and the like refer to reducing the likelihood of developing a disease, disorder or condition in an individual who does not have, but is at risk of or susceptible to developing a disease, disorder or condition.
[00233] O termo "quantidade eficaz" ou "quantidade terapeuti- camente eficaz" é usado de intercambiavelmente aqui e refere-se a uma quantidade suficiente para alcançar um resultado biológico específico ou para modular ou melhorar um sintoma em um indivíduo, ou o tempo de início de um sintoma, tipicamente por pelo menos cerca de 10%; geralmente em pelo menos cerca de 20%, preferivelmente pelo menos cerca de 30%, ou mais preferivelmente pelo menos cerca de 50%. A eficácia do uso de um anticorpo na terapia do câncer pode ser avaliada com base na mudança na carga tumoral. Tanto o encolhimento do tumor (resposta objetiva) quanto o tempo para o desenvolvimento da progressão da doença são desfechos importantes em ensaios clínicos de câncer. Critérios de resposta padronizados, conhecidos como RECIST (Critérios de Avaliação de Resposta em Tumores Sólidos), foram publicados em 2000. Uma atualização (RECIST 1.1) foi lançada em 2009. Os critérios RECIST são normalmente usados em ensaios clínicos onde a resposta objetiva é o desfecho primário do estudo, bem como em ensaios em que a avaliação da doença estável, progressão tumoral ou análises de tempo para progressão são realizadas porque essas medidas de resultados são baseadas em uma avaliação da carga tumoral anatômica e sua mudança ao longo do ensaio. Uma quantidade eficaz para um determinado indivíduo pode variar dependendo de fatores como a condição a ser tratada, a saúde geral do indivíduo, o método, a via e a dose de administração e a gravidade dos efeitos colaterais. Quando em combinação, uma quantidade eficaz é proporcional a uma combinação de componentes e o efeito não se limita apenas aos componentes individuais.[00233] The term "effective amount" or "therapeutically effective amount" is used interchangeably herein and refers to an amount sufficient to achieve a specific biological outcome or to modulate or improve a symptom in an individual, or the time to onset of a symptom, typically by at least about 10%; generally by at least about 20%, preferably at least about 30%, or more preferably at least about 50%. The effectiveness of using an antibody in cancer therapy can be assessed based on the change in tumor burden. Both tumor shrinkage (objective response) and time to disease progression are important outcomes in cancer clinical trials. Standardized response criteria, known as RECIST (Response Assessment Criteria in Solid Tumors), were published in 2000. An update (RECIST 1.1) was released in 2009. RECIST criteria are typically used in clinical trials where objective response is the primary outcome of the study, as well as in trials where assessment of stable disease, tumor progression, or time-to-progression analyses are performed because these outcome measures are based on an assessment of anatomical tumor burden and its change over the course of the trial. An effective amount for a given individual may vary depending on factors such as the condition being treated, the individual's overall health, the method, route, and dose of administration, and the severity of side effects. When combined, an effective amount is proportional to a combination of components, and the effect is not limited to the individual components alone.
[00234] Se não for definido de outra forma, "Resposta Completa" (CR) é definida como o desaparecimento de todas as lesões alvo. Quaisquer linfonodos patológicos (seja alvo ou não alvo) devem ter redução no eixo curto para <10 mm. Para "Resposta Parcial" (PR) deve ser alcançada uma diminuição de pelo menos 30% na soma dos diâmetros das lesões alvo, tomando como referência os diâmetros da soma da linha de base. Para "Doença Progressiva" (DP), pelo menos um aumento de 20% na soma dos diâmetros das lesões alvo, tomando como referência a menor soma no estudo (isso inclui a soma da linha de base, se for a menor no estudo). Além do aumento relativo de 20%, a soma também deve demonstrar um aumento absoluto de pelo menos 5 mm. Na "Doença Estável" (SD) não se observa encolhimento suficiente para se qualificar para PR nem aumento suficiente para se qualificar para DP, tomando-se como referência os diâmetros de menor soma durante o estudo.[00234] Unless otherwise defined, "Complete Response" (CR) is defined as the disappearance of all target lesions. Any pathological lymph nodes (whether target or non-target) must have a short-axis reduction to <10 mm. For "Partial Response" (PR), a decrease of at least 30% in the sum of the diameters of the target lesions must be achieved, taking as a reference the diameters of the baseline sum. For "Progressive Disease" (PD), at least a 20% increase in the sum of the diameters of the target lesions, taking as a reference the smallest sum in the study (this includes the baseline sum if it is the smallest in the study). In addition to the 20% relative increase, the sum must also demonstrate an absolute increase of at least 5 mm. In "Stable Disease" (SD), there is not sufficient shrinkage to qualify for PR nor sufficient increase to qualify for PD, taking as a reference the diameters of the smallest sum during the study.
[00235] As medidas de resultado secundário que podem ser usadas para determinar o benefício terapêutico dos anticorpos inventivos descritos aqui incluem o seguinte: "Taxa de resposta objetiva" (ORR) é definida como a proporção de indivíduos que atingem uma resposta completa (CR) ou resposta parcial (PR). A "sobrevivência livre de progressão" (PFS) é definida como o tempo desde a data da primeira dose de um anticorpo até a progressão da doença ou morte, o que ocorrer primeiro. A "sobrevivência geral" (OS) é definida como o período de tempo desde a data do diagnóstico ou do início do tratamento de uma doença, que os pacientes diagnosticados com a doença ainda estão vivos. "Duração da resposta geral" (DOR) é definido como o tempo desde o CR ou PR inicial do participante até o momento da progressão da doença. A "profundidade de resposta" (DpR) é definida como a porcentagem de redução do tumor observada no ponto de resposta máxima em comparação com a carga tumoral inicial. Os desfechos clínicos para ORR e PFS podem ser determinados com base nos critérios RECIST 1.1 descritos acima.[00235] Secondary outcome measures that can be used to determine the therapeutic benefit of the inventive antibodies described herein include the following: "Objective response rate" (ORR) is defined as the proportion of individuals who achieve a complete response (CR) or partial response (PR). "Progression-free survival" (PFS) is defined as the time from the date of the first dose of an antibody until disease progression or death, whichever occurs first. "Overall survival" (OS) is defined as the period of time from the date of diagnosis or initiation of treatment of a disease that patients diagnosed with the disease are still alive. "Duration of overall response" (DOR) is defined as the time from the participant's initial CR or PR until the time of disease progression. "Depth of response" (DpR) is defined as the percentage of tumor reduction observed at the point of maximum response compared to the initial tumor burden. Clinical outcomes for ORR and PFS can be determined based on the RECIST 1.1 criteria described above.
[00236] Quando indivíduos não humanos são analisados, os parâmetros acima mencionados para determinar a eficácia e o benefício terapêuticos devem ser adaptados como descrito em outro lugar aqui, conforme o Exemplo 12ss.[00236] When non-human subjects are analyzed, the above-mentioned parameters for determining therapeutic efficacy and benefit should be adapted as described elsewhere herein, as per Example 12ff.
[00237] "Indivíduos" típicos de acordo com a presente invenção incluem indivíduos humanos e não humanos. Os indivíduos podem ser mamíferos, tais como camundongos, ratos, gatos, cachorros, primatas e/ou humanos.[00237] Typical "individuals" according to the present invention include human and non-human individuals. Individuals may be mammals, such as mice, rats, cats, dogs, primates and/or humans.
[00238] "Composições farmacêuticas" (também "formulaçõesterapêuticas") do anticorpo, fragmento ou conjugado podem ser preparadas misturando o anticorpo com o grau de pureza desejado com veículos, excipientes ou estabilizadores fisiologicamente aceitáveis opcionais, por exemplo, de acordo com Remington's Pharmaceutical Sciences (18a ed..; Mack Pub. Co.: Eaton, Pa., 1990), por exemplo na forma de formulações liofilizadas ou soluções aquosas. Os veículos, excipientes ou estabilizadores aceitáveis não são tóxicos para os receptores nas dosagens e concentrações usadas e incluem tampões como fosfato, citrato e outros ácidos orgânicos; antioxidantes incluindo ácido ascórbico e metionina; conservantes (tais como cloreto de octa- decildimetilbenzil amônio; cloreto de hexametônio; cloreto de ben- zalcônio, cloreto de benzetônio; fenol, álcool butílico ou benzílico; al- quil parabenos, tais como metil ou propil parabeno; catecol; resorcinol; ciclohexanol; 3-pentanol; e m-cresol); polipeptídeo de baixo peso molecular (menos de cerca de 10 resíduos); proteínas, tais como albumina sérica, gelatina ou imunoglobulinas; polímeros hidrófilos tais como polivinilpirrolidona; aminoácidos, tais como glicina, glutamina, aspara- gina, histidina, arginina ou lisina; monossacarídeos, dissacarídeos e outros carboidratos incluindo glicose, manose ou dextrinas; agentes quelantes tais como EDTA; açúcares, tais como sacarose, manitol, trealose ou sorbitol; contraíons formadores de sal, tais como sódio; complexos metálicos (por exemplo, complexos Zn-proteína); e/ou ten- soativos não iônicos como Tween®, Pluronic® ou polietilenoglicol (PEG).[00238] "Pharmaceutical compositions" (also "therapeutic formulations") of the antibody, fragment or conjugate may be prepared by mixing the antibody to the desired degree of purity with optional physiologically acceptable vehicles, excipients or stabilizers, for example, according to Remington's Pharmaceutical Sciences (18th ed.; Mack Pub. Co.: Eaton, Pa., 1990), for example in the form of lyophilized formulations or aqueous solutions. Acceptable vehicles, excipients or stabilizers are not toxic to receptors at the dosages and concentrations used and include buffers such as phosphate, citrate and other organic acids; antioxidants including ascorbic acid and methionine; Preservatives (such as octadecyldimethylbenzyl ammonium chloride; hexamethonium chloride; benzalkonium chloride, benzethonium chloride; phenol, butyl or benzyl alcohol; alkyl parabens, such as methyl or propyl paraben; catechol; resorcinol; cyclohexanol; 3-pentanol; and m-cresol); low molecular weight polypeptides (less than about 10 residues); proteins, such as serum albumin, gelatin or immunoglobulins; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; amino acids, such as glycine, glutamine, asparagine, histidine, arginine or lysine; monosaccharides, disaccharides and other carbohydrates including glucose, mannose or dextrins; chelating agents such as EDTA; sugars, such as sucrose, mannitol, trehalose or sorbitol; Salt-forming counterions, such as sodium; metal complexes (e.g., Zn-protein complexes); and/or nonionic surfactants such as Tween®, Pluronic®, or polyethylene glycol (PEG).
[00239] Uma "célula hospedeira" é uma célula que é usada para receber, manter, reproduzir e amplificar um vetor. Uma célula hospedeira também pode ser usada para expressar o polipeptídeo, por exemplo, um anticorpo ou fragmento do mesmo codificado pelo vetor. O ácido nucleico contido no vetor é replicado quando a célula hospedeira se divide, amplificando assim os ácidos nucleicos. As células hospedeiras preferidas são células de mamífero, tais como células CHO ou células HEK. Outras células hospedeiras preferidas são células YB2/0 de mieloma de rato.[00239] A "host cell" is a cell that is used to receive, maintain, reproduce, and amplify a vector. A host cell may also be used to express the polypeptide, for example, an antibody or fragment thereof encoded by the vector. The nucleic acid contained in the vector is replicated when the host cell divides, thus amplifying the nucleic acids. Preferred host cells are mammalian cells, such as CHO cells or HEK cells. Other preferred host cells are YB2/0 mouse myeloma cells.
[00240] Uma "célula com expressão alvo endógena" é uma célula que expressa uma proteína alvo em um nível que é comparável à situação fisiológica ou de doença. Normalmente, as células que foram manipuladas para superexpressão expressam uma proteína alvo em níveis muito mais altos.[00240] An "endogenously targeted expression cell" is a cell that expresses a target protein at a level comparable to the physiological or disease state. Typically, cells that have been manipulated for overexpression express a target protein at much higher levels.
[00241] O termo "intratumoral", "intratumoral", "infiltração tumoral" ou "tumoral" no contexto de células, estruturas, proteínas, anticorpos ou marcadores refere-se à sua localização dentro do tecido tumoral.[00241] The term "intratumoral", "intratumoral", "tumor infiltration" or "tumor" in the context of cells, structures, proteins, antibodies or markers refers to their location within the tumor tissue.
[00242] As células que são "positivas" ou "+" para um determinado marcador ou proteína são células caracterizadas pela expressão substancial desse marcador ou proteína. A expressão do marcador ou da proteína pode ser determinada e quantificada como é conhecido na técnica, por exemplo, para definir diferentes populações de células. Para a caracterização de populações de células (imunes), a expressão do marcador pode ser determinada por FACS ou usando qualquer outra técnica descrita aqui.[00242] Cells that are "positive" or "+" for a given marker or protein are cells characterized by substantial expression of that marker or protein. The expression of the marker or protein can be determined and quantified as is known in the art, for example, to define different cell populations. For the characterization of (immune) cell populations, marker expression can be determined by FACS or using any other technique described herein.
[00243] "Leucócitos" são células imunes que expressam CD45. "Células CD45+", como usado aqui, referem-se a todos os leucócitos. CD45 pode ser usado como marcador para distinguir células imunes e células não imunes.[00243] "Leukocytes" are immune cells that express CD45. "CD45+ cells," as used herein, refers to all leukocytes. CD45 can be used as a marker to distinguish immune cells from non-immune cells.
[00244] O termo "linfócito" refere-se a todas as populações de lin- fócitos brancos imaturos, maduros, indiferenciados e diferenciados, incluindo variedades específicas de tecidos e especializadas. Abrange, por meio de exemplo não limitante, células B, células T, células NKT e células NK. Em algumas modalidades, os linfócitos incluem todas as linhagens de células B, incluindo células pré-B, células B progenitoras, células pró-B precoces, células pró-B tardias, células pré-B grandes, células pré-B pequenas, células B imaturas, células B maduras células B do plasma, células B de memória, células B1, células B-2 e populações de células anérgicas AN1/T3.[00244] The term "lymphocyte" refers to all populations of immature, mature, undifferentiated, and differentiated white lymphocytes, including tissue-specific and specialized varieties. It includes, by way of non-limiting example, B cells, T cells, NKT cells, and NK cells. In some embodiments, lymphocytes include all B cell lineages, including pre-B cells, B progenitor cells, early pro-B cells, late pro-B cells, large pre-B cells, small pre-B cells, immature B cells, mature B cells, plasma B cells, memory B cells, B1 cells, B-2 cells, and anergic AN1/T3 cell populations.
[00245] "Células T" são células imunes que expressam TCRαβ, CD3 e CD8 ou CD4. Como usado aqui, o termo inclui células T naive, células T CD4+, células T CD8+, células T regulatórias, células T de memória, células T ativadas, células T anérgicas, células T tolerantes, células B quiméricas e células T específicas de antígeno e outras populações de células T conhecidas na técnica. Em algumas modalida- des, a presença de um receptor de células T (TCR) na superfície celular distingue as células T de outros linfócitos.[00245] "T cells" are immune cells that express TCRαβ, CD3, and CD8 or CD4. As used herein, the term includes naive T cells, CD4+ T cells, CD8+ T cells, regulatory T cells, memory T cells, activated T cells, anergic T cells, tolerant T cells, chimeric B cells, and antigen-specific T cells, and other T cell populations known in the art. In some modalities, the presence of a T cell receptor (TCR) on the cell surface distinguishes T cells from other lymphocytes.
[00246] "Células T CD8+" (também "célula T citotóxica", "TC", "lin- fócito T citotóxico", "CTL", "célula T-killer", "célula T citolítica", "célula T CD8+" ou "célula exterminadora T") são células T que expressam CD3, CD45 e CD8. As células T CD8+ podem matar células cancerígenas, células infectadas (particularmente com vírus) ou células danificadas.[00246] "CD8+ T cells" (also "cytotoxic T cell", "TC", "cytotoxic T lymphocyte", "CTL", "killer T cell", "cytolytic T cell", "CD8+ T cell" or "exterminator T cell") are T cells that express CD3, CD45 and CD8. CD8+ T cells can kill cancerous cells, infected cells (particularly with viruses) or damaged cells.
[00247] "Células T CD4+" (também "células T auxiliares", "células Th") são células imunes que expressam CD3, CD4 e CD45. Existem vários subconjuntos de células T auxiliares, como, sem limitação, Th1, Th2 e Th17. As células T CD4+ ajudam a suprimir ou regular as respostas imunes. Eles são essenciais na mudança de classe de anticorpos de células B, na ativação e crescimento de células T citotóxicas e na maximização da atividade bactericida de fagócitos, como macró- fagos.[00247] "CD4+ T cells" (also "helper T cells", "Th cells") are immune cells that express CD3, CD4, and CD45. There are several subsets of helper T cells, such as, but not limited to, Th1, Th2, and Th17. CD4+ T cells help suppress or regulate immune responses. They are essential in antibody class switching of B cells, in the activation and growth of cytotoxic T cells, and in maximizing the bactericidal activity of phagocytes, such as macrophages.
[00248] Como usado aqui, o termo "células Treg" (também "Tregs", "células T regulatórias", "células T regulatórias", "células T supressoras") refere-se às células imunes que expressam CD3, CD4, CD45 e FoxP3 e, além disso, expressando altos níveis de CD25 e baixos níveis de CD127. A identificação de células Treg pode ser realizada como descrito em outro lugar aqui. As células Treg normalmente também expressam altos níveis de CTLA-4, GITR e LAG-3. Na literatura, as Tregs também foram classificadas com base no marcador de memória CD45RO.[00248] As used herein, the term "Treg cells" (also "Tregs", "regulatory T cells", "suppressor T cells") refers to immune cells that express CD3, CD4, CD45, and FoxP3, and in addition express high levels of CD25 and low levels of CD127. Identification of Treg cells can be performed as described elsewhere herein. Treg cells also typically express high levels of CTLA-4, GITR, and LAG-3. In the literature, Tregs have also been classified based on the memory marker CD45RO.
[00249] Sob condições fisiológicas, as células Treg mantêm a tolerância imunológica. Durante uma resposta imune, as células Treg interrompem a imunidade mediada por células T e suprimem as células T autorreativas que escaparam da seleção negativa dentro do timo. As células Treg também podem suprimir outros tipos de células imunes, como células NK e células B. Acredita-se que as células Treg adapta- tivas (chamadas células Th3 ou Tr1) sejam geradas durante uma resposta imune.[00249] Under physiological conditions, Treg cells maintain immunological tolerance. During an immune response, Treg cells disrupt T cell-mediated immunity and suppress autoreactive T cells that have escaped negative selection within the thymus. Treg cells can also suppress other types of immune cells, such as NK cells and B cells. Adaptive Treg cells (called Th3 or Tr1 cells) are believed to be generated during an immune response.
[00250] Além disso, as células Treg desempenham um papel importante no escape imunológico, suprimindo a imunidade antitumoral, proporcionando assim um ambiente de tolerância imunológica. As células T que reconhecem as células cancerígenas estão frequentemente presentes em grande número nos tumores, mas sua função citotóxi- ca é suprimida por células imunossupressoras próximas. As Tregs são abundantes em diversos tipos de câncer, são altamente enriquecidas no microambiente tumoral e são bem conhecidas por seu papel na progressão tumoral.[00250] Furthermore, Treg cells play an important role in immune escape, suppressing antitumor immunity, thus providing an environment of immune tolerance. T cells that recognize cancer cells are often present in large numbers in tumors, but their cytotoxic function is suppressed by nearby immunosuppressive cells. Tregs are abundant in various types of cancer, are highly enriched in the tumor microenvironment, and are well known for their role in tumor progression.
[00251] As "células Treg ativadas" expressam CD4, CD45, FoxP3, CD69 e CCR8 e, além disso, apresentam alta expressão de CD25 e baixa expressão de CD127. CD69 é um marcador de ativação de células T.[00251] "Activated Treg cells" express CD4, CD45, FoxP3, CD69, and CCR8, and in addition, they show high expression of CD25 and low expression of CD127. CD69 is a marker of T cell activation.
[00252] "Células T regulatórias positivas para CCR8" ou "células T regulatórias CCR8+" são Tregs que expressam CCR8. "Células CD4conv" são células T CD4+ e CD25 convencionais.[00252] "CCR8-positive regulatory T cells" or "CCR8+ regulatory T cells" are Tregs that express CCR8. "CD4conv cells" are conventional CD4+ and CD25 T cells.
[00253] "Células T gama delta" são células T que expressam um receptor de células T distinto, TCRYδ, em sua superfície. As células T gama delta também expressam CD3.[00253] "Gamma delta T cells" are T cells that express a distinct T cell receptor, TCRYδ, on their surface. Gamma delta T cells also express CD3.
[00254] "Células B" são células imunes que expressam CD19 e células B maduras expressam CD20 e CD22. As células B após ativação via CD40 sofrem diferenciação onde ocorre hipermutação somática e troca de classe de imunoglobulina melhorad, resultando em células B maduras ou células plasmáticas (capazes de secretar Abs). As células B estão envolvidas na imunidade humoral do sistema imune adaptativo e são células apresentadoras de antígenos.[00254] "B cells" are immune cells that express CD19, and mature B cells express CD20 and CD22. After activation via CD40, B cells undergo differentiation where somatic hypermutation and enhanced immunoglobulin class switching occur, resulting in mature B cells or plasma cells (capable of secreting antibodies). B cells are involved in the humoral immunity of the adaptive immune system and are antigen-presenting cells.
[00255] "Macrófagos" são células imunes que expressam CD14 baixo, CD16 alto, CD11b, CD68, CD163 e CD206. Os macrófagos engolfam e digerem detritos celulares, substâncias estranhas, micróbios ou células cancerosas por fagocitose. Além da fagocitose, os macrófa- gos desempenham um papel crítico na imunidade inata e também aju-dam a iniciar a imunidade adaptativa recrutando outras células imunes. Por exemplo, os macrófagos são importantes como apresentadores de antígenos para as células T. Os macrófagos que estimulam a inflamação são chamados de macrófagos M1, enquanto aqueles que diminuem a inflamação e estimulam o reparo tecidual são chamados de ma- crófagos M2.[00255] "Macrophages" are immune cells that express low CD14, high CD16, CD11b, CD68, CD163, and CD206. Macrophages engulf and digest cellular debris, foreign substances, microbes, or cancer cells by phagocytosis. In addition to phagocytosis, macrophages play a critical role in innate immunity and also help initiate adaptive immunity by recruiting other immune cells. For example, macrophages are important as antigen presenters to T cells. Macrophages that stimulate inflammation are called M1 macrophages, while those that decrease inflammation and stimulate tissue repair are called M2 macrophages.
[00256] Como usado aqui, "macrófagos M1" são um subconjunto de macrófagos que expressam ACOD1. Os macrófagos M1 têm funções pró-inflamatórias, bactericidas e fagocitárias.[00256] As used herein, "M1 macrophages" are a subset of macrophages that express ACOD1. M1 macrophages have pro-inflammatory, bactericidal, and phagocytic functions.
[00257] Como usado aqui, "macrófagos M2" são um subconjunto de macrófagos que expressam MRC1 (CD206). Os macrófagos M2 secretam interleucinas anti-inflamatórias, desempenham um papel na cicatrização de feridas e são necessários para revascularização e ree- pitelização. Os macrófagos associados ao tumor são principalmente do fenótipo M2 e parecem promover ativamente o crescimento do tumor.[00257] As used herein, "M2 macrophages" are a subset of macrophages that express MRC1 (CD206). M2 macrophages secrete anti-inflammatory interleukins, play a role in wound healing, and are required for revascularization and re-epithelialization. Tumor-associated macrophages are primarily of the M2 phenotype and appear to actively promote tumor growth.
[00258] As "células dendríticas" (DCs) são leucócitos derivados da medula óssea e são o tipo mais potente de células apresentadoras de antígenos. As DCs são especializadas em capturar e processar an- tígenos, convertendo proteínas em peptídeos que são apresentados em moléculas do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) reconhecidas pelas células T. Conforme definido aqui, as DCs são caracterizadas pela expressão de CD1c, CD14, CD16, CD141, CD11c e CD123. Existem diferentes subpopulações de células dendríticas. Em humanos, as DC1 são imunogênicas enquanto as células DC2 são to- lerogênicas. As DC maduras expressam CD83, enquanto as DC plas- mocitóides expressam CD123.[00258] Dendritic cells (DCs) are bone marrow-derived leukocytes and are the most potent type of antigen-presenting cells. DCs are specialized in capturing and processing antigens, converting proteins into peptides that are presented to major histocompatibility complex (MHC) molecules recognized by T cells. As defined herein, DCs are characterized by the expression of CD1c, CD14, CD16, CD141, CD11c, and CD123. There are different subpopulations of dendritic cells. In humans, DC1 cells are immunogenic while DC2 cells are tolerogenic. Mature DCs express CD83, while plasmacytoid DCs express CD123.
[00259] "Células NK" (também células exterminadoras naturais) são células imunes que expressam CD45, CD16, CD56, NKG2D, mas são negativas para CD3. As células NK não requerem ativação para matar células que não possuem marcadores "próprios" do MHC classe 1. NCR1 (também conhecido como CD335 ou NKp46) é expresso em células NK e em um subconjunto de células NKT.[00259] "NK cells" (also natural killer cells) are immune cells that express CD45, CD16, CD56, NKG2D, but are negative for CD3. NK cells do not require activation to kill cells that do not possess "self" MHC class 1 markers. NCR1 (also known as CD335 or NKp46) is expressed on NK cells and a subset of NKT cells.
[00260] "Células T exterminadoras naturais (NKT)" são um grupo heterogêneo de células T que compartilham propriedades tanto das células T quanto das células exterminadoras naturais.[00260] "Natural killer (NKT) T cells" are a heterogeneous group of T cells that share properties of both T cells and natural killer cells.
[00261] "Células iNKT" (também "células T exterminadoras naturais invariantes") expressam αβ TCR invariável (Vα24-Jα18, CD24lo), CD44hi, NK1.1 (camundongo) e NKG2D. O TCR invariante reconhece o antígeno glicolipídico apresentado pela molécula não po- limórfica do tipo MHC classe I, CD1d. Essas células podem influenciar uma resposta imune produzindo rapidamente grandes quantidades de citocinas, isto é, IFNg.[00261] "iNKT cells" (also "invariant natural killer T cells") express invariant αβ TCR (Vα24-Jα18, CD24lo), CD44hi, NK1.1 (mouse) and NKG2D. The invariant TCR recognizes the glycolipid antigen presented by the non-polymorphic MHC class I molecule, CD1d. These cells can influence an immune response by rapidly producing large amounts of cytokines, i.e., IFNγ.
[00262] Conforme conhecido na técnica, "células efetoras" são células imunes que suportam ativamente a resposta imune após a estimulação. Como usado aqui, células efetoras referem-se às células imunes que expressam receptores FCY e são, portanto, capazes de mediar ADCC ou ADCP. Exemplos não limitantes de células efetoras são monócitos, neutrófilos, mastócitos e, preferivelmente, macrófagos e células exterminadoras naturais.[00262] As known in the art, "effector cells" are immune cells that actively support the immune response after stimulation. As used herein, effector cells refer to immune cells that express FCY receptors and are therefore capable of mediating ADCC or ADCP. Non-limiting examples of effector cells are monocytes, neutrophils, mast cells, and preferably macrophages and natural killer cells.
[00263] "Estruturas linfoides terciárias" são estruturas intratumo- rais caracterizadas pelo aumento da expressão de LTta, LTtb, Cxcr5 e Cxcl13.[00263] "Tertiary lymphoid structures" are intratumoral structures characterized by increased expression of LTta, LTtb, Cxcr5 and Cxcl13.
[00264] O termo "receptor de antígeno quimérico" ou "CAR", como usado aqui, refere-se a um receptor de superfície de célula T artificial que é projetado para ser expresso em uma célula efetora imu- ne e se liga especificamente a um antígeno. Os CARs podem ser usados como terapia com transferência de células adotivas. Os monócitos são removidos de um paciente (sangue, tumor ou líquido ascítico) e modificados para que expressem os receptores específicos para uma determinada forma de antígeno. Em algumas modalidades, os CARs foram expressos com especificidade para um antígeno associado a tumor. Os CARs também podem compreender um domínio de ativação intracelular, um domínio transmembranar e um domínio extracelular compreendendo uma região de ligação ao antígeno associada ao tumor. Em alguns aspectos, os CARs compreendem fusões de anticorpos monoclonais derivados de fragmentos variáveis de cadeia simples (scFv), fundidos à transmembrana CD3-zeta e domínio intracelular. A especificidade dos projetos de CAR pode ser derivada de ligantes de receptores (por exemplo, peptídeos). Em algumas modalidades, um CAR pode direcionar cânceres redirecionando um monócito/macrófago que expressa o CAR específico para antígenos associados ao tumor.[00264] The term "chimeric antigen receptor" or "CAR," as used herein, refers to an artificial T cell surface receptor that is designed to be expressed on an immune effector cell and specifically binds to an antigen. CARs can be used as adoptive cell transfer therapy. Monocytes are removed from a patient (blood, tumor, or ascitic fluid) and modified to express receptors specific to a particular form of antigen. In some embodiments, CARs have been expressed with specificity for a tumor-associated antigen. CARs may also comprise an intracellular activation domain, a transmembrane domain, and an extracellular domain comprising a tumor-associated antigen-binding region. In some aspects, CARs comprise fusions of monoclonal antibodies derived from single-chain variable fragments (scFv), fused to the CD3-zeta transmembrane and intracellular domain. The specificity of CAR designs may be derived from receptor ligands (e.g., peptides). In some modalities, a CAR can target cancers by redirecting a monocyte/macrophage expressing the specific CAR to tumor-associated antigens.
[00265] Os esquemas de dosagem são abreviados como conhecido na técnica, por exemplo, todos os dias (QD), a cada 2 dias (Q2D), ou a cada 3 dias (Q3D).[00265] Dosage schedules are abbreviated as known in the art, for example, every day (QD), every 2 days (Q2D), or every 3 days (Q3D).
[00266] De acordo com um primeiro aspecto, é fornecido um poli- peptídeo sulfatado isolado compreendendo o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de sete membranas. Um domínio rico em tirosi- na é um domínio N-terminal conservado, que caracteriza receptor de sete transmembranas, tais como receptores de quimiocinas CXC e CC, conforme o Exemplo 1. Como usado aqui, o termo TRD refere-se à sequência de aminoácidos ou proteína de um receptor de quimiocina CXC ou CC que está localizado no N-terminal da primeira cisteína contada a partir do N-terminal. Além da tirosina, um TRD compreende tipicamente resíduos de aminoácidos carregados negativamente, como ácido aspártico. Os TRDs para todos os receptores de quimiocinas CC e CXC estão listados no Exemplo 4, Tabela 4.1 para camundongo, macaco e humano.[00266] According to a first aspect, an isolated sulfated polypeptide comprising the tyrosine-rich domain (TRD) of a seven-membrane receptor is provided. A tyrosine-rich domain is a conserved N-terminal domain that characterizes seven-transmembrane receptors, such as CXC and CC chemokine receptors, as in Example 1. As used herein, the term TRD refers to the amino acid sequence or protein of a CXC or CC chemokine receptor that is located at the N-terminal of the first cysteine counted from the N-terminal. In addition to tyrosine, a TRD typically comprises negatively charged amino acid residues, such as aspartic acid. The TRDs for all CC and CXC chemokine receptors are listed in Example 4, Table 4.1 for mouse, monkey, and human.
[00267] A sulfatação de tirosina é uma modificação de proteína pós- traducional onipresente que ocorre em todos os organismos multicelu- lares. É catalisada pelas tirosilproteínas sulfotransferases (TPSTs) 1 e 2, enzimas residentes em Golgi que transferem sulfato do cofator PAPS (3'-fosfoadenosina 5'-fosfosulfato) para uma tirosina dependente de contexto em um substrato proteico. Atualmente, apenas uma pequena porção de proteínas sulfatadas é conhecida e o entendimento dos mecanismos biológicos de sulfatação e posições específicas de modificação ainda está em andamento, conforme o Exemplo 4. Embora modificações pós-traducionais, tais como glicosilação, fosforilação, acilação, adenilação, farnesilação, ubiquitinação e sulfatação sejam frequentes em proteínas de sistemas vivos, a geração de anticorpos é tipicamente realizada com base na sequência alvo não modificada.[00267] Tyrosine sulfation is a ubiquitous post-translational protein modification that occurs in all multicellular organisms. It is catalyzed by tyrosylprotein sulfotransferases (TPSTs) 1 and 2, Golgi-resident enzymes that transfer sulfate from the cofactor PAPS (3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate) to a context-dependent tyrosine on a protein substrate. Currently, only a small portion of sulfated proteins are known, and understanding the biological mechanisms of sulfation and specific modification sites is still ongoing, as shown in Example 4. Although post-translational modifications such as glycosylation, phosphorylation, acylation, adenylation, farnesylation, ubiquitination, and sulfation are frequent in proteins from living systems, antibody generation is typically performed based on the unmodified target sequence.
[00268] Os inventores desenvolveram uma abordagem incomum para geração de anticorpos, e surpreendentemente descobriram que os polipeptídeos sinteticamente sulfatados de acordo com o primeiro aspecto poderiam ser usados para aumentar tanto as taxas de sucesso para geração de anticorpos para receptores de quimiocina per se, quanto também as taxas de sucesso para anticorpos de receptor de quimiocina com propriedades funcionais superiores para usos terapêuticos, como descrito em outra parte aqui. A taxa de sucesso aumentada para anticorpos de receptores de quimiocinas altamente específicos foi particularmente surpreendente, porque os anticorpos de pesquisa que são projetados para a detecção independente de sequência de tirosina sulfatada como uma modificação pós-tradução são raros.[00268] The inventors developed an unusual approach to antibody generation, and surprisingly found that synthetically sulfated polypeptides according to the first aspect could be used to increase both the success rates for generating antibodies to chemokine receptors per se, and also the success rates for chemokine receptor antibodies with superior functional properties for therapeutic uses, as described elsewhere herein. The increased success rate for highly specific chemokine receptor antibodies was particularly surprising because research antibodies that are designed for independent detection of sulfated tyrosine sequence as a post-translational modification are rare.
[00269] Os receptores de sete transmembranas podem ser de qualquer espécie que expressa receptores de quimiocinas caracterizados por um TRD, por exemplo, humano, macaco, macaca fascicularis (macaco cinomolgo), macaca mulata (macaco rhesus), roedor, camundongo, rato, cavalo, bovino, porco, cachorro, gato e camelo.[00269] Seven transmembrane receptors can be from any species that expresses chemokine receptors characterized by a TRD, for example, human, monkey, macaca fascicularis (cynomolgus monkey), macaca mulatta (rhesus monkey), rodent, mouse, rat, horse, bovine, pig, dog, cat and camel.
[00270] De acordo com algumas primeiras modalidades do primeiro aspecto, é fornecido um polipeptídeo isolado, em que o poli- peptídeo isolado compreende o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de sete transmembranas, caracterizado ainda por pelo menos 25%, pelo menos 50%, ou pelo menos 75% dos resíduos de tirosina do TRD são sulfatados.[00270] According to some early embodiments of the first aspect, an isolated polypeptide is provided, wherein the isolated polypeptide comprises the tyrosine-rich domain (TRD) of a seven-transmembrane receptor, further characterized in that at least 25%, at least 50%, or at least 75% of the tyrosine residues of the TRD are sulfated.
[00271] Por exemplo, em uma campanha de anticorpos altamente bem-sucedida, o TRD de CCR8 humano ou cinomolgo foi sulfatado nas posições Y3, Y15 e Y17, enquanto Y16 foi omitido, isto é, 75% das tirosinas no TRD foram sulfatadas (Tabela 6.1). Em outro Exemplo, o TRD de CCR4 humano foi sulfatado nas posições 19 e 22 e foi usado para ligação fora do alvo, isto é, 50% das tirosinas foram sulfatadas (Tabela 8.1). Ainda em outra abordagem, o TRD de CCR4 murino foi sulfatado na posição 22 e usado para ligação fora do alvo, isto é, 25% das tirosinas no TRD foram sulfatadas (Tabela 6.1).[00271] For example, in a highly successful antibody campaign, the TRD of human or cynomolgus CCR8 was sulfated at positions Y3, Y15, and Y17, while Y16 was omitted, i.e., 75% of the tyrosines in the TRD were sulfated (Table 6.1). In another example, the TRD of human CCR4 was sulfated at positions 19 and 22 and was used for off-target binding, i.e., 50% of the tyrosines were sulfated (Table 8.1). In yet another approach, the TRD of murine CCR4 was sulfated at position 22 and used for off-target binding, i.e., 25% of the tyrosines in the TRD were sulfated (Table 6.1).
[00272] A Tabela 4.1 mostra uma lista de peptídeos sulfatados incluindo as posições preferidas para sulfações de tirosina. Sem estarem limitados pela teoria, os inventores acreditam que a introdução de cargas adicionais na forma de sulfações de tirosina adapta o anticorpo para reconhecer um padrão específico de cargas negativas. Este reconhecimento parece requerer uma maior porcentagem de tirosinas e aminoácidos carregados positivamente, pelo menos no HCDR3 do anticorpo, isto é, o uso dos polipeptídeos sulfatados isolados de acordo com a presente invenção também influenciou na composição estrutural dos anticorpos e em particular a composição de aminoácidos do HCDR3, conforme o Exemplo 9.[00272] Table 4.1 shows a list of sulfated peptides including preferred positions for tyrosine sulfations. Without being limited by theory, the inventors believe that the introduction of additional charges in the form of tyrosine sulfations adapts the antibody to recognize a specific pattern of negative charges. This recognition appears to require a higher percentage of tyrosines and positively charged amino acids, at least in the antibody's HCDR3, i.e., the use of the isolated sulfated polypeptides according to the present invention also influenced the structural composition of the antibodies and in particular the amino acid composition of HCDR3, as per Example 9.
[00273] De acordo com algumas segundas modalidades do primeiro aspecto, que podem ser ou não iguais às primeiras modalidades de acordo com o primeiro aspecto, é fornecido um polipeptídeo isolado, em que o receptor de sete transmembranas é humano, cino- molgo ou de camundongo.[00273] According to some second embodiments of the first aspect, which may or may not be the same as the first embodiments according to the first aspect, an isolated polypeptide is provided, in which the seven-transmembrane receptor is human, cynomolgus or mouse.
[00274] Em algumas dessas segundas modalidades, o receptor de sete transmembranas é murino. Em algumas dessas segundas modalidades preferidas, o receptor de sete transmembranas é humano e/ou cinomolgo. Em algumas dessas segundas modalidades preferidas, o receptor de sete transmembranas é humano. Em algumas dessas segundas modalidades, o receptor de sete transmembranas é cinomolgo.[00274] In some of these second embodiments, the seven-transmembrane receptor is murine. In some of these preferred second embodiments, the seven-transmembrane receptor is human and/or cynomolgus. In some of these preferred second embodiments, the seven-transmembrane receptor is human. In some of these second embodiments, the seven-transmembrane receptor is cynomolgus.
[00275] De acordo com algumas terceiras modalidades do primeiro aspecto, que pode ser ou não igual à primeira e/ou segunda modalidades de acordo com o primeiro aspecto, é fornecido um poli- peptídeo isolado, em que o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina, preferivelmentea) um receptor de quimiocina CC, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 ou CCR10,b) um receptor de quimiocina CXC, como CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 ou CXCR6, ouc) CX3CR1 ou CXCR1.[00275] According to some third embodiments of the first aspect, which may or may not be the same as the first and/or second embodiments according to the first aspect, an isolated polypeptide is provided, wherein the seven-transmembrane receptor is a chemokine receptor, preferably a) a CC chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 or CCR10, b) a CXC chemokine receptor, such as CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 or CXCR6, or c) CX3CR1 or CXCR1.
[00276] Em algumas dessas terceiras modalidades, o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina CC ou um receptor de quimiocina CXC. Em algumas dessas terceiras modalidades, o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina CC, como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 ou CCR10. Em algumas dessas terceiras modalidades preferidas, o receptor de sete transmembranas é CCR8 ou CCR4. Em algumas dessas terceiras modalidades altamente preferidas, o receptor de sete transmembranas é CCR8. Em algumas dessas terceiras modalidades, o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina CXC, como CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 ou CXCR6. Em algumas dessas terceiras modalidades, o receptor de sete transmem- branas é CX3CR1 ou CXCR1.[00276] In some of these third embodiments, the seven-transmembrane receptor is a CC chemokine receptor or a CXC chemokine receptor. In some of these third embodiments, the seven-transmembrane receptor is a CC chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, or CCR10. In some of these preferred third embodiments, the seven-transmembrane receptor is CCR8 or CCR4. In some of these highly preferred third embodiments, the seven-transmembrane receptor is CCR8. In some of these third embodiments, the seven-transmembrane receptor is a CXC chemokine receptor, such as CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, or CXCR6. In some of these third embodiments, the seven-transmembrane receptor is CX3CR1 or CXCR1.
[00277] Em algumas modalidades preferidas do primeiro aspecto, é fornecido um polipeptídeo isolado que compreende o TRD de um receptor de sete transmembranas humano ou cinomolgo, caracterizado também pelo fato de que pelo menos 25%, pelo menos 50% ou pelo menos 75% da tirosina os resíduos do TRD são sulfatados, em que o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina CC ou um receptor de quimiocina CXC e, preferivelmente, em que o receptor de sete transmembranas é CCR8 ou CCR4.[00277] In some preferred embodiments of the first aspect, an isolated polypeptide is provided comprising the TRD of a human or cynomolgus seven-transmembrane receptor, further characterized in that at least 25%, at least 50% or at least 75% of the tyrosine residues of the TRD are sulfated, wherein the seven-transmembrane receptor is a CC chemokine receptor or a CXC chemokine receptor and, preferably, wherein the seven-transmembrane receptor is CCR8 or CCR4.
[00278] De acordo com algumas modalidades A das terceiras modalidades do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo com ou tendo pelo menos 90%, 95% ou 98% de identidade de sequência com:a) SEQ ID NO:1 (CCR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:7 (CCR2_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:13 (CCR3_humano_TRD), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, oud) SEQ ID NO:19 (CCR4_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:25 (CCR5_humano_TRD), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:31 (CCR6_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados, oug) SEQ ID NO:37 (CCR7_humano_TRD), preferivelmente em que um ou ambos Y8 e Y17 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), em que pelo menos Y28 e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:67 (CCR10_humano_TRD), preferivelmenteem que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:73 (CXCR1_humano_TRD), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado, oul) SEQ ID NO:79 (CXCR2_humano_TRD), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:85 (CXCR3_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:91 (CXCR4_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado.[00278] According to some embodiments of the third embodiment of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence conforming to or having at least 90%, 95% or 98% sequence identity with: a) SEQ ID NO:1 (CCR1_human_TRD), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:7 (CCR2_human_TRD), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c) SEQ ID NO:13 (CCR3_human_TRD), preferably in which Y16 and/or Y17 have been sulfated, or d) SEQ ID NO:19 (CCR4_human_TRD), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:25 (CCR5_human_TRD), preferably in which two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, or f) SEQ ID NO:31 (CCR6_human_TRD), preferably in which at least two or three of Y18, Y26, and Y27 were sulfated, or g) SEQ ID NO:37 (CCR7_human_TRD), preferably in which one or both Y8 and Y17 were sulfated, or h) SEQ ID NO:43 (CCR8_human_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15, and Y17 were sulfated, or i) SEQ ID NO:61 (CCR9_human_TRD), in which at least Y28 and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, or j) SEQ ID NO:67 (CCR10_human_TRD), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 were sulfated, ouk) SEQ ID NO:73 (CXCR1_humano_TRD), preferably where Y27 was sulfated, oul) SEQ ID NO:79 (CXCR2_humano_TRD), preferably where Y23 and/or Y25 were sulfated, oum) SEQ ID NO:85 (CXCR3_humano_TRD), preferably where at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, oun) SEQ ID NO:91 (CXCR4_humano_TRD), preferably where at least Y12 and/or Y21 were sulfated, ouo) SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), preferably where at least one of Y3 and Y27 were sulfated, ouup) SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD), preferably where at least One or both of Y6 and Y10 were sulfated, or) SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD), preferably wherein at least Y14 was sulfated, or) SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD), preferably wherein at least Y27 was sulfated.
[00279] De acordo com algumas modalidades B das terceiras modalidades do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo com ou tendo pelo menos 90%, 95% ou 98% de identidade de sequência coma) SEQ ID NO:3 (CCR1_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:9 (CCR2_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:15 (CCR3_camundongo_TRD), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oud) SEQ ID NO:21 (CCR4_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:27 (CCR5_camundongo_TRD), preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:33 (CCR6_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados,g) SEQ ID NO:39 (CCR7_camundongo_TRD), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:63 (CCR9_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ouj) SEQ ID NO:69 (CCR10_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:75 (CXCR1_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, ou l) SEQ ID NO:81 (CXCR2_camundongo_TRD), preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, oum) SEQ ID NO:87 (CXCR3_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:93 (CXCR4_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y23, Y13 e/ou Y14 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:99 (CXCR5_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:105 (CXCR6_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_camundongo_TRD), preferi-velmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:165 (CXCR1_camundongo_TRD), preferi-velmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00279] According to some embodiments B of the third embodiments of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence according to or having at least 90%, 95% or 98% sequence identity with a) SEQ ID NO:3 (CCR1_mouse_TRD), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:9 (CCR2_mouse_TRD), preferably in which at least Y37 and/or Y39 have been sulfated, or c) SEQ ID NO:15 (CCR3_mouse_TRD), preferably in which Y20 and/or Y22 have been sulfated, or d) SEQ ID NO:21 (CCR4_mouse_TRD), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:27 (CCR5_camundongo_TRD), preferably in which two or three of Y10, Y12 and Y16 were sulfated, or f) SEQ ID NO:33 (CCR6_camundongo_TRD), preferably in which at least two or three of Y13, Y18 and Y19 were sulfated, g) SEQ ID NO:39 (CCR7_camundongo_TRD), preferably in which one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 were sulfated, or h) SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 were sulfated, or i) SEQ ID NO:63 (CCR9_camundongo_TRD), preferably in which at least Y28 was sulfated, and preferably also Y19 was sulfated, or j) SEQ ID NO:69 (CCR10_mouse_TRD), preferably in which at least one, two, or all of Y14, Y17, and Y22 were sulfated, or k) SEQ ID NO:75 (CXCR1_mouse_TRD), preferably in which at least Y6 was sulfated, or l) SEQ ID NO:81 (CXCR2_mouse_TRD), preferably in which Y24 was sulfated, or m) SEQ ID NO:87 (CXCR3_mouse_TRD), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, or n) SEQ ID NO:93 (CXCR4_mouse_TRD), preferably in which at least Y23, Y13, and/or Y14 were sulfated, or o) SEQ ID NO:99 (CXCR5_mouse_TRD), preferably in which at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 were sulfated, or) SEQ ID NO:105 (CXCR6_camundongo_TRD), preferably where at least one or both of Y11 and Y15 were sulfated, or) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_camundongo_TRD), preferably where at least Y15 was sulfated, or) SEQ ID NO:165 (CXCR1_camundongo_TRD), preferably where at least Y6 was sulfated.
[00280] De acordo com algumas modalidades C das terceirasmodalidades do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo com ou tendo pelo menos 90%, 95% ou 98% de identidade de sequência com e) SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD), preferivelmenteem que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, oug) SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, oul) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:92 (CXCR4_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:98 (CXCR5_MACFA_TRD), preferivelmenteem que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado, oup) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferivel- mente em que pelo menos Y20 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado.[00280] According to some embodiments of the third embodiments of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence conforming to or having at least 90%, 95% or 98% sequence identity with e) SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD), preferably in which two, three or all of Y3, Y10, Y14 and Y15 have been sulfated, or f) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD), preferably in which at least two or three of Y23, Y31 and Y32 have been sulfated, or g) SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD), preferably in which one or both Y8 and Y17 have been sulfated, or h) SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated. sulfated, or i) SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, or j) SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 were sulfated, or k) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD), preferably in which at least one of Y14 and Y28 was sulfated, or l) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD), preferably in which Y20 and/or Y22 were sulfated, or m) SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, or n) SEQ ID NO:92 (CXCR4_MACFA_TRD), preferably in which at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, or) SEQ ID NO:98 (CXCR5_MACFA_TRD), preferably in which at least one of Y3 and Y27 has been sulfated, or) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 have been sulfated, or) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferably in which at least Y20 has been sulfated, or) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferably in which at least Y14 has been sulfated.
[00281] Em algumas quartas modalidades do primeiro aspecto, que podem ser ou não iguais à primeira, segunda e/ou terceira modalidades de acordo com o primeiro aspecto, o polipeptídeo isolado compreende o N-terminal dos receptores de sete transmembranas incluindo domínio de TRD e LID, preferivelmente em que pelo menos a ciste- ína entre o domínio de TRD e LID foi removida ou foi alterada em um aminoácido diferente.[00281] In some fourth embodiments of the first aspect, which may or may not be the same as the first, second and/or third embodiments according to the first aspect, the isolated polypeptide comprises the N-terminal of seven transmembrane receptors including TRD and LID domains, preferably wherein at least the cysteine between the TRD and LID domains has been removed or has been altered to a different amino acid.
[00282] Os domínios extracelulares dos receptores de quimiocinas podem ser estruturados em quatro regiões:(1) um domínio N-terminal que pode ser subdividido em(a) o domínio rico em tirosina distal à membrana (TRD),(b) uma cisteína, e(c) um domínio LID,(iii) um domínio extracelular 1 (ECL1),(iii) um domínio extracelular 2 (ECL2), e(iv) um domínio extracelular 3 (ECL3).[00282] The extracellular domains of chemokine receptors can be structured into four regions:(1) an N-terminal domain that can be subdivided into(a) the membrane-distal tyrosine-rich domain (TRD),(b) a cysteine, and(c) a LID domain,(iii) an extracellular domain 1 (ECL1),(iii) an extracellular domain 2 (ECL2), and(iv) an extracellular domain 3 (ECL3).
[00283] Os polipeptídeos de acordo com a presente invenção são difíceis de manusear, por exemplo, devido a uma elevada tendência para a agregação. Sem estares limitados pela teoria, os inventores acreditam que a alta "aderência" resulta do aumento do número de aminoácidos carregados e resíduos de sulfato carregados. Para os polipeptídeos compreendendo o N-terminal de um receptor de quimio- cina, as propriedades de agregação podem ser melhoradas por remoção ou troca de aminoácidos da cisteína entre o domínio TRD e LID. Resultados ideal foram obtidos alterando a cisteína em uma serina (Exemplo 5, Tabela 4.1).[00283] The polypeptides according to the present invention are difficult to handle, for example, due to a high tendency for aggregation. Without being limited by theory, the inventors believe that the high "adhesion" results from the increased number of charged amino acids and charged sulfate residues. For polypeptides comprising the N-terminal of a chemokine receptor, the aggregation properties can be improved by removing or exchanging cysteine amino acids between the TRD and LID domains. Ideal results were obtained by changing the cysteine to a serine (Example 5, Table 4.1).
[00284] Em algumas das quartas modalidades de acordo com o primeiro aspecto, a cisteína pode ser omitida e TRD e LID estão diretamente conectados. Em algumas das quartas modalidades diferentes de acordo com o primeiro aspecto, a cisteína pode ser substituída por um aminoácido polar não carregado diferente. Em algumas das quartas modalidades preferidas de acordo com o primeiro aspecto, a ciste- ína é substituída por uma serina (conforme a Tabela 4.1). Em algumas das quartas modalidades de acordo com o primeiro aspecto, a cisteína pode ser substituída por pelo menos um aminoácido diferente.[00284] In some of the fourth embodiments according to the first aspect, cysteine may be omitted and TRD and LID are directly connected. In some of the different fourth embodiments according to the first aspect, cysteine may be replaced by a different uncharged polar amino acid. In some of the preferred fourth embodiments according to the first aspect, cysteine is replaced by a serine (as per Table 4.1). In some of the fourth embodiments according to the first aspect, cysteine may be replaced by at least one different amino acid.
[00285] De acordo com algumas modalidades A das quartas modalidades do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo com ou com pelo menos 90%, 95% ou 98% de identidade de sequência coma) SEQ ID NO:4 (CCR1_humano_N term), em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados,b) SEQ ID NO:10 (CCR2_humano_N term), em que pelo menos Y26 foi sulfatado,c) SEQ ID NO:16 (CCR3_humano_N term), em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados,d) SEQ ID NO:22 (CCR4_humano_N term), em que pelo menos Y22 foi sulfatado e, preferivelmente, além disso Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados,e) SEQ ID NO:28 (CCR5_humano_N term), em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados,f) SEQ ID NO:34 (CCR6_humano_N term), em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados,g) SEQ ID NO:40 (CCR7_humano_N term), em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados,h) SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term), em que pelomenos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados,i) SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados,j) SEQ ID NO:70 (CCR10_humano_N term), em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados,k) SEQ ID NO:76 (CXCR1_humano_N term), em que Y27 foi sulfatado,l) SEQ ID NO:82 (CXCR2_humano_N term), em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados,m) SEQ ID NO:88 (CXCR3_humano_N term), em quepelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados,n) SEQ ID NO:94 (CXCR4_humano_N term), em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados,o) SEQ ID NO:100 (CXCR5_humano_N term), em que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado, oup) SEQ ID NO:106 (CXCR6_humano_N term), em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado.[00285] According to some embodiments of the fourth embodiment of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence with or with at least 90%, 95% or 98% sequence identity with a) SEQ ID NO:4 (CCR1_human_N term), wherein at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, b) SEQ ID NO:10 (CCR2_human_N term), wherein at least Y26 has been sulfated, c) SEQ ID NO:16 (CCR3_human_N term), wherein Y16 and/or Y17 have been sulfated, d) SEQ ID NO:22 (CCR4_human_N term), wherein at least Y22 has been sulfated and, preferably, in addition Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, e) SEQ ID NO:28 (CCR5_human_N term), wherein two, three or all of Y3, Y10, Y14 and Y15 were sulfated,f) SEQ ID NO:34 (CCR6_humano_N term), in which at least two or three of Y18, Y26 and Y27 were sulfated,g) SEQ ID NO:40 (CCR7_humano_N term), in which one or both Y8 and Y17 were sulfated,h) SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term), in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 were sulfated,i) SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated,j) SEQ ID NO:70 (CCR10_humano_N term), in which at least one or both of Y14 and Y22 were sulfated,k) SEQ ID NO:76 (CXCR1_human_N term), in which Y27 was sulfated, l) SEQ ID NO:82 (CXCR2_human_N term), in which Y23 and/or Y25 were sulfated, m) SEQ ID NO:88 (CXCR3_human_N term), in which at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, n) SEQ ID NO:94 (CXCR4_human_N term), in which at least Y12 and/or Y21 were sulfated, o) SEQ ID NO:100 (CXCR5_human_N term), in which at least one of Y3 and Y27 was sulfated, oup) SEQ ID NO:106 (CXCR6_human_N term), in which at least one or both of Y6 and Y10 were sulfated, ouq) SEQ ID NO:160 (CX3CR1_human_N), preferably in that at least Y14 was sulfated, our) SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferably in which at least Y27 was sulfated.
[00286] De acordo com algumas modalidades B da quarta modalidade do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo com ou tendo pelo menos 90%, 95% ou 98% de identidade de sequência coma) SEQ ID NO:6 (CCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:12 (CCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:18 (CCR3_MOUSE _N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oud) SEQ ID NO:24 (CCR4_camundongo_N term), preferi- velmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:30 (CCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:36 (CCR6_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados,g) SEQ ID NO:42 (CCR7_camundongo_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:48 (CCR8_camundongo_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:66 (CCR9_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ouj) SEQ ID NO:72 (CCR10_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:78 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, oul) SEQ ID NO:84 (CXCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, oum) SEQ ID NO:90 (CXCR3_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:96 (CXCR4_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y23 e/ou Y14 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:102 (CXCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:108 (CXCR6_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:162 (CX3CR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:168 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00286] According to some embodiments B of the fourth embodiment of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence according to or having at least 90%, 95% or 98% sequence identity with a) SEQ ID NO:6 (CCR1_mouse_N term), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:12 (CCR2_mouse_N term), preferably in which at least Y37 and/or Y39 have been sulfated, or c) SEQ ID NO:18 (CCR3_MOUSE_N term), preferably in which Y20 and/or Y22 have been sulfated, or d) SEQ ID NO:24 (CCR4_mouse_N term), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:30 (CCR5_mouse_N term), preferably in which two or three of Y10, Y12, and Y16 were sulfated, or f) SEQ ID NO:36 (CCR6_mouse_N term), preferably in which at least two or three of Y13, Y18, and Y19 were sulfated, g) SEQ ID NO:42 (CCR7_mouse_N term), preferably in which one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 were sulfated, or h) SEQ ID NO:48 (CCR8_mouse_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y14, and Y15 were sulfated, or i) SEQ ID NO:66 (CCR9_mouse_N term), preferably in which at least Y28 was sulfated, and preferably also Y19 was sulfated, or j) SEQ ID NO:72 (CCR10_mouse_N term), preferably in which at least one, two, or all of Y14, Y17, and Y22 were sulfated, ouk) SEQ ID NO:78 (CXCR1_mouse_N term), preferably in which at least Y6 was sulfated, oul) SEQ ID NO:84 (CXCR2_mouse_N term), preferably in which Y24 was sulfated, oum) SEQ ID NO:90 (CXCR3_mouse_N term), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, oun) SEQ ID NO:96 (CXCR4_mouse_N term), preferably in which at least Y23 and/or Y14 were sulfated, ouo) SEQ ID NO:102 (CXCR5_mouse_N term), preferably in which at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 were sulfated, or) SEQ ID NO:108 (CXCR6_mouse_N term), preferably wherein at least one or both of Y11 and Y15 were sulfated, or) SEQ ID NO:162 (CX3CR1_mouse_N term), preferably wherein at least Y15 was sulfated, or) SEQ ID NO:168 (CXCR1_mouse_N term), preferably wherein at least Y6 was sulfated.
[00287] De acordo com algumas modalidades C das quartas modalidades do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo com ou tendo pelo menos 90%, 95% ou 98% de identidade de sequência coma) SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que Y16 foi sulfatado, oud) SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA _N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, oug) SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferivelmente em que um ou ambos Y8 e Y17 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, oul) SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado, oup) SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y20 ou Y22 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 ou Y28 foi sulfatado.[00287] According to some embodiments of the fourth embodiment of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence according to or having at least 90%, 95% or 98% sequence identity with a) SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c) SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferably in which Y16 has been sulfated, or d) SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferably in which two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, or f) SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or three of Y23, Y31, and Y32 were sulfated, or g) SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferably in which one or both of Y8 and Y17 were sulfated, or h) SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term), preferably in which at least two or all of Y3, Y15, and Y17 were sulfated, or i) SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, or j) SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 were sulfated, ouk) SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y14 and Y28 was sulfated, oul) SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferably in which Y20 and/or Y22 were sulfated, oum) SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, oun) SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferably in which at least Y12 and/or Y21 were sulfated, ouo) SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y3 and Y27 was sulfated, oup) SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 were sulfated, ouq) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y20 or Y22 was sulfated, our) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferably in which at least Y14 or Y28 was sulfated.
[00288] Em algumas das quartas modalidades do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo coma) SEQ ID NO:4 (CCR1_humano_N term), SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N) ou SEQ ID NO:6 (CCR1_camundongo_N), preferi- velmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:10 (CCR2_humano_N term), ou SEQ ID NO:11 (CCR2_ MACMU_N), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:12 (CCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foi sulfatado, oud) SEQ ID NO:16 (CCR3_humano_N term), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que Y16 foi sulfatado, ouf) SEQ ID NO:18 (CCR3_MOUSE _N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oug) SEQ ID NO:22 (CCR4_humano_N term), SEQ IDNO:23 (CCR4_MACFA_N) ou SEQ ID NO:24(CCR4_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e, preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:28 (CCR5_humano_N term), ou SEQ ID NO:29 (CCR5_ MACMU_N), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:30 (CCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:34 (CCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, oul) SEQ ID NO:36 (CCR6_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:40 (CCR7_humano_N term), ou SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:42 (CCR7_camundongo_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), ou SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:48 (CCR8_camundongo_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), ou SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, our) SEQ ID NO:66 (CCR9_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ous) SEQ ID NO:70 (CCR10_humano_N term), ou SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, out) SEQ ID NO:72 (CCR10_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foram sulfatados, ouu) SEQ ID NO:76 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado, ouv) SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, ou w) SEQ ID NO:78 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, oux) SEQ ID NO:82 (CXCR2_humano_N term), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, ouy) SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N), preferivelmenteem que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, ouz) SEQ ID NO:84 (CXCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, ouaa) SEQ ID NO:88 (CXCR3_humano_N term), SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term) ou SEQ ID NO:90 (CXCR3_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oubb) SEQ ID NO:94 (CXCR4_humano_N term), ou SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, oucc) SEQ ID NO:96 (CXCR4_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y23 e/ou Y14 foram sulfatados, oudd) SEQ ID NO:100 (CXCR5_humano_N term), ou SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados, ouee) SEQ ID NO:102 (CXCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, ouff) SEQ ID NO:106 (CXCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados, ougg) SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouhh) SEQ ID NO:108 (CXCR6_camundongo_N term), pre- ferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ouii) SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado, oujj) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y20 ou Y22 foi sulfatado, oukk) SEQ ID NO:162 (CX3CR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, ou11) SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado, oumm) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 ou Y28 foi sulfatado, ounn) SEQ ID NO:168 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00288] In some of the fourth embodiments of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence according to a) SEQ ID NO:4 (CCR1_human_N term), SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N) or SEQ ID NO:6 (CCR1_mouse_N), preferably wherein at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:10 (CCR2_human_N term), or SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N), preferably wherein at least Y26 has been sulfated, or c) SEQ ID NO:12 (CCR2_mouse_N term), preferably wherein at least Y37 and/or Y39 have been sulfated, or d) SEQ ID NO:16 (CCR3_human_N term), preferably wherein Y16 and/or Y17 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferably where Y16 has been sulfated, or f) SEQ ID NO:18 (CCR3_MOUSE_N term), preferably where Y20 and/or Y22 have been sulfated, or g) SEQ ID NO:22 (CCR4_human_N term), SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N) or SEQ ID NO:24 (CCR4_mouse_N), preferably where at least Y22 has been sulfated and, preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or h) SEQ ID NO:28 (CCR5_human_N term), or SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N), preferably where two, three or all of Y3, Y10, Y14 and Y15 have been sulfated, or i) SEQ ID NO:30 (CCR5_mouse_N term), preferably in which two or three of Y10, Y12 and Y16 were sulfated, or j) SEQ ID NO:34 (CCR6_human_N term), preferably in which at least two or three of Y18, Y26 and Y27 were sulfated, or k) SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or three of Y23, Y31 and Y32 were sulfated, or l) SEQ ID NO:36 (CCR6_mouse_N term), preferably in which at least two or three of Y13, Y18 and Y19 were sulfated, or m) SEQ ID NO:40 (CCR7_human_N term), or SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N), preferably in which one or both Y8 and Y17 were sulfated, or n) SEQ ID NO:42 (CCR7_mouse_N term), preferably in which one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 were sulfated, or) SEQ ID NO:46 (CCR8_human_N term with C = X or S), or SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 were sulfated, or) SEQ ID NO:48 (CCR8_mouse_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 were sulfated, or) SEQ ID NO:64 (CCR9_human_N term), or SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, or) SEQ ID NO:66 (CCR9_mouse_N term), preferably in which at least Y28 has been sulfated, and preferably also Y19 has been sulfated, ous) SEQ ID NO:70 (CCR10_human_N term), or SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated, ou) SEQ ID NO:72 (CCR10_mouse_N term), preferably in which at least one, two or all of Y14, Y17 and Y22 have been sulfated, ouu) SEQ ID NO:76 (CXCR1_human_N term), preferably in which Y27 has been sulfated, ouv) SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y14 and Y28 has been sulfated, ou w) SEQ ID NO:78 (CXCR1_mouse_N term), preferably in which at least Y6 has been sulfated, or x) SEQ ID NO:82 (CXCR2_human_N term), preferably in which Y23 and/or Y25 have been sulfated, or y) SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N), preferably in which Y20 and/or Y22 have been sulfated, or z) SEQ ID NO:84 (CXCR2_mouse_N term), preferably in which Y24 has been sulfated, or aa) SEQ ID NO:88 (CXCR3_human_N term), SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term) or SEQ ID NO:90 (CXCR3_mouse_N), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, or bb) SEQ ID NO:94 (CXCR4_human_N term), or SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferably in which at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, oucc) SEQ ID NO:96 (CXCR4_mouse_N term), preferably in which at least Y23 and/or Y14 have been sulfated, oudd) SEQ ID NO:100 (CXCR5_human_N term), or SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y3 and Y27 have been sulfated, ouee) SEQ ID NO:102 (CXCR5_mouse_N term), preferably in which at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 have been sulfated, ouuff) SEQ ID NO:106 (CXCR6_human_N term), preferably in which at least one or both of Y6 and Y10 were sulfated, ougg) SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 were sulfated, ouhh) SEQ ID NO:108 (CXCR6_mouse_N term), preferably in which at least one or both of Y11 and Y15 were sulfated, ouii) SEQ ID NO:160 (CX3CR1_human_N term), preferably in which at least Y14 was sulfated, oujj) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y20 or Y22 was sulfated, oukk) SEQ ID NO:162 (CX3CR1_mouse_N term), preferably in which at least Y15 was sulfated, ou11) SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferably in which at least Y27 has been sulfated, oumm) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferably in which at least Y14 or Y28 has been sulfated, ounn) SEQ ID NO:168 (CXCR1_camundongo_N term), preferably in which at least Y6 has been sulfated.
[00289] Em algumas da primeira, segunda, terceira ou quarta modalidades do primeiro aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado compreende uma sequência de acordo com ou tendo pelo menos 90% de identidade de sequência coma) SEQ ID NO:1 (CCR1_humano_TRD), SEQ ID NO:4 (CCR1_humano_N term), SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), SEQ ID NO:3 (CCR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO :6(CCR1_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:7 (CCR2_humano_TRD), SEQ ID NO:10 (CCR2_humano_N term), SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD) ou SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:9 (CCR2_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:12 (CCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foram sulfatados, oud) SEQ ID NO:13 (CCR3_humano_TRD) ou SEQ ID NO:16 (CCR3_humano_N term), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que Y16 foi sulfatado, ouf) SEQ ID NO:15 (CCR3_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:18 (CCR3_camundongo_N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oug) SEQ ID NO:19 (CCR4_humano_TRD), SEQ ID NO:22 (CCR4_humano_N term), SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), SEQ ID NO:21 (CCR4_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO :24(CCR4_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:25 (CCR5_humano_TRD), SEQ ID NO:28 (CCR5_humano_N term), SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD) ou SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:27 (CCR5_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:30 (CCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:31 (CCR6_humano_TRD) ou SEQ ID NO:34 (CCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, ou l) SEQ ID NO:33 (CCR6_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:36 (CCR6_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:37 (CCR7_humano_TRD), SEQ ID NO:40 (CCR7_humano_N term), SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:39 (CCR7_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:42 (CCR7_camundongo_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), ou SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:48 (CCR8_camundongo_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ ou Y37 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:63 (CCR9_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:66 (CCR9_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ous) SEQ ID NO:67 (CCR10_humano_TRD), SEQ ID NO:70 (CCR10_humano_N term), SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, out) SEQ ID NO:69 (CCR10_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:72 (CCR10_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foram sulfatados, ouu) SEQ ID NO:73 (CXCR1_humano_TRD) ou SEQ ID NO:76 (CXCR1_humano_N), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado, ouv) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA _TRD) ou SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, ouw) SEQ ID NO:75 (CXCR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:78 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, oux) SEQ ID NO:79 (CXCR2_humano_TRD) ou SEQ ID NO:82 (CXCR2_humano_N term), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, ouy) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA _TRD) ou SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, ouz) SEQ ID NO:81 (CXCR2_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:84 (CXCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, ouaa) SEQ ID NO:85 (CXCR3_humano_TRD), SEQ ID NO:88 (CXCR3_humano_N term), SEQ ID NO:86(CXCR3_MACFA_TRD), SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), SEQ ID NO:87 (CXCR3_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO :90 (CXCR3_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, ou bb) SEQ ID NO:91 (CXCR4_humano_TRD), SEQ ID NO:94 (CXCR4_humano_N term), SEQ ID NO:92(CXCR4_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, oucc) SEQ ID NO:93 (CXCR4_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:96 (CXCR4_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y23 e/ou Y14 foram sulfatados, oudd) SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), SEQ ID NO:100 (CXCR5_humano_N term), SEQ ID NO:98(CXCR5_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados, ouee) SEQ ID NO:99 (CXCR5_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:102 (CXCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, ouff) SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD) ou SEQ ID NO:106 (CXCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados, ougg) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA _TRD) ou SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouhh) SEQ ID NO:105 (CXCR6_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:108 (CXCR6_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ouii) SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD) ou SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado, oujj) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y20 foi sulfatado, ou kk) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y20 ou Y22 foi sulfatado, oull) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:162 (CX3CR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, oumm) SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD) ou SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado, ounn) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado ouoo) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 ou Y28 foi sulfatado, oupp) SEQ ID NO:165 (CXCR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:168 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00289] In some of the first, second, third or fourth embodiments of the first aspect, the isolated sulfated polypeptide comprises a sequence conforming to or having at least 90% sequence identity with a) SEQ ID NO:1 (CCR1_human_TRD), SEQ ID NO:4 (CCR1_human_N term), SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), SEQ ID NO:3 (CCR1_mouse_TRD) or SEQ ID NO:6 (CCR1_mouse_N), preferably wherein at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:7 (CCR2_human_TRD), SEQ ID NO:10 (CCR2_human_N term), SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD) or SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c) SEQ ID NO:9 (CCR2_mouse_TRD) or SEQ ID NO:12 (CCR2_mouse_N term), preferably in which at least Y37 and/or Y39 have been sulfated, or d) SEQ ID NO:13 (CCR3_human_TRD) or SEQ ID NO:16 (CCR3_human_N term), preferably in which Y16 and/or Y17 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferably in which Y16 has been sulfated, or f) SEQ ID NO:15 (CCR3_mouse_TRD) or SEQ ID NO:18 (CCR3_mouse_N term), preferably in which Y20 and/or Y22 were sulfated, or g) SEQ ID NO:19 (CCR4_human_TRD), SEQ ID NO:22 (CCR4_human_N term), SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), SEQ ID NO:21 (CCR4_mouse_TRD) or SEQ ID NO:24 (CCR4_mouse_N term), preferably wherein at least Y22 was sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 were sulfated, or h) SEQ ID NO:25 (CCR5_human_TRD), SEQ ID NO:28 (CCR5_human_N term), SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD) or SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferably in which two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, or i) SEQ ID NO:27 (CCR5_mouse_TRD) or SEQ ID NO:30 (CCR5_mouse_N term), preferably in which two or three of Y10, Y12, and Y16 were sulfated, or j) SEQ ID NO:31 (CCR6_human_TRD) or SEQ ID NO:34 (CCR6_human_N term), preferably in which at least two or three of Y18, Y26, and Y27 were sulfated, or k) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or three of Y23, Y31, and Y32 were sulfated, or l) SEQ ID NO:33 (CCR6_mouse_TRD) or SEQ ID NO:36 (CCR6_mouse_N term), preferably in which at least two or three of Y13, Y18 and Y19 were sulfated, or) SEQ ID NO:37 (CCR7_human_TRD), SEQ ID NO:40 (CCR7_human_N term), SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferably in which one or both Y8 and Y17 were sulfated, or) SEQ ID NO:39 (CCR7_mouse_TRD) or SEQ ID NO:42 (CCR7_mouse_N term), preferably in which one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 were sulfated, or) SEQ ID NO:43 (CCR8_human_TRD), SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term with C = X or S), or SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, or SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD) or SEQ ID NO:48 (CCR8_camundongo_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated, or SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 has been sulfated, our) SEQ ID NO:63 (CCR9_mouse_TRD) or SEQ ID NO:66 (CCR9_mouse_N term), preferably in which at least Y28 has been sulfated, and preferably also Y19 has been sulfated, ous) SEQ ID NO:67 (CCR10_human_TRD), SEQ ID NO:70 (CCR10_human_N term), SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated, out) SEQ ID NO:69 (CCR10_mouse_TRD) or SEQ ID NO:72 (CCR10_mouse_N term), preferably in which at least one, two, or all of Y14, Y17, and Y22 have been sulfated, oru) SEQ ID NO:73 (CXCR1_human_TRD) or SEQ ID NO:76 (CXCR1_human_N), preferably in which Y27 has been sulfated, orv) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y14 and Y28 has been sulfated, orw) SEQ ID NO:75 (CXCR1_mouse_TRD) or SEQ ID NO:78 (CXCR1_mouse_N term), preferably in which at least Y6 has been sulfated, orx) SEQ ID NO:79 (CXCR2_human_TRD) or SEQ ID NO:82 (CXCR2_human_N term), preferably where Y23 and/or Y25 have been sulfated, or y) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferably where Y20 and/or Y22 have been sulfated, or z) SEQ ID NO:81 (CXCR2_mouse_TRD) or SEQ ID NO:84 (CXCR2_mouse_N term), preferably where Y24 has been sulfated, or aa) SEQ ID NO:85 (CXCR3_human_TRD), SEQ ID NO:88 (CXCR3_human_N term), SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), SEQ ID NO:87 (CXCR3_mouse_TRD) or SEQ ID NO :90 (CXCR3_mouse_N), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, or bb) SEQ ID NO:91 (CXCR4_human_TRD), SEQ ID NO:94 (CXCR4_human_N term), SEQ ID NO:92(CXCR4_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferably in which at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, oucc) SEQ ID NO:93 (CXCR4_mouse_TRD) or SEQ ID NO:96 (CXCR4_mouse_N term), preferably in which at least Y23 and/or Y14 have been sulfated, oudd) SEQ ID NO:97 (CXCR5_human_TRD), SEQ ID NO:100 (CXCR5_human_N term), SEQ ID NO:98(CXCR5_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y3 and Y27 were sulfated, ouee) SEQ ID NO:99 (CXCR5_mouse_TRD) or SEQ ID NO:102 (CXCR5_mouse_N term), preferably in which at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 were sulfated, ouff) SEQ ID NO:103 (CXCR6_human_TRD) or SEQ ID NO:106 (CXCR6_human_N term), preferably in which at least one or both of Y6 and Y10 were sulfated, ougg) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or all of Y4, Y7, and Y39 have been sulfated, or) SEQ ID NO:105 (CXCR6_mouse_TRD) or SEQ ID NO:108 (CXCR6_mouse_N term), preferably in which at least one or both of Y11 and Y15 have been sulfated, or) SEQ ID NO:157 (CX3CR1_human_TRD) or SEQ ID NO:160 (CX3CR1_human_N term), preferably in which at least Y14 has been sulfated, or) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferably in which at least Y20 has been sulfated, or) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y20 or Y22 was sulfated, oull) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_mouse_TRD) or SEQ ID NO:162 (CX3CR1_mouse_N term), preferably wherein at least Y15 was sulfated, oumm) SEQ ID NO:163 (CXCR1_human_TRD) or SEQ ID NO:166 (CXCR1_human_N term), preferably wherein at least Y27 was sulfated, ounn) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferably wherein at least Y14 was sulfated, ouoo) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferably wherein at least Y14 or Y28 was sulfated, oupp) SEQ ID NO:165 (CXCR1_mouse_TRD) or SEQ ID NO:168 (CXCR1_mouse_N term), preferably in which at least Y6 has been sulfated.
[00290] Preferivelmente, o polipeptídeo isolado de acordo com o aspecto atual é imobilizado, por exemplo, através de um ligante. A imobilização pode ocorrer sem limitação em grânulos, partículas, proteínas ou suportes sólidos adequados.[00290] Preferably, the isolated polypeptide according to the current aspect is immobilized, for example, by means of a ligand. Immobilization can occur without limitation on granules, particles, proteins or suitable solid supports.
[00291] De acordo com um segundo aspecto da presente invenção, é fornecido um conjugado compreendendo um polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto.[00291] According to a second aspect of the present invention, a conjugate comprising an isolated sulfated polypeptide according to the first aspect is provided.
[00292] Por exemplo, o conjugado pode compreender um polipeptí- deo de acordo com as primeiras modalidades do primeiro aspecto. Por exemplo, o conjugado pode compreender um polipeptídeo de acordo com as segundas modalidades do primeiro aspecto. Por exemplo, o conjugado pode compreender um polipeptídeo de acordo com as terceiras modalidades do primeiro aspecto. Por exemplo, o conjugado pode compreender um polipeptídeo de acordo com algumas modalidades A, B, C das terceiras modalidades do primeiro aspecto. Por exemplo, o conjugado pode compreender um polipeptídeo de acordo com a quarta modalidade do primeiro aspecto. Por exemplo, o conjugado pode compreender um polipeptídeo de acordo com algumas modalidades A, B, C das quartas modalidades do primeiro aspecto.[00292] For example, the conjugate may comprise a polypeptide according to the first embodiments of the first aspect. For example, the conjugate may comprise a polypeptide according to the second embodiments of the first aspect. For example, the conjugate may comprise a polypeptide according to the third embodiments of the first aspect. For example, the conjugate may comprise a polypeptide according to some embodiments A, B, C of the third embodiments of the first aspect. For example, the conjugate may comprise a polypeptide according to the fourth embodiment of the first aspect. For example, the conjugate may comprise a polypeptide according to some embodiments A, B, C of the fourth embodiments of the first aspect.
[00293] Por exemplo, o polipeptídeo sulfatado isolado pode ser ligado a um marcador ou ligante para imobilização ou recuperação. Os rótulos adequados são selecionados a partir dos rótulos conhecidos na técnica, por exemplo, pequenas moléculas orgânicas como biotina (que se liga forte e não covalentemente à estreptavidina), derivados da mesma ou sequência peptídica curta, tal como rótulo Flag, rótulo HA, rótulo Myc ou rótulo His (conforme a Tabela 4.1 ou Exemplo 10.1.2). Para algumas aplicações, o marcador pode ser uma proteína, tal como albumina de soro humano (conforme a Tabela 4.1 ou Exemplo 10.1.2), ou uma proteína transportadora, tal como KLH, OVA ou BSA, ou uma estrutura maior, tal como uma conta ou conta magnética. Pre-ferivelmente, o marcador pode ser ligado através do C term ou no N term do TRD ou no N-terminal do receptor de quimiocina, mas também pode ser ligado através de um resíduo reativo ou cadeia lateral de aminoácido, tal como uma lisina dentro do TRD. Em algumas modalidades, o rotulo é ligado por meio de um ligante, que pode ser qualquer ligante conhecido na técnica. O ligante adequado inclui o ligante de ácido trioxatridecano-succinâmico (Ttds) (conforme a Tabela 4.1), be- ta-alanina, GABA, AEA, Ava, Ahx, espaçador PEG2, espaçador PEG3, espaçador PEG4, O1Pen, O2Oc ou O1Pen-O1.[00293] For example, the isolated sulfated polypeptide can be linked to a label or ligand for immobilization or retrieval. Suitable labels are selected from labels known in the art, for example, small organic molecules such as biotin (which binds strongly and non-covalently to streptavidin), derivatives thereof, or short peptide sequences such as Flag label, HA label, Myc label, or His label (as per Table 4.1 or Example 10.1.2). For some applications, the label may be a protein, such as human serum albumin (as per Table 4.1 or Example 10.1.2), or a carrier protein, such as KLH, OVA, or BSA, or a larger structure, such as a bead or magnetic bead. Preferably, the label can be linked through the C-term or the N-term of the TRD or the N-terminal of the chemokine receptor, but it can also be linked through a reactive residue or amino acid side chain, such as a lysine within the TRD. In some embodiments, the label is linked via a ligand, which can be any ligand known in the art. Suitable ligands include trioxatridecanesuccinamic acid (Ttds) ligand (as per Table 4.1), beta-alanine, GABA, AEA, Ava, Ahx, PEG2 spacer, PEG3 spacer, PEG4 spacer, O1Pen, O2Oc, or O1Pen-O1.
[00294] Os peptídeos sulfatados podem ser difíceis de sintetizar, por exemplo, porque o sulfato é instável sob condições ácidas (Hou- ben-Weyl, Methods of Organic Chemistry Vol. E 22b, Synthesis of Pep tides and Peptidomimetics, 4a Edição, seção 6.6.1.2 Synthesis of Sulfated Tyrosine Peptides with Tyrosine O-Sulfate Synthons, p.440 segs. em: Felix, Arthur et al.:2004).[00294] Sulfated peptides can be difficult to synthesize, for example, because sulfate is unstable under acidic conditions (Houben-Weyl, Methods of Organic Chemistry Vol. E 22b, Synthesis of Peptides and Peptidomimetics, 4th Edition, section 6.6.1.2 Synthesis of Sulfated Tyrosine Peptides with Tyrosine O-Sulfate Synthons, p.440 et seq. in: Felix, Arthur et al.:2004).
[00295] De acordo com um 3° aspecto, é fornecido um método para produção do polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto, em que o método compreende a síntese do polipeptídeo isolado e a sulfa- tação dos respectivos resíduos de tirosina.[00295] According to a third aspect, a method is provided for producing the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or the conjugate according to the second aspect, wherein the method comprises synthesizing the isolated polypeptide and sulfating the respective tyrosine residues.
[00296] A síntese do polipeptídeo isolado de acordo com o primeiro aspecto e a sulfatação dos respectivos resíduos de tirosina podem ocorrer como descrito no Exemplo 5, ou podem ocorrer de acordo com qualquer outro método conhecido na técnica. No capítulo 6.6.1 "Methods of Organic Chemistry Vol. E 22b, Synthesis of Peptides and Peptidomimetics", Houben-Weyl descreve várias abordagens químicas para a síntese de peptídeos de tirosina sulfatados. O capítulo e, em particular, esses métodos, são incorporados aqui por referência em sua totalidade.[00296] The synthesis of the isolated polypeptide according to the first aspect and the sulfation of the respective tyrosine residues can occur as described in Example 5, or can occur according to any other method known in the art. In chapter 6.6.1 "Methods of Organic Chemistry Vol. E 22b, Synthesis of Peptides and Peptidomimetics", Houben-Weyl describes several chemical approaches for the synthesis of sulfated tyrosine peptides. The chapter, and in particular these methods, are incorporated herein by reference in their entirety.
[00297] Por exemplo, a síntese pode ser realizada usando o método de fase sólida independente de sequência descrito anteriormente por Bunschoten et al. (Bunschoten, Anton, et al. "A general sequence independent solid phase method for the site specific synthesis of multiple sulfated-tyrosine containing peptides." Chemical communications 21 (2009): 2999-3001.), incorporado aqui em sua totalidade. Em resumo, um peptídeo é sintetizado de acordo com a estratégia Fmoc-tBu, seguido de desproteção seletiva dos resíduos de tirosina a serem sulfatados e introdução de um grupo sulfato protegido. Após a conclusão da síntese do peptídeo sulfatado, ele é clivado da resina por acidólise e os grupos de proteção são removidos com exceção do grupo de proteção sulfato, evitando assim a remoção induzida por ácido indesejada do(s) grupo(s) sulfato durante esta etapa. Finalmente, os grupos prote- tores de sulfato podem ser removidos em uma etapa redutora levemente ácida, deixando os grupos sulfato intocados.[00297] For example, the synthesis can be carried out using the sequence-independent solid-phase method previously described by Bunschoten et al. (Bunschoten, Anton, et al. "A general sequence independent solid phase method for the site-specific synthesis of multiple sulfated-tyrosine-containing peptides." Chemical communications 21 (2009): 2999-3001.), incorporated herein in its entirety. In summary, a peptide is synthesized according to the Fmoc-tBu strategy, followed by selective deprotection of the tyrosine residues to be sulfated and introduction of a protected sulfate group. After completion of the synthesis of the sulfated peptide, it is cleaved from the resin by acidolysis and the protecting groups are removed except for the sulfate protecting group, thus avoiding unwanted acid-induced removal of the sulfate group(s) during this step. Finally, the sulfate protecting groups can be removed in a mildly acidic reducing step, leaving the sulfate groups untouched.
[00298] Chen et al. reportaram uma rota de uma etapa curta e eficiente para peptídeos contendo sY, em que a tirosina fluorossulfatada protegida por Fmoc (Y(OSO2F)) é incorporada ao peptídeo de interesse por meio de uma estratégia sintética de fase sólida baseada em Fmoc (conforme Chen, Wentao, et al. "Synthesis of Sulfotyrosine-Containing Peptides by Incorporating Fluorosulfated Tyrosine Using an Fmoc-Based Solid-Phase Strategy." Angewandte Chemie 128.5 (2016): 1867-1870.), incorporado aqui em sua totalidade. A clivagem de peptídeo-resina simultânea padrão e a remoção dos grupos protetores de cadeia lateral lábeis em ácido produzem os peptídeos brutos contendo tirosina fluorossulfatada. O etilenoglicol básico, servindo como solvente e reagente, transforma os peptídeos de tirosina fluorossul- fatados em peptídeos de sulfotirosina com alto rendimento.[00298] Chen et al. reported a short and efficient one-step route for sY-containing peptides, in which Fmoc-protected fluorosulfated tyrosine (Y(OSO2F)) is incorporated into the peptide of interest via an Fmoc-based solid-phase synthetic strategy (as described in Chen, Wentao, et al. "Synthesis of Sulfotyrosine-Containing Peptides by Incorporating Fluorosulfated Tyrosine Using an Fmoc-Based Solid-Phase Strategy." Angewandte Chemie 128.5 (2016): 1867-1870.), incorporated here in its entirety. Standard simultaneous peptide-resin cleavage and removal of acid-labile side-chain protecting groups yield crude fluorosulfated tyrosine-containing peptides. Basic ethylene glycol, serving as both solvent and reagent, transforms fluorosulfated tyrosine peptides into sulfotyrosine peptides in high yield.
[00299] A sulfatação global de polipeptídeos também é possível, por exemplo, usando trióxido de enxofre-piridina. de acordo com a presente invenção, esta via pode ser usada, se todas as tirosinas tiverem que ser sulfatadas ou se misturas "brutas" de polipeptídeos parcialmente sulfatados devem ser usadas para etapas adicionais. Além disso, a sulfatação pode ocorrer enzimaticamente, por exemplo, em uma reação de biotransformação usando as enzimas naturais de sulfa- tação ou suas versões modificadas. Preferivelmente, a sulfatação da respectiva tirosina pode ocorrer química ou enzimaticamente. Preferivelmente, a síntese do polipeptídeo isolado ocorre usando a estratégia Fmoc-tBu.[00299] Global sulfation of polypeptides is also possible, for example, using sulfur trioxide-pyridine. According to the present invention, this route can be used if all tyrosines have to be sulfated or if "crude" mixtures of partially sulfated polypeptides are to be used for further steps. Furthermore, sulfation can occur enzymatically, for example, in a biotransformation reaction using natural sulfation enzymes or their modified versions. Preferably, the sulfation of the respective tyrosine can occur chemically or enzymatically. Preferably, the synthesis of the isolated polypeptide occurs using the Fmoc-tBu strategy.
[00300] De acordo com algumas modalidades do 3° aspecto, o método compreende a purificação dos polipeptídeos obtidos. A purificação pode ocorrer, por exemplo, por HPLC, por exemplo, usando uma coluna C18. de acordo com algumas modalidades do 3° aspecto, o método compreende a caracterização analítica do polipeptídeo. Sem limitação, a caracterização analítica pode ser realizada usando métodos espectroscópicos ou espectrometria de massa.[00300] According to some embodiments of the 3rd aspect, the method comprises the purification of the obtained polypeptides. Purification can occur, for example, by HPLC, for example, using a C18 column. According to some embodiments of the 3rd aspect, the method comprises the analytical characterization of the polypeptide. Without limitation, the analytical characterization can be performed using spectroscopic methods or mass spectrometry.
[00301] De acordo com um 4° aspecto, é fornecido o uso do poli- peptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto para geração de anticorpos, como antígeno ou para panning fora do alvo e/ou para caracterização de um anticorpo. Por exemplo, o polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto pode ser usado para a geração de um anticorpo totalmente humano ou um fragmento do mesmo. Por exemplo, o polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto pode ser usado para a geração de um anticorpo reativo cruzado.[00301] According to a fourth aspect, the use of the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or conjugated according to the second aspect is provided for the generation of antibodies, as an antigen or for off-target panning and/or for the characterization of an antibody. For example, the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or conjugated according to the second aspect can be used for the generation of a fully human antibody or a fragment thereof. For example, the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or conjugated according to the second aspect can be used for the generation of a cross-reactive antibody.
[00302] De acordo com o 4° aspecto, é fornecido o uso do poli- peptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto para geração de anticorpos. Em particular, o polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto pode ser usado para facilitar a geração de anticorpos que reconhecem especificamente receptores de quimiocina, como descrito em outro lugar aqui.[00302] According to the fourth aspect, the use of the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or the conjugate according to the second aspect is provided for the generation of antibodies. In particular, the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect can be used to facilitate the generation of antibodies that specifically recognize chemokine receptors, as described elsewhere herein.
[00303] De acordo com o 4° aspecto, que pode ser igual ou diferente das primeiras modalidades de acordo com o 4° aspecto, o poli- peptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto é usado como antígeno, por exemplo, para selecionar anticorpos, fragmentos de anticorpos ou moléculas que se ligam especificamente aos receptores de quimiocina, conforme os Exemplos 6 e 8.[00303] According to the 4th aspect, which may be the same as or different from the first embodiments according to the 4th aspect, the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or conjugated according to the second aspect is used as an antigen, for example, to select antibodies, antibody fragments or molecules that bind specifically to chemokine receptors, as per Examples 6 and 8.
[00304] De acordo com o 4° aspecto, que pode ser igual ou diferente da primeira e/ou segunda modalidades de acordo com o 4° aspecto, o polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto é usado para panning fora do alvo para selecionar anticorpos que não se ligam a um certo receptor de sete transmembranas, por exemplo, um receptor de quimiocina (receptor fora do alvo), conforme os Exemplos 6 e 8.[00304] According to the 4th aspect, which may be the same as or different from the first and/or second embodiments according to the 4th aspect, the sulfated polypeptide isolated according to the first aspect or conjugated according to the second aspect is used for off-target panning to select antibodies that do not bind to a certain seven-transmembrane receptor, for example, a chemokine receptor (off-target receptor), as per Examples 6 and 8.
[00305] De acordo com o 4° aspecto compreende o uso do poli- peptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto para caracterização de um anticorpo. Preferivelmente, o anticorpo é um anticorpo de acordo com a presente invenção. Por exemplo, a caracterização do anticorpo pode compreender o uso de ELISA, ressonância plasmônica de superfície, espectrometria de massa, ensaios de competição, coloração, IHC, FACS ou vários outros ensaios conhecidos na técnica.[00305] According to the 4th aspect, it comprises the use of the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or conjugated according to the second aspect for characterization of an antibody. Preferably, the antibody is an antibody according to the present invention. For example, the characterization of the antibody may comprise the use of ELISA, surface plasmon resonance, mass spectrometry, competition assays, staining, IHC, FACS or various other assays known in the art.
[00306] De acordo com um 5° aspecto, é fornecido um método para obter um anticorpo ou ligante, o método compreendendo o uso do polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto.[00306] According to a fifth aspect, a method is provided for obtaining an antibody or ligand, the method comprising the use of the isolated sulfated polypeptide according to the first aspect or conjugated according to the second aspect.
[00307] De acordo com algumas primeiras modalidades, o método de acordo com o 5° aspecto compreende o uso do polipeptídeo sulfatado isolado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto como antígeno.[00307] According to some early embodiments, the method according to the 5th aspect comprises the use of the sulfated polypeptide isolated according to the first aspect or conjugated according to the second aspect as an antigen.
[00308] De acordo com algumas das primeiras modalidades preferidas do 5° aspecto, o método compreende o uso de pelo menos mais um polipeptídeo isolado ou conjugado do mesmo, em que o pelo menos mais um polipeptídeo isolado compreende um TRDa) de um receptor de sete transmembranas diferente do primeiro receptor de sete transmembranas, ou b) do primeiro receptor de sete transmembranas derivado de uma espécie diferente, preferivelmente em que o pelo menos um polipeptídeo isolado adicional é um polipeptídeo isolado de acordo com o primeiro aspecto.[00308] According to some of the first preferred embodiments of the 5th aspect, the method comprises the use of at least one more isolated or conjugated polypeptide, wherein the at least one more isolated polypeptide comprises a TRDa) of a seven-transmembrane receptor different from the first seven-transmembrane receptor, or b) of the first seven-transmembrane receptor derived from a different species, preferably wherein the at least one additional isolated polypeptide is an isolated polypeptide according to the first aspect.
[00309] De acordo com algumas modalidades A das primeiras modalidades do 5° aspecto, o método compreende o uso de pelo menos um polipeptídeo ou conjugado isolado adicional, preferivelmente de acordo com o primeiro ou segundo aspecto, preferivelmente como antígeno ou para panning fora do alvo. Para essas modalidades, o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreende um TRD de um primeiro receptor de sete transmembranas (por exemplo, um receptor de quimiocina) e o polipeptídeo ou conjugado isolado adicional compreende um TRD de um receptor de sete transmembranas diferente do primeiro receptor de sete transmembranas. Quando o polipeptídeo ou conjugado isolado adicional é usado como antígeno, o método é um método para a produção de anticorpos ou ligantes que reconhecem pelo menos dois receptores de sete transmembranas diferentes, por exemplo, dois membros diferentes da família de receptores de quimio- cina.[00309] According to some embodiments of the first embodiments of the 5th aspect, the method comprises the use of at least one additional isolated polypeptide or conjugate, preferably according to the first or second aspect, preferably as an antigen or for off-target panning. For these embodiments, the first isolated sulfated polypeptide comprises a TRD of a first seven-transmembrane receptor (e.g., a chemokine receptor) and the additional isolated polypeptide or conjugate comprises a TRD of a seven-transmembrane receptor other than the first seven-transmembrane receptor. When the additional isolated polypeptide or conjugate is used as an antigen, the method is a method for producing antibodies or ligands that recognize at least two different seven-transmembrane receptors, for example, two different members of the chemokine receptor family.
[00310] Quando o polipeptídeo ou conjugado isolado adicional é usado para panning fora do alvo, o método é um método para a produção de anticorpos ou ligantes que reconhecem apenas um receptor de sete transmembranas específico, por exemplo, para evitar a ligação fora do alvo aos membros da família de receptores de quimiocinas adicionais.[00310] When additional isolated polypeptide or conjugate is used for off-target panning, the method is a method for producing antibodies or ligands that recognize only one specific seven-transmembrane receptor, for example, to avoid off-target binding to additional chemokine receptor family members.
[00311] De acordo com algumas modalidades B das primeiras modalidades do 5° aspecto, o método compreende o uso de pelo menos um polipeptídeo ou conjugado isolado adicional, preferivelmente de acordo com o primeiro ou segundo aspecto, como antígeno ou para panning fora do alvo. Para estas modalidades, o primeiro polipep- tídeo isolado compreende um TRD de um primeiro receptor de sete transmembranas de uma primeira espécie (por exemplo, um receptor de quimiocina humano) e o polipeptídeo isolado adicional compreende um TRD do mesmo receptor de sete transmembrana derivado de uma espécie diferente (por exemplo, um receptor de quimiocina de cinomo- lgo). Por exemplo, o primeiro polipeptídeo pode compreender o TRD de um receptor de quimiocina humano e o segundo polipeptídeo pode compreender o TRD de um receptor de quimiocina de cinomolgo.[00311] According to some embodiments B of the first embodiments of the 5th aspect, the method comprises the use of at least one additional isolated polypeptide or conjugate, preferably according to the first or second aspect, as an antigen or for off-target panning. For these embodiments, the first isolated polypeptide comprises a TRD of a first seven-transmembrane receptor of a first species (e.g., a human chemokine receptor) and the additional isolated polypeptide comprises a TRD of the same seven-transmembrane receptor derived from a different species (e.g., a cynomolgus chemokine receptor). For example, the first polypeptide may comprise the TRD of a human chemokine receptor and the second polypeptide may comprise the TRD of a cynomolgus chemokine receptor.
[00312] Estas modalidades B são particularmente vantajosas, porque a geração de anticorpos ou ligantes de receptores de quimiocinas que são reativos de forma cruzada tanto para espécies humanas quanto para uma espécie modelo adequada é difícil para receptores de quimiocinas, em particular para CCR8. Embora o consenso geral entre os domínios transmembranares seja comparativamente alto, os domínios extracelulares dos receptores de quimiocinas têm um baixo consenso entre os diferentes membros da família de receptores de quimiocinas e também entre as espécies para um determinado receptor de quimiocinas (Fig. 1, Fig. 2 a). No entanto, de acordo com a presente invenção, descobriu-se recentemente que pequenos motifs compreendendo tirosina sulfatada dentro do TRD são suficientemente conservados para que um determinado receptor de quimiocina seja usado para obter números elevados de anticorpos de reação cruzada. O Exemplo 6 descreve a geração de anticorpos de reação cruzada para humanos e cinomolgos, e o Exemplo 10.1.1 mostra afinidades excelentes em ambas as espécies para vários anticorpos de acordo com a presente invenção. Comparado com roedores e camundongos, o cinomolgo é um sistema modelo preferido, porque os modelos de camundongos não conseguiram prever os efeitos colaterais imunológi- cos.[00312] These B embodiments are particularly advantageous because generating antibodies or chemokine receptor ligands that are cross-reactive for both human species and a suitable model species is difficult for chemokine receptors, particularly for CCR8. Although general consensus among transmembrane domains is comparatively high, extracellular domains of chemokine receptors have low consensus among different members of the chemokine receptor family and also among species for a given chemokine receptor (Fig. 1, Fig. 2a). However, according to the present invention, it has recently been discovered that small motifs comprising sulfated tyrosine within the TRD are sufficiently conserved for a given chemokine receptor to be used to obtain high numbers of cross-reacting antibodies. Example 6 describes the generation of cross-reacting antibodies for humans and cynomolgus, and Example 10.1.1 shows excellent affinities in both species for several antibodies according to the present invention. Compared to rodents and mice, cynomolgus is a preferred model system because mouse models failed to predict immunological side effects.
[00313] O método de acordo com o 5° aspecto pode ser qualquer método para geração de anticorpos conhecido na técnica. Por exemplo, o método pode ser um método de imunização convencional, por exemplo, em que o polipeptídeo de acordo com o primeiro aspecto é conjugado com KLH e é administrado a um animal adequado para imunização.[00313] The method according to the 5th aspect may be any method for generating antibodies known in the art. For example, the method may be a conventional immunization method, for instance, where the polypeptide according to the first aspect is conjugated with KLH and administered to an animal suitable for immunization.
[00314] Por exemplo, após a imunização, os esplenócitos dos animais imunizados podem ser usados para a geração de células de hi- bridoma, que produzem os anticorpos dos animais, e em uma segunda etapa podem ser selecionados anticorpos que se ligam especificamente ao antígeno por métodos conhecidos na técnica tal como, por exemplo, ELISA, bem como ligação a um fora do alvo, se aplicável. Alternativamente, os esplenócitos podem ser analisados diretamente para a produção de anticorpos que se ligam ao antígeno em sistemas microfluídicos baseados em gotículas ou em ensaios de cultura de células. Em seguida, apenas esplenócitos selecionados são aplicados diretamente ao sequenciamento para obter a sequência do anticorpo ou geração de hibridoma. Outro método pode compreender o uso do antígeno para seleção com uma biblioteca de anticorpos que, por exemplo, pode ser uma biblioteca de exibição de fagos, por exemplo, sem limitação, como descrito em outro lugar aqui, ou alternativamente uma biblioteca de mamífero. Após a seleção da biblioteca no antígeno, os anticorpos enriquecidos podem ser analisados quanto à ligação específica ao antígeno por métodos conhecidos na técnica, tais como, por exemplo, ELISA ou SPR, como descrito em mais detalhes aqui.[00314] For example, after immunization, splenocytes from immunized animals can be used to generate hybridoma cells, which produce the animals' antibodies, and in a second step, antibodies that bind specifically to the antigen can be selected by methods known in the art such as, for example, ELISA, as well as off-target binding, if applicable. Alternatively, splenocytes can be directly analyzed for the production of antibodies that bind to the antigen in droplet-based microfluidic systems or in cell culture assays. Then, only selected splenocytes are directly applied to sequencing to obtain the antibody sequence or hybridoma generation. Another method may comprise the use of the antigen for selection with an antibody library which, for example, could be a phage display library, for example, without limitation, as described elsewhere herein, or alternatively a mammalian library. After selecting the library for the antigen, the enriched antibodies can be analyzed for specific antigen binding using methods known in the art, such as ELISA or SPR, as described in more detail here.
[00315] De acordo com algumas segundas modalidades do 5° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das primeiras modalidades do 5° aspecto, o método para obter um anticorpo de acordo com o 5° aspecto, é um método que compreende o uso de uma biblioteca de exibição de fagos, um animal transgênico ou qualquer outra técnica disponível na técnica para a geração de anticorpos compreendendo CDRs humanas.[00315] According to some second embodiments of the 5th aspect, which may be the same as or different from the first embodiments of the 5th aspect, the method for obtaining an antibody according to the 5th aspect is a method comprising the use of a phage display library, a transgenic animal, or any other technique available in the art for the generation of antibodies comprising human CDRs.
[00316] Em algumas modalidades A das segundas modalidades do 5° aspecto, o método compreende o uso de uma biblioteca de exibição de fagos humanos, conforme o Exemplo 6 e Exemplo 8. Por exemplo, a biblioteca de exibição de fagos pode ser uma biblioteca de exibição de fagos de anticorpos totalmente humanos, como a biblioteca lambda BioInvent n-CoDeR Fab. Em algumas modalidades preferidas, a biblioteca de exibição em fagos é enriquecida quanto ao teor de tirosina e/ou histidina. Em uma primeira etapa, a biblioteca de exibição de fagos compreendendo bacteriófagos que exibem anticorpos ou fragmentos de anticorpos em seu exterior pode ser combinada com o po- lipeptídeo isolado imobilizado de acordo com o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto para permitir a ligação ao polipeptídeo isolado ou conjugado.[00316] In some embodiments of the second embodiments of the 5th aspect, the method comprises the use of a human phage display library, as per Example 6 and Example 8. For example, the phage display library may be a fully human antibody phage display library, such as the BioInvent n-CoDeR Fab lambda library. In some preferred embodiments, the phage display library is enriched with respect to tyrosine and/or histidine content. In a first step, the phage display library comprising bacteriophages displaying antibodies or antibody fragments on their exterior may be combined with the isolated polypeptide immobilized according to the first aspect or conjugated according to the second aspect to enable binding to the isolated or conjugated polypeptide.
[00317] Em uma segunda etapa de depleção opcional, que pode ocorrer antes ou após a primeira etapa, a biblioteca de exibição de fa- gos compreendendo bacteriófagos exibindo anticorpos ou fragmentos de anticorpos em seu exterior pode ser combinada com um polipeptí- deo isolado imobilizado ou conjugado de acordo com o primeiro aspecto, sendo diferente do polipeptídeo isolado da primeira etapa, para depauperar os ligantes fora do alvo.[00317] In a second optional depletion step, which may occur before or after the first step, the phage display library comprising bacteriophages displaying antibodies or antibody fragments on their exterior may be combined with an immobilized or conjugated isolated polypeptide, depending on the first aspect, being different from the isolated polypeptide of the first step, to deplete the ligands off-target.
[00318] Em uma terceira etapa opcional, que pode ocorrer antes ou após a primeira etapa, ou pode ocorrer antes ou após a segunda etapa, a biblioteca de exibição de fagos compreendendo bacteriófagos exibindo anticorpos ou fragmentos de anticorpos em seu exterior pode ser combinada com um polipeptídeo isolado imobilizado de acordo com sendo o primeiro aspecto ou conjugado de acordo com o segundo aspecto diferente do polipeptídeo isolado da primeira etapa e do poli- peptídeo isolado da segunda etapa opcional, para obter ligantes de reação cruzada.[00318] In an optional third step, which may occur before or after the first step, or may occur before or after the second step, the phage display library comprising bacteriophages displaying antibodies or antibody fragments on their exterior may be combined with an immobilized isolated polypeptide according to the first aspect or conjugated according to the second aspect different from the isolated polypeptide of the first step and the isolated polypeptide of the optional second step, to obtain cross-reacting ligands.
[00319] Cada uma das etapas pode ser repetida várias vezes, por exemplo, uma, duas, três, quatro, cinco, seis, sete, oito, nove, dez ou mais vezes. Anticorpos de ligação ou fragmentos podem ser recuperados para expansão por infecção de hospedeiros bacterianos adequados e o DNA pode ser sequenciado como conhecido na técnica para obter a sequência do anticorpo ou fragmento do receptor de sete transmembranas.[00319] Each of the steps can be repeated several times, for example, one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten or more times. Binding antibodies or fragments can be recovered for expansion by infection of suitable bacterial hosts and the DNA can be sequenced as known in the art to obtain the sequence of the antibody or seven-transmembrane receptor fragment.
[00320] Em algumas modalidades B das segundas modalidades do 5° aspecto, o método para obter um anticorpo de acordo com o 5° aspecto é um método que compreende o uso de animais transgênicos como descrito por Lonberg (Lonberg, Nils. "Human antibodies from transgenic animals." Nature biotechnology 23.9 (2005): 1117-1125.), incorporado aqui em sua totalidade. Por exemplo, o animal transgênico pode ser um XenoMouse (Abgenix Inc., Fremont, CA, por exemplo, Patente dos Estados Unidos N° 5.939.598), o HuMAb Mouse (Gen- Pharm-Medarex, San Jose, CA), o RenMab Mouse (Biocytogen), ou qualquer outro animal conhecido na técnica para a geração de anticorpos totalmente humanos.[00320] In some embodiments of the second embodiments of the 5th aspect, the method for obtaining an antibody according to the 5th aspect is a method comprising the use of transgenic animals as described by Lonberg (Lonberg, Nils. "Human antibodies from transgenic animals." Nature biotechnology 23.9 (2005): 1117-1125.), incorporated herein in its entirety. For example, the transgenic animal may be a XenoMouse (Abgenix Inc., Fremont, CA, for example, U.S. Patent No. 5,939,598), the HuMAb Mouse (Gen-Pharm-Medarex, San Jose, CA), the RenMab Mouse (Biocytogen), or any other animal known in the art for the generation of fully human antibodies.
[00321] Em algumas modalidades C das segundas modalidades do 5° aspecto, o método para obter um anticorpo de acordo com o 5° aspecto, é um método que compreende o uso de células B ativadas in vitro (veja, Patentes dos Estados Unidos 5.567.610 e 5.229.275, cada uma das quais é incorporada aqui por referência em sua totalidade).[00321] In some embodiments of the second embodiments of the 5th aspect, the method for obtaining an antibody according to the 5th aspect is a method comprising the use of activated B cells in vitro (see U.S. Patents 5,567,610 and 5,229,275, each of which is incorporated herein by reference in its entirety).
[00322] De acordo com algumas terceiras modalidades do 5° aspecto, é fornecido um método para obter um anticorpo ou fragmento de anticorpo ou um ligante, que se liga especificamente a um receptor de quimiocina CC ou CXC humano e/ou cinomolgo e/ou murino, o método compreendendo:a) (sinteticamente) sulfatando um polipeptídeo compreen- dendo um domínio rico em tirosina (TRD) eb) seleção de um anticorpo, fragmento de anticorpo ou li- gante reconhecendo o polipeptídeo sulfatado, ec) produzir opcionalmente o anticorpo, fragmento de anticorpo ou ligante.[00322] According to some third embodiments of the 5th aspect, a method is provided for obtaining an antibody or antibody fragment or a ligand that binds specifically to a human and/or cynomolgus and/or murine CC or CXC chemokine receptor, the method comprising: a) (synthetically) sulfated a polypeptide comprising a tyrosine-rich domain (TRD) and b) selecting an antibody, antibody fragment or ligand recognizing the sulfated polypeptide, and c) optionally producing the antibody, antibody fragment or ligand.
[00323] Em algumas modalidades, o uso de acordo com o 4° aspecto ou o método de acordo com o 5° aspecto é um uso/método para obter um anticorpo com propriedades favoráveis como descrito em outro lugar aqui, preferivelmente em que o anticorpo:a) compreende CDRs derivadas de humanos e/oub) é um anticorpo IgG humano, de rato ou murino, preferivelmente um anticorpo IgG1 humano ou um anticorpo IgG2a de muri- no, e/ouc) é reativo cruzado para dois diferentes receptores de sete transmembranas, e/oud) é reativo cruzado para um humano e um receptor de sete transmembranas de cinomolgos, e/oue) é caracterizado por uma região HCDR3 compreendendo entre 10 e 34% de tirosina e/ou entre 2 e 20% de histidina, preferivelmente entre 7 e 20% de histidina e/ouf) não modula a sinalização independente da proteína G do receptor de quimiocina e/oug) é um anticorpo não internalizante ou é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão alvo endógena que é inferior a 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 10 vezes da internalização do controle de isotipo.[00323] In some embodiments, the use according to aspect 4 or the method according to aspect 5 is a use/method for obtaining an antibody with favorable properties as described elsewhere herein, preferably wherein the antibody: a) comprises human-derived CDRs and/or b) is a human, mouse or murine IgG antibody, preferably a human IgG1 antibody or a murine IgG2a antibody, and/or c) is cross-reactive for two different seven-transmembrane receptors, and/or d) is cross-reactive for a human and a cynomolgus seven-transmembrane receptor, and/or e) is characterized by an HCDR3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or between 2 and 20% histidine, preferably between 7 and 20% histidine and/or f) does not modulate chemokine receptor G protein-independent signaling and/or g) is a non-internalizing antibody or is characterized by a internalization into a cell with endogenous target expression that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, or 10 times the internalization of isotype control.
[00324] O método de acordo com o aspecto atual pode ser usado para obter números elevados de anticorpos que se ligam a receptores de quimiocinas. Interessantemente, um número comparativamente alto desses anticorpos foi caracterizado por propriedades que os diferenci- am dos anticorpos conhecidos obtidos com métodos convencionais, como descrito em outro lugar aqui.[00324] The method according to the present aspect can be used to obtain high numbers of antibodies that bind to chemokine receptors. Interestingly, a comparatively high number of these antibodies were characterized by properties that differentiate them from known antibodies obtained by conventional methods, as described elsewhere here.
[00325] De acordo com a presente invenção, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo ou um ligante obtido com um método ou uso de acordo com um aspecto anterior.[00325] According to the present invention, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof or a ligand obtained by a method or use according to a prior aspect is provided.
[00326] Como será apreciado pelos versados na técnica, os anticorpos e/ou fragmentos de ligação são de natureza "modular". Ao longo da invenção, vários aspectos específicos e modalidades dos vários "módulos" que compõem os anticorpos e/ou fragmentos de ligação são descritos. Como exemplos específicos não limitantes, várias modalidades específicas de CDRs de VH, cadeias VH, CDRs de VL e cadeias VL ou características funcionais são descritas. Pretende-se que todas as modalidades específicas possam ser combinadas entre si como se cada combinação específica fosse explicitamente descrita individualmente. Como exemplos específicos não limitantes, várias modalidades funcionais específicas são descritas. Pretende-se que todas as modalidades específicas possam ser combinadas entre si como se cada combinação específica fosse explicitamente descrita individualmente.[00326] As will be appreciated by those skilled in the art, antibodies and/or binding fragments are of a "modular" nature. Throughout the invention, various specific aspects and embodiments of the various "modules" that comprise the antibodies and/or binding fragments are described. As specific, non-limiting examples, various specific embodiments of VH CDRs, VH chains, VL CDRs, and VL chains or functional features are described. It is intended that all specific embodiments can be combined with each other as if each specific combination were explicitly described individually. As specific, non-limiting examples, various specific functional embodiments are described. It is intended that all specific embodiments can be combined with each other as if each specific combination were explicitly described individually.
[00327] De acordo com um 6° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, (especificamente) ligando-se a um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado que compreende o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de sete transmembranas, em que pelo menos 25%, pelo menos 50% ou pelo menos 75% dos resíduos de tirosina do TRD são sulfatados. Preferivelmente, o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado também compreende o domínio LID do receptor de sete transmembranas. Preferivelmente, a cisteína entre o TRD e o domínio LID foi removida ou foi tro- cada por um aminoácido diferente.[00327] According to a sixth aspect, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, (specifically) binding to a first isolated sulfated polypeptide comprising the tyrosine-rich domain (TRD) of a seven-transmembrane receptor, wherein at least 25%, at least 50% or at least 75% of the tyrosine residues of the TRD are sulfated. Preferably, the first isolated sulfated polypeptide also comprises the LID domain of the seven-transmembrane receptor. Preferably, the cysteine between the TRD and the LID domain has been removed or replaced with a different amino acid.
[00328] Preferivelmente, o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreende o N-terminal de um receptor de sete transmembranas incluindo seu domínio rico em tirosina (TRD) e opcionalmente incluindo seu domínio LID, e ainda mais preferivelmente, pelo menos 25%, pelo menos 50% ou pelo menos 75% dos resíduos de tirosina do TRD são sulfatados.[00328] Preferably, the first isolated sulfated polypeptide comprises the N-terminal of a seven-transmembrane receptor including its tyrosine-rich domain (TRD) and optionally including its LID domain, and even more preferably, at least 25%, at least 50% or at least 75% of the tyrosine residues of the TRD are sulfated.
[00329] Em modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga ao(s) seu(s) alvo(s) com um valor KD de < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, <3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1,5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, <8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, <2,5E-10 M, < 2E-10 M, < 1,5E-10 M, < 1E-10 M, ou < 9E-11 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode se ligar ao(s) seu(s) alvo(s) com um valor de KD entre < 8E-9 M e > 4E-10 M. Quando o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga a mais de um alvo, mais preferivelmente ele se liga aos seus alvos com afinidade da mesma ordem de grandeza.[00329] In preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof binds to its target(s) with a KD value of < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2.5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, or < 9E-11 M. For example, the inventive antibody may bind to its target(s) with a KD value between < 8E-9 M and > 4E-10 M. When the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof binds to more than one target, it most preferably binds to its targets with affinity of the same order of magnitude.
[00330] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmoa) compreende CDRs derivadas de humanos e/oub) é reativo cruzado para humanos e cinomolgos, e/ouc) é caracterizado por uma região HCDR3 compreendendo entre 10 e 34% de tirosina e/ou entre 7 e 20% de histidina, e/oud) não modula a sinalização independente da proteína G dos receptores de sete transmembranas e/oue) é um anticorpo não internalizante ou é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão alvo endógena que é inferior a 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 10 vezes da internalização do contro- le de isotipo, e/ouf) induz ADCC e/ou ADCP e/oug) é um anticorpo IgG humano, de rato ou murino, preferivelmente um anticorpo IgG1 humano ou um anticorpo IgG2a murino, e/ouh) é um fragmento scFv, Fab, Fab' ou F(ab')2.[00330] According to some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof a) comprises human-derived CDRs and/or b) is cross-reactive for humans and cynomolgus, and/or c) is characterized by an HCDR3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or between 7 and 20% histidine, and/or d) does not modulate G protein-independent signaling of seven transmembrane receptors and/or e) is a non-internalizing antibody or is characterized by internalization into a cell with endogenous target expression that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 10 times the internalization of the isotype control, and/or f) induces ADCC and/or ADCP and/or g) is a human, mouse or murine IgG antibody, preferably a human IgG1 antibody or a murine IgG2a antibody, and/or h) is a scFv, Fab, Fab' or F(ab')2 fragment.
[00331] De acordo com algumas primeiras modalidades do 6° aspecto, o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimi- ocina. Em algumas dessas primeiras modalidades, o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina CC ou um receptor de quimiocina CXC. Em algumas dessas primeiras modalidades, o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina CC, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 ou CCR10. Em algumas dessas primeiras modalidades preferidas, o receptor de sete transmembranas é CCR8 ou CCR4. Em algumas dessas primeiras modalidades mais preferidas, o receptor de sete trans- membranas é CCR8. Em algumas das primeiras modalidades, o receptor de sete transmembranas é um receptor de quimiocina CXC, tal como CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 ou CXCR6. Em algumas das primeiras modalidades, o receptor de sete transmembra- nas é CX3CR1 ou CXCR1.[00331] According to some early embodiments of the 6th aspect, the seven-transmembrane receptor is a chemokine receptor. In some of these early embodiments, the seven-transmembrane receptor is a CC chemokine receptor or a CXC chemokine receptor. In some of these early embodiments, the seven-transmembrane receptor is a CC chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, or CCR10. In some of these preferred early embodiments, the seven-transmembrane receptor is CCR8 or CCR4. In some of these most preferred early embodiments, the seven-transmembrane receptor is CCR8. In some of the early embodiments, the seven-transmembrane receptor is a CXC chemokine receptor, such as CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, or CXCR6. In some of the earliest forms, the seven-transmembrane receptor is CX3CR1 or CXCR1.
[00332] De acordo com algumas segundas modalidades do 6° aspecto, que podem ou não ser as mesmas que as primeiras modalidades do 6° aspecto, os receptores de sete transmembranas podem ser de qualquer espécie que expressa receptores de quimiocinas ca-racterizados por um TRD, por exemplo, humano, macaco, macaca fascicularis (macaco cinomolgo), macaca mulatta (macaco rhesus), roedor, camundongo, rato, cavalo, bovino, porco, cachorro, gato e camelo. Em algumas dessas segundas modalidades do 6° aspecto, o receptor de sete transmembranas é murino. Em algumas dessas segun- das modalidades mais preferidas do sexto aspecto, o receptor de sete transmembranas é humano. Em algumas dessas segundas modalidades do sexto aspecto, o receptor de sete transmembranas é cinomol- go. Em algumas dessas modalidades preferidas, o receptor de sete transmembranas é humano, cinomolgo ou camundongo. Em algumas dessas segundas modalidades preferidas do sexto aspecto, o receptor de sete transmembranas é humano ou cinomolgo.[00332] According to some second embodiments of the 6th aspect, which may or may not be the same as the first embodiments of the 6th aspect, seven-transmembrane receptors can be from any species that expresses chemokine receptors characterized by a TRD, for example, human, monkey, macaca fascicularis (cynomolgus monkey), macaca mulatta (rhesus monkey), rodent, mouse, rat, horse, bovine, pig, dog, cat, and camel. In some of these second embodiments of the 6th aspect, the seven-transmembrane receptor is murine. In some of these more preferred second embodiments of the sixth aspect, the seven-transmembrane receptor is human. In some of these second embodiments of the sixth aspect, the seven-transmembrane receptor is cynomolgus. In some of these preferred embodiments, the seven-transmembrane receptor is human, cynomolgus, or mouse. In some of these preferred second-part modalities of the sixth aspect, the seven-transmembrane receptor is human or cynomolgus.
[00333] Em algumas modalidades preferidas, o receptor de sete transmembranas é um receptor de sete transmembranas humano, ci- nomolgo ou camundongo e o receptor de sete transmembranas éa) um receptor de quimiocina CC, preferivelmente CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 ou CCR10,b) um receptor de quimiocina CXC, preferivelmente CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 ou CXCR6, ouc) CX3CR1 ou CXCR1.[00333] In some preferred embodiments, the seven-transmembrane receptor is a human, cynomolgus or mouse seven-transmembrane receptor and the seven-transmembrane receptor is a) a CC chemokine receptor, preferably CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 or CCR10, b) a CXC chemokine receptor, preferably CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 or CXCR6, or c) CX3CR1 or CXCR1.
[00334] De acordo com algumas terceiras modalidades do 6° aspecto, que pode ser ou não igual à primeira e/ou segunda modalidades de acordo com o 6° aspecto, o (primeiro) polipeptídeo sulfatado isolado compreende ou consiste em uma sequência de acordo com:a) SEQ ID NO:1 (CCR1_humano_TRD), SEQ ID NO:4 (CCR1_humano_N term), SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), SEQ ID NO:3 (CCR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:6 (CCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:7 (CCR2_humano_TRD), SEQ ID NO:10 (CCR2_humano_N term), SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD) ou SEQ ID NO:11 (CCR2_ MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:9 (CCR2_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:12 (CCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foi sulfatado, oud) SEQ ID NO:13 (CCR3_humano_TRD) ou SEQ ID NO:16 (CCR3_humano_N term), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que Y16 foi sulfatado, ouf) SEQ ID NO:15 (CCR3_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:18 (CCR3_CAMUNDONGO _N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foi sulfatado, oug) SEQ ID NO:19 (CCR4_humano_TRD), SEQ ID NO:22 (CCR4_humano_N term), SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), SEQ ID NO:21 (CCR4_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:24 (CCR4_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:25 (CCR5_humano_TRD), SEQ ID NO:28 (CCR5_humano_N term), SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD) ou SEQ ID NO:29 (CCR5_ MACMU_N term), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:27 (CCR5_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:30 (CCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:31 (CCR6_humano_TRD) ou SEQ ID NO:34 (CCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA _N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, ou l) SEQ ID NO:33 (CCR6_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:36 (CCR6_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:37 (CCR7_humano_TRD), SEQ ID NO:40 (CCR7_humano_N term), SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:39 (CCR7_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:42 (CCR7_camundongo_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), ou SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:48 (CCR8_camundongo_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:63 (CCR9_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:66 (CCR9_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ous) SEQ ID NO:67 (CCR10_humano_TRD), SEQ ID NO:70 (CCR10_humano_N term), SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foi sulfatado, out) SEQ ID NO:69 (CCR10_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:72 (CCR10_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foi sulfatado, ouu) SEQ ID NO:73 (CXCR1_humano_TRD) ou SEQ ID NO:76 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado, ouv) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA _TRD) ou SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, ouw) SEQ ID NO:75 (CXCR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:78 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, oux) SEQ ID NO:79 (CXCR2_humano_TRD) ou SEQ ID NO:82 (CXCR2_humano_N term), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, ouy) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA _TRD) ou SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, ouz) SEQ ID NO:81 (CXCR2_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:84 (CXCR2_camundongo_N term), preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, ouaa) SEQ ID NO:85 (CXCR3_humano_TRD), SEQ ID NO:88 (CXCR3_humano_N term), SEQ ID NO:86(CXCR3_MACFA_TRD), SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), SEQ ID NO:87 (CXCR3_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:90 (CXCR3_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, ou bb) SEQ ID NO:91 (CXCR4_humano_TRD), SEQ ID NO:94 (CXCR4_humano_N term), SEQ ID NO:92(CXCR4_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, oucc) SEQ ID NO:93 (CXCR4_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:96 (CXCR4_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y23 e/ou Y14 foram sulfatados, oudd) SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), SEQ ID NO:100 (CXCR5_humano_N term), SEQ ID NO:98(CXCR5_MACFA_TRD) ou SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados, ouee) SEQ ID NO:99 (CXCR5_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:102 (CXCR5_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, ouff) SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD) ou SEQ ID NO:106 (CXCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foi sulfatado, ougg) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA _TRD) ou SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouhh) SEQ ID NO:105 (CXCR6_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:108 (CXCR6_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ou11) SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD) ou SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado, oujj) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y20 foi sulfatado, ou kk) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y20 ou Y22 foi sulfatado, ou11) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:162 (CX3CR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, oumm) SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD) ou SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado, ounn) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado ouoo) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 ou Y28 foi sulfatado, oupp) SEQ ID NO:165 (CXCR1_camundongo_TRD) ou SEQ ID NO:168 (CXCR1_camundongo_N term), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00334] According to some third embodiments of the 6th aspect, which may or may not be the same as the first and/or second embodiments according to the 6th aspect, the (first) isolated sulfated polypeptide comprises or consists of a sequence according to: a) SEQ ID NO:1 (CCR1_human_TRD), SEQ ID NO:4 (CCR1_human_N term), SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), SEQ ID NO:3 (CCR1_mouse_TRD) or SEQ ID NO:6 (CCR1_mouse_N term), preferably wherein at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:7 (CCR2_human_TRD), SEQ ID NO:10 (CCR2_human_N term), SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD) or SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c) SEQ ID NO:9 (CCR2_mouse_TRD) or SEQ ID NO:12 (CCR2_mouse_N term), preferably in which at least Y37 and/or Y39 has been sulfated, or d) SEQ ID NO:13 (CCR3_human_TRD) or SEQ ID NO:16 (CCR3_human_N term), preferably in which Y16 and/or Y17 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferably in which Y16 has been sulfated, or f) SEQ ID NO:15 (CCR3_mouse_TRD) or SEQ ID NO:18 (CCR3_CAMUNDONGO _N term), preferably in which Y20 and/or Y22 have been sulfated, or g) SEQ ID NO:19 (CCR4_humano_TRD), SEQ ID NO:22 (CCR4_humano_N term), SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), SEQ ID NO:21 (CCR4_camundongo_TRD) or SEQ ID NO:24 (CCR4_camundongo_N term), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or h) SEQ ID NO:25 (CCR5_humano_TRD), SEQ ID NO:28 (CCR5_humano_N term), SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD) or SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferably in which two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, or i) SEQ ID NO:27 (CCR5_mouse_TRD) or SEQ ID NO:30 (CCR5_mouse_N term), preferably in which two or three of Y10, Y12, and Y16 were sulfated, or j) SEQ ID NO:31 (CCR6_human_TRD) or SEQ ID NO:34 (CCR6_human_N term), preferably in which at least two or three of Y18, Y26, and Y27 were sulfated, or k) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or three of Y23, Y31, and Y32 were sulfated, or l) SEQ ID NO:33 (CCR6_mouse_TRD) or SEQ ID NO:36 (CCR6_mouse_N term), preferably wherein at least two or three of Y13, Y18, and Y19 were sulfated, or m) SEQ ID NO:37 (CCR7_human_TRD), SEQ ID NO:40 (CCR7_human_N term), SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD), or SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferably wherein one or both Y8 and Y17 were sulfated, or n) SEQ ID NO:39 (CCR7_mouse_TRD) or SEQ ID NO:42 (CCR7_mouse_N term), preferably wherein one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 were sulfated. sulfated were sulfated, or) SEQ ID NO:43 (CCR8_human_TRD), SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), SEQ ID NO:46 (CCR8_human_N term with C = X or S), or SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term with C = X or S), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 were sulfated, or) SEQ ID NO:45 (CCR8_mouse_TRD) or SEQ ID NO:48 (CCR8_mouse_N term with C = X or S), preferably wherein at least two or all of Y3, Y14 and Y15 were sulfated, or) SEQ ID NO:61 (CCR9_human_TRD), SEQ ID NO:64 (CCR9_human_N term), SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 has been sulfated, our) SEQ ID NO:63 (CCR9_mouse_TRD) or SEQ ID NO:66 (CCR9_mouse_N term), preferably in which at least Y28 has been sulfated, and preferably also Y19 has been sulfated, ous) SEQ ID NO:67 (CCR10_human_TRD), SEQ ID NO:70 (CCR10_human_N term), SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 has been sulfated, out) SEQ ID NO:69 (CCR10_mouse_TRD) or SEQ ID NO:72 (CCR10_mouse_N term), preferably in which at least one, two, or all of Y14, Y17, and Y22 have been sulfated, oru) SEQ ID NO:73 (CXCR1_human_TRD) or SEQ ID NO:76 (CXCR1_human_N term), preferably in which Y27 have been sulfated, orv) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y14 and Y28 have been sulfated, orw) SEQ ID NO:75 (CXCR1_mouse_TRD) or SEQ ID NO:78 (CXCR1_mouse_N term), preferably in which at least Y6 have been sulfated, orx) SEQ ID NO:79 (CXCR2_human_TRD) or SEQ ID NO:82 (CXCR2_human_N term), preferably where Y23 and/or Y25 have been sulfated, or y) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferably where Y20 and/or Y22 have been sulfated, or z) SEQ ID NO:81 (CXCR2_mouse_TRD) or SEQ ID NO:84 (CXCR2_mouse_N term), preferably where Y24 has been sulfated, or aa) SEQ ID NO:85 (CXCR3_human_TRD), SEQ ID NO:88 (CXCR3_human_N term), SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), SEQ ID NO:87 (CXCR3_mouse_TRD) or SEQ ID NO:90 (CXCR3_mouse_N term), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, or bb) SEQ ID NO:91 (CXCR4_human_TRD), SEQ ID NO:94 (CXCR4_human_N term), SEQ ID NO:92 (CXCR4_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferably in which at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, or cc) SEQ ID NO:93 (CXCR4_mouse_TRD) or SEQ ID NO:96 (CXCR4_mouse_N term), preferably in which at least Y23 and/or Y14 have been sulfated, oudd) SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), SEQ ID NO:100 (CXCR5_humano_N term), SEQ ID NO:98(CXCR5_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y3 and Y27 has been sulfated, ouee) SEQ ID NO:99 (CXCR5_camundongo_TRD) or SEQ ID NO:102 (CXCR5_camundongo_N term), preferably in which at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 has been sulfated, ouff) SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD) or SEQ ID NO:106 (CXCR6_humano_N term), preferably in which at least one or both of Y6 and Y10 has been sulfated, ougg) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD) or SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 have been sulfated, ouhh) SEQ ID NO:105 (CXCR6_mouse_TRD) or SEQ ID NO:108 (CXCR6_mouse_N term), preferably in which at least one or both of Y11 and Y15 have been sulfated, ou11) SEQ ID NO:157 (CX3CR1_human_TRD) or SEQ ID NO:160 (CX3CR1_human_N term), preferably in which at least Y14 has been sulfated, oujj) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferably in which at least Y20 has been sulfated, or kk) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y20 or Y22 has been sulfated, or 11) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_mouse_TRD) or SEQ ID NO:162 (CX3CR1_mouse_N term), preferably in which at least Y15 has been sulfated, or mm) SEQ ID NO:163 (CXCR1_human_TRD) or SEQ ID NO:166 (CXCR1_human_N term), preferably in which at least Y27 has been sulfated, or nn) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferably in which at least Y14 has been sulfated, or ooo) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferably in which at least Y14 or Y28 has been sulfated, oupp) SEQ ID NO:165 (CXCR1_camundongo_TRD) or SEQ ID NO:168 (CXCR1_camundongo_N term), preferably in which at least Y6 has been sulfated.
[00335] De acordo com algumas modalidades A do terceiras modalidades do 6° aspecto, o (primeiro) polipeptídeo sulfatado isolado compreende ou consiste em uma sequência de acordo coma. SEQ ID NO:1 (CCR1_humano_TRD), preferivelmenteem que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub. SEQ ID NO:7 (CCR2_humano_TRD), preferivelmenteem que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc. SEQ ID NO:13 (CCR3_humano_TRD), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, oud. SEQ ID NO:19 (CCR4_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue. SEQ ID NO:25 (CCR5_humano_TRD), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouf. SEQ ID NO:31 (CCR6_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados, oug. SEQ ID NO:37 (CCR7_humano_TRD), preferivelmente em que um ou ambos Y8 e Y17 foram sulfatados, ouh. SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oui. SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ouj. SEQ ID NO:67 (CCR10_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, ouk. SEQ ID NO:73 (CXCR1_humano_TRD), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado, oul. SEQ ID NO:79 (CXCR2_humano_TRD), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, oum. SEQ ID NO:85 (CXCR3_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun. SEQ ID NO:91 (CXCR4_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, ouo. SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados, oup. SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados, ouq. SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado, our. SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado.[00335] According to some embodiments of the third embodiments of the 6th aspect, the (first) isolated sulfated polypeptide comprises or consists of a sequence according to a. SEQ ID NO:1 (CCR1_human_TRD), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b. SEQ ID NO:7 (CCR2_human_TRD), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c. SEQ ID NO:13 (CCR3_human_TRD), preferably in which Y16 and/or Y17 have been sulfated, or d. SEQ ID NO:19 (CCR4_human_TRD), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e. SEQ ID NO:25 (CCR5_humano_TRD), preferably in which two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, ouf. SEQ ID NO:31 (CCR6_humano_TRD), preferably in which at least two or three of Y18, Y26, and Y27 were sulfated, oug. SEQ ID NO:37 (CCR7_humano_TRD), preferably in which one or both Y8 and Y17 were sulfated, ouh. SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15, and Y17 were sulfated, oui. SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, ouj. SEQ ID NO:67 (CCR10_humano_TRD), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated, ouk. SEQ ID NO:73 (CXCR1_humano_TRD), preferably in which Y27 has been sulfated, oul. SEQ ID NO:79 (CXCR2_humano_TRD), preferably in which Y23 and/or Y25 have been sulfated, oum. SEQ ID NO:85 (CXCR3_humano_TRD), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, oun. SEQ ID NO:91 (CXCR4_humano_TRD), preferably in which at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, ouo. SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), preferably in which at least one of Y3 and Y27 have been sulfated, ouup. SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD), preferably in which at least one or both of Y6 and Y10 have been sulfated, or SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD), preferably in which at least Y14 has been sulfated, or SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD), preferably in which at least Y27 has been sulfated.
[00336] De acordo com algumas modalidades B das terceiras modalidades do 6° aspecto, o (primeiro) polipeptídeo sulfatado isolado compreende ou consiste em uma sequência de acordo coma) SEQ ID NO:3 (CCR1_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:9 (CCR2_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:15 (CCR3_camundongo_TRD), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oud) SEQ ID NO:21 (CCR4_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:27 (CCR5_camundongo_TRD), preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:33 (CCR6_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados,g) SEQ ID NO:39 (CCR7_camundongo_TRD), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:63 (CCR9_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ouj) SEQ ID NO:69 (CCR10_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:75 (CXCR1_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, ou l) SEQ ID NO:81 (CXCR2_camundongo_TRD), preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, oum) SEQ ID NO:87 (CXCR3_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:93 (CXCR4_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y23 e/ou Y14 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:99 (CXCR5_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:105 (CXCR6_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:165 (CXCR1_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00336] According to some embodiments B of the third embodiments of the 6th aspect, the (first) isolated sulfated polypeptide comprises or consists of a sequence according to a) SEQ ID NO:3 (CCR1_mouse_TRD), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:9 (CCR2_mouse_TRD), preferably in which at least Y37 and/or Y39 have been sulfated, or c) SEQ ID NO:15 (CCR3_mouse_TRD), preferably in which Y20 and/or Y22 have been sulfated, or d) SEQ ID NO:21 (CCR4_mouse_TRD), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:27 (CCR5_mouse_TRD), preferably in which two or three of Y10, Y12 and Y16 were sulfated, or f) SEQ ID NO:33 (CCR6_mouse_TRD), preferably in which at least two or three of Y13, Y18 and Y19 were sulfated, g) SEQ ID NO:39 (CCR7_mouse_TRD), preferably in which one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 were sulfated, or h) SEQ ID NO:45 (CCR8_mouse_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 were sulfated, or i) SEQ ID NO:63 (CCR9_mouse_TRD), preferably in which at least Y28 was sulfated, and preferably also Y19 was sulfated, or j) SEQ ID NO:69 (CCR10_mouse_TRD), preferably in which at least one, two, or all of Y14, Y17, and Y22 have been sulfated, or k) SEQ ID NO:75 (CXCR1_mouse_TRD), preferably in which at least Y6 has been sulfated, or l) SEQ ID NO:81 (CXCR2_mouse_TRD), preferably in which Y24 has been sulfated, or m) SEQ ID NO:87 (CXCR3_mouse_TRD), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, or n) SEQ ID NO:93 (CXCR4_mouse_TRD), preferably in which at least Y23 and/or Y14 have been sulfated, or o) SEQ ID NO:99 (CXCR5_mouse_TRD), preferably in which at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 were sulfated, or) SEQ ID NO:105 (CXCR6_camundongo_TRD), preferably where at least one or both of Y11 and Y15 were sulfated, or) SEQ ID NO:159 (CX3CR1_camundongo_TRD), preferably where at least Y15 was sulfated, or) SEQ ID NO:165 (CXCR1_camundongo_TRD), preferably where at least Y6 was sulfated.
[00337] De acordo com algumas modalidades C das terceiras modalidades do 6° aspecto, o (primeiro) polipeptídeo sulfatado isolado compreende ou consiste em uma sequência de acordo coma) SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD), preferivelmenteem que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD), preferivelmenteem que Y16 foi sulfatado, oud) SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), preferivelmenteem que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, ou f) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD), preferivelmenteem que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, oug) SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD), preferivelmenteem que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, oul) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:92 (CXCR4_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:98 (CXCR5_MACFA_TRD), preferivelmenteem que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado, oup) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y20 foi sulfatado, ou r) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado.[00337] According to some embodiments C of the third embodiments of the 6th aspect, the (first) isolated sulfated polypeptide comprises or consists of a sequence according to a) SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c) SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD), preferably in which Y16 has been sulfated, or d) SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD), preferably in which two, three or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, or f) SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD), preferably in which at least two or three of Y23, Y31, and Y32 were sulfated, or g) SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD), preferably in which one or both Y8 and Y17 were sulfated, or h) SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15, and Y17 were sulfated, or i) SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, or j) SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 were sulfated, ouk) SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD), preferably in which at least one of Y14 and Y28 has been sulfated, oul) SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD), preferably in which Y20 and/or Y22 has been sulfated, oum) SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 has been sulfated, oun) SEQ ID NO:92 (CXCR4_MACFA_TRD), preferably in which at least Y12 and/or Y21 has been sulfated, ouo) SEQ ID NO:98 (CXCR5_MACFA_TRD), preferably in which at least one of Y3 and Y27 has been sulfated, ouup) SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 were sulfated, or q) SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferably in which at least Y20 was sulfated, or r) SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferably in which at least Y14 was sulfated.
[00338] De acordo com algumas quartas modalidades do 6° aspecto, que pode ou não ser igual à primeira, segunda e/ou terceira modalidades do 6° aspecto, o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreende o N-terminal de um receptor de sete transmembranas incluindo domínio rico em tirosina (TRD) e preferivelmente domínio LID, e pelo menos 25%, pelo menos 50% ou pelo menos 75% dos resíduos de tirosina do TRD são sulfatados, preferivelmente em que pelo menos uma/a cisteína entre o TRD e o LID domínio foi removido ou foi trocado por um aminoácido diferente.[00338] According to some fourth embodiments of the 6th aspect, which may or may not be the same as the first, second and/or third embodiments of the 6th aspect, the first isolated sulfated polypeptide comprises the N-terminal of a seven-transmembrane receptor including a tyrosine-rich domain (TRD) and preferably a LID domain, and at least 25%, at least 50% or at least 75% of the tyrosine residues of the TRD are sulfated, preferably in which at least one cysteine between the TRD and the LID domain has been removed or has been replaced by a different amino acid.
[00339] De acordo com algumas modalidades A do quarta modalidade do 6° aspecto, o (primeiro) polipeptídeo sulfatado isolado compreende ou consiste em uma sequência de acordo coma) SEQ ID NO:4 (CCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados,b) SEQ ID NO:10 (CCR2_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado,c) SEQ ID NO:16 (CCR3_humano_N term), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados,d) SEQ ID NO:22 (CCR4_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados,e) SEQ ID NO:28 (CCR5_humano_N term), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados,f) SEQ ID NO:34 (CCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados,g) SEQ ID NO:40 (CCR7_humano_N term), preferivelmente em que um ou ambos Y8 e Y17 foram sulfatados,h) SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados,i) SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados,j) SEQ ID NO:70 (CCR10_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados,k) SEQ ID NO:76 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado,l) SEQ ID NO:82 (CXCR2_humano_N term), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados,m) SEQ ID NO:88 (CXCR3_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados,n) SEQ ID NO:94 (CXCR4_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados,o) SEQ ID NO:100 (CXCR5_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado, oup) SEQ ID NO:106 (CXCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados,q) SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado.[00339] According to some embodiments A of the fourth embodiment of the 6th aspect, the (first) isolated sulfated polypeptide comprises or consists of a sequence according to a) SEQ ID NO:4 (CCR1_human_N term), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, b) SEQ ID NO:10 (CCR2_human_N term), preferably in which at least Y26 has been sulfated, c) SEQ ID NO:16 (CCR3_human_N term), preferably in which Y16 and/or Y17 have been sulfated, d) SEQ ID NO:22 (CCR4_human_N term), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, e) SEQ ID NO:28 (CCR5_human_N term), preferably in which two, three or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, f) SEQ ID NO:34 (CCR6_human_N term), preferably in which at least two or three of Y18, Y26, and Y27 were sulfated, g) SEQ ID NO:40 (CCR7_human_N term), preferably in which one or both Y8 and Y17 were sulfated, h) SEQ ID NO:46 (CCR8_human_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y15, and Y17 were sulfated, i) SEQ ID NO:64 (CCR9_human_N term), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, j) SEQ ID NO:70 (CCR10_human_N term), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 were sulfated, k) SEQ ID NO:76 (CXCR1_human_N term), preferably in which Y27 has been sulfated, l) SEQ ID NO:82 (CXCR2_human_N term), preferably in which Y23 and/or Y25 have been sulfated, m) SEQ ID NO:88 (CXCR3_human_N term), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, n) SEQ ID NO:94 (CXCR4_human_N term), preferably in which at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, o) SEQ ID NO:100 (CXCR5_human_N term), preferably in which at least one of Y3 and Y27 has been sulfated, oup) SEQ ID NO:106 (CXCR6_human_N term), preferably in which at least one or both of Y6 and Y10 have been sulfated, q) SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N term), preferably in which at least Y14 has been sulfated, our) SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferably in which at least Y27 has been sulfated.
[00340] De acordo com algumas modalidades B do quarta modalidade do 6° aspecto, o (primeiro) polipeptídeo sulfatado isolado compreende ou consiste em uma sequência de acordo coma) SEQ ID NO:6 (termo CCR1_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, ou b) SEQ ID NO:12 (termo CCR2_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:18 (termo CCR3_MOUSE _N), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oud) SEQ ID NO:24 (termo CCR4_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:30 (termo CCR5_camundongo_N), preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:36 (termo CCR6_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados,g) SEQ ID NO:42 (termo CCR7_camundongo_N), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:48 (termo CCR8_camundongo_N com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:66 (termo CCR9_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ouj) SEQ ID NO:72 (termo CCR10_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:78 (termo CXCR1_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, oul) SEQ ID NO:84 (termo CXCR2_camundongo_N), preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, oum) SEQ ID NO:90 (termo CXCR3_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sul- fatados, oun) SEQ ID NO:96 (termo CXCR4_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y13 e/ou Y14 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:102 (termo CXCR5_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, oup) SEQ ID NO:108 (termo CXCR6_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:162 (termo CX3CR1_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:168 (termo CXCR1_camundongo_N), preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00340] According to some embodiments B of the fourth embodiment of the 6th aspect, the (first) isolated sulfated polypeptide comprises or consists of a sequence according to a) SEQ ID NO:6 (term CCR1_mouse_N), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:12 (term CCR2_mouse_N), preferably in which at least Y37 and/or Y39 have been sulfated, or c) SEQ ID NO:18 (term CCR3_MOUSE_N), preferably in which Y20 and/or Y22 have been sulfated, or d) SEQ ID NO:24 (term CCR4_mouse_N), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:30 (term f) SEQ ID NO:36 (term CCR6_camundongo_N), preferably in which at least two or three of Y13, Y18 and Y19 were sulfated, g) SEQ ID NO:42 (term CCR7_camundongo_N), preferably in which one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 were sulfated, h) SEQ ID NO:48 (term CCR8_camundongo_N with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 were sulfated, i) SEQ ID NO:66 (term CCR9_camundongo_N), preferably in which at least Y28 was sulfated, and preferably also Y19 was sulfated, j) SEQ ID NO:72 (term CCR10_mouse_N), preferably in which at least one, two, or all of Y14, Y17, and Y22 were sulfated, ouk) SEQ ID NO:78 (term CXCR1_mouse_N), preferably in which at least Y6 was sulfated, oul) SEQ ID NO:84 (term CXCR2_mouse_N), preferably in which Y24 was sulfated, oum) SEQ ID NO:90 (term CXCR3_mouse_N), preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, oun) SEQ ID NO:96 (term CXCR4_mouse_N), preferably in which at least Y13 and/or Y14 were sulfated, ouo) SEQ ID NO:102 (term CXCR5_mouse_N), preferably in which at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 were sulfated, or) SEQ ID NO:108 (term CXCR6_mouse_N), preferably where at least one or both of Y11 and Y15 were sulfated, or) SEQ ID NO:162 (term CX3CR1_mouse_N), preferably where at least Y15 was sulfated, or) SEQ ID NO:168 (term CXCR1_mouse_N), preferably where at least Y6 was sulfated.
[00341] De acordo com algumas modalidades C do quarta modalidade do 6° aspecto, o (primeiro) polipeptídeo sulfatado isolado compreende ou consiste em uma sequência de acordo coma) SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub) SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que Y16 foi sulfatado, oud) SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouf) SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA _N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfa- tados, oug) SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferivelmente em que um ou ambos Y8 e Y17 foram sulfatados, ouh) SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N com term C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oui) SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ouj) SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, ouk) SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, oul) SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oum) SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, ouo) SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado, oup) SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouq) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y20 ou Y22 foi sulfatado, our) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 ou Y28 foi sulfatado.[00341] According to some embodiments C of the fourth embodiment of the 6th aspect, the (first) isolated sulfated polypeptide comprises or consists of a sequence according to a) SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c) SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferably in which Y16 has been sulfated, or d) SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferably in which two, three or all of Y3, Y10, Y14 and Y15 were sulfated, or f) SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferably wherein at least two or three of Y23, Y31 and Y32 were sulfated, or g) SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferably wherein one or both Y8 and Y17 were sulfated, or h) SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N with term C = X or S), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 were sulfated, or i) SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferably wherein at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, or j) SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferably wherein at least one or both of Y14 and Y22 were sulfated, ouk) SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferably where at least one of Y14 and Y28 was sulfated, oul) SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferably where Y20 and/or Y22 were sulfated, oum) SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), preferably where at least one or both of Y27 and Y29 were sulfated, oun) SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferably where at least Y12 and/or Y21 were sulfated, ouo) SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferably where at least one of Y3 and Y27 was sulfated, ouup) SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 were sulfated, ouq) SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y20 or Y22 was sulfated, ouq) SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferably in which at least Y14 or Y28 was sulfated.
[00342] De acordo com algumas quintas modalidades do 6° aspecto, que pode ser ou não igual à primeira, segunda, terceira e/ou quarta modalidades de acordo com o 6° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, (especificamente) se liga a um segundo polipeptídeo sulfatado isolado que compreende o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de sete transmembranas.[00342] According to some fifth embodiments of the 6th aspect, which may or may not be the same as the first, second, third and/or fourth embodiments according to the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof (specifically) binds to a second isolated sulfated polypeptide comprising the tyrosine-rich domain (TRD) of a seven-transmembrane receptor.
[00343] Preferivelmente, o receptor de sete transmembranas do TRD compreendido pelo segundo polipeptídeo sulfatado isoladoa) é diferente do receptor de sete transmembranas do TRD compreendido pelo primeiro polipeptídeo sulfatado isolado, ou éb) os receptores de sete transmembranas correspondentes do TRD compreendidos pelo primeiro polipeptídeo sulfatado isolado, porém de uma espécie diferente.[00343] Preferably, the seven-transmembrane receptor of the TRD comprised by the second isolated sulfated polypeptide a) is different from the seven-transmembrane receptor of the TRD comprised by the first isolated sulfated polypeptide, or b) the corresponding seven-transmembrane receptors of the TRD comprised by the first isolated sulfated polypeptide, but of a different species.
[00344] De acordo com algumas modalidades preferidas, o segundo polipeptídeo sulfatado isolado que compreende o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de sete transmembranas é diferente do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado que compreende o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de sete transmembranas e é um po- lipeptídeo isolado com uma sequência de acordo com qualquer uma das modalidades A, B ou C de acordo com a terceira e/ou quarta modalidades do 6° aspecto. Por exemplo, o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado pode compreender o TRD de um receptor de sete trans- membranas de uma primeira espécie e o segundo polipeptídeo sulfatado isolado pode compreender o TRD de um receptor de sete trans- membranas de uma segunda espécie, preferivelmente em que as es-pécies são humanas e cinomolgos, ou humano e camundongo, ou humano e rato.[00344] According to some preferred embodiments, the second isolated sulfated polypeptide comprising the tyrosine-rich domain (TRD) of a seven-transmembrane receptor is different from the first isolated sulfated polypeptide comprising the tyrosine-rich domain (TRD) of a seven-transmembrane receptor and is an isolated polypeptide with a sequence according to any of the embodiments A, B, or C according to the third and/or fourth embodiments of the 6th aspect. For example, the first isolated sulfated polypeptide may comprise the TRD of a seven-transmembrane receptor of a first species and the second isolated sulfated polypeptide may comprise the TRD of a seven-transmembrane receptor of a second species, preferably wherein the species are humans and cynomolgus, or humans and mice, or humans and rats.
[00345] De acordo com algumas modalidades A da quinta modalidade do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento se liga especificamente a a) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:1 (CCR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, e um segundo polipeptí- deo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y10 e /ou Y18 foram sulfatados, oub) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:7 (CCR2_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD), preferi-velmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:13 (CCR3_humano_TRD), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD), prefe-rivelmente em que Y16 foi sulfatado, oud) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:19 (CCR4_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, oue) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:25 (CCR5_humano_TRD), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouf) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreen- dendo a SEQ ID NO:31 (CCR6_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, oug) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:37 (CCR7_humano_TRD), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados, e um segundo polipeptí- deo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD), preferivelmente em que um ou ambos Y8 e Y17 foram sulfatados, ouh) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oui) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foi sulfatado, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ouj) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:67 (CCR10_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos Y14 e Y22 foram sulfatados, ouk) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreen- dendo SEQ ID NO:73 (CXCR1_humano_TRD), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, oul) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:79 (CXCR2_humano_TRD), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, oum) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:85 (CXCR3_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos Y27 e Y29 foram sulfatados, oun) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:91 (CXCR4_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, e um segundo poli- peptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:92 (CXCR4_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y12 e /ou Y21 foram sulfatados, ouo) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados e um segundo poli- peptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:98 (CXCR5_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados, oup) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados e um se gundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatadosq) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:158(CX3CR1_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y20 foi sulfatado, our) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado.[00345] According to some embodiments of the fifth embodiment of the sixth aspect, the antibody or fragment binds specifically to a) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:1 (CCR1_human_TRD), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:2 (CCR1_MACFA_TRD), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:7 (CCR2_human_TRD), preferably in which at least Y26 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:8 (CCR2_MACMU_TRD), preferably in which at least Y26 has been sulfated, or c) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:13 (CCR3_human_TRD), preferably in which Y16 and/or Y17 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:14 (CCR3_MACFA_TRD), preferably in which Y16 has been sulfated, or d) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:19 (CCR4_human_TRD), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:20 (CCR4_MACFA_TRD), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or e) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:25 (CCR5_human_TRD), preferably in wherein two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:26 (CCR5_MACMU_TRD), preferably wherein two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, or f) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:31 (CCR6_humano_TRD), preferably wherein at least two or three of Y18, Y26, and Y27 were sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:32 (CCR6_MACFA_TRD), preferably wherein at least two or three of Y23, Y31, and Y32 were sulfated, or g) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:37 (CCR7_humano_TRD), preferably wherein one or both Y8 and Y17 were sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:38 (CCR7_MACFA_TRD), preferably in which one or both Y8 and Y17 were sulfated, or h) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 were sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 were sulfated, or i) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:61 (CCR9_humano_TRD), preferably also Y17 and/or Y37 were sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:62 (CCR9_MACFA_TRD), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 have been sulfated, or j) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:67 (CCR10_human_TRD), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:68 (CCR10_MACFA_TRD), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated, or k) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:73 (CXCR1_human_TRD), preferably in which Y27 has been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:74 (CXCR1_MACFA_TRD), preferably in which at least one of Y14 and Y28 has been sulfated, oul) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:79 (CXCR2_human_TRD), preferably wherein Y23 and/or Y25 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:80 (CXCR2_MACFA_TRD), preferably wherein Y20 and/or Y22 have been sulfated, oum) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:85 (CXCR3_human_TRD), preferably wherein at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:86 (CXCR3_MACFA_TRD), preferably wherein at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, oun) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:91 (CXCR4_human_TRD), preferably wherein at least Y12 and/or Y21 were sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:92 (CXCR4_MACFA_TRD), preferably in which at least Y12 and/or Y21 were sulfated, or a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:97 (CXCR5_humano_TRD), preferably in which at least one of Y3 and Y27 were sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:98 (CXCR5_MACFA_TRD), preferably in which at least one of Y3 and Y27 were sulfated, or a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:103 (CXCR6_humano_TRD), preferably in which at least one or both of Y6 and Y10 were sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:104 (CXCR6_MACFA_TRD), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 have been sulfated; or) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:157 (CX3CR1_humano_TRD), preferably in which at least Y14 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:158 (CX3CR1_MACFA_TRD), preferably in which at least Y20 has been sulfated; or) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:163 (CXCR1_humano_TRD), preferably in which at least Y27 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:164 (CXCR1_MACMU_TRD), preferably in which at least Y14 has been sulfated.
[00346] De acordo com algumas modalidades B da quinta modalidade do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento se liga especificamente aa) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:4 (CCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, e um segundo polipeptí- deo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados,b) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:10 (CCR2_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), pre-ferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado,c) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:16 (CCR3_humano_N term), preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que Y16 foi sulfatado,d) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:22 (CCR4_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados,e) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:28 (CCR5_humano_N term), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:29 (CCR5_ MACMU_N term), preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados,f) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:34 (CCR6_humano_N), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA _N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados,g) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:40 (CCR7_humano_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados e um segundo poli- peptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados,h) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), pre- ferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO: 47 (CCR8_MACFA_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados,i) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:64 (CCR9_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foi sulfatado,j) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:70 (CCR10_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados,k) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:76 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que Y27 foi sulfatado e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 tem foi sulfatado,l) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:82 (CXCR2_humano_N term), preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados,m) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compre- endendo a SEQ ID NO:88 (CXCR3_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos Y27 e Y29 foram sulfatados,h) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:94 (CXCR4_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados e um segundo po- lipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados,o) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:100 (CXCR5_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado e um segundo poli- peptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foi sulfatado, oup) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:106 (CXCR6_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouq) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferivelmente em que pelo menos Y20 ou Y22 tem sulfatado our) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreen- dendo a SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferivelmente em que pelo menos Y14 ou Y28 tem foi sulfatado.[00346] According to some embodiments B of the fifth embodiment of the 6th aspect, the antibody or fragment binds specifically to a) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:4 (CCR1_human_N term), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:5 (CCR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, b) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:10 (CCR2_human_N term), preferably in which at least Y26 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:11 (CCR2_MACMU_N term), preferably in which at least Y26 has been sulfated, c) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:16 (CCR3_human_N term), preferably in which Y16 and/or Y17 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:17 (CCR3_MACFA_N term), preferably in which Y16 has been sulfated, d) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:22 (CCR4_human_N term), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:23 (CCR4_MACFA_N term), preferably in which at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, e) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:28 (CCR5_human_N term), preferably in which two, three or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:29 (CCR5_MACMU_N term), preferably in which two, three, or all of Y3, Y10, Y14, and Y15 were sulfated, f) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:34 (CCR6_human_N), preferably in which at least two or three of Y18, Y26, and Y27 were sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:35 (CCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or three of Y23, Y31, and Y32 were sulfated, g) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:40 (CCR7_human_N term), preferably in which one or both of Y8 and Y17 were sulfated and a second poly- a) an isolated sulfated peptide comprising SEQ ID NO:41 (CCR7_MACFA_N term), preferably wherein one or both Y8 and Y17 have been sulfated; b) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:46 (CCR8_human_N term with C = X or S), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term with C = X or S), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated; c) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:64 (CCR9_human_N term), preferably wherein at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:64 (CCR9_human_N term), preferably wherein at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:64 (CCR8_human_N term). ID NO:65 (CCR9_MACFA_N term), preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 has been sulfated,j) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:70 (CCR10_human_N term), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:71 (CCR10_MACFA_N term), preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated,k) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:76 (CXCR1_human_N term), preferably in which Y27 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:77 (CXCR1_MACFA_N term), preferably in which at least one of Y14 and Y28 has been sulfated sulfated, l) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:82 (CXCR2_human_N term), preferably wherein Y23 and/or Y25 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:83 (CXCR2_MACFA_N term), preferably wherein Y20 and/or Y22 have been sulfated, m) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:88 (CXCR3_human_N term), preferably wherein at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:89 (CXCR3_MACFA_N term), preferably wherein at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, h) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:94 (CXCR4_human_N term), preferably wherein at least Y12 and/or Y21 have been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:95 (CXCR4_MACFA_N term), preferably wherein at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, o) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:100 (CXCR5_human_N term), preferably wherein at least one of Y3 and Y27 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:101 (CXCR5_MACFA_N term), preferably wherein at least one of Y3 and Y27 has been sulfated, oup) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:106 (CXCR6_human_N term), preferably wherein at least one or both of Y6 and Y10 have been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:107 (CXCR6_MACFA_N term), preferably in which at least two or all of Y4, Y7 and Y39 have been sulfated, or a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:160 (CX3CR1_humano_N term), preferably in which at least Y14 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:161 (CX3CR1_MACFA_N term), preferably in which at least Y20 or Y22 has been sulfated, or a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:166 (CXCR1_humano_N term), preferably in which at least Y27 has been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:167 (CXCR1_MACMU_N term), preferably in which at least Y14 or Y28 has been sulfated.
[00347] De acordo com algumas modalidades C1 das quintas modalidades do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento se liga especificamente a um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo uma sequência de acordo com algumas modalidades A das terceiras modalidades do 6° aspecto e se liga a um segundo polipeptídeo isolado polipeptídeo sulfatado compreendendo uma sequência de acordo com algumas modalidades B ou C das terceiras modalidades do 6° aspecto, em que preferivelmente o primeiro e o segundo polipep- tídeo compreendem o TRD do mesmo receptor, mas de espécies diferentes.[00347] According to some C1 embodiments of the fifth embodiments of the 6th aspect, the antibody or fragment binds specifically to a first isolated sulfated polypeptide comprising a sequence according to some A embodiments of the third embodiments of the 6th aspect and binds to a second isolated sulfated polypeptide comprising a sequence according to some B or C embodiments of the third embodiments of the 6th aspect, wherein preferably the first and second polypeptide comprise the TRD of the same receptor, but of different species.
[00348] De acordo com algumas modalidades C2 das quintas modalidades do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento se liga especificamente a um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo uma sequência de acordo com algumas modalidades A das quartas modalidades do 6° aspecto e se liga a um segundo polipeptídeo isolado polipeptídeo sulfatado compreendendo uma sequência de acordo com algumas modalidades B ou C da quarta modalidade do 6° aspecto, em que preferivelmente o primeiro e o segundo polipeptídeo compreendem o TRD do mesmo receptor, mas de espécies diferentes.[00348] According to some C2 embodiments of the fifth embodiments of the 6th aspect, the antibody or fragment binds specifically to a first isolated sulfated polypeptide comprising a sequence according to some A embodiments of the fourth embodiments of the 6th aspect and binds to a second isolated sulfated polypeptide comprising a sequence according to some B or C embodiments of the fourth embodiment of the 6th aspect, wherein preferably the first and second polypeptide comprise the TRD of the same receptor, but of different species.
[00349] De acordo com algumas sextas modalidades do 6° aspecto, que pode ser ou não igual à primeira, segunda, terceira, quarta e/ou quinta modalidades de acordo com o 6° aspecto, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antí- geno para a ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado e/ou para a ligação do referido receptor de sete transmembranas está abai- xo de 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM.[00349] According to some sixth embodiments of the 6th aspect, which may or may not be the same as the first, second, third, fourth and/or fifth embodiments according to the 6th aspect, the dissociation constant or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding the first isolated sulfated polypeptide and/or for binding said seven-transmembrane receptor is below 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM.
[00350] De acordo com algumas modalidades A das sextas modalidades do 6° aspecto, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado e/ou para a ligação do referido receptor de sete transmembranas está abaixo de 200 nM, 199 nM, 198 nM, 197 nM, 196 nM, 195 nM, 194 nM, 193 nM, 192 nM, 191 nM, 190nM, 189 nM, 188 nM, 187 nM, 186 nM, 185 nM, 184 nM, 183 nM, 182nM, 181 nM, 180 nM, 179 nM, 178 nM, 177 nM, 176 nM, 175 nM, 174nM, 173 nM, 172 nM, 171 nM, 170 nM,169 nM, 168 nM, 167 nM, 166nM, 165 nM, 164 nM, 163 nM, 162 nM, 161 nM, 160 nM, 159 nM, 158nM, 157 nM, 156 nM, 155 nM, 154 nM, 153 nM, 152 nM, 151 nM, 150nM, 149 nM, 148 nM, 147 nM, 146 nM, 145 nM, 144 nM, 143 nM, 142nM, 141 nM, 140 nM, 139 nM, 138 nM, 137 nM, 136 nM, 135 nM, 134nM, 133 nM,132 nM, 131 nM, 130 nM, 129 nM, 128 nM, 127 nM, 126nM, 125 nM, 124 nM, 123 nM, 122 nM, 121 nM, 120 nM, 119 nM, 118nM, 117 nM, 116 nM, 115 nM, 114 nM, 113 nM, 112 nM, 111 nM, 110nM, 109 nM, 108 nM, 107 nM, 106 nM, 105 nM, 104 nM, 103 nM, 102nM, 101 nM, 100 nM, 99 nM, 98 nM, 97 nM, 96 nM, 95 nM, 94 nM, 93 nM, 92 nM, 91 nM, 90 nM, 89 nM, 88 nM,87 nM, 86 nM, 85 nM, 84 nM, 83 nM, 82 nM, 81 nM, 80 nM, 79 nM, 78 nM, 77 nM,76 nM, 75 nM, 74 nM, 73 nM, 72 nM, 71 nM, 70 nM, 69 nM, 68 nM, 67 nM, 66 nM, 65nM, 64 nM, 63 nM, 62 nM, 61 nM, 60 nM, 59 nM, 58 nM, 57 nM, 56nM, 55 nM, 54 nM, 53 nM, 52 nM, 51 nM, 50 nM, 49 nM, 48 nM, 47nM, 46 nM, 45 nM, 44 nM, 43 nM, 42 nM, 41 nM, 40 nM, 39 nM, 38nM, 37 nM, 36 nM, 35 nM, 34 nM, 33 nM, 32 nM, 31 nM, 30 nM, 29nM, 28 nM, 27 nM, 26 nM, 25 nM, 24 nM, 23 nM, 22 nM, 21 nM, 20nM, 19 nM, 18 nM, 17 nM, 16 nM, 15 nM, 14 nM, 13 nM, 12 nM, 11nM, 10 nM, 9 nM, 8 nM, 7 nM, 6 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, 1 nM, 0,9 nM, 0,8 nM, 0,7 nM, 0,6 nM, 0,5 nM, 0,4 nM, 0,3 nM, 0,25 nM, 0,2 nM, 0,15 nM, ou 0,1 nM.[00350] According to some embodiments A of the sixth embodiments of the 6th aspect, the dissociation constant or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding the first isolated sulfated polypeptide and/or for binding said seven-transmembrane receptor is below 200 nM, 199 nM, 198 nM, 197 nM, 196 nM, 195 nM, 194 nM, 193 nM, 192 nM, 191 nM, 190 nM, 189 nM, 188 nM, 187 nM, 186 nM, 185 nM, 184 nM, 183 nM, 182 nM, 181 nM, 180 nM, 179 nM, 178 nM, 177 nM, 176 nM, 175 nM, 174nM, 173 nM, 172 nM, 171 nM, 170 nM,169 nM, 168 nM, 167 nM, 166nM, 165 nM, 164 nM, 163 nM, 162 nM, 161 nM, 160 nM, 159 nM, 158nM, 157 nM, 156 nM, 155 nM, 154 nM, 153 nM, 152 nM, 151 nM, 150nM, 149 nM, 148 nM, 147 nM, 146 nM, 145 nM, 144 nM, 143 nM, 142nM, 141 nM, 140 nM, 139 nM, 138 nM, 137 nM, 136 nM, 135 nM, 134nM, 133 nM,132 nM, 131 nM, 130 nM, 129 nM, 128 nM, 127 nM, 126nM, 125 nM, 124 nM, 123 nM, 122 nM, 121 nM, 120 nM, 119 nM, 118 nM, 117 nM, 116 nM, 115 nM, 114 nM, 113 nM, 112 nM, 111 nM, 110 nM, 109 nM, 108 nM, 107 nM, 106 nM, 105 nM, 104 nM, 103 nM, 102nM, 101 nM, 100 nM, 99 nM, 98 nM, 97 nM, 96 nM, 95 nM, 94 nM, 93 nM, 92 nM, 91 nM, 90 nM, 89 nM, 88 nM,87 nM, 86 nM, 85 nM, 84 nM, 83 nM, 82 nM, 81 nM, 80 nM, 79 nM, 78 nM, 77 nM, 76 nM, 75 nM, 74 nM, 73 nM, 72 nM, 71 nM, 70 nM, 69 nM, 68 nM, 67 nM, 66 nM, 65nM, 64nM, 63nM, 62nM, 61nM, 60nM, 59nM, 58nM, 57nM, 56nM, 55nM, 54nM, 53nM, 52nM, 51nM, 50nM, 49nM, 48nM, 47nM, 46 nM, 45 nM, 44 nM, 43 nM, 42 nM, 41 nM, 40 nM, 39 nM, 38 nM, 37 nM, 36 nM, 35 nM, 34 nM, 33 nM, 32 nM, 31 nM, 30 nM, 29 nM, 28 nM, 27 nM, 26 nM, 25 nM, 24 nM, 23 nM, 22 nM, 21 nM, 20nM, 19 nM, 18 nM, 17 nM, 16 nM, 15 nM, 14 nM, 13 nM, 12 nM, 11nM, 10 nM, 9 nM, 8 nM, 7 nM, 6 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, 1 nM, 0.9 nM, 0.8 nM, 0.7 nM, 0.6 nM, 0.5 nM, 0.4 nM, 0.3 nM, 0.25 nM, 0.2 nM, 0.15 nM, or 0.1 nM.
[00351] Preferivelmente, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado e/ou para o referido receptor de sete transmembranas está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM, 0,25 nM, 0,2 nM, 0,15 nM ou 0,1 nM.[00351] Preferably, the dissociation constant or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding the first isolated sulfated polypeptide and/or for said seven-transmembrane receptor is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM, 0.25 nM, 0.2 nM, 0.15 nM or 0.1 nM.
[00352] Preferivelmente, a EC50 pode ser determinada em células CHO que superexpressam o alvo. Como descrito, por exemplo, no Exemplo 10.1.1, os anticorpos obtidos com um método descrito aqui possuem afinidades excelentes para seus respectivos alvos. Por exemplo, TPP-21181, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360 e TPP-23411 ligaram CCR8 humano com uma EC50 de 4,8 nM, 1,7 nM, 0,8 nM, 0,6 nM, ~0,9 nM ou 1,7 nM em células CHO manipuladas para superexpressar CCR8. Além disso, TPP-21181, TPP- 17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360 e TPP-23411 ligaramCCR8 de cinomolgo com uma EC50 de 1,8 nM, 1 nM, 0,5 nM, 0,7 nM, ~0,55 nM ou 0,9 nM. Além disso, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206 e TPP-21360 ligaram-se às células T regulatórias humanas com uma EC50 de 25 nM, 15 nM, 23 nM ou 10 nM. Além disso, o anticorpo CCR8 antimurino TPP-14099 liga células CHO expressando CCR8 de murino com uma EC50 de 3 nM e iTregs murino com uma EC50 de 13,2 nM, conforme a Tabela 10.1.1.5.[00352] Preferably, the EC50 can be determined in CHO cells that overexpress the target. As described, for example, in Example 10.1.1, antibodies obtained with a method described herein have excellent affinities for their respective targets. For example, TPP-21181, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360, and TPP-23411 bound human CCR8 with an EC50 of 4.8 nM, 1.7 nM, 0.8 nM, 0.6 nM, ~0.9 nM, or 1.7 nM in CHO cells engineered to overexpress CCR8. Furthermore, TPP-21181, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360, and TPP-23411 bound cynomolgus CCR8 cells with an EC50 of 1.8 nM, 1 nM, 0.5 nM, 0.7 nM, ~0.55 nM, or 0.9 nM. Additionally, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, and TPP-21360 bound human regulatory T cells with an EC50 of 25 nM, 15 nM, 23 nM, or 10 nM. Furthermore, the anti-murine CCR8 antibody TPP-14099 binds murine CCR8-expressing CHO cells with an EC50 of 3 nM and murine iTregs with an EC50 of 13.2 nM, as shown in Table 10.1.1.5.
[00353] De acordo com algumas modalidades B das sextas modalidades do 6° aspecto, que podem ou não ser iguais às modalidades A das sextas modalidades do 6° aspecto, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo ou ligação ao antígeno fragmento para ligação do segundo polipeptídeo sulfatado isolado e/ou para ligação do segundo receptor de sete transmembranas está abaixo de 200 nM, 199 nM, 198 nM, 197 nM, 196 nM, 195 nM, 194 nM, 193 nM, 192 nM, 191 nM, 190 nM, 189 nM, 188 nM, 187 nM, 186 nM, 185 nM, 184 nM,183 nM, 182 nM, 181 nM, 180 nM, 180 nM, 179 nM, 178 nM, 177 nM,176 nM, 175 nM, 173 nM, 172 nM, 171 nM, 170 nM, 169 nM, 168 nM,167 nM, 166 nM, 165 nM, 164 nM, 163 nM, 162 nM, 161 nM, 160 nM,159 nM, 158 nM nM, 156 nM, 155 nM, 154 nM, 153 nM, 152 nM, 151 nM, 150 nM, 149 nM, 148 nM, 147 nM, 146 nM, 145 nM, 144 nM, 143nM, 142 nM, 141 nM, 140 nM, 139 nM, 138 nM, 137 nM, 136 nM, 135nM, 134 nM, 133 nM, 132 nM, 131 nM, 130 nM, 129 nM, 128 nM, 127nM, 126 nM, 125 nM, 124 nM, 123n M, 122 nM, 121 nM, 120 nM, 119nM, 118 nM, 117 nM, 116 nM, 115 nM, 114 nM, 113 nM, 112 nM, 111nM, 110 nM, 109 nM, 108 nM, 107 nM, 106 nM, 105 nM, 104 nM, 103nM, 102 nM, 101 nM, 100 nM, 99 nM, 98 nM, 97 nM, 96 nM, 95 nM, 94 nM, 93 nM, 92 nM, 91 nM, 90 nM, 89 nM, 88 nM, 87 nM, 86 nM, 85nM, 84 nM, 83 nM, 82 nM, 82 nM, 81 nM, 80 nM, 79 nM, 78 nM, 77nM, 76 nM, 75 nM, 74 nM, 73 nM, 72 nM, 71 nM, 70 nM, 69 nM, 68nM, 67 nM, 66 nM, 65 nM, 64 nM, 64 nM, 63 nM, 62 nM, 61 nM, 60nM, 59 nM, 58 nM, 57 nM, 56 nM, 55 nM, 54 nM, 53 nM, 52 nM, 51nM, 50 nM, 49 nM, 48 nM, 47 nM, 46 nM, 45 nM, 44 nM, 43 nM, 42nM, 41 nM, 40 nM, 39 nM, 38 nM, 37 nM, 36 nM, 35 nM, 34 nM, 33nM, 32 nM, 31 nM, 30 nM, 29 nM, 28 nM, 27 nM, 26 nM, 25 nM, 24nM, 23 nM, 22 nM, 21 nM, 20 nM, 19 nM, 18 nM, 17 nM, 16 nM, 15nM, 14 nM, 14 nM, 13 nM, 12 nM, 11 nM, 10 nM, 9 nM, 8 nM, 7 nM, 6 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, 1 nM, 0,9 nM, 0,8 nM, 0,7 nM, 0,6 nM, 0,6 nM, 0,5 nM, 0,4 nM, 0,3 nM, 0,25 nM, 0,2 nM, 0,15 nM ou 0,1 nM.[00353] According to some B embodiments of the sixth embodiments of the 6th aspect, which may or may not be the same as the A embodiments of the sixth embodiments of the 6th aspect, the dissociation constant or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding of the second isolated sulfated polypeptide and/or for binding of the second seven-transmembrane receptor is below 200 nM, 199 nM, 198 nM, 197 nM, 196 nM, 195 nM, 194 nM, 193 nM, 192 nM, 191 nM, 190 nM, 189 nM, 188 nM, 187 nM, 186 nM, 185 nM, 184 nM, 183 nM, 182 nM, 181 nM, 180 nM, 180 nM, 179 nM, 178 nM, 177 nM,176 nM, 175 nM, 173 nM, 172 nM, 171 nM, 170 nM, 169 nM, 168 nM, 167 nM, 166 nM, 165 nM, 164 nM, 163 nM, 162 nM, 161 nM, 160 nM,159 nM, 158 nM, 156 nM, 155 nM, 154 nM, 153 nM, 152 nM, 151 nM, 150 nM, 149 nM, 148 nM, 147 nM, 146 nM, 145 nM, 144 nM, 143nM, 142 nM, 141 nM, 140 nM, 139 nM, 138 nM, 137 nM, 136 nM, 135nM, 134 nM, 133 nM, 132 nM, 131 nM, 130 nM, 129 nM, 128 nM, 127nM, 126 nM, 125 nM, 124 nM, 123nM, 122 nM, 121 nM, 120 nM, 119nM, 118 nM, 117 nM, 116 nM, 115 nM, 114 nM, 113 nM, 112 nM, 111nM, 110 nM, 109nM, 108nM, 107 nM, 106 nM, 105 nM, 104 nM, 103nM, 102 nM, 101 nM, 100 nM, 99 nM, 98 nM, 97 nM, 96 nM, 95 nM, 94 nM, 93 nM, 92 nM, 91 nM, 90 nM, 89 nM, 88 nM, 87 nM, 86 nM, 85 nM, 84 nM, 83 nM, 82 nM, 82 nM, 81 nM, 80 nM, 79 nM, 78 nM, 77 nM, 76 nM, 75 nM, 74 nM, 73 nM, 72 nM, 71 nM, 70 nM, 69 nM, 68nM, 67nM, 66nM, 65nM, 64nM, 64nM, 63nM, 62nM, 61nM, 60nM, 59nM, 58nM, 57nM, 56nM, 55nM, 54nM, 53nM, 52nM, 51nM, 50 nM, 49 nM, 48 nM, 47 nM, 46 nM, 45 nM, 44 nM, 43 nM, 42nM, 41 nM, 40 nM, 39 nM, 38 nM, 37 nM, 36 nM, 35 nM, 34 nM, 33nM, 32 nM, 31 nM, 30 nM, 29 nM, 28 nM, 27 nM, 26 nM, 25 nM, 24nM, 23 nM, 22 nM, 21 nM, 20 nM, 19 nM, 18 nM, 17 nM, 16 nM, 15nM, 14 nM, 14 nM, 13 nM, 12 nM, 11 nM, 10 nM, 9 nM, 8 nM, 7 nM, 6 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, 1 nM, 0.9 nM, 0.8 nM, 0.7 nM, 0.6 nM, 0.6 nM, 0.5 nM, 0.4 nM, 0.3 nM, 0.25 nM, 0.2nM, 0.15nM or 0.1 nM.
[00354] Preferivelmente, a constante de dissociação (KD) ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a ligação do segundo polipeptídeo sulfatado isolado e/ou para a ligação do segundo receptor de sete transmembranas está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM.[00354] Preferably, the dissociation constant (KD) or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding the second isolated sulfated polypeptide and/or for binding the second seven-transmembrane receptor is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM.
[00355] De acordo com algumas modalidades AB da sexta moda- lidade do 6° aspecto, a constante de dissociação (KD) ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado e/ou do primeiro receptor de sete transmembranas está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM e a constante de dissociação (KD) ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligar o segundo polipeptídeo sulfatado isolado e/ou o segundo receptor de sete transmembranas está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM.[00355] According to some AB embodiments of the sixth embodiment of the 6th aspect, the dissociation constant (KD) or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding the first isolated sulfated polypeptide and/or the first seven-transmembrane receptor is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM and the dissociation constant (KD) or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding the second isolated sulfated polypeptide and/or the second seven-transmembrane receptor is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM.
[00356] De acordo com algumas sétimas modalidades do 6° aspecto, que pode ser ou não igual à primeira, segunda, terceira, quarta, quinta e/ou sexta modalidades de acordo com o 6° aspecto, a constante de dissociação (KD) do anticorpo para a ligação do primeiro polipep- tídeo sulfatado isolado está abaixo da constante de dissociação (KD) do anticorpo para a ligação de um primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado com a mesma sequência que o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado. Preferivelmente, o anticorpo não se liga substancialmente a um primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado com a mesma sequência que o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado.[00356] According to some seventh embodiments of the 6th aspect, which may or may not be the same as the first, second, third, fourth, fifth and/or sixth embodiments according to the 6th aspect, the antibody dissociation constant (KD) for binding the first isolated sulfated polypeptide is below the antibody dissociation constant (KD) for binding a first isolated non-sulfated polypeptide with the same sequence as the first isolated sulfated polypeptide. Preferably, the antibody does not substantially bind to a first isolated non-sulfated polypeptide with the same sequence as the first isolated sulfated polypeptide.
[00357] De acordo com algumas modalidades A das sétimas modalidades do 6° aspecto, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo para a ligação do primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 100 nM, 150 nM, 200 nM, 250 nM, 300 nM, 350 nM, 400 nM, 450 nM, 500 nM, 600 nM, 700 nM, 800 nM, 900 nM, 1 μM, 1,25 μM, 1,5 μM, 1,75 μM, 2 μM, 2,25 μM, ou 2,5 μM, 2,75 μM 3 μM, ou não é detectável. Preferivelmente, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo para a ligação do primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 100 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM ou 3 μM, ou não é detectável.[00357] According to some embodiments A of the seventh embodiments of the 6th aspect, the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding the first isolated non-sulfated polypeptide is greater than 100 nM, 150 nM, 200 nM, 250 nM, 300 nM, 350 nM, 400 nM, 450 nM, 500 nM, 600 nM, 700 nM, 800 nM, 900 nM, 1 μM, 1.25 μM, 1.5 μM, 1.75 μM, 2 μM, 2.25 μM, or 2.5 μM, 2.75 μM 3 μM, or is not detectable. Preferably, the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding the first isolated non-sulfated polypeptide is greater than 100 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM, or 3 μM, or it is not detectable.
[00358] De acordo com algumas modalidades B das sétimas modalidades do 6° aspecto, que podem ser as mesmas que as modali- dades A das sétimas modalidades do 6° aspecto, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo ou fragmento para ligação do primeiro isolado polipeptídeo sulfatado é menor do que 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM, e a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo ou fragmento para ligação do primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 250 nM ou 500 nM, ou não é detectável.[00358] According to some embodiments B of the seventh embodiments of the 6th aspect, which may be the same as the embodiments A of the seventh embodiments of the 6th aspect, the dissociation constant or EC50 of the antibody or fragment for binding the first isolated sulfated polypeptide is less than 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM, and the dissociation constant or EC50 of the antibody or fragment for binding the first isolated non-sulfated polypeptide is greater than 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 250 nM or 500 nM, or is not detectable.
[00359] O anticorpo de acordo com o 6° aspecto pode compreender CDRs derivadas de humano, macaco, macaca fascicularis (macaco cinomolgo), macaca mulata (macaco rhesus), roedor, camundongo, rato, cavalo, bovino, porco, cachorro, gato e camelo. Preferivelmente, o anticorpo de acordo com o 6° aspecto compreende CDRs derivadas de humanos, ratos ou camundongos.[00359] The antibody according to aspect 6 may comprise CDRs derived from human, monkey, Macaca fascicularis (cynomolgus monkey), Macaca mulatta (rhesus monkey), rodent, mouse, rat, horse, bovine, pig, dog, cat and camel. Preferably, the antibody according to aspect 6 comprises CDRs derived from humans, rats or mice.
[00360] De acordo com algumas 8a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridos serem combinados com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta e/ou sétima modalidades do sexto aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antíge- no compreende CDRs derivadas de humanos. De acordo com algumas modalidades altamente preferidas, as CDRs derivadas de humanos não compreendem desvios ou menos de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 ou 15 desvios da linhagem germinativa humana mais próxima. A linhagem germinativa humana mais próxima pode ser determinada como conhecido na técnica, por exemplo, in silico usando IgBLAST (Ye, Jian, et al. "IgBLAST: an immunoglobulin variable domain sequence analysis tool." Nucleic acids research 41.W1 (2013): W34-W40.) com dados recuperados do banco de dados de linhagem germinativa humana IMGT. Os anticorpos de acordo com estas 8a modalidades podem ser obtidos como descrito, por exemplo, no Exemplo 6 ou 8, ou como descrito em outro lugar aqui.[00360] According to some 8a embodiments of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth and/or seventh embodiments of the sixth aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises human-derived CDRs. According to some highly preferred embodiments, the human-derived CDRs do not comprise deviations or less than 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 or 15 deviations from the nearest human germline. The closest human germline can be determined as known in the art, for example, in silico using IgBLAST (Ye, Jian, et al. "IgBLAST: an immunoglobulin variable domain sequence analysis tool." Nucleic acids research 41.W1 (2013): W34-W40.) with data retrieved from the IMGT human germline database. Antibodies according to these 8a embodiments can be obtained as described, for example, in Example 6 or 8, or as described elsewhere herein.
[00361] De acordo com algumas 9a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridas para serem combinadas com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima ou 8a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para humanos e cinomolgos, conforme o Exemplo 10.1.1. Preferivelmente, a constante de dissociação (KD) ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a ligação de um receptor de quimiocina humano é menor do que 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM, tal como abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM. Preferivelmente, a constante de dissociação (KD) ou a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação a um receptor de quimiocina de cinomolgo é menor do que 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM.[00361] According to some 9th embodiments of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth, seventh or 8th embodiments of the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive for humans and cynomolgus, as per Example 10.1.1. Preferably, the dissociation constant (KD) or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to a human chemokine receptor is less than 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM, such as below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM. Preferably, the dissociation constant (KD) or EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to a cynomolgus chemokine receptor is less than 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5, or 0.25 nM.
[00362] De acordo com algumas 10a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, 8a e/ou 9a modalidades da 6a aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno é caracterizado por uma região HCDR3 que se desvia em composição das regiões HCDR3 médias. Preferivelmente, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno é caracterizado por uma região HCDR3 compreendendo entre 10 e 34% de tirosina e/ou pelo menos uma histidina, preferivelmente entre 2 e 20% de histidina, mais preferivelmente entre 7 e 20% de histidina.[00362] According to some 10a embodiments of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth, seventh, eighth and/or ninth embodiments of the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment is characterized by an HCD3 region that deviates in composition from the average HCD3 regions. Preferably, the isolated antibody or antigen-binding fragment is characterized by an HCD3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or at least one histidine, preferably between 2 and 20% histidine, more preferably between 7 and 20% histidine.
[00363] Em algumas modalidades A das 10a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 coma) > 0 e < 35 %, > 8 e < 34 %, > 10 e < 34 %, ou > 15 e < 31 % de resíduos de tirosina (Y), e/oub) > 0 e < 16%, > 2 e < 20% ou > 7 e < 20% de resíduos de histidina (H), ec) preferivelmente > 0 e < 18%, > 7 e < 10% ou > 0 e < 7% de resíduos de arginina (R), e/oud) preferivelmente > 0 e < 25%, > 7 e < 16% ou > 7 e < 13% de resíduos de ácido aspártico (D), e/oue) preferivelmente sem resíduos de lisina (K), e/ouf) preferivelmente sem resíduos de ácido glutâmico (E).[00363] In some embodiments of the 10 embodiments of aspect 6, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCDR3 with a) > 0 and < 35%, > 8 and < 34%, > 10 and < 34%, or > 15 and < 31% of tyrosine (Y) residues, and/or b) > 0 and < 16%, > 2 and < 20%, or > 7 and < 20% of histidine (H) residues, and/or c) preferably > 0 and < 18%, > 7 and < 10%, or > 0 and < 7% of arginine (R) residues, and/or d) preferably > 0 and < 25%, > 7 and < 16%, or > 7 and < 13% of aspartic acid (D) residues, and/or e) preferably without lysine residues (K), and/or (E) preferably without glutamic acid residues.
[00364] Em algumas modalidades B das 10a modalidades do 6° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das modalidades A, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende uma HCDR3 coma) > 0 e < 47 %, > 22 e < 50 %, > 10 e < 34 %, ou > 15 e < 47 % de aminoácidos carregados, e/oub) > 0 e < 32 %, > 8 e < 30 %, ou > 10 e < 37 % de aminoá- cidos carregados positivamente, e/ouc) > 0 e < 26 %, > 7 e < 16 %, ou > 7 e < 14 % de aminoá- cidos carregados negativamente.[00364] In some embodiments B of the 10 embodiments of aspect 6, which may be the same as or different from embodiments A, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with a) > 0 and < 47%, > 22 and < 50%, > 10 and < 34%, or > 15 and < 47% of charged amino acids, and/or b) > 0 and < 32%, > 8 and < 30%, or > 10 and < 37% of positively charged amino acids, and/or c) > 0 and < 26%, > 7 and < 16%, or > 7 and < 14% of negatively charged amino acids.
[00365] Em algumas modalidades C das 10a modalidades do 6° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das modalidades A e/ou B, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende uma HCDR3 com > 0 e < 42%, > 10 e < 42 % ou > 36 e < 43 % de resíduos de histidina e tirosina no total.[00365] In some C embodiments of the 10a embodiments of aspect 6, which may be the same as or different from embodiments A and/or B, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCD3 with > 0 and < 42%, > 10 and < 42%, or > 36 and < 43% of total histidine and tyrosine residues.
[00366] Cada uma das modalidades e descrições descritas para CCR8, de acordo com o aspecto 10, é descrita aqui para anticorpos do receptor de quimiocina em geral, por exemplo, com as alterações necessárias. Os inventores acreditam que o motif TRD sulfatado em vez da sequência de CCR8 específica promove o aumento das frequências de tirosina e/ou histidina.[00366] Each of the embodiments and descriptions described for CCR8, according to aspect 10, is described here for chemokine receptor antibodies in general, for example, with the necessary modifications. The inventors believe that the sulfated TRD motif instead of the specific CCR8 sequence promotes increased tyrosine and/or histidine frequencies.
[00367] De acordo com algumas 11a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, oitava, nona e/ou 10a modalidades das 6 aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de liga ção ao antígeno pelo menos parcialmente modula a sinalização CCR8.[00367] According to some 11th modalities of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth, seventh, eighth, ninth and/or 10th modalities of the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment at least partially modulates CCR8 signaling.
[00368] Por exemplo, um anticorpo de acordo com a presente invenção podea) bloquear a sinalização independente da proteína G e/ou b) bloquear a sinalização dependente da proteína G e/ou c) bloquear a sinalização dependente de proteína G e independente de proteína G, e/oud) aumentar a sinalização independente da proteína G e/oue) aumentar a sinalização dependente da proteína G e/ouf) aumentar a sinalização dependente da proteína G e independente da proteína G.[00368] For example, an antibody according to the present invention can a) block G protein-independent signaling and/or b) block G protein-dependent signaling and/or c) block both G protein-dependent and G protein-independent signaling, and/or d) increase G protein-independent signaling and/or e) increase G protein-dependent signaling and/or f) increase both G protein-dependent and G protein-independent signaling.
[00369] No contexto particular, a modulação refere-se ao bloqueio da sinalização independente da proteína G induzida pelo ligante e indução da sinalização independente da proteína G.[00369] In this particular context, modulation refers to the blocking of ligand-induced G protein-independent signaling and the induction of G protein-independent signaling.
[00370] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento não modula a sinalização independente da proteína G do receptor de sete transmembranas. De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento não bloqueia a sinalização independente da proteína G induzida por ligante da proteína alvo. De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento não induz sinalização independente da proteína G.[00370] According to some preferred embodiments, the antibody or fragment does not modulate G protein-independent signaling of the seven-transmembrane receptor. According to some preferred embodiments, the antibody or fragment does not block ligand-induced G protein-independent signaling of the target protein. According to some preferred embodiments, the antibody or fragment does not induce G protein-independent signaling.
[00371] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento bloqueia a sinalização dependente da proteína G. A sinalização dependente da proteína G pode ser analisada por ensaio de quimiotaxia ou preferivelmente por ensaio de fluxo de cálcio, como descrito em outro lugar aqui.[00371] According to some preferred embodiments, the antibody or fragment blocks G protein-dependent signaling. G protein-dependent signaling can be analyzed by chemotaxis assay or preferably by calcium flux assay, as described elsewhere here.
[00372] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento bloqueia a sinalização dependente da proteína G do receptor de quimiocina, mas não bloqueia a sinalização independente da proteína G do receptor de quimiocina, conforme Exemplo 10.4. A sinalização independente da proteína G do receptor de quimiocina é qualquer atividade de sinalização que não seja sinalização dependente da proteína G.[00372] According to some preferred embodiments, the antibody or fragment blocks chemokine receptor G protein-dependent signaling, but does not block chemokine receptor G protein-independent signaling, as per Example 10.4. Chemokine receptor G protein-independent signaling is any signaling activity that is not G protein-dependent signaling.
[00373] De acordo com algumas 12a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, 8a, 9a, 10a e 11a modalidades de no 6° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de baixa internalização ou não internalização.[00373] According to some 12th modalities of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth, seventh, eighth, ninth, tenth and eleventh modalities of the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment is a low-internalization or non-internalization antibody or antigen-binding fragment.
[00374] Visto que a superexpressão pode afetar o comportamento de internalização e é menos adequada para modelar a internalização em um ambiente terapêutico, a internalização é preferivelmente determinada usando uma linhagem celular modelo com expressão endógena do receptor de quimiocina alvo, conforme o Exemplo 10.5. Por exemplo, a internalização pode ser determinada ao longo de um período de tempo ou para pontos de tempo específicos. Preferivelmente, a internalização pode ser determinada após 15 min, 30 min, 1h, 2h, 3h, 6h, 12h, 24h ou 48h em uma célula que expressa endogenamente o alvo.[00374] Since overexpression can affect internalization behavior and is less suitable for modeling internalization in a therapeutic setting, internalization is preferably determined using a model cell line with endogenous expression of the target chemokine receptor, as in Example 10.5. For example, internalization can be determined over a period of time or for specific time points. Preferably, internalization can be determined after 15 min, 30 min, 1 h, 2 h, 3 h, 6 h, 12 h, 24 h, or 48 h in a cell endogenously expressing the target.
[00375] De acordo com algumas modalidades A das 12a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antíge- no tem uma taxa de internalização na mesma ordem de grandeza que a taxa de internalização do controle de isotipo.[00375] According to some of the 12a modalities of the 6th aspect, the antibody or antigen-binding fragment has an internalization rate of the same order of magnitude as the internalization rate of the isotype control.
[00376] De acordo com algumas modalidades B das 12a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antíge- no é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão alvo endógena que é menor do que 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, ou 10 vezes da internalização do controle do isotipo. O controle de isotipo para um anticorpo pode ser selecionado como conhecido na técnica para corresponder ao isotipo do anticorpo o mais próximo possível, mas sem ligação ao alvo.[00376] According to some embodiments B of the 12a embodiments of aspect 6, the antibody or antigen-binding fragment is characterized by internalization into a cell with endogenous target expression that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, or 10 times the internalization of the isotype control. The isotype control for an antibody may be selected as known in the art to match the antibody isotype as closely as possible, but without binding to the target.
[00377] De acordo com algumas modalidades C das 12a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antíge- no é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão alvo endógena que é menor do que 150%, 175%, 200%, 300%, 400 % ou 500% da internalização do controle de isotipo, por exemplo, após 15 min, 30 min, 1h, 2h, 3h, 6h, 12h, 24h ou 48h.[00377] According to some C modalities of the 12a modalities of the 6th aspect, the antibody or antigen-binding fragment is characterized by an internalization in a cell with endogenous target expression that is less than 150%, 175%, 200%, 300%, 400%, or 500% of the internalization of the isotype control, for example, after 15 min, 30 min, 1h, 2h, 3h, 6h, 12h, 24h, or 48h.
[00378] De acordo com algumas 13a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, 8°, 9°, 10°, 11° e / ou 12a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno induz ADCC e/ou ADCP de células que expressam o receptor alvo do anticorpo.[00378] According to some 13th embodiments of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth, seventh, eighth, ninth, tenth, eleventh and/or twelfth embodiments of the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment induces ADCC and/or ADCP of cells expressing the antibody's target receptor.
[00379] Em algumas modalidades preferidas das 13a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é fu- cosilado.[00379] In some preferred embodiments of the 13 embodiments of aspect 6, the antibody or antigen-binding fragment is fucosylated.
[00380] Em algumas modalidades A1 das 13a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga ao receptor gama Fc humano IIIA variante V176 (CD16a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM ou 200 nM. Preferivelmente, o KD pode ser determinado usando ressonância de plasmônio de superfície.[00380] In some A1 embodiments of the 13a embodiments of aspect 6, the antibody or antigen-binding fragment binds to the human Fc gamma receptor IIIA variant V176 (CD16a) with a dissociation constant (KD) less than 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM, or 200 nM. Preferably, the KD can be determined using surface plasmon resonance.
[00381] Em algumas modalidades B1 das 13a modalidades do 6° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das modalidades A1, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam o receptor alvo através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas. A indução de ADCC pode ser analisada com um ensaio conhecido na técnica, por exemplo, como descrito de acordo com os Exemplos 10.3.3 ff. ou em outro lugar aqui. Preferivelmente, o ensaio é realizado com células Treg em que pelo menos 80% ou 85% das células Treg expressam CCR8.[00381] In some B1 embodiments of the 13a embodiments of aspect 6, which may be the same as or different from A1 embodiments, the antibody or antigen-binding fragment induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing the target receptor via human effector cells, such as human NK cells. ADCC induction can be analyzed with an assay known in the art, for example, as described in Examples 10.3.3 ff. or elsewhere herein. Preferably, the assay is performed with Treg cells in which at least 80% or 85% of the Treg cells express CCR8.
[00382] Em algumas modalidades C1 das 13a modalidades do 6° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das modalidades A1 ou B1, a depleção máxima induzida por ADCC de células que expressam o receptor alvo é de pelo menos 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% ou 99%.[00382] In some C1 modalities of the 13 modalities of the 6th aspect, which may be the same as or different from the A1 or B1 modalities, the maximum ADCC-induced depletion of cells expressing the target receptor is at least 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, or 99%.
[00383] Em algumas modalidades D1 da 13a modalidade do 6° aspecto, que pode ser igual ou diferente das modalidades A1, B1 ou C1 , a EC50 para a depleção induzida por ADCC de células que expressam alvo é menor do que 500 pM, 400 pM, 300 pM, 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 20 pM, 12,5 pM, 10 pM, 5 pM ou 2,5 pM.[00383] In some D1 modalities of the 13th modality of the 6th aspect, which may be the same as or different from modalities A1, B1 or C1, the EC50 for ADCC-induced depletion of target-expressing cells is less than 500 pM, 400 pM, 300 pM, 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 20 pM, 12.5 pM, 10 pM, 5 pM or 2.5 pM.
[00384] Em algumas modalidades A2 das 13a modalidades do 6° aspecto, que podem ou não ser iguais às modalidades A1, B1, C1 e/ou D1, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga ao Fc gama RIIA humano (CD32a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM ou 1 μM.[00384] In some A2 embodiments of the 13a embodiments of aspect 6, which may or may not be the same as embodiments A1, B1, C1 and/or D1, the antibody or antigen-binding fragment binds to human Fc gamma RIIA (CD32a) with a dissociation constant (KD) less than 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM or 1 μM.
[00385] Em algumas modalidades B2 das 13a modalidades do 6° aspecto, que podem ser iguais às modalidades A1, B1, C1 e/ou D1, e que podem ser iguais às modalidades A2, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células que expressam o receptor alvo através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos. Por exemplo, os macrófagos humanos podem ser macrófagos M2 ou M1.[00385] In some B2 embodiments of the 13th embodiment of aspect 6, which may be the same as A1, B1, C1 and/or D1 embodiments, and which may be the same as A2 embodiments, the antibody or antigen-binding fragment induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in cells expressing the target receptor via human effector cells, such as human macrophages. For example, human macrophages may be M2 or M1 macrophages.
[00386] Em algumas modalidades C2 das 13a modalidades do 6° aspecto, que podem ser iguais às modalidades A1, B1, C1 e/ou D1, e que podem ser iguais às modalidades A2 e/ou B2, o ADCP- a deple- ção máxima induzida de células que expressam o receptor alvo é de pelo menos 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40 ou 50%.[00386] In some C2 modalities of the 13 modalities of the 6th aspect, which may be the same as modalities A1, B1, C1 and/or D1, and which may be the same as modalities A2 and/or B2, the ADCP - the maximum induced depletion of cells expressing the target receptor is at least 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40 or 50%.
[00387] Em algumas modalidades D2 das 13a modalidades do 6 aspecto, que podem ser iguais às modalidades A1, B1, C1 e/ou D1, e que podem ser iguais às modalidades A2, B2 e/ou C2, a EC50 para a depleção induzida por ADCP de células T regulatórias humanas ativadas está abaixo de 1500 pM, 1000 pM, 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM, 25 pM ou 10 pM.[00387] In some D2 modalities of the 13a modalities of aspect 6, which may be the same as modalities A1, B1, C1 and/or D1, and which may be the same as modalities A2, B2 and/or C2, the EC50 for ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is below 1500 pM, 1000 pM, 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM, 25 pM or 10 pM.
[00388] Em algumas modalidades preferidas das 13a modalidades do 6° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligando-se especificamente a um receptor de quimiocina, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antíge- noa) liga-se ao receptor gama Fc humano IIIA variante V176 (CD16a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM ou 200 nM e/oub) liga-se ao Fc gama RIIA humano (CD32a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM ou 1 μM.[00388] In some preferred embodiments of the 13 embodiments of aspect 6, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, specifically binding to a chemokine receptor, wherein the antibody or antigen-binding fragment a) binds to human Fc gamma receptor IIIA variant V176 (CD16a) with a dissociation constant (KD) less than 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM or 200 nM and/or b) binds to human Fc gamma receptor RIIA (CD32a) with a dissociation constant (KD) less than 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM or 1 μM.
[00389] Em algumas modalidades preferidas das 13amodalidades do 6° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligando-se especificamente a um receptor de quimiocina, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam o receptor de qui- miocina humana através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas e/oub) induz fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células alvo que expressam o receptor de quimio- cina humana através de células efetoras humanas, tais como macró- fagos humanos.[00389] In some preferred embodiments of the 13 embodiments of aspect 6, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, specifically binding to a chemokine receptor, wherein the antibody or antigen-binding fragment a) induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing the human chemokine receptor via human effector cells, such as human NK cells and/or b) induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing the human chemokine receptor via human effector cells, such as human macrophages.
[00390] Em algumas modalidades preferidas das 13a modalidades do 6° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligando-se especificamente a um receptor de quimiocina, em quea) a depleção máxima induzida por ADCC em células alvo que expressam o receptor de quimiocina humana é de pelo menos 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% ou 99%, e/oub) a depleção máxima induzida por ADCP em células alvo que expressam o receptor de quimiocina humana é de pelo menos 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% ou 50%, e/ouc) a depleção máxima de células alvo que expressam o receptor de quimiocina humana é de pelo menos 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% ou 99%.[00390] In some preferred embodiments of the 13 embodiments of aspect 6, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, specifically binding to a chemokine receptor, wherein a) the maximum ADCC-induced depletion in target cells expressing the human chemokine receptor is at least 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% or 99%, and/or b) the maximum ADCP-induced depletion in target cells expressing the human chemokine receptor is at least 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% or 50%, and/or c) the maximum depletion of target cells expressing the chemokine receptor The human percentage is at least 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, or 99%.
[00391] Em algumas modalidades preferidas das 13a modalidades do 6° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligando-se especificamente a um receptor de quimiocina, em quea) a EC50 para a depleção induzida por ADCC de células alvo que expressam o receptor de quimiocina humana é menor do que 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12,5 pM, 10 pM ou 5 pM e/oub) a EC50 para a depleção induzida por ADCP de células alvo que expressam o receptor de quimiocina humano é menor do que 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM ou 25 pM.[00391] In some preferred embodiments of the 13th embodiment of aspect 6, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, specifically binding to a chemokine receptor, wherein a) the EC50 for ADCC-induced depletion of target cells expressing the human chemokine receptor is less than 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12.5 pM, 10 pM or 5 pM and/or b) the EC50 for ADCP-induced depletion of target cells expressing the human chemokine receptor is less than 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM or 25 pM.
[00392] De acordo com algumas 14a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, 8a, 9a, 10a, 11a, 12a e/ou 13a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um anticorpo IgG humano, de rato ou murino, preferivelmente um anticorpo IgG1 humano ou um anticorpo IgG2a murino, conforme Exemplo 6 e 8.[00392] According to some 14 embodiments of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth, seventh, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th and/or 13th embodiments of the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises a human, mouse or murine IgG antibody, preferably a human IgG1 antibody or a murine IgG2a antibody, as per Examples 6 and 8.
[00393] De acordo com algumas 15a modalidades do 6° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com a primeira, segunda, terceira, quarta, quinta, sexta, sétima, 8a, 9a, 10a, 11a, 12a 13a e/ou 14a modalidades do 6° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno é um fragmento scFv, Fab, Fab' ou F(ab')2, conforme o Exemplo 6.[00393] According to some 15th embodiments of the 6th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second, third, fourth, fifth, sixth, seventh, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th and/or 14th embodiments of the 6th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment is an scFv, Fab, Fab' or F(ab')2 fragment, as per Example 6.
[00394] Os anticorpos de acordo com o aspecto atual podem ser conjugados, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui. Os anticorpos de acordo com o aspecto atual podem ser usados no tratamento de um tumor ou uma doença caracterizada pelo envolvimento de células que expressam o receptor de sete transmembranas, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui.[00394] Antibodies according to the current aspect can be conjugated, for example, as described elsewhere here. Antibodies according to the current aspect can be used in the treatment of a tumor or a disease characterized by the involvement of cells expressing the seven-transmembrane receptor, for example, as described elsewhere here.
[00395] Os anticorpos de acordo com o aspecto atual podem ser usados como um agente de diagnóstico in vivo ou in vitro, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui. Além disso, é fornecido um kit compreendendo um anticorpo de acordo com o aspecto atual com instruções de uso.[00395] Antibodies according to the current aspect can be used as a diagnostic agent in vivo or in vitro, for example, as described elsewhere herein. In addition, a kit comprising one antibody according to the current aspect with instructions for use is provided.
[00396] As seguintes modalidades descrevem combinações preferidas do sexto aspecto, enfatizando assim a natureza modular da invenção. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida I, um anti-corpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente a um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado que compreende o domínio rico em tirosina (TRD) de um receptor de sete transmembranas e, opcionalmente, seu domínio LID, em que pelo menos 25%, pelo menos 50% ou pelo menos 75% dos resíduos de tirosi- na do TRD são sulfatados. É fornecido, de acordo com uma modalidade II preferida, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antíge- no de acordo com a modalidade I preferida, em que a cisteína entre o TRD e o domínio LID foi removida ou foi trocada por um aminoácido diferente. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferivel III, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com a modalidade preferida I ou II, em que o receptor de sete transmem- branas é um receptor de sete transmembranas humano, cinomolgo ou camundongo. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida IV, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I, II ou III, em que o receptor de sete transmembranas é a) um receptor de quimiocina CC, preferivelmente CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9 ou CCR10, b) um receptor de quimiocina CXC, preferivelmente CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5 ou CXCR6, ou c) CX3CR1 ou CXCR1. Fornecido de acordo com uma modalidade preferida V é um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I, II, III ou IV, o referido primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo ou consistindo em uma sequência de acordo coma. SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:3 ou SEQ ID NO:6, preferivelmente em que pelo menos Y10 e/ou Y18 foram sulfatados, oub. SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:8 ou SEQ ID NO:11, preferivelmente em que pelo menos Y26 foi sulfatado, ouc. SEQ ID NO:9 ou SEQ ID NO:12, preferivelmente em que pelo menos Y37 e/ou Y39 foi sulfatado, oud. SEQ ID NO:13 ou SEQ ID NO:16, preferivelmente em que Y16 e/ou Y17 foram sulfatados, oue. SEQ ID NO:14 ou SEQ ID NO:17, preferivelmente em que Y16 foi sulfatado, ouf. SEQ ID NO:15 ou SEQ ID NO:18 preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, ou g. SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:21 ou SEQ ID NO:24, preferivelmente em que pelo menos Y22 foi sulfatado e preferivelmente, além disso, Y16, Y19 e/ou Y20 foram sulfatados, ouh. SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:26 ou SEQ ID NO:29, preferivelmente em que dois, três ou todos de Y3, Y10, Y14 e Y15 foram sulfatados, oui. SEQ ID NO:27 ou SEQ ID NO:30,preferivelmente em que dois ou três de Y10, Y12 e Y16 foram sulfatados, ouj. SEQ ID NO:31 ou SEQ ID NO:34, preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y18, Y26 e Y27 foram sulfatados, ouk. SEQ ID NO:32 ou SEQ ID NO:35, preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y23, Y31 e Y32 foram sulfatados, oul. SEQ ID NO:33 ou SEQ ID NO:36, preferivelmente em que pelo menos dois ou três de Y13, Y18 e Y19 foram sulfatados, oum. SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:38 ou SEQ ID NO:41, preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 foram sulfatados, oun. SEQ ID NO:39 ou SEQ ID NO:42, preferivelmente em que um ou tanto Y8 quanto Y17 e opcionalmente Y20 foram sulfatados, ouo. SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:46 ou SEQ ID NO:47, preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oup. SEQ ID NO:45 ou SEQ ID NO:48, preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, ouq. SEQ ID NO:61, SEQ ID NO:64, SEQ ID NO:62 ou SEQ ID NO:65, preferivelmente em que pelo menos Y28, e preferivelmente também Y17 e/ou Y37 foram sulfatados, ou r. SEQ ID NO:63 ou SEQ ID NO:66, preferivelmente em que pelo menos Y28 foi sulfatado, e preferivelmente também Y19 foi sulfatado, ous. SEQ ID NO:67, SEQ ID NO:70, SEQ ID NO:68 ou SEQ ID NO:71, preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y14 e Y22 foram sulfatados, out. SEQ ID NO:69 ou SEQ ID NO:72, preferivelmente em que pelo menos um, dois ou todos de Y14, Y17 e Y22 foram sulfatados, ouu. SEQ ID NO:73 ou SEQ ID NO:76, preferivelmente em que Y27 foi sulfatado, ouv. SEQ ID NO:74 ou SEQ ID NO:77, preferivelmente em que pelo menos um de Y14 e Y28 foi sulfatado, ouw. SEQ ID NO:75 ou SEQ ID NO:78, preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado, oux. SEQ ID NO:79 ou SEQ ID NO:82, preferivelmente em que Y23 e/ou Y25 foram sulfatados, ouy. SEQ ID NO:80 ou SEQ ID NO:83, preferivelmente em que Y20 e/ou Y22 foram sulfatados, ouz. SEQ ID NO:81 ou SEQ ID NO:84, preferivelmente em que Y24 foi sulfatado, ouaa. SEQ ID NO:85, SEQ ID NO:88, SEQ ID NO:86, SEQ ID NO:89, SEQ ID NO:87 ou SEQ ID NO:90, preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y27 e Y29 foram sulfatados, oubb. SEQ ID NO:91, SEQ ID NO:94, SEQ ID NO:92 ou SEQ ID NO:95, preferivelmente em que pelo menos Y12 e/ou Y21 foram sulfatados, oucc. SEQ ID NO:93 ou SEQ ID NO:96, preferivelmente em que pelo menos Y23 e/ou Y14 foram sulfatados, oudd. SEQ ID NO:97, SEQ ID NO:100, SEQ ID NO:98 ou SEQ ID NO:101, preferivelmente em que pelo menos um de Y3 e Y27 foram sulfatados, ouee. SEQ ID NO:99 ou SEQ ID NO:102, preferivelmente em que pelo menos Y3 e/ou Y14 e/ou Y20 e/ou Y26 foram sulfatados, ouff. SEQ ID NO:103 ou SEQ ID NO:106, preferivelmenteem que pelo menos um ou ambos de Y6 e Y10 foram sulfatados, ougg. SEQ ID NO:104 ou SEQ ID NO:107, preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y4, Y7 e Y39 foram sulfatados, ouhh. SEQ ID NO:105 ou SEQ ID NO:108, preferivelmente em que pelo menos um ou ambos de Y11 e Y15 foram sulfatados, ouii. SEQ ID NO:157 ou SEQ ID NO:160, preferivelmenteem que pelo menos Y14 foi sulfatado, oujj. SEQ ID NO:158, preferivelmente em que pelo menos Y20 foi sulfatado, oukk. SEQ ID NO:161, preferivelmente em que pelo menos Y20 ou Y22 foi sulfatado, ou11. SEQ ID NO:159 ou SEQ ID NO:162, preferivelmente em que pelo menos Y15 foi sulfatado, oumm. SEQ ID NO:163 ou SEQ ID NO:166, preferivelmente em que pelo menos Y27 foi sulfatado, ounn. SEQ ID NO:164, preferivelmente em que pelo menos Y14 foi sulfatado ouoo. SEQ ID NO:167, preferivelmente em que pelo menos Y14 ou Y28 foi sulfatado, oupp. SEQ ID NO:165 ou SEQ ID NO:168, preferivelmente em que pelo menos Y6 foi sulfatado.[00396] The following embodiments describe preferred combinations of the sixth aspect, thus emphasizing the modular nature of the invention. According to a preferred embodiment I, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, which specifically binds to an isolated first sulfated polypeptide comprising the tyrosine-rich domain (TRD) of a seven-transmembrane receptor and, optionally, its LID domain, wherein at least 25%, at least 50%, or at least 75% of the tyrosine residues of the TRD are sulfated. According to a preferred embodiment II, the isolated antibody or antigen-binding fragment according to the preferred embodiment I is provided, wherein the cysteine between the TRD and the LID domain has been removed or replaced with a different amino acid. According to a preferred embodiment III, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to preferred embodiment I or II, wherein the seven-transmembrane receptor is a human, cynomolgus, or mouse seven-transmembrane receptor. According to a preferred embodiment IV, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of preferred embodiments I, II, or III, wherein the seven-transmembrane receptor is a) a CC chemokine receptor, preferably CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, or CCR10, b) a CXC chemokine receptor, preferably CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, or CXCR6, or c) CX3CR1 or CXCR1. Provided according to a preferred embodiment V is an isolated antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I, II, III or IV, said first isolated sulfated polypeptide comprising or consisting of a sequence according to a. SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:3 or SEQ ID NO:6, preferably wherein at least Y10 and/or Y18 have been sulfated, or b. SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:8 or SEQ ID NO:11, preferably wherein at least Y26 has been sulfated, or c. SEQ ID NO:9 or SEQ ID NO:12, preferably wherein at least Y37 and/or Y39 have been sulfated, or d. SEQ ID NO:13 or SEQ ID NO:16, preferably wherein Y16 and/or Y17 have been sulfated, or e. SEQ ID NO:14 or SEQ ID NO:17, preferably wherein Y16 has been sulfated, or f. SEQ ID NO:15 or SEQ ID NO:18 preferably wherein Y20 and/or Y22 have been sulfated, or g. SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:21 or SEQ ID NO:24, preferably wherein at least Y22 has been sulfated and preferably, in addition, Y16, Y19 and/or Y20 have been sulfated, or h. SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:26 or SEQ ID NO:29, preferably in which two, three or all of Y3, Y10, Y14 and Y15 were sulfated, oui. SEQ ID NO:27 or SEQ ID NO:30, preferably in which two or three of Y10, Y12 and Y16 were sulfated, ouj. SEQ ID NO:31 or SEQ ID NO:34, preferably in which at least two or three of Y18, Y26 and Y27 were sulfated, ouk. SEQ ID NO:32 or SEQ ID NO:35, preferably in which at least two or three of Y23, Y31 and Y32 were sulfated, oul. SEQ ID NO:33 or SEQ ID NO:36, preferably in which at least two or three of Y13, Y18 and Y19 were sulfated, oum. SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:38 or SEQ ID NO:41, preferably in which one or both Y8 and Y17 have been sulfated, oun. SEQ ID NO:39 or SEQ ID NO:42, preferably in which one or both Y8 and Y17 and optionally Y20 have been sulfated, ouo. SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:46 or SEQ ID NO:47, preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, ouup. SEQ ID NO:45 or SEQ ID NO:48, preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated, ouq. SEQ ID NO:61, SEQ ID NO:64, SEQ ID NO:62 or SEQ ID NO:65, preferably in which at least Y28, and preferably also Y17 and/or Y37 have been sulfated, or r. SEQ ID NO:63 or SEQ ID NO:66, preferably in which at least Y28 has been sulfated, and preferably also Y19 has been sulfated, ous. SEQ ID NO:67, SEQ ID NO:70, SEQ ID NO:68 or SEQ ID NO:71, preferably in which at least one or both of Y14 and Y22 have been sulfated, ouu. SEQ ID NO:69 or SEQ ID NO:72, preferably in which at least one, two or all of Y14, Y17 and Y22 have been sulfated, ouu. SEQ ID NO:73 or SEQ ID NO:76, preferably in which Y27 has been sulfated, ouv. SEQ ID NO:74 or SEQ ID NO:77, preferably wherein at least one of Y14 and Y28 has been sulfated, ouw. SEQ ID NO:75 or SEQ ID NO:78, preferably wherein at least Y6 has been sulfated, oux. SEQ ID NO:79 or SEQ ID NO:82, preferably wherein Y23 and/or Y25 have been sulfated, ouy. SEQ ID NO:80 or SEQ ID NO:83, preferably wherein Y20 and/or Y22 have been sulfated, ouz. SEQ ID NO:81 or SEQ ID NO:84, preferably wherein Y24 has been sulfated, ouaa. SEQ ID NO:85, SEQ ID NO:88, SEQ ID NO:86, SEQ ID NO:89, SEQ ID NO:87 or SEQ ID NO:90, preferably in which at least one or both of Y27 and Y29 have been sulfated, oubb. SEQ ID NO:91, SEQ ID NO:94, SEQ ID NO:92 or SEQ ID NO:95, preferably in which at least Y12 and/or Y21 have been sulfated, oucc. SEQ ID NO:93 or SEQ ID NO:96, preferably in which at least Y23 and/or Y14 have been sulfated, oudd. SEQ ID NO:97, SEQ ID NO:100, SEQ ID NO:98 or SEQ ID NO:101, preferably in which at least one of Y3 and Y27 have been sulfated, ouee. SEQ ID NO:99 or SEQ ID NO:102, preferably where at least Y3 and/or Y14 and/or Y20 and/or Y26 have been sulfated, ouff. SEQ ID NO:103 or SEQ ID NO:106, preferably where at least one or both of Y6 and Y10 have been sulfated, ougg. SEQ ID NO:104 or SEQ ID NO:107, preferably where at least two or all of Y4, Y7 and Y39 have been sulfated, ouhh. SEQ ID NO:105 or SEQ ID NO:108, preferably where at least one or both of Y11 and Y15 have been sulfated, ouii. SEQ ID NO:157 or SEQ ID NO:160, preferably where at least Y14 has been sulfated, oujj. SEQ ID NO:158, preferably where at least Y20 has been sulfated, oukk. SEQ ID NO:161, preferably in which at least Y20 or Y22 was sulfated, ou11. SEQ ID NO:159 or SEQ ID NO:162, preferably in which at least Y15 was sulfated, oumm. SEQ ID NO:163 or SEQ ID NO:166, preferably in which at least Y27 was sulfated, ounn. SEQ ID NO:164, preferably in which at least Y14 was sulfated, ouoo. SEQ ID NO:167, preferably in which at least Y14 or Y28 was sulfated, oupp. SEQ ID NO:165 or SEQ ID NO:168, preferably in which at least Y6 was sulfated.
[00397] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida VI, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I, II, III, IV ou V, em que a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo para ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado e/ou para o referido receptor de sete transmembranas é menor do que 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida VII, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a VI, em que o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno se liga especificamente a um segundo polipeptídeo sulfatado isolado que compreende o TRD de receptor de sete transmembranas, preferivelmente em que o receptor de sete transmembranas do TRD compreende o segundo polipeptídeo sulfatado isoladoa. é diferente dos receptores de sete transmembranas do TRD compreendidos pelo primeiro polipeptídeo sulfatado isolado, oub. é o correspondente receptores de sete transmembranas do TRD constituído pelo primeiro polipeptídeo sulfatado isolado mas de uma espécie diferente.[00397] According to a preferred embodiment VI, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I, II, III, IV or V, wherein the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding to the first isolated sulfated polypeptide and/or to said seven-transmembrane receptor is less than 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM. According to a preferred embodiment VII, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I to VI, wherein the isolated antibody or antigen-binding fragment specifically binds to a second isolated sulfated polypeptide comprising the seven-transmembrane receptor DRT, preferably wherein the seven-transmembrane receptor of the DRT comprises the second isolated sulfated polypeptide. It is different from the seven transmembrane receptors of the TRD comprised by the first isolated sulfated polypeptide, or it is the corresponding seven transmembrane receptor of the TRD constituted by the first isolated sulfated polypeptide but of a different species.
[00398] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida VIII, é o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com a modalidade preferida VII, em que a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo para a ligação do segundo polipeptídeo sulfatado isolado e/ou para a ligação do segundo receptor de sete transmem- branas é menor do que 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida IX, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a VIII, em que a constante de dissociação (KD) do anticorpo para ligação ao primeiro polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que a constante de dissociação (KD) do anticorpo para ligação de um primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado com a mesma sequência que o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida X, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com a modalidade preferida IX, em que a constante de dissociação e/ou EC50 do anticorpo para ligação ao primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 150 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM ou 3 μM, ou não é detectável. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XI, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas IX ou X, em que a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo ou fragmento para ligação ao primeiro polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM, e em que a constante de dissociação do anticorpo ou fragmento para ligação do primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 250 nM ou 500 nM, ou não é detectável. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XI, em que o anticorpo compreende CDRs derivadas de seres humanos, ratos ou camundongos. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XIII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XII, em que o anticorpoa. compreende CDRs derivadas de seres humanos e/ou b. é reativo cruzado para humanos e cinomolgos, e/ou c. é caracterizado por uma região HCDR3 compreendendo entre 10 e 34% de tirosina e/ou entre 2 e 20% de histidina, e/oud. não modula a sinalização independente da proteína G dos receptores de sete transmembranas e/oue. é um anticorpo não internalizante ou é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão alvo endógena que é menor do que 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 10 vezes da internalização do controle de isotipo, e/ouf. induz ADCC e/ou ADCPg. é um anticorpo IgG humano, de rato ou murino, preferivelmente um anticorpo IgG1 humano ou um anticorpo IgG2a murino, e/ouh. é um fragmento scFv, Fab, Fab' ou F(ab')2.[00398] Provided according to a preferred embodiment VIII is the isolated antibody or antigen-binding fragment according to preferred embodiment VII, wherein the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding the second isolated sulfated polypeptide and/or for binding the second seven-transmembrane receptor is less than 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM. Provided according to a preferred embodiment IX is an isolated antibody or antigen-binding fragment according to any of preferred embodiments I to VIII, wherein the dissociation constant (KD) of the antibody for binding the first isolated sulfated polypeptide is less than the dissociation constant (KD) of the antibody for binding a first isolated non-sulfated polypeptide with the same sequence as the first isolated sulfated polypeptide. According to a preferred embodiment X, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided, according to preferred embodiment IX, wherein the dissociation constant and/or EC50 of the antibody for binding to the first isolated non-sulfated polypeptide is greater than 150 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM or 3 μM, or is not detectable. According to a preferred embodiment XI, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments IX or X, wherein the dissociation constant or EC50 of the antibody or fragment for binding to the first isolated sulfated polypeptide is less than 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM, or 0.25 nM, and wherein the dissociation constant of the antibody or fragment for binding to the first isolated non-sulfated polypeptide is greater than 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 250 nM, or 500 nM, or is not detectable. According to a preferred embodiment XII, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I to XI, wherein the antibody comprises CDRs derived from humans, rats, or mice. According to a preferred embodiment XIII, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of preferred embodiments I to XII, wherein the antibody a. comprises human-derived CDRs and/or b. is cross-reactive for humans and cynomolgus, and/or c. is characterized by an HCDR3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or between 2 and 20% histidine, and/or d. does not modulate G protein-independent signaling of seven transmembrane receptors and/or e. is a non-internalizing antibody or is characterized by internalization into a cell with endogenous target expression that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 10 times the internalization of the isotype control, and/or f. induces ADCC and/or ADCPγ. is a human, mouse, or murine IgG antibody, preferably a human IgG1 antibody or a murine IgG2a antibody, and/or h. is a scFv, Fab, Fab', or F(ab')2 fragment.
[00399] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XIV, um conjugado compreendendo um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XIII, preferivelmente em que o conjugado compreende:a. um elemento radioativo,b. um agente citotóxico, tal como uma auristatina, um mai- tansinoide, um inibidor de proteína de fuso de cinesina, um inibidor de nicotinamida fosforibosiltransferase ou um derivado de pirrolobenzodi- azepina,c. um anticorpo adicional ou fragmento de ligação ao antí- geno, oud. um receptor de antígeno quimérico.[00399] A conjugate comprising an antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XIII is provided, according to a preferred embodiment XIV, preferably wherein the conjugate comprises: a. a radioactive element, b. a cytotoxic agent, such as an auristatin, a maytansinoid, a kinesin spindle protein inhibitor, a nicotinamide phosphoribosyltransferase inhibitor or a pyrrolobenzodiazepine derivative, c. an additional antibody or antigen-binding fragment, or d. a chimeric antigen receptor.
[00400] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XV, um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XIII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XIV para uso no tratamento de um tumor ou uma doença caracterizada pelo envolvimento de células que expressam os receptores de sete transmembranas, opcionalmente em combinação com um anticorpo direcionado a um inibidor de ponto de verificação. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XVI, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XIII ou um conjugado de acordo com a modalidade XIV preferida para uso como agente de di-agnóstico in vivo ou in vitro. É fornecido, de acordo com uma modali- dade preferida XVII, um kit compreendendo um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XIII ou um conjugado de acordo com a modalidade XIV preferida com instruções de uso.[00400] An antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XIII or a conjugate according to the preferred embodiment XV is provided for use in the treatment of a tumor or disease characterized by the involvement of cells expressing seven transmembrane receptors, optionally in combination with an antibody directed to a checkpoint inhibitor. An antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XIII or a conjugate according to the preferred embodiment XIV is provided for use as an in vivo or in vitro diagnostic agent. A kit comprising an antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XIII or a conjugate according to the preferred embodiment XIV with instructions for use is provided according to the preferred embodiment XVII.
[00401] Os seguintes aspectos 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 e 18 referem-se aos anticorpos que se ligam especificamente a CCR8. Embora cada aspecto seja descrito individualmente, os diferentes aspectos estruturais ou funcionais podem ser combinados e sugere-se que sejam combinados entre si, exceto quando obviamente incompatíveis. Além disso, cada modalidade em cada aspecto pode ser combinada com cada modalidade no mesmo aspecto ou em um aspecto diferente, exceto quando obviamente incompatível.[00401] The following aspects 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and 18 refer to antibodies that bind specifically to CCR8. Although each aspect is described individually, the different structural or functional aspects can be combined and it is suggested that they be combined with each other, except when obviously incompatible. Furthermore, each modality in each aspect can be combined with each modality in the same aspect or in a different aspect, except when obviously incompatible.
[00402] A menos que de outro indicado, o CCR8 pode ser de qualquer espécie, por exemplo, humano, de macaco, macaca fascicularis (macaco cinomolgo), macaca mulatta (macaco rhesus), roedor, camundongo, rato, cavalo, bovino, porco, cachorro, gato e camelo CCR8. Anticorpos que se ligam a CCR8 de pelo menos duas espécies, em que uma espécie é humana, são altamente preferidos e sugere-se que sejam combinados com cada modalidade descrita para esses aspectos. Anticorpos com CDRs derivadas de seres humanos são altamente preferidos e sugere-se que sejam combinados com cada modalidade descrita para esses aspectos. De acordo com os aspectos atuais, anticorpos com um domínio HCDR3 caracterizado por uma frequência de pelo menos 21% de resíduos de tirosina e/ou pelo menos 2%, 7% ou 10% de histidina são altamente preferidos e sugere-se que sejam combinados com cada modalidade descrita para o aspecto atual. De acordo com os aspectos atuais, anticorpos que induzem tanto ADCC quanto ADCP, tal como anticorpos não fucosilados, são altamente pre-feridos e sugere-se que sejam combinados com cada modalidade des- crita para esses aspectos. De acordo com os aspectos atuais, anticorpos ou fragmentos de baixa internalização ou não internalização são altamente preferidos e sugere-se que sejam combinados com cada modalidade descrita para esses aspectos. Alguns recursos de caracte-rização altamente preferidos que são aplicáveis para cada um dos aspectos descritos são descritos na seção "Combinações preferidas de acordo com 'todos os aspectos'".[00402] Unless otherwise indicated, CCR8 can be from any species, for example, human, monkey, macaque (cynomolgus macaque), macaque (rhesus macaque), rodent, mouse, rat, horse, bovine, pig, dog, cat, and camel CCR8. Antibodies that bind to CCR8 from at least two species, wherein one species is human, are highly preferred and are suggested to be combined with each embodiment described for these aspects. Antibodies with CDRs derived from humans are highly preferred and are suggested to be combined with each embodiment described for these aspects. According to the current aspects, antibodies with an HCDR3 domain characterized by a frequency of at least 21% tyrosine residues and/or at least 2%, 7%, or 10% histidine are highly preferred and are suggested to be combined with each embodiment described for the current aspect. According to the current aspects, antibodies that induce both ADCC and ADCP, such as non-fucosylated antibodies, are highly preferred and it is suggested that they be combined with each modality described for these aspects. According to the current aspects, low-internalization or non-internalization antibodies or fragments are highly preferred and it is suggested that they be combined with each modality described for these aspects. Some highly preferred characterization features that are applicable to each of the described aspects are described in the section "Preferred combinations according to 'all aspects'".
[00403] Os domínios extracelulares do CCR8 humano podem ser estruturados em quatro regiões:(1) um domínio N-terminal que pode ser subdividido ema) o domínio rico em tirosina distal à membrana (TRD), formado pelos aminoácidos 1 a 24 (SEQ ID NO:43)b) uma cisteína na posição de aminoácido 25, ec) um domínio LID, formado pelos aminoácidos 26 a 35 (SEQ ID NO:49)(iii) um domínio extracelular 1 (ECL1) de acordo com a SEQ ID NO:52,(iii) um domínio extracelular 2 (ECL2) de acordo com a SEQ ID NO:55, e(iv) um domínio extracelular 3 (ECL3) de acordo com SEQ ID NO:58.[00403] The extracellular domains of human CCR8 can be structured into four regions:(1) an N-terminal domain that can be subdivided into a) the membrane-distal tyrosine-rich domain (TRD), formed by amino acids 1 to 24 (SEQ ID NO:43)b) a cysteine at amino acid position 25, and c) a LID domain, formed by amino acids 26 to 35 (SEQ ID NO:49)(iii) an extracellular domain 1 (ECL1) according to SEQ ID NO:52,(iii) an extracellular domain 2 (ECL2) according to SEQ ID NO:55, and(iv) an extracellular domain 3 (ECL3) according to SEQ ID NO:58.
[00404] De acordo com um 7° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligando-se especificamente ao domínio rico em tirosina sulfatada de CCR8.[00404] According to a 7th aspect, which may or may not be the same as the 6th aspect, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided that specifically binds to the sulfated tyrosine-rich domain of CCR8.
[00405] Por exemplo, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antí- geno se liga a um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado que compreende: a) o domínio rico em tirosina (TRD) de CCR8 ou b) o N term de CCR8 incluindo o TRD,opcionalmente em que pelo menos a cisteína entre o TRD e o domínio LID foi removida ou foi trocada por um aminoácido diferente. Um poli- peptídeo sulfatado de acordo com o aspecto atual é um polipeptídeo em que preferivelmente pelo menos 25%, pelo menos 50% ou pelo menos 75% dos resíduos de tirosina do TRD são sulfatados. Quando o polipeptídeo compreende o N term de CCR8 incluindo o TRD, preferivelmente a cisteína entre o TRD e o domínio LID foi trocada por uma serina ou foi removida.[00405] For example, the antibody or antigen-binding fragment binds to a first isolated sulfated polypeptide comprising: a) the tyrosine-rich domain (TRD) of CCR8 or b) the N-term of CCR8 including the TRD, optionally wherein at least the cysteine between the TRD and the LID domain has been removed or replaced with a different amino acid. A sulfated polypeptide according to the present aspect is a polypeptide in which preferably at least 25%, at least 50%, or at least 75% of the tyrosine residues of the TRD are sulfated. When the polypeptide comprises the N-term of CCR8 including the TRD, preferably the cysteine between the TRD and the LID domain has been replaced with a serine or removed.
[00406] Sem estar limitado pela teoria, o reconhecimento específico do padrão de sulfatação fornecido para CCR8 parece influenciar se o anticorpo compete com CCL1, o ligante natural de CCR8, e também se e como o anticorpo agoniza ou antagoniza a sinalização de CCR8, por exemplo, como descrito de acordo com ao 11° aspecto.[00406] Without being limited by theory, specific recognition of the sulfation pattern provided for CCR8 appears to influence whether the antibody competes with CCL1, the natural ligand of CCR8, and also whether and how the antibody agonizes or antagonizes CCR8 signaling, for example, as described in relation to aspect 11.
[00407] Em algumas modalidades preferidas de acordo com o aspecto atual, o anticorpo inventivo liga TRD sulfatado de CCR8 humano e/ou cinomolgo com um valor KD de < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2,5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2,5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, ou < 9E- 11 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode ligar TRD sulfatado de CCR8 humano e/ou cinomolgo com um valor de KD entre <8E-9 M e > 4E-10 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode ligar TRD sulfatado de ser humano e/ou CCR8 de cinomolgo com um valor KD entre < 8E- 9 M e > 5,5E-10 M. Em algumas outras modalidades preferidas, o anticorpo inventivo liga-se ao N term sulfatado (isto é, compreendendo o TRD sulfatado mencionado acima) de ser humano e/ou CCR8 de ci- nomolgo com substancialmente o mesmo valor de KD. Em algumas dessas modalidades mais preferidas, o anticorpo inventivo não se liga substancialmente a TRD não sulfatado de CCR8 humano e/ou cinomo- lgo.[00407] In some preferred embodiments according to the present aspect, the inventive antibody binds sulfated TRDs of human and/or cynomolgus CCR8 with a KD value of < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2.5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, or < 9E-11 M. For example, the inventive antibody can bind sulfated TRDs from human and/or cynomolgus CCR8 with a KD value between <8E-9 M and > 4E-10 M. For example, the inventive antibody can bind sulfated TRDs from human and/or cynomolgus CCR8 with a KD value between < 8E-9 M and > 5.5E-10 M. In some other preferred embodiments, the inventive antibody binds to sulfated N-terminus (i.e., comprising the sulfated TRD mentioned above) from human and/or cynomolgus CCR8 with substantially the same KD value. In some of these preferred embodiments, the inventive antibody does not bind substantially to non-sulfated TRDs of human and/or canine CCR8.
[00408] Em algumas modalidades preferidas de acordo com o aspecto atual, o anticorpo inventivo liga-se ao N term sulfatado de CCR8 humano e/ou cinomolgo com um valor KD de < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2.5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, < 9E-11 M, < 8E-11 M, < 7E-11 M, < 6E-11 M, ou < 5E-11 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode se ligar ao N term sulfatado de CCR8 humano e/ou cinomolgo com um valor KD entre < 8E-9 M e > 8E-11 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode se ligar ao N term sulfatado de CCR8 humano e/ou cinomolgo com um valor KD entre < 8E-9 M e > 7,5E-11 M. Em alguns outros preferido destas modalidades, o anticorpo inventivo liga TRD sulfatado (isto é, uma subsequên- cia do N term sulfatado acima mencionado) de CCR8 humano e/ou cinomolgo com substancialmente o mesmo KD valor ou um valor KD dentro da mesma ordem de grandeza. Em algumas dessas modalidades mais preferidas, o anticorpo inventivo não se liga substancialmen-te a TRD não sulfatado de CCR8 humano e/ou cinomolgo.[00408] In some preferred embodiments according to the present aspect, the inventive antibody binds to N-termined sulfated human and/or cynomolgus CCR8 with a KD value of < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2.5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, < 9E-11 M, < 8E-11 M, < 7E-11 M, < 6E-11 M, or < 5E-11 M. For example, the inventive antibody can bind to the sulfated N-term of human and/or cynomolgus CCR8 with a KD value between < 8E-9 M and > 8E-11 M. For example, the inventive antibody can bind to the sulfated N-term of human and/or cynomolgus CCR8 with a KD value between < 8E-9 M and > 7.5E-11 M. In some other preferred embodiments, the inventive antibody binds to sulfated TRD (i.e., a subsequence of the aforementioned sulfated N-term) of human and/or cynomolgus CCR8. with substantially the same KD value or a KD value within the same order of magnitude. In some of these more preferred embodiments, the inventive antibody does not bind substantially to non-sulfated human CCR8 and/or cynomolgus TRDs.
[00409] De acordo com algumas primeiras modalidades do 7° aspecto, o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreende:a) SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados,b) SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/ouc) SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD), preferivel- mente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados.[00409] According to some early embodiments of the 7th aspect, the first isolated sulfated polypeptide comprises: a) SEQ ID NO:43 (CCR8_human_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, b) SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or c) SEQ ID NO:45 (CCR8_mouse_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated.
[00410] De acordo com algumas segundas modalidades do 7° aspecto, o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreende:a) SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados,b) SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/ouc) SEQ ID NO:48 (CCR8_camundongo_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados.[00410] According to some second embodiments of the 7th aspect, the first isolated sulfated polypeptide comprises: a) SEQ ID NO:46 (CCR8_human_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, b) SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or c) SEQ ID NO:48 (CCR8_mouse_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated.
[00411] De acordo com algumas terceiras modalidades do 7° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes da primeira e/ou segunda modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga especificamente ao primeiro polipeptídeo sulfatado isolado com uma constante de dissociação ou uma EC50 de < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM ou < 0,6 nM.[00411] According to some third embodiments of the 7th aspect, which may be the same as or different from the first and/or second embodiments, the antibody or antigen-binding fragment binds specifically to the first isolated sulfated polypeptide with a dissociation constant or EC50 of < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM or < 0.6 nM.
[00412] De acordo com algumas dessas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligase especificamente com uma constante de dissociação ou uma EC50 de < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM ou < 0,6 nMa) ao CCR8 humano ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados,b) ao CCR8 de cinomolgo ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/ouc) ao CCR8 de murino ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:48, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados.[00412] According to some of these preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof specifically binds with a dissociation constant or EC50 of < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM or < 0.6 nM) to human CCR8 or to a polypeptide isolated according to SEQ ID NO:46, in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, b) to cynomolgus CCR8 or to a polypeptide isolated according to SEQ ID NO:47, in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or c) to murine CCR8 or to a polypeptide isolated according to SEQ ID NO:48, in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated.
[00413] De acordo com algumas quartas modalidades do 7° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com a primeira, segunda e/ou terceira modalidades do 7° aspecto, a constante de dissociação (KD) do anticorpo para ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que a constante de dissociação (KD) do anticorpo para a ligação de um polipeptídeo não sulfatado isolado com a mesma sequência que o primeiro polipeptídeo sulfatado isolado.[00413] According to some fourth embodiments of the 7th aspect, which can be and are suggested to be combined with the first, second and/or third embodiments of the 7th aspect, the antibody dissociation constant (KD) for binding the first isolated sulfated polypeptide is smaller than the antibody dissociation constant (KD) for binding an isolated non-sulfated polypeptide with the same sequence as the first isolated sulfated polypeptide.
[00414] De acordo com algumas modalidades A destas quartas modalidades, a constante de dissociação ou EC50 do anticorpo para a ligação do polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 1 pM, 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 150 nM, 200 nM, 250 nM, 300 nM, 350 nM, 400 nM, 450 nM, 500 nM, 600 nM, 700 nM, 800 nM, 900 nM, 1 μM, 1,25 μM, 1,5 μM, 1,75 μM, 2 μM, 2,25 μM, 2,75 μM, ou 3 μM, 5 μM ou não é detectável. Preferivelmente, a constante de dissociação ou EC50 do anticorpo para a ligação do polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 100 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM ou 3 μM, ou não é detectável.[00414] According to some embodiments A of these fourth embodiments, the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding the isolated non-sulfated polypeptide is greater than 1 pM, 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 150 nM, 200 nM, 250 nM, 300 nM, 350 nM, 400 nM, 450 nM, 500 nM, 600 nM, 700 nM, 800 nM, 900 nM, 1 μM, 1.25 μM, 1.5 μM, 1.75 μM, 2 μM, 2.25 μM, 2.75 μM, or 3 μM, 5 μM or is not detectable. Preferably, the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding the isolated non-sulfated polypeptide is greater than 100 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM, or 3 μM, or it is not detectable.
[00415] De acordo com algumas modalidades B destas quartas modalidades, que podem ser as mesmas que as modalidades A destas segundas modalidades, a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo para a ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM, e a constante de dissociação ou a EC50 do anticorpo para a ligação do po- lipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 250 nM ou 500 nM, ou não é detectável.[00415] According to some embodiments B of these fourth embodiments, which may be the same as embodiments A of these second embodiments, the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding the first isolated sulfated polypeptide is less than 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM, and the dissociation constant or EC50 of the antibody for binding the isolated non-sulfated polypeptide is greater than 10 nM, 25 nM, 50 nM, 100 nM, 250 nM or 500 nM, or is not detectable.
[00416] De acordo com um 8° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6° ou 7° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, (especificamente) ligando-se ao CCR8, em que o anticorpo compreende CDRs derivadas de ser humano. Mais preferivelmente, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, (especificamente) liga-se ao TRD sulfatado de CCR8. De acordo com algumas modalidades preferidas, uma única CDR compreende menos de 1, 2, 3, 4, 5 ou 6 desvios da linhagem germinativa humana mais próxima. De acordo com algumas modalidades altamente preferidas, as CDRs derivadas de seres humanos não compreendem desvios ou menos de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 ou 15 desvios da linhagem germinativa humana mais próxima. A linhagem germinativa humana mais próxima pode ser determinada como conhecido na técnica, por exemplo, in silico usando IgBLAST com dados recuperados do banco de dados de linhagem germinativa humana IMGT, como descrito em outro lugar aqui.[00416] According to an 8th aspect, which may or may not be the same as the 6th or 7th aspect, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, (specifically) binding to CCR8, wherein the antibody comprises human-derived CDRs. More preferably, the antibody or antigen-binding fragment thereof (specifically) binds to the sulfated TRD of CCR8. According to some preferred embodiments, a single CDR comprises fewer than 1, 2, 3, 4, 5, or 6 deviations from the nearest human germline. According to some highly preferred embodiments, the human-derived CDRs comprise no deviations or fewer than 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15 deviations from the nearest human germline. The closest human germline can be determined as known in the art, for example, in silico using IgBLAST with data retrieved from the IMGT human germline database, as described elsewhere here.
[00417] Embora a humanização de anticorpos com CDRs não humanos possa melhorar a imunogenicidade, a imunogenicidade residual reside nas regiões CDR (Harding, Fiona A., et al. "The immunogenicity of humanized and fully human antibodies: residual immunogenicity re-sides in the CDR regions." MAbs. Vol. 2. No. 3. Taylor & Francis, 2010.). Os anticorpos de acordo com o aspecto atual compreendendo CDRs derivadas de seres humanos e um baixo número de desvios da linhagem germinativa são, portanto, assumidos como tendo uma adequação superior como agentes terapêuticos.[00417] Although humanization of antibodies with non-human CDRs can improve immunogenicity, residual immunogenicity resides in the CDR regions (Harding, Fiona A., et al. "The immunogenicity of humanized and fully human antibodies: residual immunogenicity re-sides in the CDR regions." MAbs. Vol. 2. No. 3. Taylor & Francis, 2010.). Antibodies according to the current aspect comprising human-derived CDRs and a low number of germline deviations are therefore assumed to have superior suitability as therapeutic agents.
[00418] Anticorpos compreendendo CDRs derivadas de seres humanos podem ser obtidos como descrito aqui, por exemplo, usando uma biblioteca de exibição de fagos humanos como descrito nos Exemplos 4 e 6. Em alternativa, os anticorpos com CDRs humanas também podem ser produzidos usando camundongos transgênicos que são incapazes de expressar imunoglobulinas endógenas funcio- nais, mas que podem expressar genes de imunoglobulinas humanas. Além disso, anticorpos compreendendo CDRs humanos também podem ser gerados usando células B ativadas in vitro (veja, Patentes dos Estados Unidos Nos. 5.567.610 e 5.229.275, cada uma das quais é incorporada aqui por referência em sua totalidade).[00418] Antibodies comprising human-derived CDRs can be obtained as described herein, for example, using a human phage display library as described in Examples 4 and 6. Alternatively, antibodies with human CDRs can also be produced using transgenic mice that are unable to express functional endogenous immunoglobulins but can express human immunoglobulin genes. In addition, antibodies comprising human CDRs can also be generated using activated B cells in vitro (see U.S. Patents Nos. 5,567,610 and 5,229,275, each of which is incorporated herein by reference in its entirety).
[00419] O anticorpo isolado fornecido ou fragmento de ligação ao antígeno compreendendo CDRs derivadas de seres humanos é preferivelmente também um anticorpo de acordo com qualquer um dos aspectos 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 ou 18 ou uma combinação dos mesmos.[00419] The supplied isolated antibody or antigen-binding fragment comprising human-derived CDRs is preferably also an antibody according to any one of aspects 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 or a combination thereof.
[00420] De acordo com um 9° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6°, 7° e/ou 8° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligando-se especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8 de pelo menos duas espécies, preferivelmente selecionadas de ser humano, macaco, macaca fascicularis (macaco cinomolgo), macaca mulata (macaco rhesus), roedor, camundongo, rato, cavalo, bovino, porco, cachorro, gato e camelo, ainda mais prefe-rivelmente selecionados de seres humanos, cinomolgos e camundongos. De acordo com algumas modalidades mais preferidas, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8 humano e cinomolgo.[00420] According to a 9th aspect, which may or may not be the same as the 6th, 7th and/or 8th aspects, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive for CCR8 of at least two species, preferably selected from humans, monkeys, Macaca fascicularis (cynomolgus monkey), Macaca mulatta (rhesus monkey), rodents, mice, rats, horses, cattle, pigs, dogs, cats and camels, and even more preferably selected from humans, cynomolgus monkeys and mice. According to some more preferred embodiments, the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive for human and cynomolgus CCR8.
[00421] Em modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga ao CCR8 de uma primeira espécie com uma primeira constante de dissociação KD e liga-se ao CCR8 de uma segunda espécie com uma segunda constante de dissociação KD, em que a primeira e a segunda constante de dissociação estão na mesma ordem de grandeza. Conforme entendido pela pessoa versada na técnica, uma diferença de ordem de grandeza entre dois valores é um fator de 10.[00421] In preferred embodiments, the antibody or antigen-binding fragment binds to CCR8 of a first species with a first dissociation constant KD and binds to CCR8 of a second species with a second dissociation constant KD, wherein the first and second dissociation constants are of the same order of magnitude. As understood by a person skilled in the art, a difference of order of magnitude between two values is a factor of 10.
[00422] Os anticorpos anti-CCR8 de reação cruzada são vantajosos para o desenvolvimento de um anticorpo terapêutico porque podem ser usados em modelos animais não humanos para caracterizar os agentes terapêuticos no que diz respeito aos dados farmacológicos e segurança antes que os anticorpos sejam administrados a humanos. No entanto, anticorpos de reação cruzada com comportamento de ligação semelhante em duas espécies são difíceis de gerar, porque as partes de CCR8 que podem ser usadas para reconhecimento de anticorpos têm uma baixa homologia entre espécies (veja, Exemplo 2). De acordo com a presente invenção, anticorpos de reação cruzada para CCR8 podem ser gerados usando pequena tirosina sulfatada que compreende motifs que têm uma maior conservação entre espécies, de modo que anticorpos de reação cruzada que ligam CCR8 de duas ou mais espécies com afinidades na mesma ordem de grandeza podem ser obtido de forma fácil e conveniente. Em mais detalhes, os anticorpos ligam-se especificamente aos motifs de TRD sulfatados e anticorpos de reação cruzada podem ser obtidos porque esses motifs de TRD sulfatados são conservados entre as espécies.[00422] Cross-reacting anti-CCR8 antibodies are advantageous for the development of a therapeutic antibody because they can be used in non-human animal models to characterize therapeutic agents with respect to pharmacological and safety data before the antibodies are administered to humans. However, cross-reacting antibodies with similar binding behavior in two species are difficult to generate because the CCR8 parts that can be used for antibody recognition have low homology between species (see Example 2). According to the present invention, cross-reacting antibodies to CCR8 can be generated using small sulfated tyrosine comprising motifs that have greater conservation between species, so that cross-reacting antibodies that bind CCR8 from two or more species with affinities on the same order of magnitude can be obtained easily and conveniently. In more detail, the antibodies bind specifically to the sulfated TRD motifs and cross-reacting antibodies can be obtained because these sulfated TRD motifs are conserved between species.
[00423] Em algumas modalidades preferidas de acordo com o aspecto atual, o anticorpo inventivo liga o TRD sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo com um valor KD de < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2,5E-9 M, < 2E-9 M, < 1,5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2,5E-10 M, < 2E-10 M, < 1,5E-10 M, < 1E-10 M, ou < 9E- 11 M. Para por exemplo, o anticorpo inventivo pode ligar TRD sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo com um valor KD entre < 8E-9 M e > 4E-10 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode ligar TRD sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo com um valor KD entre < 8E-9 M e > 5,5E-10 M. Em algumas outras modalidades preferidas, o anticorpo inventivo liga-se ao N term sulfatado (isto é, compreendendo o TRD sulfatado mencionado acima) de CCR8 humano e cinomolgo com substancialmente o mesmo valor de KD ou um KD dentro de uma ordem de magnitude. Em algumas dessas modalidades mais preferidas, o anticorpo inventivo não se liga substancialmente ao TRD não sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo.[00423] In some preferred embodiments according to the present aspect, the inventive antibody binds to the sulfated TRD of human and cynomolgus CCR8 with a KD value of < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2.5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, or < 9E-11 M. For example, the inventive antibody can bind sulfated TRDs of human and cynomolgus CCR8 with a KD value between < 8E-9 M and > 4E-10 M. For example, the inventive antibody can bind sulfated TRDs of human and cynomolgus CCR8 with a KD value between < 8E-9 M and > 5.5E-10 M. In some other preferred embodiments, the inventive antibody binds to sulfated N-terminus (i.e., comprising the sulfated TRD mentioned above) of human and cynomolgus CCR8 with substantially the same KD value or a KD within an order of magnitude. In some of these preferred embodiments, the inventive antibody does not bind substantially to the non-sulfated TRD of human CCR8 and cynomolgus.
[00424] Em algumas modalidades preferidas de acordo com o aspecto atual, o anticorpo inventivo liga-se ao N term sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo com um valor KD de < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2,5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E- 9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E- 10 M, < 3E-10 M, < 2,5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, < 9E-11 M, < 8E-11 M, < 7E-11 M, < 6E-11 M, ou < 5E-11 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode se ligar ao N term sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo com um valor KD entre < 8E-9 M e > 8E-11 M. Por exemplo, o anticorpo inventivo pode se ligar ao N term sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo com um valor KD entre < 8E-9 M e > 7,5E-11 M. Em algumas outras modalidades preferidas, o anticorpo inventivo liga TRD sulfatado (isto é, uma subsequência do N term sulfatado acima mencionado) de CCR8 humano e cinomolgo com substancialmente o mesmo valor de KD ou um valor na mesma ordem de grandeza. Em algumas dessas modalidades mais preferidas, o anticorpo inventivo não se liga substancialmente ao TRD não sulfatado de CCR8 humano e cinomolgo.[00424] In some preferred embodiments according to the present aspect, the inventive antibody binds to N-termined sulfated human CCR8 and cynomolgus with a KD value of < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2.5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, < 9E-11 M, < 8E-11 M, < 7E-11 M, < 6E-11 M, or < 5E-11 M. For example, the inventive antibody can bind to the sulfated N-term of human and cynomolgus CCR8 with a KD value between < 8E-9 M and > 8E-11 M. For example, the inventive antibody can bind to the sulfated N-term of human and cynomolgus CCR8 with a KD value between < 8E-9 M and > 7.5E-11 M. In some other preferred embodiments, the inventive antibody binds to sulfated TRD (i.e., a subsequence of the aforementioned sulfated N-term) of human and cynomolgus CCR8 with substantially the same KD value or a value of the same order of magnitude. In some of these more preferred embodiments, the inventive antibody does not bind substantially to the non-sulfated TRD of human CCR8 and cynomolgus.
[00425] De acordo com algumas primeiras modalidades do 9° aspecto, o anticorpo se liga especificamente aa) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), pre- ferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO: 47 (CCR8_MACFA_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, oub) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados.[00425] According to some early embodiments of the 9th aspect, the antibody binds specifically to a) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:46 (CCR8_human_N term with C = X or S), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:47 (CCR8_MACFA_N term with C = X or S), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, or b) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:43 (CCR8_human_TRD), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:44 (CCR8_MACFA_TRD), preferably wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated. At least two or all of Y3, Y15, and Y17 were sulfated.
[00426] Preferivelmente, a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação de CCR8 humano ou para ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM, tal como abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM. Preferivelmente, a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação de CCR8 de cinomolgo ou para ligação do segundo polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM. Em algumas modalidades preferidas, os anticorpos se ligam ao primeiro polipeptídeo sulfatado isolado e o segundo polipeptídeo sulfatado isolado com substancialmente a mesma afinidade.[00426] Preferably, the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to human CCR8 or for binding to the first isolated sulfated polypeptide is less than 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM, such as below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM. Preferably, the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to cynomolgus CCR8 or for binding to the second isolated sulfated polypeptide is less than 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM. In some preferred embodiments, antibodies bind to the first isolated sulfated polypeptide and the second isolated sulfated polypeptide with substantially the same affinity.
[00427] De acordo com algumas segundas modalidades do 9° aspecto, o anticorpo se liga especificamente aa) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:46 (CCR8_humano_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO: 48 (CCR8_camundongo_N term com C = X ou S), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados, oub) um primeiro polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:43 (CCR8_humano_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, e um segundo polipeptídeo sulfatado isolado compreendendo a SEQ ID NO:45 (CCR8_camundongo_TRD), preferivelmente em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados.[00427] According to some second embodiments of the 9th aspect, the antibody binds specifically to a) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:46 (CCR8_human_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:48 (CCR8_mouse_N term with C = X or S), preferably in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated, or b) a first isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:43 (CCR8_human_TRD), preferably in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, and a second isolated sulfated polypeptide comprising SEQ ID NO:45 (CCR8_mouse_TRD), preferably in which At least two or all of Y3, Y14, and Y15 were sulfated.
[00428] Preferivelmente, a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação de CCR8 humano ou para ligação do primeiro polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM, tal como abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM. Preferivelmente, a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a ligação de CCR8 de murino ou para a ligação do segundo polipeptídeo sulfatado isolado é menor do que 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 ou 0,25 nM. Em algumas modalidades preferidas, os anticorpos se ligam ao primeiro polipeptídeo sulfatado isolado e o segundo polipeptídeo sulfatado isolado com substancialmente a mesma afinidade.[00428] Preferably, the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to human CCR8 or for binding to the first isolated sulfated polypeptide is less than 200 nM, 150 nM, 100 nM, 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM, such as below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM. Preferably, the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to murine CCR8 or for binding to the second isolated sulfated polypeptide is less than 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 or 0.25 nM. In some preferred embodiments, antibodies bind to the first isolated sulfated polypeptide and the second isolated sulfated polypeptide with substantially the same affinity.
[00429] O anticorpo isolado fornecido ou fragmento de ligação ao antígeno é preferivelmente também um anticorpo de acordo com qualquer um dos aspectos 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 ou 18 ou uma combinação dos mesmos.ASPECTO 10 - ANTICORPO CCR8 DEFINIDO PELA ESTRUTURA HCDR3[00429] The supplied isolated antibody or antigen-binding fragment is preferably also an antibody according to any one of aspects 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 or a combination thereof. ASPECT 10 - CCR8 ANTIBODY DEFINED BY HCDR3 STRUCTURE
[00430] De acordo com um 10° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6°, 7°, 8° e/ou 9° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, ligando-se especificamente a CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antí- geno é caracterizado por uma região HCDR3 com frequência aumentada de histidina e/ou tirosina. Conforme entendido pela pessoa versa- da na técnica, embora a frequência para cada aminoácido seja descrita separadamente, as respectivas frequências estão inter-relacionadas e sugere-se que sejam combinadas, exceto quando a pessoa versada reconhece imediatamente sua incompatibilidade. Para determinação das regiões CDR, o sistema de numeração de resíduos de aminoáci- dos de imunoglobulina de Kabat foi usado aqui e deve ser decisivo em caso de dúvida.[00430] According to a 10th aspect, which may or may not be the same as the 6th, 7th, 8th and/or 9th aspect, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided, specifically binding to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment is characterized by an HCDR3 region with an increased frequency of histidine and/or tyrosine. As understood by a person skilled in the art, although the frequency for each amino acid is described separately, the respective frequencies are interrelated and it is suggested that they be combined, except when the person skilled immediately recognizes their incompatibility. For the determination of CDR regions, the Kabat immunoglobulin amino acid residue numbering system was used here and should be decisive in case of doubt.
[00431] Verificou-se surpreendentemente que os anticorpos CCR8 de acordo com a presente invenção foram caracterizados por um HCDR3 com frequências substancialmente mais altas de resíduos de tirosina do que seria esperado para um HCDR3 aleatório totalmente humano com comprimento correspondente (~10%, conforme Zemlin, Michael, et al. "Expressed murine and human CDR-H3 intervals of equal length exhibit distinct repertoires that differ in their amino acid composition and predicted range of structures." Journal of molecular biology 334.4 (2003): 733-749.). Em média, o conjunto inicial de anticorpos inventivos compreendeu ~ 20,6% de resíduos de tirosina, enquanto o conjunto otimizado de anticorpos específicos de ligação ao CCR8 humano compreendeu em média 21% de resíduos de tirosina no HCDR3.[00431] It was surprisingly found that the CCR8 antibodies according to the present invention were characterized by an HCDR3 with substantially higher frequencies of tyrosine residues than would be expected for a random, fully human HCDR3 of corresponding length (~10%, as per Zemlin, Michael, et al. "Expressed murine and human CDR-H3 intervals of equal length exhibit distinct repertoires that differ in their amino acid composition and predicted range of structures." Journal of molecular biology 334.4 (2003): 733-749.). On average, the initial set of inventive antibodies comprised ~20.6% tyrosine residues, while the optimized set of human CCR8-binding specific antibodies comprised on average 21% tyrosine residues in the HCDR3.
[00432] Além disso, o número de aminoácidos carregados positivamente e, em particular, o número de resíduos de histidina foi maior do que o esperado, em particular no conjunto otimizado de anticorpos com características terapêuticas melhoradas, conforme o Exemplo 9. Em média, quando somados, os resíduos de histidina e resíduos de tirosina representaram 31% de todos os aminoácidos no HCDR3 do conjunto otimizado de anticorpos de ligação a CCR8.[00432] Furthermore, the number of positively charged amino acids, and in particular the number of histidine residues, was higher than expected, particularly in the optimized antibody set with improved therapeutic characteristics, as shown in Example 9. On average, when summed, histidine and tyrosine residues accounted for 31% of all amino acids in the HCDR3 of the optimized CCR8-binding antibody set.
[00433] Interessantemente, o antígeno usado compreendendo o TRD sulfatado, é caracterizado por resíduos de tirosina e um número particularmente elevado de cargas negativas, que foi ainda aumentada pela sulfatação. Sem estarem limitados pela teoria, os inventores acreditam que a preferência por um alto teor de tirosina e histidina no CDRH3 dos anticorpos inventivos é causada pelo motif sulfatado particular do antígeno e que um alto teor de tirosina/histidina no HCDR3 promove o específico reconhecimento do antígeno. Sem estarem limitados pela teoria, os inventores acreditam, além disso, que este reconhecimento específico influencia as características dos anticorpos obtidos como um modulador de CCR8, por exemplo, como descrito no aspecto 11.[00433] Interestingly, the antigen used, comprising the sulfated TRD, is characterized by tyrosine residues and a particularly high number of negative charges, which was further increased by sulfation. Without being limited by theory, the inventors believe that the preference for a high tyrosine and histidine content in the CDRH3 of the inventive antibodies is caused by the particular sulfated motif of the antigen and that a high tyrosine/histidine content in the CDRH3 promotes specific antigen recognition. Without being limited by theory, the inventors further believe that this specific recognition influences the characteristics of the antibodies obtained as a CCR8 modulator, for example, as described in aspect 11.
[00434] Em algumas modalidades altamente preferidas do 10° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento é caracterizado por uma região HCDR3 com-preendendo entre 10 e 34% de tirosina e /ou entre 2 e 20% de histidi- na.[00434] In some highly preferred embodiments of the 10th aspect, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided that binds specifically to CCR8, wherein the antibody or fragment is characterized by an HCDR3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or between 2 and 20% histidine.
[00435] O anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno fornecido é preferivelmente também um anticorpo de acordo com qualquer um dos aspectos 7, 8, 9, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 ou 18 ou uma combinação dos mesmos.[00435] The supplied isolated antibody or antigen-binding fragment is preferably also an antibody according to any one of aspects 7, 8, 9, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 or a combination thereof.
[00436] Em algumas primeiras modalidades do 10° aspecto, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 possuindo:a) > 0 e < 35 %, > 8 e < 34 %, > 10 e < 34 %, ou > 15 e < 31 % de resíduos de tirosina (Y), e/oub) > 0 e < 16%, > 2 e < 20% ou > 7 e < 20% de resíduos de histidina (H), ec) preferivelmente > 0 e < 18%, > 7 e < 10% ou > 0 e < 7% de resíduos de arginina (R), e/oud) preferivelmente > 0 e < 25%, > 7 e < 16% ou > 7 e < 13% de resíduos de ácido aspártico (D), e/ou e) preferivelmente sem resíduos de lisina (K), e/ouf) preferivelmente sem resíduos de ácido glutâmico (E).[00436] In some early embodiments of the 10th aspect, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 having: a) > 0 and < 35%, > 8 and < 34%, > 10 and < 34%, or > 15 and < 31% of tyrosine (Y) residues, and/or b) > 0 and < 16%, > 2 and < 20%, or > 7 and < 20% of histidine (H) residues, and/or c) preferably > 0 and < 18%, > 7 and < 10%, or > 0 and < 7% of arginine (R) residues, and/or d) preferably > 0 and < 25%, > 7 and < 16%, or > 7 and < 13% of aspartic acid (D) residues, and/or e) preferably without lysine (K) residues, and/or) preferably without glutamic acid residues (E).
[00437] Em algumas segundas modalidades do 10° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das primeiras modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 coma) > 0 e < 47 %, > 22 e < 50 %, > 10 e < 34 %, ou > 15 e < 47 % de aminoácidos carregados, e/oub) > 0 e < 32 %, > 8 e < 30 %, ou > 10 e < 37 % de amino- ácidos carregados positivamente, e/ouc) > 0 e < 26 %, > 7 e < 16 %, ou > 7 e < 14 % de aminoá- cidos carregados negativamente.[00437] In some second embodiments of the 10th aspect, which may be the same as or different from the first embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with a) > 0 and < 47%, > 22 and < 50%, > 10 and < 34%, or > 15 and < 47% of charged amino acids, and/or b) > 0 and < 32%, > 8 and < 30%, or > 10 and < 37% of positively charged amino acids, and/or c) > 0 and < 26%, > 7 and < 16%, or > 7 and < 14% of negatively charged amino acids.
[00438] Em algumas terceiras modalidades do 10° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes da primeira e/ou segunda modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com > 0 e < 42%, > 10 e < 42 % ou > 36 e < 43 % de resí-duos de histidina e tirosina no total.Tirosina (Y)[00438] In some third embodiments of the 10th aspect, which may be the same as or different from the first and/or second embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with > 0 and < 42%, > 10 and < 42%, or > 36 and < 43% of total histidine and tyrosine residues.Tyrosine (Y)
[00439] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 33%, 31%, 25%, 23%, 21%, 20%, 18%, 15%, 10%, 9%, 8% ou 0 % de tiro- sina. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 35%, (b) > 8 e < 34%, (c) > 10 e < 34%, ou (d) > 15 e < 31% de tirosina.[00439] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 33%, 31%, 25%, 23%, 21%, 20%, 18%, 15%, 10%, 9%, 8%, or 0% tyrosine. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 35%, (b) > 8 and < 34%, (c) > 10 and < 34%, or (d) > 15 and < 31% tyrosine.
[00440] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20, > 21, > 22, > 23, > 24, > 25, > 26, > 27, > 28, > 29, > 30, > 31, > 32, > 33% de resíduos de tirosina. Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fra- gmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com < 35, < 34, < 33, < 32, < 31, < 30, < 29, < 28, < 27, < 26, < 25, < 24, < 23, < 22, < 21, < 20, < 19, < 18, < 17, < 16, < 15, < 14 < 13, < 12, < 11, < 10, < 9 ou < 8% de resíduos de tirosina.[00440] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCDR3 with > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20, > 21, > 22, > 23, > 24, > 25, > 26, > 27, > 28, > 29, > 30, > 31, > 32, > 33% tyrosine residues. In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCDR3 with < 35, < 34, < 33, < 32, < 31, < 30, < 29, < 28, < 27, < 26, < 25, < 24, < 23, < 22, < 21, < 20, < 19, < 18, < 17, < 16, < 15, < 14, < 13, < 12, < 11, < 10, < 9 or < 8% tyrosine residues.
[00441] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com > 0 e < 34%, > 1 e < 34%, > 2 e < 34%, > 3 e < 34%, > 4 e < 34%, > 5 e < 34 %, > 6 e < 34 %, > 7 e < 34 %, > 8 e < 34 %, > 9 e < 34 %, > 10 e < 34 %, > 11 e< 34 %, > 12 e < 34 %, > 13 e < 34 %, > 14 e < 34 %, > 15 e < 34 %, >16 e < 34 %, > 17 e < 34 %, > 18 e < 34 %, > 19 e < 34 %, > 20 e < 34%, > 21 e < 34 %, > 22 e < 34 %, > 23 e < 34 %, > 24 e < 34 %, > 25 e< 34 %, > 26 e < 34 %, > 27 e < 34 %, > 28 e < 34 %, > 29 e < 34 % ou > 30 e < 34 % resíduos de tirosina.[00441] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with > 0 and < 34%, > 1 and < 34%, > 2 and < 34%, > 3 and < 34%, > 4 and < 34%, > 5 and < 34%, > 6 and < 34%, > 7 and < 34%, > 8 and < 34%, > 9 and < 34%, > 10 and < 34%, > 11 and < 34%, > 12 and < 34%, > 13 and < 34%, > 14 and < 34%, > 15 and < 34%, > 16 and < 34%, > 17 and < 34%, > 18 and < 34%, > 19 and < 34%, > 20 and < 34%, > 21 and < 34%, > 22 and < 34%, > 23 and < 34%, > 24 and < 34%, > 25 and < 34%, > 26 and < 34%, > 27 and < 34%, > 28 and < 34%, > 29 and < 34% or > 30 and < 34% tyrosine residues.
[00442] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com > 0 e < 36%, > 0 e < 35%, > 0 e < 34%, > 0 e < 33%, > 0 e < 32%, > 0 e < 31 %, > 0 e < 30 %, > 0 e < 29 %, > 0 e < 28 %, > 0 e < 27 %, > 0 e < 26 %, > 0 e <25 %, > 0 e < 24 %, > 0 e < 23 %, > 0 e < 22 %, > 0 e < 21 %, > 0 e <20 %, > 0 e < 19 %, > 0 e < 18 %, > 0 e < 17 %, > 0 e < 16 %, ou > 0 e < 15 %, > 0 e < 14 %, > 0 e < 13 %, > 0 e < 12 %, > 0 e < 11 %, > 0 e< 10 %, > 0 e < 9 %, > 0 e < 8 %, > 0 e < 7 %, > 0 e < 6 %, > 0 e < 5 %resíduos de tirosina.[00442] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with > 0 and < 36%, > 0 and < 35%, > 0 and < 34%, > 0 and < 33%, > 0 and < 32%, > 0 and < 31%, > 0 and < 30%, > 0 and < 29%, > 0 and < 28%, > 0 and < 27%, > 0 and < 26%, > 0 and < 25%, > 0 and < 24%, > 0 and < 23%, > 0 and < 22%, > 0 and < 21%, > 0 and < 20%, > 0 and < 19%, > 0 and < 18%, > 0 and < 17%, > 0 and < 16%, or > 0 and < 15%, > 0 and < 14%, > 0 and < 13%, > 0 and < 12%, > 0 and < 11%, > 0 and < 10%, > 0 and < 9%, > 0 and < 8%, > 0 and < 7%, > 0 and < 6%, > 0 and < 5% tyrosine residues.
[00443] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 47%, 39%, 31%, 28%, 27%, 25%, 23%, 20%, 18%, 17%, 16%, 15 %, 9% ou 0% de aminoácidos carregados. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 47%, (b) > 22 e < 50%, (c) > 10 e < 34%, ou (d) > 15 e < 47% de aminoácidos carregados.[00443] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 47%, 39%, 31%, 28%, 27%, 25%, 23%, 20%, 18%, 17%, 16%, 15%, 9%, or 0% of charged amino acids. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 47%, (b) > 22 and < 50%, (c) > 10 and < 34%, or (d) > 15 and < 47% of charged amino acids.
[00444] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 31%, 23%, 18%, 15%, 10%, 8%, 7% ou 0% de aminoácidos positivamente carregados. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 32%, (b) > 8 e < 30%, ou (c) > 10 e < 37% aminoácidos positivamente carregado.[00444] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 31%, 23%, 18%, 15%, 10%, 8%, 7%, or 0% positively charged amino acids. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 32%, (b) > 8 and < 30%, or (c) > 10 and < 37% positively charged amino acids.
[00445] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 25%, 17%, 15%, 11%, 10%, 9%, 8%, 7% ou 0% de aminoácidos negativamente carregados. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 26%, (b) > 7 e < 16%, ou (c) > 7 e < 14% aminoácidos de negativamente carregados.[00445] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 25%, 17%, 15%, 11%, 10%, 9%, 8%, 7%, or 0% negatively charged amino acids. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 26%, (b) > 7 and < 16%, or (c) > 7 and < 14% negatively charged amino acids.
[00446] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 0%, 3%, 7%, 8%, 10% ou 15% de resíduos de histidina. Preferivelmente, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com pelo menos um resíduo de histidina. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 16%, (b) > 2 e < 20% ou (c) > 7 e < 20% de resíduos de histidina.[00446] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 0%, 3%, 7%, 8%, 10%, or 15% histidine residues. Preferably, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with at least one histidine residue. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 16%, (b) > 2 and < 20%, or (c) > 7 and < 20% histidine residues.
[00447] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com > 0, > 0, > 1, > 2, > 3, > 4, > 5, > 6, > 7, > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20% de resíduos de histidina. Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno com- preende um HCDR3 com < 20, < 19, < 18, < 17, < 16, < 15, < 14 < 13, < 12, < 11, < 10, < 9, < 8, < 7, < 6, < 5, < 4, < 3, < 2 ou < 1% de resíduos de histidina.[00447] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCDR3 with > 0, > 0, > 1, > 2, > 3, > 4, > 5, > 6, > 7, > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20% histidine residues. In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with < 20, < 19, < 18, < 17, < 16, < 15, < 14, < 13, < 12, < 11, < 10, < 9, < 8, < 7, < 6, < 5, < 4, < 3, < 2, or < 1% of histidine residues.
[00448] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com > 0 e < 24%, > 1 e < 24%, > 2 e < 24%, > 3 e < 24%, > 4 e < 24%, > 5 e < 24 %, > 6 e < 24 %, > 7 e < 24 %, > 8 e < 24 %, > 9 e < 24 %, > 10 e < 24 %, > 11 e< 24 %, > 12 e < 24 %, > 13 e < 24 %, > 14 e < 24 %, > 15 e < 24 %, >16 e < 24 %, > 17 e < 24 %, > 18 e < 24 %, > 19 e < 24 %, > 20 e < 24%, > 21 e < 24 %, > 22 e < 24 % ou > 23 e < 24 % de resíduos de his-tidina.[00448] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with > 0 and < 24%, > 1 and < 24%, > 2 and < 24%, > 3 and < 24%, > 4 and < 24%, > 5 and < 24%, > 6 and < 24%, > 7 and < 24%, > 8 and < 24%, > 9 and < 24%, > 10 and < 24%, > 11 and < 24%, > 12 and < 24%, > 13 and < 24%, > 14 and < 24%, > 15 and < 24%, > 16 and < 24%, > 17 and < 24%, > 18 and < 24%, > 19 and < 24%, > 20% and < 24%, > 21% and < 24%, > 22% and < 24%, or > 23% and < 24% of histidine residues.
[00449] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com > 0 e < 24%, > 0 e < 23%, > 0 e < 22%, > 0 e < 21%, > 0 e < 20%, > 0 e < 19 %, > 0 e < 18 %, > 0 e < 17 %, > 0 e < 16 %, ou > 0 e < 15 %, > 0 e < 14 %, > 0 e < 13 %, > 0 e < 12 %, > 0 e < 11 %, > 0 e < 10 %, > 0 e < 9 %, > 0 e < 8 %, > 0 e < 7 %, > 0 e < 6 %, > 0 e < 5 %, > 0 e < 4 %, > 0 e < 3 %, > 0 e < 2 % ou > 0 e < 1 % resíduos de histidina.[00449] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with > 0 and < 24%, > 0 and < 23%, > 0 and < 22%, > 0 and < 21%, > 0 and < 20%, > 0 and < 19%, > 0 and < 18%, > 0 and < 17%, > 0 and < 16%, or > 0 and < 15%, > 0 and < 14%, > 0 and < 13%, > 0 and < 12%, > 0 and < 11%, > 0 and < 10%, > 0 and < 9%, > 0 and < 8%, > 0 and < 7%, > 0 and < 6%, > 0 and < 5%, > 0 and < 4%, >0 and <3%, >0 and <2%, or >0 and <1% histidine residues.
[00450] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 42%, 38%, 33%, 31%, 30%, 24%, 23%, 18%, 15%, 10%, 9% ou 0 % de resíduos de histidina e tirosina no total. Preferivelmente, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com pelo menos um resíduo de histidina. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 42%, (b) > 10 e < 42% ou (c) > 36 e < 43% histidina e tirosina resíduos no total.[00450] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 42%, 38%, 33%, 31%, 30%, 24%, 23%, 18%, 15%, 10%, 9%, or 0% of total histidine and tyrosine residues. Preferably, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with at least one histidine residue. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 42%, (b) > 10 and < 42%, or (c) > 36 and < 43% total histidine and tyrosine residues.
[00451] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 0%, 7%, 8%, 10%, 15% ou 18% de resíduos de arginina. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 18%, (b) > 7 e < 10% ou (c) > 0 e < 7% de resíduos de arginina.[00451] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 0%, 7%, 8%, 10%, 15%, or 18% arginine residues. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 18%, (b) > 7 and < 10%, or (c) > 0 and < 7% arginine residues.
[00452] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmentode ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 0% a 8% de resíduos de lisina. Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 sem resíduos de lisina.[00452] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises a HCDR3 with 0% to 8% lysine residues. In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises a HCDR3 without lysine residues.
[00453] Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 0%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 15%, 16%, 17% ou 25% de resíduos de ácido aspártico. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com (a) > 0 e < 25%, (b) > 7 e < 16% ou (c) > 7 e < 13% de resíduos de ácido aspártico.[00453] In some preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with 0%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 15%, 16%, 17%, or 25% aspartic acid residues. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises an HCR3 with (a) > 0 and < 25%, (b) > 7 and < 16%, or (c) > 7 and < 13% aspartic acid residues.
[00454] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmentode ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com 0%, 8% ou 9% de resíduos de ácido glutâmico. Em algumas modalidades altamente preferidas, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 sem resíduos de ácido glutâmico.[00454] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises a HCDR3 with 0%, 8%, or 9% glutamic acid residues. In some highly preferred embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises a HCDR3 without glutamic acid residues.
[00455] Em algumas modalidades, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com um comprimento de 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 ou 20 ami- noácidos. Preferivelmente, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreende um HCDR3 com um comprimento de 10, 11, 12 ou 13 resíduos de aminoácidos ou um comprimento entre 8 e 13 resíduos de aminoácidos.[00455] In some embodiments, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises a HCDR3 with a length of 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 or 20 amino acids. Preferably, the isolated antibody or antigen-binding fragment comprises a HCDR3 with a length of 10, 11, 12 or 13 amino acid residues or a length between 8 and 13 amino acid residues.
[00456] Existem várias maneiras diferentes de como um anticorpo pode modular a sinalização do CCR8. Por exemplo, um anticorpo pode:a) bloquear a sinalização independente da proteína G, b) bloquear a sinalização dependente da proteína G, c) bloquear a sinalização dependente da proteína G e independente da proteína G,d) aumentar a sinalização independente da proteína G,e) aumentar a sinalização dependente da proteína G,f) aumentar a sinalização dependente da proteína G e independente da proteína G.[00456] There are several different ways in which an antibody can modulate CCR8 signaling. For example, an antibody can: a) block G protein-independent signaling, b) block G protein-dependent signaling, c) block both G protein-dependent and G protein-independent signaling, d) increase G protein-independent signaling, e) increase G protein-dependent signaling, f) increase both G protein-dependent and G protein-independent signaling.
[00457] De acordo com um 11° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6°, 7°, 8°, 9° e/ou 10° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente a CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao an- tígeno pelo menos parcialmente modula a sinalização de CCR8.[00457] According to an 11th aspect, which may or may not be the same as the 6th, 7th, 8th, 9th and/or 10th aspects, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment at least partially modulates CCR8 signaling.
[00458] Para CCR8, as vias de sinalização independentes da proteína G são sinalização de β-arrestina (Exemplo 10.4.1), sinalização fosfo Erk1/2 (fosforilação de Erk1/2) e sinalização fosfo Akt (fosforila- ção de AKT) (Exemplo 10.4.2). Outros subtipos de antagonistas ou agonistas podem ser definidos com base no impacto nessas três vias de sinalização independentes da proteína G.[00458] For CCR8, the G protein-independent signaling pathways are β-arrestin signaling (Example 10.4.1), phospho Erk1/2 signaling (phosphorylation of Erk1/2), and phospho Akt signaling (phosphorylation of AKT) (Example 10.4.2). Other antagonist or agonist subtypes can be defined based on their impact on these three G protein-independent signaling pathways.
[00459] De acordo com algumas primeiras modalidades do 11° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) não bloqueia a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1 e/ou b) não induz a fosforilação de ERK1/2 e/ou c) não induz a fosforilação de AKT.[00459] According to some early embodiments of the 11th aspect, the antibody or antigen-binding fragment a) does not block CCL1-induced β-arrestin signaling and/or b) does not induce ERK1/2 phosphorylation and/or c) does not induce AKT phosphorylation.
[00460] O Exemplo 10.4.1 mostra que os anticorpos da técnica anterior 433H e L268G8 bloquearam eficazmente a sinalização de β- arrestina induzida por CCL1, por exemplo, com valores de IC50 abaixo de 20 nM (conforme tabela 10.4.1.1), enquanto nenhum valor de IC50 pode ser determinado para anticorpos inventivos, tais como TPP- 23411.[00460] Example 10.4.1 shows that the prior art antibodies 433H and L268G8 effectively blocked CCL1-induced β-arrestin signaling, for example, with IC50 values below 20 nM (as per Table 10.4.1.1), whereas no IC50 value could be determined for inventive antibodies such as TPP-23411.
[00461] De acordo com algumas modalidades A das primeiras modalidades do 11° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno não bloqueia a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1. Em caso de dúvida, um anticorpo bloqueia a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1, se o IC50 estiver abaixo de 100 nM. Em caso de dúvida, um anticorpo não bloqueia a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1, se o IC50 for > 100 nM, ou se nenhum IC50 puder ser determinado com o sistema de ensaio descrito aqui. A sinalização de β- arrestina induzida por CCL1 foi associada à internalização do receptor, como descrito no 12° aspecto.[00461] According to some embodiments of the first embodiments of aspect 11, the antibody or antigen-binding fragment does not block CCL1-induced β-arrestin signaling. In case of doubt, an antibody blocks CCL1-induced β-arrestin signaling if the IC50 is below 100 nM. In case of doubt, an antibody does not block CCL1-induced β-arrestin signaling if the IC50 is > 100 nM, or if no IC50 can be determined with the assay system described herein. CCL1-induced β-arrestin signaling has been associated with receptor internalization, as described in aspect 12.
[00462] O Exemplo 10.4.2, Fig. 27, 28 mostra que os anticorpos da técnica anterior induzem a fosforilação de Erk1/2 em células CHO expressando CCR8 humano ou Tregs humanos ativados, por exemplo, após 15 minutos, pelo menos por um fator de 1,5. Em vez disso, o an-ticorpo TPP-23411 da invenção não induziu uma fosforilação significativa de Erk1/2.[00462] Example 10.4.2, Fig. 27, 28 shows that the antibodies of the prior art induce Erk1/2 phosphorylation in CHO cells expressing human CCR8 or activated human Tregs, for example, after 15 minutes, by at least a factor of 1.5. Instead, the TPP-23411 antibody of the invention did not induce significant Erk1/2 phosphorylation.
[00463] De acordo com algumas modalidades B das primeiras modalidades do 11° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno não induz a fosforilação de ERK1/2. Em caso de dúvida, um anticorpo induz a fosforilação de Erk1/2, se - usando um ensaio como descrito aqui - pelo menos um aumento de 1,5 vezes dos níveis de fosforilação de Erk1/2 sobre o controle puder ser detectado. Em caso de dúvida, um anticorpo não induz a fosforilação de Erk1/2, se não for detectado aumento significativo dos níveis de fosforilação de Erk1/2 ou se o aumento for inferior a 1,5 vezes em relação ao controle.[00463] According to some embodiments B of the first embodiments of the 11th aspect, the antibody or antigen-binding fragment does not induce ERK1/2 phosphorylation. In case of doubt, an antibody induces Erk1/2 phosphorylation if – using an assay as described herein – at least a 1.5-fold increase in Erk1/2 phosphorylation levels over the control can be detected. In case of doubt, an antibody does not induce Erk1/2 phosphorylation if no significant increase in Erk1/2 phosphorylation levels is detected or if the increase is less than 1.5-fold relative to the control.
[00464] O Exemplo 10.4.2, Fig. 30, mostra que os anticorpos da técnica anterior induzem a fosforilação de AKT, por exemplo, após 15 minutos pelo menos por um fator de 1,5. Em vez disso, o anticorpo TPP-23411 da invenção não induziu uma fosforilação significativa de AKT.[00464] Example 10.4.2, Fig. 30, shows that the antibodies of the prior art induce AKT phosphorylation, for example, after 15 minutes by a factor of 1.5. Instead, the TPP-23411 antibody of the invention did not induce significant AKT phosphorylation.
[00465] De acordo com algumas modalidades C das primeiras modalidades do 11° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno não induz a fosforilação de AKT. Em caso de dúvida, um anticorpo induz a fosforilação de AKT, se - usando um ensaio como descrito aqui - pelo menos um aumento de 1,5 vezes dos níveis de fosfori- lação de AKT sobre o controle puder ser detectado. Em caso de dúvida, um anticorpo não induz a fosforilação de AKT se não for detectado aumento significativo dos níveis de fosforilação de AKT ou se o aumento for menor do que 1,5 vezes em relação ao controle.[00465] According to some embodiments C of the first embodiments of the 11th aspect, the antibody or antigen-binding fragment does not induce AKT phosphorylation. In case of doubt, an antibody induces AKT phosphorylation if – using an assay as described herein – at least a 1.5-fold increase in AKT phosphorylation levels over the control can be detected. In case of doubt, an antibody does not induce AKT phosphorylation if no significant increase in AKT phosphorylation levels is detected or if the increase is less than 1.5-fold relative to the control.
[00466] Presume-se que anticorpos ou fragmentos que não mostram indução de vias de sinalização independentes de proteína G, tais como fosforilação de AKT ou ERK1/2, tenham vantagens na terapia porque a indução de sinalização dependente de proteína G pode levar a efeitos indesejados e efeitos colaterais.[00466] It is assumed that antibodies or fragments that do not show induction of G protein-independent signaling pathways, such as AKT or ERK1/2 phosphorylation, have advantages in therapy because induction of G protein-dependent signaling can lead to undesirable effects and side effects.
[00467] Para analisar a sinalização dependente da proteína G, o ensaio de fluxo de Ca como conhecido na técnica e como descrito aqui pode ser usado como uma leitura. Constatou-se que a maioria dos anticorpos inventivos testados eram antagonistas totalmente eficazes da sinalização de Ca dependente da proteína G, no entanto, as diferenças no IC50 podem ser determinadas em comparação com os anticorpos da técnica anterior.[00467] To analyze G protein-dependent signaling, the Ca flux assay as known in the art and as described herein can be used as a readout. Most of the inventive antibodies tested were found to be fully effective antagonists of G protein-dependent Ca signaling; however, differences in IC50 can be determined in comparison with antibodies from the prior art.
[00468] O Exemplo 10.4.3 mostra que vários dos anticorpos anti- CCR8 testados bloquearam a sinalização de Ca dependente de proteína G induzida por CCL1, por exemplo, com valores de IC50 na faixa de nM baixo ou mesmo sub nM.[00468] Example 10.4.3 shows that several of the anti-CCR8 antibodies tested blocked CCL1-induced G protein-dependent Ca signaling, for example, with IC50 values in the low nM or even sub-nM range.
[00469] De acordo com algumas segundas modalidades do 11° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das primeiras modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno bloqueia a sinalização de cálcio induzida por CCL1. Em algumas dessas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno bloqueia a sinalização de cálcio induzida por CCL1, por exemplo, com um IC50 < 1 nM, < 0,5 nM ou < 0,01 nM.[00469] According to some second embodiments of the 11th aspect, which may be the same as or different from the first embodiments, the antibody or antigen-binding fragment blocks CCL1-induced calcium signaling. In some of these preferred embodiments, the antibody or antigen-binding fragment blocks CCL1-induced calcium signaling, for example, with an IC50 < 1 nM, < 0.5 nM, or < 0.01 nM.
[00470] De acordo com algumas terceiras modalidades do 11° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes às primeiras modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno não bloqueia a sinalização de cálcio dependente de proteína G induzida por CCL1.[00470] According to some third embodiments of the 11th aspect, which may be the same as or different from the first embodiments, the antibody or antigen-binding fragment does not block CCL1-induced G protein-dependent calcium signaling.
[00471] Um anticorpo anti-CCR8 pode ser um anticorpo não inter- nalizante, de baixa internalização, de internalização média ou de alta internalização ou fragmento de ligação ao antígeno.[00471] An anti-CCR8 antibody can be a non-internalizing, low-internalizing, medium-internalizing, or high-internalizing antibody or antigen-binding fragment.
[00472] De acordo com um 12° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6°, 7°, 8°, 9°, 10° e/ou 11° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é um anticorpo não internalizante ou de baixa interna- lização ou fragmento de ligação ao antígeno.[00472] According to a 12th aspect, which may or may not be the same as the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th and/or 11th aspects, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided that binds specifically to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment is a non-internalizing or low-internalizing antibody or antigen-binding fragment.
[00473] Dependendo do modo de ação específico de um anticorpo, fragmento ou conjugado, a internalização em uma célula pode ser desejada ou deve ser evitada, como descrito em outro lugar aqui. Os anticorpos de acordo com o 12° aspecto são particularmente adequados para uma abordagem ADCC/ADCP, ou qualquer outro modo de ação baseado no anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para recrutar células efetoras.[00473] Depending on the specific mode of action of an antibody, fragment, or conjugate, internalization into a cell may be desired or should be avoided, as described elsewhere here. Antibodies according to the 12th aspect are particularly well-suited for an ADCC/ADCP approach, or any other antibody- or fragment-based antigen-binding mode of action to recruit effector cells.
[00474] Como a superexpressão pode afetar o comportamento de internalização e é menos adequada para modelar a internalização em um ambiente terapêutico, a internalização é preferivelmente determinada usando uma linhagem celular modelo com expressão endógena do alvo. Quando o alvo é CCR8 humano, a célula que expressa endo- genamente o alvo é preferivelmente HuT78. Quando o alvo é CCR8 de murino, a célula que expressa endogenamente o alvo é preferivelmente BW5147.3 murino. HuT78 e mBW5147.3 podem ser obtidos da ATCC.[00474] Because overexpression can affect internalization behavior and is less suitable for modeling internalization in a therapeutic setting, internalization is preferably determined using a model cell line with endogenous expression of the target. When the target is human CCR8, the cell endogenously expressing the target is preferably HuT78. When the target is murine CCR8, the cell endogenously expressing the target is preferably murine BW5147.3. HuT78 and mBW5147.3 can be obtained from ATCC.
[00475] Embora todos os anticorpos da técnica anterior sejam prontamente internalizados em células com expressão alvo endógena, como mostrado no Exemplo 10.5, os anticorpos testados TPP-21360, TPP-21047 (dados não mostrados) e TPP-23411 e vários outros anticorpos de acordo com a presente invenção não internalizaram significativamente.[00475] Although all antibodies of the prior art are readily internalized into cells with endogenous target expression, as shown in Example 10.5, the tested antibodies TPP-21360, TPP-21047 (data not shown) and TPP-23411 and several other antibodies according to the present invention did not internalize significantly.
[00476] Por exemplo, a internalização pode ser determinada ao longo de um período de tempo ou para pontos de tempo específicos. Preferivelmente, a internalização pode ser determinada após 15 min, 30 min, 1h, 2h, 3h, 6h, 12h, 24h ou 48h em uma célula que expressa endogenamente o alvo.[00476] For example, internalization can be determined over a period of time or for specific time points. Preferably, internalization can be determined after 15 min, 30 min, 1 h, 2 h, 3 h, 6 h, 12 h, 24 h, or 48 h in a cell that endogenously expresses the target.
[00477] De acordo com algumas primeiras modalidades do 12° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão alvo endógena que é menor do que 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 10 vezes a internali- zação do controle de isotipo. O controle de isotipo para um anticorpo pode ser selecionado conforme conhecido na técnica para corresponder ao isotipo do anticorpo o mais próximo possível, mas sem se ligar ao alvo.[00477] According to some early embodiments of the 12th aspect, the antibody or antigen-binding fragment is characterized by internalization into a cell with endogenous target expression that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, or 10 times the internalization of the isotype control. The isotype control for an antibody may be selected as known in the art to match the antibody isotype as closely as possible, but without binding to the target.
[00478] De acordo com algumas dessas modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é caracterizado por uma interna- lização em uma célula com expressão alvo endógena que é menor do que 150%, 175%, 200%, 300%, 400% ou 500% da internalização do controle de isotipo, por exemplo, após 15 min, 30 min, 1h, 2h, 3h, 6h, 12h, 24h ou 48h, preferivelmente em que a célula com expressão alvo endógena é uma célula de linfoma HuT78.[00478] According to some of these embodiments, the antibody or antigen-binding fragment is characterized by internalization into a cell with endogenous target expression that is less than 150%, 175%, 200%, 300%, 400%, or 500% of the internalization of the isotype control, for example, after 15 min, 30 min, 1h, 2h, 3h, 6h, 12h, 24h, or 48h, preferably where the cell with endogenous target expression is a HuT78 lymphoma cell.
[00479] De acordo com algumas dessas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno tem uma taxa de inter- nalização na mesma ordem de grandeza que a taxa de internalização do controle de isotipo.[00479] According to some of these preferred embodiments, the antibody or antigen-binding fragment has an internalization rate on the same order of magnitude as the internalization rate of the isotype control.
[00480] De acordo com algumas segundas modalidades do 12° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das primeiras modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno liga-se especificamente ao CCR8 humano e é caracterizado por um tempo até metade da quantidade de anticorpo, fragmento ou conjugado ser internalizado que é > 2 horas, preferivelmente > 4, > 5, > 6, > 7, > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20, > 21, > 22, > 23, > 24, > 26, > 28, > 30 ou > 48 horas em uma célula que expressa endogenamente o alvo, ou nenhum tempo pode ser determinado, preferivelmente em que a célula que expressa endogenamente o alvo é uma célula de linfoma HuT78. Por exemplo, o anticorpo anti-CCR8 tem uma taxa de internalização mais baixa do que os anticorpos 433H e L263G8 (BioLegend Cat. No. 360602).[00480] According to some second embodiments of the 12th aspect, which may be the same as or different from the first embodiments, the antibody or antigen-binding fragment binds specifically to human CCR8 and is characterized by a time until half the amount of antibody, fragment or conjugate is internalized that is > 2 hours, preferably > 4, > 5, > 6, > 7, > 8, > 9, > 10, > 11, > 12, > 13, > 14, > 15, > 16, > 17, > 18, > 19, > 20, > 21, > 22, > 23, > 24, > 26, > 28, > 30 or > 48 hours in a cell endogenously expressing the target, or no time can be determined, preferably in which the cell endogenously expressing the target is a HuT78 lymphoma cell. For example, the anti-CCR8 antibody has a lower internalization rate than the 433H and L263G8 antibodies (BioLegend Cat. No. 360602).
[00481] De acordo com algumas terceiras modalidades do 12° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes da primeira ou segunda modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno liga-se especificamente ao CCR8 de murino e tem uma taxa de internalização mais baixa do que o anticorpo SA214G2 em uma célula endogena- mente expressando o alvo, preferivelmente em que a célula que ex- pressa endogenamente o alvo é uma linhagem celular de linfoma de murino BW5147.3.[00481] According to some third embodiments of the 12th aspect, which may be the same as or different from the first or second embodiments, the antibody or antigen-binding fragment binds specifically to murine CCR8 and has a lower internalization rate than SA214G2 antibody in a cell endogenously expressing the target, preferably where the cell endogenously expressing the target is a murine lymphoma cell line BW5147.3.
[00482] O anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno fornecido é preferivelmente também um anticorpo de acordo com qualquer um dos aspectos 7, 8, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 16, 17 ou 18 ou uma combinação dos mesmos.[00482] The supplied isolated antibody or antigen-binding fragment is preferably also an antibody according to any one of aspects 7, 8, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 or a combination thereof.
[00483] Para induzir a morte de células que expressam CCR8, tal como Tregs ativadas, vários modos de ação podem ser previstos. Um modo de ação é a conjugação de um anticorpo direcionado ao CCR8 a um fármaco na forma de um conjugado anticorpo-fármaco (ADC). Ou-tros possíveis modos de ação são ADCC, CDC e ADCP. Para ADCC, CDC e ADCP, um mecanismo de duas etapas está envolvido: por um lado, o anticorpo ou fragmento é necessário para se ligar eficazmente à célula alvo, por exemplo, o Treg por meio de CCR8, por outro lado, a parte FC do anticorpo (ou uma porção de ligação alternativa que pode ser conjugada com o anticorpo ou fragmento como descrito em outro lugar aqui) tem que se ligar a uma célula efetora, que então mediará a morte da célula alvo. Para ADCP, a ligação aos macrófagos como células efetoras ocorre tipicamente através da interação da parte FC dos anticorpos com FcYRIIa (CD32a) expresso por macrófagos. Ao contrário, ADCC é mediado através da interação do anticorpo ou fragmento com FcYRIIIa. Em humanos, FCYRIII existe em duas formas diferentes: FcYRIIIa (CD16a) e FcYRIIIb (CD16b). Enquanto o FcYRIIIa é expresso em mastócitos, macrófagos e células exterminadoras naturais como um receptor de transmembrana, o FcYRIIIb é expresso apenas em neutrófilos. Esses receptores se ligam à porção Fc dos anticorpos IgG, que então ativa a citotoxicidade mediada por células dependentes de anticorpos (ADCC) mediada pelas células efetoras humanas.[00483] To induce the death of cells expressing CCR8, such as activated Tregs, several modes of action can be predicted. One mode of action is the conjugation of an antibody targeting CCR8 to a drug in the form of an antibody-drug conjugate (ADC). Other possible modes of action are ADCC, CDC, and ADCP. For ADCC, CDC, and ADCP, a two-step mechanism is involved: on the one hand, the antibody or fragment is required to bind effectively to the target cell, for example, the Treg via CCR8; on the other hand, the FC portion of the antibody (or an alternative binding portion that may be conjugated to the antibody or fragment as described elsewhere here) has to bind to an effector cell, which will then mediate the death of the target cell. For ADCP, binding to macrophages as effector cells typically occurs through the interaction of the FC portion of the antibodies with FcYRIIa (CD32a) expressed by macrophages. In contrast, ADCC is mediated through the interaction of the antibody or fragment with FcYRIIIa. In humans, FcYRIII exists in two different forms: FcYRIIIa (CD16a) and FcYRIIIb (CD16b). While FcYRIIIa is expressed on mast cells, macrophages, and natural killer cells as a transmembrane receptor, FcYRIIIb is expressed only on neutrophils. These receptors bind to the Fc portion of IgG antibodies, which then activates antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) mediated by human effector cells.
[00484] Em caso de dúvida, onde a indução de ADCC e/ou ADCP é analisada, pelo menos 80% e preferivelmente pelo menos 85% das células alvo são necessárias para mostrar a expressão de CCR8.[00484] In case of doubt, where ADCC and/or ADCP induction is analyzed, at least 80% and preferably at least 85% of the target cells are required to show CCR8 expression.
[00485] De acordo com um 13° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11° e/ou 12° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente a CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz ADCC e/ou ADCP.[00485] According to a 13th aspect, which may or may not be the same as aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11 and/or 12, an isolated antibody or antigen-binding fragment is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment induces ADCC and/or ADCP.
[00486] Por exemplo, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é não fucosilado e a) induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas, e b) induz fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos, preferivelmente em que o ADCC e ADCP máximo induzidos em a depleção in vitro de células alvo que expressam CCR8 humano é de pelo menos 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% ou 99%. Em caso de dúvida, ADCC e ADCP devem ser determinados usando células alvo em que pelo menos 85% das células expressam CCR8.[00486] For example, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment is non-fucosylated and a) induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human NK cells, and b) induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human macrophages, preferably wherein the maximum ADCC and ADCP induced upon in vitro depletion of target cells expressing human CCR8 is at least 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% or 99%. In case of doubt, ADCC and ADCP should be determined using target cells in which at least 85% of the cells express CCR8.
[00487] Em algumas modalidades preferidas do 13° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é não fucosilado. Os anticorpos não fucosilados são anticorpos projetados de modo que os oligossacarídeos na região Fc do anticorpo não tenham unidades de açúcar fucose. Os anticorpos não fucosilados podem ser obtidos como é conhecido na técnica, por exemplo, como descrito no Exemplo 10.3. O Exemplo 10.3.2 demonstra a ligação melhorada das versões não fucosiladas dos anticorpos inventivos a FcYRIIIa. A ligação a FcYRIIa também foi ligeiramente melhorada. Além disso, a fucosilação aumentou a ligação ao cinomolgo Fc gama RIII, conforme a Tabela 10.3.2.1. ADCC[00487] In some preferred embodiments of the 13th aspect, the antibody or antigen-binding fragment is non-fucosylated. Non-fucosylated antibodies are antibodies designed so that the oligosaccharides in the Fc region of the antibody do not have fucose sugar units. Non-fucosylated antibodies can be obtained as is known in the art, for example, as described in Example 10.3. Example 10.3.2 demonstrates the improved binding of the non-fucosylated versions of the inventive antibodies to FcYRIIIa. Binding to FcYRIIa was also slightly improved. In addition, fucosylation increased binding to cynomolgus Fc gamma RIII, as shown in Table 10.3.2.1. ADCC
[00488] Em algumas primeiras modalidades A do 13° aspecto, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga ao receptor gama Fc humano IIIA variante V176 (CD16a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM ou 200 nM.[00488] In some early embodiments of the 13th aspect, the antibody or antigen-binding fragment binds to the human Fc gamma receptor IIIA variant V176 (CD16a) with a dissociation constant (KD) less than 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM, or 200 nM.
[00489] Em algumas primeiras modalidades B do 13° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das primeiras modalidades A, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam CCR8 humano por meio de células efetoras humanas, tais como células NK humanas. A indução de ADCC pode ser analisada com um ensaio conhecido na técnica, por exemplo, como descrito de acordo com os Exemplos 10.3.3 ff.[00489] In some early embodiments B of aspect 13, which may be the same as or different from early embodiments A, the antibody or antigen-binding fragment induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human NK cells. The induction of ADCC can be analyzed with an assay known in the art, for example, as described in Examples 10.3.3 ff.
[00490] Em algumas primeiras modalidades C do 13° aspecto, que podem ser iguais ou diferentes das primeiras modalidades A ou B, a depleção máxima induzida por ADCC de células T regulatórias humanas ativadas é de pelo menos 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% ou 99%, preferivelmente, onde pelo menos 85% das células T regulatórias humanas ativadas têm expressão de CCR8, conforme a Tabela 10.3.3.1.2 e Tabela 10.3.3.1.3.[00490] In some early C embodiments of aspect 13, which may be the same as or different from early A or B embodiments, the maximum ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, or 99%, preferably, where at least 85% of activated human regulatory T cells have CCR8 expression, as per Table 10.3.3.1.2 and Table 10.3.3.1.3.
[00491] Em algumas primeiras modalidades D do 13° aspecto, que pode ser igual ou diferente das primeiras modalidades A, B ou C, a EC50 para a depleção induzida por ADCC de células T regulatórias humanas ativadas é menor do que 500 pM, 400 pM, 300 pM, 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 20 pM, 12,5 pM, 10 pM, 5 pM ou 2,5 pM. Preferivelmente, pelo menos 85% das células T regulatórias humanas ativadas têm expressão de CCR8. ADCP[00491] In some early D modalities of aspect 13, which may be the same as or different from early A, B, or C modalities, the EC50 for ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is less than 500 pM, 400 pM, 300 pM, 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 20 pM, 12.5 pM, 10 pM, 5 pM, or 2.5 pM. Preferably, at least 85% of activated human regulatory T cells have CCR8 expression. ADCP
[00492] Em algumas segundas modalidades A do 13° aspecto, que pode ou não ser o mesmo que as primeiras modalidades A, B, C e/ou D, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga ao Fc gama RIIA humano (CD32a) com um constante de dissociação (KD) menor do que 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM ou 1 μM.[00492] In some second embodiments A of the 13th aspect, which may or may not be the same as the first embodiments A, B, C and/or D, the antibody or antigen-binding fragment binds to human Fc gamma RIIA (CD32a) with a dissociation constant (KD) less than 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM or 1 μM.
[00493] Em algumas segundas modalidades B do 13° aspecto, que podem ser iguais às primeiras modalidades A, B, C e/ou D, e que podem ser iguais às segundas modalidades A, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz anticorpo fagocitose mediada por células dependente (ADCP) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos. Por exemplo, os macrófagos humanos podem ser macrófa- gos M2c ou M1.[00493] In some second-part B embodiments of the 13th aspect, which may be the same as the first embodiments A, B, C, and/or D, and which may be the same as the second-part A embodiments, the antibody or antigen-binding fragment induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human macrophages. For example, human macrophages may be M2c or M1 macrophages.
[00494] Em algumas segundas modalidades C do 13° aspecto, que podem ser iguais às primeiras modalidades A, B, C e/ou D, e que podem ser iguais às segundas modalidades A e/ou B, a depleção máxima induzida por ADCP de células T regulatórias humanas ativadas é de pelo menos 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% ou 50%.[00494] In some second C modalities of the 13th aspect, which may be the same as the first modalities A, B, C and/or D, and which may be the same as the second modalities A and/or B, the maximum ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% or 50%.
[00495] Em algumas segundas modalidades D do 13° aspecto, que podem ser iguais às primeiras modalidades A, B, C e/ou D, e que podem ser iguais às segundas modalidades A, B e/ou C, a EC50 para ADCP- a depleção induzida de células T regulatórias humanas ativadas é menor do que 1500 pM, 1000 pM, 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM, 25 pM ou 10 pM.[00495] In some second D modalities of the 13th aspect, which may be the same as the first modalities A, B, C and/or D, and which may be the same as the second modalities A, B and/or C, the EC50 for ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is less than 1500 pM, 1000 pM, 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM, 25 pM or 10 pM.
[00496] Em algumas modalidades preferidas, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) liga-se ao receptor gama Fc humano IIIA variante V176 (CD16a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM ou 200 nM e/oub) liga-se ao Fc gama RIIA humano (CD32a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM ou 1 μM.[00496] In some preferred embodiments, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that binds specifically to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment a) binds to human Fc gamma receptor IIIA variant V176 (CD16a) with a dissociation constant (KD) less than 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM or 200 nM and/or b) binds to human Fc gamma receptor RIIA (CD32a) with a dissociation constant (KD) less than 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM or 1 μM.
[00497] Em algumas modalidades preferidas, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas e/oub) induz fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos.[00497] In some preferred embodiments, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that binds specifically to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment a) induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells such as human NK cells and/or b) induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells such as human macrophages.
[00498] Em algumas modalidades preferidas, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em quea) a depleção máxima induzida por ADCC de células T re- gulatórias humanas ativadas é de pelo menos 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% ou 99%, e/oub) a depleção máxima induzida por ADCP de células T re- gulatórias humanas ativadas é de pelo menos 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% ou 50%, e/ouc) a depleção máxima de células T regulatórias intratumo- rais, in vitro ou em um indivíduo, é de pelo menos 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% ou 99%.[00498] In some preferred embodiments, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that binds specifically to CCR8, wherein a) the maximum ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% or 99%, and/or b) the maximum ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% or 50%, and/or c) the maximum depletion of intratumoral regulatory T cells, in vitro or in an individual, is at least 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% or 99%.
[00499] Em algumas modalidades preferidas, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em quea) a EC50 para a depleção induzida por ADCC de células T regulatórias humanas ativadas é menor do que 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12,5 pM, 10 pM ou 5 pM e/oub) a EC50 para a depleção induzida por ADCP de células T regulatórias humanas ativadas é menor do que 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM ou 25 pM.[00499] In some preferred embodiments, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that binds specifically to CCR8, wherein a) the EC50 for ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is less than 200 pM, 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12.5 pM, 10 pM or 5 pM and/or b) the EC50 for ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is less than 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM or 25 pM.
[00500] O anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno fornecido é preferivelmente também um anticorpo de acordo com qualquer um dos aspectos 14, 15, 16, 17 ou 18 ou uma combinação dos mesmos.[00500] The supplied isolated antibody or antigen-binding fragment is preferably also an antibody according to any of aspects 14, 15, 16, 17 or 18 or a combination thereof.
[00501] Os efeitos terapêuticos in vivo dos anticorpos de acordo com a presente invenção são mostrados nos Exemplos 12 segs. A capacidade de um anticorpo para modular números absolutos e relativos de várias populações de células imunes é estruturalmente realizada por uma combinação de propriedades de ligação ao alvo e interação com o receptor FC, por exemplo, como descrito de acordo com o 7°, 10°, 12° e/ou 13° ° aspecto ou uma combinação dos mesmos.[00501] The in vivo therapeutic effects of antibodies according to the present invention are shown in Examples 12 et seq. The ability of an antibody to modulate absolute and relative numbers of various immune cell populations is structurally realized by a combination of target-binding properties and interaction with the FC receptor, for example, as described according to the 7th, 10th, 12th and/or 13th aspects or a combination thereof.
[00502] De acordo com um 14° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12° e/ou 13° aspecto, é fornecido um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente a CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno esgota células T regulatórias ativadas, preferivelmente Tregs intratumorais. O Exemplo 12.1.1 mostra altos níveis de depleção de Treg obtidas com os anticorpos inventivos em vários modelos de camundongo, em que os anticorpos substitutos são caracterizados por características funcionais comparáveis como os anticorpos CCR8 anti- humanos fornecidos. Interessantemente, uma resposta terapêutica superior foi observada naqueles casos, onde a depleção de Treg foi de pelo menos 50%. A depleção de Tregs pode ser medida in vitro ou in vivo. Conforme entendido pela pessoa versada na técnica, a depleção de Treg pode ser uma depleção temporal. Por exemplo, a depleção de Tregs pode ser analisada 24, 48 ou 72 horas após o tratamento.[00502] According to a 14th aspect, which may or may not be the same as aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, and/or 13, an antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment depletes activated regulatory T cells, preferably intratumoral Tregs. Example 12.1.1 shows high levels of Treg depletion obtained with the inventive antibodies in several mouse models, wherein the surrogate antibodies are characterized by functional features comparable to the provided anti-human CCR8 antibodies. Interestingly, a superior therapeutic response was observed in those cases where Treg depletion was at least 50%. Treg depletion can be measured in vitro or in vivo. As understood by someone skilled in the art, Treg depletion can be a temporal depletion. For example, Treg depletion can be analyzed 24, 48, or 72 hours after treatment.
[00503] De acordo com algumas primeiras modalidades do 14° aspecto, uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é caracterizada por uma depleção máxima de células T regu- latórias ativadas ou intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, de pelo menos 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% ou 99%.[00503] According to some early embodiments of the 14th aspect, an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment is characterized by a maximal depletion of activated or intratumoral regulatory T cells, in vitro or in an individual, of at least 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% or 99%.
[00504] A determinação in vitro ou in vivo pode ocorrer como conhecido na técnica. A determinação in vivo pode ocorrer como descrito nos Exemplos 12 segs. Indivíduos adequados incluem, por exemplo, humanos e não humanos, como camundongo (por exemplo, modelo CT26 ou modelo EMT-6), roedor ou cinomolgo.[00504] In vitro or in vivo determination may occur as known in the art. In vivo determination may occur as described in Examples 12 et seq. Suitable subjects include, for example, humans and non-humans such as mice (e.g., CT26 model or EMT-6 model), rodents, or cynomolgus.
[00505] De acordo com algumas segundas modalidades do 14° aspecto, que podem ou não ser iguais às primeiras modalidades, uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno diminui o número de células T regulatórias ativadas ou intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para menos de 55%, 50%, 40%, 30%, 25%, 20%, 10%, 5% ou 1%. A diminuição pode ser uma diminuição temporária. Por exemplo, e sem estar limitado pela teoria, o pool de Tregs intratu- morais pode ser posteriormente reabastecido.[00505] According to some second embodiments of the 14th aspect, which may or may not be the same as the first embodiments, an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment decreases the number of activated or intratumoral regulatory T cells, in vitro or in an individual, to less than 55%, 50%, 40%, 30%, 25%, 20%, 10%, 5%, or 1%. The decrease may be temporary. For example, and without being limited by the theory, the pool of intratumoral Tregs may be subsequently replenished.
[00506] De acordo com algumas terceiras modalidades do 14° aspecto, que pode ou não ser o mesmo que a primeira e/ou segunda modalidades, uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno aumenta a relação de células T CD8+ intratumorais para - Tregs tumorais, in vitro ou em um indivíduo, a pelo menos 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 ou superior. O aumento pode ser um aumento temporário.[00506] According to some third embodiments of the 14th aspect, which may or may not be the same as the first and/or second embodiments, an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment increases the ratio of intratumoral CD8+ T cells to tumor-Tregs, in vitro or in an individual, to at least 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 or higher. The increase may be a temporary increase.
[00507] De acordo com algumas quartas modalidades do 14° aspecto, que pode ou não ser o mesmo que a primeira, segunda e/ou terceira modalidades, uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno diminui a porcentagem de células T regulatórias de células T CD4+ intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para < 30 %, < 20 %, < 10 % ou < 5 %. A diminuição pode ser uma diminuição temporária.[00507] According to some fourth embodiments of the 14th aspect, which may or may not be the same as the first, second and/or third embodiments, an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment decreases the percentage of intratumoral CD4+ T cells, in vitro or in an individual, to < 30%, < 20%, < 10% or < 5%. The decrease may be a temporary decrease.
[00508] Em modalidades preferidas, uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) diminui o número de células T regulatórias ativadas ou intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para menos de 30%, 25%, 20%, 10%, 5% ou 1% e/oub) aumenta a relação de células T CD8+ intratumorais para Tregs intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para pelo menos 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 ou mais e/ouc) diminui a percentagem de células T regulatórias de células T CD4+ intratumorais, in vitro ou num indivíduo, para < 30 %, < 20 %, < 10 % ou < 5 %.[00508] In preferred embodiments, an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment a) decreases the number of activated or intratumoral regulatory T cells, in vitro or in an individual, to less than 30%, 25%, 20%, 10%, 5% or 1% and/or b) increases the ratio of intratumoral CD8+ T cells to intratumoral Tregs, in vitro or in an individual, to at least 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 or more and/or c) decreases the percentage of regulatory T cells to intratumoral CD4+ T cells, in vitro or in an individual, to < 30%, < 20%, < 10% or < 5%.
[00509] Os anticorpos de acordo com o aspecto atual foram superiores em termos de eficácia terapêutica, veja os Exemplos 12 e segs. O anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno fornecido é preferivelmente também um anticorpo de acordo com qualquer um dos aspectos 15, 16, 17 ou 18 ou uma combinação dos mesmos.[00509] Antibodies according to the present aspect were superior in terms of therapeutic efficacy, see Examples 12 et seq. The single antibody or antigen-binding fragment provided is preferably also an antibody according to any of aspects 15, 16, 17 or 18 or a combination thereof.
[00510] De acordo com um 15° aspecto, que pode ser ou não igual ao 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13° e/ou 14° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em que uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno aumenta o número absoluto de células imunes em um volume de tumor definido, por exemplo, pelo menos por um fator de 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5 ou 4.[00510] According to a 15th aspect, which may or may not be the same as the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th and/or 14th aspect, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided which binds specifically to CCR8, wherein an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment increases the absolute number of immune cells in a defined tumor volume, for example, by at least a factor of 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5 or 4.
[00511] O Exemplo 12.8 mostra um aumento maciço nos níveis de expressão de mRNA para vários marcadores de células imunes globais ou específicos em tumores responsivos de diferentes indivíduos no final do estudo. Um aumento foi observado, por exemplo, para ma- crófagos (em particular macrófagos M1), células T CD8+, células NK, células T CD3+, células B e, interessantemente, também Tregs ativadas, sugerindo um aumento da infiltração dessas populações de células imunes dentro do tumor após tratamento crônico. O aumento no número absoluto de células imunes também foi confirmado por FACS, veja, Exemplo 12.3 (CT26), Exemplo 12.4 (EMT6), Exemplo 12.5 (F9). Indivíduos adequados incluem, por exemplo, indivíduos humanos e não humanos, tais como camundongo, roedor ou cinomolgo. Por exemplo, o aumento de células imunes pode ser determinado após uma, duas, três ou quatro doses efetivas do anticorpo, conforme o Exemplo 12.3, 12.4.2 e também após tratamento crônico, por exemplo, após o tratamento final. Por exemplo, o tumor pode ser um tumor caracterizado por linfócitos infiltrantes de tumor, por exemplo, um tumor caracterizado por células T infiltrantes de tumor ou um tumor caracterizado por expressão de citocinas pró-inflamatórias.[00511] Example 12.8 shows a massive increase in mRNA expression levels for several global or specific immune cell markers in responsive tumors from different individuals at the end of the study. An increase was observed, for example, for macrophages (in particular M1 macrophages), CD8+ T cells, NK cells, CD3+ T cells, B cells and, interestingly, also activated Tregs, suggesting an increased infiltration of these immune cell populations into the tumor after chronic treatment. The increase in the absolute number of immune cells was also confirmed by FACS, see Example 12.3 (CT26), Example 12.4 (EMT6), Example 12.5 (F9). Suitable individuals include, for example, human and non-human individuals such as mice, rodents or cynomolgus. For example, an increase in immune cells can be determined after one, two, three, or four effective doses of the antibody, as per Examples 12.3, 12.4.2, and also after chronic treatment, for example, after the final treatment. For example, the tumor may be a tumor characterized by tumor-infiltrating lymphocytes, for example, a tumor characterized by tumor-infiltrating T cells, or a tumor characterized by the expression of pro-inflammatory cytokines.
[00512] De acordo com algumas primeiras modalidades do 15° aspecto, as células imunes são pelo menos uma, duas, três, quatro, cinco, seis, sete, oito ou nove selecionadas dea) células CD45+ (intratumorais),b) células T CD8+ (intratumorais), c) células T CD4+ (intratumorais), d) macrófagos (intratumorais), tais como macrófagos M1 ou macrófagos M2,e) células NK (intratumorais),f) células B (intratumorais), g) Células dendríticas (intratumorais),h) células T gama delta (intratumorais) (células T não convencionais), ei) células iNKT.[00512] According to some early embodiments of the 15th aspect, immune cells are at least one, two, three, four, five, six, seven, eight, or nine selected from a) CD45+ cells (intratumoral), b) CD8+ T cells (intratumoral), c) CD4+ T cells (intratumoral), d) macrophages (intratumoral), such as M1 macrophages or M2 macrophages, e) NK cells (intratumoral), f) B cells (intratumoral), g) dendritic cells (intratumoral), h) gamma delta T cells (intratumoral) (non-conventional T cells), and i) iNKT cells.
[00513] Os respectivos tipos de células e populações são definidos como conhecidos na técnica e, em particular, como definidos em outro lugar aqui.[00513] The respective cell types and populations are defined as known in the art and, in particular, as defined elsewhere herein.
[00514] De acordo com algumas dessas primeiras modalidades altamente preferidas, três ou mais doses eficazes do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno, em um tumor, aumentama) o número de células T CD8+ intratumorais em pelo menos 150%, 200%, 250%, 300% ou 350%,b) a relação de células T CD8+ intratumorais para células T regulatórias intratumorais para pelo menos 4, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, ou mais alto,c) o número de macrófagos intratumorais pelo menos por um fator de 2, 3, 4 ou 5,d) o número de macrófagos ACOD1+ intratumorais (macró- fagos M1) pelo menos por um fator de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ou 10,e) a relação de macrófagos ACOD1+ (macrófagos M1) para macrófagos MRC1+ (macrófagos M2) para pelo menos 1,5, 2, 3, 4, 5, 10 ou maior,f) o número de células NK intratumorais em pelo menos 140% ou 200%,g) o número de células T CD3+ intratumorais em pelo menos 150%, 200%, 300% ou 400%,h) o número de células B intratumorais pelo menos por um fator de 2, 5, 10, 20, 30 ou 40,i) o número de células T CD45+ intratumorais em pelo menos 150%, 200% ou 300%, e/ou j) o número de células T CD4+ intratumorais em pelo menos 150%, 200%, 300% ou 400%.[00514] According to some of these highly preferred early modalities, three or more effective doses of antibody or antigen-binding fragment in a tumor increase a) the number of intratumoral CD8+ T cells by at least 150%, 200%, 250%, 300%, or 350%, b) the ratio of intratumoral CD8+ T cells to intratumoral regulatory T cells by at least 4, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, or higher, c) the number of intratumoral macrophages by at least a factor of 2, 3, 4, or 5, d) the number of intratumoral ACOD1+ macrophages (M1 macrophages) by at least a factor of 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 or 10, e) the ratio of ACOD1+ macrophages (M1 macrophages) to MRC1+ macrophages (M2 macrophages) by at least 1, 5, 2, 3, 4, 5, 10 or greater, f) the number of intratumoral NK cells by at least 140% or 200%, g) the number of intratumoral CD3+ T cells by at least 150%, 200%, 300% or 400%, h) the number of intratumoral B cells by at least a factor of 2, 5, 10, 20, 30 or 40, i) the number of intratumoral CD45+ T cells by at least 150%, 200% or 300%, and/or j) the number of Intratumoral CD4+ T cells in at least 150%, 200%, 300%, or 400%.
[00515] O tumor é preferivelmente um tumor caracterizado por lin- fócitos infiltrantes de tumor. Conforme entendido pela pessoa versada na técnica, o tumor é caracterizado por células que expressam o CCR8 alvo do anticorpo ou fragmento inventivo, por exemplo, Tregs intratumorais. Preferivelmente, o tumor é um tumor em um modelo de tumor singênico derivado de uma cepa BALB/c. Por exemplo, como mostrado no Exemplo 12.1.1, o tumor pode ser derivado do modelo CT26, modelo EMT-6, modelo F9, modelo C38, H22 ou B16F10-OVA, onde o anticorpo se liga especificamente ao CCR8 de murino. Por exemplo, quando o anticorpo se liga especificamente ao CCR8 humano, o tumor pode ser selecionado a partir de câncer adrenal (por exemplo, carcinoma adrenocortical ou feocromocitoma), câncer de bexiga (por exemplo, carcinoma de células de transição, carcinoma de células de transição-papilar), câncer cerebral (por exemplo, glioma- astrocitoma, Glioma-Astrocitoma-Glioblastoma, Glioma-Oligoastrocitoma, Glioma-Oligodendroglioma), Câncer de mama (por exemplo, ADC, ADC-Dutal, ADC-Ductal-TNBC, ADC-Ductal-TPBC, ADC-Lobular), Câncer colorretal (por exemplo, ADC), Câncer de esôfago (por exemplo, ADC), câncer de esôfago (por exemplo, SCC), câncer gástrico (por exemplo, ADC, ADC-difuso, ADC-Intestinal, ADC- Intestinal-Tubular), câncer de cabeça e pescoço (por exemplo, câncer de laringe-SCC, SCC, câncer oral-SCC), câncer de rim (por exemplo, ccRCC, cromófobo, papilar, papilar tipo I, papilar tipo II), câncer de fígado (por exemplo, HCC), câncer de pulmão (por exemplo, NSCLC- ADC, NSCLC-ADC-Misto, NSCLC-SCC, SCLC), mesotelioma (por exemplo, epitelioide), câncer de ovário (por exemplo, ADC- Cistadenocarcinoma-papilar seroso), câncer de pâncreas (por exemplo, ADC-ductal), câncer de próstata (por exemplo, tipo ADC-Acinar), Sarcoma (por exemplo, Leiomiossarcoma, Lipossarcoma desdiferenci- ado, Histiocitoma fibroso maligno), Câncer de pele (por exemplo, Melanoma), Câncer de testículo (por exemplo, tumor de células germina- tivas-Seminoma), Timoma, Câncer de tireoide (por exemplo, carcinoma folicular, Carcinoma papilar-variante clássica), câncer uterino (por exemplo, CEC Cervical, CEC Cervical-Queratinizante, CEC Cervical- Não-queratinizante, Endométrio-ADC-Endometrioide, Endométrio- ADC-Papilar seroso, Endométrio-Carcinossarcoma-Tumor mülleriano maligno), conforme Tabela 11.1.2.[00515] The tumor is preferably a tumor characterized by tumor-infiltrating lymphocytes. As understood by a person skilled in the art, the tumor is characterized by cells expressing the antibody-target CCR8 or inventive fragment, for example, intratumoral Tregs. Preferably, the tumor is a tumor in a syngeneic tumor model derived from a BALB/c strain. For example, as shown in Example 12.1.1, the tumor may be derived from the CT26, EMT-6, F9, C38, H22, or B16F10-OVA models, where the antibody specifically binds to murine CCR8. For example, when the antibody binds specifically to human CCR8, the tumor can be selected from adrenal cancer (e.g., adrenocortical carcinoma or pheochromocytoma), bladder cancer (e.g., transitional cell carcinoma, transitional cell-papillary carcinoma), brain cancer (e.g., glioma-astrocytoma, glioma-astrocytoma-glioblastoma, glioma-oligoastrocytoma, glioma-oligodendroglioma), breast cancer (e.g., ADC, ADC-ductal, ADC-ductal-TNBC, ADC-ductal-TPBC, ADC-lobular), colorectal cancer (e.g., ADC), esophageal cancer (e.g., ADC), esophageal cancer (e.g., SCC), gastric cancer (e.g., ADC, diffuse ADC, ADC-intestinal, ADC-intestinal-tubular), head and neck cancer (e.g., Laryngeal cancer (SCC, SCC, oral cancer), kidney cancer (e.g., ccRCC, chromophobe, papillary, papillary type I, papillary type II), liver cancer (e.g., HCC), lung cancer (e.g., NSCLC-ADC, NSCLC-ADC-Mixed, NSCLC-SCC, SCLC), mesothelioma (e.g., epithelioid), ovarian cancer (e.g., ADC-Serous papillary cystadenocarcinoma), pancreatic cancer (e.g., ADC-ductal), prostate cancer (e.g., ADC-Acinar type), sarcoma (e.g., leiomyosarcoma, undifferentiated liposarcoma, malignant fibrous histiocytoma), skin cancer (e.g., melanoma), testicular cancer (e.g., germ cell tumor-seminoma), thymoma, thyroid cancer (e.g., follicular carcinoma, carcinoma papillary-classical variant), uterine cancer (e.g., Cervical SCC, Keratinizing Cervical SCC, Non-keratinizing Cervical SCC, Endometrial-ADC-Endometrioid, Endometrial-ADC-Serous Papillary, Endometrial-Carcinosarcoma-Malignant Müllerian Tumor), as per Table 11.1.2.
[00516] Em algumas dessas modalidades, as células imunes sãoa) Células T CD8+, células T CD4+ e macrófagos,b) células T CD8+, células T CD4+, células NK,c) células T CD8+, células T CD4+, células CD45+,d) Células T CD8+, células T CD4+, células NK e macrófa- gos,e) Células T CD8+, células T CD4+, células NK e macrófa- gos, por exemplo, macrófagos ACOD1+,f) células T CD8+, células T CD4+, células NK, células CD45+,g) Células T CD8+, células T CD4+, células NK, células CD45+ e macrófagos, por exemplo, macrófagos ACOD1+,h) Células T CD8+, macrófagos ACOD1+ (macrófagos M1) e células B,i) Células T CD8+, células T CD4+ e células dendríticas, em que as células dendríticas são caracterizadas pela expressão de CD1c, CD14, CD16, CD141, CD11c e CD123, ouj) Células T CD8+ e macrófagos Acod1+ (macrófagos M1).[00516] In some of these modalities, the immune cells are a) CD8+ T cells, CD4+ T cells and macrophages, b) CD8+ T cells, CD4+ T cells, NK cells, c) CD8+ T cells, CD4+ T cells, CD45+ cells, d) CD8+ T cells, CD4+ T cells, NK cells and macrophages, e) CD8+ T cells, CD4+ T cells, NK cells and macrophages, for example, ACOD1+ macrophages, f) CD8+ T cells, CD4+ T cells, NK cells, CD45+ cells, g) CD8+ T cells, CD4+ T cells, NK cells, CD45+ cells and macrophages, for example, ACOD1+ macrophages, h) CD8+ T cells, ACOD1+ macrophages (M1 macrophages) and cells B,i) CD8+ T cells, CD4+ T cells and dendritic cells, wherein the dendritic cells are characterized by the expression of CD1c, CD14, CD16, CD141, CD11c and CD123, or j) CD8+ T cells and Acod1+ macrophages (M1 macrophages).
[00517] Em algumas dessas modalidades preferidas, as células imunes sãoa) Células T CD8+, células T CD4+ e macrófagos, ou b) Células T CD8+, células T CD4+, células NK e macrófa- gos, ouc) Células T CD8+, macrófagos ACOD1+ (macrófagos M1) e células B.[00517] In some of these preferred modalities, the immune cells are a) CD8+ T cells, CD4+ T cells and macrophages, or b) CD8+ T cells, CD4+ T cells, NK cells and macrophages, or c) CD8+ T cells, ACOD1+ macrophages (M1 macrophages) and B cells.
[00518] De acordo com algumas outras modalidades, as células imunes são células CD45+ e células T CD8+, células CD45+ e células T CD4+, células CD45+ e macrófagos (como macrófagos M1 ou ma- crófagos M2), células CD45+ e células NK, células CD45+ e células B, Células CD45+ e células dendríticas, células CD45+ e células T gama delta, células CD45+ e células iNKT, células T CD8+ e células T CD4+, células T CD8+ e macrófagos (tais como macrófagos M1 ou macrófagos M2), células T CD8+ e células NK, Células T CD8+ e células B, células T CD8+ e células dendríticas, células T CD8+ e células T gama delta, células T CD8+ e células iNKT, células T CD4+ e macró- fagos (tais como macrófagos M1 ou macrófagos M2), células T CD4+ e NK células T CD4+ e células B, células T CD4+ e células dendríti- cas, células T CD4+ e células T Gama delta, células T CD4+ e células iNKT, macrófagos (tais como macrófagos M1 ou macrófagos M2) e células NK, macrófagos (tais como Macrófagos M1 ou macrófagos M2) e células B, macrófagos (tais como macrófagos M1 ou macrófagos M2) e células dendríticas, macrófagos (tais como macrófagos M1 ou macrófagos M2) e células T gama delta, macrófagos (tais como macró- fagos M1 ou macrófagos M2) e células iNKT, células B e células den- dríticas, células B e gama delta T células B e células iNKT, células dendríticas e células T gama delta, células dendríticas e células iNKT ou células T gama delta e células iNKT.[00518] According to some other modalities, immune cells are CD45+ cells and CD8+ T cells, CD45+ cells and CD4+ T cells, CD45+ cells and macrophages (such as M1 macrophages or M2 macrophages), CD45+ cells and NK cells, CD45+ cells and B cells, CD45+ cells and dendritic cells, CD45+ cells and gamma delta T cells, CD45+ cells and iNKT cells, CD8+ T cells and CD4+ T cells, CD8+ T cells and macrophages (such as M1 macrophages or M2 macrophages), CD8+ T cells and NK cells, CD8+ T cells and B cells, CD8+ T cells and dendritic cells, CD8+ T cells and gamma delta T cells, CD8+ T cells and iNKT cells, CD4+ T cells and macrophages (such as M1 macrophages or macrophages (M2), CD4+ T cells and NK cells, CD4+ T cells and B cells, CD4+ T cells and dendritic cells, CD4+ T cells and Gamma delta T cells, CD4+ T cells and iNKT cells, macrophages (such as M1 or M2 macrophages) and NK cells, macrophages (such as M1 or M2 macrophages) and B cells, macrophages (such as M1 or M2 macrophages) and dendritic cells, macrophages (such as M1 or M2 macrophages) and gamma delta T cells, macrophages (such as M1 or M2 macrophages) and iNKT cells, B cells and dendritic cells, B cells and gamma delta T cells, B cells and iNKT cells, dendritic cells and gamma delta T cells, dendritic cells and iNKT cells gamma delta T and iNKT cells.
[00519] O anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno fornecido é preferivelmente também um anticorpo de acordo com qualquer um dos aspectos 16, 17 ou 18 ou uma combinação dosmesmos.[00519] The supplied isolated antibody or antigen-binding fragment is preferably also an antibody according to any of aspects 16, 17 or 18 or a combination thereof.
[00520] De acordo com um 16° aspecto, que pode ser igual ou não ao 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14° e/ou 15° aspecto, é fornecido um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz a formação de estruturas lin- foides terciárias. As estruturas linfoides terciárias são estruturas intra- tumorais caracterizadas pelo aumento da expressão de LTta, LTtb, Cxcr5 e seu ligante Cxcl13. Estruturas linfoides terciárias foram descritas como principais impulsionadoras de um efeito antitumoral em humanos. Sem estarem limitados pela teoria, os inventores acreditam que a formação dessas subestruturas pode contribuir para o padrão alterado em células imunes e um efeito antitumoral dos anticorpos inventivos, por exemplo, em humanos. Como descrito no Exemplo 12.8, o tratamento crônico com os anticorpos da invenção aumentou consistentemente os níveis de expressão para LTta, LTtb, bem como Cxcr5 e seu ligante Cxcl13.[00520] According to a 16th aspect, which may or may not be the same as aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 and/or 15, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that binds specifically to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment induces the formation of tertiary lymphoid structures. Tertiary lymphoid structures are intra-tumoral structures characterized by increased expression of LTta, LTtb, Cxcr5 and its ligand Cxcl13. Tertiary lymphoid structures have been described as major drivers of an antitumor effect in humans. Without being limited by theory, the inventors believe that the formation of these substructures may contribute to the altered pattern in immune cells and an antitumor effect of the inventive antibodies, for example, in humans. As described in Example 12.8, chronic treatment with the antibodies of the invention consistently increased expression levels for LTta, LTtb, as well as Cxcr5 and its ligand Cxcl13.
[00521] Os anticorpos de acordo com os dois aspectos 17 e 18 a seguir foram obtidos com um método de acordo com o aspecto 3 ou 4. Os anticorpos resultantes de acordo com o aspecto 17 e 18 ligam-se especificamente a um polipeptídeo compreendendo o TRD sulfatado de um receptor de quimiocina humano, por exemplo, em que em pelo menos 50% dos resíduos de tirosina foram sulfatados. Como descrito anteriormente aqui, o método influencia as características estruturais específicas do HCDR3 dos anticorpos obtidos e também pode influenciar as características funcionais, tal como a modulação da sinalização independente da proteína G ou o comportamento de internalização.[00521] Antibodies according to aspects 17 and 18 below were obtained using a method according to aspect 3 or 4. The resulting antibodies according to aspects 17 and 18 bind specifically to a polypeptide comprising the sulfated TRD of a human chemokine receptor, for example, wherein at least 50% of the tyrosine residues have been sulfated. As described earlier herein, the method influences the specific structural characteristics of the HCDR3 of the antibodies obtained and may also influence functional characteristics, such as modulation of G protein-independent signaling or internalization behavior.
[00522] Onde CDRs, cadeias pesadas variáveis, cadeias leves va- riáveis, cadeias pesadas ou cadeias leves são descritas, a natureza modular dos anticorpos normalmente permite sua combinação, mas também a combinação com as várias características funcionais, como descrito em outro lugar aqui.ASPECTO 17 - ANTICORPO ANTI-HUMANO CCR8 (SEQ DEFINIDO)[00522] Where CDRs, variable heavy chains, variable light chains, heavy chains or light chains are described, the modular nature of antibodies normally allows their combination, but also combination with various functional features, as described elsewhere here. ASPECT 17 - ANTI-HUMAN CCR8 ANTIBODY (SEQ DEFINED)
[00523] De acordo com um 17° aspecto, que pode ser ou não igual ao 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15° e/ou 16° aspecto, é fornecido um anticorpo anti-CCR8 isolado ou seu fragmento de ligação ao antígeno.[00523] In accordance with a 17th aspect, which may or may not be the same as aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 and/or 16, an isolated anti-CCR8 antibody or its antigen-binding fragment is provided.
[00524] Preferivelmente, os anticorpos de acordo com o aspecto atual se ligam (a) a um polipeptídeo isolado de acordo com SEQ ID NO:43 e/ou SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e (b) a um polipeptídeo isolado de acordo com SEQ ID NO:44 e/ou SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e os anticorpos são, portanto, reativos cruzados para CCR8 humano e cinomolgo. Além disso, os anticorpos são preferivelmente caracterizados por propriedades que os tornam particularmente adequados para terapia, por exemplo, são anticorpos de acordo com pelo menos um ou mais dos aspectos 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 ou 16.[00524] Preferably, the antibodies according to the present aspect bind (a) to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:43 and/or SEQ ID NO:46, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and (b) to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:44 and/or SEQ ID NO:47, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and the antibodies are therefore cross-reactive for human CCR8 and cynomolgus. In addition, the antibodies are preferably characterized by properties that make them particularly suitable for therapy, for example, they are antibodies according to at least one or more of aspects 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or 16.
[00525] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende pelo menos uma, duas e, preferivelmente, três, quatro, cinco ou seis sequências CDR com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência com qualquer uma dasa) SEQ ID NO:258, SEQ ID NO:259, SEQ ID NO:260,SEQ ID NO:262, SEQ ID NO:263 ou SEQ ID NO:264 (TPP-16966),b) SEQ ID NO:276, SEQ ID NO:277, SEQ ID NO:278,SEQ ID NO:280, SEQ ID NO:281 ou SEQ ID NO:282 (TPP-17575), c) SEQ ID NO:294, SEQ ID NO:295, SEQ ID NO:296, SEQ ID NO:298, SEQ ID NO:299 ou SEQ ID NO:300 (TPP-17576),d) SEQ ID NO:312, SEQ ID NO:313, SEQ ID NO:314,SEQ ID NO:316, SEQ ID NO:317 ou SEQ ID NO:318 (TPP-17577),e) SEQ ID NO:330, SEQ ID NO:331, SEQ ID NO:332,SEQ ID NO:334, SEQ ID NO:335 ou SEQ ID NO:336 (TPP-17578),f) SEQ ID NO:348, SEQ ID NO:349, SEQ ID NO:350,SEQ ID NO:352, SEQ ID NO:353 ou SEQ ID NO:354 (TPP-17579),g) SEQ ID NO:366, SEQ ID NO:367, SEQ ID NO:368,SEQ ID NO:370, SEQ ID NO:371 ou SEQ ID NO:372 (TPP-17580),h) SEQ ID NO:384, SEQ ID NO:385, SEQ ID NO:386,SEQ ID NO:388, SEQ ID NO:389 ou SEQ ID NO:390 (TPP-17581),i) SEQ ID NO:402, SEQ ID NO:403, SEQ ID NO:404,SEQ ID NO:406, SEQ ID NO:407 ou SEQ ID NO:408 (TPP-18205),j) SEQ ID NO:420, SEQ ID NO:421, SEQ ID NO:422,SEQ ID NO:424, SEQ ID NO:425 ou SEQ ID NO:426 (TPP-18206),k) SEQ ID NO:438, SEQ ID NO:439, SEQ ID NO:440,SEQ ID NO:442, SEQ ID NO:443 ou SEQ ID NO:444 (TPP-18207),l) SEQ ID NO:456, SEQ ID NO:457, SEQ ID NO:458,SEQ ID NO:460, SEQ ID NO:461 ou SEQ ID NO:462 (TPP-19546),m) SEQ ID NO:474, SEQ ID NO:475, SEQ ID NO:476,SEQ ID NO:478, SEQ ID NO:479 ou SEQ ID NO:480 (TPP-20950),n) SEQ ID NO:492, SEQ ID NO:493, SEQ ID NO:494,SEQ ID NO:496, SEQ ID NO:497 ou SEQ ID NO:498 (TPP-20955),o) SEQ ID NO:510, SEQ ID NO:511, SEQ ID NO:512,SEQ ID NO:514, SEQ ID NO:515 ou SEQ ID NO:516 (TPP-20965),p) SEQ ID NO:528, SEQ ID NO:529, SEQ ID NO:530,SEQ ID NO:532, SEQ ID NO:533 ou SEQ ID NO:534 (TPP-21045),q) SEQ ID NO:546, SEQ ID NO:547, SEQ ID NO:548,SEQ ID NO:550, SEQ ID NO:551 ou SEQ ID NO:552 (TPP-21047), r) SEQ ID NO:564, SEQ ID NO:565, SEQ ID NO:566,SEQ ID NO:568, SEQ ID NO:569 ou SEQ ID NO:570 (TPP-21181),s) SEQ ID NO:582, SEQ ID NO:583, SEQ ID NO:584,SEQ ID NO:586, SEQ ID NO:587 ou SEQ ID NO:588 (TPP-21183),t) SEQ ID NO:600, SEQ ID NO:601, SEQ ID NO:602,SEQ ID NO:604, SEQ ID NO:605 ou SEQ ID NO:606 (TPP-21360),u) SEQ ID NO:618, SEQ ID NO:619, SEQ ID NO:620,SEQ ID NO:622, SEQ ID NO:623 ou SEQ ID NO:624 (TPP-23411),v) SEQ ID NO:661, SEQ ID NO:662, SEQ ID NO:663,SEQ ID NO:665, SEQ ID NO:666 ou SEQ ID NO:667 (TPP-29596),w) SEQ ID NO:681, SEQ ID NO:682, SEQ ID NO:683,SEQ ID NO:685, SEQ ID NO:686 ou SEQ ID NO:687 (TPP-29597),x) SEQ ID NO:703, SEQ ID NO:704, SEQ ID NO:705,SEQ ID NO:707, SEQ ID NO:708 ou SEQ ID NO:709 (TPP-18429),y) SEQ ID NO:723, SEQ ID NO:724, SEQ ID NO:725,SEQ ID NO:727, SEQ ID NO:728 ou SEQ ID NO:729 (TPP-18430),z) SEQ ID NO:743, SEQ ID NO:744, SEQ ID NO:745,SEQ ID NO:747, SEQ ID NO:748 ou SEQ ID NO:749 (TPP-18432),aa) SEQ ID NO:763, SEQ ID NO:764, SEQ ID NO:765,SEQ ID NO:767, SEQ ID NO:768 ou SEQ ID NO:769 (TPP-18433),bb) SEQ ID NO:783, SEQ ID NO:784, SEQ ID NO:785,SEQ ID NO:787, SEQ ID NO:788 ou SEQ ID NO:789 (TPP-18436),cc) SEQ ID NO:803, SEQ ID NO:804, SEQ ID NO:805,SEQ ID NO:807, SEQ ID NO:808 ou SEQ ID NO:809 (TPP-19571),dd) SEQ ID NO: 827, SEQ ID NO: 828, SEQ ID NO: 829,SEQ ID NO: 831, SEQ ID NO: 832 ou SEQ ID NO: 833 (TPP-27477),ee) SEQ ID NO: 847, SEQ ID NO: 848, SEQ ID NO: 849,SEQ ID NO: 851, SEQ ID NO: 852 ou SEQ ID NO: 853 (TPP-27478),ff) SEQ ID NO: 867, SEQ ID NO: 868, SEQ ID NO: 869,SEQ ID NO: 871, SEQ ID NO: 872 ou SEQ ID NO: 873 (TPP-27479), gg) SEQ ID NO: 887, SEQ ID NO: 888, SEQ ID NO: 889, SEQ ID NO: 891, SEQ ID NO: 892 ou SEQ ID NO: 893 (TPP-27480),hh) SEQ ID NO: 907, SEQ ID NO: 908, SEQ ID NO: 909,SEQ ID NO: 911, SEQ ID NO: 912 ou SEQ ID NO: 913 (TPP-29367),11) SEQ ID NO: 927, SEQ ID NO: 928, SEQ ID NO: 929,SEQ ID NO: 931, SEQ ID NO: 932 ou SEQ ID NO: 933 (TPP-29368), e/oujj) SEQ ID NO: 947, SEQ ID NO: 948, SEQ ID NO: 949, SEQ ID NO: 951, SEQ ID NO: 952 ou SEQ ID NO: 953 (TPP-29369).[00525] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises at least one, two, and preferably three, four, five, or six CDR sequences with at least 90%, 95%, 98%, or 100% sequence identity with any of the following: a) SEQ ID NO:258, SEQ ID NO:259, SEQ ID NO:260, SEQ ID NO:262, SEQ ID NO:263, or SEQ ID NO:264 (TPP-16966), b) SEQ ID NO:276, SEQ ID NO:277, SEQ ID NO:278, SEQ ID NO:280, SEQ ID NO:281, or SEQ ID NO:282 (TPP-17575), c) SEQ ID NO:294, SEQ ID NO:295, SEQ ID NO:296, SEQ ID NO:298, SEQ ID NO:299 or SEQ ID NO:300 (TPP-17576),d) SEQ ID NO:312, SEQ ID NO:313, SEQ ID NO:314,SEQ ID NO:316, SEQ ID NO:317 or SEQ ID NO:318 (TPP-17577),e) SEQ ID NO:330, SEQ ID NO:331, SEQ ID NO:332,SEQ ID NO:334, SEQ ID NO:335 or SEQ ID NO:336 (TPP-17578),f) SEQ ID NO:348, SEQ ID NO:349, SEQ ID NO:350,SEQ ID NO:352, SEQ ID NO:353 or SEQ ID NO:354 (TPP-17579),g) SEQ ID NO:366, SEQ ID NO:367, SEQ ID NO:368,SEQ ID NO:370, SEQ ID NO:371 or SEQ ID NO:372 (TPP-17580),h) SEQ ID NO:384, SEQ ID NO:385, SEQ ID NO:386,SEQ ID NO:388, SEQ ID NO:389 or SEQ ID NO:390 (TPP-17581) NO:425 or SEQ ID NO:426 (TPP-18206) NO:461 or SEQ ID NO:462 (TPP-19546),m) SEQ ID NO:474, SEQ ID NO:475, SEQ ID NO:476,SEQ ID NO:478, SEQ ID NO:479 or SEQ ID NO:480 (TPP-20950),n) SEQ ID NO:492, SEQ ID NO:493, SEQ ID NO:494,SEQ ID NO:496, SEQ ID NO:497 or SEQ ID NO:498 (TPP-20955),o) SEQ ID NO:510, SEQ ID NO:511, SEQ ID NO:512,SEQ ID NO:514, SEQ ID NO:515 or SEQ ID NO:516 (TPP-20965),p) SEQ ID NO:528, SEQ ID NO:529, SEQ ID NO:530,SEQ ID NO:532, SEQ ID NO:533 or SEQ ID NO:534 (TPP-21045),q) SEQ ID NO:546, SEQ ID NO:547, SEQ ID NO:548,SEQ ID NO:550, SEQ ID NO:551 or SEQ ID NO:552 (TPP-21047), r) SEQ ID NO:564, SEQ ID NO:565, SEQ ID NO:566,SEQ ID NO:568, SEQ ID NO:569 or SEQ ID NO:570 (TPP-21181),s) SEQ ID NO:582, SEQ ID NO:583, SEQ ID NO:584,SEQ ID NO:586, SEQ ID NO:587 or SEQ ID NO:588 (TPP-21183),t) SEQ ID NO:600, SEQ ID NO:601, SEQ ID NO:602,SEQ ID NO:604, SEQ ID NO:605 or SEQ ID NO:606 (TPP-21360),u) SEQ ID NO:618, SEQ ID NO:619, SEQ ID NO:620,SEQ ID NO:622, SEQ ID NO:623 or SEQ ID NO:624 (TPP-23411),v) SEQ ID NO:661, SEQ ID NO:662, SEQ ID NO:663,SEQ ID NO:665, SEQ ID NO:666 or SEQ ID NO:667 (TPP-29596),w) SEQ ID NO:681, SEQ ID NO:682, SEQ ID NO:683,SEQ ID NO:685, SEQ ID NO:686 or SEQ ID NO:687 (TPP-29597),x) SEQ ID NO:703, SEQ ID NO:704, SEQ ID NO:705,SEQ ID NO:707, SEQ ID NO:708 or SEQ ID NO:709 (TPP-18429) NO:728 or SEQ ID NO:729 (TPP-18430),z) SEQ ID NO:743, SEQ ID NO:744, SEQ ID NO:745,SEQ ID NO:747, SEQ ID NO:748 or SEQ ID NO:749 (TPP-18432) NO:768 or SEQ ID NO:769 (TPP-18433),bb) SEQ ID NO:783, SEQ ID NO:784, SEQ ID NO:785,SEQ ID NO:787, SEQ ID NO:788 or SEQ ID NO:789 (TPP-18436),cc) SEQ ID NO:803, SEQ ID NO:804, SEQ ID NO:805,SEQ ID NO:807, SEQ ID NO:808 or SEQ ID NO:809 (TPP-19571),dd) SEQ ID NO: 827, SEQ ID NO: 828, SEQ ID NO: 829,SEQ ID NO: 831, SEQ ID NO: 832 or SEQ ID NO: 833 (TPP-27477),ee) SEQ ID NO: 847, SEQ ID NO: 848, SEQ ID NO: 849,SEQ ID NO: 851, SEQ ID NO: 852 or SEQ ID NO: 853 (TPP-27478),ff) SEQ ID NO: 867, SEQ ID NO: 868, SEQ ID NO: 869,SEQ ID NO: 871, SEQ ID NO: 872 or SEQ ID NO: 873 (TPP-27479), gg) SEQ ID NO: 887, SEQ ID NO: 888, SEQ ID NO: 889, SEQ ID NO: 891, SEQ ID NO: 892 or SEQ ID NO: 893 (TPP-27480),hh) SEQ ID NO: 907, SEQ ID NO: 908, SEQ ID NO: 909,SEQ ID NO: 911, SEQ ID NO: 912 or SEQ ID NO: 913 (TPP-29367) 948, SEQ ID NO: 949, SEQ ID NO: 951, SEQ ID NO: 952 or SEQ ID NO: 953 (TPP-29369).
[00526] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma sequência de HCDR3 com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência com qualquer um de SEQ ID NO:260 (TPP-16966), SEQ ID NO:278 (TPP-17575), SEQ IDNO:296 (TPP-17576), SEQ ID NO:314 (TPP-17577), SEQ ID NO:332(TPP-17578), SEQ ID NO:350 (TPP-17579), SEQ ID NO:368 (TPP-17580), SEQ ID NO:386 (TPP-17581), SEQ ID NO:404 (TPP-18205),SEQ ID NO:422 (TPP-18206), SEQ ID NO:440 (TPP-18207), SEQ IDNO:458 (TPP-19546), SEQ ID NO:476 (TPP-20950), SEQ ID NO:494(TPP-20955), SEQ ID NO:512 (TPP-20965), SEQ ID NO:530 (TPP-21045), SEQ ID NO:548 (TPP-21047), SEQ ID NO:566 (TPP-21181), SEQ ID NO:584 (TPP-21183), SEQ ID NO:602 (21360), ou SEQ ID NO:620 (TPP-23411), SEQ ID NO:663 (TPP-29596), SEQ ID NO:683 (TPP-29597), SEQ ID NO:705 (TPP-18429), SEQ ID NO:725 (TPP- 18430), SEQ ID NO:745 (TPP-18432), SEQ ID NO:765 (TPP-18433), SEQ ID NO:785 (TPP-18436), SEQ ID NO:805 (TPP-19571), SEQ ID NO:829 (TPP-27477), SEQ ID NO:849 (TPP-27478), SEQ ID NO:869 (TPP-27479), SEQ ID NO:889 (TPP-27480), SEQ ID NO:909 (TPP - 29367), SEQ ID NO:929 (TPP-29368), ou SEQ ID NO:949 (TPP- 29369).[00526] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises an HCDR3 sequence with at least 90%, 95%, 98%, or 100% sequence identity with any of SEQ ID NO:260 (TPP-16966), SEQ ID NO:278 (TPP-17575), SEQ ID NO:296 (TPP-17576), SEQ ID NO:314 (TPP-17577), SEQ ID NO:332 (TPP-17578), SEQ ID NO:350 (TPP-17579), SEQ ID NO:368 (TPP-17580), SEQ ID NO:386 (TPP-17581), SEQ ID NO:404 (TPP-18205), SEQ ID NO:422 (TPP-18206), SEQ ID NO:440 (TPP-18207), SEQ ID NO:458 (TPP-19546), SEQ ID NO:476 (TPP-20950), SEQ ID NO:494(TPP-20955), SEQ ID NO:512 (TPP-20965), SEQ ID NO:530 (TPP-21045), SEQ ID NO:548 (TPP-21047), SEQ ID NO:566 (TPP-21181), SEQ ID NO:584 (TPP-21183), SEQ ID NO:602 (21360), or SEQ ID NO:620 (TPP-23411), SEQ ID NO:663 (TPP-29596), SEQ ID NO:683 (TPP-29597), SEQ ID NO:705 (TPP-18429), SEQ ID NO:725 (TPP-18430), SEQ ID NO:745 (TPP-18432), SEQ ID NO:765 (TPP-18433), SEQ ID NO:785 (TPP-18436), SEQ ID NO:805 (TPP-19571), SEQ ID NO:829 (TPP-27477), SEQ ID NO:849 (TPP-27478), SEQ ID NO:869 (TPP-27479), SEQ ID NO:889 (TPP-27480), SEQ ID NO:909 (TPP - 29367), SEQ ID NO:929 (TPP-29368), or SEQ ID NO:949 (TPP- 29369).
[00527] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende pelo menos uma, duas e, preferivelmente, três, quatro, cinco ou seis sequências CDR de acordo coma) SEQ ID NO:258, SEQ ID NO:259, SEQ ID NO:260,SEQ ID NO:262, SEQ ID NO:263 e SEQ ID NO:264 (TPP-16966),b) SEQ ID NO:276, SEQ ID NO:277, SEQ ID NO:278,SEQ ID NO:280, SEQ ID NO:281 e SEQ ID NO:282 (TPP-17575),c) SEQ ID NO:294, SEQ ID NO:295, SEQ ID NO:296,SEQ ID NO:298, SEQ ID NO:299 e SEQ ID NO:300 (TPP-17576),d) SEQ ID NO:312, SEQ ID NO:313, SEQ ID NO:314,SEQ ID NO:316, SEQ ID NO:317 e SEQ ID NO:318 (TPP-17577),e) SEQ ID NO:330, SEQ ID NO:331, SEQ ID NO:332,SEQ ID NO:334, SEQ ID NO:335 e SEQ ID NO:336 (TPP-17578),f) SEQ ID NO:348, SEQ ID NO:349, SEQ ID NO:350,SEQ ID NO:352, SEQ ID NO:353 e SEQ ID NO:354 (TPP-17579),g) SEQ ID NO:366, SEQ ID NO:367, SEQ ID NO:368,SEQ ID NO:370, SEQ ID NO:371 e SEQ ID NO:372 (TPP-17580),h) SEQ ID NO:384, SEQ ID NO:385, SEQ ID NO:386,SEQ ID NO:388, SEQ ID NO:389 e SEQ ID NO:390 (TPP-17581),i) SEQ ID NO:402, SEQ ID NO:403, SEQ ID NO:404,SEQ ID NO:406, SEQ ID NO:407 e SEQ ID NO:408 (TPP-18205),j) SEQ ID NO:420, SEQ ID NO:421, SEQ ID NO:422,SEQ ID NO:424, SEQ ID NO:425 e SEQ ID NO:426 (TPP-18206),k) SEQ ID NO:438, SEQ ID NO:439, SEQ ID NO:440,SEQ ID NO:442, SEQ ID NO:443 e SEQ ID NO:444 (TPP-18207),l) SEQ ID NO:456, SEQ ID NO:457, SEQ ID NO:458,SEQ ID NO:460, SEQ ID NO:461 e SEQ ID NO:462 (TPP-19546),m) SEQ ID NO:474, SEQ ID NO:475, SEQ ID NO:476,SEQ ID NO:478, SEQ ID NO:479 e SEQ ID NO:480 (TPP-20950), h) SEQ ID NO:492, SEQ ID NO:493, SEQ ID NO:494,SEQ ID NO:496, SEQ ID NO:497 e SEQ ID NO:498 (TPP-20955),o) SEQ ID NO:510, SEQ ID NO:511, SEQ ID NO:512,SEQ ID NO:514, SEQ ID NO:515 e SEQ ID NO:516 (TPP-20965),p) SEQ ID NO:528, SEQ ID NO:529, SEQ ID NO:530,SEQ ID NO:532, SEQ ID NO:533 e SEQ ID NO:534 (TPP-21045),q) SEQ ID NO:546, SEQ ID NO:547, SEQ ID NO:548,SEQ ID NO:550, SEQ ID NO:551 e SEQ ID NO:552 (TPP-21047),r) SEQ ID NO:564, SEQ ID NO:565, SEQ ID NO:566,SEQ ID NO:568, SEQ ID NO:569 e SEQ ID NO:570 (TPP-21181),s) SEQ ID NO:582, SEQ ID NO:583, SEQ ID NO:584,SEQ ID NO:586, SEQ ID NO:587 e SEQ ID NO:588 (TPP-21183),t) SEQ ID NO:600, SEQ ID NO:601, SEQ ID NO:602,SEQ ID NO:604, SEQ ID NO:605 ou SEQ ID NO:606 (TPP-21360),u) SEQ ID NO:618, SEQ ID NO:619, SEQ ID NO:620,SEQ ID NO:622, SEQ ID NO:623 ou SEQ ID NO:624 (TPP-23411),v) SEQ ID NO:661, SEQ ID NO:662, SEQ ID NO:663,SEQ ID NO:665, SEQ ID NO:666 ou SEQ ID NO:667 (TPP-29596),w) SEQ ID NO:681, SEQ ID NO:682, SEQ ID NO:683,SEQ ID NO:685, SEQ ID NO:686 ou SEQ ID NO:687 (TPP-29597),x) SEQ ID NO:703, SEQ ID NO:704, SEQ ID NO:705,SEQ ID NO:707, SEQ ID NO:708 ou SEQ ID NO:709 (TPP-18429),y) SEQ ID NO:723, SEQ ID NO:724, SEQ ID NO:725,SEQ ID NO:727, SEQ ID NO:728 ou SEQ ID NO:729 (TPP-18430),z) SEQ ID NO:743, SEQ ID NO:744, SEQ ID NO:745,SEQ ID NO:747, SEQ ID NO:748 ou SEQ ID NO:749 (TPP-18432),aa) SEQ ID NO:763, SEQ ID NO:764, SEQ ID NO:765,SEQ ID NO:767, SEQ ID NO:768 ou SEQ ID NO:769 (TPP-18433),bb) SEQ ID NO:783, SEQ ID NO:784, SEQ ID NO:785,SEQ ID NO:787, SEQ ID NO:788 ou SEQ ID NO:789 (TPP-18436), cc) SEQ ID NO:803, SEQ ID NO:804, SEQ ID NO:805, SEQ ID NO:807, SEQ ID NO:808 ou SEQ ID NO:809 (TPP-19571),dd) SEQ ID NO: 827, SEQ ID NO: 828, SEQ ID NO: 829, SEQ ID NO: 831, SEQ ID NO: 832 ou SEQ ID NO: 833 (TPP-27477),ee) SEQ ID NO: 847, SEQ ID NO: 848, SEQ ID NO: 849, SEQ ID NO: 851, SEQ ID NO: 852 ou SEQ ID NO: 853 (TPP-27478),ff) SEQ ID NO: 867, SEQ ID NO: 868, SEQ ID NO: 869, SEQ ID NO: 871, SEQ ID NO: 872 ou SEQ ID NO: 873 (TPP-27479),gg) SEQ ID NO: 887, SEQ ID NO: 888, SEQ ID NO: 889, SEQ ID NO: 891, SEQ ID NO: 892 ou SEQ ID NO: 893 (TPP-27480),hh) SEQ ID NO: 907, SEQ ID NO: 908, SEQ ID NO: 909, SEQ ID NO: 911, SEQ ID NO: 912 ou SEQ ID NO: 913 (TPP-29367),ii) SEQ ID NO: 927, SEQ ID NO: 928, SEQ ID NO: 929, SEQ ID NO: 931, SEQ ID NO: 932 ou SEQ ID NO: 933 (TPP-29368), e/oujj) SEQ ID NO: 947, SEQ ID NO: 948, SEQ ID NO: 949, SEQ ID NO: 951, SEQ ID NO: 952 ou SEQ ID NO: 953 (TPP-29369), opcionalmente em que até uma, duas, três, quatro ou cinco mutações foram introduzidas em pelo menos uma CDR. Preferivelmente, o HCDR3 compreende ou foi projetado para compreender pelo menos um ou mais resíduos de histidina como descrito em outro lugar aqui.[00527] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises at least one, two, and preferably three, four, five, or six CDR sequences according to a) SEQ ID NO:258, SEQ ID NO:259, SEQ ID NO:260, SEQ ID NO:262, SEQ ID NO:263, and SEQ ID NO:264 (TPP-16966), b) SEQ ID NO:276, SEQ ID NO:277, SEQ ID NO:278, SEQ ID NO:280, SEQ ID NO:281, and SEQ ID NO:282 (TPP-17575), c) SEQ ID NO:294, SEQ ID NO:295, SEQ ID NO:296, SEQ ID NO:298, SEQ ID NO:299, and SEQ ID NO:300 (TPP-17576) NO:335 and SEQ ID NO:336 (TPP-17578),f) SEQ ID NO:348, SEQ ID NO:349, SEQ ID NO:350,SEQ ID NO:352, SEQ ID NO:353 and SEQ ID NO:354 (TPP-17579),g) SEQ ID NO:366, SEQ ID NO:367, SEQ ID NO:368,SEQ ID NO:370, SEQ ID NO:371 and SEQ ID NO:372 (TPP-17580),h) SEQ ID NO:384, SEQ ID NO:385, SEQ ID NO:386,SEQ ID NO:388, SEQ ID NO:389 and SEQ ID NO:390 (TPP-17581),i) SEQ ID NO:402, SEQ ID NO:403, SEQ ID NO:404,SEQ ID NO:406, SEQ ID NO:407 and SEQ ID NO:408 (TPP-18205),j) SEQ ID NO:420, SEQ ID NO:421, SEQ ID NO:422,SEQ ID NO:424, SEQ ID NO:425 and SEQ ID NO:426 (TPP-18206),k) SEQ ID NO:438, SEQ ID NO:439, SEQ ID NO:440,SEQ ID NO:442, SEQ ID NO:443 and SEQ ID NO:444 (TPP-18207),l) SEQ ID NO:456, SEQ ID NO:457, SEQ ID NO:458,SEQ ID NO:460, SEQ ID NO:461 and SEQ ID NO:462 (TPP-19546),m) SEQ ID NO:474, SEQ ID NO:475, SEQ ID NO:476,SEQ ID NO:478, SEQ ID NO:479 and SEQ ID NO:480 (TPP-20950), h) SEQ ID NO:492, SEQ ID NO:493, SEQ ID NO:494,SEQ ID NO:496, SEQ ID NO:497 and SEQ ID NO:498 (TPP-20955),o) SEQ ID NO:510, SEQ ID NO:511, SEQ ID NO:512,SEQ ID NO:514, SEQ ID NO:515 and SEQ ID NO:516 (TPP-20965),p) SEQ ID NO:528, SEQ ID NO:529, SEQ ID NO:530,SEQ ID NO:532, SEQ ID NO:533 and SEQ ID NO:534 (TPP-21045) NO:569 and SEQ ID NO:570 (TPP-21181) NO:605 or SEQ ID NO:606 (TPP-21360),u) SEQ ID NO:618, SEQ ID NO:619, SEQ ID NO:620,SEQ ID NO:622, SEQ ID NO:623 or SEQ ID NO:624 (TPP-23411),v) SEQ ID NO:661, SEQ ID NO:662, SEQ ID NO:663,SEQ ID NO:665, SEQ ID NO:666 or SEQ ID NO:667 (TPP-29596), w) SEQ ID NO:681, SEQ ID NO:682, SEQ ID NO:683,SEQ ID NO:685, SEQ ID NO:686 or SEQ ID NO:687 (TPP-29597), NO:705,SEQ ID NO:707, SEQ ID NO:708 or SEQ ID NO:709 (TPP-18429),y) SEQ ID NO:723, SEQ ID NO:724, SEQ ID NO:725,SEQ ID NO:727, SEQ ID NO:728 or SEQ ID NO:729 (TPP-18430),z) SEQ ID NO:743, SEQ ID NO:744, SEQ ID NO:745,SEQ ID NO:747, SEQ ID NO:748 or SEQ ID NO:749 (TPP-18432),aa) SEQ ID NO:763, SEQ ID NO:764, SEQ ID NO:765,SEQ ID NO:767, SEQ ID NO:768 or SEQ ID NO:769 (TPP-18433),bb) SEQ ID NO:783, SEQ ID NO:784, SEQ ID NO:785,SEQ ID NO:787, SEQ ID NO:788 or SEQ ID NO:789 (TPP-18436), cc) SEQ ID NO:803, SEQ ID NO:804, SEQ ID NO:805, SEQ ID NO:807, SEQ ID NO:808 or SEQ ID NO:809 (TPP-19571),dd) SEQ ID NO: 827, SEQ ID NO: 828, SEQ ID NO: 829, SEQ ID NO: 831, SEQ ID NO: 832 or SEQ ID NO: 833 (TPP-27477),ee) SEQ ID NO: 847, SEQ ID NO: 848, SEQ ID NO: 849, SEQ ID NO: 851, SEQ ID NO: 852 or SEQ ID NO: 853 (TPP-27478),ff) SEQ ID NO: 867, SEQ ID NO: 868, SEQ ID NO: 869, SEQ ID NO: 871, SEQ ID NO: 872 or SEQ ID NO: 873 (TPP-27479) 889, SEQ ID NO: 891, SEQ ID NO: 892 or SEQ ID NO: 893 (TPP-27480),hh) SEQ ID NO: 907, SEQ ID NO: 908, SEQ ID NO: 909, SEQ ID NO: 911, SEQ ID NO: 912 or SEQ ID NO: 913 (TPP-29367),ii) SEQ ID NO: 927, SEQ ID NO: 928, SEQ ID NO: 929, SEQ ID NO: 931, SEQ ID NO: 932 or SEQ ID NO: 933 (TPP-29368), and/orjj) SEQ ID NO: 947, SEQ ID NO: 948, SEQ ID NO: 949, SEQ ID NO: 951, SEQ ID NO: 952 or SEQ ID NO: 953 (TPP-29369), optionally in which up to one, two, three, four, or five mutations have been introduced into at least one CDR. Preferably, HCDR3 comprises or is designed to comprise at least one or more histidine residues as described elsewhere herein.
[00528] Por exemplo, a tirosina pode ser trocada por um aminoáci- do carregado positivamente, como histidina e vice-versa. Por exemplo, um aminoácido carregado positivamente pode ser trocado por um aminoácido carregado positivamente diferente, um aminoácido carregado negativamente pode ser trocado por um aminoácido carregado negativamente diferente, um aminoácido polar pode ser trocado por um aminoácido polar diferente, um aminoácido polar não carregado pode ser trocado por um aminoácido polar não carregado diferente, um aminoácido pequeno pode ser trocado por um aminoácido peque- no diferente, um aminoácido anfifático pode ser trocado por um ami- noácido anfifático diferente, um aminoácido aromático pode ser trocado com um aminoácido aromático diferente. Conforme entendido pela pessoa versada na técnica, em particular são possíveis aquelas trocas de aminoácidos que não alteram a interação específica entre o anticorpo e o TRD sulfatado de CCR8.[00528] For example, tyrosine can be exchanged for a positively charged amino acid, such as histidine, and vice versa. For example, a positively charged amino acid can be exchanged for a different positively charged amino acid, a negatively charged amino acid can be exchanged for a different negatively charged amino acid, a polar amino acid can be exchanged for a different polar amino acid, an uncharged polar amino acid can be exchanged for a different uncharged polar amino acid, a small amino acid can be exchanged for a different small amino acid, an amphiphatic amino acid can be exchanged for a different amphiphatic amino acid, an aromatic amino acid can be exchanged for a different aromatic amino acid. As understood by a person skilled in the art, in particular, those amino acid exchanges are possible that do not alter the specific interaction between the antibody and the sulfated CCR8 TRD.
[00529] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma sequência de cadeia pesada variável e/ou uma sequência de cadeia leve variável com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência com:a) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:257 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:261 (TPP-16966),b) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:275 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:279 (TPP-17575),c) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:293 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:297 (TPP-17576),d) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:311 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:315 (TPP-17577),e) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:329 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:333 (TPP-17578),f) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:347 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:351 (TPP-17579),g) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:365 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:369 (TPP-17580),h) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:383 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:387 (TPP-17581),i) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:401 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:405 (TPP-18205),j) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:419 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:423 (TPP-18206),k) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:437 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:441 (TPP-18207),l) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:455 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:459 (TPP-19546),m) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:473 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:477 (TPP-20950),n) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:491 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:495 (TPP-20955),o) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:509 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:513 (TPP-20965),p) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:527 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:531 (TPP-21045),q) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:545 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:549 (TPP-21047),r) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:563 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:567 (TPP-21181),s) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:581 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:585 (TPP-21183),t) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:599 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:603 (TPP-21360),u) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:617 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:621 (TPP-23411),v) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:660 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:664 (TPP-29596),w) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:680 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:684 (TPP-29597),x) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:702 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:706 (TPP-18429),y) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:722 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:726 (TPP-18430),z) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:742 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:746 (TPP-18432),aa) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:762 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:766 (TPP-18433),bb) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:782 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:786 (TPP-18436),cc) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:802 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:806 (TPP-19571),dd) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:826 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:830 (TPP-27477),ee) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:846 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:850 (TPP-27478),ff) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:866 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:870 (TPP-27479),gg) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:886 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:890 (TPP-27480),hh) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:906 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:910 (TPP-29367),ii) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:926 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:930 (TPP-29368), oujj) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:946 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:950 (TPP-29369).[00529] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a variable heavy chain sequence and/or a variable light chain sequence with at least 90%, 95%, 98% or 100% sequence identity with: a) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:257 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:261 (TPP-16966), b) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:275 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:279 (TPP-17575), c) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:293 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:297 (TPP-17576), d) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:311 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:315 (TPP-17577),e) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:329 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:333 (TPP-17578),f) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:347 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:351 (TPP-17579),g) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:365 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:369 (TPP-17580),h) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:383 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:387 (TPP-17581),i) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:401 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:405 (TPP-18205),j) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:419 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:423 (TPP-18206),k) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:437 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:441 (TPP-18207),l) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:455 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:459 (TPP-19546),m) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:473 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:477 (TPP-20950),n) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:491 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:495 (TPP-20955),o) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:509 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:513 (TPP-20965),p) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:527 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:531 (TPP-21045),q) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:545 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:549 (TPP-21047),r) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:563 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:567 (TPP-21181),s) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:581 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:585 (TPP-21183), t) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:599 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:603 (TPP-21360), u) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:617 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:621 (TPP-23411), v) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:660 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:664 (TPP-29596), w) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:680 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:684 (TPP-29597), x) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:702 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:706 (TPP-18429),y) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:722 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:726 (TPP-18430),z) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:742 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:746 (TPP-18432),aa) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:762 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:766 (TPP-18433),bb) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:782 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:786 (TPP-18436),cc) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:802 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:806 (TPP-19571),dd) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:826 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:830 (TPP-27477),ee) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:846 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:850 (TPP-27478),ff) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:866 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:870 (TPP-27479),gg) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:886 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:890 (TPP-27480),hh) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:906 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:910 (TPP-29367), ii) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:926 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:930 (TPP-29368), or jj) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:946 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:950 (TPP-29369).
[00530] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anti- corpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende:a) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:257 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:261 (TPP-16966),b) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:275 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:279 (TPP-17575),c) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:293 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:297 (TPP-17576),d) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:311 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:315 (TPP-17577),e) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:329 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:333 (TPP-17578),f) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:347 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:351 (TPP-17579),g) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:365 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:369 (TPP-17580),h) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:383 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:387 (TPP-17581),i) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:401 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:405 (TPP-18205),j) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:419 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:423 (TPP-18206),k) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:437 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:441 (TPP-18207),l) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:455 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:459 (TPP-19546),m) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:473 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:477 (TPP-20950),n) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:491 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:495 (TPP-20955),o) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:509 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:513 (TPP-20965),p) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:527 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:531 (TPP-21045),q) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:545 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:549 (TPP-21047),r) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:563 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:567 (TPP-21181),s) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:581 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:585 (TPP-21183),t) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:599 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:603 (TPP-21360),u) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:617 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:621 (TPP-23411),v) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:660 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:664 (TPP-29596),w) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:680 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:684 (TPP-29597),x) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:702 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:706 (TPP-18429),y) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:722 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:726 (TPP-18430),z) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:742 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:746 (TPP-18432),aa) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:762 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:766 (TPP-18433),bb) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:782 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:786 (TPP-18436),cc) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:802 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:806 (TPP-19571),dd) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:826 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:830 (TPP-27477),ee) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:846 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:850 (TPP-27478),ff) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:866 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:870 (TPP-27479),gg) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:886 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:890 (TPP-27480),hh) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:906 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:910 (TPP-29367),11) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:926 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:930 (TPP-29368), oujj) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com SEQ ID NO:946 e/ou uma sequência de cadeia leve variável de acordo com SEQ ID NO:950 (TPP-29369).[00530] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises: a) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:257 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:261 (TPP-16966), b) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:275 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:279 (TPP-17575), c) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:293 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:297 (TPP-17576), d) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:311 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:315 (TPP-17577), e) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:329 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:333 (TPP-17578),f) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:347 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:351 (TPP-17579),g) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:365 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:369 (TPP-17580),h) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:383 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:387 (TPP-17581),i) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:401 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:405 (TPP-18205),j) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:419 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:423 (TPP-18206),k) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:437 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:441 (TPP-18207),l) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:455 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:459 (TPP-19546),m) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:473 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:477 (TPP-20950),n) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:491 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:495 (TPP-20955),o) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:509 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:513 (TPP-20965),p) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:527 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:531 (TPP-21045),q) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:545 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:549 (TPP-21047),r) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:563 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:567 (TPP-21181),s) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:581 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:585 (TPP-21183),t) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:599 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:603 (TPP-21360),u) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:617 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:621 (TPP-23411),v) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:660 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:664 (TPP-29596),w) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:680 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:684 (TPP-29597),x) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:702 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:706 (TPP-18429),y) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:722 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:726 (TPP-18430),z) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:742 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:746 (TPP-18432),aa) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:762 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:766 (TPP-18433),bb) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:782 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:786 (TPP-18436),cc) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:802 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:806 (TPP-19571),dd) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:826 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:830 (TPP-27477),ee) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:846 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:850 (TPP-27478),ff) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:866 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:870 (TPP-27479),gg) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:886 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:890 (TPP-27480),hh) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:906 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:910 (TPP-29367),11) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:926 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:930 (TPP-29368), or a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:946 and/or a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:950 (TPP-29369).
[00531] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma sequência de cadeia pesada e/ou uma sequência de cadeia leve com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência coma) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:273 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:274 (TPP-16966),b) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:291 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:292 (TPP-17575),c) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:309 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:310 (TPP-17576), d) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:327 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:328 (TPP-17577),e) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:345 euma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:346 (TPP-17578),f) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:363 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:364 (TPP-17579),g) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:381 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:382 (TPP-17580),h) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:399 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:400 (TPP-17581),i) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:417 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:418 (TPP-18205),j) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:435 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:436 (TPP-18206),k) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:453 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:454 (TPP-18207),l) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:471 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:472 (TPP-19546),m) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:489 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:490 (TPP-20950),n) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:507 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:508 (TPP-20955),o) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:525 euma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:526 (TPP-20965),p) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:543 euma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:544 (TPP-21045),q) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:561 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:562 (TPP-21047), r) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:579 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:580 (TPP-21181),s) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:597 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:598 (TPP-21183),t) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:615 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:616 (TPP-21360),u) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:633 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:634 (TPP-23411),v) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:676 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:677 (TPP-29596),w) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:696 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:697 (TPP-29597),x) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:718 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:719 (TPP-18429),y) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:738 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:739 (TPP-18430),z) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:758 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:759 (TPP-18432),aa) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:778 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:779 (TPP-18433),bb) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:798 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:799 (TPP-18436),cc) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:818 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:819 (TPP-19571),dd) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:842 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:843 (TPP-27477),ee) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:862 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:863 (TPP-27478),ff) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:882 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:883 (TPP-27479),gg) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:902 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:903 (TPP-27480),hh) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:922 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:923 (TPP-29367),11) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:942 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:943 (TPP-29368), oujj) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:962 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:963 (TPP-29369).[00531] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence and/or a light chain sequence with at least 90%, 95%, 98% or 100% sequence identity with a) a heavy chain according to SEQ ID NO:273 and a light chain according to SEQ ID NO:274 (TPP-16966), b) a heavy chain according to SEQ ID NO:291 and a light chain according to SEQ ID NO:292 (TPP-17575), c) a heavy chain according to SEQ ID NO:309 and a light chain according to SEQ ID NO:310 (TPP-17576), d) a heavy chain according to SEQ ID NO:327 and a light chain according to SEQ ID NO:328 (TPP-17577),e) a heavy chain according to SEQ ID NO:345 and a light chain according to SEQ ID NO:346 (TPP-17578),f) a heavy chain according to SEQ ID NO:363 and a light chain according to SEQ ID NO:364 (TPP-17579),g) a heavy chain according to SEQ ID NO:381 and a light chain according to SEQ ID NO:382 (TPP-17580),h) a heavy chain according to SEQ ID NO:399 and a light chain according to SEQ ID NO:400 (TPP-17581),i) a heavy chain according to SEQ ID NO:417 and a light chain according to SEQ ID NO:418 (TPP-18205),j) a heavy chain according to SEQ ID NO:435 and a light chain according to with SEQ ID NO:436 (TPP-18206),k) a heavy chain according to SEQ ID NO:453 and a light chain according to SEQ ID NO:454 (TPP-18207),l) a heavy chain according to SEQ ID NO:471 and a light chain according to SEQ ID NO:472 (TPP-19546),m) a heavy chain according to SEQ ID NO:489 and a light chain according to SEQ ID NO:490 (TPP-20950),n) a heavy chain according to SEQ ID NO:507 and a light chain according to SEQ ID NO:508 (TPP-20955),o) a heavy chain according to SEQ ID NO:525 and a light chain according to SEQ ID NO:526 (TPP-20965),p) a heavy chain according to SEQ ID NO:543 and a light chain according to SEQ ID NO:544 (TPP-21045), q) a heavy chain according to SEQ ID NO:561 and a light chain according to SEQ ID NO:562 (TPP-21047), r) a heavy chain according to SEQ ID NO:579 and a light chain according to SEQ ID NO:580 (TPP-21181), s) a heavy chain according to SEQ ID NO:597 and a light chain according to SEQ ID NO:598 (TPP-21183), t) a heavy chain according to SEQ ID NO:615 and a light chain according to SEQ ID NO:616 (TPP-21360), u) a heavy chain according to SEQ ID NO:633 and a light chain according to SEQ ID NO:634 (TPP-23411), v) a heavy chain according to SEQ ID NO:676 and a light chain according to SEQ ID NO:677 (TPP-29596),w) a heavy chain according to SEQ ID NO:696 and a light chain according to SEQ ID NO:697 (TPP-29597),x) a heavy chain according to SEQ ID NO:718 and a light chain according to SEQ ID NO:719 (TPP-18429),y) a heavy chain according to SEQ ID NO:738 and a light chain according to SEQ ID NO:739 (TPP-18430),z) a heavy chain according to SEQ ID NO:758 and a light chain according to SEQ ID NO:759 (TPP-18432),aa) a heavy chain according to SEQ ID NO:778 and a light chain according to SEQ ID NO:779 (TPP-18433),bb) a heavy chain according to SEQ ID NO:798 and a light chain according to SEQ ID NO:799 (TPP-18436),cc) a heavy chain according to SEQ ID NO:818 and a light chain according to SEQ ID NO:819 (TPP-19571),dd) a heavy chain according to SEQ ID NO:842 and a light chain according to SEQ ID NO:843 (TPP-27477),ee) a heavy chain according to SEQ ID NO:862 and a light chain according to SEQ ID NO:863 (TPP-27478),ff) a heavy chain according to SEQ ID NO:882 and a light chain according to SEQ ID NO:883 (TPP-27479),gg) a heavy chain according to SEQ ID NO:902 and a light chain according to SEQ ID NO:903 (TPP-27480),hh) a heavy chain according to SEQ ID NO:922 and a light chain according to SEQ ID NO:923 (TPP-29367),11) a heavy chain according to SEQ ID NO:942 and a light chain according to SEQ ID NO:943 (TPP-29368), orjj) a heavy chain according to SEQ ID NO:962 and a light chain according to SEQ ID NO:963 (TPP-29369).
[00532] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende:a) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:273 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:274 (TPP-16966),b) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:291 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:292 (TPP-17575),c) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:309 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:310 (TPP-17576),d) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:327 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:328 (TPP-17577),e) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:345 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:346 (TPP-17578),f) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:363 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:364 (TPP-17579),g) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:381 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:382 (TPP-17580),h) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:399 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:400 (TPP-17581),i) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:417 euma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:418 (TPP-18205),j) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:435 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:436 (TPP-18206), k) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:453 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:454 (TPP-18207),l) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:471 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:472 (TPP-19546),m) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:489 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:490 (TPP-20950),n) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:507 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:508 (TPP-20955),o) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:525 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:526 (TPP-20965),p) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:543 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:544 (TPP-21045),q) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:561 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:562 (TPP-21047),r) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:579 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:580 (TPP-21181),s) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:597 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:598 (TPP-21183),t) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:615 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:616 (TPP-21360),u) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:633 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:634 (TPP-23411),v) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:676 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:677 (TPP-29596),w) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:696 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:697 (TPP-29597),x) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:718 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:719 (TPP-18429),y) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:738 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:739 (TPP-18430), z) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:758 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:759 (TPP-18432),aa) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:778 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:779 (TPP-18433),bb) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:798 e uma cadeia leve de acordo com SEQ ID NO:799 (TPP-18436),cc) uma cadeia pesada de acordo com SEQ ID NO:818 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:819 (TPP-19571),dd) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:842 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:843 (TPP-27477),ee) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:862 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:863 (TPP-27478),ff) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:882 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:883 (TPP-27479),gg) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:902 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:903 (TPP-27480),hh) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:922 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:923 (TPP-29367),11) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:942 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:943 (TPP-29368), oujj) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:962 e uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:963 (TPP-29369).[00532] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises: a) a heavy chain according to SEQ ID NO:273 and a light chain according to SEQ ID NO:274 (TPP-16966), b) a heavy chain according to SEQ ID NO:291 and a light chain according to SEQ ID NO:292 (TPP-17575), c) a heavy chain according to SEQ ID NO:309 and a light chain according to SEQ ID NO:310 (TPP-17576), d) a heavy chain according to SEQ ID NO:327 and a light chain according to SEQ ID NO:328 (TPP-17577), e) a heavy chain according to SEQ ID NO:345 and a light chain according to SEQ ID NO:346 (TPP-17578),f) a heavy chain according to SEQ ID NO:363 and a light chain according to SEQ ID NO:364 (TPP-17579),g) a heavy chain according to SEQ ID NO:381 and a light chain according to SEQ ID NO:382 (TPP-17580),h) a heavy chain according to SEQ ID NO:399 and a light chain according to SEQ ID NO:400 (TPP-17581),i) a heavy chain according to SEQ ID NO:417 and a light chain according to SEQ ID NO:418 (TPP-18205),j) a heavy chain according to SEQ ID NO:435 and a light chain according to SEQ ID NO:436 (TPP-18206),k) a heavy chain according to SEQ ID NO:453 and a light chain according to SEQ ID NO:454 (TPP-18207),l) a heavy chain according to SEQ ID NO:471 and a light chain according to SEQ ID NO:472 (TPP-19546),m) a heavy chain according to SEQ ID NO:489 and a light chain according to SEQ ID NO:490 (TPP-20950),n) a heavy chain according to SEQ ID NO:507 and a light chain according to SEQ ID NO:508 (TPP-20955),o) a heavy chain according to SEQ ID NO:525 and a light chain according to SEQ ID NO:526 (TPP-20965),p) a heavy chain according to SEQ ID NO:543 and a light chain according to SEQ ID NO:544 (TPP-21045),q) a heavy chain according to the r) a heavy chain according to SEQ ID NO:579 and a light chain according to SEQ ID NO:580 (TPP-21181), s) a heavy chain according to SEQ ID NO:597 and a light chain according to SEQ ID NO:598 (TPP-21183), t) a heavy chain according to SEQ ID NO:615 and a light chain according to SEQ ID NO:616 (TPP-21360), u) a heavy chain according to SEQ ID NO:633 and a light chain according to SEQ ID NO:634 (TPP-23411), v) a heavy chain according to SEQ ID NO:676 and a light chain according to SEQ ID NO:677 (TPP-29596),w) a heavy chain according to SEQ ID NO:696 and a light chain according to SEQ ID NO:697 (TPP-29597),x) a heavy chain according to SEQ ID NO:718 and a light chain according to SEQ ID NO:719 (TPP-18429),y) a heavy chain according to SEQ ID NO:738 and a light chain according to SEQ ID NO:739 (TPP-18430),z) a heavy chain according to SEQ ID NO:758 and a light chain according to SEQ ID NO:759 (TPP-18432),aa) a heavy chain according to SEQ ID NO:778 and a light chain according to SEQ ID NO:779 (TPP-18433),bb) a heavy chain according to SEQ ID NO:798 and a light chain according to SEQ ID NO:799 (TPP-18436),cc) a heavy chain according to SEQ ID NO:818 and a light chain according to SEQ ID NO:819 (TPP-19571),dd) a heavy chain according to SEQ ID NO:842 and a light chain according to SEQ ID NO:843 (TPP-27477),ee) a heavy chain according to SEQ ID NO:862 and a light chain according to SEQ ID NO:863 (TPP-27478),ff) a heavy chain according to SEQ ID NO:882 and a light chain according to SEQ ID NO:883 (TPP-27479),gg) a heavy chain according to SEQ ID NO:902 and a light chain according to SEQ ID NO:903 (TPP-27480),hh) a heavy chain according with SEQ ID NO:922 and a light chain according to SEQ ID NO:923 (TPP-29367),11) a heavy chain according to SEQ ID NO:942 and a light chain according to SEQ ID NO:943 (TPP-29368), orjj) a heavy chain according to SEQ ID NO:962 and a light chain according to SEQ ID NO:963 (TPP-29369).
[00533] Também são fornecidos de acordo com o aspecto atual vários anticorpos compreendendo permutações aleatórias das CDRs dos anticorpos anti-CCR8 fornecidos com as listagens de sequências.[00533] Several antibodies comprising random permutations of the CDRs of the anti-CCR8 antibodies provided with the sequence listings are also provided in accordance with the current aspect.
[00534] Preferivelmente, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o aspecto atual é não fucosilado, como descrito em outro lugar aqui. Preferivelmente, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o aspecto atual induz ADCC e/ou ADCP, como descrito em outro lugar aqui. Preferivelmente, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o aspecto atual é um anticorpo não internalizante ou de baixa internalização, como descrito em outro lugar aqui.[00534] Preferably, the antibody or antigen-binding fragment according to the current aspect is non-fucosylated, as described elsewhere herein. Preferably, the antibody or antigen-binding fragment according to the current aspect induces ADCC and/or ADCP, as described elsewhere herein. Preferably, the antibody or antigen-binding fragment according to the current aspect is a non-internalizing or low-internalizing antibody, as described elsewhere herein.
[00535] De acordo com um 18° aspecto, que pode ser ou não igual ao 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15° e /ou 16° aspecto, é fornecido um anticorpo anti-CCR8 isolado ou seu fragmento de ligação ao antígeno. Preferivelmente, os anticorpos de acordo com o aspecto atual se ligam a CCR8 de murino, em particular a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:45 e/ou SEQ ID NO:48, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados. As CDRs dos anticorpos de acordo com o aspecto atual são preferivelmente CDRs derivadas de seres humanos. Além disso, os anticorpos são caracterizados por propriedades que os tornam particularmente adequa-dos para terapia, por exemplo, são anticorpos de acordo com pelo menos um ou mais dos aspectos 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 ou 16. Em suma, os anticorpos de acordo com o aspecto atual podem ser usados como anticorpos substitutos que reconhecem CCR8 de murino e possuem propriedades terapêuticas superiores como descrito, por exemplo, no Exemplo 12.[00535] According to an 18th aspect, which may or may not be the same as aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 and/or 16, an isolated anti-CCR8 antibody or its antigen-binding fragment is provided. Preferably, the antibodies according to the present aspect bind to murine CCR8, in particular to a polypeptide isolated according to SEQ ID NO:45 and/or SEQ ID NO:48, in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated. The CDRs of the antibodies according to the present aspect are preferably CDRs derived from humans. Furthermore, antibodies are characterized by properties that make them particularly suitable for therapy; for example, they are antibodies according to at least one or more of aspects 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, or 16. In short, antibodies according to the present aspect can be used as surrogate antibodies that recognize murine CCR8 and possess superior therapeutic properties as described, for example, in Example 12.
[00536] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende pelo menos uma, duas, três, quatro, cinco ou seis sequências de CDR com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência com qualquer uma dasa) SEQ ID NO:202, SEQ ID NO:203, SEQ ID NO:204, SEQ ID NO:206, SEQ ID NO:207 e SEQ ID NO:208 (TPP-14095),b) SEQ ID NO:216, SEQ ID NO:217, SEQ ID NO:218, SEQ ID NO:220, SEQ ID NO:221 ou SEQ ID NO:222 (TPP-14099),c) SEQ ID NO:230, SEQ ID NO:231, SEQ ID NO:232, SEQ ID NO:234, SEQ ID NO:235 e SEQ ID NO:236 (TPP-15285), oud) SEQ ID NO:244, SEQ ID NO:245, SEQ ID NO:246, SEQ ID NO:248, SEQ ID NO:249 e SEQ ID NO:250 (TPP-15286).[00536] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises at least one, two, three, four, five, or six CDR sequences with at least 90%, 95%, 98%, or 100% sequence identity with any of the following: a) SEQ ID NO:202, SEQ ID NO:203, SEQ ID NO:204, SEQ ID NO:206, SEQ ID NO:207, and SEQ ID NO:208 (TPP-14095), b) SEQ ID NO:216, SEQ ID NO:217, SEQ ID NO:218, SEQ ID NO:220, SEQ ID NO:221, or SEQ ID NO:222 (TPP-14099), c) SEQ ID NO:230, SEQ ID NO:231, SEQ ID NO:232, SEQ ID NO:234, SEQ ID NO:235 and SEQ ID NO:236 (TPP-15285), ord) SEQ ID NO:244, SEQ ID NO:245, SEQ ID NO:246, SEQ ID NO:248, SEQ ID NO:249 and SEQ ID NO:250 (TPP-15286).
[00537] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma sequência de HCDR3 com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência com qualquer uma das SEQ ID NO:204, SEQ ID NO:218, SEQ ID NO:232 ou SEQ ID NO:246.[00537] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises an HCDR3 sequence with at least 90%, 95%, 98%, or 100% sequence identity with any of the SEQ ID NO:204, SEQ ID NO:218, SEQ ID NO:232, or SEQ ID NO:246.
[00538] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende pelo menos uma, duas e, preferivelmente, três, quatro, cinco ou seis sequências CDR de acordo coma) SEQ ID NO:202, SEQ ID NO:203, SEQ ID NO:204, SEQ ID NO:206, SEQ ID NO:207 e SEQ ID NO:208 (TPP-14095),b) SEQ ID NO:216, SEQ ID NO:217, SEQ ID NO:218, SEQ ID NO:220, SEQ ID NO:221 ou SEQ ID NO:222 (TPP-14099),c) SEQ ID NO:230, SEQ ID NO:231, SEQ ID NO:232, SEQ ID NO:234, SEQ ID NO:235 e SEQ ID NO:236 (TPP-15285), oud) SEQ ID NO:244, SEQ ID NO:245, SEQ ID NO:246, SEQ ID NO:248, SEQ ID NO:249 e SEQ ID NO:250 (TPP-15286), opcionalmente em que até uma, duas, três, quatro ou cinco mutações foram introduzidas em pelo menos uma CDR.[00538] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises at least one, two, and preferably three, four, five, or six CDR sequences according to a) SEQ ID NO:202, SEQ ID NO:203, SEQ ID NO:204, SEQ ID NO:206, SEQ ID NO:207, and SEQ ID NO:208 (TPP-14095), b) SEQ ID NO:216, SEQ ID NO:217, SEQ ID NO:218, SEQ ID NO:220, SEQ ID NO:221, or SEQ ID NO:222 (TPP-14099), c) SEQ ID NO:230, SEQ ID NO:231, SEQ ID NO:232, SEQ ID NO:234, SEQ ID NO:235, and SEQ ID NO:236 (TPP-15285), or) SEQ ID NO:244, SEQ ID NO:245, SEQ ID NO:246, SEQ ID NO:248, SEQ ID NO:249 and SEQ ID NO:250 (TPP-15286), optionally wherein up to one, two, three, four or five mutations have been introduced into at least one CDR.
[00539] Por exemplo, a tirosina pode ser trocada por um aminoáci- do carregado positivamente, tal como histidina e vice-versa. Por exemplo, um aminoácido carregado positivamente pode ser trocado por um aminoácido carregado positivamente diferente, um aminoácido carregado negativamente pode ser trocado por um aminoácido carregado negativamente diferente, um aminoácido polar pode ser trocado por um aminoácido polar diferente, um aminoácido polar não carrega- do pode ser trocado por um aminoácido polar não carregado diferente, um aminoácido pequeno pode ser trocado por um aminoácido pequeno diferente, um aminoácido anfifático pode ser trocado por um ami- noácido anfifático diferente, um aminoácido aromático pode ser trocado com um aminoácido aromático diferente. Conforme entendido pela pessoa versada na técnica, em particular são possíveis aquelas trocas de aminoácidos que não alteram a interação específica entre o anticorpo e o TRD sulfatado de CCR8. As trocas de aminoácidos que in-troduzem histidina são preferidas.[00539] For example, tyrosine can be exchanged for a positively charged amino acid, such as histidine, and vice versa. For example, a positively charged amino acid can be exchanged for a different positively charged amino acid, a negatively charged amino acid can be exchanged for a different negatively charged amino acid, a polar amino acid can be exchanged for a different polar amino acid, an uncharged polar amino acid can be exchanged for a different uncharged polar amino acid, a small amino acid can be exchanged for a different small amino acid, an amphiphatic amino acid can be exchanged for a different amphiphatic amino acid, an aromatic amino acid can be exchanged for a different aromatic amino acid. As understood by a person skilled in the art, in particular, those amino acid exchanges that do not alter the specific interaction between the antibody and the sulfated CCR8 TRD are possible. Amino acid exchanges that introduce histidine are preferred.
[00540] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma sequência de cadeia pesada variável e/ou uma sequência de cadeia leve variável com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência coma) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:201 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:205 (TPP-14095),b) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:215 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:219 (TPP-14099),c) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:229 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:233 (TPP-15285), oud) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:243 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:247 (TPP-15286).[00540] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a variable heavy chain sequence and/or a variable light chain sequence with at least 90%, 95%, 98% or 100% sequence identity with a) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:201 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:205 (TPP-14095), b) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:215 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:219 (TPP-14099), c) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:229 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:233 (TPP-15285), or d) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:243 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:247 (TPP-15286).
[00541] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreendee) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:201 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:205 (TPP-14095),f) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:215 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:219 (TPP-14099),g) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:229 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:233 (TPP-15285), ouh) uma sequência de cadeia pesada variável de acordo com a SEQ ID NO:243 e uma sequência de cadeia leve variável de acordo com a SEQ ID NO:247 (TPP-15286).[00541] According to some preferred embodiments, the anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises e) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:201 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:205 (TPP-14095), f) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:215 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:219 (TPP-14099), g) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:229 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:233 (TPP-15285), or h) a variable heavy chain sequence according to SEQ ID NO:243 and a variable light chain sequence according to SEQ ID NO:247 (TPP-15286).
[00542] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma sequência de cadeia pesada e/ou uma sequência de cadeia leve com pelo menos 90%, 95%, 98% ou 100% de identidade de sequência coma) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:211 e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:212 (TPP-14095),b) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:225 e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:226 (TPP-14099),c) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:239 e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:240 (TPP-15285), oud) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:253 e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:254 (TPP-15286).[00542] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence and/or a light chain sequence with at least 90%, 95%, 98% or 100% sequence identity with a) a heavy chain according to SEQ ID NO:211 and/or a light chain according to SEQ ID NO:212 (TPP-14095), b) a heavy chain according to SEQ ID NO:225 and/or a light chain according to SEQ ID NO:226 (TPP-14099), c) a heavy chain according to SEQ ID NO:239 and/or a light chain according to SEQ ID NO:240 (TPP-15285), or d) a heavy chain according to SEQ ID NO:253 and/or a light chain according to SEQ ID NO:254 (TPP-15286).
[00543] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo anti-CCR8 isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreendea) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:211 e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:212 (TPP-14095), b) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:225e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:226 (TPP-14099),c) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:239e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:240 (TPP-15285), oud) uma cadeia pesada de acordo com a SEQ ID NO:253 e/ou uma cadeia leve de acordo com a SEQ ID NO:254 (TPP-15286).[00543] According to some preferred embodiments, the isolated anti-CCR8 antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a) a heavy chain according to SEQ ID NO:211 and/or a light chain according to SEQ ID NO:212 (TPP-14095), b) a heavy chain according to SEQ ID NO:225 and/or a light chain according to SEQ ID NO:226 (TPP-14099), c) a heavy chain according to SEQ ID NO:239 and/or a light chain according to SEQ ID NO:240 (TPP-15285), or d) a heavy chain according to SEQ ID NO:253 and/or a light chain according to SEQ ID NO:254 (TPP-15286).
[00544] As seguintes modalidades são modalidades particularmente preferidas dos aspectos 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 e 18 ("todos os aspectos" de acordo com esta seção).[00544] The following modalities are particularly preferred modalities of aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and 18 ("all aspects" according to this section).
[00545] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, liga-se especificamente ao domínio rico em tirosina sulfatada de CCR8. Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao an- tígeno é caracterizado por uma região HCDR3 compreendendo entre 10 e 34% de tirosina e/ou entre 2 e 20% de histidina. Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno não é internalizado ou é caracterizado por uma internali- zação em uma célula com expressão alvo endógena que é menor do que 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, ou 10 vezes da internalização do controle de isotipo.[00545] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof, binds specifically to the sulfated tyrosine-rich domain of CCR8. In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment is characterized by an HCDR3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or between 2 and 20% histidine. In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment is not internalized or is characterized by internalization in a cell with endogenous target expression that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, or 10 times the internalization of the isotype control.
[00546] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno compreende CDRs (derivadas) humanas. Por exemplo, o anticorpo pode ser um anticorpo de CCR8 humano anti-humano. Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8 de pelo menos duas espécies, preferivelmente selecionadas de ser humano, macaco, macaca fascicularis (macaco cinomolgo), macaca mulatta (macaco rhesus), roedor, camundongo, rato, cavalo, bovino, porco, cachorro, gato e camelo, ainda mais preferivelmente selecionados de seres humanos, cinomolgos e camundongos. De acordo com algumas dessas modalidades mais preferidas, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8 humano e cinomolgo.[00546] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment comprises human (derived) CDRs. For example, the antibody may be a human anti-human CCR8 antibody. In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive to CCR8 of at least two species, preferably selected from humans, monkeys, macaques (cynomolgus macaques), macaques (rhesus macaques), rodents, mice, rats, horses, cattle, pigs, dogs, cats, and camels, even more preferably selected from humans, cynomolgus macaques, and mice. According to some of these more preferred embodiments, the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive to human and cynomolgus CCR8.
[00547] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga ao CCR8 de uma primeira espécie com uma primeira constante de dissociação KD e liga-se ao CCR8 de uma segunda espécie com uma segunda constante de dissociação KD, em que a primeira e a segunda constante de dissociação são da mesma ordem de grandeza.[00547] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment binds to CCR8 of a first species with a first dissociation constant KD and binds to CCR8 of a second species with a second dissociation constant KD, wherein the first and second dissociation constants are of the same order of magnitude.
[00548] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga com um valor KD de < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2,5E-9 M, < 2E-9 M, < 1,5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2,5E-10 M, < 2E-10 M, < 1,5E-10 M, < 1E-10 M, ou < 9E-11 Ma) a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:43 e/ou SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/oub) a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:44 e/ou SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/ouc) a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:45 e/ou SEQ ID NO:48, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados.[00548] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment binds with a KD value of < 5E-8 M, < 4E-8 M, < 3E-8 M, < 2E-8 M, < 1E-8 M, < 9E-9 M, < 8E-9 M, < 7E-9 M, < 6E-9 M, < 5E-9 M, < 4E-9 M, < 3E-9 M, < 2.5E-9 M, < 2E-9 M, < 1.5E-9 M, < 1E-9 M, < 9E-10 M, < 8E-10 M, < 7E-10 M, < 6E-10 M, < 5E-10 M, < 4E-10 M, < 3E-10 M, < 2.5E-10 M, < 2E-10 M, < 1.5E-10 M, < 1E-10 M, or < 9E-11 M) to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:43 and/or SEQ ID NO:46, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or b) to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:44 and/or SEQ ID NO:47, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or c) to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:45 and/or SEQ ID NO:48, wherein at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated.
[00549] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anti- corpo ou fragmento de ligação ao antígeno (especificamente) se liga com uma EC50 de < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM ou < 0,6 nMa) ao CCR8 humano e/ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:43 e/ou SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/oub) a CCR8 de cinomolgo e/ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:44 e/ou SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/ouc) a CCR8 de murino e/ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:45 e/ou SEQ ID NO:48, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados,e opcionalmente se liga com uma EC50 de < 50 nM, < 25 nM, < 15 nM ou < 10 nM às células T regulatórias humanas ativadas.[00549] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment (specifically) binds with an EC50 of < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM or < 0.6 nM) to human CCR8 and/or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:43 and/or SEQ ID NO:46, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or b) to cynomolgus CCR8 and/or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:44 and/or SEQ ID NO:47, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or c) to murine CCR8 and/or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:45 and/or SEQ ID NO:48, wherein at least two or All of Y3, Y14, and Y15 were sulfated, and optionally bind with an EC50 of < 50 nM, < 25 nM, < 15 nM, or < 10 nM to activated human regulatory T cells.
[00550] De acordo com algumas dessas modalidades mais preferidas, a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação ao CCR8 humano ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 têm foi sulfatado, está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM e a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação ao CCR8 de cinomolgo ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM.[00550] According to some of these more preferred embodiments, the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to human CCR8 or to an isolated polypeptide according to SEQ ID NO:46, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM and the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to cynomolgus CCR8 or to an isolated polypeptide according to SEQ ID NO:47, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM.
[00551] Como descrito, por exemplo, no Exemplo 10.1.1, os anticorpos de acordo com a presente invenção têm afinidades excelentes para seus respectivos alvos. Por exemplo, anticorpos de reação cruzada TPP-21181, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360 e TPP-23411 ligaram CCR8 humano com uma EC50 de 4,8 nM, 1,7 nM, 0,8 nM, 0,6 nM, ~0,9 nM ou 1,7 nM. Além disso, TPP-21181, TPP- 17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360 e TPP-23411 ligaram CCR8 de cinomolgo com uma EC50 de 1,8 nM, 1 nM, 0,5 nM, 0,7 nM, ~0,55 nM ou 0,9 nM. Além disso, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206 e TPP-21360 ligaram-se às células T regulatórias humanas com uma EC50 de 25 nM, 15 nM, 23 nM ou 10 nM. Além disso, o anticorpo CCR8 antimurino TPP-14099 liga células CHO expressando CCR8 de murino com uma EC50 de 3 nM e iTregs murino com uma EC50 de 13,2 nM, conforme a Tabela 10.1.1.5.[00551] As described, for example, in Example 10.1.1, the antibodies according to the present invention have excellent affinities for their respective targets. For example, cross-reacting antibodies TPP-21181, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360 and TPP-23411 bound human CCR8 with an EC50 of 4.8 nM, 1.7 nM, 0.8 nM, 0.6 nM, ~0.9 nM or 1.7 nM. Furthermore, TPP-21181, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, TPP-21360, and TPP-23411 bound cynomolgus CCR8 with an EC50 of 1.8 nM, 1 nM, 0.5 nM, 0.7 nM, ~0.55 nM, or 0.9 nM. Additionally, TPP-17578, TPP-19546, TPP-18206, and TPP-21360 bound human regulatory T cells with an EC50 of 25 nM, 15 nM, 23 nM, or 10 nM. Furthermore, the anti-murine CCR8 antibody TPP-14099 binds murine CCR8-expressing CHO cells with an EC50 of 3 nM and murine iTregs with an EC50 of 13.2 nM, as shown in Table 10.1.1.5.
[00552] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno, preferivelmente a uma concentração de 10 nM,a) não ou não substancialmente ou em menor grau do que os anticorpos L263G8 e 433H bloqueiam a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1, e/oub) não ou não substancialmente ou em menor grau do que os anticorpos L263G8 e 433H induzem a fosforilação de ERK1/2 e/ouc) não ou não substancialmente ou em menor grau do que os anticorpos L263G8 e 433H induzem a fosforilação de AKT.[00552] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment, preferably at a concentration of 10 nM, a) does not or does not substantially or to a lesser degree than L263G8 and 433H antibodies block CCL1-induced β-arrestin signaling, and/or b) does not or does not substantially or to a lesser degree than L263G8 and 433H antibodies induce ERK1/2 phosphorylation, and/or c) does not or does not substantially or to a lesser degree than L263G8 and 433H antibodies induce AKT phosphorylation.
[00553] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno bloqueia a sinalização dependente da proteína G do receptor de quimiocina.[00553] In preferred embodiments of all respects, the antibody or antigen-binding fragment blocks G protein-dependent signaling of the chemokine receptor.
[00554] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é não fucosilado.[00554] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment is non-fucosylated.
[00555] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) liga-se ao receptor gama Fc humano IIIA variante V176 (CD16a) com uma constante de dissociação (KD) inferior a 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM ou 200 nM e/oub) liga-se ao Fc gama RIIA humano (CD32a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM ou 1 μM.[00555] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment a) binds to the human Fc gamma receptor IIIA variant V176 (CD16a) with a dissociation constant (KD) less than 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM or 200 nM and/or b) binds to the human Fc gamma receptor RIIA (CD32a) with a dissociation constant (KD) less than 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM or 1 μM.
[00556] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas e/oub) induz fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos.[00556] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment a) induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human NK cells and/or b) induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human macrophages.
[00557] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz ADCC e/ou ADCP ea) a depleção máxima induzida por ADCC de células T re- gulatórias humanas ativadas é de pelo menos 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% ou 99%, e/oub) a depleção máxima induzida por ADCP de células T re- gulatórias humanas ativadas é de pelo menos 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% ou 50%, e/ouc) a depleção máxima de células T regulatórias intratumo- rais, in vitro ou em um indivíduo, é de pelo menos 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% ou 99%.[00557] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment induces ADCC and/or ADCP and a) the maximum ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% or 99%, and/or b) the maximum ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% or 50%, and/or c) the maximum depletion of intratumoral regulatory T cells, in vitro or in an individual, is at least 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% or 99%.
[00558] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa) para a depleção induzida por ADCC de células T regula- tórias humanas ativadas é menor do que 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12,5 pM, 10 pM ou 5 pM e/oub) para a depleção induzida por ADCP de células T regula- tórias humanas ativadas é menor do que 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM ou 25 pM.[00558] In preferred embodiments in all respects, the EC50 of the antibody or antigen-binding fragmenta) for ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is less than 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12.5 pM, 10 pM or 5 pM and/orb) for ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is less than 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM or 25 pM.
[00559] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno a) diminui o número de células T regulatórias ativadas ou intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para menos de 30%, 25%, 20%, 10%, 5% ou 1% e/oub) aumenta a relação de células T CD8+ intratumorais para Tregs intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para pelo menos 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 ou superior e/ouc) diminui a percentagem de células T regulatórias de células T CD4+ intratumorais, in vitro ou num indivíduo, para < 30 %, < 20 %, < 10 % ou < 5 %.[00559] In preferred embodiments in all respects, an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment a) decreases the number of activated or intratumoral regulatory T cells, in vitro or in an individual, to less than 30%, 25%, 20%, 10%, 5% or 1% and/or b) increases the ratio of intratumoral CD8+ T cells to intratumoral Tregs, in vitro or in an individual, to at least 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 or higher and/or c) decreases the percentage of regulatory T cells to intratumoral CD4+ T cells, in vitro or in an individual, to < 30%, < 20%, < 10% or < 5 %.
[00560] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno aumenta o número absoluto de células imunes em um volume tumoral definido, pelo menos por um fator de 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5 ou 4, preferivelmente em que as células imunes são selecionadoas dea) Células CD45+ (intratumorais),b) (intratumorais) células T CD8+,c) Células T CD4+ (intratumorais),d) Macrófagos (intratumorais), tais como macrófagos M1 ou macrófagos M2,e) Células NK (intratumorais),f) Células B (intratumorais),g) Células dendríticas (intratumorais),h) Células T gama delta (intratumorais),i) Células iNKT(intratumorais), ou qualquer combinação dos mesmos.[00560] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment increases the absolute number of immune cells in a defined tumor volume by at least a factor of 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, or 4, preferably wherein the immune cells are selected from a) CD45+ cells (intratumoral), b) CD8+ T cells (intratumoral), c) CD4+ T cells (intratumoral), d) Macrophages (intratumoral), such as M1 macrophages or M2 macrophages, e) NK cells (intratumoral), f) B cells (intratumoral), g) Dendritic cells (intratumoral), h) Gamma delta T cells (intratumoral), i) iNKT cells (intratumoral), or any combination thereof.
[00561] Por exemplo, as células do sistema imunológico sãoa) Células T CD8+, células T CD4+ e macrófagos, oub) Células T CD8+, células T CD4+, células NK e macrófa- gos, ou c) Células T CD8+, macrófagos ACOD1+ (macrófagos M1) e células B.[00561] For example, the cells of the immune system are a) CD8+ T cells, CD4+ T cells and macrophages, or b) CD8+ T cells, CD4+ T cells, NK cells and macrophages, or c) CD8+ T cells, ACOD1+ macrophages (M1 macrophages) and B cells.
[00562] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, três ou mais doses eficazes do anticorpo ou fragmento de ligação ao antíge- no, em um tumor, aumentama) o número de células T CD8+ intratumorais em pelo menos 150%, 200%, 250%, 300% ou 350%,a relação de células T CD8+ intratumorais para células T regulatórias intratumorais para pelo menos 4, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, ou mais alto,b) o número de macrófagos intratumorais pelo menos por um fator de 2, 3, 4 ou 5,c) o número de macrófagos ACOD1+ intratumorais (ma- crófagos M1) pelo menos por um fator de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ou 10,d) a relação de macrófagos ACOD1+ (macrófagos M1) para macrófagos MRC1+ (macrófagos M2) para pelo menos 1,5, 2, 3, 4, 5, 10 ou mais,e) o número de células NK intratumorais em pelo menos 140% ou 200%,f) o número de células T CD3+ intratumorais em pelo menos 150%, 200%, 300% ou 400%,g) o número de células B intratumorais pelo menos por um fator de 2, 5, 10, 20, 30 ou 40,h) o número de células T CD45+ intratumorais para pelo menos 150%, 200% ou 300%, e/oui) o número de células T CD4+ intratumorais para pelo menos 150%, 200%, 300% ou 400%,preferivelmente em que o tumor é caracterizado por linfóci- tos infiltrantes de tumor, tais como células T infiltrantes de tumor.[00562] In preferred embodiments in all respects, three or more effective doses of the antibody or antigen-binding fragment in a tumor increase a) the number of intratumoral CD8+ T cells by at least 150%, 200%, 250%, 300%, or 350%, the ratio of intratumoral CD8+ T cells to intratumoral regulatory T cells by at least 4, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, or higher, b) the number of intratumoral macrophages by at least a factor of 2, 3, 4, or 5, c) the number of intratumoral ACOD1+ macrophages (M1 macrophages) by at least a factor of 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 or 10, d) the ratio of ACOD1+ macrophages (M1 macrophages) to MRC1+ macrophages (M2 macrophages) by at least 1, 5, 2, 3, 4, 5, 10 or more, e) the number of intratumoral NK cells by at least 140% or 200%, f) the number of intratumoral CD3+ T cells by at least 150%, 200%, 300% or 400%, g) the number of intratumoral B cells by at least a factor of 2, 5, 10, 20, 30 or 40, h) the number of intratumoral CD45+ T cells by at least 150%, 200% or 300%, and/or i) the number of T cells Intratumoral CD4+ counts of at least 150%, 200%, 300%, or 400%, preferably in tumors characterized by tumor-infiltrating lymphocytes, such as tumor-infiltrating T cells.
[00563] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anti- corpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz a formação de estruturas linfoides terciárias.[00563] In preferred modalities of all respects, the antibody or antigen-binding fragment induces the formation of tertiary lymphoid structures.
[00564] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo é um anticorpo IgG, preferivelmente um IgG1 humano ou um IgG2a murino.[00564] In preferred embodiments in all respects, the antibody is an IgG antibody, preferably a human IgG1 or a murine IgG2a.
[00565] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga com uma EC50 de < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM ou < 0,6 nMa) ao CCR8 de ser humano ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/oub) ao CCR8 de cinomolgo ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/ouc) a CCR8 de murino ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:48, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados.[00565] In preferred embodiments in all respects, the antibody or antigen-binding fragment binds with an EC50 of < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM or < 0.6 nM) to human CCR8 or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:46, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or b) to cynomolgus CCR8 or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:47, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or c) to murine CCR8 or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:48, wherein at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated.
[00566] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação ao CCR8 humano ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM e a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para ligação a CCR8 de cinomolgo ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados, está abaixo de 10 nM, 5 nM, 2,5 nM, 1 nM, 0,5 nM ou 0,25 nM.[00566] In preferred embodiments in all respects, the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to human CCR8 or to an isolated polypeptide according to SEQ ID NO:46, in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM and the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for binding to cynomolgus CCR8 or to an isolated polypeptide according to SEQ ID NO:47, in which at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated, is below 10 nM, 5 nM, 2.5 nM, 1 nM, 0.5 nM or 0.25 nM.
[00567] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno se liga com uma EC50 de < 50 nM, < 25 nM, < 15 nM ou < 10 nM às células T regulató- rias humanas ativadas.[00567] In preferred embodiments in all respects, the isolated antibody or antigen-binding fragment binds with an EC50 of < 50 nM, < 25 nM, < 15 nM or < 10 nM to activated human regulatory T cells.
[00568] Em modalidades preferidas de todos os aspectos, a constante de dissociação do anticorpo para a ligação do primeiro polipeptí- deo não sulfatado isolado é maior do que 100 nM, 150 nM, 200 nM, 250 nM, 300 nM, 350 nM, 400 nM, 450 nM, 500 nM, 600 nM, 700 nM, 800 nM, 900 nM, 1 μM, 1,25 μM, 1,5 μM, 1,75 μM, 2 μM, 2,25 μM, 2,5 μM, 2,75 μM ou 3 μM, ou não é detectável. Preferivelmente, a constante de dissociação do anticorpo para a ligação do primeiro polipeptídeo não sulfatado isolado é maior do que 100 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM ou 3 μM, ou não é detectável.[00568] In preferred embodiments in all respects, the antibody dissociation constant for binding the first isolated non-sulfated polypeptide is greater than 100 nM, 150 nM, 200 nM, 250 nM, 300 nM, 350 nM, 400 nM, 450 nM, 500 nM, 600 nM, 700 nM, 800 nM, 900 nM, 1 μM, 1.25 μM, 1.5 μM, 1.75 μM, 2 μM, 2.25 μM, 2.5 μM, 2.75 μM or 3 μM, or is not detectable. Preferably, the antibody dissociation constant for binding the first isolated non-sulfated polypeptide is greater than 100 nM, 250 nM, 500 nM, 1 μM, 2 μM, or 3 μM, or it is not detectable.
[00569] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida I, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno não é internalizado ou é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão alvo endógena que é inferior do que 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 10 vezes da internalização do controle de isotipo.[00569] According to a preferred embodiment I, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment is not internalized or is characterized by internalization into a cell with endogenous target expression that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 10 times the internalization of the isotype control.
[00570] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida II, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente a CCR8, em que o anticorpo ou fragmento é caracterizado por uma região HCDR3 compreendendo entre 10 e 34% de tirosina e/ou entre 2 e 20% de histidina.[00570] According to a preferred embodiment II, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided, which binds specifically to CCR8, wherein the antibody or fragment is characterized by an HCDR3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or between 2 and 20% histidine.
[00571] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida III, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga especificamente a CCR8, em que o anticorpo compreende CDRs derivadas de seres humanos.[00571] According to a preferred embodiment III, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody comprises human-derived CDRs.
[00572] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida IV, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmen- to de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8 de pelo menos duas espécies, preferivelmente selecionadas de ser humano, cinomol- go e camundongo, mais preferivelmente em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8 humano e cinomolgo.[00572] According to a preferred embodiment IV, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive for CCR8 of at least two species, preferably selected from human, cynomolgus and mouse, more preferably wherein the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive for human and cynomolgus CCR8.
[00573] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida V, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno,a. não bloqueia a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1 e/oub. não induz a fosforilação de ERK1/2 e/ouc. não induz a fosforilação de AKT.[00573] According to a preferred embodiment V, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment a. does not block CCL1-induced β-arrestin signaling and/or b. does not induce ERK1/2 phosphorylation and/or c. does not induce AKT phosphorylation.
[00574] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida VI, um anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga especificamente ao CCR8, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é não fucosilado ea. induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas, eb. induz fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos,c. em que a depleção in vitro máxima induzida por ADCC e ADCP de de células alvo expressando CCR8 humano é de pelo menos 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95 % ou 99%.[00574] According to a preferred embodiment VI, an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided that specifically binds to CCR8, wherein the antibody or antigen-binding fragment is non-fucosylated and a. induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human NK cells, and b. induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human macrophages, c. wherein the maximum in vitro depletion induced by ADCC and ADCP of target cells expressing human CCR8 is at least 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% or 99%.
[00575] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida VII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas II a VI, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno não é internalizado ou é caracterizado por uma internalização em uma célula com expressão endógena alvo que é menor do que 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 10 vezes da internalização do controle do isotipo.[00575] According to a preferred embodiment VII, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments II to VI, wherein the antibody or antigen-binding fragment is not internalized or is characterized by internalization into a target endogenously expressing cell that is less than 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, or 10 times the internalization of the isotype control.
[00576] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida VIII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I, ou III a VII, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é caracterizado por uma região HCDR3 compreendendo entre 10 e 34% de tirosina e/ou entre 2 e 20% de histidina.[00576] According to a preferred embodiment VIII, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I, or III to VII, wherein the antibody or antigen-binding fragment is characterized by an HCDR3 region comprising between 10 and 34% tyrosine and/or between 2 and 20% histidine.
[00577] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida IX, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a II, ou IV a VIII, em que o anticorpo compreende CDRs derivadas de seres humanos.[00577] The isolated antibody or antigen-binding fragment is provided, according to a preferred embodiment IX, according to any of the preferred embodiments I to II, or IV to VIII, wherein the antibody comprises human-derived CDRs.
[00578] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida X, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a III, ou V a IX, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8 de pelo menos duas espécies, preferivelmente selecionado de ser humano, cinomolgo e camundongo, mais preferivelmente em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é reativo cruzado para CCR8humano e cinomolgo.[00578] The isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to a preferred embodiment X, according to any of the preferred embodiments I to III, or V to IX, wherein the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive for CCR8 of at least two species, preferably selected from human, cynomolgus and mouse, more preferably wherein the antibody or antigen-binding fragment is cross-reactive for human and cynomolgus CCR8.
[00579] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XI, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a X, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno liga o CCR8 de uma primeira espé-cie com uma primeira constante de dissociação KD e liga o CCR8 de uma segunda espécie com uma segunda constante de dissociação KD, em que a primeira e a segunda constante de dissociação estão na mesma ordem de grandeza.[00579] According to a preferred embodiment XI, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I to X, wherein the antibody or antigen-binding fragment binds the CCR8 of a first species with a first dissociation constant KD and binds the CCR8 of a second species with a second dissociation constant KD, wherein the first and second dissociation constants are of the same order of magnitude.
[00580] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a IV, ou VI a XI, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno,a. não bloqueia a sinalização de β-arrestina induzida por CCL1 e/oub. não induz a fosforilação de ERK1/2 e/ouc. não induz a fosforilação de AKT.[00580] According to a preferred embodiment XII, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I to IV, or VI to XI, wherein the antibody or antigen-binding fragment, a. does not block CCL1-induced β-arrestin signaling and/or b. does not induce ERK1/2 phosphorylation and/or c. does not induce AKT phosphorylation.
[00581] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XIII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a V, ou VII a XII, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa. induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas, eb. induz a fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos e, opcionalmentec. em que a depleção maxim in vitro induzida por ADCC e ADCP de células alvo expressando CCR8 humano é de pelo menos 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95 % ou 99%.[00581] According to a preferred embodiment XIII, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I to V, or VII to XII, wherein the antibody or antigen-binding fragment a. induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human NK cells, and b. induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human macrophages, and optionally c. wherein the maximal in vitro depletion induced by ADCC and ADCP of target cells expressing human CCR8 is at least 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% or 99%.
[00582] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XIV, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XIII, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga especificamente ao domínio rico em tirosina sulfatada de CCR8.[00582] According to a preferred embodiment XIV, the isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to any of the preferred embodiments I to XIII, wherein the antibody or antigen-binding fragment binds specifically to the sulfated tyrosine-rich domain of CCR8.
[00583] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XV, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XIV, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga especificamente (i) com uma EC50 de < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM ou < 0,6 nMa. ao CCR8 humano e/ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:46, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/oub. ao CCR8 de cinomolgo e/ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:47, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y15 e Y17 foram sulfatados e/ouc. ao CCR8 de murino e/ou a um polipeptídeo isolado de acordo com a SEQ ID NO:48, em que pelo menos dois ou todos de Y3, Y14 e Y15 foram sulfatados,e/ou (ii) com EC50 < 50 nM, < 25 nM, < 15 nM ou < 10 nM para células T regulatórias humanas ativadas.[00583] Provided according to a preferred embodiment XV, the isolated antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XIV, wherein the antibody or antigen-binding fragment binds specifically (i) with an EC50 of < 15 nM, < 10 nM, < 5 nM, < 1 nM or < 0.6 nM to human CCR8 and/or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:46, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or b) to cynomolgus CCR8 and/or to a polypeptide isolate according to SEQ ID NO:47, wherein at least two or all of Y3, Y15 and Y17 have been sulfated and/or c) to murine CCR8 and/or to an isolated polypeptide according to SEQ ID NO:48, in which at least two or all of Y3, Y14 and Y15 have been sulfated, and/or (ii) with EC50 < 50 nM, < 25 nM, < 15 nM or < 10 nM for activated human regulatory T cells.
[00584] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XVI, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XV,a. em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno liga-se ao receptor gama Fc humano IIIA variante V176 (CD16a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM ou 200 nM e/oub. em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga ao Fc gama RIIA humano (CD32a) com uma constante de dissociação (KD) menor do que 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM ou 1 μM.[00584] According to a preferred embodiment XVI, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided according to any of the preferred embodiments I to XV,a. wherein the antibody or antigen-binding fragment binds to the human Fc gamma receptor IIIA variant V176 (CD16a) with a dissociation constant (KD) less than 530 nM, 500 nM, 450 nM, 400 nM, 300 nM or 200 nM and/or b. wherein the antibody or antigen-binding fragment binds to the human Fc gamma receptor RIIA (CD32a) with a dissociation constant (KD) less than 30 μM, 20 μM, 10 μM, 5 μM or 1 μM.
[00585] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XVII, é o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XVI, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é fucosilado.[00585] It is provided, according to a preferred embodiment XVII, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof according to any of the preferred embodiments I to XVI, wherein the antibody or antigen-binding fragment is fucosylated.
[00586] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XVIII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XVII, em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa. induz citotoxicidade mediada por células dependente de anticorpos (ADCC) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como células NK humanas e/oub. induz a fagocitose mediada por células dependente de anticorpos (ADCP) em células alvo que expressam CCR8 humano através de células efetoras humanas, tais como macrófagos humanos, preferivelmente, em quec. a depleção máxima induzida por ADCC de células T re- gulatórias humanas ativadas é de pelo menos 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% ou 99%, e/oud. a depleção máxima induzida por ADCP de células T re- gulatórias humanas ativadas é de pelo menos 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% ou 50%, e/oue. depleção in vitro máxima induzida por ADCC e ADCP de células T regulatórias humanas ativadas é de pelo menos 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% ou 99%.[00586] According to a preferred embodiment XVIII, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided according to any of the preferred embodiments I to XVII, wherein the antibody or antigen-binding fragment a. induces antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human NK cells and/or b. induces antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP) in target cells expressing human CCR8 via human effector cells, such as human macrophages, preferably where c. the maximum ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% or 99%, and/or d. the maximum ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is at least 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40% or 50%, and/or e. The maximum in vitro depletion of activated human regulatory T cells induced by ADCC and ADCP is at least 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, or 99%.
[00587] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XIX é o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XVIII, em quea. o EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a depleção induzida por ADCC de células T regulatórias humanas ativadas está abaixo de 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12,5 pM, 10 pM ou 5 pM e/oub. a EC50 do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno para a depleção induzida por ADCP de células T regulatórias humanas ativadas está abaixo de 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM ou 25 pM.[00587] Provided according to a preferred embodiment XIX is the isolated antibody or antigen-binding fragment according to any of preferred embodiments I to XVIII, wherein a. the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for ADCC-induced depletion of activated human regulatory T cells is below 100 pM, 50 pM, 25 pM, 12.5 pM, 10 pM or 5 pM and/or b. the EC50 of the antibody or antigen-binding fragment for ADCP-induced depletion of activated human regulatory T cells is below 500 pM, 250 pM, 200 pM, 150 pM, 100 pM, 75 pM, 50 pM or 25 pM.
[00588] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XX, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer modalidade preferida anterior, em que uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígenoa. diminui o número de células T regulatórias ativadas ou intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para menos de 50%, 40%, 30%, 25%, 20%, 10%, 5% ou 1% e/oub. aumenta a proporção de células T CD8+ intratumorais para Tregs intratumorais, in vitro ou em um indivíduo, para pelo menos 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 ou superior e/ouc. diminui a percentagem de células T regulatórias de células T CD4+ intratumorais, in vitro ou num indivíduo, para < 30 %, < 20 %, < 10 % ou < 5 %.[00588] The isolated antibody or antigen-binding fragment is provided according to a preferred embodiment XX, according to any of the above preferred embodiments, wherein an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment a. decreases the number of activated or intratumoral regulatory T cells, in vitro or in an individual, to less than 50%, 40%, 30%, 25%, 20%, 10%, 5% or 1% and/or b. increases the ratio of intratumoral CD8+ T cells to intratumoral Tregs, in vitro or in an individual, to at least 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200 or higher and/or c. Decreases the percentage of regulatory T cells compared to intratumoral CD4+ T cells, in vitro or in an individual, to < 30%, < 20%, < 10% or < 5%.
[00589] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXI é o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer modalidade preferida anterior, em que uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno induz a formação de estruturas linfoides terciárias em um tumor.[00589] It is provided, according to a preferred embodiment XXI, the isolated antibody or antigen-binding fragment according to any previous preferred embodiment, wherein an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment induces the formation of tertiary lymphoid structures in a tumor.
[00590] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXII, o anticorpo isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo de acordo com qualquer modalidade preferida anterior, em que o anticorpo é um anticorpo IgG, preferivelmente uma IgG1 humana ou uma IgG2a de murino, e ou em que o fragmento de ligação ao antígeno é um fragmento scFv, Fab, Fab' ou F(ab')2.[00590] According to a preferred embodiment XXII, the isolated antibody or antigen-binding fragment thereof is provided according to any of the above preferred embodiments, wherein the antibody is an IgG antibody, preferably a human IgG1 or a murine IgG2a, and/or wherein the antigen-binding fragment is an scFv, Fab, Fab' or F(ab')2 fragment.
[00591] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXIII, um conjugado compreendendo um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII, preferivelmente em que o conjugado compreendea. um elemento radioativo,b. um agente citotóxico, tal como uma auristatina, um mai- tansinoide, um inibidor de proteína de fuso de cinesina, um inibidor de nicotinamida fosforibosiltransferase ou um derivado de pirrolobenzodi- azepina,c. um anticorpo adicional ou fragmento de ligação ao antí- geno, oud. um receptor de antígeno quimérico.[00591] A conjugate comprising an antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XXII is provided, according to a preferred embodiment XXIII, preferably wherein the conjugate comprises a. a radioactive element, b. a cytotoxic agent, such as an auristatin, a maytansinoid, a kinesin spindle protein inhibitor, a nicotinamide phosphoribosyltransferase inhibitor or a pyrrolobenzodiazepine derivative, c. an additional antibody or antigen-binding fragment, or d. a chimeric antigen receptor.
[00592] É fornecida, de acordo com uma modalidade preferida XXIV, uma composição farmacêutica compreendendo um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XXIII.[00592] A pharmaceutical composition comprising an antibody or antigen-binding fragment according to any of preferred embodiments I to XXII or a conjugate according to preferred embodiment XXIII is provided, in accordance with preferred embodiment XXIV.
[00593] É fornecida, de acordo com uma modalidade preferida XXV, a composição farmacêutica de acordo com a modalidade preferida XXIV, compreendendo um ou mais outros compostos terapeuticamen- te ativos, preferivelmente selecionados dea. um anticorpo ou composto direcionado a uma proteína de ponto de verificação, tal como PD1, PD-L1 ou CTLA-4, preferivelmente em que o anticorpo ou composto direcionado à proteína de ponto de verificação é Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizu- mab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab ou Ipilimumab,b. um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1,c. um anticorpo ou uma pequena molécula direcionada a HER2 e/ou EGFR,d. o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas e tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata,e. um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxano, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gen- citabina,f. um agente de depleção de células B, tal como um anticorpo anti-CD19 ou um anticorpo anti-CD20 e/oug. um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1.[00593] A pharmaceutical composition according to preferred embodiment XXIV is provided, comprising one or more other therapeutically active compounds, preferably selected from: a. an antibody or compound targeting a checkpoint protein, such as PD1, PD-L1 or CTLA-4, preferably wherein the antibody or compound targeting the checkpoint protein is Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab or Ipilimumab, b. an antibody targeting another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1, c. an antibody or small molecule targeting HER2 and/or EGFR,d. the standard of care for any head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma and esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer,e. a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin or gemcitabine,f. a B-cell depleting agent, such as an anti-CD19 antibody or an anti-CD20 antibody and/org. a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1.
[00594] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXVI, um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XXIII ou uma composição farmacêutica de acordo com a modalidade preferida XXIV ou XXV para uso como medicamento.[00594] An antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XXII or a conjugate according to preferred embodiment XXIII or a pharmaceutical composition according to preferred embodiment XXIV or XXV is provided for use as a medicament.
[00595] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXVII, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XXIII ou uma composição farmacêutica de acordo com a modalidade preferida XXIV ou XXV para uso no tratamento de um tumor ou uma doença caracterizada por células positivas para CCR8, tais como células T regulatórias positivas para CCR8.[00595] The antibody or antigen-binding fragment according to any of preferred embodiments I to XXII or a conjugate according to preferred embodiment XXIII or a pharmaceutical composition according to preferred embodiment XXIV or XXV is provided for use in the treatment of a tumor or disease characterized by CCR8-positive cells, such as CCR8-positive regulatory T cells.
[00596] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXVIII, um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XXIII ou uma composição farmacêutica de acordo com a modalidade preferida XXIV ou XXV para uso em simultâneo, separado, ou combinação sequencial (i) com um ou mais compostos terapeuticamente ativos, preferivelmente selecionados dea. um anticorpo ou uma molécula pequena que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação, tal como PD1, PD-L1 ou CTLA-4, preferivelmente em que o anticorpo ou molécula pequena que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação é Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab ou Ipilimumab,b. um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1,c. um anticorpo que tem como alvo uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais,d. um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR,e. o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata,f. um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxano, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gen- citabina e/oug. um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1, e/ou(ii) com terapia de radiação, e/ou (iii) com depleção de células B intra- tumorais, no tratamento de um tumor ou uma doença caracterizada por células CCR8 positivas, tais como células T regulatórias positivas para CCR8.[00596] An antibody or antigen-binding fragment according to any of preferred embodiments I to XXII or a conjugate according to preferred embodiment XXIII or a pharmaceutical composition according to preferred embodiment XXIV or XXV is provided for simultaneous, separate, or sequential combination use (i) with one or more therapeutically active compounds, preferably selected from a. an antibody or small molecule targeting a checkpoint protein, such as PD1, PD-L1 or CTLA-4, preferably wherein the antibody or small molecule targeting a checkpoint protein is Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab or Ipilimumab, b. an antibody that targets another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1, or CXCR1; c. an antibody that targets a protein that is specifically expressed by tumor cells; d. an antibody or small molecule that targets HER2 and/or EGFR; e. the standard of care for any head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer, and/or prostate cancer; f. a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin or gemcitabine and/or (i) a targeted kinase inhibitor, such as sorafinib, regorafenib or MEKi-1, and/or (ii) with radiation therapy, and/or (iii) with intra-tumoral B cell depletion, in the treatment of a tumor or disease characterized by CCR8-positive cells, such as CCR8-positive regulatory T cells.
[00597] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXIX, o anticorpo, fragmento, conjugado ou composição farmacêutica para uso de acordo com a modalidade preferida XXVII ou XXVIII, em que o tumor é selecionado do grupo de leucemia linfoblástica aguda de células T, câncer de mama, câncer de mama triplo negativo, câncer de mama triplo positivo, câncer de pulmão de não pequenas células (NSCLC), câncer de pulmão de pequenas células (CPPC), câncer testicular, câncer gástrico, carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço, timoma, adenocarcinoma esofágico, câncer colorretal, adenocarcinoma pancreático, câncer ovariano ou câncer cervical, leucemia mieloide aguda, câncer de rim, câncer de bexiga, câncer de pele, melanoma, câncer de tireoide, mesotelioma, sarcoma e câncer de próstata, linfo- ma de células B, linfoma de células T ou qualquer outro câncer envolvendo células que expressam CCR8, preferivelmente em que o tumor é selecionado de câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor de esôfago, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado, câncer de próstata, linfoma de células B e linfoma de células T. É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXX, o anticorpo, fragmento, conjugado ou composição farmacêutica para uso de acordo com a modalidade preferida XXVI a XXIX, em que o uso compreende determinara. a presença ou quantidade de linfócitos infiltrantes tumo- rais,b. a presença ou quantidade de macrófagos e/ou células NK,c. a presença ou quantidade de células T regulatórias positivas para CCR8 ou positivas para FOXP3,d. a carga mutacional do tumor, e. o estadiamento do câncer, f. a presença, nível ou ativação de genes ou proteínas es- timulados por interferon,g. a expressão de CCR8,h. a presença ou quantidade de proteínas do fator do complemento, serpinas e/ou componentes do MHC,i. a presença ou quantidade de citocinas, tais como citoci- nas inflamatórias ou supressoras,j. a ativação da expressão do gene imune e/ouk. a expressão de ponto de verificação imunológica (proteína), tal como expressão de PD-(L)1 ou CTLA4,l. a presença ou quantidade de células B CD19+ infiltradas no tumor,m. a presença ou quantidade de células T CD8+ infiltradas no tumor;para prever ou monitorar o sucesso do tratamento.[00597] The antibody, fragment, conjugate or pharmaceutical composition is provided, according to a preferred embodiment XXIX, for use according to preferred embodiment XXVII or XXVIII, wherein the tumor is selected from the group of acute lymphoblastic leukemia, T-cell breast cancer, triple-negative breast cancer, triple-positive breast cancer, non-small cell lung cancer (NSCLC), small cell lung cancer (SCLC), testicular cancer, gastric cancer, squamous cell carcinoma of the head and neck, thymoma, esophageal adenocarcinoma, colorectal cancer, pancreatic adenocarcinoma, ovarian cancer or cervical cancer, acute myeloid leukemia, kidney cancer, bladder cancer, skin cancer, melanoma, thyroid cancer, mesothelioma, sarcoma and prostate cancer, B-cell lymphoma, T-cell lymphoma or any other cancer involving cells expressing CCR8, preferably wherein the tumor is selected from head and neck cancer, breast cancer, Gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer, prostate cancer, B-cell lymphoma, and T-cell lymphoma. The antibody, fragment, conjugate, or pharmaceutical composition is provided, according to a preferred embodiment XXX, for use according to preferred embodiments XXVI to XXIX, wherein the use comprises determining: a. the presence or quantity of tumor-infiltrating lymphocytes; b. the presence or quantity of macrophages and/or NK cells; c. the presence or quantity of CCR8-positive or FOXP3-positive regulatory T cells; d. the mutational load of the tumor; e. the cancer staging; f. the presence, level, or activation of interferon-stimulated genes or proteins; g. the expression of CCR8; h. the presence or quantity of complement factor proteins, serpins, and/or MHC components; i. the presence or quantity of cytokines, such as inflammatory or suppressive cytokines, j. the activation of immune gene expression and/or k. the expression of an immune checkpoint (protein), such as PD-(L)1 or CTLA4 expression, l. the presence or quantity of CD19+ B cells infiltrating the tumor, m. the presence or quantity of CD8+ T cells infiltrating the tumor; to predict or monitor treatment success.
[00598] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXXI, um polinucleotídeo que codifica um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII.[00598] A polynucleotide encoding an antibody or antigen-binding fragment according to any of preferred embodiments I to XXII is provided, according to a preferred embodiment XXXI.
[00599] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXXII, um vetor compreendendo um polinucleótido de acordo com a modalidade preferida XXXI.[00599] A vector comprising a polynucleotide according to preferred embodiment XXXII is provided.
[00600] É fornecida, de acordo com uma modalidade preferida XXXIII, uma célula isolada disposta para a produção de um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII.[00600] A single cell arranged for the production of an antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XXII is provided, according to a preferred embodiment XXXIII.
[00601] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXXIV, um método de produção de um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XXIII, compreendendo a cultura de uma célula de acordo com a modalidade preferida XXXIII e opcionalmente purificação de o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno.[00601] A method for producing an antibody or antigen-binding fragment according to any of preferred embodiments I to XXII or a conjugate according to preferred embodiment XXIII is provided, comprising culturing a cell according to preferred embodiment XXXIII and optionally purifying the antibody or antigen-binding fragment.
[00602] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXXV, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XXIII para uso como agente de diagnóstico in vivo ou in vitro.[00602] The antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XXII or a conjugate according to preferred embodiment XXIII is provided for use as an in vivo or in vitro diagnostic agent, in accordance with a preferred embodiment XXXV.
[00603] É fornecido, de acordo com uma modalidade preferida XXXVI, um kit compreendendo um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com qualquer uma das modalidades preferidas I a XXII ou um conjugado de acordo com a modalidade preferida XXIII ou uma composição farmacêutica de acordo com a modalidade preferida XXIV ou XXV com instruções de uso.[00603] A kit comprising an antibody or antigen-binding fragment according to any of the preferred embodiments I to XXII or a conjugate according to preferred embodiment XXIII or a pharmaceutical composition according to preferred embodiment XXIV or XXV with instructions for use is provided, in accordance with preferred embodiment XXXVI.
[00604] Além de anticorpos nus, vários outros conjugados baseados em anticorpo ou fragmento de anticorpo podem ser projetados usando os anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno descritos aqui. Esses conjugados podem ser conjugados para diagnóstico, terapia, aplicações de pesquisa e vários outros propósitos. São fornecidos, por exemplo, anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos conjugados com radionuclídeos, agentes citotóxicos, compostos orgânicos, toxinas proteicas, imunomoduladores, tais como citoci- nas, porções fluorescentes, células, outros anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos.[00604] In addition to naked antibodies, several other antibody- or antibody fragment-based conjugates can be designed using the antibodies or antigen-binding fragments described herein. These conjugates can be used for diagnostic, therapeutic, research applications, and various other purposes. For example, antibodies or antigen-binding fragments thereof are provided conjugated with radionuclides, cytotoxic agents, organic compounds, protein toxins, immunomodulators such as cytokines, fluorescent moieties, cells, other antibodies, or antigen-binding fragments thereof.
[00605] Os conjugados descritos aqui, por exemplo, conjugados anticorpo-fármaco (ADCs), conjugados de tório direcionados (TTCs), anticorpos biespecíficos, etc., são de natureza "modular". Ao longo da invenção, são descritas várias modalidades específicas dos vários "módulos" que compõem os conjugados. Como exemplos específicos não limitantes, são descritas modalidades específicas de anticorpos ou fragmentos dos mesmos, ligantes e agentes citotóxicos e/ou citostáti- cos que podem compor os ADCs. Pretende-se que todas as modalidades específicas descritas possam ser combinadas entre si como se cada combinação específica fosse explicitamente descrita individualmente.[00605] The conjugates described herein, for example, antibody-drug conjugates (ADCs), targeted thorium conjugates (TTCs), bispecific antibodies, etc., are of a "modular" nature. Throughout the invention, various specific embodiments of the various "modules" that make up the conjugates are described. As specific, non-limiting examples, specific embodiments of antibodies or fragments thereof, ligands, and cytotoxic and/or cytostatic agents that may compose the ADCs are described. It is intended that all the specific embodiments described can be combined with each other as if each specific combination were explicitly described individually.
[00606] De acordo com um 19° aspecto, é fornecido um conjugado compreendendo um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto ou uma combinação dos mesmos. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 7° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 8° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 9° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 10° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 11° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 12° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 13° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 14° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 15° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 16° aspecto. Por exemplo, o conjugado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 17° aspecto. Por exemplo, o conju- gado compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 18° aspecto.[00606] According to aspect 19, a conjugate is provided comprising an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18 or a combination thereof. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 6. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 7. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 8. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 9. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 10. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 11. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 12. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 13. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 14. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 15. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 16. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 17. For example, the conjugate comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 18.
[00607] De acordo com algumas modalidades preferidas, o conjugado compreende (a) um elemento radioativo, (b) um agente citotóxi- co, tal como uma auristatina, um maitansinoide, um inibidor de proteína de fuso de cinesina (KSP), um inibidor de nicotinamida fosforibosil- transferase (NAMPT) ou um derivado de pirrolobenzodiazepina, (c) um anticorpo adicional ou fragmento de ligação ao antígeno, (d) um receptor de antígeno quimérico.[00607] According to some preferred embodiments, the conjugate comprises (a) a radioactive element, (b) a cytotoxic agent, such as an auristatin, a maytansinoid, a kinesin spindle protein (KSP) inhibitor, a nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) inhibitor or a pyrrolobenzodiazepine derivative, (c) an additional antibody or antigen-binding fragment, (d) a chimeric antigen receptor.
[00608] De acordo com algumas primeiras modalidades do 19° aspecto, o conjugado compreende ou está disposto para compreender um radionuclídeo, tal como uma partícula beta, uma partícula alfa ou um emissor de elétrons Auger. Emissores beta adequados de acordo com a presente invenção são, por exemplo, ítrio-90, iodo-131, es- trôncio-89-cloreto, lutécio-177, hólmio-166, rênio-186, rênio-188, cobre-67, promécio-149, ouro -199 e ródio-105. Os emissores de ele- trons Auger adequados, de acordo com a presente invenção, são, por exemplo, bromo-77, índio-111, iodo-123 e iodo-125. Emissores alfa adequados, de acordo com a presente invenção são, por exemplo, tó- rio-227, bismuto-213, rádio-223, actínio-225 e astatina-211.[00608] According to some early embodiments of the 19th aspect, the conjugate comprises or is arranged to comprise a radionuclide, such as a beta particle, an alpha particle, or an Auger electron emitter. Suitable beta emitters according to the present invention are, for example, yttrium-90, iodine-131, strontium-89 chloride, lutetium-177, holmium-166, rhenium-186, rhenium-188, copper-67, promethium-149, gold-199, and rhodium-105. Suitable Auger electron emitters according to the present invention are, for example, bromine-77, indium-111, iodine-123, and iodine-125. Suitable alpha emitters according to the present invention are, for example, thorium-227, bismuth-213, radium-223, actinium-225 and astatine-211.
[00609] Por exemplo, o tório-227 (227Th) pode ser eficazmente complexado com quelantes octadentados de 3,2-hidroxipiridinona (3,2- HOPO) que são conjugados com anticorpos de acordo com a presente invenção, resultando em conjugados de tório-227 direcionados alta-mente estáveis (TTCs), como descrito no Exemplo 13. Os conjugados de tório direcionados (TTCs) compreendem três blocos de construção principais. Após o decaimento de partículas β de actínio-227, o primeiro bloco de construção, o radionuclídeo emissor de partículas α 227Th é purificado por cromatografia de troca iônica. O segundo bloco de construção é um quelante, tal como um quelante derivado de siderófo- ro contendo grupos HOPO contendo quatro porções de 3-hidroxi-N- metil-2-piridinona em um andaime de poliamina simétrico funcionaliza- do com um ligante de ácido carboxílico para bioconjugação. A conju-gação com uma porção de direcionamento pode ser alcançada através da formação de ligação amida com os grupos ε-amino de resíduos de lisina. Esses quelantes 3,2-HOPO octadentados podem ser marcados eficazmente com 227Th, com alto rendimento, pureza e estabilidade em condições ambientais. Em comparação com o quelante de ácido tetra-azaciclododecano-1,4,7,10-tetra-acético (DOTA), que muitas vezes requer aquecimento, os quelantes HOPO são superiores devido à radiomarcação eficiente em temperatura ambiente e alta estabilidade dos complexos formados. O terceiro bloco de construção é a porção de direcionamento, que é o anticorpo do receptor de quimiocina ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo de acordo com qualquer um dos aspectos 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 ou 18.[00609] For example, thorium-227 (227Th) can be effectively complexed with octadentate 3,2-hydroxypyridinone (3,2-HOPO) chelators that are conjugated with antibodies according to the present invention, resulting in highly stable targeted thorium-227 conjugates (TTCs), as described in Example 13. The targeted thorium conjugates (TTCs) comprise three main building blocks. After the decay of β particles of actinium-227, the first building block, the α particle-emitting radionuclide 227Th is purified by ion-exchange chromatography. The second building block is a chelating agent, such as a siderophore-derived chelating agent containing HOPO groups with four 3-hydroxy-N-methyl-2-pyridinone moieties in a symmetrical polyamine scaffold functionalized with a carboxylic acid ligand for bioconjugation. Conjugation with a targeting moiety can be achieved through amide linkage formation with the ε-amino groups of lysine residues. These octadentate 3,2-HOPO chelating agents can be effectively labeled with 227Th, with high yield, purity, and stability under ambient conditions. Compared to the tetra-azacyclododecane-1,4,7,10-tetraacetic acid (DOTA) chelating agent, which often requires heating, HOPO chelating agents are superior due to efficient radiolabeling at room temperature and high stability of the complexes formed. The third building block is the targeting portion, which is the chemokine receptor antibody or antigen-binding fragment thereof according to any of aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18.
[00610] De acordo com algumas segundas modalidades do 19° aspecto, o conjugado compreende um agente citotóxico, por exemplo, para formar um conjugado anticorpo-fármaco (ADC).[00610] According to some second embodiments of the 19th aspect, the conjugate comprises a cytotoxic agent, for example, to form an antibody-drug conjugate (ADC).
[00611] Em algumas modalidades preferidas, o agente citotóxico é uma auristatina, um maitansinoide, um inibidor de proteína de fuso de cinesina (KSP), um inibidor de nicotinamida fosforibosiltransferase (NAMPT) ou um derivado de pirrolobenzodiazepina. A geração de con-jugados compreendendo maitansinoide pode ocorrer como descrito em Chari, Ravi VJ, et al. "Immunoconjugates containing novel maytansi- noids: promising anticancer drugs." Cancer research 52.1 (1992): 127131, ou EP2424569 B1, ambos os quais são incorporados aqui em sua totalidade. A geração de conjugados compreendendo inibidores de proteína de fuso de cinesina (KSP) pode ocorrer como descrito no WO2019243159 A1, incorporado aqui em sua totalidade. A geração de conjugados compreendendo um inibidor de nicotinamida fosforibosil- transferase (NAMPT) pode ocorrer como descrito no WO2019149637 A1, incorporado aqui em sua totalidade. A geração de conjugados compreendendo uma pirrolobenzodiazepina pode ser obtida como descrito em EP3355935 A1, incorporado aqui em sua totalidade.[00611] In some preferred embodiments, the cytotoxic agent is an auristatin, a maytansinoid, a kinesin spindle protein (KSP) inhibitor, a nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) inhibitor, or a pyrrolobenzodiazepine derivative. Generation of conjugates comprising maytansinoid may occur as described in Chari, Ravi VJ, et al. "Immunoconjugates containing novel maytansinoids: promising anticancer drugs." Cancer research 52.1 (1992): 127131, or EP2424569 B1, both of which are incorporated herein in their entirety. Generation of conjugates comprising kinesin spindle protein (KSP) inhibitors may occur as described in WO2019243159 A1, incorporated herein in its entirety. The generation of conjugates comprising a nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) inhibitor can occur as described in WO2019149637 A1, incorporated herein in its entirety. The generation of conjugates comprising a pyrrolobenzodiazepine can be obtained as described in EP3355935 A1, incorporated herein in its entirety.
[00612] O agente citotóxico e/ou citostático do receptor antiquimio- cina ou ADC anti-CCR8 pode ser qualquer agente conhecido em inibir o crescimento e/ou replicação e/ou matar células. São conhecidos na literatura numerosos agentes com propriedades citotóxicas e/ou citos- táticas. Exemplos não limitantes de classes de agentes citotóxicos e/ou citostáticos incluem, por meio de exemplo e não limitação, modu- ladores do ciclo celular, reguladores de apoptose, inibidores de qui- nase, inibidores de síntese de proteínas, agentes alquilantes, agentes de reticulação de DNA, agentes intercalantes, inibidores de mitocôn- drias, inibidores de exportação nuclear, inibidores de topoisomerase I, inibidores de topoisomerase II, antimetabólitos de RNA/DNA e agentes antimitóticos.[00612] The cytotoxic and/or cytostatic agent of the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC may be any agent known to inhibit growth and/or replication and/or kill cells. Numerous agents with cytotoxic and/or cytostatic properties are known in the literature. Non-limiting examples of classes of cytotoxic and/or cytostatic agents include, by way of example and not limitation, cell cycle modulators, apoptosis regulators, kinase inhibitors, protein synthesis inhibitors, alkylating agents, DNA cross-linking agents, intercalating agents, mitochondrial inhibitors, nuclear export inhibitors, topoisomerase I inhibitors, topoisomerase II inhibitors, RNA/DNA antimetabolites, and antimitotic agents.
[00613] Os ligantes que ligam o(s) agente(s) citotóxico(s) e/ou citos- tático(s) à porção de ligação ao antígeno de um receptor antiquimioci- na ou ADC anti-CCR8 podem ser longos, curtos, flexíveis, rígidos, hi- drofílicos ou hidrofóbicos por natureza, ou podem compreender segmentos que têm características diferentes, como segmentos de flexibilidade, segmentos de rigidez, etc. O ligante pode ser quimicamente estável para ambientes extracelulares, por exemplo, quimicamente estável na corrente sanguínea, ou pode incluir ligações que não são estáveis e liberam o citotóxico e/ou agentes citostáticos no meio extrace- lular. Em algumas modalidades, os ligantes incluem ligações que são projetadas para liberar os agentes citotóxicos e/ou citostáticos mediante internalização do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8, dentro da célula. Em algumas modalidades específicas, os ligantes incluem ligações projetadas para clivar e/ou imolar ou de outra forma quebrar especificamente ou não especificamente dentro das células. Uma grande variedade de ligantes úteis para ligar fármacos às porções de ligação ao antígeno, tais como anticorpos no contexto de ADCs, são conhecidos na técnica. Qualquer um desses ligantes, bem como outros ligantes, pode ser usado para ligar os agentes citotóxicos e/ou ci- tostáticos à porção de ligação ao antígeno do receptor antiquimiocina ou ADCs anti-CCR8, descritos aqui.[00613] The ligands that link the cytotoxic and/or cytostatic agent(s) to the antigen-binding portion of an antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC may be long, short, flexible, rigid, hydrophilic, or hydrophobic in nature, or may comprise segments that have different characteristics, such as flexible segments, rigid segments, etc. The ligand may be chemically stable in extracellular environments, for example, chemically stable in the bloodstream, or it may include linkages that are not stable and release the cytotoxic and/or cytostatic agents into the extracellular medium. In some embodiments, the linkages include linkages that are designed to release the cytotoxic and/or cytostatic agents by internalizing the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC within the cell. In some specific embodiments, the ligands include linkers designed to cleave and/or immolate or otherwise break down specifically or non-specifically within cells. A wide variety of ligands useful for linking drugs to antigen-binding moieties, such as antibodies in the context of ADCs, are known in the art. Any of these ligands, as well as other ligands, can be used to link cytotoxic and/or cytostatic agents to the antigen-binding moiety of the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADCs, described herein.
[00614] O número de agentes citotóxicos e/ou citostáticos ligados à porção de ligação ao antígeno de um receptor antiquimiocina ou anti- CCR8 ADC (relação fármaco-anticorpo: DAR) pode variar e será limitado apenas pelo número de locais de ligação disponíveis na porção de ligação ao antígeno e no número de agentes ligados a um único ligante. Normalmente, um ligante ligará um único agente citotóxico e/ou citostático à porção de ligação ao antígeno de um receptor anti- quimiocina ou ADC anti-CCR8. Em modalidades de receptor antiqui- miocina ou ADCs anti-CCR8, que incluem mais de um único agente citotóxico e/ou citostático, cada agente pode ser o mesmo ou diferente. Contanto que o receptor antiquimocina ou ADC anti-CCR8, não exiba níveis inaceitáveis de agregação nas condições de uso e/ou armazenamento, o receptor antiquimocina ou anti-CCR8 ADCs, com DARs de vinte ou até mais, são contemplados. Em algumas modalidades, o receptor antiquimiocina ou ADCs anti-CCR8, descritos aqui podem ter um DAR na faixa de cerca de 1-10, 1-8, 1-6 ou 1-4. Em certas modalidades específicas, o receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 pode ter um DAR de 2, 3 ou 4. Em algumas modalidades, o receptor anti- quimocina ou ADC anti-CCR8 são compostos de acordo com a fórmula estrutural (I):[DL-XY]n-Ab (I) ou sais dos mesmos, onde cada "D" representa, independentemente dos outros, um agente citotóxico e/ou citostático; cada "L" representa, independentemente dos demais, um ligante; "Ab" representa uma porção de ligação ao receptor antiquimiocina, por exemplo, um anticorpo anti-CCR8 de acordo com a presente invenção; cada "XY" representa uma ligação formada entre um grupo funcional Rx no ligante e um grupo funcional "complementar" Ry na porção de ligação ao receptor anti- quimiocina; e n representa o DAR do ADC do receptor antiquimiocina.[00614] The number of cytotoxic and/or cytostatic agents bound to the antigen-binding portion of an antichemokine or anti-CCR8 ADC receptor (drug-antibody ratio: DAR) may vary and will be limited only by the number of binding sites available in the antigen-binding portion and the number of agents bound to a single ligand. Typically, a ligand will bind a single cytotoxic and/or cytostatic agent to the antigen-binding portion of an antichemokine or anti-CCR8 ADC receptor. In antichemokine or anti-CCR8 ADC receptor modalities that include more than one cytotoxic and/or cytostatic agent, each agent may be the same or different. Provided that the antichemokine or anti-CCR8 ADC receptor does not exhibit unacceptable levels of aggregation under conditions of use and/or storage, antichemokine or anti-CCR8 ADC receptors with DARs of twenty or more are contemplated. In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADCs described herein may have a DAR in the range of about 1-10, 1-8, 1-6 or 1-4. In certain specific embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC may have a DAR of 2, 3 or 4. In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC are composed according to the structural formula (I):[DL-XY]n-Ab (I) or salts thereof, where each “D” represents, independently of the others, a cytotoxic and/or cytostatic agent; each “L” represents, independently of the others, a ligand; “Ab” represents a binding moiety to the antichemokine receptor, for example, an anti-CCR8 antibody according to the present invention; Each "XY" represents a bond formed between an Rx functional group in the ligand and a "complementary" Ry functional group in the antichemokine receptor-binding portion; and n represents the DAR of the antichemokine receptor ADC.
[00615] Em uma modalidade exemplar específica, os ADCs do receptor antiquimiocina são compostos de acordo com a fórmula estrutural (I) em que cada "D" é igual e é uma auristatina de permeação celular (por exemplo, dolastatina-10 ou MMAE) ou uma agente de reticula- ção de DNA de ligação aos sulcos menores de permeação celular; cada "L" é igual e é um ligante clivável por uma enzima lisossomal; cada "XY" é uma ligação formada entre uma maleimida e um grupo sulfidri- la; "Ab" é um anticorpo ou fragmento do mesmo compreendendo seis CDRs correspondentes às seis CDRs de um receptor antiquimiocina ou anticorpo CCR8 de acordo com a presente invenção; e n é 2, 3 ou 4. Em uma modalidade específica, "Ab" é um anticorpo totalmente humano compreendendo CDRs derivadas de seres humanos.[00615] In a specific exemplary embodiment, the antichemokine receptor ADCs are composed according to structural formula (I) wherein each “D” is equal to and is a cell-permeable auristatin (e.g., dolastatin-10 or MMAE) or a DNA crosslinking agent binding to the minor cell-permeable grooves; each “L” is equal to and is a lysosomal enzyme-cleavable ligand; each “XY” is a linkage formed between a maleimide and a sulfhydryl group; “Ab” is an antibody or fragment thereof comprising six CDRs corresponding to the six CDRs of an antichemokine receptor or CCR8 antibody according to the present invention; and n is 2, 3, or 4. In a specific embodiment, “Ab” is a fully human antibody comprising human-derived CDRs.
[00616] Os agentes citotóxicos e citostáticos são agentes conhecidos por inibir o crescimento e/ou replicação e/ou morte de células e, em particular, células tumorais ou células Treg intratumorais. Esses compostos podem ser usados em uma terapia de combinação com um anticorpo de receptor antiquimiocina, tal como um anticorpo CCR8, ou como parte de um ADC de receptor antiquimiocina, como descrito aqui:[00616] Cytotoxic and cytostatic agents are agents known to inhibit the growth and/or replication and/or death of cells, and in particular, tumor cells or intratumoral Treg cells. These compounds can be used in combination therapy with an antichemokine receptor antibody, such as a CCR8 antibody, or as part of an antichemokine receptor ADC, as described here:
[00617] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um agente citostático selecionado de radionuclídeos, agentes alquilantes, agentes de reticulação de DNA, agentes intercalante de DNA (por exemplo, agentes de ligação de sulco, tal como ligantes de sulco menor), moduladores do ciclo celular, reguladores de apoptose, inibidores de quinase, inibidores de síntese de proteínas, inibidores de mitocôndrias, inibidores de exportação nuclear, inibidores de topoisomerase I, inibidores de topoisomerase II, antimetabólitos de RNA/DNA e agentes antimitóticos.[00617] In some embodiments, the drug portion of the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC is a cytostatic agent selected from radionuclides, alkylating agents, DNA crosslinking agents, DNA intercalating agents (e.g., sulcus linking agents, such as minor sulcus ligands), cell cycle modulators, apoptosis regulators, kinase inhibitors, protein synthesis inhibitors, mitochondrial inhibitors, nuclear export inhibitors, topoisomerase I inhibitors, topoisomerase II inhibitors, RNA/DNA antimetabolites, and antimitotic agents.
[00618] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um agente alquilante selecionado de (L-Leucina, N—[N-acetil-4-[bis-(2-cloroetil)amino]-DL-fenilalanil]-, éster etílico); AZQ (ácido 1,4-ciclo-hexadieno-1,4-dicarbâmico, 2,5- bis(1-aziridinil)-3,6-dioxo-, éster dietílico); BCNU (N,N'-Bis(2-cloroetil)- N-nitrosoureia); bussulfano (dimetanossulfonato de 1,4-butanodiol); (carboxiftalato)platina; CBDCA (cis-(1,1-ciclobutanodicarboxilato)diaminoplatina(II))); CCNU (N-(2-cloroetil)-N'- ciclo-hexil-N-nitrosoureia); CHIP (iproplatina; NSC 256927); clorambu- cil; clorozotocina (2-[[[(2-cloroetil) nitrosoamino]carbonil]amino]-2- desoxi-D-glucopiranose); cis-platina (cisplatina); clomesona; cianomor- folinodoxorrubicina; ciclodisona; dianidrogalactitol (5,6-diepoxiducitol); fluorodopan ((5-[(2-cloroetil)-(2-fluoroetil)amino]-6-metil-uracil); hepsul- fam; hicantona; dímero de indolinobenzodiazepina DGN462; melfala- no; metil CCNU ((1-(2-cloroetil)-3-(trans-4-metilciclo-hexano)-1- nitrosoureia); mitomicina C; mitozolamida; mostarda de nitrogênio (clo- ridrato de (bis(2-cloroetil)metilamina); PCNU ((1-(2-cloroetil)-3-(2,6)- dioxo-3-piperidil)-1-nitrosoureia)); alquilante de piperazina (dicloridrato de (1-(2-cloroetil)-4-(3-cloropropil)-piperazina)); piperazinodiona; pipo- broman (N,N'-bis(3-bromopropionil) piperazina); porfiromicina (N- metilmitomicina C); mostarda de espiro-hidantoína; teroxirona (triglicidi- lisocianurato); tetraplatina; tio-tepa (N,N',N'-tri-1,2-etanodi-iltio fosfora- mida); trietilenomelamina; uracil mostarda de nitrogênio (desmetildo- pan); Yoshi-864 (cloridrato de (bis(3-mesiloxipropil)amina).[00618] In some embodiments, the antichemokine receptor drug moiety or anti-CCR8 ADC is an alkylating agent selected from (L-Leucine, N—[N-acetyl-4-[bis-(2-chloroethyl)amino]-DL-phenylalanine]-, ethyl ester); AZQ (1,4-cyclohexadiene-1,4-dicarbamic acid, 2,5-bis(1-aziridinyl)-3,6-dioxo-, diethyl ester); BCNU (N,N'-Bis(2-chloroethyl)-N-nitrosourea); busulfan (1,4-butanediol dimethanesulfonate); (carboxyphthalate)platinum; CBDCA (cis-(1,1-cyclobutanedicarboxylate)diaminoplatinum(II))); CCNU (N-(2-chloroethyl)-N'-cyclohexyl-N-nitrosourea); CHIP (iproplatin; NSC 256927); chlorambucil; chlorozotocin (2-[[[(2-chloroethyl) nitrosoamino]carbonyl]amino]-2-deoxy-D-glucopyranose); cis-platinum (cisplatin); clomesone; cyanomorpholinodoxorubicin; cyclodysone; dianhydrogalactitol (5,6-diepoxyducitol); fluorodopan ((5-[(2-chloroethyl)-(2-fluoroethyl)amino]-6-methyluracil); hepsulfam; hycantone; indolinobenzodiazepine dimer DGN462; melphalan; methyl CCNU ((1-(2-chloroethyl)-3-(trans-4-methylcyclohexane)-1-nitrosourea); mitomycin C; mitozolamide; nitrogen mustard ((bis(2-chloroethyl)methylamine hydrochloride); PCNU ((1-(2-chloroethyl)-3-(2,6)-dioxo-3-piperidyl)-1-nitrosourea)); piperazine alkylating agent ((1-(2-chloroethyl)-4-(3-chloropropyl)piperazine dihydrochloride)); piperazinodione; pipobroman (N,N'-bis(3-bromopropionyl)piperazine); porphyromycin (N-methylmitomycin C); spirohydantoin mustard; teroxirone (triglycidyl lysocyanurate); tetraplatinum; thio-tepa (N,N',N'-tri-1,2-ethanediylthiophosphoramide); triethylenemelamine; uracil nitrogen mustard (desmethyldopan); Yoshi-864 (bis(3-mesyloxypropyl)amine hydrochloride).
[00619] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um agente semelhante à alquila- ção de DNA selecionado de Cisplatina; carboplatina; Nedaplatina; Oxaliplatina; Satraplatina; tetranitrato de triplatina; Procarbazina; altre- tamina; dacarbazina; mitozolomida; temozolomida.[00619] In some embodiments, the antichemokine receptor drug moiety or anti-CCR8 ADC is a DNA alkylation-like agent selected from Cisplatin; carboplatin; Nedaplatin; Oxaliplatin; Satraplatin; triplatin tetranitrate; Procarbazine; altretamine; dacarbazine; mitozolomide; temozolomide.
[00620] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um agente antineoplásico alqui- lante selecionado de Carboquona; Carmustina; Clornafazina; Clorozo- tocina; Duocarmicina; Evofosfamida; Fotemustina; Glufosfamida; Lo- mustina; Mannossulfano; Nimustina; Fenantriplatina; Pipobroman; Ra- nimustina; Semustina; Estreptozotocina; TioTEPA; Treossulfan; Triazi- quona; Trietilenomelamina; Tetranitrato de triplatina.[00620] In some embodiments, the antichemokine receptor drug portion or anti-CCR8 ADC is an alkylating antineoplastic agent selected from Carboquone; Carmustine; Chlornaphazine; Chlorozotocin; Duocarmycin; Evofosfamide; Fotemustine; Glufosfamide; Lomustine; Mannosolfane; Nimustine; Phenantiplatin; Pipobroman; Ranimustine; Semustine; Streptozotocin; ThioTEPA; Treosulfan; Triaziquone; Triethylenemelamine; Triplatin tetranitrate.
[00621] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de replicação e reparo de DNA selecionado de Altretamina; Bleomicina; Dacarbazina; Dacti- nomicina; mitobronitol; mitomicina; Pingiangmicina; Plicamicina; Pro- carbazina; Temozolomida; ABT-888 (veliparib); olaparibe; KU-59436; AZD-2281; AG-014699; BSI-201; BGP-15; INO-1001; ONO-2231.[00621] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a DNA replication and repair inhibitor selected from Altretamine; Bleomycin; Dacarbazine; Dactinomycin; mitobronitol; mitomycin; Pingiangmycin; Plicamycin; Procarbazine; Temozolomide; ABT-888 (veliparib); olaparib; KU-59436; AZD-2281; AG-014699; BSI-201; BGP-15; INO-1001; ONO-2231.
[00622] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um modulador do ciclo celular, tal como Paclitaxel; Nab-Paclitaxel; Docetaxel; Vincristina; Vinblastina; ABT-348; AZD-1152; MLN-8054; VX-680; inibidores de quinase espe-cíficos de Aurora A; inibidores de quinase específicos de Aurora B e inibidores de quinase pan-Aurora; AZD-5438; IMC-1040; BMS-032;BMS-387; CVT-2584; flavopiridol; GPC-286199; MCS-5A; PD0332991; PHA-690509; seliciclib (CYC-202, R-roscovitina); ZK-304709; AZD4877, ARRY-520: GSK923295A.[00622] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a cell cycle modulator, such as Paclitaxel; Nab-Paclitaxel; Docetaxel; Vincristine; Vinblastine; ABT-348; AZD-1152; MLN-8054; VX-680; Aurora A-specific kinase inhibitors; Aurora B-specific kinase inhibitors and pan-Aurora kinase inhibitors; AZD-5438; IMC-1040; BMS-032; BMS-387; CVT-2584; flavopiridol; GPC-286199; MCS-5A; PD0332991; PHA-690509; seliciclib (CYC-202, R-roscovitine); ZK-304709; AZD4877, ARRY-520: GSK923295A.
[00623] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um regulador de apoptose, tal como AT-101 ((-)gossipol); G3139 ou oblimersen (oligonucleotídeo antisense direcionado a Bcl-2); IPI-194; IPI-565; N-(4-(4-((4'-cloro(1,1'- bifenil)-2-il)metil)piperazin-1-ilbenzoil)-4-(((1R)-3-(dimetilamino)-1- ((fenilsulfanil)metil)propil)amino)-3-nitrobenzenossulfonamida); N-(4-(4- ((2-(4-clorofenil)-5,5-dimetil-1-ciclo-hex-1-en-1-il)metil)piperazin-1- il)benzoil)-4-(((1R)-3-(morfolin-4-il)-1-((fenilsulfanil)metil)propil)amino)- 3-((trifluorometil)sulfonil)benzenossulfonamida; GX-070 (Obatoclax®; 1H-Indol, 2-(2-((3,5-dimetil-1H-pirrol-2-il)metileno)-3-metóxi-2H-pirrol-5- il)-)); HGS1029; GDC-0145; GDC-0152; LCL-161; LBW-242; veneto- clax; agentes que têm como alvo TRAIL ou receptores de morte (por exemplo, DR4 e DR5), tais como ETR2-ST01, GDC0145, HGS-1029, LBY-135, PRO-1762; fármacos que têm como alvo caspases, reguladores de caspases, membros da família BCL-2, proteínas do domínio de morte, membros da família TNF, membros da família Toll e/ou proteínas NF-kappa-B.[00623] In some embodiments, the drug portion of the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC is an apoptosis regulator, such as AT-101 ((-)gssypol); G3139 or oblimersen (antisense oligonucleotide targeting Bcl-2); IPI-194; IPI-565; N-(4-(4-((4'-chloro(1,1'-biphenyl)-2-yl)methyl)piperazin-1-ylbenzoyl)-4-(((1R)-3-(dimethylamino)-1-((phenylsulfanyl)methyl)propyl)amino)-3-nitrobenzenesulfonamide); N-(4-(4-((2-(4-chlorophenyl)-5,5-dimethyl-1-cyclohex-1-en-1-yl)methyl)piperazin-1-yl)benzoyl)-4-(((1R)-3-(morpholin-4-yl)-1-((phenylsulfanyl)methyl)propyl)amino)- 3-((trifluoromethyl)sulfonyl)benzenesulfonamide; GX-070 (Obatoclax®; 1H-Indole, 2-(2-((3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl)methylene)-3-methoxy-2H-pyrrol-5-yl)-)); HGS1029; GDC-0145; GDC-0152; LCL-161; LBW-242; veneto- clax; Agents that target TRAIL or death receptors (e.g., DR4 and DR5), such as ETR2-ST01, GDC0145, HGS-1029, LBY-135, PRO-1762; drugs that target caspases, caspase regulators, BCL-2 family members, death domain proteins, TNF family members, Toll family members, and/or NF-kappa-B proteins.
[00624] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de angiogênese, tal como ABT-869; AEE-788; axitinib (AG-13736); AZD-2171; CP-547.632; IM-862; pegaptamib; sorafenibe; BAY43-9006; pazopanib(GW-786034); vatalanib (PTK-787, ZK-222584); sunitinibe; SU-11248; armadilha VEGF; vandetanib; ABT-165; ZD-6474; Inibidores de DLL4.[00624] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is an angiogenesis inhibitor, such as ABT-869; AEE-788; axitinib (AG-13736); AZD-2171; CP-547632; IM-862; pegaptamib; sorafenib; BAY43-9006; pazopanib (GW-786034); vatalanib (PTK-787, ZK-222584); sunitinib; SU-11248; VEGF trap; vandetanib; ABT-165; ZD-6474; DLL4 inhibitors.
[00625] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de proteassoma tal como Bortezomib; Carfilzomib; Epoxomicina; Ixazomib; Salinospora- mida A.[00625] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a proteasome inhibitor such as Bortezomib; Carfilzomib; Epoxomicin; Ixazomib; Salinosporamide A.
[00626] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de quinase, tal como Afatinib; Axitinibe; Bosutinib; Crizotinib; Dasatinib; Erlotinib; Fostamati- nib; Gefitinib; Ibrutinib; Imatinib; lapatinib; lenvatinib; Mubritinib; Niloti- nib; Pazopanib; Pegaptanib; Sorafenibe; Sunitinib; SU6656; Vandeta- nib; Vemurafenibe; CEP-701 (lesaurtinib); XL019; INCB018424 (ruxoli- tinib); ARRY-142886 (selemetinib); ARRY-438162 (binimetinib); PD- 325901; PD-98059; AP-23573; CCI-779; everolimo; RAD-001; rapami- cina; temsirolimus; inibidores de TORC1/TORC2 competitivos com ATP, incluindo PI-103, PP242, PP30, Torin 1; LY294002; XL-147;CAL-120; ONC-21; AEZS-127; ETP-45658; PX-866; GDC-0941;BGT226; BEZ235; XL765.[00626] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a kinase inhibitor, such as Afatinib; Axitinib; Bosutinib; Crizotinib; Dasatinib; Erlotinib; Fostamati-nib; Gefitinib; Ibrutinib; Imatinib; lapatinib; lenvatinib; Mubritinib; Nilotinib; Pazopanib; Pegaptanib; Sorafenib; Sunitinib; SU6656; Vandetanib; Vemurafenib; CEP-701 (lesaurtinib); XL019; INCB018424 (ruxoli- tinib); ARRY-142886 (selemetinib); ARRY-438162 (binimetinib); PD-325901; PD-98059; AP-23573; CCI-779; everolimus; RAD-001; rapamycin; temsirolimus; ATP-competitive TORC1/TORC2 inhibitors, including PI-103, PP242, PP30, Torin 1; LY294002; XL-147; CAL-120; ONC-21; AEZS-127; ETP-45658; PX-866; GDC-0941; BGT226; BEZ235; XL765.
[00627] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor da síntese de proteínas, tal como estreptomicina; Di-hidroestreptomicina; Neomicina; fra- micetina; Paromomicina; Ribostamicina; canamicina; Amicacina; Arbe- cacina; Becanamicina; Dibecacina; Tobramicina; Espectinomicina; Hi- gromicina B; Paromomicina; Gentamicina; Netilmicina; Sisomicina; Isepamicina; Verdamicina; Astromicina; Tetraciclina; Doxiciclina; Clor- tetraciclina; Clomociclina; Demeclociclina; limeciclina; meclociclina; Metaciclina; Minociclina; Oxitetraciclina; Penimepiciclina; Rolitetracicli- na; Tetraciclina; Glicilciclinas; Tigeciclina; Oxazolidinona; Eperezolida; Linezolida; Posizolida; Radazolida; Ranbezolida; Sutezolida; Tedizoli- da; Inibidores de peptidil transferase; Cloranfenicol; Azidamfenicol; Ti- anfenicol; Florfenicol; Pleuromutilinas; Retapamulina; Tiamulina; Val- nemulina; Azitromicina; Claritromicina; Diritromicina; Eritromicina; Fluri- tromicina; Josamicina; Midecamicina; Miocamicina; Oleandomicina; Rokitamicina; Roxitromicina; Espiramicina; Troleandomicina; Tilosina; Cetólidos; Telitromicina; Cetromicina; solitromicina; Clindamicina; Lin- comicina; Pirlimicina; Estreptograminas; Pristinamicina; Quinupristi- na/dalfopristina; Virginiamicina.[00627] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a protein synthesis inhibitor, such as streptomycin; Dihydrostreptomycin; Neomycin; Framycetin; Paromomycin; Ribostamycin; Kanamycin; Amikacin; Arbecacin; Becanamycin; Dibecacin; Tobramycin; Spectinomycin; Hygromycin B; Paromomycin; Gentamicin; Netilmicin; Sisomicin; Isepamycin; Verdamycin; Astromycin; Tetracycline; Doxycycline; Chlortetracycline; Clomocycline; Demeclocycline; Limecycline; Meclocycline; Metacycline; Minocycline; Oxytetracycline; Penimepicilline; Rolitetracycline; Tetracycline; Glycylcyclines; Tigecycline; Oxazolidinone; Eperezolilide; Linezolid; Posizolid; Radazolid; Ranbezolid; Sutezolid; Tedizolid; Peptidyl transferase inhibitors; Chloramphenicol; Azidamphenicol; Thiamphenicol; Florfenicol; Pleuromutilins; Retapamulin; Tiamulin; Valnemulin; Azithromycin; Clarithromycin; Dirithromycin; Erythromycin; Flurithromycin; Josamycin; Midecamycin; Miocamycin; Oleandomycin; Rokitamycin; Roxithromycin; Spiramycin; Troleandomycin; Tylosin; Ketolides; Telithromycin; Cethromycin; Solithromycin; Clindamycin; Lincomin; Pirlimycin; Streptogramins; Pristinamycin; Quinupristin/dalfopristin; Virginiamycin.
[00628] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de histona desacetila- se, tal como Vorinostat; Romidepsina; Chidamida; Panobinostat; Ácido valpróico; Belinostat; Mocetinostat; Abexinostat; Entinostat; SB939 (pracinostat); Resminostato; Givinostat; Quisinostat; tioureidobutironi- trilo (Kevetrin™); CUDC-10; CHR-2845 (tefinostat); CHR-3996; 4SC- 202; CG200745; ACY-1215 (rocilinostat); ME-344; sulforafano.[00628] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a histone deacetylase inhibitor, such as Vorinostat; Romidepsin; Chidamide; Panobinostat; Valproic acid; Belinostat; Mocetinostat; Abexinostat; Entinostat; SB939 (pracinostat); Resminostat; Givinostat; Quisinostat; thioureidobutyronitrile (Kevetrin™); CUDC-10; CHR-2845 (tefinostat); CHR-3996; 4SC-202; CG200745; ACY-1215 (rocilinostat); ME-344; sulforaphane.
[00629] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de topoisomerase I, tal como camptotecina; Vários derivados e análogos da campototecina (por exemplo, NSC 100880, NSC 603071, NSC 107124, NSC 643833, NSC 629971, NSC 295500, NSC 249910, NSC 606985, NSC 74028, NSC 17633, NSC 618939, NSC 610457, NSC 610459, NSC 606499, NSC 610456, NSC 364830 e NSC 606497); morfolinisoxorrubicina; SN-38.[00629] In some embodiments, the antichemokine receptor drug portion or anti-CCR8 ADC is a topoisomerase I inhibitor, such as camptothecin; Various campotothecin derivatives and analogues (e.g., NSC 100880, NSC 603071, NSC 107124, NSC 643833, NSC 629971, NSC 295500, NSC 249910, NSC 606985, NSC 74028, NSC 17633, NSC 618939, NSC 610457, NSC 610459, NSC 606499, NSC 610456, NSC 364830 and NSC 606497); morpholinisoxorubicin; SN-38.
[00630] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de topoisomerase II tal como doxorrubicina; amonafide (benzisoquinolinediona); m-AMSA (4'- (9-acridinilamino)-3'-metoximetanossulfonanilida); derivado de antrapi- razol ((NSC 355644); etoposídeo (VP-16); pirazoloacridina ((pira- zolo[3,4,5-kl]acridina-2(6H)-propanamina, 9-metóxi-N,N-dimetil-5-nitro-, monometanossulfonato); cloridrato de bisantreno; daunorrubicina; de- soxidoxorrubicina; mitoxantrona; menogaril; N,N-dibenzil daunomicina; oxantrazol; rubidazona; teniposídeo.[00630] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a topoisomerase II inhibitor such as doxorubicin; amonafide (benzisoquinolinedione); m-AMSA (4'-(9-acridinylamino)-3'-methoxymethanesulfonanilide); anthrapyrazole derivative ((NSC 355644); etoposide (VP-16); pyrazoloacridine ((pyrazolo[3,4,5-kl]acridine-2(6H)-propanamine, 9-methoxy-N,N-dimethyl-5-nitro-, monomethanesulfonate); bisanthrene hydrochloride; daunorubicin; desoxyxorubicin; mitoxantrone; menogaril; N,N-dibenzyl daunomycin; oxanthrazole; rubidazone; teniposide.
[00631] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um agente intercalante de DNA, tal como antramicina; chicamicina A; tomamicina; DC-81; sibiromicina; derivado de pirrolobenzodiazepina; SGD-1882 ((S)-2-(4-aminofenil)-7- metóxi-8-(3S)-7-metóxi-2-(4-metoxifenil)-5-oxo-5,11a-di-hidro-1H- benzo[e]pirrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-il)óxi)propóxi)-1H-benzo[e]pirrolo[1,2-a][1,4]diazepin- 5(11aH)-ona); SG2000 (SJG-136; (11aS,11a'S)-8,8'-(propano-1,3-di-ilbis(óxi))bis(7-metóxi-2-metileno- 2,3-di-hidro-1H-benzo[e]pirrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-ona)).[00631] In some embodiments, the drug portion of the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC is a DNA intercalating agent, such as anthramycin; chicamycin A; tomamycin; DC-81; sibiromycin; pyrrolobenzodiazepine derivative; SGD-1882 ((S)-2-(4-aminophenyl)-7-methoxy-8-(3S)-7-methoxy-2-(4-methoxyphenyl)-5-oxo-5,11a-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)propoxy)-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin- 5(11aH)-one); SG2000 (SJG-136; (11aS,11a'S)-8,8'-(propane-1,3-di-ylbis(oxy))bis(7-methoxy-2-methylene-2,3-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one)).
[00632] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um antimetabólito de RNA/DNA, tal como L-alanosina; 5-azacitidina; 5-fluorouracilo; acivicina; derivado de aminopterina ácido N-[2-cloro-5[[(2,4-diamino-5-metil-6-quinazolinil)metil]amino]benzoil]L-aspártico (NSC 132483); ácido N-[4- [[(2,4-diamino-5-etil-6-quinazolinil)metil]amino]benzoil]L-aspártico derivado de aminopterina; derivado de aminopterina mono-hidrato de ácido N-[2-cloro-4-[[(2,4-diamino-6-pteridinil)metil]amino]benzoil]L-aspártico; antifolato PT523 ((Nα-(4-amino-4-desoxipteroil)-NY-hemiftaloil-L-ornitina)); antifol solúvel de Baker (NSC 139105); dicloralil leisona ((2-(3,3-dicloroalil)-3-hidróxi-1,4-naftoquinona); brequinar; ftora- fur ((pró-fármaco; 5-fluoro-1-(tetra-hidro-2-furil)-uracil); 5,6-di-hidro-5- azacitidina; metotrexato; derivado de metotrexato (ácido N-[[4-[[(2,4- diamino-6-pteridinil)metil]metilamino]-1-naftalenil]carbonil]L-glutâmico); PALA ((N-(fosfonoacetil)-L-aspartato); pirazofurina; trimetrexato.[00632] In some embodiments, the antichemokine receptor drug portion or anti-CCR8 ADC is an RNA/DNA antimetabolite, such as L-alanosine; 5-azacitidine; 5-fluorouracil; acivicin; aminopterin derivative N-[2-chloro-5[[(2,4-diamino-5-methyl-6-quinazolinyl)methyl]amino]benzoyl]L-aspartic acid (NSC 132483); aminopterin derivative N-[4-[[(2,4-diamino-5-ethyl-6-quinazolinyl)methyl]amino]benzoyl]L-aspartic acid; aminopterin derivative monohydrate of N-[2-chloro-4-[[(2,4-diamino-6-pteridinyl)methyl]amino]benzoyl]L-aspartic acid; antifolate PT523 ((Nα-(4-amino-4-deoxypteroyl)-NY-hemifthaloyl-L-ornithine)); Baker's soluble antifol (NSC 139105); dichloralyl leisone ((2-(3,3-dichloroallyl)-3-hydroxy-1,4-naphthoquinone); brequinar; phthorafur ((prodrug; 5-fluoro-1-(tetrahydro-2-furyl)-uracil); 5,6-dihydro-5-azacytidine; methotrexate; methotrexate derivative (acid N-[[4-[[(2,4-diamino-6-pteridinyl)methyl]methylamino]-1-naphthalenyl]carbonyl]L-glutamic acid ((N-(phosphonoacetyl)-L-aspartate); pyrazofurin; trimetrexate.
[00633] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um antimetabólito de DNA tal como 3-HP; 2'-desóxi-5-fluorouridina; 5-HP; α-TGDR (a-2'-desóxi-6- tioguanosina); glicinato de afidicolina; araC (citosina arabinosídeo); 5- aza-2'-desoxicitidina; β-TGDR (β-2'-des0xi-6-tioguanosina); ciclocitidi- na; guanazol; hidroxiureia; inosina glicodialdeído; macbecina II; pira- zoloimidazol; tioguanina; tiopurina.[00633] In some embodiments, the drug portion of the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC is a DNA antimetabolite such as 3-HP; 2'-deoxy-5-fluorouridine; 5-HP; α-TGDR (α-2'-deoxy-6-thioguanosine); aphidicolin glycinate; araC (cytosine arabinoside); 5-aza-2'-deoxycytidine; β-TGDR (β-2'-deoxy-6-thioguanosine); cyclocytidine; guanazole; hydroxyurea; inosine glycodialdehyde; macbecin II; pyrazoloimidazole; thioguanine; thiopurine.
[00634] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de mitocôndrias, tal como pancratistatina; fenpanstatina; rodamina-123; edelfosina; succi- nato de d-alfa-tocoferol; composto 11β; aspirina; elipticina; berberina; cerulenina; GX015-070 (Obatoclax®; 1H-Indol, 2-(2-((3,5-dimetil-1H- pirrol-2-il)metileno)-3-metóxi-2H-pirrol-5-il)-); celastrol (tripterina); met- formina; Verde brilhante; ME-344.[00634] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a mitochondrial inhibitor, such as pancratistatin; fenpanstatin; rhodamine-123; edelfosine; d-alpha-tocopherol succinate; compound 11β; aspirin; ellipticin; berberine; cerulenin; GX015-070 (Obatoclax®; 1H-Indole, 2-(2-((3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl)methylene)-3-methoxy-2H-pyrrol-5-yl)-); celastrol (tripterin); metformin; Brilliant Green; ME-344.
[00635] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8, é um agente antimitótico, tal como alocolchicina; auristatinas, tais como MMAE (monometil auristatina E) e MMAF (monometil auristatina F); halicondrina B; cemadotina; colchi- cina; derivado de colchicina (N-benzoil-desacetil benzamida); dolasta- tina-10; dolastatina-15; maitansina; maitansinoides, tais como DM1 (N2'-desacetil-N2'-(3-mercapto-1-oxopropil)-maitansina); rozoxina; paclitaxel; derivado de paclitaxel ((2'-N-[3-(dimetilamino)propil]glutaramato paclitaxel); docetaxel; tiocolchicina; tritilcisteína; sulfato de vinblastina; sulfato de vincristina.[00635] In some embodiments, the antichemokine receptor drug portion or anti-CCR8 ADC is an antimitotic agent, such as allocolchicine; auristatins, such as MMAE (monomethyl auristatin E) and MMAF (monomethyl auristatin F); halicondrin B; cemadotine; colchicine; colchicine derivative (N-benzoyl-desacetylbenzamide); dolastatin-10; dolastatin-15; maytansine; maytansinoids, such as DM1 (N2'-desacetyl-N2'-(3-mercapto-1-oxopropyl)-maytansine); rozoxine; paclitaxel; paclitaxel derivative ((2'-N-[3-(dimethylamino)propyl]glutaramate paclitaxel); docetaxel; thiocolchicine; tritylcysteine; vinblastine sulfate; vincristine sulfate.
[00636] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um inibidor de exportação nuclear, tal como calistatina A; delactonmicina; KPT-185 ((Z)-3-[3-[3-metóxi-5- (trifluorometil)fenil]-1,2,4-triazol-1-il]prop-2-enoato de propan-2-ila); ca- zusamicina A; leptolstatina; leptofuranina A; leptomicina B; ratjadona; Verdinexor ((Z)-3-[3-[3,5-bis(trifluorometil)fenil]-1,2,4-triazol-1-il]-N-piridin-2-ilprop-2-eno-hidrazida).[00636] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a nuclear export inhibitor, such as calistatin A; delactonmycin; KPT-185 ((Z)-3-[3-[3-methoxy-5-(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,4-triazol-1-yl]prop-2-enoate propan-2-yl); cazusamycin A; leptolstatin; leptofuranin A; leptomycin B; ratjadone; Verdinexor ((Z)-3-[3-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,4-triazol-1-yl]-N-pyridin-2-ylprop-2-enehydrazide).
[00637] Em algumas modalidades, a porção de fármaco do receptor antiquimiocina ou ADC anti-CCR8 é um produto terapêutico hormonal, tal como anastrozol; exemestano; arzoxifeno; bicalutamida; cetrorrelix; degarrelix; deslorelina; trilostano; dexametasona; flutamida; raloxifeno; fadrozol; toremifeno; fulvestranto; letrozol; formestano; glucocorticói- des; doxercalciferol; carbonato de sevelâmero; lasofoxifeno; acetato de leuprolida; megesterol; mifepristona; nilutamida; citrato de tamoxifeno; abarelix; prednisona; finasterida; rilostano; buserelina; hormônio de liberação de hormônio luteinizante (LHRH); Histrelina; trilostano ou modrastano; fosrelina; goserelina.[00637] In some embodiments, the antichemokine receptor or anti-CCR8 ADC drug portion is a hormonal therapeutic product, such as anastrozole; exemestane; arzoxifene; bicalutamide; cetrorelix; degarelix; deslorelin; trilostane; dexamethasone; flutamide; raloxifene; fadrozole; toremifene; fulvestrant; letrozole; formestane; glucocorticoids; doxercalciferol; sevelamer carbonate; lasofoxifene; leuprolide acetate; megesterol; mifepristone; nilutamide; tamoxifen citrate; abarelix; prednisone; finasteride; rilostane; buserelin; luteinizing hormone-releasing hormone (LHRH); histrelin; trilostane or modrastan; fosrelin; goserelin.
[00638] Qualquer um desses agentes que incluem, ou que podem ser modificados para incluir, um sítio de ligação a um anticorpo e/ou fragmento de ligação pode ser incluído em um ADC receptor antiqui- miocina, por exemplo, em um ADC anti-CCR8.[00638] Any of these agents that include, or can be modified to include, an antibody binding site and/or binding fragment can be included in an anti-chemokine receptor ADC, for example, in an anti-CCR8 ADC.
[00639] De acordo com algumas terceiras modalidades do 19° aspecto, o conjugado é um conjugado de células T CAR projetado para o receptor de quimiocina ou direcionamento de CCR8. Recentemente, as células T CAR ganharam atenção por seus sucessos clínicos e agilizaram as aprovações da FDA, conforme o WO2020102240, incorporado aqui em sua totalidade. Na abordagem de células T CAR, as células T são coletadas do sangue do paciente e, em seguida, são geneticamente modificadas para expressar CARs específicos para um antígeno presente nas células tumorais. Essas células T modificadas são então readministradas ao mesmo paciente. Após a injeção, as células T CAR reconhecem o antígeno alvo nas células alvo para induzir a morte da célula alvo. As células T que expressam receptores de an- tígenos quiméricos (células T CAR) constituem assim uma nova modalidade para usos médicos, tal como tratamento de tumores. O receptor de antígeno quimérico (CAR) é um receptor geneticamente modificado que é projetado para direcionar um antígeno específico, por exemplo, um antígeno tumoral. Esse direcionamento pode resultar em citotoxici- dade contra o tumor, por exemplo, de modo que as células T CAR que expressam CARs possam direcionar e matar tumores por meio dos antígenos tumorais específicos.[00639] According to some third modalities of the 19th aspect, the conjugate is a CAR T cell conjugate designed for chemokine receptor or CCR8 targeting. Recently, CAR T cells have gained attention for their clinical successes and expedited FDA approvals, as per WO2020102240, incorporated herein in its entirety. In the CAR T cell approach, T cells are collected from the patient's blood and then genetically modified to express CARs specific for an antigen present on tumor cells. These modified T cells are then readministered to the same patient. After injection, the CAR T cells recognize the target antigen on the target cells to induce target cell death. T cells expressing chimeric antigen receptors (CAR T cells) thus constitute a novel modality for medical uses, such as tumor treatment. A chimeric antigen receptor (CAR) is a genetically modified receptor that is designed to target a specific antigen, for example, a tumor antigen. This targeting can result in cytotoxicity against the tumor, for example, so that CAR T cells expressing CARs can target and kill tumors through specific tumor antigens.
[00640] De acordo com a presente invenção, os anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno fornecidos para CCR8 ou reconhecimento de receptor de quimiocina podem ser usados para manipular células T CAR para reconhecimento específico de células que expres-sam CCR8 ou células que expressam o respectivo receptor de quimio- cina. CARs de acordo com a presente invenção podem compreender a) uma região de reconhecimento, por exemplo, uma região variável de fragmento de cadeia simples (scFv) derivada de um anticorpo anti-CCR8 ou receptor antiquimiocina fornecido para reconhecimento e ligação ao CCR8 ou receptor de quimiocina expresso pela célula alvo, e b) um domínio de sinalização de ativação, por exemplo, a cadeia CD3 de células T, que pode servir como um sinal de ativação de células T em CARs.[00640] According to the present invention, antibodies or antigen-binding fragments provided for CCR8 or chemokine receptor recognition can be used to manipulate CAR T cells for specific recognition of cells expressing CCR8 or cells expressing the respective chemokine receptor. CARs according to the present invention may comprise a) a recognition region, for example, a single-strand fragment variable (scFv) region derived from an anti-CCR8 antibody or anti-chemokine receptor provided for recognition and binding to the CCR8 or chemokine receptor expressed by the target cell, and b) an activation signaling domain, for example, the CD3 chain of T cells, which can serve as an activation signal for T cells in CARs.
[00641] Preferivelmente, os CARs de acordo com a presente invenção compreendem um domínio de coestimulação (por exemplo, CD137, CD28 ou CD134) para obter ativação prolongada de células T in vivo. A adição de um domínio de coestimulação aumenta a prolife-ração in vivo e a sobrevivência de células T contendo CARs, e dados clínicos iniciais mostraram que tais construtos são agentes terapêuticos promissores no tratamento de doenças, como câncer. De acordo com a presente invenção, as células T CAR podem ser usadas para tratar qualquer doença com presença aberrante local ou sistêmica de células que expressam o receptor de quimiocina alvo, em particular células que expressam CCR8, tal como células Treg.[00641] Preferably, the CARs according to the present invention comprise a co-stimulatory domain (e.g., CD137, CD28, or CD134) to achieve prolonged T cell activation in vivo. The addition of a co-stimulatory domain increases the in vivo proliferation and survival of CAR-containing T cells, and initial clinical data have shown that such constructs are promising therapeutic agents in the treatment of diseases such as cancer. According to the present invention, CAR T cells can be used to treat any disease with aberrant local or systemic presence of cells expressing the target chemokine receptor, in particular cells expressing CCR8, such as Treg cells.
[00642] De acordo com algumas quartas modalidades do 19° aspecto, o conjugado é um anticorpo biespecífico ou um anticorpo multi- específico. Em algumas modalidades preferidas, o anticorpo biespecí- fico compreende pelo menos um domínio Fc.[00642] According to some fourth embodiments of the 19th aspect, the conjugate is a bispecific antibody or a multispecific antibody. In some preferred embodiments, the bispecific antibody comprises at least one Fc domain.
[00643] Em algumas modalidades preferidas do 19° aspecto, a primeira porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto.[00643] In some preferred embodiments of the 19th aspect, the first binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment according to the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th, 14th, 15th, 16th, 17th and/or 18th aspect.
[00644] Em algumas modalidades A das quartas modalidades do 19° aspecto, a primeira porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12° °, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto e a segunda porção de ligação do anticorpo biespecífico é o mesmo ou um anticorpo diferente ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto.[00644] In some embodiments of the fourth embodiments of the 19th aspect, the first binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment according to the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th, 14th, 15th, 16th, 17th and/or 18th aspect and the second binding portion of the bispecific antibody is the same or a different antibody or antigen-binding fragment according to the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th, 14th, 15th, 16th, 17th and/or 18th aspect.
[00645] Em algumas modalidades B das quartas modalidades do 19° aspecto, a primeira porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12° °, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto que se liga ao CCR8 humano e a segunda porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno que se liga a um receptor de quimiocina diferente, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1. Por exemplo, a segunda porção de ligação do anticorpo bies- pecífico é Mogamulizumab ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.[00645] In some embodiments of the fourth embodiments of the 19th aspect, the first binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18 that binds to human CCR8 and the second binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment that binds to a different chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1. For example, the second binding portion of the bispecific antibody is Mogamulizumab or an antigen-binding fragment of the same.
[00646] Em algumas modalidades C das quartas modalidades do 19° aspecto, a primeira porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12° °, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, preferivelmente que se liga ao CCR8, e a segunda porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno que se liga a uma proteína de superfície celular tal como proteína de superfície celular expressa em células imunes ou um antígeno específico de tecido ou tipo de célula. Em algumas dessas modalidades, a segunda porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno que tem como alvo a uma proteína de ponto de verificação, tal como um anticorpo anti-PD1, um anticorpo anti-PD-L1 ou um anticorpo CTLA-4. Os anticorpos que têm como alvo à proteína do ponto de verificação adequados incluem Nivo- lumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemi- plimab, Dostarlimab ou Ipilimumab. Em algumas outras dessas moda-lidades, a segunda porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo direcionado a HER2, tal como Trastuzumab, Pertuzumab e/ou Margetuximab.[00646] In some embodiments of the fourth embodiments of aspect 19, the first binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, preferably binding to CCR8, and the second binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment that binds to a cell surface protein such as a cell surface protein expressed on immune cells or a tissue- or cell-type-specific antigen. In some of these embodiments, the second binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment that targets a checkpoint protein, such as an anti-PD1 antibody, an anti-PD-L1 antibody or a CTLA-4 antibody. Antibodies that target the appropriate checkpoint protein include Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab, or Ipilimumab. In some other of these modalities, the second binding portion of the bispecific antibody is an antibody directed against HER2, such as Trastuzumab, Pertuzumab, and/or Margetuximab.
[00647] Em algumas modalidades D das quartas modalidades do 19° aspecto, a primeira porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12° °, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, que se liga preferivelmente ao CCR8, e a segunda porção de ligação do anticorpo biespecífico é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno que se liga a uma molécula de superfície celular associada com ativação de células T, preferivelmente selecionadas de CD25, CTLA-4, PD-1, LAG3, TIGIT, ICOS e membros da superfamília de receptores de TNF, 4-1BB, OX-40 e GITR.[00647] In some embodiments of the fourth embodiments of the 19th aspect, the first binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment according to the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th, 14th, 15th, 16th, 17th and/or 18th aspect, which preferably binds to CCR8, and the second binding portion of the bispecific antibody is an antibody or antigen-binding fragment that binds to a cell surface molecule associated with T cell activation, preferably selected from CD25, CTLA-4, PD-1, LAG3, TIGIT, ICOS and members of the TNF receptor superfamily, 4-1BB, OX-40 and GITR.
[00648] As técnicas para preparar anticorpos bi ou multiespecíficos incluem, mas não estão limitadas a, coexpressão recombinante de dois pares de cadeia pesada-cadeia leve de imunoglobulina com diferentes especificidades (veja Milstein and Cuello. "Hybrid hybridomas and their use in immunohistochemistry." Nature 305.5934 (1983): 537540.; WO1993008829 A1, e Traunecker, André, Antonio Lanzavec- chia, e Klaus Karjalainen. "Bispecific single chain molecules (Janusins) target cytotoxic lymphocytes on HIV infected cells." The EMBO Journal 10.12 (1991): 3655-3659.), e conjugação química de dois anticorpos monoclonais diferentes (veja Staerz, Uwe D., Osami Kanagawa, and Michael J. Bevan. "Hybrid antibodies can target sites for attack by T cells." Nature 314.6012 (1985): 628-631.). Anticorpos multiespecíficos também podem ser feitos por reticulação de dois ou mais anticorpos ou fragmentos (veja, por exemplo, Patente dos Estados Unidos No. 4.676.980 e Brennan, Maureen, Peter F. Davison, and Henry Paulus. "Preparation of bispecific antibodies by chemical recombination of monoclonal immunoglobulin G1 fragments." Science 229.4708 (1985): 81-83.), usando zíperes de leucina para produzir anticorpos bi- específicos (veja, por exemplo, Kostelny, Sheri A., M. S. Cole, and J. Yun Tso. "Formation of a bispecific antibody by the use of leucine zippers." The Journal of Immunology 148.5 (1992): 1547-1553.), usando a tecnologia de diacorpo para preparar fragmentos de anticorpos bies- pecíficos (veja, por exemplo, Holliger, Philipp, Terence Prospero, and Greg Winter. ""Diabodies": small bivalent and bispecific antibody fragments." Proceedings of the National Academy of Sciences 90.14 (1993): 6444-6448.), usando dímeros de Fv de cadeia simples (sFv) (veja, por exemplo, Gruber, Meegan, et al. "Efficient tumor cell lysis mediated by a bispecific single chain antibody expressed in Escherichia coli." The Journal of immunology 152.11 (1994): 5368-5374.), preparando anticorpos triespecíficos como descrito (por exemplo, em Tutt, Alison, GT Stevenson, and M. J. Glennie. "Trispecific F (ab') 3 derivatives that use cooperative signaling via the TCR/CD3 complex e CD2 to activate and redirect resting cytotoxic T cells." The Journal of Immu-nology 147.1 (1991): 60-69.), e por permuta de ramificação Fab controlada (cFAE) de acordo com Labrijn, Aran F., et al. "Efficient generation of stable bispecific IgG1 by controlled Fab-arm exchange." Proceedings of the National Academy of Sciences 110.13 (2013): 5145-5150.[00648] Techniques for preparing bispecific or multispecific antibodies include, but are not limited to, recombinant co-expression of two immunoglobulin heavy-chain-light chain pairs with different specificities (see Milstein and Cuello. "Hybrid hybridomas and their use in immunohistochemistry." Nature 305.5934 (1983): 537-540; WO1993008829 A1, and Traunecker, André, Antonio Lanzavecchia, and Klaus Karjalainen. "Bispecific single chain molecules (Janusins) target cytotoxic lymphocytes on HIV-infected cells." The EMBO Journal 10.12 (1991): 3655-3659), and chemical conjugation of two different monoclonal antibodies (see Staerz, Uwe D., Osami Kanagawa, and Michael J. Bevan. "Hybrid antibodies can target sites for attack by T cells." Nature 314.6012 (1985): 628-631.). Multispecific antibodies can also be made by crosslinking two or more antibodies or fragments (see, for example, U.S. Patent No. 4,676,980 and Brennan, Maureen, Peter F. Davison, and Henry Paulus. "Preparation of bispecific antibodies by chemical recombination of monoclonal immunoglobulin G1 fragments." Science 229,4708 (1985): 81-83.), using leucine zippers to produce bispecific antibodies (see, for example, Kostelny, Sheri A., M. S. Cole, and J. Yun Tso. "Formation of a bispecific antibody by the use of leucine zippers." The Journal of Immunology 148.5 (1992): 1547-1553.), using diacorporeal technology to prepare bispecific antibody fragments (see, for example, Holliger, Philipp, Terence Prospero, and Greg Winter). "Diabodies: small bivalent and bispecific antibody fragments." Proceedings of the National Academy of Sciences 90.14 (1993): 6444-6448.), using single-chain Fv dimers (sFv) (see, for example, Gruber, Meegan, et al. "Efficient tumor cell lysis mediated by a bispecific single-chain antibody expressed in Escherichia coli." The Journal of Immunology 152.11 (1994): 5368-5374.), preparing trispecific antibodies as described (for example, in Tutt, Alison, GT Stevenson, and M. J. Glennie. "Trispecific F(ab')3 derivatives that use cooperative signaling via the TCR/CD3 complex and CD2 to activate and redirect resting cytotoxic T cells." The Journal of Immunology 147.1 (1991): 60-69.), and by switching controlled Fab branching (cFAE) according to Labrijn, Aran F., et al. "Efficient generation of stable bispecific IgG1 by controlled Fab-arm exchange." Proceedings of the National Academy of Sciences 110.13 (2013): 5145-5150.
[00649] De acordo com algumas quintas modalidades do 19° aspecto, o conjugado compreende uma porção detectável. Exemplos de porções detectáveis incluem várias enzimas, grupos prostéticos, materiais fluorescentes, materiais luminescentes, materiais bioluminescen- tes, materiais radioativos, metais emissores de pósitrons, íons metálicos paramagnéticos não radioativos e porções reativas. A substância detectável pode ser acoplada ou conjugada diretamente ao anticorpo ou fragmento do mesmo ou indiretamente, por exemplo, através de um ligante conhecido na técnica ou outra porção, usando técnicas conhecidas na técnica. Exemplos de marcadores enzimáticos incluem lucife rases (por exemplo, luciferase do vagalume e luciferase bacteriana; Patente dos Estados Unidos 4.737.456), luciferina, 2,3-di- hidroftalazinodionas, malato desidrogenase, urease, peroxidase, tal como peroxidase de rábano (HRPO), fosfatase alcalina, β- galactosidase, acetilcolinesterase, glicoamilase, lisozima, sacarídeo oxidases (por exemplo, glicose oxidase, galactose oxidase e glicose-6- fosfato desidrogenase), oxidases heterocíclicas (tais como uricase e xantina oxidase), lactoperoxidase, microperoxidase e semelhantes.[00649] According to some fifth embodiments of the 19th aspect, the conjugate comprises a detectable portion. Examples of detectable portions include various enzymes, prosthetic groups, fluorescent materials, luminescent materials, bioluminescent materials, radioactive materials, positron-emitting metals, non-radioactive paramagnetic metal ions, and reactive portions. The detectable substance may be coupled or conjugated directly to the antibody or a fragment thereof or indirectly, for example, through a ligand known in the art or another portion, using techniques known in the art. Examples of enzyme markers include luciferases (e.g., firefly luciferase and bacterial luciferase; U.S. Patent 4,737,456), luciferin, 2,3-dihydrophthalazinediones, malate dehydrogenase, urease, peroxidase, such as horseradish peroxidase (HRPO), alkaline phosphatase, β-galactosidase, acetylcholinesterase, glucoamylase, lysozyme, saccharide oxidases (e.g., glucose oxidase, galactose oxidase, and glucose-6-phosphate dehydrogenase), heterocyclic oxidases (such as uricase and xanthine oxidase), lactoperoxidase, microperoxidase, and the like.
[00650] Exemplos de complexos de grupos prostéticos adequados incluem estreptavidina/biotina e avidina/biotina; exemplos de materiais fluorescentes adequados incluem umbeliferona, fluoresceína, isotioci- anato de fluoresceína, rodamina, diclorotriazinilamina fluoresceína, cloreto de dansilo ou ficoeritrina; um exemplo de um material luminescen- te inclui luminol; exemplos de materiais bioluminescentes incluem luciferase, luciferina e aequorina; e exemplos de material radioativo adequado incluem 125I, 131I, 111In ou 99mTc.[00650] Examples of suitable prosthetic group complexes include streptavidin/biotin and avidin/biotin; examples of suitable fluorescent materials include umbelliferone, fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine, fluorescein dichlorotriazinylamine, dansyl chloride or phycoerythrin; an example of a luminescent material includes luminol; examples of bioluminescent materials include luciferase, luciferin and aequorin; and examples of suitable radioactive material include 125I, 131I, 111In or 99mTc.
[00651] A detecção da expressão de um receptor de quimiocina ou CCR8 geralmente envolve o contato de uma amostra biológica (tumor, células, tecido ou fluido corporal de um indivíduo) com um ou mais anticorpos ou fragmentos de acordo com a presente invenção (opcionalmente conjugado a uma porção detectável), e detectar se a amostra é ou não positiva para o receptor de quimiocina ou CCR8, ou se a amostra tem expressão alterada (por exemplo, reduzida ou aumentada) em comparação com uma amostra de controle.[00651] The detection of the expression of a chemokine receptor or CCR8 generally involves contacting a biological sample (tumor, cells, tissue or body fluid from an individual) with one or more antibodies or fragments according to the present invention (optionally conjugated to a detectable portion), and detecting whether the sample is positive or not for the chemokine receptor or CCR8, or whether the sample has altered expression (e.g., reduced or increased) compared to a control sample.
[00652] De acordo com um 20° aspecto, é fornecida uma composição farmacêutica compreendendo um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto. Preferivelmente, a composição farmacêutica compreende um anticorpo ou fragmento do mesmo ou um conjugado de acordo com qualquer uma das modalidades descritas aqui, ou uma combinação dos mesmos, em uma quantidade terapeuticamente eficaz em conjunto com um carreador, excipiente ou estabilizador farmaceutica- mente aceitável.[00652] According to a 20th aspect, a pharmaceutical composition is provided comprising an antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19. Preferably, the pharmaceutical composition comprises an antibody or fragment thereof or a conjugate according to any of the embodiments described herein, or a combination thereof, in a therapeutically effective amount together with a pharmaceutically acceptable carrier, excipient or stabilizer.
[00653] As composições farmacêuticas podem ser preparadas misturando o anticorpo, fragmento ou conjugado com o grau desejado de pureza com veículos, excipientes ou estabilizadores fisiologicamente aceitáveis opcionais (Remington, Joseph Price. Remington: The science and practice of Pharmacy. Vol. 1. Lippincott Williams & Wilkins, 2006.). As composições farmacêuticas podem estar, por exemplo, na forma de formulações liofilizadas ou soluções aquosas.[00653] Pharmaceutical compositions can be prepared by mixing the antibody, fragment, or conjugate with the desired degree of purity with optional physiologically acceptable vehicles, excipients, or stabilizers (Remington, Joseph Price. Remington: The science and practice of Pharmacy. Vol. 1. Lippincott Williams & Wilkins, 2006.). Pharmaceutical compositions may be, for example, in the form of lyophilized formulations or aqueous solutions.
[00654] Os veículos, excipientes ou estabilizadores aceitáveis não são tóxicos para os receptores nas dosagens e concentrações usadas e incluem tampões, tais como tampão fosfato (por exemplo, PBS), tampão citrato e outro tampão de ácido orgânico; antioxidantes incluindo ácido ascórbico e metionina; conservantes (tais como cloreto de octadecildimetilbenzil amônio; cloreto de hexametônio; cloreto de ben- zalcônio, cloreto de benzetônio; fenol, álcool butílico ou benzílico; al- quil parabenos, tais como metil ou propil parabeno; catecol; resorcinol; ciclo-hexanol; 3-pentanol; e m-cresol); polipeptídeo de baixo peso molecular (por exemplo, menos de cerca de 10 resíduos); proteínas, tais como albumina sérica, gelatina ou imunoglobulinas; polímeros hidrófilos tais como polivinilpirrolidona; aminoácidos tais como glicina, gluta- mina, asparagina, histidina, arginina ou lisina; monossacarídeos, dis- sacarídeos e outros carboidratos incluindo glicose, manose ou dextrinas; agentes quelantes tais como EDTA; açúcares como sacarose, manitol, trealose ou sorbitol; contra-iões formadores de sal tais como sódio; complexos metálicos (por exemplo, complexos Zn-proteína); e/ou tensoativos não iônicos como Tween®, Pluronic® ou polietileno- glicol (PEG).[00654] Acceptable vehicles, excipients or stabilizers are not toxic to receptors at the dosages and concentrations used and include buffers such as phosphate buffer (e.g., PBS), citrate buffer and other organic acid buffers; antioxidants including ascorbic acid and methionine; preservatives (such as octadecyldimethylbenzyl ammonium chloride; hexamethonium chloride; benzalkonium chloride, benzethonium chloride; phenol, butyl or benzyl alcohol; alkyl parabens such as methyl or propyl paraben; catechol; resorcinol; cyclohexanol; 3-pentanol; and m-cresol); low molecular weight polypeptide (e.g., less than about 10 residues); proteins such as serum albumin, gelatin or immunoglobulins; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; amino acids such as glycine, glutamine, asparagine, histidine, arginine or lysine; monosaccharides, disaccharides and other carbohydrates including glucose, mannose or dextrins; chelating agents such as EDTA; sugars such as sucrose, mannitol, trehalose or sorbitol; salt-forming counter-ions such as sodium; metal complexes (e.g., Zn-protein complexes); and/or nonionic surfactants such as Tween®, Pluronic® or polyethylene glycol (PEG).
[00655] De acordo com a presente invenção, uma composição farmacêutica pode conter mais de um composto ativo, por exemplo, conforme necessário ou benéfico para a indicação particular a ser tratada.[00655] According to the present invention, a pharmaceutical composition may contain more than one active compound, for example, as needed or beneficial for the particular indication to be treated.
[00656] De acordo com algumas primeiras modalidades do 20° aspecto, a composição farmacêutica compreende um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos.[00656] According to some early embodiments of the 20th aspect, the pharmaceutical composition comprises one or more other therapeutically active compounds.
[00657] Em algumas das primeiras modalidades preferidas do 20° aspecto, a composição farmacêutica compreende um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ea) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação, tal como PD1, PD-L1 ou CTLA-4, e/oub) um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1, e/ouc) um anticorpo que tem como alvo a uma proteína que é expressa especificamente por células tumorais e/oud) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR, e/oue) o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata e/ouf) um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxano, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina, paclitaxel ou gencitabina e/oug) um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1.[00657] In some of the first preferred embodiments of aspect 20, the pharmaceutical composition comprises an antibody or antigen-binding fragment according to aspect 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or aspect 18, or a conjugate according to aspect 19 and a) an antibody or small molecule targeting a checkpoint protein, such as PD1, PD-L1 or CTLA-4, and/or b) an antibody targeting another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1, and/or c) an antibody that targets a protein that is specifically expressed by tumor cells and/or d) an antibody or small molecule that targets HER2 and/or EGFR, and/or e) the standard of care for any head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer and/or f) a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin, paclitaxel or gemcitabine and/or g) a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1.
[00658] De acordo com algumas modalidades preferidas A das primeiras modalidades do 20° aspecto, a composição farmacêutica compreende também um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação, tal como PD1, PD-L1 ou CTLA-4. Anticorpos de direcionamento de ponto de verificação adequados incluem Nivolumab (PD1; IgG4 humana), Pembrolizumab (PD1; IgG4 humanizado), Atezolizumab (PD-L1; IgG1 humanizado), Avelumab (PD-L1; IgG1 humano), Durvalumab (PD-L1; IgG1 humano), Cemiplimab, cemiplimab-rwlc (PD-1; mAb humano), Dostarlimab (TSR- 042) (PD-1; IgG4 humanizado) ou Ipilimumab (CTLA-4; IgG1 humano).[00658] According to some preferred embodiments of the first embodiments of the 20th aspect, the pharmaceutical composition also comprises an antibody or a small molecule that targets a checkpoint protein, such as PD1, PD-L1 or CTLA-4. Suitable checkpoint targeting antibodies include Nivolumab (PD1; human IgG4), Pembrolizumab (PD1; humanized IgG4), Atezolizumab (PD-L1; humanized IgG1), Avelumab (PD-L1; human IgG1), Durvalumab (PD-L1; human IgG1), Cemiplimab, cemiplimab-rwlc (PD-1; human mAb), Dostarlimab (TSR-042) (PD-1; humanized IgG4) or Ipilimumab (CTLA-4; human IgG1).
[00659] Em algumas modalidades, o anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação tem como alvo CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, TIM3, GAL9, LAG3, VISTA, KIR, 2B4, CD160, CGEN-15049, CHK 1, CHK2, A2aR, ligantes da família B-7 ou uma combinação destes.[00659] In some embodiments, the antibody or small molecule that targets a checkpoint protein targets CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, TIM3, GAL9, LAG3, VISTA, KIR, 2B4, CD160, CGEN-15049, CHK 1, CHK2, A2aR, B-7 family ligands, or a combination thereof.
[00660] De acordo com algumas modalidades preferidas B das primeiras modalidades do 20° aspecto, a composição farmacêutica compreende também um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1. Anticorpos adequados que tem como alvo um outro receptor de quimiocina incluem os anticorpos fornecidos de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou Mogamuli- zumab.[00660] According to some preferred embodiments B of the first embodiments of aspect 20, the pharmaceutical composition also comprises an antibody or a small molecule that targets another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1. Suitable antibodies targeting another chemokine receptor include antibodies provided according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or Mogamulizumab.
[00661] Combinação com anticorpos ou moléculas que têm como alvo à HER2 ou EGFR[00661] Combination with antibodies or molecules that target HER2 or EGFR
[00662] De acordo com algumas modalidades preferidas C das primeiras modalidades do 20° aspecto, a composição farmacêutica compreende também um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR. Anticorpos adequados que têm como alvo a HER2 são Trastuzumab (HER2; IgG1 humanizado), Pertuzu- mab (HER2; IgG1 humanizado), Ado-trastuzumab emtansina (HER2; IgG1 humanizado; ADC), [fam-]trastuzumab deruxtecan, famtrastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; IgG1 ADC humanizado), Saci- tuzumab govitecano; sacituzumab govitecan-hziy (TROP-2; IgG1 ADC humanizado) e/ou Margetuximab (HER2; IgG1 quimérica). Anticorpos adequados que têm como alvo EGFR são Cetuximab (EGFR; IgG1 quimérica), Panitumumab (EGFR; IgG2 humana) e Necitumumab (EGFR; IgG1 humana).[00662] According to some preferred embodiments C of the first embodiments of the 20th aspect, the pharmaceutical composition also comprises an antibody or a small molecule that targets HER2 and/or EGFR. Suitable antibodies targeting HER2 are Trastuzumab (HER2; humanized IgG1), Pertuzumab (HER2; humanized IgG1), Ado-trastuzumab emtansine (HER2; humanized IgG1; ADC), [fam-]trastuzumab deruxtecan, famtrastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; humanized IgG1 ADC), Sacituzumab govitecan; sacituzumab govitecan-hziy (TROP-2; humanized IgG1 ADC) and/or Margetuximab (HER2; chimeric IgG1). Suitable antibodies that target EGFR are Cetuximab (EGFR; chimeric IgG1), Panitumumab (EGFR; human IgG2), and Necitumumab (EGFR; human IgG1).
[00663] De acordo com algumas modalidades D das primeiras modalidades do 20° aspecto, a composição farmacêutica compreende um outro anticorpo terapêutico selecionado de Muromonab-CD3 (CD3; Murine IgG2a), Efalizumab (CD11a; IgG1 Humanizada), Tositu- momab-I131 (CD20; IgG2a de Murino), Nebacumab (Endotoxina; IgM Humana), Edrecolomab (EpCAM; IgG2a de murino), Catumaxomab (EPCAM/CD3; mAb biespecífico de rato/camundongo), Daclizumab (IL-2R; IgG1 humanizado), Abciximab (GPIIb/IIIa; IgG1 quimérica Fab), Rituximabe (CD20; IgG1 Quimérica), Basiliximabe (IL-2R; IgG1 Quimérica), Palivizumabe (RSV; IgG1 Humanizada), Infliximabe (TNF; IgG1 Quimérica), Trastuzumabe (HER2; IgG1 Humanizada), Adalimumabe (TNF; IgG1 Humana), Ibritumomab tiuxetan (CD20; IgG1 de Murino), Omalizumab (IgE; IgG1 Humanizada), Cetuximab (EGFR; Quimérica IgG1), Bevacizumab (VEGF; IgG1 Humanizada), Natalizumab (a4 in- tegrina; IgG4 Humanizada), Panitumumab (EGFR; IgG2 Humanizada), Ranibizumab (VEGF; Fab IgG1 humanizada), Eculizumab (C5; IgG2/4 humanizada), Certolizumab pegol (TNF; Fab Humanizado, peguilado), Ustequinumab (IL-12/23; IgG1 humana), Canaquinumab (IL-1β; IgG1 humana), Golimumab (TNF; IgG1 humana), Ofatumumab (CD20; IgG1 humana), Tocilizumab (IL-6R; IgG1 humanizada), Denosumab (RANK- L; IgG2 humana), Belimumab (BLyS; IgG1 humana), Ipilimumab (CTLA-4; IgG1 humana), Brentuximab vedotina (CD30; IgG1 quimérica; ADC), Pertuzumab (HER2; IgG1 humanizada), Ado-trastuzumab emtansina (HER2; IgG1 humanizada; ADC), Raxibacumab (B. anthra- sis PA; IgG1 humano), Obinutuzumab (CD20; IgG1 humanizada Glycoengineered), Siltuximab (IL-6; IgG1 quimérica), Ramucirumab (VEGFR2; IgG1 humana), Vedolizumab (α4β7 integrina; IgG1 humanizada), Nivolumab (PD1; IgG4 humana), Pembrolizumab (PD1; IgG4 humanizada), Blinatumomab (CD19, CD3; scFv em tandem biespecífi- co murino), Alemtuzumab (CD52; IgG1 humanizada), Evolocumab (PCSK9; IgG2 humano), Idarucizumab (Dabigatrano; Fab humanizado), Necitumumab (EGFR; IgG1 Humana), Dinutuximab (GD2; IgG1 Quimérica), Secukinumab (IL-17a; IgG1 Humana), Mepolizumab (IL-5; IgG1 Humanizada), Alirocumab (PCSK9; IgG1 Humana), Daratumu- mab (C D38; IgG1 humana), Elotuzumab (SLAMF7; IgG1 humanizado), Ixekizumab (IL-17a; IgG4 humanizada), Reslizumab (IL-5; IgG4 humanizada), Olaratumab (PDGFRα; IgG1 humana), Bezlotoxumab (enterotoxina B de Clostridium difficile; IgG1 humana), Atezolizumab (PD-L1; IgG1 humanizada), Obiltoxaximab (B. anthrasis PA; IgG1 quimérico), Brodalumab (IL-17R; IgG2 humana), Dupilumab (IL-4Rα; IgG4 humana), Inotuzumab ozogamicina (CD22; IgG4 humanizada; ADC), Guselkumab (IL-23 p19; IgG1 humana), Sarilumab (IL-6R; IgG1 humana), Avelumab (PD-L1; IgG1 humana), Emicizumab (Fator Ixa, X; IgG4 humanizada, biespecífico), Ocrelizumab (CD20; IgG1 humanizada), Benralizumab (IL-5R α; IgG1 humanizada), Durvalumab (PD-L1; IgG1 humana), Gemtuzumab ozogamicina (CD33; IgG4 humanizada; ADC), Erenumab, erenumab-aooe (receptor CGRP; IgG2 humana), Galca- nezumab, galcanezumab-gnlm (CGRP; IgG4 Humanizada), Burosu- mab, burosumab-twza (FGF23; IgG1 Humana), Lanadelumab, lanade- lumab-flyo (Plasma kallikrelin; IgG1 Humana), Mogamulizumab, mo- gamulizumab-kpkc (CCR4; IgG1 Humanizada), tildraquizumab; tildra- kizumab-asmn (IL-23 p19; IgG1 humanizada), Fremanezumab, frema- nezumab-vfrm (CGRP; IgG2 humanizada), Ravulizumab, ravulizumab- cwvz (C5; IgG2/4 Humanizada), Cemiplimab, cemiplimab-rwlc (PD-1; mAb Humano), Ibalizumab, ibalizumab-uiyk (CD4; IgG4 Humanizada), Emapalumab, empalumab-lzsg (IFNg; IgG1 humana), Moxetumomab pasudotox, moxetumomab pasudotox-tdfk (CD22; imunotoxina de dsFv de IgG1 de murino), Caplacizumab, caplacizumab-yhdp (Fator von Willebrand; Nanocorpo humanizado), Risankizumab, risankizumab-rzaa (IL-23 p19; IgG1 Humanizada), Polatuzumab vedotina, polatuzumab vedotin-piiq (CD79b; ADC de IgG1 Humanizada), Romosozumab, ro- mosozumab-aqqg (Sclerostin; IgG2 Humanizada), Brolucizumab, bro- lucizumab-dbll (VEGF-A; scFv humanizado), Crizanlizumab; crizan- lizumab-tmca (CD62 (também conhecido como P-selectina); Humanized IgG2), Enfortumab vedotina, enfortumab vedotin-ejfv (Nectin-4; ADC de IgG1 Humana), [fam-]trastuzumab deruxtecan, famtrastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; ADC de IgG1 Humana), Tepro- tumumab, teprotumumab-trbw (IGF-1R; IgG1 humana), Eptinezumab, eptinezumab-jjmr (CGRP; IgG1 humanizada), Isatuximab, isatuximab- irfc (CD38; IgG1 quimérica), Sacituzumab govitecan; sacituzumab go- vitecan-hziy (TROP-2; ADC de IgG1 Humana), Inebilizumab (CD19; IgG1 humanizado), Leronlimab (CCR5; IgG4 humanizado), Satralizu- mab (IL-6R; IgG2 humanizada), Narsoplimab (MASP-2, IgG4 humana), Tafasitamab (CD19; IgG1 humanizada), REGNEB3 (vírus Ebola; mistura de 3 IgG1 humana), Naxitamab (GD2; IgG1 humanizada), Opor- tuzumab monatox (EpCAM; imunotoxina scFv humanizada), Belanta- mab mafodotina (antígeno de maturação de células B; ADC de IgG1 Humana), Margetuximab (HER2; IgG1 quimérica), Tanezumab (Fator de crescimento do nervo; IgG2 humanizada), Dostarlimab (TSR-042) (PD-1; IgG4 humanizada), Teplizumab (CD3; IgG1 humanizada), Adu- canumab (beta amiloide; IgG1 humana), Sutimlimab (BIVV009) (C1s; IgG4 humanizada), Evinacumab (Angiopoietina-símile 3; IgG4 Humana).[00663] According to some embodiments D of the first embodiments of the 20th aspect, the pharmaceutical composition comprises another therapeutic antibody selected from Muromonab-CD3 (CD3; Murine IgG2a), Efalizumab (CD11a; Humanized IgG1), Tositumomab-I131 (CD20; Murine IgG2a), Nebacumab (Endotoxin; Human IgM), Edrecolomab (EpCAM; Murine IgG2a), Catumaxomab (EPCAM/CD3; Mouse/mouse bispecific mAb), Daclizumab (IL-2R; Humanized IgG1), Abciximab (GPIIb/IIIa; Chimeric Fab IgG1), Rituximab (CD20; Chimeric IgG1), Basiliximab (IL-2R; Chimeric IgG1), Palivizumab (RSV; Humanized IgG1), Infliximab (TNF; IgG1 Chimeric), Trastuzumab (HER2; Humanized IgG1), Adalimumab (TNF; Human IgG1), Ibritumomab tiuxetan (CD20; Murine IgG1), Omalizumab (IgE; Humanized IgG1), Cetuximab (EGFR; Chimeric IgG1), Bevacizumab (VEGF; Humanized IgG1), Natalizumab (a4 integrin; Humanized IgG4), Panitumumab (EGFR; Humanized IgG2), Ranibizumab (VEGF; humanized IgG1 Fab), Eculizumab (C5; humanized IgG2/4), Certolizumab pegol (TNF; Humanized Fab, pegylated), Ustekinumab (IL-12/23; human IgG1), Canakinumumab (IL-1β; human IgG1), Golimumab (TNF; human IgG1), Ofatumumab (CD20; human IgG1), Tocilizumab (IL-6R; humanized IgG1), Denosumab (RANK- L; human IgG2), Belimumab (BLyS; human IgG1), Ipilimumab (CTLA-4; human IgG1), Brentuximab vedotin (CD30; chimeric IgG1; ADC), Pertuzumab (HER2; humanized IgG1), Ado-trastuzumab emtansine (HER2; humanized IgG1; ADC), Raxibacumab (B. anthrasis PA; human IgG1), Obinutuzumab (CD20; Glycoengineered humanized IgG1), Siltuximab (IL-6; chimeric IgG1), Ramucirumab (VEGFR2; human IgG1), Vedolizumab (α4β7 integrin; humanized IgG1), Nivolumab (PD1; human IgG4), Pembrolizumab (PD1; humanized IgG4), Blinatumomab (CD19, CD3; murine bispecific tandem scFv), Alemtuzumab (CD52; humanized IgG1), Evolocumab (PCSK9; human IgG2), Idarucizumab (Dabigatran; humanized Fab), Necitumumab (EGFR; Human IgG1), Dinutuximab (GD2; Chimeric IgG1), Secukinumab (IL-17a; Human IgG1), Mepolizumab (IL-5; Humanized IgG1), Alirocumab (PCSK9; Human IgG1), Daratumumab (C D38; human IgG1), Elotuzumab (SLAMF7; humanized IgG1), Ixekizumab (IL-17a; humanized IgG4), Reslizumab (IL-5; humanized IgG4), Olaratumab (PDGFRα; human IgG1), Bezlotoxumab (enterotoxin B of Clostridium difficile; human IgG1), Atezolizumab (PD-L1; humanized IgG1), Obiltoxaximab (B. anthrasis PA; chimeric IgG1), Brodalumab (IL-17R; human IgG2), Dupilumab (IL-4Rα; human IgG4), Inotuzumab ozogamicin (CD22; humanized IgG4; ADC), Guselkumab (IL-23 p19; human IgG1), Sarilumab (IL-6R; human IgG1), Avelumab (PD-L1; human IgG1), Emicizumab (Factor Ixa, Erenumab, erenumab-aooe (CGRP receptor; Human IgG2), Galcanezumab, galcanezumab-gnlm (CGRP; Humanized IgG4), Burosumab, burosumab-twza (FGF23; Human IgG1), Lanadelumab, lanadelumab-flyo (Plasma kallikrelin; Human IgG1), Mogamulizumab, mo- gamulizumab-kpkc (CCR4; Humanized IgG1), tildrakizumab; tildra- kizumab-asmn (IL-23 p19; humanized IgG1), Fremanezumab, fremanezumab-vfrm (CGRP; humanized IgG2), Ravulizumab, ravulizumab- cwvz (C5; Humanized IgG2/4), Cemiplimab, cemiplimab-rwlc (PD-1; Human mAb), Ibalizumab, ibalizumab-uiyk (CD4; Humanized IgG4), Emapalumab, empalumab-lzsg (IFNg; human IgG1), Moxetumomab pasudotox, moxetumomab pasudotox-tdfk (CD22; murine IgG1 dsFv immunotoxin), Caplacizumab, caplacizumab-yhdp (von Willebrand Factor; Humanized Nanobody), Risankizumab, risankizumab-rzaa (IL-23 p19; Humanized IgG1), Polatuzumab vedotin, polatuzumab vedotin-piiq (CD79b; Humanized IgG1 ADC), Romosozumab, romosozumab-aqqg (Sclerostin; Humanized IgG2), Brolucizumab, brolucizumab-dbll (VEGF-A; humanized scFv), Crizanlizumab; crizan-lizumab-tmca (CD62 (also known as P-selectin); Humanized IgG2), Enfortumab vedotin, enfortumab vedotin-ejfv (Nectin-4; Human IgG1 ADC), [fam-]trastuzumab deruxtecan, famtrastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; Human IgG1 ADC), Tepro-tumumab, teprotumumab-trbw (IGF-1R; human IgG1), Eptinezumab, eptinezumab-jjmr (CGRP; humanized IgG1), Isatuximab, isatuximab-irfc (CD38; chimeric IgG1), Sacituzumab govitecan; sacituzumab go-vitecan-hziy (TROP-2; Human IgG1 ADC), Inebilizumab (CD19; humanized IgG1), Leronlimab (CCR5; humanized IgG4), Satralizumab (IL-6R; humanized IgG2), Narsoplimab (MASP-2, human IgG4), Tafasitamab (CD19; humanized IgG1), REGNEB3 (Ebola virus; mixture of 3 human IgG1), Naxitamab (GD2; humanized IgG1), Opotuzumab monatox (EpCAM; humanized scFv immunotoxin), Belantamab mafodotin (B cell maturation antigen; Human IgG1 ADC), Margetuximab (HER2; chimeric IgG1), Tanezumab (Nerve growth factor; humanized IgG2), Dostarlimab (TSR-042) (PD-1; humanized IgG4), Teplizumab (CD3; humanized IgG1), Aducanumab (amyloid beta; human IgG1), Sutimlimab (BIVV009) (C1s; humanized IgG4), Evinacumab (Angiopoietin-like 3; Human IgG4).
[00664] De acordo com algumas modalidades E das primeiras modalidades do 20° aspecto, a composição farmacêutica compreende também um agente citostático e/ou citotóxico selecionado de radio- nuclídeos, agentes alquilantes, agentes de reticulação de DNA, agentes intercalante de DNA (por exemplo, agentes de ligação a sulcos, tais como ligantes de sulco menor), moduladores do ciclo celular, reguladores de apoptose, inibidores de quinase, inibidores de síntese de proteínas, inibidores de mitocôndrias, inibidores de exportação nuclear, inibidores de topoisomerase I, inibidores de topoisomerase II, anti- metabólitos de RNA/DNA e agentes antimitóticos, como descrito de acordo com as segundas modalidades do 19° aspecto.[00664] According to some embodiments of the first embodiments of the 20th aspect, the pharmaceutical composition also comprises a cytostatic and/or cytotoxic agent selected from radionuclides, alkylating agents, DNA crosslinking agents, DNA intercalating agents (e.g., groove-binding agents, such as minor groove ligands), cell cycle modulators, apoptosis regulators, kinase inhibitors, protein synthesis inhibitors, mitochondrial inhibitors, nuclear export inhibitors, topoisomerase I inhibitors, topoisomerase II inhibitors, RNA/DNA anti-metabolites and antimitotic agents, as described according to the second embodiments of the 19th aspect.
[00665] Em algumas modalidades preferidas, o agente citotóxico é uma auristatina, um maitansinoide, um inibidor de proteína de fuso de cinesina (KSP), um inibidor de nicotinamida fosforibosiltransferase (NAMPT) ou um derivado de pirrolobenzodiazepina.[00665] In some preferred embodiments, the cytotoxic agent is an auristatin, a maytansinoid, a kinesin spindle protein (KSP) inhibitor, a nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) inhibitor, or a pyrrolobenzodiazepine derivative.
[00666] De acordo com um 21° aspecto, é fornecido o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um con- jugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para uso como medicamento.[00666] According to a 21st aspect, the antibody or antigen-binding fragment is provided according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19, or the pharmaceutical composition according to aspect 20, for use as a medicament.
[00667] Também é fornecido o uso do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para a fabricação de um medicamento, por exemplo, para o tratamento de um tumor ou uma doença envolvendo células que expressam um receptor de quimiocina e em particular CCR8.[00667] The use of the antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19, or the pharmaceutical composition according to aspect 20, for the manufacture of a medicament, for example, for the treatment of a tumor or a disease involving cells expressing a chemokine receptor and in particular CCR8, is also provided.
[00668] Além disso, é fornecido um método de tratamento de uma doença, o método compreendendo administrar uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para um paciente em necessidade.[00668] In addition, a method of treating a disease is provided, the method comprising administering an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment according to the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th, 14th, 15th, 16th, 17th and/or 18th aspect, or a conjugate according to the 19th aspect or the pharmaceutical composition according to the 20th aspect to a patient in need.
[00669] Para aplicações terapêuticas, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno ou o conjugado ou a composição farmacêutica de acordo com a invenção podem ser administrados a um paciente ou indivíduo, por exemplo, a um indivíduo humano ou não humano, em uma forma de dosagem farmaceuticamente aceitável. Por exemplo, a administração pode ocorrer por via intravenosa como um bolus ou por infusão contínua durante um período de tempo, por vias intramuscular, intraperitoneal, intracerebrospinal, subcutânea, intra-articular, intrasi- novial, intratecal, oral, tópica ou inalatória. Os anticorpos, fragmentos, conjugados e composições farmacêuticas de acordo com a presente invenção são particularmente adequados para serem administrados pelas vias intratumoral, peritumoral, intralesional ou perilesional, para exercer efeitos terapêuticos locais e sistêmicos.[00669] For therapeutic applications, the antibody or antigen-binding fragment or conjugate or pharmaceutical composition according to the invention may be administered to a patient or individual, for example, to a human or non-human individual, in a pharmaceutically acceptable dosage form. For example, administration may occur intravenously as a bolus or by continuous infusion over a period of time, via intramuscular, intraperitoneal, intracerebrospinal, subcutaneous, intra-articular, intrasynovial, intrathecal, oral, topical or inhalation routes. The antibodies, fragments, conjugates and pharmaceutical compositions according to the present invention are particularly suitable for administration via intratumoral, peritumoral, intralesional or perilesional routes, to exert local and systemic therapeutic effects.
[00670] As vias de administração possíveis incluem parenteral (por exemplo, intramuscular, intravenosa, intra-arterial, intraperitoneal ou subcutânea), intrapulmonar e intranasal. Além disso, os anticorpos, fragmentos, conjugados e composições farmacêuticas podem ser administrados por infusão de pulso, com, por exemplo, doses decrescentes do anticorpo, fragmento ou conjugado. Preferivelmente, a dosagem é administrada por injeções, mais preferivelmente injeções intravenosas ou subcutâneas, dependendo em parte se a administração é breve ou crônica. A quantidade a ser administrada pode depender de uma variedade de fatores, tais como os sintomas clínicos, peso do paciente ou indivíduo e se outros medicamentos são administrados. O técnico versado reconhecerá que a via de administração variará dependendo do distúrbio ou condição a ser tratada.[00670] Possible routes of administration include parenteral (e.g., intramuscular, intravenous, intra-arterial, intraperitoneal, or subcutaneous), intrapulmonary, and intranasal. In addition, antibodies, fragments, conjugates, and pharmaceutical compositions may be administered by pulse infusion, with, for example, decreasing doses of the antibody, fragment, or conjugate. Preferably, the dosage is administered by injection, most preferably intravenous or subcutaneous injections, depending in part on whether the administration is brief or chronic. The amount to be administered may depend on a variety of factors, such as clinical symptoms, patient or individual weight, and whether other medications are administered. A skilled practitioner will recognize that the route of administration will vary depending on the disorder or condition being treated.
[00671] A frequência de dosagem do anticorpo pode variar de uma vez a cada 3 a 6 meses a uma dosagem semanal, quinzenal (BIW) ou diária. Similarmente, os níveis de dose variam de uma dose fixa de mg baixa (diária, semanal, quinzenal ou mensal, dependendo do anticorpo) até doses de aproximadamente 1 g. A frequência de dosagem depende de uma variedade de fatores, incluindo a concentração e taxa de renovação do alvo, biodistribuição do alvo, meia-vida dos anticorpos, fragmentos ou conjugados e potenciais efeitos farmacodinâmicos que podem aumentar os efeitos biológicos dos anticorpos, fragmentos, conjugados e composições farmacêuticas além de sua presença em níveis farmacologicamente relevantes.[00671] The frequency of antibody dosing can vary from once every 3 to 6 months to weekly, biweekly (BIW), or daily dosing. Similarly, dose levels range from a low fixed mg dose (daily, weekly, biweekly, or monthly, depending on the antibody) to doses of approximately 1 g. Dosing frequency depends on a variety of factors, including target concentration and turnover rate, target biodistribution, antibody half-life, fragments or conjugates, and potential pharmacodynamic effects that may enhance the biological effects of antibodies, fragments, conjugates, and pharmaceutical compositions beyond their presence at pharmacologically relevant levels.
[00672] Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CCR8 é administrado com uma dose de 1 mg/kg, por exemplo, diariamente, semanalmente, q2w, q3w ou q4w. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CCR8 é administrado com uma dose de 1 a 30 mg/kg, preferivelmente 5 a 10 mg/kg, por exemplo, diariamente, semanalmente, q2w, q3w ou q4w. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CCR8 é administrado com uma dose de 4 a 8 mg/kg, preferivelmente 5 a 6 mg/kg, por exemplo, diariamente, semanalmente, q2w, q3w ou q4w.[00672] In some embodiments, the anti-CCR8 antibody is administered at a dose of 1 mg/kg, for example, daily, weekly, every 2 weeks, every 3 weeks or every 4 weeks. In some embodiments, the anti-CCR8 antibody is administered at a dose of 1 to 30 mg/kg, preferably 5 to 10 mg/kg, for example, daily, weekly, every 2 weeks, every 3 weeks or every 4 weeks. In some embodiments, the anti-CCR8 antibody is administered at a dose of 4 to 8 mg/kg, preferably 5 to 6 mg/kg, for example, daily, weekly, every 2 weeks, every 3 weeks or every 4 weeks.
[00673] Para a prevenção ou tratamento da doença, a dosagem apropriada de anticorpo dependerá do tipo de doença a ser tratada, da gravidade e do curso da doença, se o anticorpo é administrado para fins preventivos ou terapêuticos, terapia anterior, histórico clínico do indivíduo. e resposta à variante de anticorpo, e a critério do médico assistente ou profissional veterinário de saúde. O anticorpo é adequadamente administrado ao indivíduo de uma só vez ou ao longo de uma série de tratamentos.[00673] For the prevention or treatment of disease, the appropriate antibody dosage will depend on the type of disease being treated, the severity and course of the disease, whether the antibody is administered for preventive or therapeutic purposes, prior therapy, the individual's clinical history and response to the antibody variant, and at the discretion of the attending physician or veterinary health professional. The antibody is appropriately administered to the individual at one time or over a series of treatments.
[00674] Conforme mostrado no Exemplo 12.4.2, foi surpreendentemente observado que mesmo uma única dose pode ser suficiente para estabelecer uma resposta substancial ao tratamento.[00674] As shown in Example 12.4.2, it was surprisingly observed that even a single dose can be sufficient to establish a substantial response to treatment.
[00675] De acordo com a presente invenção, é fornecido, portanto, um anticorpo anti-CCR8 induzindo ADCC e/ou ADCP para uso no tratamento de um tumor, em que apenas uma dose única do anticorpo anti-CCR8 é administrada a um indivíduo, de modo que não dose adicional do mesmo ou de um anticorpo anti-CCR8 diferente é administrada ao indivíduo. Esse método não é apenas logisticamente superior e particularmente conveniente para os pacientes, mas também evita problemas com a adesão do paciente.[00675] According to the present invention, an anti-CCR8 antibody inducing ADCC and/or ADCP is therefore provided for use in the treatment of a tumor, wherein only a single dose of the anti-CCR8 antibody is administered to an individual, so that no additional dose of the same or a different anti-CCR8 antibody is administered to the individual. This method is not only logistically superior and particularly convenient for patients, but also avoids problems with patient adherence.
[00676] Quando administrada por via intravenosa, a composição farmacêutica compreendendo os anticorpos, fragmentos ou conjugados pode ser administrada por infusão durante um período de cerca de 0,5 a cerca de 5 horas. Em algumas modalidades, a infusão pode ocorrer durante um período de cerca de 0,5 a cerca de 2,5 horas, durante um período de cerca de 0,5 a cerca de 2,0 horas, durante um período de cerca de 0,5 a cerca de 1,5 hora ou durante um período de cerca de 1,5 hora, dependendo dos anticorpos, fragmentos, conjugados e composições farmacêuticas administrados e a quantidade de anticorpo, fragmento ou conjugado administrado.[00676] When administered intravenously, the pharmaceutical composition comprising the antibodies, fragments or conjugates may be administered by infusion over a period of about 0.5 to about 5 hours. In some embodiments, the infusion may occur over a period of about 0.5 to about 2.5 hours, over a period of about 0.5 to about 2.0 hours, over a period of about 0.5 to about 1.5 hours or over a period of about 1.5 hours, depending on the antibodies, fragments, conjugates and pharmaceutical compositions administered and the amount of antibody, fragment or conjugate administered.
[00677] O tratamento com um anticorpo anti-CCR8 de acordo com a presente invenção mostrou eficácias notáveis em vários modelos de tumores singênicos. Em alguns casos, a administração de uma dose eficaz do anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno a um grupo de indivíduos doentes leva aa. uma resposta completa em pelo menos 15%, 20% ou 25% dos indivíduos, e/ou parab. uma taxa de resposta global em pelo menos 40%, 50%, 60% ou 70% dos indivíduos.[00677] Treatment with an anti-CCR8 antibody according to the present invention has shown remarkable efficacy in several syngeneic tumor models. In some cases, administration of an effective dose of the antibody or antigen-binding fragment to a group of diseased individuals leads to aa. a complete response in at least 15%, 20% or 25% of individuals, and/or parab. an overall response rate in at least 40%, 50%, 60% or 70% of individuals.
[00678] De acordo com um 22° aspecto, é fornecido o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16° °, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para uso no tratamento de um tumor ou uma doença caracterizada por células positivas para receptores de quimiocinas, preferivelmente CCR8 células positivas, tais como células T regulatórias positivas para CCR8. O tratamento pode ocorrer como descrito para o aspecto 21.[00678] According to aspect 22, the antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19, or the pharmaceutical composition according to aspect 20, is provided for use in the treatment of a tumor or disease characterized by chemokine receptor-positive cells, preferably CCR8-positive cells, such as CCR8-positive regulatory T cells. Treatment may occur as described for aspect 21.
[00679] Preferivelmente, é fornecido o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para uso no tratamento de um tumor ou uma doença caracterizada pelo envolvimento de células que expressam o receptor de sete transmembranas ou quimiocina alvo receptor.[00679] Preferably, the antibody or antigen-binding fragment according to aspect 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19 or the pharmaceutical composition according to aspect 20 is provided for use in the treatment of a tumor or disease characterized by the involvement of cells expressing the seven-transmembrane receptor or target chemokine receptor.
[00680] Múltiplos modos de ação podem ser previstos para os anticorpos, fragmentos de ligação ao antígeno ou conjugados de acordo com a presente invenção. Um modo de ação é a conjugação de um anticorpo de receptor antiquimiocina inventivo a um fármaco na forma de um conjugado de anticorpo-fármaco (ADC). Outro modo de ação é a capacidade de um anticorpo que tem como alvo um receptor de qui- miocina em induzir ADCC. Um terceiro modo de ação reside na capacidade do anticorpo que tem como alvo o receptor de quimiocina em induzir ADCP.[00680] Multiple modes of action can be predicted for the antibodies, antigen-binding fragments or conjugates according to the present invention. One mode of action is the conjugation of an inventive antichemokine receptor antibody to a drug in the form of an antibody-drug conjugate (ADC). Another mode of action is the ability of an antibody targeting a chemokine receptor to induce ADCC. A third mode of action lies in the ability of the antibody targeting the chemokine receptor to induce ADCP.
[00681] Os anticorpos CCR8 ou fragmentos de ligação ao antígeno específicos, em particular de acordo com o 8°, 11°, 12°, 13° e 14° aspecto, são particularmente adequados para uma abordagem baseada em ADCC/ADCP, por exemplo, porque são caracterizados por uma internalização particularmente baixa ou são anticorpos não internali- zantes, residindo assim na superfície das células alvo expressando CCR8 e causando sua morte eficiente, conforme demonstrado para Tregs humanos ativados in vitro (Exemplos 10.3.3 ss, Exemplos 10.3.4 ss) ou in vivo (Exemplos 12 ss).[00681] CCR8 antibodies or antigen-binding fragments, particularly according to aspects 8, 11, 12, 13 and 14, are particularly suitable for an ADCC/ADCP-based approach, for example, because they are characterized by particularly low internalization or are non-internalizing antibodies, thus residing on the surface of target cells expressing CCR8 and causing their efficient death, as demonstrated for activated human Tregs in vitro (Examples 10.3.3 ff, Examples 10.3.4 ff) or in vivo (Examples 12 ff).
[00682] As células T regulatórias (Tregs) promovem o crescimento do tumor suprimindo a função das células T efetoras, incluindo células T responsivas ao tumor no microambiente tumoral. De fato, as Tregs são um dos principais mecanismos de resistência que dificultam a eficácia dos inibidores de ponto de verificação imunológica (ICIs) em muitas indicações.[00682] Regulatory T cells (Tregs) promote tumor growth by suppressing the function of effector T cells, including tumor-responsive T cells in the tumor microenvironment. In fact, Tregs are one of the main resistance mechanisms that hinder the effectiveness of immune checkpoint inhibitors (ICIs) in many indications.
[00683] O CCR8 é um receptor de superfície da família GPCR de receptores de quimiocinas, que é predominantemente expresso em Tregs imunossupressoras ativadas frequentemente encontradas em tumores. Ao contrário de outras abordagens direcionadas contra essas células T supressoras, o direcionamento do CCR8 oferece a oportunidade de depauperar as Tregs intratumorais sem afetar as Tregs em repouso ou outras células imunes sistemicamente. Desse modo, o direcionamento de CCR8 pode ser superior em termos de eficácia e segurança. Este modo de ação pode, portanto, ser usado em tumores com Tregs intratumorais, mas também pode ser usado em outras doenças caracterizadas por uma presença aberrante de Tregs ativadas, isto é, que expressam CCR8.[00683] CCR8 is a surface receptor of the GPCR family of chemokine receptors, which is predominantly expressed on activated immunosuppressive Tregs frequently found in tumors. Unlike other approaches targeting these suppressor T cells, targeting CCR8 offers the opportunity to deplete intratumoral Tregs without affecting resting Tregs or other immune cells systemically. Thus, targeting CCR8 may be superior in terms of efficacy and safety. This mode of action can therefore be used in tumors with intratumoral Tregs, but it can also be used in other diseases characterized by an aberrant presence of activated Tregs, i.e., those expressing CCR8.
[00684] Em princípio, os anticorpos, fragmentos, conjugados e composições farmacêuticas podem ser usados no tratamento de qualquer câncer envolvendo células que expressam CCR8. Por exemplo, o câncer pode compreender células tumorais que expressam CCR8, tal como linfoma de células B e linfoma de células T. Em alternativa, o câncer pode compreender Tregs intratumorais expressando CCR8. Conforme mostrado no Exemplo 11, CCR8 é regulado positivamente em várias indicações de tumor, tal como leucemia linfoblástica aguda de células T, câncer de mama, câncer de mama triplo negativo, câncer de mama triplo positivo, câncer de pulmão de não pequenas células (NSCLC), câncer de pulmão de células pequenas (SCLC), câncer testicular, câncer gástrico, carcinoma de células escamosas de cabeça e pescoço, timoma, adenocarcinoma esofágico, câncer colorretal, adenocarcinoma pancreático, câncer de ovário ou câncer cervical, leucemia mieloide aguda, câncer de rim, câncer de bexiga, câncer de pele, melanoma, câncer de tireoide, mesotelioma, sarcoma e câncer de próstata. De acordo com algumas modalidades preferidas, o uso como medicamento é o uso no tratamento de câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor de esôfago, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata.[00684] In principle, antibodies, fragments, conjugates and pharmaceutical compositions can be used in the treatment of any cancer involving cells expressing CCR8. For example, the cancer may comprise tumor cells expressing CCR8, such as B-cell lymphoma and T-cell lymphoma. Alternatively, the cancer may comprise intratumoral Tregs expressing CCR8. As shown in Example 11, CCR8 is upregulated in several tumor indications, such as T-cell acute lymphoblastic leukemia, breast cancer, triple-negative breast cancer, triple-positive breast cancer, non-small cell lung cancer (NSCLC), small cell lung cancer (SCLC), testicular cancer, gastric cancer, squamous cell carcinoma of the head and neck, thymoma, esophageal adenocarcinoma, colorectal cancer, pancreatic adenocarcinoma, ovarian or cervical cancer, acute myeloid leukemia, kidney cancer, bladder cancer, skin cancer, melanoma, thyroid cancer, mesothelioma, sarcoma, and prostate cancer. According to some preferred embodiments, its use as a medicine is in the treatment of head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer, and/or prostate cancer.
[00685] De acordo com algumas primeiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, o tumor é selecionado de câncer adrenal (por exemplo, carcinoma adrenocortical ou feocromocitoma), câncer de bexiga (por exemplo, carcinoma de células de transição, carcinoma de células de transição-papilar), câncer cerebral (por exemplo, glioma- astrocitoma, glioma-Astrocitoma-Glioblastoma, Glioma-Oligoastrocitoma, Glioma-Oligodendroglioma), Câncer de mama (por exemplo, ADC, ADC-Ductal, ADC-Ductal-TNBC, ADC-Ductal-TPBC, ADC-Lobular), câncer colorretal (por exemplo, ADC), câncer de esôfago (por exemplo, ADC), câncer de esôfago (por exemplo, SCC), câncer gástrico (por exemplo, ADC, ADC-difuso, ADC-Intestinal, ADC- Intestinal-Tubular), câncer de cabeça e pescoço (por exemplo, câncer de laringe-SCC, SCC, câncer oral-SCC), câncer de rim (por exemplo, ccRCC, cromófobo, papilar, papilar tipo I, papilar tipo II), câncer de fígado (por exemplo, HCC), câncer de pulmão (por exemplo, NSCLC- ADC, NSCLC-ADC-Misto, NSCLC-SCC, SCLC), Mesotelioma (por exemplo, Epitelioide), Câncer de ovário (por exemplo, ADC- Cistadenocarcinoma-Papilar seroso), Câncer de pâncreas (por exem-plo, ADC-Ductal), Câncer de próstata (por exemplo, ADC-tipo Acinar), Sarcoma (por exemplo, Leiomiossarcoma, Lipossarcoma Desdiferen- ciado, Histiocitoma fibroso maligno), Câncer de pele (por exemplo, Melanoma), Câncer testicular (por exemplo, Tumor de células germinati- vas-Seminoma), Timoma, Câncer de tireoide (por exemplo, Carcinoma folicular, Carcinoma papilar-Variante clássica) ou câncer uterino (por exemplo, CEC Cervical, CEC Cervical-Queratinizante, CEC Cervical- Não-queratinizante, Endométrio-ADC-Endometrioide, Endométrio- ADC-Papilar seroso, Endométrio-Carcinossarcoma-Tumor mülleriano maligno), linfoma de células B e linfoma de células T (conforme Tabela 11.1.2).[00685] According to some early modalities according to the 22nd aspect, the tumor is selected from adrenal cancer (e.g., adrenocortical carcinoma or pheochromocytoma), bladder cancer (e.g., transitional cell carcinoma, transitional cell-papillary carcinoma), brain cancer (e.g., glioma-astrocytoma, glioma-astrocytoma-glioblastoma, glioma-oligoastrocytoma, glioma-oligodendroglioma), breast cancer (e.g., ADC, ADC-ductal, ADC-ductal-TNBC, ADC-ductal-TPBC, ADC-lobular), colorectal cancer (e.g., ADC), esophageal cancer (e.g., ADC), esophageal cancer (e.g., SCC), gastric cancer (e.g., ADC, diffuse ADC, ADC-intestinal, ADC-intestinal-tubular), cancer of Head and neck cancer (e.g., laryngeal cancer-SCC, SCC, oral cancer-SCC), kidney cancer (e.g., ccRCC, chromophobe, papillary, papillary type I, papillary type II), liver cancer (e.g., HCC), lung cancer (e.g., NSCLC-ADC, NSCLC-ADC-Mixed, NSCLC-SCC, SCLC), mesothelioma (e.g., epithelioid), ovarian cancer (e.g., ADC-cystadenocarcinoma-serous papillary), pancreatic cancer (e.g., ADC-ductal), prostate cancer (e.g., ADC-acinar type), sarcoma (e.g., leiomyosarcoma, undifferentiated liposarcoma, malignant fibrous histiocytoma), skin cancer (e.g., melanoma), testicular cancer (e.g., germ cell tumor-seminoma), thymoma, cancer of Thyroid (e.g., Follicular carcinoma, Papillary carcinoma - Classic variant) or uterine cancer (e.g., Cervical SCC, Keratinizing Cervical SCC, Non-keratinizing Cervical SCC, Endometrial ADC - Endometrioid, Endometrial ADC - Serous Papillary, Endometrial Carcinosarcoma - Malignant Müllerian tumor), B-cell lymphoma and T-cell lymphoma (as per Table 11.1.2).
[00686] De acordo com algumas segundas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o tumor é selecionado de leucemia linfoblásti- ca aguda de células T, câncer de mama, câncer de mama triplo negativo, câncer de mama triplo positivo, câncer de pulmão de não pequenas células (NSCLC), pulmão de células pequenas câncer (SCLC), câncer testicular, câncer gástrico, carcinoma de células escamosas de cabeça e pescoço, timoma, adenocarcinoma de esôfago, câncer color- retal, adenocarcinoma pancreático, câncer de ovário ou câncer cervi- cal, leucemia mieloide aguda, câncer de rim, câncer de bexiga, câncer de pele, câncer de pele, melanoma, câncer de tireóide, mesotelioma, sarcoma e câncer de próstata ou qualquer outro câncer envolvendo receptor de quimiocina ou células que expressam CCR8. Preferivelmente, o tumor é selecionado de câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata.[00686] According to some second modalities according to the 22nd aspect, the tumor is selected from acute T-cell lymphoblastic leukemia, breast cancer, triple-negative breast cancer, triple-positive breast cancer, non-small cell lung cancer (NSCLC), small cell lung cancer (SCLC), testicular cancer, gastric cancer, squamous cell carcinoma of the head and neck, thymoma, esophageal adenocarcinoma, colorectal cancer, pancreatic adenocarcinoma, ovarian cancer or cervical cancer, acute myeloid leukemia, kidney cancer, bladder cancer, skin cancer, melanoma, thyroid cancer, mesothelioma, sarcoma and prostate cancer or any other cancer involving chemokine receptor or cells expressing CCR8. Preferably, the tumor is selected from head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer, and/or prostate cancer.
[00687] De acordo com algumas terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com as modalidades da primeira e/ou segunda modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso é um uso em combinação simultânea, separada ou sequencial com um ou mais outros compostos te- rapeuticamente ativos. Exemplos para tratamentos de combinação são fornecidos nos Exemplos 12.6, 12.6.1, 12.6.2, 12.6.3, 12.6.4, 12.6.5, 12.6.6, 12.6.7, 12.6.8 e 12.6.9, demonstrando a ampla aplicabilidade dos anticorpos anti-CCR8 de acordo com a presente invenção e anticorpos anti-CCR8 em geral em tratamento de combinação.[00687] According to some third embodiments according to the 22nd aspect, which can be and are suggested to be combined with the embodiments of the first and/or second embodiments according to the 22nd aspect, the use is a simultaneous, separate or sequential combination use with one or more other therapeutically active compounds. Examples for combination treatments are provided in Examples 12.6, 12.6.1, 12.6.2, 12.6.3, 12.6.4, 12.6.5, 12.6.6, 12.6.7, 12.6.8 and 12.6.9, demonstrating the wide applicability of anti-CCR8 antibodies according to the present invention and anti-CCR8 antibodies in general in combination treatment.
[00688] Anticorpos de receptor antiquimiocina, por exemplo, anticorpos CCR8, ou ADCs, podem ser usados como adjuvantes ou com outros agentes ou tratamentos com propriedades anticancerígenas. Quando usados em conjunto, os anticorpos, fragmentos ou conjugados e outro(s) agente(s) podem ser formulados em conjunto em uma única composição ou formulação farmacêutica de combinação, como descrito para o 20° aspecto, ou podem ser preferivelmente formulados e administrados separadamente, seja em um regime de dosagem coordenado único ou em regimes de dosagem diferentes.[00688] Antichemokine receptor antibodies, for example, CCR8 antibodies, or ADCs, may be used as adjuvants or with other agents or treatments with anticancer properties. When used together, the antibodies, fragments or conjugates and other agent(s) may be formulated together in a single combination pharmaceutical composition or formulation, as described for aspect 20, or may preferably be formulated and administered separately, either in a single coordinated dosing regimen or in different dosing regimens.
[00689] Constatou-se, de acordo com a presente invenção, que a administração do anticorpo anti-CCR8 como primeiro agente e a administração de um ou mais compostos terapeuticamente ativos posteriormente aumentaram a eficácia de uma maneira imprevista.[00689] It has been found, according to the present invention, that administering the anti-CCR8 antibody as a first agent and subsequently administering one or more therapeutically active compounds increased efficacy in an unexpected manner.
[00690] De acordo com um esquema de tratamento preferido, o tratamento começa com a administração do anticorpo anti-CCR8 (por exemplo, diariamente, semanalmente, q2w, q3w ou q4w, como descrito acima), opcionalmente seguido pela administração de um ou mais compostos terapeuticamente ativos adicionais. Como descrito nos Exemplos 12.6 ss., o início da administração do segundo agente terapêutico ou terapia após a dose inicial do anticorpo anti-CCR8 foi associado a uma eficácia também melhorada. Sem estar limitado pela teoria, o tempo entre as doses iniciais deve ser escolhido para permitir uma depleção de Treg intratumoral de pelo menos 30%, 40%, 50% ou 60%. Sugere-se que um ou mais compostos terapeuticamente ativos ou parceiros de combinação sejam qualquer um dos descritos aqui para esta finalidade. Por exemplo, um ou mais compostos terapeutica- mente ativos adicionais podem compreender um inibidor de ponto de verificação (por exemplo, anticorpo anti-PD1/anti-PD-L1/anti-CTLA4), um anticorpo direcionado a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais ou um agente quimioterapêutico aqui descrito.[00690] According to a preferred treatment regimen, treatment begins with administration of the anti-CCR8 antibody (e.g., daily, weekly, q2w, q3w, or q4w, as described above), optionally followed by administration of one or more additional therapeutically active compounds. As described in Examples 12.6 ff., initiating administration of the second therapeutic agent or therapy after the initial dose of the anti-CCR8 antibody has been associated with improved efficacy. Without being limited by theory, the time between initial doses should be chosen to allow for intratumoral Treg depletion of at least 30%, 40%, 50%, or 60%. It is suggested that one or more therapeutically active compounds or combination partners be any of those described herein for this purpose. For example, one or more additional therapeutically active compounds may comprise a checkpoint inhibitor (e.g., anti-PD1/anti-PD-L1/anti-CTLA4 antibody), an antibody targeting a protein that is specifically expressed by tumor cells, or a chemotherapeutic agent described herein.
[00691] Em uma modalidade diferente, o tratamento começa com a administração de um agente quimioterápico e é seguido pela administração do anticorpo anti-CCR8 (por exemplo, programação semanal ou quinzenal).[00691] In a different modality, treatment begins with the administration of a chemotherapeutic agent and is followed by the administration of the anti-CCR8 antibody (e.g., weekly or biweekly schedule).
[00692] Agentes administrados em conjunto com um anticorpo de receptor antiquimiocina ou ADC, por exemplo, com um anticorpo anti- CCR8 ou ADC, podem ter atividades complementares ao anticorpo de receptor antiquimiocina ou ADC, de modo que os anticorpos/ADCs e outros agentes não afetem adversamente uns aos outros. Os agentes que podem ser usados em conjunto com os anticorpos de receptor an- tiquimiocina ou anti-CCR8 ou ADCs de acordo com a presente invenção podem ser agentes alquilantes, inibidores de angiogênese, anticorpos, antimetabólitos, antimitóticos, antiproliferativos, antivirais, inibidores de aurora quinase, promotores de apoptose (por exemplo, inibidores da família Bcl-2), ativadores da via do receptor de morte, inibidores da quinase Bcr-Abl, anticorpos BiTE (Ativador de células T bies- pecíficos), conjugados de anticorpo-fármaco, modificadores de resposta biológica, inibidores de quinase dependentes de ciclina, inibidores do ciclo celular, inibidores da ciclooxigenase-2, DVDs, inibidores do receptor homólogo do oncogene viral da leucemia (ErbB2), inibidores do fator de crescimento, inibidores da proteína de choque térmico (HSP)-90, inibidores da histona deacetilase (HDAC), terapias hormonais, imunológicos, inibidores de inibidores de proteínas de apoptose (IAPs), antibióticos intercalantes, inibidores de quinase, inibidores de cinesina, inibidores de Jak2, alvo mamífero de inibidores de rapamici- na, microRNAs, inibidores de quinase regulados por sinal extracelular ativado por mitógeno, proteínas de ligação multivalentes, anti- inflamatórios não esteroidais (AINEs), inibidores de poli ADP (adenosi- na difosfato)-ribose polimerase (PARP), quimioterapêuticos de platina, inibidores de quinase tipo polo (Plk), inibidores de fosfoinositide-3 qui- nase (PI3K), inibidores de proteassoma, análogos de purina, análogos de pirimidina, inibidores de receptor de tirosina quinase, alcaloides vegetais retinoides/deltoides, inibidores de pequenos ácidos ribonuclei- cos (siRNAs), inibidores de topoisomerase, inibidores de ubiquitina ligase e semelhantes, bem como combinações de um ou mais destes agentes[00692] Agents administered together with an antichemokine receptor antibody or ADC, for example, with an anti-CCR8 antibody or ADC, may have complementary activities to the antichemokine receptor antibody or ADC, so that the antibodies/ADCs and other agents do not adversely affect each other. The agents that can be used in conjunction with anti-chemokine or anti-CCR8 receptor antibodies or ADCs according to the present invention may be alkylating agents, angiogenesis inhibitors, antibodies, antimetabolites, antimitotics, antiproliferatives, antivirals, aurora kinase inhibitors, apoptosis promoters (e.g., Bcl-2 family inhibitors), death receptor pathway activators, Bcr-Abl kinase inhibitors, BiTE (Bispecific T-cell activator) antibodies, antibody-drug conjugates, biological response modifiers, cyclin-dependent kinase inhibitors, cell cycle inhibitors, cyclooxygenase-2 inhibitors, DVDs, viral leukemia oncogene homolog receptor (ErbB2) inhibitors, growth factor inhibitors, heat shock protein (HSP)-90 inhibitors, histone deacetylase (HDAC) inhibitors, hormonal therapies, immunological agents, protein inhibitors. apoptosis inhibitors (IAPs), intercalating antibiotics, kinase inhibitors, kinesin inhibitors, Jak2 inhibitors, mammalian target of rapamcin inhibitors, microRNAs, mitogen-activated extracellular signal-regulated kinase inhibitors, multivalent binding proteins, nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs), poly ADP (adenosine diphosphate)-ribose polymerase (PARP) inhibitors, platinum chemotherapeutic agents, polo-type kinase inhibitors (Plk), phosphoinositide-3 kinase (PI3K) inhibitors, proteasome inhibitors, purine analogs, pyrimidine analogs, tyrosine kinase receptor inhibitors, retinoid/deltoid plant alkaloids, small ribonucleic acid (siRNA) inhibitors, topoisomerase inhibitors, ubiquitin ligase inhibitors and the like, as well as combinations of one or more of these agents.
[00693] De acordo com algumas modalidades altamente preferidas das terceiras modalidades do 22° aspecto, é fornecido o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14° °, 15°, 16°, 17° e /ou 18° aspecto, ou um con-jugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para uso em combinação simultânea, separada ou sequencial(i) com um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos, preferivelmente selecionados dea) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação, tal como PD1, PD-L1 ou CTLA-4,b) um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1,c) um anticorpo direcionado a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais,d) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR,e) o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata e/ouf) um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxano, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gen- citabina,g) um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1 e/ou(ii) com radioterapia, e ou (iii) com depleção de células B intratumorais, por exemplo, no tratamento de um tumor ou uma doença, preferivelmente caracterizada por células positivas para o receptor de quimioci- na, tais como células positivas para CCR8, tais como células T regula- tórias positivas para CCR8.[00693] According to some highly preferred embodiments of the third embodiments of aspect 22, the antibody or antigen-binding fragment according to aspect 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19 or the pharmaceutical composition according to aspect 20 is provided for use in simultaneous, separate or sequential combination(i) with one or more other therapeutically active compounds, preferably selected from(a) an antibody or small molecule targeting a checkpoint protein, such as PD1, PD-L1 or CTLA-4,(b) an antibody targeting another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1, c) an antibody directed to a protein that is specifically expressed by tumor cells, d) an antibody or small molecule that targets HER2 and/or EGFR, e) the standard of care for any head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer and/or f) a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin or gemcitabine, g) a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1 and/or (ii) with radiotherapy, and or (iii) with depletion of intratumoral B cells, for example, in the treatment of a tumor or disease, preferably characterized by chemokine receptor-positive cells, such as CCR8-positive regulatory T cells.
[00694] Taxanos adequados podem ser selecionados, por exemplo, de paclitaxel, abraxano, cabazitaxel ou docetaxel, ou derivados dos mesmos.[00694] Suitable taxanes may be selected, for example, from paclitaxel, abraxane, cabazitaxel or docetaxel, or derivatives thereof.
[00695] Modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com doxorrubicina, taxanos, cis-platina ou carboplatina, modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com trastuzumab ou per- tuzumab e modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com um anticorpo PD-L1, tal como atezolizumab são particularmente adequados para o tratamento de câncer de mama, como câncer de mama em estágio IV.[00695] Modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with doxorubicin, taxanes, cisplatin or carboplatin, modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with trastuzumab or pertuzumab, and modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with a PD-L1 antibody, such as atezolizumab, are particularly suitable for the treatment of breast cancer, such as stage IV breast cancer.
[00696] Modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com cis-/carboplatina, paclitaxel, docetaxel ou gencitabina, modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com avastina, inibidor de EGFR (tal como Tarceva ou Iressa), inibidor de ALK, inibidor de ROS, inibidor de BRAF ou inibidor de NTRK, e modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com nivolumab, pembrolizumab ou atezolizumab, ou um derivado de qualquer um dos mesmos, são particularmente adequados para o tratamento de NSCLC.[00696] Modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with cis-/carboplatin, paclitaxel, docetaxel or gemcitabine, modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with avastine, an EGFR inhibitor (such as Tarceva or Iressa), an ALK inhibitor, a ROS inhibitor, a BRAF inhibitor or an NTRK inhibitor, and modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with nivolumab, pembrolizumab or atezolizumab, or a derivative thereof, are particularly suitable for the treatment of NSCLC.
[00697] Modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com nivolumab, pembrolizumab ou ipilimumab (CTLA4), anticorpo anti- IL2 ou um derivado de qualquer um dos mesmos, modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com inibidor de BRAF ou inibidor de MEK e modalidades em que o anticorpo anti-CCR8 é combinado com darcabazina, paclitaxel, carboplatina ou cis-platina são particularmente adequados para o tratamento de melanoma.[00697] Modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with nivolumab, pembrolizumab or ipilimumab (CTLA4), anti-IL2 antibody or a derivative thereof, modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with a BRAF inhibitor or MEK inhibitor and modalities in which the anti-CCR8 antibody is combined with darcabazine, paclitaxel, carboplatin or cisplatin are particularly suitable for the treatment of melanoma.
[00698] Constatou-se que os tumores eram particularmente respon- sivos à terapia com anticorpos anti-CCR8, se o tumor respondesse à inibição do ponto de verificação imunológica ou se o tumor apresentasse infiltração imune alta ou média e se um número substancial de células T CD8+ e/ ou células NK estivesse presente ou pode ser induzida, por exemplo, além de altas relações CCR8/FoxP3 (conforme Exemplo 12,6 ss, conforme modelos singênicos responsivos).[00698] Tumors were found to be particularly responsive to anti-CCR8 antibody therapy if the tumor responded to immune checkpoint inhibition or if the tumor had high or medium immune infiltration and if a substantial number of CD8+ T cells and/or NK cells were present or could be induced, for example, in addition to high CCR8/FoxP3 ratios (as per Example 12.6 ff, as per responsive syngeneic models).
[00699] De acordo com algumas modalidades particularmente preferidas A das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, o um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação, tal como PD1, PD-L1 ou CTLA-4. Anticorpos de direcionamento de ponto de verificação adequados incluem Nivo- lumab (PD1; IgG4 humana), Pembrolizumab (PD1; IgG4 humanizada), Atezolizumab (PD-L1; IgG1 humanizada), Avelumab (PD-L1; IgG1 humano), Durvalumab (PD-L1; IgG1 humano), Cemiplimab, cemipli- mab-rwlc (PD-1; mAb humano), Dostarlimab (TSR-042) (PD-1; IgG4 humanizada) ou Ipilimumab (CTLA-4; IgG1 humano). Em algumas modalidades, o anticorpo ou molécula pequena que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação tem como alvo e/ou inibe uma proteína de ponto de verificação que pode ser CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, TIM3, GAL9, LAG3, VISTA, KIR, 2B4, CD160, CGEN-15049, CHK 1, CHK2, A2aR, ligantes da família B-7 ou uma combinação dos mesmos. Os Exemplos 12.6 e segs. mostram um efeito terapêutico superior obtido pela combinação de um anticorpo direcionado à proteína de ponto de verificação PD-L1 e um anticorpo inventivo de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto. Exemplos 12.6 e segs. demonstrar essa combinação de um anticorpo inventivo de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto e uma proteína de ponto de verificação de direcionamento de anticorpo CTLA4 também mostrou eficácia excelente em um modelo de tumor.[00699] According to some particularly preferred embodiments of the third embodiment according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise an antibody or a small molecule that targets a checkpoint protein, such as PD1, PD-L1 or CTLA-4. Suitable checkpoint targeting antibodies include Nivolumab (PD1; human IgG4), Pembrolizumab (PD1; humanized IgG4), Atezolizumab (PD-L1; humanized IgG1), Avelumab (PD-L1; human IgG1), Durvalumab (PD-L1; human IgG1), Cemiplimab, cemiplimab-rwlc (PD-1; human mAb), Dostarlimab (TSR-042) (PD-1; humanized IgG4) or Ipilimumab (CTLA-4; human IgG1). In some embodiments, the antibody or small molecule targeting a checkpoint protein targets and/or inhibits a checkpoint protein that may be CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, TIM3, GAL9, LAG3, VISTA, KIR, 2B4, CD160, CGEN-15049, CHK1, CHK2, A2aR, B-7 family ligands, or a combination thereof. Examples 12.6 et seq. Examples 12.6 et seq. demonstrate that a superior therapeutic effect was obtained by combining an antibody targeting the PD-L1 checkpoint protein and an inventive antibody according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18. Examples 12.6 et seq. demonstrate that this combination of an inventive antibody according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18 and a CTLA4 antibody targeting checkpoint protein also showed excellent efficacy in a tumor model.
[00700] De acordo com algumas modalidades preferidas B das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1. Anticorpos adequados que têm como alvo outro receptor de quimiocina incluem os anticorpos fornecidos de acordo com o 6° aspecto, por exemplo, um anticorpo CCR5, anticorpo CXCR5, anticorpo CCR4 ou Mogamulizumab.[00700] According to some preferred embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise an antibody targeting another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1. Suitable antibodies targeting another chemokine receptor include antibodies provided according to aspect 6, for example, a CCR5 antibody, CXCR5 antibody, CCR4 antibody or Mogamulizumab.
[00701] De acordo com algumas modalidades preferidas C das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem uma molécula pequena ou um anticorpo que tem como alvo a HER2 e/ou EGFR. Anticorpos adequados que têm como alvo a HER2 são Trastuzumab (HER2; IgG1 humanizada), Pertuzumab (HER2; IgG1 humanizada), Ado-trastuzumab emtansina (HER2; IgG1 humanizada; ADC), [fam- ]trastuzumab deruxtecan, fam-trastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; ADC de IgG1 humanizada), Sacituzumab govitecano; sacituzumab go- vitecan-hziy (TROP-2; ADC de IgG1 humanizada) e/ou Margetuximab (HER2; IgG1 quimérica). Anticorpos adequados que têm como alvo EGFR são Cetuximab (EGFR; IgG1 quimérica), Panitumumab (EGFR; IgG2 humana) e Necitumumab (EGFR; IgG1 humana).[00701] According to some preferred embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise a small molecule or an antibody that targets HER2 and/or EGFR. Suitable antibodies targeting HER2 are Trastuzumab (HER2; humanized IgG1), Pertuzumab (HER2; humanized IgG1), Ado-trastuzumab emtansine (HER2; humanized IgG1; ADC), [fam-]trastuzumab deruxtecan, fam-trastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; humanized IgG1 ADC), Sacituzumab govitecan; sacituzumab go-vitecan-hziy (TROP-2; humanized IgG1 ADC) and/or Margetuximab (HER2; chimeric IgG1). Suitable antibodies that target EGFR are Cetuximab (EGFR; chimeric IgG1), Panitumumab (EGFR; human IgG2), and Necitumumab (EGFR; human IgG1).
[00702] De acordo com algumas modalidades D das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um anticorpo terapêutico adicional selecionado de Muromonab-CD3 (CD3; IgG2a de Murino), Efalizumab (CD11a; IgG1 Humanizada), Abciximab (GPIIb/IIIa; Fab IgG1 Quimérica), Rituximab (CD20; IgG1 Quimérica), Basiliximab (IL-2R; IgG1 Quimérica), Palivizumab (RSV; IgG1 humani-zada), Infliximab (TNF; IgG1 Quimérica), Trastuzumab (HER2; IgG1 humanizada), Adalimumab (TNF; IgG1 humana), Ibritumomab tiuxetan (CD20; IgG1 de murino), Omalizumab (IgE; IgG1 humanizada), Cetuximab (EGFR; IgG1 quimérica), Bevacizumab (VEGF; IgG1 humanizada), Natalizumab (a4 integrina; IgG4 humanizada), Panitumumab (EGFR; IgG2 humana), Ranibizumab (VEGF; Fab de IgG1 humanizada), Eculizumab (C5; IgG2/4 humanizada), Certolizumab pegol (TNF; Fab humanizado, peguilado), Ustequinumab (IL-12/23; IgG1 Humana), Canaquinumab (IL-1β; IgG1 Humana), Golimumab (TNF; IgG1 Humana), Ofatumumab (CD20; IgG1 Humana), Tocilizumab (IL-6R; IgG1 humanizada), Denosumab (RANK-L; IgG2 humana), Belimumab (BLyS; IgG1 humana), Ipilimumab (CTLA-4; IgG1 humana), Brentuxi- mab vedotina (CD30; IgG1 quimérica; ADC), Pertuzumab (HER2; IgG1 humanizada), Ado-trastuzumab emtansina (HER2; IgG1 humanizada; ADC), Raxibacumab (PA de B. anthrasis; IgG1 humana), Obinutuzu- mab (CD20; IgG1 humanizada Glycoengineered), Siltuximab (IL-6; IgG1 Quimérica), Ramucirumab (VEGFR2; IgG1 Humano)), Vedolizu- mab (α4β7 integrina; IgG1 humanizada), Nivolumab (PD1; IgG4 humano), Pembrolizumab (PD1; IgG4 humanizada), Blinatumomab (CD19, CD3; scFv in tandem biespecífico murino), Alemtuzumab (CD52; IgG1 humanizada), Evolocumab (PCSK9; IgG2 humana), Idarucizumab (Dabigatrana; Fab humanizado), Necitumumab (EGFR; IgG1 humana), Dinutuximab (GD2; IgG1 quimérica), Secucinumab (IL-17a; IgG1 hu- mana), Mepolizumab (IL-5; IgG humanizada 1), Alirocumab (PCSK9; IgG1 humana), Daratumumab (CD38; IgG1 humana), Elotuzumab (SLAMF7; IgG1 humanizada), Ixekizumab (IL-17a; IgG4 humanizada), Reslizumab (IL-5; IgG4 humanizada), Olaratumab (PDGFRα; IgG1 humano), Bezlotoxumab (Enterotoxina B de Clostridium difficile; IgG1 humana), Atezolizumab (PD-L1; IgG1 humanizada), Obiltoxaximab (PA de B. anthrasis; IgG1 quimérica), Brodalumab (IL-17R; IgG2 humana), Dupilumab (IL-4Rα; IgG4 humana), Inotuzumab ozogamicina (CD22; IgG4 humanizada; ADC), Guselkumab (IL-23 p19; IgG1 humano), Sari- lumab (IL-6R; IgG1 humano), Avelumab (PD-L1; IgG1 humana), Emi- cizumab (Fator Ixa, X; IgG4 humanizada, biespecífico), Ocrelizumab (CD20; IgG1 humanizada), Benralizumab (IL-5Rα; IgG1 humanizada), Durvalumab (PD-L1; IgG1 humana), Gemtuzumab ozogamicina (CD33; IgG4 humanizada; ADC), Erenumab, erenumab- aooe (receptor CGRP; IgG2 humana), Galcanezumab, galcanezumab-gnlm (CGRP; IgG4 humanizada), Burosumab, burosumab-twza (FGF23; IgG1 humana), Lanadelumab, lanadelumab-flyo (Plasma kalicrelina; IgG1 Humana), Mogamulizumab, mogamulizumab-kpkc (CCR4; IgG1 humanizada), tildraquizumab; tildrakizumab-asmn (IL-23 p19; IgG1humanizada), Fremanezumab, fremanezumab-vfrm (CGRP; IgG2 humanizado), Ravulizumab, ravulizumab-cwvz (C5; IgG2/4 Humanizada), Cemiplimab, cemiplimab-rwlc (PD-1; mAb Humano), Ibalizumab, iba- lizumab-uiyk (CD4; Humanized IgG4), Emapalumab, empalumab-lzsg (IFNg; IgG1 humana), Moxetumomab pasudotox, moxetumomab pa- sudotox-tdfk (CD22; imunotoxina de dsFv IgG1 de murino), Caplaci- zumab, caplacizumab-yhdp (Fator von Willebrand; Nanocorpo humanizado), Risankizumab, risankizumab-rzaa (IL-23 p19; IgG1 Humanizada), Polatuzumab vedotin, polatuzumab vedotin-piiq (CD79b; ADC de IgG1 Humanizada), Romosozumab, romosozumab-aqqg (esclerostina; Humanized IgG2), Brolucizumab, brolucizumab-dbll (VEGF-A; scFv humanizado), Crizanlizumab; crizanlizumab-tmca (CD62 (também conhecido como P-selectina); IgG2 Humanizada), Enfortumab vedotin, enfortumab vedotin-ejfv (Nectin-4; ADC de IgG1 humana), [fam- ]trastuzumab deruxtecan, fam-trastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; ADC de IgG1 humanizada), Teprotumumab, teprotumumab-trbw (IGF- 1R; IgG1 humana), Eptinezumab, eptinezumab-jjmr (CGRP; IgG1 humanizada), Isatuximab, isatuximab-irfc (CD38; IgG1 quimérica), Saci- tuzumab govitecan; sacituzumab govitecan-hziy (TROP-2; IgG1 ADC humanizado), Inebilizumab (CD19; IgG1 humanizada), Leronlimab (CCR5; IgG4 humanizada), Satralizumab (IL-6R; IgG2 humanizada), Narsoplimab (MASP-2, IgG4 humana), Tafasitamab (CD19; IgG1 humanizada), REGNEB3 (vírus Ebola; mistura de 3 IgG1 humana), Naxi- tamab (GD2; IgG1 humanizada), Oportuzumab monatox (EpCAM; imunotoxina de scFv humanizada), Belantamab mafodotina (antígeno de maturação de células B; ADC de IgG1 humanizada), Margetuximab (HER2; IgG1 quimérica), Tanezumab (Fator de crescimento do nervo; IgG2 humanizada), Dostarlimab (TSR-042) (PD-1; IgG4 humanizada), Teplizumab (CD3; IgG1 humanizada), Aducanumab (beta amiloide; IgG1 humana), Sutimlimab (BIVV009) (C1s; IgG4 humanizada), Evina- cumab (Angiopoietina-símile 3; IgG4 Humano).[00702] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise an additional therapeutic antibody selected from Muromonab-CD3 (CD3; Murine IgG2a), Efalizumab (CD11a; Humanized IgG1), Abciximab (GPIIb/IIIa; Chimeric Fab IgG1), Rituximab (CD20; Chimeric IgG1), Basiliximab (IL-2R; Chimeric IgG1), Palivizumab (RSV; Humanized IgG1), Infliximab (TNF; Chimeric IgG1), Trastuzumab (HER2; Humanized IgG1), Adalimumab (TNF; Human IgG1), Ibritumomab tiuxetan (CD20; Murine IgG1), Omalizumab (IgE; Humanized IgG1), Cetuximab (EGFR; Chimeric IgG1), Bevacizumab (VEGF; humanized IgG1), Natalizumab (a4 integrin; humanized IgG4), Panitumumab (EGFR; human IgG2), Ranibizumab (VEGF; humanized IgG1 Fab), Eculizumab (C5; humanized IgG2/4), Certolizumab pegol (TNF; humanized Fab, pegylated), Ustekinumab (IL-12/23; Human IgG1), Canakinumab (IL-1β; Human IgG1), Golimumab (TNF; Human IgG1), Ofatumumab (CD20; Human IgG1), Tocilizumab (IL-6R; humanized IgG1), Denosumab (RANK-L; human IgG2), Belimumab (BLyS; human IgG1), Ipilimumab (CTLA-4; human IgG1), Brentuximab vedotin (CD30; chimeric IgG1; Pertuzumab (HER2; Humanized IgG1), Ado-trastuzumab emtansine (HER2; Humanized IgG1; ADC), Raxibacumab (B. anthrasis PA; Human IgG1), Obinutuzumab (CD20; Glycoengineered Humanized IgG1), Siltuximab (IL-6; Chimeric IgG1), Ramucirumab (VEGFR2; Human IgG1)), Vedolizumab (α4β7 integrin; humanized IgG1), Nivolumab (PD1; human IgG4), Pembrolizumab (PD1; humanized IgG4), Blinatumomab (CD19, CD3; murine bispecific tandem scFv), Alemtuzumab (CD52; humanized IgG1), Evolocumab (PCSK9; human IgG2), Idarucizumab (Dabigatran; humanized Fab), Necitumumab (EGFR; human IgG1), Dinutuximab (GD2; chimeric IgG1), Secukinumab (IL-17a; human IgG1), Mepolizumab (IL-5; humanized IgG 1), Alirocumab (PCSK9; human IgG1), Daratumumab (CD38; human IgG1), Elotuzumab (SLAMF7; humanized IgG1), Ixekizumab (IL-17a; Humanized IgG4), Reslizumab (IL-5; humanized IgG4), Olaratumab (PDGFRα; human IgG1), Bezlotoxumab (Clostridium difficile Enterotoxin B; human IgG1), Atezolizumab (PD-L1; humanized IgG1), Obiltoxaximab (B. anthrasis PA; chimeric IgG1), Brodalumab (IL-17R; human IgG2), Dupilumab (IL-4Rα; human IgG4), Inotuzumab ozogamicin (CD22; humanized IgG4; ADC), Guselkumab (IL-23 p19; human IgG1), Sarilumab (IL-6R; human IgG1), Avelumab (PD-L1; human IgG1), Emicizumab (Factor Ixa, X; humanized IgG4, bispecific), Ocrelizumab (CD20; humanized IgG1), Benralizumab (IL-5Rα; humanized IgG1); human), Lanadelumab, lanadelumab-flyo (Plasma kalicrelin; Human IgG1), Mogamulizumab, mogamulizumab-kpkc (CCR4; Humanized IgG1), tildrakizumab; tildrakizumab-asmn (IL-23 p19; humanized IgG1), Fremanezumab, fremanezumab-vfrm (CGRP; humanized IgG2), Ravulizumab, ravulizumab-cwvz (C5; Humanized IgG2/4), Cemiplimab, cemiplimab-rwlc (PD-1; Human mAb), Ibalizumab, iba- lizumab-uiyk (CD4; Humanized IgG4), Emapalumab, empalumab-lzsg (IFNg; human IgG1), Moxetumomab pasudotox, moxetumomab pasudotox-tdfk (CD22; murine IgG1 dsFv immunotoxin), Caplacizumab, caplacizumab-yhdp (von Willebrand Factor; Humanized Nanobody), Risankizumab, risankizumab-rzaa (IL-23 p19; Humanized IgG1), Polatuzumab vedotin, polatuzumab vedotin-piiq (CD79b; Humanized IgG1 ADC), Romosozumab, romosozumab-aqqg (sclerostin; Humanized IgG2), Brolucizumab, brolucizumab-dbll (VEGF-A; humanized scFv), Crizanlizumab; crizanlizumab-tmca (CD62 (also known as P-selectin); Humanized IgG2), Enfortumab vedotin, enfortumab vedotin-ejfv (Nectin-4; human IgG1 ADC), [fam-]trastuzumab deruxtecan, fam-trastuzumab deruxtecan-nxki (HER2; humanized IgG1 ADC), Teprotumumab, teprotumumab-trbw (IGF-1R; human IgG1), Eptinezumab, eptinezumab-jjmr (CGRP; humanized IgG1), Isatuximab, isatuximab-irfc (CD38; chimeric IgG1), Sacituzumab govitecan; Sacituzumab govitecan-hziy (TROP-2; humanized IgG1 ADC), Inebilizumab (CD19; humanized IgG1), Leronlimab (CCR5; humanized IgG4), Satralizumab (IL-6R; humanized IgG2), Narsoplimab (MASP-2, human IgG4), Tafasitamab (CD19; humanized IgG1), REGNEB3 (Ebola virus; mixture of 3 human IgG1), Naxitamab (GD2; humanized IgG1), Oportuzumab monatox (EpCAM; humanized scFv immunotoxin), Belantamab mafodotin (B-cell maturation antigen; humanized IgG1 ADC), Margetuximab (HER2; chimeric IgG1), Tanezumab (Nerve growth factor; humanized IgG2), Dostarlimab (TSR-042) (PD-1; humanized IgG4), Teplizumab (CD3; humanized IgG1), Aducanumab (amyloid beta; human IgG1), Sutimlimab (BIVV009) (C1s; humanized IgG4), Evinacumab (Angiopoietin-like 3; Human IgG4).
[00703] O tratamento de combinação com qualquer um destes anticorpos terapêuticos adicionais é preferido em particular para um tumor expressando especificamente o alvo do anticorpo terapêutico adicional selecionado.[00703] Combination treatment with any of these additional therapeutic antibodies is preferred, particularly for a tumor specifically expressing the target of the selected additional therapeutic antibody.
[00704] De acordo com algumas modalidades E das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um outro anticorpo terapêutico tem como alvo CD16a, ILDR2, PSMA ou Mesotelina.[00704] According to some embodiments and of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more other therapeutically active compounds comprise another therapeutic antibody targeting CD16a, ILDR2, PSMA or Mesothelin.
[00705] Vários quimioterápicos, tais como a doxorrubicina e a oxali- platina, induzem a morte celular imunogênica (CDI). No entanto, o ICD foi relacionado à resposta aos anticorpos anti-CCR8, de modo que uma terapia de combinação possa adicionar mais benefícios à aplicação da monoterapia.[00705] Several chemotherapeutic agents, such as doxorubicin and oxalic acid, induce immunogenic cell death (ICD). However, ICD has been linked to the response to anti-CCR8 antibodies, so combination therapy may add more benefits to the application of monotherapy.
[00706] De acordo com algumas modalidades F das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um agente citostático selecionado de radionuclídeos, agentes alquilantes, agentes de reticulação de DNA, agentes intercalante de DNA (por exemplo, agentes de ligação de sulco, tais como ligantes de sulco menor), moduladores do ciclo celular, reguladores de apoptose, inibidores de quinase, inibidores de síntese de proteínas, inibidores de mitocôndrias, inibidores de exportação nuclear, inibidores de topoisomerase I, inibidores de topoisomerase II, antimetabólitos de RNA/DNA e agentes antimitóticos.[00706] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise a cytostatic agent selected from radionuclides, alkylating agents, DNA crosslinking agents, DNA intercalating agents (e.g., sulcus linking agents, such as minor sulcus ligands), cell cycle modulators, apoptosis regulators, kinase inhibitors, protein synthesis inhibitors, mitochondrial inhibitors, nuclear export inhibitors, topoisomerase I inhibitors, topoisomerase II inhibitors, RNA/DNA antimetabolites and antimitotic agents.
[00707] De acordo com algumas modalidades F1 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, o um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um agente alquilan- te selecionado de um (L-Leucina, N—[N-acetil-4-[bis-(2-cloroetil)amino]-DL-fenilalanil]-, éster etílico); AZQ (ácido 1,4-ciclo- hexadieno-1,4-dicarbâmico, 2,5-bis(1-aziridinil)-3,6-dioxo-, éster dietíli- co); BCNU (N,N'-Bis(2-cloroetil)-N-nitrosoureia); bussulfano (dimeta- nossulfonato de 1,4-butanodiol); (carboxiftalato)platina; CBDCA (cis- (1,1-ciclobutanodicarboxilato)diaminoplatina(II))); CCNU (N-(2-cloroetil)-N'-ciclo-hexil-N-nitrosoureia); CHIP (iproplatina; NSC 256927); clorambucil; clorozotocina (2-[[[(2-cloroetil) nitrosoami- no]carbonil]amino]-2-desóxi-D-glucopiranose); cis-platina (cisplatina); clomesona; cianomorfolinodoxorrubicina; ciclodisona; dianidrogalactitol (5,6-diepoxiducitol); fluorodopan ((5-[(2-cloroetil)-(2-fluoroetil)amino]-6- metil-uracil); hepsulfam; hicantona; dímero de indolinobenzodiazepina DGN462; melfalano; metil CCNU ((1-(2-cloroetil)-3-(trans-4- metilciclohexano)-1-nitrosoureia); mitomicina C; mitozolamida; mostarda de nitrogênio (cloridrato de (bis(2-cloroetil)metilamina); PCNU ((1- (2-cloroetil)-3-(2,6)-dioxo-3-piperidil)-1-nitrosoureia)); alquilador de pi- perazina (dicloridrato de (1-(2-cloroetil)-4-(3-cloropropil)-piperazina)); piperazinodiona; pipobroman (N,N'-bis(3-bromopropionil) piperazina); porfiromicina (N-metilmitomicina C); mostarda de espiro-hidantoína; teroxirona (triglicidilisocianurato); tetraplatina; tiotepa (N,N',N'-tri-1,2- etanodi-iltio fosforamida); trietilenomelamina; uracil mostarda de nitrogênio (desmetildopan); Yoshi-864 (cloridrato de (bis(3- mesiloxipropil)amina).[00707] According to some F1 embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise an alkylating agent selected from (L-Leucine, N—[N-acetyl-4-[bis-(2-chloroethyl)amino]-DL-phenylalanine]-, ethyl ester); AZQ (1,4-cyclohexadiene-1,4-dicarbamic acid, 2,5-bis(1-aziridinyl)-3,6-dioxo-, diethyl ester); BCNU (N,N'-Bis(2-chloroethyl)-N-nitrosourea); busulfan (1,4-butanediol dimethanesulfonate); (carboxyphthalate)platinum; CBDCA (cis-(1,1-cyclobutanedicarboxylate)diaminoplatinum(II))); CCNU (N-(2-chloroethyl)-N'-cyclohexyl-N-nitrosourea); CHIP (iproplatin; NSC 256927); chlorambucil; chlorozotocin (2-[[[(2-chloroethyl) nitrosoamino]carbonyl]amino]-2-deoxy-D-glucopyranose); cis-platinum (cisplatin); clomesone; cyanomorpholinodoxorubicin; cyclodysone; dianhydrogalactitol (5,6-diepoxyducitol); fluorodopan ((5-[(2-chloroethyl)-(2-fluoroethyl)amino]-6-methyluracil); hepsulfam; hycantone; indolinobenzodiazepine dimer DGN462; melphalan; methyl CCNU ((1-(2-chloroethyl)-3-(trans-4-methylcyclohexane)-1-nitrosourea); mitomycin C; mitozolamide; nitrogen mustard ((bis(2-chloroethyl)methylamine hydrochloride); PCNU ((1-(2-chloroethyl)-3-(2,6)-dioxo-3-piperidyl)-1-nitrosourea)); piperazine alkylator ((1-(2-chloroethyl)-4-(3-chloropropyl)piperazine dihydrochloride)); piperazinodione; pipobroman (N,N'-bis(3-bromopropionyl) piperazine); porphyromycin (N-methylmitomycin C); spirohydantoin mustard; teroxirone (triglycidylisocyanurate); tetraplatinum; thiotepa (N,N',N'-tri-1,2-ethanediylthiophosphoramide); triethylenemelamine; uracil nitrogen mustard (desmethyldopan); Yoshi-864 (bis(3-mesyloxypropyl)amine hydrochloride).
[00708] De acordo com algumas modalidades F2 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um agente semelhante a alqui- lação de DNA selecionado de Cisplatina; carboplatina; Nedaplatina; Oxaliplatina; Satraplatina; tetranitrato de triplatina; Procarbazina; altre- tamina; dacarbazina; mitozolomida; temozolomida.[00708] According to some F2 embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more therapeutically active compounds comprise a DNA alkylation-like agent selected from Cisplatin; Carboplatin; Nedaplatin; Oxaliplatin; Satraplatin; Triplatin tetranitrate; Procarbazine; Altretamine; Dacarbazine; Mitozolomide; Temozolomide.
[00709] De acordo com algumas modalidades F3 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um agente antineoplásico al- quilante selecionado de Carboquona ; Carmustina; Clornafazina; Clo- rozotocina; Duocarmicina; Evofosfamida; Fotemustina; Glufosfamida; Lomustina; Mannossulfano; Nimustina; Fenantriplatina; Pipobroman; Ranimustina; Semustina; Estreptozotocina; TioTEPA; Treossulfano; Triaziquona; Trietilenomelamina; Tetranitrato de triplatina.[00709] According to some embodiments F3 of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more therapeutically active compounds comprise an alkylating antineoplastic agent selected from Carboquone; Carmustine; Chlornaphazine; Chlorozotocin; Duocarmycin; Evofosfamide; Fotemustine; Glufosfamide; Lomustine; Mannosolfane; Nimustine; Phenantiplatin; Pipobroman; Ranimustine; Semustine; Streptozotocin; ThioTEPA; Treosulfane; Triaziquone; Triethylenemelamine; Triplatin tetranitrate.
[00710] De acordo com algumas modalidades F4 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de replicação e reparo de DNA selecionado de Altretamina; Bleomicina; Dacarbazina; Dactinomicina; mitobronitol; mitomicina; Pingyangmicina; Plicamicina; Procarbazina; Temozolomida; ABT-888 (veliparib); olaparibe; KU- 59436; AZD-2281; AG-014699; BSI-201; BGP-15; INO-1001; ONO-2231.[00710] According to some F4 embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more therapeutically active compounds comprise a DNA replication and repair inhibitor selected from Altretamine; Bleomycin; Dacarbazine; Dactinomycin; mitobronitol; mitomycin; Pingyangmycin; Plicamycin; Procarbazine; Temozolomide; ABT-888 (veliparib); olaparib; KU-59436; AZD-2281; AG-014699; BSI-201; BGP-15; INO-1001; ONO-2231.
[00711] De acordo com algumas modalidades F5 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um modulador do ciclo celular, tal como Paclitaxel; Nab-Paclitaxel; Docetaxel; Vincristina; Vinblastina; ABT-348; AZD-1152; MLN-8054; VX-680; inibidores dequinase específicos de Aurora A; inibidores de quinase específicos de Aurora B e inibidores de quinase pan-Aurora; AZD-5438; IMC-1040; BMS-032; BMS-387; CVT-2584; flavopiridol; GPC-286199; MCS-5A; PD0332991; PHA-690509; seliciclib (CYC-202, R-roscovitina); ZK-304709; AZD4877, ARRY-520: GSK923295A.[00711] According to some F5 embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more other therapeutically active compounds comprise a cell cycle modulator, such as Paclitaxel; Nab-Paclitaxel; Docetaxel; Vincristine; Vinblastine; ABT-348; AZD-1152; MLN-8054; VX-680; Aurora A-specific kinase inhibitors; Aurora B-specific kinase inhibitors and pan-Aurora kinase inhibitors; AZD-5438; IMC-1040; BMS-032; BMS-387; CVT-2584; flavopiridol; GPC-286199; MCS-5A; PD0332991; PHA-690509; seliciclib (CYC-202, R-roscovitine); ZK-304709; AZD4877, ARRY-520: GSK923295A.
[00712] De acordo com algumas modalidades F6 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um regulador de apoptose, tal como AT-101 ((-)gossipol); G3139 ou oblimersen (oligonucleotídeo antisense direcionado a Bcl-2); IPI-194; IPI-565; N-(4-(4-((4'-cloro(1,1'- bifenil)-2-il)metil)piperazin-1-ilbenzoil)-4-(((1R)-3-(dimetilamino)-1-((fenilsulfanil)metil)propil)amino)-3-nitrobenzenossulfonamida); N-(4-(4- ((2-(4-clorofenil)-5,5-dimetil-1-ciclo-hex-1-en-1-il)metil)piperazin-1- il)benzoil)-4-(((1R)-3-(morfolin-4-il)-1-((fenilsulfanil)metil)propil)amino)- 3-((trifluorometil)sulfonil)benzenossulfonamida; GX-070 (Obatoclax®; 1H-Indol, 2-(2-((3,5-dimetil-1H-pirrol-2-il)metileno)-3-metóxi-2H-pirrol-5- il)-)); HGS1029; GDC-0145; GDC-0152; LCL-161; LBW-242; veneto- clax; agentes que têm como alvo TRAIL ou receptores de morte (por exemplo, DR4 e DR5), como ETR2-ST01, GDC0145, HGS-1029, LBY- 135, PRO-1762; fármacos que visam caspases, reguladores de caspases, membros da família BCL-2, proteínas do domínio de morte, membros da família TNF, membros da família Toll e/ou proteínas NF- kappa-B.[00712] According to some F6 embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise an apoptosis regulator, such as AT-101 ((-)gssypol); G3139 or oblimersen (antisense oligonucleotide directed at Bcl-2); IPI-194; IPI-565; N-(4-(4-((4'-chloro(1,1'-biphenyl)-2-yl)methyl)piperazin-1-ylbenzoyl)-4-(((1R)-3-(dimethylamino)-1-((phenylsulfanyl)methyl)propyl)amino)-3-nitrobenzenesulfonamide); N-(4-(4-((2-(4-chlorophenyl)-5,5-dimethyl-1-cyclohex-1-en-1-yl)methyl)piperazin-1-yl)benzoyl)-4-(((1R)-3-(morpholin-4-yl)-1-((phenylsulfanyl)methyl)propyl)amino)- 3-((trifluoromethyl)sulfonyl)benzenesulfonamide; GX-070 (Obatoclax®; 1H-Indole, 2-(2-((3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl)methylene)-3-methoxy-2H-pyrrol-5-yl)-)); HGS1029; GDC-0145; GDC-0152; LCL-161; LBW-242; veneto- clax; Agents that target TRAIL or death receptors (e.g., DR4 and DR5), such as ETR2-ST01, GDC0145, HGS-1029, LBY-135, PRO-1762; drugs that target caspases, caspase regulators, BCL-2 family members, death domain proteins, TNF family members, Toll family members, and/or NF-kappa-B proteins.
[00713] De acordo com algumas modalidades F7 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de an- giogênese, tal como ABT-869; AEE-788; axitinib (AG-13736); AZD- 2171; CP-547.632; IM-862; pegaptamib; sorafenibe; BAY43-9006; pa- zopanib (GW-786034); vatalanib (PTK-787, ZK-222584); sunitinib; SU- 11248; armadilha VEGF; vandetanib; ABT-165; ZD-6474; Inibidores de DLL4.[00713] According to some F7 embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more other therapeutically active compounds comprise an angiogenesis inhibitor, such as ABT-869; AEE-788; axitinib (AG-13736); AZD-2171; CP-547632; IM-862; pegaptamib; sorafenib; BAY43-9006; pazopanib (GW-786034); vatalanib (PTK-787, ZK-222584); sunitinib; SU-11248; VEGF trap; vandetanib; ABT-165; ZD-6474; DLL4 inhibitors.
[00714] De acordo com algumas modalidades F8 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de pro- teassoma, tal como Bortezomib; Carfilzomibe; Epoxomicina; Ixazomib; Salinosporamida A.[00714] According to some F8 embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise a proteasome inhibitor, such as Bortezomib; Carfilzomib; Epoxomicin; Ixazomib; Salinosporamide A.
[00715] De acordo com algumas modalidades F9 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de qui- nase tal como Afatinib; Axitinib; Bosutinib; Crizotinib; Dasatinib; Erlotinib; Fostamatinib; Gefitinib; Ibrutinib; Imatinib; lapatinib; lenvatinib; Mu- britinib; Nilotinib; Pazopanib; Pegaptanib; Sorafenibe; Sunitinib; SU6656; Vandetanib; Vemurafenibe; CEP-701 (lesaurtinib); XL019; INCB018424 (ruxolitinib); ARRY-142886 (selemetinib); ARRY-438162 (binimetinib); PD-325901; PD-98059; AP-23573; CCI-779; everolimo; RAD-001; rapamicina; temsirolimus; inibidores de TORC1/TORC2 competitivos com ATP, incluindo PI-103, PP242, PP30, Torina 1;LY294002; XL-147; CAL-120; ONC-21; AEZS-127; ETP-45658; PX- 866; GDC-0941; BGT226; BEZ235; XL765, Regorafenibe e MEKi-1. Inibidor da síntese de proteínas[00715] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise a kinase inhibitor such as Afatinib; Axitinib; Bosutinib; Crizotinib; Dasatinib; Erlotinib; Fostamatinib; Gefitinib; Ibrutinib; Imatinib; lapatinib; lenvatinib; Mubritinib; Nilotinib; Pazopanib; Pegaptanib; Sorafenib; Sunitinib; SU6656; Vandetanib; Vemurafenib; CEP-701 (lesaurtinib); XL019; INCB018424 (ruxolitinib); ARRY-142886 (selemetinib); ARRY-438162 (binimetinib); PD-325901; PD-98059; AP-23573; CCI-779; everolimus; RAD-001; rapamycin; temsirolimus; ATP-competitive TORC1/TORC2 inhibitors, including PI-103, PP242, PP30, Torina 1; LY294002; XL-147; CAL-120; ONC-21; AEZS-127; ETP-45658; PX-866; GDC-0941; BGT226; BEZ235; XL765, Regorafenib and MEKi-1. Protein synthesis inhibitor
[00716] De acordo com algumas modalidades F10 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor da síntese de proteínas, tal como estreptomicina; Di-hidroestreptomicina; Neomicina; framicetina; Paromomicina; Ribostamicina; canamicina; Amicacina; Arbecacina; Becanamicina; Dibecacina; Tobramicina; Es- pectinomicina; Higromicina B; Paromomicina; Gentamicina; Netilmici- na; Sisomicina; Isepamicina; Verdamicina; Astromicina; Tetraciclina; Doxiciclina; Clortetraciclina; Clomociclina; Demeclociclina; limeciclina; meclociclina; Metaciclina; Minociclina; Oxitetraciclina; Penimepiciclina; Rolitetraciclina; Tetraciclina; Glicilciclinas; Tigeciclina; Oxazolidinona; Eperezolida; Linezolida; Posizolida; Radazolida; Ranbezolida; Sutezo- lida; Tedizolida; Inibidores de peptidil transferase; Cloranfenicol; Azi- damfenicol; Tianfenicol; Florfenicol; Pleuromutilinas; Retapamulina; Tiamulina; Valnemulina; Azitromicina; Claritromicina; Diritromicina; Eri- tromicina; Fluritromicina; Josamicina; Midecamicina; Miocamicina; Ole- andomicina; Rokitamicina; Roxitromicina; Espiramicina; Troleandomi- cina; Tilosina; Cetólidos; Telitromicina; Cetromicina; solitromicina; Clin- damicina; Lincomicina; Pirlimicina; Estreptograminas; Pristinamicina; Quinupristina/dalfopristina; Virginiamicina.[00716] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise a protein synthesis inhibitor, such as streptomycin; Dihydrostreptomycin; Neomycin; framycetin; Paromomycin; Ribostamycin; kanamycin; Amikacin; Arbekacin; Becanamycin; Dibekacin; Tobramycin; Pectinomycin; Hygromycin B; Paromomycin; Gentamicin; Netilmycin; Sisomicin; Isepamycin; Verdamycin; Astromycin; Tetracycline; Doxycycline; Chlortetracycline; Clomocycline; Demeclocycline; Limecycline; Meclocycline; Metacycline; Minocycline; Oxytetracycline; Penimepicilcycline; Rolitetracycline; Tetracycline; Glycylcyclines; Tigecycline; Oxazolidinone; Eperezolid; Linezolid; Posizolid; Radazolide; Ranbezolid; Sutezolide; Tedizolid; Peptidyl transferase inhibitors; Chloramphenicol; Azidamphenicol; Thiamphenicol; Florfenicol; Pleuromutilins; Retapamulin; Tiamulin; Valnemulin; Azithromycin; Clarithromycin; Dirithromycin; Erythromycin; Flurithromycin; Josamycin; Midecamycin; Myocamycin; Ole-andomycin; Rokitamycin; Roxithromycin; Spiramycin; Troleandomycin; Tylosin; Ketolides; Telithromycin; Cethromycin; solithromycin; Clindamycin; Lincomycin; Pirlimycin; Streptogramins; Pristinamycin; Quinupristin/dalfopristin; Virginiamycin.
[00717] De acordo com algumas modalidades F11 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de his- tona desacetilase, tal como Vorinostat; Romidepsina; Chidamida; Pa- nobinostate; Ácido valproico; Belinostat; Mocetinostate; Abexinostate; Entinostat; SB939 (pracinostate); Resminostato; Givinostate; Quisinos- tate; tioureidobutironitrila (Kevetrin™); CUDC-10; CHR-2845 (tefinosta- te); CHR-3996; 4SC-202; CG200745; ACY-1215 (rocilinostate); ME- 344; sulforafano.[00717] According to some embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more other therapeutically active compounds comprise a histone deacetylase inhibitor, such as Vorinostat; Romidepsin; Chidamide; Panobinostat; Valproic acid; Belinostat; Mocetinostat; Abexinostat; Entinostat; SB939 (pracinostat); Resminostat; Givinostat; Quisinostat; thioureidobutyronitrile (Kevetrin™); CUDC-10; CHR-2845 (tefinostat); CHR-3996; 4SC-202; CG200745; ACY-1215 (rocilinostat); ME-344; sulforaphane.
[00718] De acordo com algumas modalidades F12 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de topoisomerase I tal como camptotecina; Vários derivados e análogos da campotothecina (por exemplo, NSC 100880, NSC 603071, NSC 107124, NSC 643833, NSC 629971, NSC 295500, NSC 249910, NSC 606985, NSC 74028, NSC 17633,, NSC 618939, NSC 610457, NSC 610459, NSC 606499, NSC 610456, NSC 364830 e NSC 606497); morfolinisoxorrubicina; SN-38.[00718] According to some embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more other therapeutically active compounds comprise a topoisomerase I inhibitor such as camptothecin; Various derivatives and analogues of camptothecin (e.g., NSC 100880, NSC 603071, NSC 107124, NSC 643833, NSC 629971, NSC 295500, NSC 249910, NSC 606985, NSC 74028, NSC 17633, NSC 618939, NSC 610457, NSC 610459, NSC 606499, NSC 610456, NSC 364830 and NSC 606497); morpholinisoxorubicin; SN-38.
[00719] De acordo com algumas modalidades F13 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de topoisomerase II tal como doxorrubicina; amonafide (benzisoquinolinadi- ona); m-AMSA (4'-(9-acridinilamino)-3'-metoximetanossulfonanilida); derivado de antrapirazol ((NSC 355644); etoposido (VP-16); pirazoloa- cridina ((pirazolo[3,4,5-kl]acridina-2(6H)-propanamina, 9-metóxi-N,N- dimetil-5-nitro-, monometanossulfonato); cloridrato de bisantreno; dau- norrubicina; desoxidoxorrubicina; mitoxantrona; menogaril; N,N- dibenzil daunomicina; oxantrazol; rubidazona; teniposídeo.[00719] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise a topoisomerase II inhibitor such as doxorubicin; amonafide (benzisoquinolinedione); m-AMSA (4'-(9-acridinylamino)-3'-methoxymethanesulfonanilide); anthrapyrazole derivative ((NSC 355644); etoposide (VP-16); pyrazoloacridine ((pyrazolo[3,4,5-kl]acridine-2(6H)-propanamine, 9-methoxy-N,N-dimethyl-5-nitro-, monomethanesulfonate); bisanthrene hydrochloride; daunorubicin; deoxyxorubicin; mitoxantrone; menogaril; N,N-dibenzyl daunomycin; oxanthrazole; rubidazone; teniposide.
[00720] De acordo com algumas modalidades F14 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um agente intercalante de DNA, tal como antramicina; chicamicina A; tomamicina; DC-81; sibiro- micina; derivado de pirrolobenzodiazepina; SGD-1882 ((S)-2-(4-aminofenil)-7-metóxi-8-(3S)-7-metóxi-2-(4-metoxifenil)-5-oxo-5,11a-di- hidro-1H-benzo[e]pirrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-il)óxi)propóxi)-1H- benzo[e]pirrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-ona); SG2000 (SJG-136;(11aS,11a'S)-8,8'-(propano-1,3-diilbis(óxi))bis(7-metóxi-2-metileno-2,3- di-hidro-1H-benzo[e]pirrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-ona)).Antimetabólito de RNA/DNA[00720] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise a DNA intercalating agent, such as anthramycin; chicamycin A; tomamycin; DC-81; sibiromycin; pyrrolobenzodiazepine derivative; SGD-1882 ((S)-2-(4-aminophenyl)-7-methoxy-8-(3S)-7-methoxy-2-(4-methoxyphenyl)-5-oxo-5,11a-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)propoxy)-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one); SG2000 (SJG-136;(11aS,11a'S)-8,8'-(propane-1,3-diylbis(oxy))bis(7-methoxy-2-methylene-2,3-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one)). RNA/DNA antimetabolite
[00721] De acordo com algumas modalidades F15 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um antimetabólito de RNA/DNA, tal como gencitabina, L-alanosina; 5-azacitidina; 5- fluorouracilo; acivicina; derivado de aminopterina ácido N-[2-cloro- 5[[(2,4-diamino-5-metil-6-quinazolinil)metil]amino]benzoil]L-aspártico (NSC 132483); ácido N-[4-[[(2,4-diamino-5-etil-6-quinazolinil)metil]amino]benzoil]L-aspártico derivado de aminopterina; derivado de aminopterina mono-hidrato de ácido N-[2-cloro-4-[[(2,4- diamino-6-pteridinil)metil]amino]benzoil]L-aspártico; antifolato PT523 ((Nα-(4-amino-4-desoxipteroil)-NY-hemiftaloil-L-ornitina)); antifol solúvel de Baker (NSC 139105); dicloralil leisona ((2-(3,3-dicloroalil)-3-hidróxi- 1,4-naftoquinona); brequinar; ftorafur ((pró-fármaco; 5-fluoro-1-(tetra- hidro-2-furil)-uracil); 5,6-di-hidro-5-azacitidina; metotrexato; derivado de metotrexato (ácido N-[[4-[[(2,4-diamino-6-pteridinil)metil]metilamino]-1-naftalenil]carbonil]L-glutâmico); PALA ((N- (fosfonoacetil)-L-aspartato); pirazofurina; trimetrexato.Antimetabólito de DNA[00721] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise an RNA/DNA antimetabolite, such as gemcitabine, L-alanosine; 5-azacitidine; 5-fluorouracil; acivicin; aminopterin derivative N-[2-chloro-5[[(2,4-diamino-5-methyl-6-quinazolinyl)methyl]amino]benzoyl]L-aspartic acid (NSC 132483); aminopterin derivative N-[4-[[(2,4-diamino-5-ethyl-6-quinazolinyl)methyl]amino]benzoyl]L-aspartic acid; aminopterin derivative N-[2-chloro-4-[[(2,4-diamino-6-pteridinyl)methyl]amino]benzoyl]L-aspartic acid monohydrate; antifolate PT523 ((Nα-(4-amino-4-deoxypteroyl)-NY-hemifthaloyl-L-ornithine)); Baker's soluble antifol (NSC 139105); dichloralyl leisone ((2-(3,3-dichloroallyl)-3-hydroxy-1,4-naphthoquinone); brequinar; ftorafur ((prodrug; 5-fluoro-1-(tetrahydro-2-furyl)-uracil); 5,6-dihydro-5-azacytidine; methotrexate; methotrexate derivative (acid N-[[4-[[(2,4-diamino-6-pteridinyl)methyl]methylamino]-1-naphthalenyl]carbonyl]L-glutamic acid; PALA ((N-(phosphonoacetyl)-L-aspartate); pyrazofurin; trimetrexate. DNA antimetabolite
[00722] De acordo com algumas modalidades F16 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um antimetabólito de DNA tal como 3-HP; 2'-desóxi-5-fluorouridina; 5-HP; α-TGDR (α-2'- desóxi-6-tioguanosina); glicinato de afidicolina; araC (citosina arabino- sídeo); 5-aza-2'-desoxicitidina; β-TGDR (β-2'-des0xi-6-tioguanosina); ciclocitidina; guanazol; hidroxiureia; inosina glicodialdeído; macbecina II; pirazoloimidazol; tioguanina; tiopurina.Inibidor de mitocôndrias[00722] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise a DNA antimetabolite such as 3-HP; 2'-deoxy-5-fluorouridine; 5-HP; α-TGDR (α-2'-deoxy-6-thioguanosine); aphidicolin glycinate; araC (cytosine arabinoside); 5-aza-2'-deoxycytidine; β-TGDR (β-2'-deoxy-6-thioguanosine); cyclocytidine; guanazole; hydroxyurea; inosine glycodialdehyde; macbecine II; pyrazoloimidazole; thioguanine; thiopurine. Mitochondrial inhibitor
[00723] De acordo com algumas modalidades F17 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de mi- tocôndrias, tal como pancratistatina; fenpanstatina; rodamina-123; edelfosina; succinato de d-alfa-tocoferol; composto 11β; aspirina; elip- ticina; berberina; cerulenina; GX015-070 (Obatoclax®; 1H-Indole, 2-(2- ((3,5-dimetil-1H-pirrol-2-il)metileno)-3-metóxi-2H-pirrol-5-il)-); celastrol (tripterina); metformina; Verde brilhante; ME-344.Agente Antimitótico[00723] According to some embodiments F17 of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise a mitochondrial inhibitor, such as pancratistatin; fenpanstatin; rhodamine-123; edelfosine; d-alpha-tocopherol succinate; compound 11β; aspirin; ellipticin; berberine; cerulenin; GX015-070 (Obatoclax®; 1H-Indole, 2-(2-((3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl)methylene)-3-methoxy-2H-pyrrol-5-yl)-); celastrol (tripterin); metformin; Brilliant Green; ME-344. Antimitotic Agent
[00724] De acordo com algumas modalidades F18 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos compreendem um agente antimitó- tico, tal como alocolchicina; auristatinas, tais como MMAE (monometil auristatina E) e MMAF (monometil auristatina F); halicondrina B; ce- madotina; colchicina; derivado de colchicina (N-benzoil-desacetil ben- zamida); dolastatina-10; dolastatina-15; maitansina; maitansinoides, tais como DM1 (N2'-desacetil-N2'-(3-mercapto-1-oxopropil)-maitansina); rozoxina; paclitaxel; derivado de paclitaxel ((2'-N-[3- (dimetilamino)propil]glutaramato paclitaxel); docetaxel; tiocolchicina; tritilcisteína; sulfato de vinblastina; sulfato de vincristina.Inibidor de Exportação Nuclear[00724] According to some embodiments F18 of the third embodiments according to aspect 22, one or more other therapeutically active compounds comprise an antimitotic agent, such as alocolchicine; auristatins, such as MMAE (monomethyl auristatin E) and MMAF (monomethyl auristatin F); halicondrin B; cemadotin; colchicine; colchicine derivative (N-benzoyl-desacetyl benzamide); dolastatin-10; dolastatin-15; maytansine; maytansinoids, such as DM1 (N2'-desacetyl-N2'-(3-mercapto-1-oxopropyl)-maytansine); rozoxin; paclitaxel; Paclitaxel derivative ((2'-N-[3-(dimethylamino)propyl]glutamate paclitaxel); docetaxel; thiocolchicine; tritylcysteine; vinblastine sulfate; vincristine sulfate. Nuclear Export Inhibitor
[00725] De acordo com algumas modalidades F19 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um inibidor de exportação nu- clear, tal como calistatina A; delactonmicina; KPT-185 ((Z)-3-[3-[3- metóxi-5-(trifluorometil)fenil]-1,2,4-triazol-1-il]prop-2-enoato de propan- 2-ila); cazusamicina A; leptolstatina; leptofuranina A; leptomicina B; ratjadona; Verdinexor ((Z)-3-[3-[3,5-bis(trifluorometil)fenil]-1,2,4-triazol- 1-il]-N-piridin-2-ilprop-2-eno-hidrazida).Terapêuticos Hormonais[00725] According to some embodiments of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise a nuclear export inhibitor, such as calistatin A; delactonmycin; KPT-185 ((Z)-3-[3-[3-methoxy-5-(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,4-triazol-1-yl]prop-2-enoate); cazusamycin A; leptolstatin; leptofuranin A; leptomycin B; ratjadone; Verdinexor ((Z)-3-[3-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,4-triazol-1-yl]-N-pyridin-2-ylprop-2-enohydrazide). Hormonal Therapists
[00726] De acordo com algumas modalidades F20 das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, o um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreende(m) uma terapêutica hormonal tal como anastrozol; exemestano; arzoxifeno; bicalutamida; cetrorrelix; degarrelix; deslorelina; trilostano; dexametasona; flutamida; raloxifeno; fadrozol; toremifeno; fulvestranto; letrozol; formestano; glucocorticói- des; doxercalciferol; carbonato de sevelâmero; lasofoxifeno; acetato de leuprolida; megesterol; mifepristona; nilutamida; citrato de tamoxifeno; abarelix; prednisona; finasterida; rilostano; buserelina; hormona libertadora da hormona luteinizante (LHRH); Histrelina; trilostano ou mo- drastano; fosrelina; goserelina.[00726] According to some embodiments F20 of the third embodiments according to aspect 22, one or more therapeutically active compounds comprise(s) a hormonal therapy such as anastrozole; exemestane; arzoxifene; bicalutamide; cetrorelix; degarelix; deslorelin; trilostane; dexamethasone; flutamide; raloxifene; fadrozole; toremifene; fulvestrant; letrozole; formestane; glucocorticoids; doxercalciferol; sevelamer carbonate; lasofoxifene; leuprolide acetate; megesterol; mifepristone; nilutamide; tamoxifen citrate; abarelix; prednisone; finasteride; rilostane; buserelin; luteinizing hormone-releasing hormone (LHRH); histrelin; trilostane or modrastane; fosrelin; goserelin.
[00727] De acordo com algumas modalidades G das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem um anticorpo que tem como alvo células supressoras mieloides.[00727] According to some G embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more therapeutically active compounds comprise an antibody that targets myeloid suppressor cells.
[00728] De acordo com algumas modalidades H das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos terapeuticamente ativos compreendem agentes que iniciam células apresentadoras de antígeno (APC), que por sua vez podem ativar células T.[00728] According to some H-modalities of the third modalities according to the 22nd aspect, one or more therapeutically active compounds comprise agents that initiate antigen-presenting cells (APCs), which in turn can activate T cells.
[00729] De acordo com algumas modalidades I das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, um ou mais compostos te- rapeuticamente ativos compreendem um anticorpo BiTE. Os anticorpos BiTE são anticorpos biespecíficos que têm como alvo as células T para atacar as células cancerígenas, ligando simultaneamente as duas células. A célula T então ataca a célula alvo, isto é, a Treg. Por exemplo, uma abordagem BiTE é complementar à abordagem baseada em ADCC de um anticorpo CCR8 nu.Terapia Padrão[00729] According to some embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, one or more therapeutically active compounds comprise a BiTE antibody. BiTE antibodies are bispecific antibodies that target T cells to attack cancer cells by simultaneously binding to both cells. The T cell then attacks the target cell, i.e., the Treg. For example, a BiTE approach is complementary to the ADCC-based approach of a nuCCR8 antibody. Standard Therapy
[00730] De acordo com algumas modalidades J das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, a combinação é uma combinação com o padrão de tratamento para o tumor ou a doença caracterizada por receptor de quimiocina positivo, por exemplo, células positivas para CCR8. O padrão de atendimento pode ser o padrão de atendimento para qualquer leucemia linfoblástica aguda de células T, câncer de mama, câncer de mama triplo negativo, câncer de mama triplo positivo, câncer de pulmão de não pequenas células (NSCLC), câncer testicular, câncer gástrico, carcinoma de células escamosas de cabeça e pescoço, timoma, adenocarcinoma de esôfago, câncer color- retal, adenocarcinoma pancreático, câncer de ovário ou câncer cervical, leucemia mieloide aguda, câncer de rim, câncer de bexiga, melanoma, câncer de tireoide, mesotelioma, sarcoma e câncer de próstata.[00730] According to some J modalities of the third modalities according to the 22nd aspect, the combination is a combination with the standard of care for the tumor or disease characterized by positive chemokine receptor, for example, CCR8-positive cells. The standard of care may be the standard of care for any T-cell acute lymphoblastic leukemia, breast cancer, triple-negative breast cancer, triple-positive breast cancer, non-small cell lung cancer (NSCLC), testicular cancer, gastric cancer, squamous cell carcinoma of the head and neck, thymoma, esophageal adenocarcinoma, colorectal cancer, pancreatic adenocarcinoma, ovarian cancer or cervical cancer, acute myeloid leukemia, kidney cancer, bladder cancer, melanoma, thyroid cancer, mesothelioma, sarcoma, and prostate cancer.
[00731] De acordo com algumas modalidades preferidas, o padrão de atendimento é o padrão de atendimento para o tratamento de câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor de esôfago, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata. Em caso de dúvida, o padrão de tratamento é definido como no "S3 Leitli- nie" para o respectivo tumor, por exemplo, Leitlinie Analkarzinom, Akti- nische Keratose und Plattenepithelkarzinom der Haut, Chronische Lymphatische Leukamie (CLL), Endometriumkarzinom, Follikulares Lymphom, Harnblasenkarzinom, Hautkrebs-Pravention, Hepatozellu- lares Karzinom (HCC), Hodentumoren, Hodgkin-Lymphom, Kolorekta- les Karzinom, Larynxkarzinom, Lungenkarzinom, Magenkarzinom, Mammakarzinom, Melanom, Mundhoehlenkarzinom, Nierenzellkarzi- nom, Ovarialkarzinom, Osophaguskarzinom, Palliativmedizin, Pankreaskarzinom, Peniskarzinom, Prostatakarzinom, Psychoonkolo- gie, Supportive Therapie, Zervixkarzinom, em vigor em 26-06-2020, conforme https://www.leitlinienprogramm-onkologie.de/leitlinien/, incorporado aqui por referência em sua totalidade, conforme disponível em 01-06-2021.Radioterapia[00731] According to some preferred modalities, the standard of care is the standard of care for the treatment of head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer. In case of doubt, the standard of care is defined as in the "S3 Leitlinie" for the respective tumor, e.g. Leitlinie Analkarzinom, Aktinische Keratose und Plattenepithelkarzinom der Haut, Chronische Lymphatische Leukamie (CLL), Endometriumkarzinom, Follikulares Lymphom, Harnblasenkarzinom, Hautkrebs-Pravention, Hepatozellulars Karzinom (HCC), Hodentumoren, Hodgkin-Lymphom, Kolorektales Karzinom, Larynxkarzinom, Lungenkarzinom, Magenkarzinom, Mammakarzinom, Melanom, Mundhoehlenkarzinom, Nierenzellkarzinom, Ovarialkarzinom, Osophaguskarzinom, Palliativmedizin, Pankreaskarzinom, Peniskarzinom, Prostatakarzinom, Psychoonkolo- gie, Supportive Therapie, Zervixkarzinom, in effect as of 26-06-2020, as per https://www.leitlinienprogramm-onkologie.de/leitlinien/, incorporated herein by reference in its entirety, as available on 01-06-2021. Radiotherapy
[00732] De acordo com algumas modalidades K das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com as modalidades da primeira e/ou segunda modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso é um uso em simultâneo, combinação separada ou sequencial com radioterapia.[00732] According to some K modalities of the third modalities according to the 22nd aspect, which can be and are suggested to be combined with the modalities of the first and/or second modalities according to the 22nd aspect, the use is simultaneous, separate combination or sequential use with radiotherapy.
[00733] Por exemplo, a radioterapia pode ser uma terapia envolvendo um esquema de radiação como conhecido na técnica, por exemplo, compreendendo terapia de feixe externo por raios X com uma dose total típica de 40 Gy fracionada em 15 tratamentos diários ou uma dose total de 70 Gy fracionada a 37 tratamentos diários. Por exemplo, a radioterapia pode ser braquiterapia. O Exemplo 12.6.8 mostra um tratamento de combinação com um anticorpo anti-CCR8 e radioterapia.Terapia com células NK[00733] For example, radiotherapy may be a therapy involving a radiation regimen as known in the art, for example, comprising external beam X-ray therapy with a typical total dose of 40 Gy fractionated into 15 daily treatments or a total dose of 70 Gy fractionated into 37 daily treatments. For example, radiotherapy may be brachytherapy. Example 12.6.8 shows a combination treatment with an anti-CCR8 antibody and radiotherapy. NK cell therapy
[00734] De acordo com algumas modalidades L das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com as modalidades da primeira e/ou segunda modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso é um uso em simultâneo, combinação separada ou sequencial com terapia de células NK. A terapia de células NK pode, por exemplo, compreender o uso de uma linhagem de células NK manipulada como descrito em EP1771471 ou pode compreender o uso de células NK primárias iso- ladas, incluindo potencialmente modificações como um receptor quimérico, conforme WO2006052534.Direcionamento de moléculas da superfície celular associadas à ativação de células T[00734] According to some L modalities of the third modalities according to the 22nd aspect, which can be and are suggested to be combined with the modalities of the first and/or second modalities according to the 22nd aspect, the use is simultaneous, separate combination or sequential use with NK cell therapy. NK cell therapy may, for example, comprise the use of a manipulated NK cell line as described in EP1771471 or may comprise the use of isolated primary NK cells, potentially including modifications such as a chimeric receptor, as per WO2006052534. Targeting cell surface molecules associated with T cell activation
[00735] De acordo com algumas modalidades M das terceiras modalidades do 22° aspecto, é fornecido o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para uso em combinação simultânea, separada ou sequencial com um ou mais outros compostos terapeuticamente ativos que têm como alvo moléculas de superfície celular associadas à ativação de células T, selecionadas de CD25, CTLA-4, PD-1, LAG3, TIGIT, ICOS e membros da superfamília de receptores de TNF, 4-1BB, OX-40, e GITR.Depleção de células B[00735] According to some embodiments of the third embodiments of aspect 22, the antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19, or the pharmaceutical composition according to aspect 20, is provided for use in simultaneous, separate or sequential combination with one or more other therapeutically active compounds targeting cell surface molecules associated with T cell activation, selected from CD25, CTLA-4, PD-1, LAG3, TIGIT, ICOS and members of the TNF receptor superfamily, 4-1BB, OX-40, and GITR. B cell depletion
[00736] De acordo com algumas modalidades N das terceiras modalidades de acordo com o 22° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com as modalidades da primeira e/ou segunda modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso é um uso em simultâneo, combinação separada ou sequencial com depleção de células B intratumoral. A depleção de células B intratumorais pode ocorrer pela administração de um anticorpo ou outra molécula ou qualquer outro tratamento direcionado especificamente para células B intratu- morais, preferivelmente células B CD19+. O Exemplo 12.3.2 mostra um tratamento em que um anticorpo anti-CCR8 foi administrado e as células B CD19+ intratumorais foram esgotadas. Embora a depleção de células T CD8+ tenha abolido o efeito benéfico do tratamento com um anticorpo anti-CCR8, foi surpreendentemente descoberto que a depleção de células B melhorou o efeito benéfico do tratamento com um anticorpo anti-CCR8. Sem limitação, a depleção de células B pode ocorrer usando um anticorpo que tem como alvo a CD19 ou CD20 ou outro marcador de células B adequado.Esquemas de estratificação / previsão e monitoramento[00736] According to some N embodiments of the third embodiments according to the 22nd aspect, which can be and are suggested to be combined with the embodiments of the first and/or second embodiments according to the 22nd aspect, the use is simultaneous, separate combination or sequential use with intratumoral B cell depletion. Intratumoral B cell depletion can occur by administering an antibody or other molecule or any other treatment specifically targeted to intratumoral B cells, preferably CD19+ B cells. Example 12.3.2 shows a treatment in which an anti-CCR8 antibody was administered and intratumoral CD19+ B cells were depleted. Although CD8+ T cell depletion abolished the beneficial effect of treatment with an anti-CCR8 antibody, it was surprisingly found that B cell depletion enhanced the beneficial effect of treatment with an anti-CCR8 antibody. Without limitation, B cell depletion can be achieved using an antibody that targets CD19 or CD20 or another suitable B cell marker. Stratification/prediction and monitoring schemes
[00737] As etapas de estratificação descritas de acordo com as modalidades a seguir também são fornecidas como métodos independentes, por exemplo, para estratificação, diagnóstico ou monitoramento do sucesso do tratamento para um tratamento com anticorpo anti- CCR8.[00737] The stratification steps described according to the following modalities are also provided as independent methods, for example, for stratification, diagnosis or monitoring of treatment success for an anti-CCR8 antibody treatment.
[00738] De acordo com algumas quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, que podem ser e são sugeridas ser combinadas com as modalidades da primeira, segunda e/ou terceira modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende determinar certos parâmetros para prever ou monitorar o sucesso do tratamento, por exemplo, para estratificar um grupo de indivíduos ou pacientes para prever a resposta do tumor ou monitorar o sucesso do tratamento. Por exemplo, os indivíduos podem ser humanos ou não humanos, tais como camundongo, roedor ou cinomolgo.[00738] According to some fourth modalities according to the 22nd aspect, which can be and are suggested to be combined with the modalities of the first, second and/or third modalities according to the 22nd aspect, the use comprises determining certain parameters to predict or monitor treatment success, for example, to stratify a group of individuals or patients to predict tumor response or monitor treatment success. For example, the individuals may be human or non-human, such as mice, rodents or cynomolgus.
[00739] De acordo com algumas modalidades A das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende determinar:a. a presença ou quantidade de linfócitos infiltrantes tumo- rais,b. a presença ou quantidade de macrófagos e/ou células NK,c. a presença ou quantidade de células T regulatórias positivas para CCR8 ou positivas para FOXP3,d. a carga mutacional do tumor, e. o estadiamento do câncer, f. a presença, nível ou ativação de genes ou proteínas estimulados por interferon, g. a expressão CCR8,h. a presença ou quantidade de proteínas do fator do complemento, serpinas e/ou componentes do MHC,i. a presença ou quantidade de citocinas, como citocinas inflamatórias ou supressoras,j. a ativação da expressão de genes imunes,k. a expressão de proteína de ponto de verificação imuno-lógica, como expressão de PD-(L)1 ou CTLA4,l. a presença ou quantidade de células B CD19+ infiltradas no tumor e/oum. a presença ou quantidade de células T CD8+ infiltradas no tumor,para estratificar um grupo de indivíduos ou pacientes para prever a resposta do tumor, ou para prever ou monitorar o sucesso do tratamento.[00739] According to some modalities A of the fourth modalities according to the 22nd aspect, the use comprises determining: a. the presence or quantity of tumor-infiltrating lymphocytes, b. the presence or quantity of macrophages and/or NK cells, c. the presence or quantity of regulatory T cells positive for CCR8 or positive for FOXP3, d. the mutational load of the tumor, e. the cancer staging, f. the presence, level or activation of genes or proteins stimulated by interferon, g. the CCR8 expression, h. the presence or quantity of complement factor proteins, serpins and/or MHC components, i. the presence or quantity of cytokines, such as inflammatory or suppressive cytokines, j. the activation of immune gene expression, k. the expression of immune checkpoint protein, such as PD-(L)1 or CTLA4 expression, l. The presence or quantity of CD19+ B cells infiltrating the tumor and/or the presence or quantity of CD8+ T cells infiltrating the tumor, to stratify a group of individuals or patients to predict tumor response, or to predict or monitor treatment success.
[00740] De acordo com algumas modalidades A1 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende determinar a presença ou quantidade de (a) linfócitos infiltrantes de tumor, (b) macrófagos e/ou células NK e/ou (c) células T regulatórias positivas para CCR8 ou FOXP3 positivas. A avaliação da presença ou quantidade de tipos de células como (a) linfócitos infiltrantes tumorais, (b) macrófagos e/ou células NK e/ou (c) células T regulatórias positivas para CCR8 podem ocorrer usando biópsia, tal como biópsia de pele, biópsia cirúrgica, biópsia endoscópica ou biópsia por agulha, como aspiração por agulha fina, biópsia por agulha grossa, biópsia assistida por vácuo ou biópsia guiada por imagem e coloração subsequente. O número ou quantidade relativa de (a) linfócitos infiltrantes de tumor, (b) macrófagos e/ou células NK e/ou (c) células T regulatórias positivas para CCR8 podem então ser comparados a uma referência, por exemplo, uma amostra de referência ou um valor de referência. A presença ou quantidade relativa de (a) linfócitos infiltrantes de tumor, (b) macrófagos e/ou células NK e/ou (c) células T regulatórias positivas para CCR8 podem ser usadas para prever uma resposta favorável ao tratamento com um anticorpo ou fragmento de acordo com para a presente invenção. Em alternativa, pode ser usado um sistema de pontuação, por exemplo, para determinar o número ou quantidade relativa de linfócitos infiltrantes de tumor, tal como o sistema de pontuação descrito em Zhang, Dachuan, et al. "Scoring system for tumorinfiltrating lymphocytes and its prognostic value for gastric cancer." Frontiers in immunology 10 (2019): 71.[00740] According to some A1 modalities of the fourth modalities according to the 22nd aspect, the use comprises determining the presence or quantity of (a) tumor-infiltrating lymphocytes, (b) macrophages and/or NK cells and/or (c) CCR8-positive or FOXP3-positive regulatory T cells. The assessment of the presence or quantity of cell types such as (a) tumor-infiltrating lymphocytes, (b) macrophages and/or NK cells and/or (c) CCR8-positive regulatory T cells may occur using biopsy, such as skin biopsy, surgical biopsy, endoscopic biopsy or needle biopsy, such as fine needle aspiration, core needle biopsy, vacuum-assisted biopsy or image-guided biopsy and subsequent staining. The number or relative quantity of (a) tumor-infiltrating lymphocytes, (b) macrophages and/or NK cells, and/or (c) CCR8-positive regulatory T cells can then be compared to a reference, for example, a reference sample or a reference value. The presence or relative quantity of (a) tumor-infiltrating lymphocytes, (b) macrophages and/or NK cells, and/or (c) CCR8-positive regulatory T cells can be used to predict a favorable response to treatment with an antibody or fragment according to the present invention. Alternatively, a scoring system can be used, for example, to determine the number or relative quantity of tumor-infiltrating lymphocytes, such as the scoring system described in Zhang, Dachuan, et al. "Scoring system for tumor-infiltrating lymphocytes and its prognostic value for gastric cancer." Frontiers in Immunology 10 (2019): 71.
[00741] De acordo com algumas modalidades A2 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende determinar a carga mutacional do tumor para prever e monitorar a resposta do tumor. A carga mutacional tumoral (TMB) é um biomarcador que mede o número de mutações somáticas presentes no tumor de um paciente com câncer e é quantificada como mutações por megabase (mut/Mb). Esta métrica pode ser usada para estratificar pacientes, por exemplo, para prever ou monitorar a resposta ao tratamento com um anticorpo ou conjugado de acordo com a presente invenção. Existem testes aprovados pela FDA e podem ser usados, por exemplo, com um valor de referência de >10 mut/Mb. Em alternativa, a instabilidade de microssatélites (MSI) pode ser usada para estratificação, que é causada pela falha do sistema de reparo de desemparelhamento de DNA.[00741] According to some A2 embodiments of the fourth embodiments according to the 22nd aspect, the use comprises determining the tumor mutational burden to predict and monitor tumor response. Tumor mutational burden (TMB) is a biomarker that measures the number of somatic mutations present in a cancer patient's tumor and is quantified as mutations per megabase (mut/Mb). This metric can be used to stratify patients, for example, to predict or monitor the response to treatment with an antibody or conjugate according to the present invention. There are FDA-approved tests that can be used, for example, with a reference value of >10 mut/Mb. Alternatively, microsatellite instability (MSI) can be used for stratification, which is caused by the failure of the DNA mismatch repair system.
[00742] De acordo com algumas modalidades A3 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende determinar o estadiamento do câncer para prever e monitorar a resposta do tumor. O estadiamento do câncer pode ser realizado como conhecido na técnica, por exemplo, usando o sistema de classificação TNM ou o estadiamento FIGO, e pode ser usado para estratificar pacientes, por exemplo, para prever ou monitorar a resposta ao tratamento com um anticorpo ou conjugado de acordo com a presente invenção.[00742] According to some embodiments A3 of the fourth embodiments according to the 22nd aspect, the use comprises determining cancer staging to predict and monitor tumor response. Cancer staging can be performed as known in the art, for example, using the TNM classification system or FIGO staging, and can be used to stratify patients, for example, to predict or monitor response to treatment with an antibody or conjugate according to the present invention.
[00743] De acordo com algumas modalidades A4 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende a determinação da presença, nível ou ativação de genes ou proteínas estimulados por interferon ou interferon para prever e monitorar a resposta tumoral. Um gene estimulado por interferon é um gene cuja expressão é estimulada por interferon, em particular por IFNg. Os genes ou proteínas estimulados por interferon adequados incluem, sem limitação, ACOD1, ACTG1, ACTR2, ACTR3, ADAMTS13, AIF1, AQP4, ASS1, B2M, BST2, C9JQL5, CALCOCO2, CAMK2A, CAMK2B, CAMK2D, CAMK2G, CASP1, CCL1, CCL11, CCL13, CCL14, CCL15, CCL15, CCL14, CCL16, CCL17, CCL18, CCL19, CCL2, CCL20, CCL21, CCL22, CCL23, CCL24, CCL25, CCL26, CCL3, CCL3L1, CCL4, CCL4L1, CCL5, CCL7, CCL8, CD40, CD44, CD58, CDC42EP2, CDC42EP4, CIITA, CITED1, CLDN1, CX3CL1, CXCL16, CYP27B1 DAPK1, DAPK3, EDN1, EPRS, EVL, FCGR1A, FCGR1B, FLNB, GA- PDH, GBP1, GBP2, GBP4, GBP5, GBP6, GCH1, GSN, HCK, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQA2, HLA- DQB1, HLA-DQB2, HLA-DRA HLA-DRB1, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-E, HLA-F, HLA-G, HLA-H, ICAM1, IFI30, IFITM1, IFITM2, IFITM3, IFNG, IFNGR1, IFNGR2, IL12B, IL12RB1 IL23R, IRF1, IRF2, IRF3, IRF4, IRF5, IRF6, IRF7, IRF8, IRF9, JAK1, JAK2, KIF16B, KIF5B, KYNU, LGALS9, MEFV, MID1, MRC1, MT2A, MYO1C, NCAM1, NMI, NOS2, NUB1, OAS1, OAS2, OAS3, OASL, PDE12, PML, PRKCD, PTAFR, RAB12, RAB20, RAB43, RAB7B, RPL13A, RPS6KB1 RYDEN, SEC61A1 SLC11A1 SLC26A6 SLC30A8 SNCA, SP100, STAR, STAT1, STX4, STX8, STXBP1, STXBP2, STXBP3, STXBP4, SYNCRIP TDGF1, TLR2, TLR3, TLR4, TRIM21, TRIM22, TRIM25, TRIM26, TRIM31, TRIM34, TRIM38, TRIM5, TRIM62, TRIM68, TRIM8, UBD, VAMP3, VCAM1, VIM, VPS26B, WAS, WNT5A, XCL1, XCL2, ZYX.[00743] According to some A4 modalities of the fourth modalities according to the 22nd aspect, the use comprises the determination of the presence, level or activation of interferon-stimulated genes or proteins or interferon to predict and monitor tumor response. An interferon-stimulated gene is a gene whose expression is stimulated by interferon, in particular by IFNγ. Suitable interferon-stimulated genes or proteins include, but are not limited to, ACOD1, ACTG1, ACTR2, ACTR3, ADAMTS13, AIF1, AQP4, ASS1, B2M, BST2, C9JQL5, CALCOCO2, CAMK2A, CAMK2B, CAMK2D, CAMK2G, CASP1, CCL1, CCL11, CCL13, CCL14, CCL15, CCL15, CCL14, CCL16, CCL17, CCL18, CCL19, CCL2, CCL20, CCL21, CCL22, CCL23, CCL24, CCL25, CCL26, CCL3, CCL3L1, CCL4, CCL4L1, CCL5, CCL7, CCL8, CD40, CD44, CD58, CDC42EP2, CDC42EP4, CIITA, CITED1, CLDN1, CX3CL1, CXCL16, CYP27B1 DAPK1, DAPK3, EDN1, EPRS, EVL, FCGR1A, FCGR1B, FLNB, GA-PDH, GBP1, GBP2, GBP4, GBP5, GBP6, GCH1, GSN, HCK, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQA2, HLA-DQB1, HLA-DQB2, HLA-DRA HLA-DRB1, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-E, HLA-F, HLA-G, HLA-H, ICAM1, IFI30, IFITM1, IFITM2, IFITM3, IFNG, IFNGR1, IFNGR2, IL12B, IL12RB1 IL23R, IRF1, IRF2, IRF3, IRF4, IRF5, IRF6, IRF7, IRF8, IRF9, JAK1, JAK2, KIF16B, KIF5B, KYNU, LGALS9, MEFV, MID1, MRC1, MT2A, MYO1C, NCAM1, NMI, NOS2, NUB1, OAS1, OAS2, OAS3, OASL, PDE12, PML, PRKCD, PTAFR, RAB12, RAB20, RAB43, RAB7B, RPL13A, RPS6KB1 RYDEN, SEC61A1 SLC11A1 SLC26A6 SLC30A8 SNCA, SP100, STAR, STAT1, STX4, STX8, STXBP1, STXBP2, STXBP3, STXBP4, SYNCRIP TDGF1, TLR2, TLR3, TLR4, TRIM21, TRIM22, TRIM25, TRIM26, TRIM31, TRIM34, TRIM38, TRIM5, TRIM62, TRIM68, TRIM8, UBD, VAMP3, VCAM1, VIM, VPS26B, WAS, WNT5A, XCL1, XCL2, ZYX.
[00744] De acordo com algumas modalidades A5 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende determinar a expressão de CCR8 para prever e monitorar a resposta do tumor. Os níveis de expressão de CCR8 podem ser determinados, por exemplo, com base em amostras de biópsia, como conhecido na técnica, por exemplo, usando métodos baseados em IHC, PCR ou ELISA, por exemplo, usando um anticorpo, fragmento ou conjugado como descrito aqui.[00744] According to some A5 modalities of the fourth modalities according to the 22nd aspect, the use comprises determining CCR8 expression to predict and monitor tumor response. CCR8 expression levels can be determined, for example, based on biopsy samples, as known in the art, for example, using IHC, PCR or ELISA-based methods, for example, using an antibody, fragment or conjugate as described herein.
[00745] De acordo com algumas modalidades A6 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende a determinação da presença, nível ou ativação de genes ou proteínas selecionadas de (a) proteínas do fator de complemento, (b) serpinas, (c) componentes do MHC ou (d) Arg2 ou (e) outro biomarcador aqui descrito (veja, por exemplo, Exemplo 12.7.1 ou 12.7.2) para prever e monitorar a resposta do tumor. Proteínas de fator de complemento adequadas incluem, sem limitação, C1R, C1S, C4A, C5ar2, F12 e MASP2, ou seus análogos das respectivas espécies para tratamento. Serpinas adequadas incluem, sem limitação, Serpina1a, Serpina1b, Serpina1d, Serpina3i ou seus análogos de outras espécies. Os com-ponentes de MHC adequados incluem, sem limitação, H2-K2, H2-T24, H2-Q10, H2-Bl, H2-Q1, H2-Q5 e H2-DMb2, ou seus análogos de outras espécies.[00745] According to some A6 embodiments of the fourth embodiments according to the 22nd aspect, the use comprises determining the presence, level, or activation of selected genes or proteins of (a) complement factor proteins, (b) serpins, (c) MHC components, or (d) Arg2, or (e) another biomarker described herein (see, for example, Example 12.7.1 or 12.7.2) to predict and monitor tumor response. Suitable complement factor proteins include, without limitation, C1R, C1S, C4A, C5ar2, F12, and MASP2, or their respective species analogues for treatment. Suitable serpins include, without limitation, Serpina1a, Serpina1b, Serpina1d, Serpina3i, or their other species analogues. Suitable MHC components include, without limitation, H2-K2, H2-T24, H2-Q10, H2-Bl, H2-Q1, H2-Q5 and H2-DMb2, or their analogues from other species.
[00746] Como descrito no Exemplo 12.1.2, os inventores descobriram com base em dados RNA-seq de genoma de tumores precoces de modelos de camundongos singênicos, que níveis aumentados dos seguintes genes fortemente correlacionados com a resposta do tumor: Eif3j2, Eno1b, Ifi44l, Hist1h2al, Ifi202b, Hmga1b, Amd2, Sycp1, Itln1, Trim34b, Catsperg2, Zfp868, Serpina1b, Prss41, C1rb, Cyld, Ccnb1ip1, Masp2, Acaa1b, C4a, Snord93, Abhd1, Serpina3h, H2-K2, Cd1d2, Hal, Rnf151, Rbm46, Arg2, Mir8099-2, Igsf21, Olfr373, C1s2, Crym, Arv1, Hddc3, Plppr4, Ppp1r11, Rps3a2, Zfp459, Rnd1, Serpi- na1a, Vcpkmt, Atp10d, Gbp2b, H2-T24, Tlcd2, Ctse, H2-Q10, Cyp2c55, Borcs8, Tpsab1,Trim43b, Cc2d1a, Serpina1d, Cacna1a, Kcnj14, Ttc13, Farsa, Olfr1217, Jaml, H2-Bl, Tnpo2, Rims3, Dock9, Car5b, Atp1a4, H2-Q1, Zfp69, Slpi, Pcdhgb8, Ocel1, Selenbp2, Nsd3, Wt1, Nap1l2, Ranbp9, Gtpbp3, AY761185, Rnaset2a, Serpina3i, Ell2, Gal3st2b, Urb2, F12, Klk1, Ifi214, Cstl1, Agtpbp1, Msh5, Cox18, Zfp330, Ttc37, Klk4, H2-Q5, Cxcl11, Rab39, Pm20d1, Nod2, H2- DMb2. Interessantemente, este conjunto é altamente enriquecido para fatores precoces do complemento, fatores reguladores do complemento, como Serpins e componentes do MHC. Em particular, a presença de altos níveis de Complemento C1/C4 pode contribuir para a lise de Treg. Quando a depleção/consumo de fatores do complemento reduz a eficácia da depleção de Treg, a suplementação do sistema de complemento, por exemplo, em um tratamento combinado, pode ser uma opção.[00746] As described in Example 12.1.2, the inventors discovered, based on RNA-seq genome data from early tumors in syngeneic mouse models, that increased levels of the following genes strongly correlated with tumor response: Eif3j2, Eno1b, Ifi44l, Hist1h2al, Ifi202b, Hmga1b, Amd2, Sycp1, Itln1, Trim34b, Catsperg2, Zfp868, Serpina1b, Prss41, C1rb, Cyld, Ccnb1ip1, Masp2, Acaa1b, C4a, Snord93, Abhd1, Serpina3h, H2-K2, Cd1d2, Hal, Rnf151, Rbm46, Arg2, Mir8099-2, Igsf21, Olfr373, C1s2, Crym, Arv1, Hddc3, Plppr4, Ppp1r11, Rps3a2, Zfp459, Rnd1, Serpina1a, Vcpkmt, Atp10d, Gbp2b, H2-T24, Tlcd2, Ctse, H2-Q10, Cyp2c55, Borcs8, Tpsab1, Trim43b, Cc2d1a, Serpina1d, Cacna1a, Kcnj14, Ttc13, Farsa, Olfr1217, Jaml, H2-Bl, Tnpo2, Rims3, Dock9, Car5b, Atp1a4, H2-Q1, Zfp69, Slpi, Pcdhgb8, Ocel1, Selenbp2, Nsd3, Wt1, Nap1l2, Ranbp9, Gtpbp3, AY761185, Rnaset2a, Serpina3i, Ell2, Gal3st2b, Urb2, F12, Klk1, Ifi214, Cstl1, Agtpbp1, Msh5, Cox18, Zfp330, Ttc37, Klk4, H2-Q5, Cxcl11, Rab39, Pm20d1, Nod2, H2-DMb2. Interestingly, this set is highly enriched for early complement factors, complement regulatory factors such as Serpins, and MHC components. In particular, the presence of high levels of Complement C1/C4 may contribute to Treg lysis. When depletion/consumption of complement factors reduces the effectiveness of Treg depletion, supplementation of the complement system, for example in a combination treatment, may be an option.
[00747] De acordo com algumas modalidades preferidas das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende determinar a presença, nível ou ativação de genes ou proteínas selecionados de Eif3j2, Eno1b, Ifi44l, Hist1h2al, Ifi202b, Hmga1b, Amd2, Sycp1, Itln1, Trim34b, Catsperg2, Zfp868, Serpina1b, Prss41, C1rb, Cyld, Ccnb1ip1, Masp2, Acaa1b, C4a, Snord93, Abhd1, Serpina3h, H2-K2, Cd1d2, Hal, Rnf151, Rbm46, Arg2, Mir8099-2, Igsf21, Olfr373, C1s2, Crym, Arv1, Hddc3, Plppr4, Ppp1r11, Rps3a2, Zfp459, Rnd1, Serpina1a, Vcpkmt, Atp10d, Gbp2b, H2-T24, Tlcd2, Ctse, H2-Q10, Cyp2c55, Borcs8, Tpsab1,Trim43b, Cc2d1a, Serpina1d, Cacna1a, Kcnj14, Ttc13, Farsa, Olfr1217, Jaml, H2-Bl, Tnpo2, Rims3, Dock9, Car5b, Atp1a4, H2-Q1, Zfp69, Slpi, Pcdhgb8, Ocel1, Selenbp2, Nsd3, Wt1, Nap1l2, Ranbp9, Gtpbp3, AY761185, Rnaset2a, Serpina3i, Ell2, Gal3st2b, Urb2, F12, Klk1, Ifi214, Cstl1, Agtpbp1, Msh5, Cox18, Zfp330, Ttc37, Klk4, H2-Q5, Cxcl11, Rab39, Pm20d1, Nod2, H2-DMb2 ou qualquer combinação do mesmo para prever e monitorar a resposta do tumor. Conforme imediatamente entendido pela pessoa versada, para um indivíduo humano, o método de estratificação, predição ou monitoramento compreende determinar a presença, nível ou ativação das contrapartes humanas dos genes ou proteínas fornecidos.[00747] According to some preferred embodiments of the fourth embodiments according to the 22nd aspect, the use comprises determining the presence, level or activation of selected genes or proteins of Eif3j2, Eno1b, Ifi44l, Hist1h2al, Ifi202b, Hmga1b, Amd2, Sycp1, Itln1, Trim34b, Catsperg2, Zfp868, Serpina1b, Prss41, C1rb, Cyld, Ccnb1ip1, Masp2, Acaa1b, C4a, Snord93, Abhd1, Serpina3h, H2-K2, Cd1d2, Hal, Rnf151, Rbm46, Arg2, Mir8099-2, Igsf21, Olfr373, C1s2, Crym, Arv1, Hddc3, Plppr4, Ppp1r11, Rps3a2, Zfp459, Rnd1, Serpina1a, Vcpkmt, Atp10d, Gbp2b, H2-T24, Tlcd2, Ctse, H2-Q10, Cyp2c55, Borcs8, Tpsab1, Trim43b, Cc2d1a, Serpina1d, Cacna1a, Kcnj14, Ttc13, Farsa, Olfr1217, Jaml, H2-Bl, Tnpo2, Rims3, Dock9, Car5b, Atp1a4, H2-Q1, Zfp69, Slpi, Pcdhgb8, Ocel1, Selenbp2, Nsd3, Wt1, Nap1l2, Ranbp9, Gtpbp3, AY761185, Rnaset2a, Serpina3i, Ell2, Gal3st2b, Urb2, F12, Klk1, Ifi214, Cstl1, Agtpbp1, Msh5, Cox18, Zfp330, Ttc37, Klk4, H2-Q5, Cxcl11, Rab39, Pm20d1, Nod2, H2-DMb2 or any combination thereof to predict and monitor tumor response. As immediately understood by the skilled person, for a human individual, the method of stratification, prediction or monitoring comprises determining the presence, level or activation of the human counterparts of the genes or proteins provided.
[00748] De acordo com algumas modalidades A7 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende a determinação da presença ou quantidade de citocinas inflamatórias ou supressoras para prever e monitorar a resposta do tumor. A avaliação da presença ou quantidade de citocinas inflamatórias ou supressoras pode ocorrer como conhecido na técnica.[00748] According to some A7 modalities of the fourth modalities according to the 22nd aspect, the use comprises the determination of the presence or quantity of inflammatory or suppressive cytokines to predict and monitor tumor response. The assessment of the presence or quantity of inflammatory or suppressive cytokines may occur as known in the art.
[00749] De acordo com algumas modalidades A8 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende prever ou monitorar a resposta do tumor com base na ativação da expressão do gene imune. A medição da ativação da expressão do gene imune pode ocorrer usando um método conhecido na técnica, por exemplo, usando análise de enriquecimento do conjunto de genes ou usando um ensaio baseado em marcador conhecido na técnica. Além disso, estratificação, previsão ou monitoramento podem ocorrer com base em uma característica de assinatura gênica para Tregs ativadas ou células imunes.[00749] According to some A8 modalities of the fourth modalities according to the 22nd aspect, the use comprises predicting or monitoring tumor response based on the activation of immune gene expression. Measurement of immune gene expression activation may occur using a method known in the art, for example, using gene set enrichment analysis or using a marker-based assay known in the art. In addition, stratification, prediction, or monitoring may occur based on a gene signature characteristic for activated Tregs or immune cells.
[00750] De acordo com algumas modalidades altamente preferidas A9 das quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto, o uso compreende estratificar um grupo de indivíduos ou pacientes para prever a resposta tumoral com base na expressão da proteína do ponto de verificação imunológica, tal como expressão de PD-L1, expressão de PD-1 ou expressão de CTLA4, ou o uso compreende determinar os níveis de expressão de proteína de ponto de verificação imunológica, tal como expressão de PD-L1, expressão de PD-1 ou expressão de CTLA4 para prever e monitorar a resposta do tumor.[00750] According to some highly preferred A9 modalities of the fourth modalities according to the 22nd aspect, the use comprises stratifying a group of individuals or patients to predict tumor response based on the expression of immune checkpoint protein, such as PD-L1 expression, PD-1 expression or CTLA4 expression, or the use comprises determining the expression levels of immune checkpoint protein, such as PD-L1 expression, PD-1 expression or CTLA4 expression to predict and monitor tumor response.
[00751] O ligante de morte programada 1 (PD-L1) é um biomarca- dor relacionado ao sistema imunológico que pode ser expresso na superfície de muitos tipos de tecidos, incluindo células tumorais. A expressão da proteína PD-L1 pode ser determinada usando Pontuação de Proporção de Tumor (TPS) ou Pontuação Positiva Combinada (CPS). De acordo com a presente invenção, descobriu-se surpreendentemente que a resposta à (mono)terapia com anticorpo anti-CCR8 foi melhorada para indivíduos com um tumor responsivo a ICI e, em particular, um tumor com (alta) expressão de PD-L1 (conforme Exemplo 12.7). Seguindo esta observação, os inventores descobriram que a infiltração com células Treg FoxP3+ também estava associada à alta expressão de PD-L1. Os inventores, portanto, sugerem PD-L1 como um marcador substituto para estratificação para superar o problema de que CCR8 é difícil de analisar e, portanto, não pode ser facilmente usado para selecionar populações de indivíduos que provavelmente poderiam se beneficiar do tratamento com anticorpo anti-CCR8. Em modalidades particularmente preferidas, a expressão de PD-L1 é determinada com base em CPS ou TPS. Um indivíduo ou paciente é determinado como elegível para tratamento com um anticorpo anti- CCR8, se a expressão de PD-L1 estiver presente ou alta, por exemplo, conforme indicado por um CPS > 1, preferivelmente por um CPS > 5, mais preferivelmente por um CPS > 10, ou conforme indicado por um TPS > 1%, preferivelmente por um TPS > 10%, mais preferivelmente por um TPS > 50%.[00751] Programmed death ligand 1 (PD-L1) is an immune-related biomarker that can be expressed on the surface of many tissue types, including tumor cells. PD-L1 protein expression can be determined using Tumor Ratio Score (TPS) or Combined Positive Score (CPS). According to the present invention, it was surprisingly found that the response to anti-CCR8 antibody (mono)therapy was improved for individuals with an ICI-responsive tumor and, in particular, a tumor with (high) PD-L1 expression (as per Example 12.7). Following this observation, the inventors found that infiltration with FoxP3+ Treg cells was also associated with high PD-L1 expression. The inventors therefore suggest PD-L1 as a surrogate marker for stratification to overcome the problem that CCR8 is difficult to analyze and therefore cannot be easily used to select populations of individuals who could likely benefit from anti-CCR8 antibody treatment. In particularly preferred embodiments, PD-L1 expression is determined based on CPS or TPS. An individual or patient is determined as eligible for treatment with an anti-CCR8 antibody if PD-L1 expression is present or high, for example, as indicated by a CPS > 1, preferably by a CPS > 5, more preferably by a CPS > 10, or as indicated by a TPS > 1%, preferably by a TPS > 10%, more preferably by a TPS > 50%.
[00752] Os anticorpos receptor antiquimiocina ou anti-CCR8, fragmentos e conjugados como descritos aqui podem ser usados para uma variedade de propósitos, tal como para auxiliar a purificação ou imobilização do receptor de quimiocina ou células que expressam CCR8, tais como Tregs ativadas ou intratumorais, para aplicações ou diagnósticos in vitro, in vivo e ex vivo. Como exemplo específico, os anticorpos podem ser usados em imunoensaios para medir qualitativamente e/ou quantitativamente os níveis de receptores de quimioci- nas ou células que expressam receptores de quimiocinas em amostras biológicas, veja, por exemplo, Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, Segunda Edição (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1988).[00752] Anti-chemokine receptor or anti-CCR8 antibodies, fragments and conjugates as described herein can be used for a variety of purposes, such as to aid the purification or immobilization of the chemokine receptor or CCR8-expressing cells, such as activated or intratumoral Tregs, for in vitro, in vivo and ex vivo applications or diagnostics. As a specific example, antibodies can be used in immunoassays to qualitatively and/or quantitatively measure the levels of chemokine receptors or cells expressing chemokine receptors in biological samples; see, for example, Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, Second Edition (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1988).
[00753] Por exemplo, anticorpos receptor antiquimiocina, anticorpos anti-CCR8 ou seus fragmentos de ligação ao antígeno podem ser usados para detectar a presença de tumores que expressam o receptor de quimiocina ou CCR8. A presença ou o nível de células que expressam o receptor de quimiocina ou CCR8 ou o receptor de quimiocina ou CCR8 liberado em várias amostras biológicas, incluindo soro e espécimes de biópsia de tecido, podem ser analisados. Além disso, anticorpos de receptor antiquimiocina ou anti-CCR8 podem ser usados em várias metodologias de imagem, tal como imunocintilografia com um anticorpo conjugado com 99Tc (ou um isótopo diferente). Por exemplo, um protocolo de imagem semelhante ao descrito usando um anticorpo anti-PSMA conjugado 111In pode ser usado para detectar câncer (So- dee, D. Bruce, et al. "Preliminary Imaging Results Using In-111 Labeled CYT-356 (Prostascintst) in the Detection of Recurrent Prostate Cancer." Clinical nuclear medicine 21.10 (1996): 759-767.). Outro método de detecção que pode ser usado é a tomografia por emissão de pósitrons, por exemplo, conjugando os anticorpos da invenção com um isótopo adequado (ver Herzog, Hans, et al. "Measurement of pharmacokinetics of yttrium-86 radiopharmaceuticals com PET and radiation dose calculation of analogous yttrium-90 radiotherapeutics." Journal of Nuclear Medicine 34.12 (1993): 2222-2226.)[00753] For example, anti-chemokine receptor antibodies, anti-CCR8 antibodies, or their antigen-binding fragments can be used to detect the presence of tumors expressing the chemokine receptor or CCR8. The presence or level of cells expressing the chemokine receptor or CCR8, or the chemokine receptor or CCR8 released in various biological samples, including serum and tissue biopsy specimens, can be analyzed. Furthermore, anti-chemokine receptor or anti-CCR8 antibodies can be used in various imaging methodologies, such as immunoscintigraphy with a 99Tc-conjugated antibody (or a different isotope). For example, an imaging protocol similar to that described using an anti-PSMA antibody conjugated to 111In can be used to detect cancer (Sodee, D. Bruce, et al. "Preliminary Imaging Results Using In-111 Labeled CYT-356 (Prostascintst) in the Detection of Recurrent Prostate Cancer." Clinical Nuclear Medicine 21.10 (1996): 759-767). Another detection method that can be used is positron emission tomography, for example, by conjugating the antibodies of the invention with a suitable isotope (see Herzog, Hans, et al. "Measurement of pharmacokinetics of yttrium-86 radiopharmaceuticals with PET and radiation dose calculation of analogous yttrium-90 radiotherapeutics." Journal of Nuclear Medicine 34.12 (1993): 2222-2226).
[00754] De acordo com um 23° aspecto, é fornecido o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para uso em aplicações de diagnóstico ou diagnóstico.[00754] According to a 23rd aspect, the antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18 is provided, or a conjugate according to aspect 19 or the pharmaceutical composition according to aspect 20 for use in diagnostic or diagnostic applications.
[00755] Em algumas primeiras modalidades do 23° aspecto, é fornecido um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e /ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto para uso em um método de diagnóstico in vivo. O uso pode ser um uso para o diagnóstico de um tumor ou de uma doença caracterizada por células positivas para o receptor de quimiocina, por exemplo, células positivas para CCR8, tais como células T regulatórias positivas para CCR8. Por exemplo, o tumor ou a doença caracterizada por células positivas para receptores de quimiocinas é selecionado de leucemia linfoblástica aguda de células T, câncer de mama, câncer de mama triplo negativo, câncer de mama triplo positivo, câncer de pulmão de não pequenas células (NSCLC), câncer de pulmão celular (SCLC) câncer testicular, câncer gástrico, carcinoma de células escamosas de cabeça e pescoço, timoma, adenocarcinoma de esôfago, câncer colorretal, adenocarcinoma pancreático, câncer de ovário ou câncer cervical, leucemia mi- elóide aguda, câncer de rim, câncer de bexiga, câncer de pele, melanoma, câncer de tireóide, mesotelioma, sarcoma e câncer de próstata. De acordo com algumas modalidades preferidas, o uso em um método de diagnóstico in vivo é o uso no diagnóstico de câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor de esôfago, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado, e/ou câncer de próstata, ou qualquer outro tumor descrito aqui.[00755] In some early embodiments of aspect 23, an antibody or antigen-binding fragment is provided according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19 or a pharmaceutical composition according to aspect 20 for use in an in vivo diagnostic method. The use may be for the diagnosis of a tumor or disease characterized by chemokine receptor-positive cells, for example, CCR8-positive cells, such as CCR8-positive regulatory T cells. For example, the tumor or disease characterized by cells positive for chemokine receptors is selected from acute T-cell lymphoblastic leukemia, breast cancer, triple-negative breast cancer, triple-positive breast cancer, non-small cell lung cancer (NSCLC), squamous cell lung cancer (SCLC), testicular cancer, gastric cancer, squamous cell carcinoma of the head and neck, thymoma, esophageal adenocarcinoma, colorectal cancer, pancreatic adenocarcinoma, ovarian cancer or cervical cancer, acute myeloid leukemia, kidney cancer, bladder cancer, skin cancer, melanoma, thyroid cancer, mesothelioma, sarcoma, and prostate cancer. According to some preferred modalities, the use in an in vivo diagnostic method is the use in the diagnosis of head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer, and/or prostate cancer, or any other tumor described herein.
[00756] De acordo com algumas modalidades preferidas, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto é usado para a estratificação de indivíduos ou pacientes para tratamento, por exemplo, para o tratamento de uma doença descrita aqui.[00756] According to some preferred embodiments, the antibody or antigen-binding fragment according to the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 11th, 12th, 13th, 14th, 15th, 16th, 17th and/or 18th aspect, or a conjugate according to the 19th aspect or the pharmaceutical composition according to the 20th aspect is used for the stratification of individuals or patients for treatment, for example, for the treatment of a disease described herein.
[00757] De acordo com um 24° aspecto, é fornecido um polinu- cleotídeo que codifica um anticorpo ou fragmento de ligação ao antí- eno de acordo com o 6° 7° 8° 9° 10° 11° 12° 13° 14° 15° 16° 17° e/ougeno e acoro com , , , , , , , , , , , eou18° aspecto. Preferivelmente, o polinucleotídeo de acordo com este aspecto é um polinucleotídeo como fornecido de acordo com a listagem de sequências.[00757] According to a 24th aspect, a polynucleotide is provided that encodes an antibody or antigen-binding fragment according to the 6th, 7th, 8th, 9th, 10th, 11th, 12th, 13th, 14th, 15th, 16th, 17th and/or 18th aspect and according to , , , , , , , , , , , and/or 18th aspect. Preferably, the polynucleotide according to this aspect is a polynucleotide as provided according to the sequence listing.
[00758] De acordo com um 25° aspecto, é fornecido um vetor compreendendo um polinucleotídeo de acordo com o 24° aspecto. Vários sistemas de vetores adequados são conhecidos na técnica ou descritos aqui.[00758] According to a 25th aspect, a vector comprising a polynucleotide according to the 24th aspect is provided. Several suitable vector systems are known in the art or described herein.
[00759] De acordo com um 26° aspecto, é fornecida uma célula isolada disposta para a produção de um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e/ou 18° aspecto. Preferivelmente, a célula isolada de acordo com o aspecto atual é uma célula eucariótica, tal como uma célula CHO ou HEK compreendendo um vetor de acordo com o 25° aspecto. Em outra modalidade preferida, a célula é uma célula YB2/0 de mieloma de rato.[00759] According to a 26th aspect, an isolated cell is provided that is disposed for the production of an antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18. Preferably, the isolated cell according to the present aspect is a eukaryotic cell, such as a CHO or HEK cell comprising a vector according to aspect 25. In another preferred embodiment, the cell is a mouse myeloma YB2/0 cell.
[00760] De acordo com um 27° aspecto, é fornecido um método de produção de um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15°, 16°, 17° e /ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto, compreendendo a cultura de uma célula de acordo com o 26° aspecto e opcionalmente purificação do anticorpo ou fragmento de ligação ao antíge- no. Em algumas modalidades altamente preferidas, o método compreende a fucosilação do anticorpo como descrito em outro lugar aqui. Em algumas modalidades, o método compreende a purificação do anticorpo.[00760] According to a 27th aspect, a method is provided for producing an antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19, comprising culturing a cell according to aspect 26 and optionally purifying the antibody or antigen-binding fragment. In some highly preferred embodiments, the method comprises fucosylation of the antibody as described elsewhere herein. In some embodiments, the method comprises purification of the antibody.
[00761] Por exemplo, o anticorpo de acordo com a presente invenção pode ser purificado pelo processo de purificação descrito a seguir. O processo de purificação descrito é adequado para uma ampla faixa de anticorpos monoclonais IgG e é otimizado para títulos de biorreator de até 8 g/L com um volume de coleta esperado de, por exemplo, 2000 L de um biorreator de uso único ou de aço inoxidável. Com modificações apropriadas, culturas de anticorpos com outras faixas de títulos podem ser processadas. As culturas de células são colhidas e clarificadas através de filtração em profundidade e/ou filtração carregada. A coleta clarificada é armazenada em sacos descartáveis ou em um tanque de armazenamento de aço inoxidável com refrigeração opcional.Condições Gerais do Processo[00761] For example, the antibody according to the present invention can be purified by the purification process described below. The described purification process is suitable for a wide range of IgG monoclonal antibodies and is optimized for bioreactor titers up to 8 g/L with an expected collection volume of, for example, 2000 L of a single-use or stainless steel bioreactor. With appropriate modifications, antibody cultures with other titer ranges can be processed. Cell cultures are harvested and clarified by depth filtration and/or loaded filtration. The clarified collection is stored in disposable bags or in a stainless steel storage tank with optional refrigeration. General Process Conditions
[00762] Processamento fechado e sistemas de uso único são preferidos; skids ou sistemas de aço inoxidável também são possíveis com procedimentos adequados de limpeza e troca. Os sacos descartáveis são tipicamente de polietileno de baixa ou ultrabaixa densidade como camada de contato. Entre outros, podem ser usados sistemas tampão de acetato de sódio/ácido acético ou Tris/Tris-HCl, normalmente em uma concentração total de 50 mM e incluindo NaCl a 50 mM, a menos que de outro indicado. Os tampões e intermediários de processo das respectivas operações unitárias (por exemplo, Carga, Eluato ou Fluxo) são geralmente filtrados em linha de 0,2 μm ou com um conjunto de filtração, usando, por exemplo, membrana PES e/ou filtros de lã. Essas soluções são geralmente armazenadas em sacos de uso único ou recipientes de aço inoxidável, em condições ambientais (por exemplo, 18 a 26 °C) ou 2-8 °C.Captura[00762] Closed processing and single-use systems are preferred; skids or stainless steel systems are also possible with appropriate cleaning and changeover procedures. Disposable bags are typically made of low or ultra-low density polyethylene as the contact layer. Among others, sodium acetate/acetic acid or Tris/Tris-HCl buffer systems may be used, typically at a total concentration of 50 mM and including 50 mM NaCl, unless otherwise indicated. Buffers and process intermediates from the respective unit operations (e.g., Feed, Eluate, or Flow) are generally filtered in-line to 0.2 μm or with a filtration assembly, using, for example, PES membrane and/or wool filters. These solutions are generally stored in single-use bags or stainless steel containers, under ambient conditions (e.g., 18 to 26 °C) or 2-8 °C. Capture
[00763] A captura de anticorpos é realizada usando cromatografia baseada em Proteína A, usando, por exemplo, as resinas Cytiva Mab- Select SuRe, MabSelect SuRe LX, Mab Select PrismA ou Purolite A50. O carregamento é realizado após a clarificação, com ou sem pré- concentração por ultrafiltração. A densidade de carregamento é tipicamente de 45 a 75 g/L, usando uma taxa de fluxo única ou variável para aplicar a coleta clarificada na coluna (120 a 400 cm/h). A croma- tografia pode ser realizada em modo descontínuo com uma ou mais colunas, ou em modo contínuo (MCC (cromatografia multicoluna)/SMB (leito móvel simulado)) com até 8 colunas. Colunas pré-empacotadas ou autoempacotadas são usadas com uma altura de leito típica de 20 cm para o modo de batelada. Para o modo contínuo, o tempo de contato da coleta clarificada com a resina é de 1 a 4 min. A captura é realizada em um ou vários ciclos, dependendo do título do anticorpo. Antes do carregamento, a coluna é equilibrada usando um tampão Tris (por exemplo, pH 7); a lavagem é realizada com pelo menos duas etapas de lavagem; alta concentração de NaCl no primeiro tampão de lavagem, depois baixa concentração de NaCl no segundo tampão (por exemplo, 1a lavagem: NaCl a 1 M, pH 5,5; 2a lavagem: NaCl a 50 mM, pH 6,0) em tampão acetato. A eluição pode, por exemplo, ser obtida por tampão acetato de pH baixo (por exemplo, 3,5) contendo NaCl a 0 a 50 mM em tipicamente < 5 volumes de coluna (CV) com coleta de eluato controlada por UV ou volume. Os eluatos podem ser reunidos e bem misturados nesta etapa ou após a inativação do vírus. A coluna de afinidade é regenerada por > 3 CV de ácido acético (por exemplo, 0,1 M, incl. 500 mM de NaCl), sanitização (limpeza no local, CIP) ocorre com 0,5-1,0 M de NaOH durante 30 min, reequilíbrio com > 4 CV. A coluna é armazenada em, por exemplo, 20% de EtOH ou 2% de BnOH.[00763] Antibody capture is performed using Protein A-based chromatography, using, for example, Cytiva Mab-Select SuRe, MabSelect SuRe LX, Mab Select PrismA, or Purolite A50 resins. Loading is performed after clarification, with or without pre-concentration by ultrafiltration. The loading density is typically 45 to 75 g/L, using a single or variable flow rate to apply the clarified sample to the column (120 to 400 cm/h). Chromatography can be performed in batch mode with one or more columns, or in continuous mode (MCC (multicolumn chromatography)/SMB (simulated moving bed)) with up to 8 columns. Pre-packed or self-packed columns are used with a typical bed height of 20 cm for batch mode. For continuous mode, the contact time of the clarified sample with the resin is 1 to 4 min. Capture is performed in one or more cycles, depending on the antibody titer. Before loading, the column is equilibrated using a Tris buffer (e.g., pH 7); washing is performed with at least two washing steps; high concentration NaCl in the first wash buffer, then low concentration NaCl in the second buffer (e.g., 1st wash: 1 M NaCl, pH 5.5; 2nd wash: 50 mM NaCl, pH 6.0) in acetate buffer. Elution can, for example, be achieved using low pH acetate buffer (e.g., 3.5) containing 0 to 50 mM NaCl in typically < 5 column volumes (CV) with UV-controlled or volume-controlled eluate collection. Eluates can be pooled and thoroughly mixed at this step or after virus inactivation. The affinity column is regenerated with > 3 CV of acetic acid (e.g., 0.1 M, incl. 500 mM NaCl), sanitization (clean-in-place, CIP) occurs with 0.5-1.0 M NaOH for 30 min, re-equilibration with > 4 CV. The column is stored in, for example, 20% EtOH or 2% BnOH.
[00764] Alternativamente, a captura de afinidade da coleta clarificada pode ser realizada com ligantes de afinidade em uma arquitetura de celulose (por exemplo, Fibro PrismA) usando os mesmos esquemas de carregamento e sistema tampão como descrito acima. A regeneração ou o bloco CIP podem ser ignorados para um tempo de processamento ideal. Um tempo de contato de 5 a 20 segundos pode ser aplicado a unidades Fibro de tamanhos variados (por exemplo, 0,4 mL a 2,4 L). Normalmente, uma capacidade de carga de 25 a 35 g/L de volume unitário pode ser realizada. Uma única unidade pode ser usada para processar uma única batelada ou vários lotes, dependendo da unidade Fibro e dos tamanhos do biorreator, bem como do título da cultura de anticorpos. Os materiais de carregamento de afinidade podem ser ainda mais clarificados por filtros carregados com taxa de transferência >300 L/m2 antes do carregamento para maximizar o uso da vida útil e minimizar a incrustação.Inativação de vírus de baixo pH[00764] Alternatively, affinity capture of the clarified collection can be performed with affinity binders in a cellulose architecture (e.g., Fibro PrismA) using the same loading schemes and buffer system as described above. Regeneration or CIP block can be bypassed for optimal processing time. A contact time of 5 to 20 seconds can be applied to Fibro units of varying sizes (e.g., 0.4 mL to 2.4 L). Typically, a loading capacity of 25 to 35 g/L unit volume can be achieved. A single unit can be used to process a single batch or multiple batches depending on the Fibro unit and bioreactor sizes, as well as the antibody culture titer. Affinity loading materials can be further clarified by loaded filters with a throughput >300 L/m2 prior to loading to maximize lifetime utilization and minimize fouling. Low pH virus inactivation
[00765] O eluato de captura é ajustado com HOAc ou HCl para pH 3,7 a 3,9 e mantido durante 120 a 240 min no mesmo saco ou em um saco separado a > 18 °C para inativar os vírus potencialmente presentes. Alternativamente, a inativação viral é realizada em pH 3,4-3,6 por >30 minutos. O intermediário do processo é então ajustado para armazenamento ou para condições de processamento adicionais, por exemplo, para pH 4-7 usando estoque de titulante Tris/-HCl 1-2 M. Polimento 1[00765] The capture eluate is adjusted with HOAc or HCl to pH 3.7 to 3.9 and maintained for 120 to 240 min in the same bag or in a separate bag at >18 °C to inactivate potentially present viruses. Alternatively, viral inactivation is carried out at pH 3.4-3.6 for >30 minutes. The process intermediate is then adjusted for storage or for further processing conditions, for example, to pH 4-7 using 1-2 M Tris/-HCl titrant stock. Polishing 1
[00766] O anticorpo é ainda polido por cromatografia de troca aniô- nica (AEX), tipicamente na forma de cápsula de membrana ou cassetes (por exemplo, Sartorius Sartobind STIC PA 4 mm ou 3M MA ST Polisher) no modo de fluxo contínuo, com taxas de fluxo < 350 MV/h, para remoção de impurezas e partículas relacionadas ao processo e/ou ao produto. A quantidade total de um lote pode ser processada em um ou em vários ciclos, dependendo da quantidade de anticorpo. Antes do carregamento, o intermediário é ajustado para uma conduti- vidade alvo de, por exemplo, 8 a 20 mS/cm, e um pH alvo de, por exemplo, 7,0 para anticorpos com pontos isoelétricos básicos. Para anticorpos com um ponto isoelétrico menor do que pH 7,0, a condutivi- dade pode ser de 5 a 20 mS/cm, e o pH pode estar entre seu ponto isoelétrico e pH 5,0 A membrana é equilibrada com tampão Tris, pH 7,0 ou tampão Acetato pH 5- 6, e carregado com densidades tipicamente entre 0,5 a 10 g de anticorpo/mL de volume de membrana (MV). Uma perseguição com tampão de equilíbrio pode ser realizada e combinada com o fluxo coletado, cujos critérios de coleta são controlados, por exemplo, por UV ou volume. O adsorvedor de membrana pode ser usado uma ou várias vezes, para o qual é regenerado (NaCl 1 M para 25 MV) e reequilibrado (tampão Tris pH 7,0).Polimento 2[00766] The antibody is further polished by anion exchange chromatography (AEX), typically in the form of membrane capsules or cassettes (e.g., Sartorius Sartobind STIC PA 4 mm or 3M MA ST Polisher) in continuous flow mode, with flow rates < 350 MV/h, to remove impurities and process- and/or product-related particles. The total quantity of a batch can be processed in one or several cycles, depending on the amount of antibody. Before loading, the intermediate is adjusted to a target conductivity of, for example, 8 to 20 mS/cm, and a target pH of, for example, 7.0 for antibodies with basic isoelectric points. For antibodies with an isoelectric point lower than pH 7.0, the conductivity can be 5 to 20 mS/cm, and the pH can be between its isoelectric point and pH 5.0. The membrane is equilibrated with Tris buffer, pH 7.0, or Acetate buffer pH 5-6, and loaded with densities typically between 0.5 and 10 g of antibody/mL of membrane volume (MV). A chase with equilibration buffer can be performed and combined with the collected flow, whose collection criteria are controlled, for example, by UV or volume. The membrane adsorbent can be used once or several times, for which it is regenerated (1 M NaCl for 25 MV) and re-equilibrated (Tris buffer pH 7.0). Polishing 2
[00767] O polimento final pode, por exemplo, ser obtido por croma- tografia de troca catiônica (CEX). Em princípio, a ordem das operações unitárias AEX e CEX pode ser invertida. A operação da unidade CEX é geralmente realizada no modo de ligação e eluição com taxas de fluxo entre 100 a 200 cm/h. Colunas pré ou auto-empacotadas com resinas, por exemplo, Cytiva Capto S ImpAct ou Capto SP ImpRes, podem ser usadas a 20 cm de altura do leito. A etapa de polimento é realizada em um ou vários ciclos, dependendo da quantidade de anticorpo. Se necessário, a carga pode ser ajustada para atingir condutivi- dades entre 5 a 9 mS/cm e pH 4,5 - 7,5 com HOAc, titulantes Tris ou WFI. A carga é aplicada em densidades típicas entre 40 a 105 g/L em uma coluna CEX equilibrada com > 5 CV de tampão acetato (pH e condutividade compatível com a carga CEX) e lavada posteriormente usando > 5 CV do mesmo tampão. O anticorpo é eluído usando um tampão de acetato com concentração de NaCl adequada (> 50 mM; < 500 mM), e o eluato é coletado por controle de UV em tipicamente < 10 CV de volume de eluído coletado. A coluna é regenerada usando NaCl a 0,5 a 2 M em tampão de acetato, reequilibrada (> 5 CV com tampão de equilíbrio CEX), higienizada (NaOH 0,5-1,0 M por > 30 min), reequilibrada (> 5 CV com equilíbrio CEX tampão), e finalmente armazenada em, por exemplo, 20% de EtOH ou 2% de BnOH.Polimento Adicional[00767] Final polishing can, for example, be achieved by cation exchange chromatography (CEX). In principle, the order of the AEX and CEX unit operations can be reversed. The CEX unit operation is generally performed in ligation and elution mode with flow rates between 100 and 200 cm/h. Pre- or self-packed columns with resins, for example, Cytiva Capto S ImpAct or Capto SP ImpRes, can be used at a bed height of 20 cm. The polishing step is performed in one or more cycles, depending on the amount of antibody. If necessary, the load can be adjusted to achieve conductivities between 5 and 9 mS/cm and pH 4.5 - 7.5 with HOAc, Tris or WFI titrants. The loading is applied at typical densities between 40 and 105 g/L to a CEX column equilibrated with > 5 CV of acetate buffer (pH and conductivity compatible with the CEX loading) and subsequently washed using > 5 CV of the same buffer. The antibody is eluted using an acetate buffer with an appropriate NaCl concentration (> 50 mM; < 500 mM), and the eluate is collected by UV control in typically < 10 CV of eluate volume collected. The column is regenerated using 0.5 to 2 M NaCl in acetate buffer, reequilibrated (> 5 CV with CEX equilibration buffer), sanitized (0.5-1.0 M NaOH for > 30 min), reequilibrated (> 5 CV with CEX equilibration buffer), and finally stored in, for example, 20% EtOH or 2% BnOH. Additional Polishing
[00768] Quando é necessário polimento adicional para remover impurezas residuais relacionadas ao produto ou ao processo, uma cro- matografia de modo misto (MMC) pode ser usada no lugar ou em conjunto com a etapa CEX. Exemplos de resinas cromatográficas de mo-do misto são Capto aderir e Capto MMC ImpRes. Esta operação unitária é tipicamente operada em um modo de fluxo contínuo, mas o modo de ligação e eluição também podem ser empregados. A coluna pode ser autoembalada ou pré-embalada com uma altura de leito de 5-20 cm em vários diâmetros e operada a taxas de fluxo entre 100-500 cm/h em modo de fluxo contínuo ou 100-220 cm/h em modo de ligação e - modo de eluição.[00768] When additional polishing is required to remove residual impurities related to the product or process, mixed-mode chromatography (MMC) can be used in place of or in conjunction with the CEX step. Examples of mixed-mode chromatographic resins are Capto adhere and Capto MMC ImpRes. This unit operation is typically operated in a continuous flow mode, but bonding and elution modes can also be employed. The column can be self-packed or pre-packed with a bed height of 5-20 cm in various diameters and operated at flow rates between 100-500 cm/h in continuous flow mode or 100-220 cm/h in bonding and elution modes.
[00769] A carga é normalmente ajustada, se necessário, para direcionar condutividades entre 3 a 12 mS/cm e para pH 4,2 - 7,5 com HOAc, titulantes Tris ou WFI. A carga é aplicada em densidades típicas entre 75 a 300 g/L em uma coluna MMC equilibrada com tampão acetato > 5 CV (pH e condutividade compatíveis com a carga MMC). Uma perseguição com tampão de equilíbrio pode ser realizada e combinada com o fluxo coletado, cujos critérios de coleta são controlados, por exemplo, por UV ou volume. A coluna MMC pode ser usada uma ou várias vezes, dependendo da quantidade de anticorpo a ser polida. A coluna é regenerada usando NaCl a 0,5 a 2 M em tampão de acetato, reequilibrada (> 5 CV com tampão de equilíbrio), higienizada (Na- OH 0,5-1,0 M por > 30 min) e finalmente armazenada em, por exem-plo, 20% de EtOH ou 2% de BnOH.Nanofiltração[00769] The loading is normally adjusted, if necessary, to target conductivities between 3 and 12 mS/cm and pH 4.2–7.5 with HOAc, Tris titrants, or WFI. The loading is applied at typical densities between 75 and 300 g/L on an MMC column equilibrated with acetate buffer > 5 CV (pH and conductivity compatible with the MMC loading). A chase with equilibrated buffer can be performed and combined with the collected flow, the collection criteria of which are controlled, for example, by UV or volume. The MMC column can be used once or several times, depending on the amount of antibody to be polished. The column is regenerated using 0.5 to 2 M NaCl in acetate buffer, re-equilibrated (> 5 CV with equilibrium buffer), sanitized (0.5-1.0 M NaOH for > 30 min) and finally stored in, for example, 20% EtOH or 2% BnOH. Nanofiltration
[00770] Os vírus adventícios potencialmente remanescentes são removidos por nanofiltração baseada em PDVF, por exemplo, usando Planova BioEX com ou sem pré-filtro. A carga é aplicada em pressão constante (por exemplo, 2,0 - 3,4 bar) com uma densidade de carga de 1500 - 5000 g de anticorpo/m2 a um nanofiltro pré-equilibrado (> 5 L/m2 de tampão de acetato, receita, por exemplo, compatível com as condições de eluição MA AEX ou CEX. O filtro pode ser perseguido usando o mesmo tampão e a integridade do filtro é tipicamente testada após o uso. Em caso de falha do teste de integridade, esta etapa pode ser repetida. Alternativamente, os vírus adventícios podem ser removidos por nanofiltração à base de celulose com ou sem um pré-filtro. A carga é aplicada a uma pressão constante (por exemplo, 0,8 - 1,2 bar) com uma densidade de carga de 500 - 2000 g de anticorpo/m2 a um nanofiltro pré-equilibrado (> 5 L/m2 de tampão de acetato, receita, por exemplo, compatível com condições de eluição MA AEX ou CEX).Concentração e troca de tampão[00770] Potentially remaining adventitious viruses are removed by PDVF-based nanofiltration, for example, using Planova BioEX with or without a pre-filter. The load is applied at constant pressure (e.g., 2.0–3.4 bar) with a loading density of 1500–5000 g antibody/m² to a pre-equilibrated nanofilter (> 5 L/m² acetate buffer, recipe, for example, compatible with MA AEX or CEX elution conditions). The filter can be chased using the same buffer, and the filter integrity is typically tested after use. In case of integrity test failure, this step can be repeated. Alternatively, adventitious viruses can be removed by cellulose-based nanofiltration with or without a pre-filter. The load is applied at constant pressure (e.g., 0.8–1.2 bar) with a loading density of 500–2000 g antibody/m² to a pre-equilibrated nanofilter (> 5 L/m² acetate buffer, recipe, for example, compatible with MA AEX or CEX elution conditions). Concentration and changing the tampon
[00771] O intermediário é concentrado por ultrafiltração para 15-110 g/L, diafiltrado com > 6 volumes de diafiltração contra um tampão de diafiltração (DFB) (por exemplo, 10 mM de histidina, 10 mM de metio- nina, 30 mM de arginina, pH 5,3) e, se necessário, ainda concentrado até 200 g/L. Isso é normalmente realizado usando um dispositivo de filtração de fluxo tangencial e uma membrana adequada com um corte de 30 a 50 kDa (por exemplo, Millipore Pellicon, Sartorius Hydrosart, Pall Omega) com uma carga de tipicamente 300-1000 g de anticor- po/m2. O processo é tipicamente controlado pelo fluxo de alimentação ou retentado (por exemplo, 2 a 7 L/min/m2), alternativamente pela pressão de alimentação (2-4 bar) e por TMP (0,7 a 2 bar). A membrana pode ser perseguida por DFB e o retentado misturado diluído com DFB até a concentração alvo. O sistema TFF e as membranas são higienizados com NaOH a 0,5 M e equilibrados com tampão acetato ou DFB. A integridade ou permeabilidade da membrana é testada antes do uso.Estabilização[00771] The intermediate is concentrated by ultrafiltration to 15-110 g/L, diafiltered with > 6 diafiltration volumes against a diafiltration buffer (DFB) (e.g., 10 mM histidine, 10 mM methionine, 30 mM arginine, pH 5.3) and, if necessary, further concentrated to 200 g/L. This is typically accomplished using a tangential flow filtration device and a suitable membrane with a cutoff of 30 to 50 kDa (e.g., Millipore Pellicon, Sartorius Hydrosart, Pall Omega) with a loading of typically 300-1000 g antibody/m2. The process is typically controlled by the feed or retentate flow rate (e.g., 2 to 7 L/min/m2), alternatively by the feed pressure (2-4 bar) and by TMP (0.7 to 2 bar). The membrane can be chased by DFB and the retentate mixed diluted with DFB to the target concentration. The TFF system and membranes are sanitized with 0.5 M NaOH and equilibrated with acetate buffer or DFB. The integrity or permeability of the membrane is tested before use. Stabilization
[00772] Em uma etapa de estabilização opcional, um concentrado de excipiente é adicionado para produzir substância fármaco a granel (BDS). Uma filtração de redução de carga biológica (por exemplo, 0,2 μm) é realizada usando, por exemplo, um filtro pré-equilibrado (por exemplo, concentrado de excipiente diluído em DFB), que é testado após o uso quanto à integridade. Em caso de falha do teste de integridade, a etapa de filtração pode ser repetida.Carregamento e Congelamento[00772] In an optional stabilization step, an excipient concentrate is added to produce bulk drug substance (BDS). A bioload reduction filtration (e.g., 0.2 μm) is performed using, for example, a pre-equilibrated filter (e.g., excipient concentrate diluted in BDS), which is tested for integrity after use. In case of integrity test failure, the filtration step can be repeated. Loading and Freezing
[00773] O BDS é preenchido em sacos adequados com uma camada de contato LDPE (por exemplo, 5 ou 10 L) com compartimentos de amostragem de identificação individual que são preferivelmente conectados e desconectados assepticamente. Os sacos são embalados in-dividualmente com proteção a vácuo opcional (sacos LDPE overwrap) e colocados em invólucros de proteção (por exemplo, RoSS Shells). Após um armazenamento intermediário opcional de 2-8 °C, os sacos sem casca são congelados (usando uma placa ou um freezer passivo) e subsequentemente armazenados a < - 30 ou < - 60 °C, por exemplo, +/- 5 °C, alternativamente em < - 25 ou < - 60°C, por exemplo, +/- 5°C. ASPECTO 28 - KIT DE PARTES COM ANTICORPO DEFINIDO PELO ANTÍGENO[00773] The BDS is filled into suitable bags with an LDPE contact layer (e.g., 5 or 10 L) with individually identifying sampling compartments that are preferably aseptically connected and disconnected. The bags are individually packaged with optional vacuum protection (LDPE overwrap bags) and placed in protective wrappers (e.g., RoSS Shells). After optional intermediate storage at 2-8 °C, the shell-less bags are frozen (using a plate or a passive freezer) and subsequently stored at < -30 or < -60 °C, e.g., +/- 5 °C, alternatively at < -25 or < -60 °C, e.g., +/- 5 °C. ASPECT 28 - ANTIGEN-DEFINED ANTIBODY PARTS KIT
[00774] De acordo com um 28° aspecto, é fornecido um kit compreendendo o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno de acordo com o 6°, 7°, 8°, 9°, 10°, 11°, 12°, 13°, 14°, 15° °, 16°, 17° e /ou 18° aspecto, ou um conjugado de acordo com o 19° aspecto, ou a composição farmacêutica de acordo com o 20° aspecto, com instruções de uso.[00774] According to aspect 28, a kit is provided comprising the antibody or antigen-binding fragment according to aspects 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 and/or 18, or a conjugate according to aspect 19, or the pharmaceutical composition according to aspect 20, with instructions for use.
[00775] Os anticorpos, fragmentos, conjugados ou composições farmacêuticas da presente invenção podem ser fornecidos em um kit, isto é, uma combinação embalada de reagentes em quantidades predeterminadas em um ou mais recipientes com instruções. Por exemplo, quando o anticorpo, fragmento ou conjugado é um anticorpo, fragmento ou conjugado terapêutico, as instruções de uso podem compreender a bula. Por exemplo, a bula pode compreender informações que descrevem um modo de administração vantajoso ou tratamento de combinação como descrito aqui.[00775] The antibodies, fragments, conjugates, or pharmaceutical compositions of the present invention may be supplied in a kit, that is, a packaged combination of reagents in predetermined quantities in one or more containers with instructions. For example, when the antibody, fragment, or conjugate is a therapeutic antibody, fragment, or conjugate, the instructions for use may comprise the package insert. For example, the package insert may comprise information describing an advantageous mode of administration or combination treatment as described herein.
[00776] Por exemplo, quando o anticorpo é marcado com uma enzima, o kit pode incluir substratos e cofatores requeridos pela enzima (por exemplo, um precursor de substrato que fornece o cromóforo ou fluoróforo detectável). Além disso, outros aditivos podem ser incluídos, como estabilizadores, tampões (por exemplo, um tampão de bloco ou tampão de lise) e semelhantes. As quantidades relativas dos vários reagentes podem variar amplamente para proporcionar concentrações em solução dos reagentes que optimizam substancialmente a sensibilidade do ensaio. Particularmente, os reagentes podem ser fornecidos como pós secos, geralmente liofilizados, incluindo excipientes que, por dissolução, fornecerão uma solução reagente com a concentração apropriada.[00776] For example, when the antibody is labeled with an enzyme, the kit may include substrates and cofactors required by the enzyme (e.g., a substrate precursor that provides the detectable chromophore or fluorophore). In addition, other additives may be included, such as stabilizers, buffers (e.g., a block buffer or lysis buffer), and the like. The relative amounts of the various reagents may vary widely to provide reagent solution concentrations that substantially optimize assay sensitivity. In particular, reagents may be supplied as dry powders, usually lyophilized, including excipients which, upon dissolution, will provide a reagent solution with the appropriate concentration.
[00777] De acordo com um aspecto, é fornecido um anticorpo anti- CCR8 e um outro composto terapeuticamente ativo ou terapia para uso no tratamento de um tumor, em que o outro composto terapeuti- camente ativo éa) um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxano, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gencitabina,b) um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1,c) um anticorpo que tem como alvo a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais,d) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR,e) o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata,f) um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1, e/oug) radioterapia.[00777] According to one aspect, an anti-CCR8 antibody and another therapeutically active compound or therapy are provided for use in the treatment of a tumor, wherein the other therapeutically active compound is a) a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin or gemcitabine, b) an antibody targeting another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1, c) an antibody targeting a protein that is specifically expressed by tumor cells, d) an antibody or small molecule targeting HER2 and/or EGFR, e) the pattern of treatment for any head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer, f) a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1, and/or g) radiotherapy.
[00778] Em outras palavras, é fornecido um anticorpo anti-CCR8, preferivelmente um anticorpo anti-CCR8 induzindo ADCC e/ou ADCP como descrito em outro lugar aqui, para uso no tratamento de um tumor, em que o uso compreende a administração de um outro composto terapeuticamente ativo. ou terapia que não tem como alvo uma proteína de ponto de verificação e é selecionada deh) um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxano, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gen- citabina,i) um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1,j) um anticorpo que tem como alvo a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais,k) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR,l) o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata,m) um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafi-nib, Regorafenibe ou MEKi-1, n) radioterapia e/ouo) (um composto ou anticorpo para) depleção de células B intratumorais, preferivelmente células B CD19+.[00778] In other words, an anti-CCR8 antibody is provided, preferably an ADCC and/or ADCP-inducing anti-CCR8 antibody as described elsewhere herein, for use in the treatment of a tumor, wherein the use comprises the administration of another therapeutically active compound. or therapy that does not target a checkpoint protein and is selected from: h) a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin, or gemcitabine; i) an antibody that targets another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1, or CXCR1; j) an antibody that targets a protein that is specifically expressed by tumor cells; k) an antibody or small molecule that targets HER2 and/or EGFR; l) the standard of care for any head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, tumor esophageal, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer, m) a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1, n) radiotherapy and/or o) (a compound or antibody for) depletion of intratumoral B cells, preferably CD19+ B cells.
[00779] O anticorpo anti-CCR8 pode ser um anticorpo anti-CCR8 inventivo como descrito aqui ou qualquer outro anticorpo anti-CCR8 terapeuticamente adequado conhecido na técnica. O tumor pode ser qualquer tumor descrito aqui, por exemplo, para o 22° aspecto. Preferivelmente, o tumor ou doença é caracterizado por células positivas para o receptor de quimiocina, tais como células positivas para CCR8, tais como células T regulatórias positivas para CCR8 ou células tumo- rais positivas para CCR8. Preferivelmente, o tumor é um tumor res- ponsivo a ICI. Com base nos Exemplos descritos aqui (por exemplo, Exemplos 12.6 e segs., veja modelos de camundongos que respondem), é plausível que, em particular, aqueles tumores que são ou fo- ram inicialmente responsivos à inibição do ponto de verificação imuno- lógico se beneficiarão do tratamento com anticorpo anti-CCR8, sozinho e em combinação. O outro composto terapeuticamente ativo pode ser um composto terapeuticamente ativo como descrito em outro lugar aqui. Taxanos adequados podem ser selecionados, por exemplo, de paclitaxel, abraxano, cabazitaxel ou docetaxel, ou derivados dos mesmos. De acordo com uma modalidade preferida, o uso compreende também a administração de um inibidor de ponto de verificação, tal como um anticorpo anti-PD-1, um anticorpo anti-PD-L1 ou um anticorpo CTLA4, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui.[00779] The anti-CCR8 antibody may be an inventive anti-CCR8 antibody as described herein or any other therapeutically suitable anti-CCR8 antibody known in the art. The tumor may be any tumor described herein, for example, for aspect 22. Preferably, the tumor or disease is characterized by chemokine receptor-positive cells, such as CCR8-positive cells, such as CCR8-positive regulatory T cells or CCR8-positive tumor cells. Preferably, the tumor is an ICI-responsive tumor. Based on the Examples described herein (e.g., Examples 12.6 et seq., see responding mouse models), it is plausible that, in particular, those tumors that are or were initially responsive to immune checkpoint inhibition will benefit from treatment with anti-CCR8 antibody, alone and in combination. The other therapeutically active compound may be a therapeutically active compound as described elsewhere herein. Suitable taxanes may be selected, for example, from paclitaxel, abraxane, cabazitaxel or docetaxel, or derivatives thereof. According to a preferred embodiment, the use also comprises the administration of a checkpoint inhibitor, such as an anti-PD-1 antibody, an anti-PD-L1 antibody or a CTLA4 antibody, for example, as described elsewhere herein.
[00780] De acordo com um aspecto, é fornecido um anticorpo anti- CCR8, um inibidor de ponto de verificação, tal como um anticorpo anti- PD-1, um anticorpo anti-PD-L1 ou um anticorpo CTLA4 e um outro composto terapeuticamente ativo ou terapia para uso em o tratamento de um tumor, em que o composto ou terapia terapeuticamente ativo adicional é preferivelmentea) um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1,b) um anticorpo que tem como alvo a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais,c) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR,d) o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata, e) um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxa- no, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gencitabina,f) um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1, e/oug) radioterapia,h) (um composto ou anticorpo para) depleção de células B intratumorais, preferivelmente células B CD19+.[00780] According to one aspect, an anti-CCR8 antibody, a checkpoint inhibitor such as an anti-PD-1 antibody, an anti-PD-L1 antibody or a CTLA4 antibody, and another therapeutically active compound or therapy are provided for use in the treatment of a tumor, wherein the additional therapeutically active compound or therapy is preferably a) an antibody targeting another chemokine receptor such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1, b) an antibody targeting a protein that is specifically expressed by tumor cells, c) an antibody or small molecule targeting HER2 and/or EGFR, d) the standard of care for any head and neck cancer, cancer of breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer, e) a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin or gemcitabine, f) a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1, and/or g) radiotherapy, h) (a compound or antibody for) depletion of intratumoral B cells, preferably CD19+ B cells.
[00781] Em outras palavras, é fornecido um anticorpo anti-CCR8 que induz ADCC e/ou ADCP para uso no tratamento de um tumor, em que o uso compreende a administração de um outro composto tera- peuticamente ativo ou terapia que não tem como alvo uma proteína de ponto de verificação e é selecionado dea) um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxano, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gen- citabina,b) um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1,c) um anticorpo que tem como alvo a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais,d) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR,e) um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1,f) radioterapia e/oudepleção de células B intratumorais, preferivelmente células B CD19+, e o uso compreende também a administração de um inibidor de ponto de verificação, tal como um anticorpo anti-PD-1, um anticorpo anti-PD- L1 ou um anticorpo CTLA4, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui.ASPECTO 31 - Tratamento de combinação sequencial compreendendo anticorpo anti-CCR8[00781] In other words, an anti-CCR8 antibody that induces ADCC and/or ADCP is provided for use in the treatment of a tumor, wherein the use comprises the administration of another therapeutically active compound or therapy that does not target a checkpoint protein and is selected from a) a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin or gemcitabine, b) an antibody that targets another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 or CXCR1, c) an antibody that targets a protein that is specifically expressed by tumor cells, d) an antibody or a small molecule targeting HER2 and/or EGFR, e) a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1, f) radiotherapy and/or depletion of intratumoral B cells, preferably CD19+ B cells, and the use also includes the administration of a checkpoint inhibitor, such as an anti-PD-1 antibody, an anti-PD-L1 antibody or a CTLA4 antibody, for example, as described elsewhere herein. ASPECT 31 - Sequential combination therapy comprising anti-CCR8 antibody
[00782] De acordo com um aspecto, é fornecido um anticorpo anti- CCR8 e um composto ou terapia terapeuticamente ativo adicional para uso no tratamento de um tumor, em que uma dose do composto ou terapia terapeuticamente ativo adicional é administrada após a primeira dose do anticorpo anti-CCR8, por exemploa) após o anticorpo anti-CCR8 ter realizado um aumento da relação de células CD8 intratumorais para células Treg pelo menos por um fator de 2, 3, 4 ou 5 oub) após o anticorpo anti-CCR8 ter esgotado pelo menos 40, 45, 50, 55, 60, 65 ou 70% das células Treg intratumorais.[00782] According to one aspect, an anti-CCR8 antibody and an additional therapeutically active compound or therapy are provided for use in the treatment of a tumor, wherein a dose of the additional therapeutically active compound or therapy is administered after the first dose of the anti-CCR8 antibody, for example a) after the anti-CCR8 antibody has increased the ratio of intratumoral CD8 cells to Treg cells by at least a factor of 2, 3, 4 or 5 or b) after the anti-CCR8 antibody has depleted at least 40, 45, 50, 55, 60, 65 or 70% of the intratumoral Treg cells.
[00783] Em outras palavras, é fornecido um anticorpo anti-CCR8, preferivelmente um anticorpo anti-CCR8 induzindo ADCC e/ou ADCP como descrito em outro lugar aqui, para uso no tratamento de um tumor, em que o uso compreende a administração de um outro composto terapeuticamente ativo ou terapia, em que uma dose do outro composto terapeuticamente ativo ou terapia é administrada após a primeira dose do anticorpo anti-CCR8, preferivelmentea) após o anticorpo anti-CCR8 ter induzido um aumento da relação de células CD8 intratumorais para células Treg pelo menos por um fator de 2, 3, 4 ou 5 oub) após o anticorpo anti-CCR8 ter esgotado pelo menos 40, 45, 50, 55, 60, 65 ou 70% das células Treg intratumorais.[00783] In other words, an anti-CCR8 antibody is provided, preferably an anti-CCR8 antibody inducing ADCC and/or ADCP as described elsewhere herein, for use in the treatment of a tumor, wherein the use comprises the administration of another therapeutically active compound or therapy, wherein a dose of the other therapeutically active compound or therapy is administered after the first dose of the anti-CCR8 antibody, preferably a) after the anti-CCR8 antibody has induced an increase in the ratio of intratumoral CD8 cells to Treg cells by at least a factor of 2, 3, 4 or 5 or b) after the anti-CCR8 antibody has depleted at least 40, 45, 50, 55, 60, 65 or 70% of the intratumoral Treg cells.
[00784] De acordo com um esquema de tratamento preferido, o tratamento começa com a administração da primeira dose de anticorpo anti-CCR8 (por exemplo, diariamente, semanalmente, q2w, q3w ou q4w como descrito acima), seguido pela administração do composto ou terapia terapeuticamente ativo adicional. Sem estar limitado pela teoria, o tempo entre a dose inicial do anticorpo anti-CCR8 e o outro composto terapeuticamente ativo deve ser escolhido para permitir uma depleção de Treg intratumoral de pelo menos 40, 50 ou 60%. O anticorpo anti-CCR8 pode ser um anticorpo anti-CCR8 inventivo como descrito aqui, mas também pode ser qualquer outro anticorpo anti- CCR8 terapeuticamente adequado. O tumor pode ser qualquer tumor aqui descrito, por exemplo, para o 22° aspecto. Preferivelmente, o tumor ou doença é caracterizado por células positivas para o receptor de quimiocina, tais como células positivas para CCR8, tais como células T regulatórias positivas para CCR8 ou células tumorais positivas para CCR8. Preferivelmente, o tumor é ou foi inicialmente um tumor res- ponsivo a ICI. Uma vez que a resistência adquirida aos anticorpos PD(L)-1 pode ser fortemente influenciada por células T regulatórias ativadas intratumorais (caracterizadas pela expressão de CCR8), o tratamento sequencial com um anticorpo anti-CCR8 combinado com um inibidor de ponto de verificação é benéfico para superar tal resistência. Descobriu-se que a administração do composto ou terapia te- rapeuticamente ativo adicional após a primeira dose do anticorpo anti- CCR8 melhora substancialmente a eficácia do tratamento, mesmo para modelos de tumor extremamente desafiadores. O tempo entre a primeira dose do anticorpo anti-CCR8 e a dose do outro composto te- rapeuticamente ativo deve ser suficiente para induzir uma primeira resposta imune antitumoral. De acordo com os dados fornecidos aqui (conforme Exemplos 12.6 ss), isso é indicado por um aumento da relação de células CD8 intratumorais para células T reg pelo menos por um fator de 2, 3, 4 ou 5 ou por (temporário) depleção de pelo menos 40, 45, 50, 55, 60, 65 ou 70% das células Treg intratumorais.[00784] According to a preferred treatment regimen, treatment begins with the administration of the first dose of anti-CCR8 antibody (e.g., daily, weekly, q2w, q3w, or q4w as described above), followed by the administration of the additional therapeutically active compound or therapy. Without being limited by theory, the time between the initial dose of anti-CCR8 antibody and the other therapeutically active compound should be chosen to allow for intratumoral Treg depletion of at least 40, 50, or 60%. The anti-CCR8 antibody may be an inventive anti-CCR8 antibody as described herein, but it may also be any other therapeutically suitable anti-CCR8 antibody. The tumor may be any tumor described herein, for example, for aspect 22. Preferably, the tumor or disease is characterized by chemokine receptor-positive cells, such as CCR8-positive regulatory T cells or CCR8-positive tumor cells. Preferably, the tumor is or was initially an ICI-responsive tumor. Since acquired resistance to PD(L)-1 antibodies can be strongly influenced by intratumoral activated regulatory T cells (characterized by CCR8 expression), sequential treatment with an anti-CCR8 antibody combined with a checkpoint inhibitor is beneficial to overcome such resistance. Administration of the additional therapeutically active compound or therapy after the first dose of the anti-CCR8 antibody has been found to substantially improve treatment efficacy, even for extremely challenging tumor models. The time between the first dose of the anti-CCR8 antibody and the dose of the other therapeutically active compound should be sufficient to induce an initial antitumor immune response. According to the data provided here (as per Examples 12.6 ff), this is indicated by an increase in the ratio of intratumoral CD8 cells to T reg cells by at least a factor of 2, 3, 4, or 5, or by (temporary) depletion of at least 40, 45, 50, 55, 60, 65, or 70% of intratumoral Treg cells.
[00785] O composto ou terapia terapeuticamente ativo adicional pode ser qualquer composto ou terapia descrito em outro lugar aqui. O composto terapeuticamente ativo pode ou não ser um inibidor de ponto de verificação, por exemplo, um anticorpo anti-PD-L1, um anticorpo anti-PD1 ou um anticorpo anti-CTLA4. Embora o segundo agente terapêutico possa ser um produto terapêutico não direcionado, constatou- se que os produtos terapêuticos direcionados são altamente preferidos para esta finalidade. Os produtos terapêuticos direcionados, como aqui definidos, são compostos terapeuticamente ativos que reconhecem especificamente células tumorais em vez de todas as células de divisão rápida ou populações de células imunes. Embora os agentes direcionados a todas as células em divisão ou que afetem as populações de células imunes possam ser usados em combinação e possam melhorar a eficácia (conforme Exemplo 12.6.8, 12.6.9), eles podem interferir nas populações de células imunes que eram necessárias para uma resposta tumoral imunológica sustentável. Este problema foi resolvido pelo uso de um anticorpo que tem como alvo a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais. Os produtos terapêuticos direcionados preferidos são anticorpos que se ligam a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais.[00785] The additional therapeutically active compound or therapy may be any compound or therapy described elsewhere herein. The therapeutically active compound may or may not be a checkpoint inhibitor, for example, an anti-PD-L1 antibody, an anti-PD1 antibody, or an anti-CTLA4 antibody. Although the second therapeutic agent may be a non-targeted therapeutic product, targeted therapeutic products have been found to be highly preferred for this purpose. Targeted therapeutic products, as defined herein, are therapeutically active compounds that specifically recognize tumor cells rather than all rapidly dividing cells or immune cell populations. While agents targeting all dividing cells or affecting immune cell populations may be used in combination and may improve efficacy (as per Example 12.6.8, 12.6.9), they may interfere with immune cell populations that were necessary for a sustained tumor immune response. This problem was solved by using an antibody that targets a protein specifically expressed by tumor cells. Preferred targeted therapeutic products are antibodies that bind to a protein specifically expressed by tumor cells.
[00786] Preferivelmente, o composto terapeuticamente ativo ou terapia adicional é selecionado dea) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo uma proteína de ponto de verificação, tal como PD-(L)1 ou CTLA- 4,b) um agente quimioterapêutico, preferivelmente um taxa- no, paclitaxel, doxorrubicina, cis-platina, carboplatina, oxaliplatina ou gencitabina,c) um anticorpo que tem como alvo um outro receptor de quimiocina, tal como CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1 ou CXCR1, d) um anticorpo que tem como alvo a uma proteína que é expressa especificamente pelas células tumorais,e) um anticorpo ou uma pequena molécula que tem como alvo HER2 e/ou EGFR,f) um inibidor de quinase direcionado, tal como Sorafinib, Regorafenibe ou MEKi-1,g) o padrão de tratamento para qualquer câncer de cabeça e pescoço, câncer de mama, câncer gástrico, câncer de pulmão, carcinoma de células escamosas, tumor esofágico, melanoma, câncer de bexiga, câncer de fígado e/ou câncer de próstata,h) radioterapia e/oui) (um composto ou anticorpo para) depleção de células B intratumorais, preferivelmente células B CD19+.[00786] Preferably, the therapeutically active compound or additional therapy is selected from a) an antibody or small molecule targeting a checkpoint protein, such as PD-(L)1 or CTLA-4, b) a chemotherapeutic agent, preferably a taxane, paclitaxel, doxorubicin, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin, or gemcitabine, c) an antibody targeting another chemokine receptor, such as CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1, or CXCR1, d) an antibody targeting a protein specifically expressed by tumor cells, e) an antibody or small molecule targeting HER2 and/or EGFR, f) a targeted kinase inhibitor, such as Sorafinib, Regorafenib or MEKi-1, g) the standard of care for any head and neck cancer, breast cancer, gastric cancer, lung cancer, squamous cell carcinoma, esophageal tumor, melanoma, bladder cancer, liver cancer and/or prostate cancer, h) radiotherapy and/or i) (a compound or antibody for) depletion of intratumoral B cells, preferably CD19+ B cells.
[00787] Taxanos adequados podem ser selecionados, por exemplo, de paclitaxel, abraxano, cabazitaxel ou docetaxel, ou derivados dos mesmos.[00787] Suitable taxanes may be selected, for example, from paclitaxel, abraxane, cabazitaxel or docetaxel, or derivatives thereof.
[00788] Preferivelmente, a dose do composto ou terapia terapeuti- camente ativo adicional é a primeira dose do composto ou terapia te- rapeuticamente ativo adicional mencionado.ASPECTO 32 - Métodos de estratificação/métodos diagnósticos[00788] Preferably, the dose of the additional therapeutically active compound or therapy is the first dose of the additional therapeutically active compound or therapy mentioned. ASPECT 32 - Stratification methods/diagnostic methods
[00789] Como descrito em outro lugar aqui, as etapas de estratificação descritas para as quartas modalidades de acordo com o 22° aspecto podem ser usadas como parte de um método de tratamento de acordo com o 22° aspecto ou são fornecidas de forma independente comoa) um método para selecionar indivíduos que provavelmente se beneficiarão do tratamento com um anticorpo anti-CCR8,b) um método de diagnóstico para diagnosticar um tumor como sensível para tratamento com um anticorpo anti-CCR8, ouc) um método para monitorar o sucesso do tratamento para tratamento com um anticorpo anti-CCR8.[00789] As described elsewhere herein, the stratification steps described for the fourth modalities according to the 22nd aspect may be used as part of a treatment method according to the 22nd aspect or are provided independently as a) a method for selecting individuals who are likely to benefit from treatment with an anti-CCR8 antibody, b) a diagnostic method for diagnosing a tumor as sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody, or c) a method for monitoring treatment success for treatment with an anti-CCR8 antibody.
[00790] Para o aspecto atual, o anticorpo pode ser um anticorpo de acordo com a presente invenção, mas também pode ser qualquer anticorpo anti-CCR8 terapeuticamente adequado.Biomarcador para tratamento de anticorpos anti-CCR8[00790] For the present aspect, the antibody may be an antibody according to the present invention, but it may also be any therapeutically suitable anti-CCR8 antibody. Biomarker for anti-CCR8 antibody treatment
[00791] Até agora, nenhum biomarcador está disponível para prever ou monitorar o sucesso do tratamento para anticorpos anti-CCR8. Embora o modo de ação demonstrado sugira que o próprio CCR8 pode servir como um possível biomarcador, os inventores descobriram que os níveis de CCR8 são um pouco difíceis de avaliar em uma configuração clínica ou em estudos clínicos. Para resolver este problema premente, os inventores geraram hipóteses e puderam validar algumas delas como biomarcadores adequados com excelente poder pre- ditivo, veja, por exemplo, os Exemplos 12.7.1 e 12.7.2. O nível de expressão do marcador é geralmente determinado com um ensaio ou um método conhecido na técnica e o nível é subsequentemente comparado com um valor de referência como descrito em outro lugar aqui e é subsequentemente usado para prever ou monitorar a resposta ao tratamento.[00791] To date, no biomarker is available to predict or monitor treatment success for anti-CCR8 antibodies. Although the demonstrated mode of action suggests that CCR8 itself may serve as a potential biomarker, the inventors found that CCR8 levels are somewhat difficult to assess in a clinical setting or in clinical studies. To address this pressing problem, the inventors generated hypotheses and were able to validate some of them as suitable biomarkers with excellent predictive power, see, for example, Examples 12.7.1 and 12.7.2. The marker expression level is generally determined with an assay or method known in the art, and the level is subsequently compared to a reference value as described elsewhere herein and is subsequently used to predict or monitor treatment response.
[00792] É fornecido um biomarcador para uso em um método para diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, o uso compreendendo:a. determinar o nível do biomarcador em um tumor ou amostra de tumor compreendendo células T regulatórias,b. comparar o nível do biomarcador com uma amostra ou valor de referência, ec. diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, se o nível do biomarcador for maior ou igual a uma amostra ou valor de referência, em que o biomarcador éd. uma proteína de ponto de verificação imunológica, preferivelmente PD-1, PD-L1 ou CTLA4,e. uma granzima ou marcador de células imunes, preferivelmente um marcador para linfócitos, células efetoras, células T, células T citotóxicas, células de macrófagos, células de macrófagos M1, células de macrófagos M2, células B, células NK ou uma combinação dos mesmos,f. um marcador de infiltração de Treg, preferivelmente CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9,CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7 ou CXCL9,g. um marcador de células T ou marcador de células T cito- tóxicas preferivelmente selecionado de CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, 4-1BB, OX-40 ou GITR,h. um interferon ou proteína induzível por interferon preferivelmente selecionada de IFN gama, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 e TNF alfa,i. um fator de complemento, j. uma serpina e/ouk. uma molécula derivada de um gene de acordo com a Tabela 12.7.2.1, 12.7.2.2 ou 12.7.2.3.[00792] A biomarker is provided for use in a method for diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody, the use comprising: a. determining the level of the biomarker in a tumor or tumor sample comprising regulatory T cells, b. comparing the level of the biomarker with a sample or reference value, and c. diagnosing/stratifying an individual as having a tumor sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody if the level of the biomarker is greater than or equal to a sample or reference value, wherein the biomarker is d. an immune checkpoint protein, preferably PD-1, PD-L1 or CTLA4, and a granzyme or immune cell marker, preferably a marker for lymphocytes, effector cells, T cells, cytotoxic T cells, macrophages, M1 macrophages, M2 macrophages, B cells, NK cells, or a combination thereof, f. a Treg infiltration marker, preferably CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7, or CXCL9, g. a T-cell marker or cytotoxic T-cell marker preferably selected from CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, 4-1BB, OX-40 or GITR, h. an interferon or interferon-inducible protein preferably selected from IFN gamma, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 and TNF alpha, i. a complement factor, j. a serpin and/or k. a molecule derived from a gene according to Table 12.7.2.1, 12.7.2.2 or 12.7.2.3.
[00793] Preferivelmente, o biomarcador é uma proteína de ponto de verificação imunológica, mais preferivelmente PD-1, PD-L1 ou CTLA4.[00793] Preferably, the biomarker is an immune checkpoint protein, most preferably PD-1, PD-L1 or CTLA4.
[00794] Também é fornecido o uso de um biomarcador para prever ou monitorar o sucesso terapêutico de uma terapia compreendendo a administração de um anticorpo anti-CCR8, o uso compreendendo a. determinar o nível do biomarcador em uma amostra, e b. comparar o nível do biomarcador com uma amostra ou valor de referência, em que o biomarcador éc. uma proteína de ponto de verificação imunológica, preferivelmente PD-1, PD-L1 ou CTLA4,d. um marcador de granzima ou célula imune, preferivelmente um marcador para linfócitos, células efetoras, células T, células T citotóxicas, células de macrófagos, células de macrófagos M1, células de macrófagos M2, células B, células NK ou uma combinação dos mesmose. um marcador de infiltração de Treg, preferivelmente selecionado de FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7, CXCL9,f. um marcador de células T ou marcador de células T cito- tóxicas, preferivelmente selecionado de CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5 e membros da superfamília de receptores de TNF, como 4-1BB, OX-40 ou GITR,g. uma proteína induzível por interferon, preferivelmente selecionada de IFN gama, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 e TNF alfa,h. um fator de complemento,i. uma serpina e/ouj. uma molécula derivada de um gene de acordo com a Tabela 12.7.2.1, 12.7.2.2 ou 12.7.2.3.[00794] Also provided is the use of a biomarker to predict or monitor the therapeutic success of a therapy comprising the administration of an anti-CCR8 antibody, the use comprising a. determining the level of the biomarker in a sample, and b. comparing the level of the biomarker with a sample or reference value, wherein the biomarker is c. an immune checkpoint protein, preferably PD-1, PD-L1 or CTLA4, d. a granzyme or immune cell marker, preferably a marker for lymphocytes, effector cells, T cells, cytotoxic T cells, macrophages, M1 macrophages, M2 macrophages, B cells, NK cells or a combination thereof. a Treg infiltration marker, preferably selected from FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7, CXCL9,f. a T cell marker or cytotoxic T cell marker, preferably selected from CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5 and members of the TNF receptor superfamily, such as 4-1BB, OX-40 or GITR,g. an interferon-inducible protein, preferably selected from IFN gamma, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 and TNF alpha,h. a complement factor,i. a serpin and/or a molecule derived from a gene according to Table 12.7.2.1, 12.7.2.2 or 12.7.2.3.
[00795] Preferivelmente, o biomarcador é uma proteína de ponto de verificação imunológica, mais preferivelmente PD-1, PD-L1 ou CTLA4.[00795] Preferably, the biomarker is an immune checkpoint protein, most preferably PD-1, PD-L1 or CTLA4.
[00796] Além disso, é também fornecida uma molécula que se liga a um biomarcador para uso em um método para diagnosti- car/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, o uso compreendendo determinar o nível do biomarcador em um tumor ou amostra de tumor usando a molécula ligando o biomarcador, em que o biomarcador é (preferivelmente)a. uma proteína de ponto de verificação imunológica, preferivelmente PD-1, PD-L1 ou CTLA4,b. um marcador de granzima ou célula imune, preferivelmente um marcador para linfócitos, células efetoras, células T, células T citotóxicas, células de macrófagos, células de macrófagos M1, células de macrófagos M2, células B, células NK ou uma combinação dos mesmosc. um marcador de infiltração de Treg, preferivelmente CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9,CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7 ou CXCL9,d. um marcador de células T ou marcador de células T cito- tóxicas preferivelmente selecionado de CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, 4-1BB, OX-40 ou GITR,e. um interferon ou proteína induzível por interferon preferivelmente selecionado de IFN gama, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 e TNF alfa,f. um fator de complemento,g. uma serpina e/ouh. uma molécula derivada de um gene de acordo com a Tabela 12.7.2.1, 12.7.2.2 ou 12.7.2.3.[00796] In addition, a molecule that binds to a biomarker is also provided for use in a method for diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody, the use comprising determining the level of the biomarker in a tumor or tumor sample using the biomarker-binding molecule, wherein the biomarker is (preferably) a. an immune checkpoint protein, preferably PD-1, PD-L1 or CTLA4, b. a granzyme or immune cell marker, preferably a marker for lymphocytes, effector cells, T cells, cytotoxic T cells, macrophage cells, M1 macrophage cells, M2 macrophage cells, B cells, NK cells or a combination thereof c. a marker of Treg infiltration, preferably CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7 or CXCL9, d. a T cell marker or cytotoxic T cell marker preferably selected from CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, 4-1BB, OX-40 or GITR, e. an interferon or interferon-inducible protein preferably selected from IFN gamma, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 and TNF alpha, f. a complement factor, g. a serpin and/or h. a molecule derived from a gene according to Table 12.7.2.1, 12.7.2.2 or 12.7.2.3.
[00797] A molécula que se liga ao biomarcador é preferivelmente um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno, ou um conjugado do mesmo. Mais preferivelmente, a molécula que se liga ao biomarca- dor é um anticorpo anti-PD-1, PD-L1 ou CTLA4, como Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab ou Ipilimumab.[00797] The molecule that binds to the biomarker is preferably an antibody or antigen-binding fragment, or a conjugate thereof. More preferably, the molecule that binds to the biomarker is an anti-PD-1, PD-L1 or CTLA4 antibody, such as Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab or Ipilimumab.
[00798] Além disso, também é fornecido o uso de uma molécula que se liga a um biomarcador para prever ou monitorar o sucesso te- rapêutico de uma terapia compreendendo a administração de um anticorpo anti-CCR8, o uso compreendendo determinar o nível do biomar- cador em um tumor ou amostra de tumor usando a molécula que se liga ao biomarcador, em que o biomarcador é (preferivelmente)a. uma proteína de ponto de verificação imunológica, preferivelmente PD-1, PD-L1 ou CTLA4,b. uma granzima ou marcador de células imunes, preferivelmente um marcador para linfócitos, células efetoras, células T, células T citotóxicas, células de macrófagos, células de macrófagos M1, células de macrófagos M2, células B, células NK ou uma combinação dos mesmos,c. um marcador de infiltração de Treg, preferivelmente CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9,CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7 ou CXCL9,d. um marcador de células T ou marcador de células T cito- tóxicas preferivelmente selecionado de CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, 4-1BB, OX-40 ou GITR,e. um interferon ou proteína induzível por interferon preferivelmente selecionada de IFN gama, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 e TNF alfa,f. um fator de complemento,g. uma serpina e/ouh. uma molécula derivada de um gene de acordo com a Tabela 12.7.2.1, 12.7.2.2 ou 12.7.2.3, eem que a molécula que se liga ao biomarcador é preferivelmente um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno, ou um conjugado do mesmo. Mais preferivelmente, a molécula que se liga ao biomarcador é um anticorpo antiponto de verificação, anti-PD-1, anti-PD-L1 ou anti- CTLA4, como Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab ou Ipilimumab.[00798] In addition, the use of a molecule that binds to a biomarker to predict or monitor the therapeutic success of a therapy comprising the administration of an anti-CCR8 antibody is also provided, the use comprising determining the level of the biomarker in a tumor or tumor sample using the molecule that binds to the biomarker, wherein the biomarker is (preferably) a. an immune checkpoint protein, preferably PD-1, PD-L1 or CTLA4, b. a granzyme or immune cell marker, preferably a marker for lymphocytes, effector cells, T cells, cytotoxic T cells, macrophage cells, M1 macrophage cells, M2 macrophage cells, B cells, NK cells or a combination thereof, c. a marker of Treg infiltration, preferably CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7 or CXCL9, d. a T cell marker or cytotoxic T cell marker preferably selected from CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, 4-1BB, OX-40 or GITR, e. an interferon or interferon-inducible protein preferably selected from IFN gamma, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 and TNF alpha, f. a complement factor, g. a serpin and/or h. a molecule derived from a gene according to Table 12.7.2.1, 12.7.2.2 or 12.7.2.3, wherein the molecule that binds to the biomarker is preferably an antibody or antigen-binding fragment, or a conjugate thereof. More preferably, the molecule that binds to the biomarker is an anti-checkpoint, anti-PD-1, anti-PD-L1 or anti-CTLA4 antibody, such as Nivolumab, Pembrolizumab, Atezolizumab, Avelumab, Durvalumab, Cemiplimab, Dostarlimab or Ipilimumab.
[00799] Em modalidades preferidas do aspecto atual, o biomarca- dor é um marcador de células imunes e a molécula que se liga a um biomarcador é preferivelmente um anticorpo que se liga a um marcador para linfócitos, células efetoras, células T, células T citotóxicas, células de macrófagos, células de macrófagos M1, células M2 células de macrófagos, células B, células NK ou uma combinação das mesmas.[00799] In preferred embodiments of the present aspect, the biomarker is a marker of immune cells and the molecule that binds to a biomarker is preferably an antibody that binds to a marker for lymphocytes, effector cells, T cells, cytotoxic T cells, macrophages, M1 macrophages, M2 macrophages, B cells, NK cells or a combination thereof.
[00800] Em modalidades preferidas do aspecto atual, a molécula que se liga ao biomarcador é uma molécula que se liga a um marcador de infiltração de Treg, preferivelmente um anticorpo que se liga a CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9,CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7 ou CXCL9.[00800] In preferred embodiments of the present aspect, the biomarker-binding molecule is a molecule that binds to a Treg infiltration marker, preferably an antibody that binds to CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7, or CXCL9.
[00801] Em modalidades preferidas do aspecto atual, a molécula que se liga ao biomarcador é um anticorpo que se liga a um marcador de células T preferivelmente selecionado de CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5 e membros da superfamília do receptor de TNF, incluindo 4-1BB, OX-40, ou GITR.[00801] In preferred embodiments of the present aspect, the molecule that binds to the biomarker is an antibody that binds to a T-cell marker preferably selected from CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, and members of the TNF receptor superfamily, including 4-1BB, OX-40, or GITR.
[00802] Em modalidades preferidas do aspecto atual, a molécula que se liga ao biomarcador é um anticorpo que se liga a um interferon ou proteína induzível por interferon preferivelmente selecionada de INF gama, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 e TNF alfa.Proteína de ponto de verificação imunológica como biomarcador para tratamento de anticorpos anti-CCR8[00802] In preferred embodiments of the present aspect, the biomarker-binding molecule is an antibody that binds to an interferon or interferon-inducible protein, preferably selected from INF gamma, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2, and TNF alpha. Immune checkpoint protein as a biomarker for anti-CCR8 antibody treatment.
[00803] De acordo com a presente invenção, descobriu-se surpreendentemente que a resposta à (mono)terapia com anticorpo anti- CCR8 foi melhorada para indivíduos que responderam pelo menos inicialmente ao tratamento com ICI e, em particular, ao tratamento com anticorpos anti-PD-(L)1 ou CTLA4, veja, por exemplo, Tabela 12.7.1. Como a expressão de PD-L1 é um preditor de responsividade ao tratamento com anticorpo anti-PD-L1, os inventores levantaram a hipótese de que a expressão de PD-L1 e a expressão da proteína de ponto de verificação per se também podem ser adequadas para prever diretamente a resposta ao tratamento com anticorpo anti-CCR8. Esta hipótese pode ser confirmada por dados de correlação entre a expressão de PD-L1 e a resposta ao tratamento com anticorpos anti-CCR8 (Tabela 12.8.1). A expressão de PD-L1 pode ser determinada como conhecido na técnica, por exemplo, sem limitação, usando a pontuação de proporção de tumor (TPS), pontuação positiva combinada (CPS) ou expressão de mRNA. Os inventores, portanto, sugerem marcador de ponto de verificação imunológica e particularmente PD-L1 como marcador substituto para estratificação para superar o problema de que CCR8 é difícil de analisar e, portanto, difícil de implementar para selecionar populações de pacientes que provavelmente poderiam se bene-ficiar do tratamento com anticorpos anti-CCR8.[00803] According to the present invention, it has been surprisingly found that the response to (mono)therapy with anti-CCR8 antibody was improved for individuals who responded at least initially to ICI treatment and, in particular, to treatment with anti-PD-(L)1 or CTLA4 antibodies, see, for example, Table 12.7.1. Since PD-L1 expression is a predictor of responsiveness to anti-PD-L1 antibody treatment, the inventors hypothesized that PD-L1 expression and checkpoint protein expression per se may also be suitable for directly predicting the response to anti-CCR8 antibody treatment. This hypothesis can be confirmed by correlation data between PD-L1 expression and response to anti-CCR8 antibody treatment (Table 12.8.1). PD-L1 expression can be determined as known in the art, for example, without limitation, using tumor proportion score (TPS), combined positive score (CPS), or mRNA expression. The inventors, therefore, suggest an immunological checkpoint marker, and particularly PD-L1, as a surrogate marker for stratification to overcome the problem that CCR8 is difficult to analyze and therefore difficult to implement for selecting patient populations that could likely benefit from treatment with anti-CCR8 antibodies.
[00804] Consequentemente, é fornecida uma molécula que se liga a uma proteína de ponto de verificação imunológica para uso em um método para diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, o método compreendendo:a. determinar o nível da expressão da proteína do ponto de verificação imunológica em um tumor (amostra),b. comparar o nível de expressão da proteína do ponto de verificação imunológica com uma amostra ou valor de referência, ec. diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, se o nível de expressão da proteína do ponto de verificação imunológica for maior ou igual a uma amostra ou valor de referência.[00804] Consequently, a molecule is provided that binds to an immune checkpoint protein for use in a method for diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody, the method comprising: a. determining the expression level of the immune checkpoint protein in a tumor (sample), b. comparing the expression level of the immune checkpoint protein with a sample or reference value, and c. diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody if the expression level of the immune checkpoint protein is greater than or equal to a sample or reference value.
[00805] Além disso, é fornecido o uso de uma molécula que se liga a uma proteína de ponto de verificação imunológica para monitorar o sucesso do tratamento da terapia com anticorpos anti-CCR8, o método compreendendo:a. determinar o nível da expressão da proteína do ponto de verificação imunológica em um tumor (amostra)/uma amostra, eb. comparar o nível de expressão da proteína do ponto de verificação imunológica com uma amostra ou valor de referência.[00805] In addition, the use of a molecule that binds to an immune checkpoint protein to monitor the success of anti-CCR8 antibody therapy treatment is provided, the method comprising: a. determining the expression level of the immune checkpoint protein in a tumor (sample)/a sample, and b. comparing the expression level of the immune checkpoint protein with a reference sample or value.
[00806] A molécula que se liga a uma proteína de ponto de verificação imunológica é preferivelmente um anticorpo. A proteína do ponto de verificação imunológica é preferivelmente PD-1, PD-L1 ou CTLA4. A molécula que se liga a uma proteína de ponto de verificação imuno- lógica é preferivelmente um anticorpo que se liga a PD-1, PD-L1 ou CTLA4. Por exemplo, o anticorpo pode ser PD-L1 28-8, PD-L1 22C3, PD-L1 SP142, PD-L1 SP263 ou qualquer outro anticorpo adequado conhecido na técnica como diagnóstico complementar. Em modalidades particularmente preferidas, o nível de expressão da proteína do ponto de verificação é determinado com base na pontuação positiva combinada (CPS) ou na pontuação da proporção do tumor (TPS). Um tumor de paciente ou paciente é diagnosticado/estratificado como sensível para tratamento com um anticorpo anti-CCR8, se a expressão da proteína do ponto de verificação imunológica estiver presente ou alta, por exemplo, conforme indicado por um CPS > 1, preferivelmente por um CPS > 5, mais preferivelmente por um CPS > 10, ou conforme indi-cado por um TPS > 1%, preferivelmente por um TPS > 10%, mais preferivelmente por um TPS > 50%. Desse modo, em algumas modalidades preferidas, o valor de referência é CPS = 1, mais preferivelmente CPS = 5 ou mais preferivelmente CPS = 10. Em algumas outras ou nas mesmas modalidades preferidas, o valor de referência é TPS = 1%, mais preferivelmente TPS = 10 %, ou mais preferivelmente TPS > 50%.[00806] The molecule that binds to an immune checkpoint protein is preferably an antibody. The immune checkpoint protein is preferably PD-1, PD-L1, or CTLA4. The molecule that binds to an immune checkpoint protein is preferably an antibody that binds to PD-1, PD-L1, or CTLA4. For example, the antibody could be PD-L1 28-8, PD-L1 22C3, PD-L1 SP142, PD-L1 SP263, or any other suitable antibody known in the art as complementary diagnostic. In particularly preferred embodiments, the expression level of the checkpoint protein is determined based on the combined positive score (CPS) or the tumor ratio score (TPS). A patient's tumor is diagnosed/stratified as sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody if the expression of the immune checkpoint protein is present or high, for example, as indicated by a CPS > 1, preferably by a CPS > 5, more preferably by a CPS > 10, or as indicated by a TPS > 1%, preferably by a TPS > 10%, more preferably by a TPS > 50%. Thus, in some preferred embodiments, the reference value is CPS = 1, more preferably CPS = 5 or more preferably CPS = 10. In some other or the same preferred embodiments, the reference value is TPS = 1%, more preferably TPS = 10%, or more preferably TPS > 50%.
[00807] Em algumas modalidades preferidas, a expressão de PD- L1 é determinada por um CPS > 1, preferivelmente por um CPS > 5, mais preferivelmente por um CPS > 10 ou é determinada por um TPS > 1%, preferivelmente por um TPS > 10%, mais preferivelmente por um TPS > 50%.Marcador de infiltração de Treg como biomarcador para tratamento de anticorpos anti-CCR8[00807] In some preferred embodiments, PD-L1 expression is determined by a CPS > 1, preferably by a CPS > 5, more preferably by a CPS > 10, or by a TPS > 1%, preferably by a TPS > 10%, more preferably by a TPS > 50%. Treg infiltration marker as a biomarker for anti-CCR8 antibody treatment.
[00808] É fornecida uma molécula que se liga a um marcador de infiltração de Treg para uso em um método para diagnosti- car/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, o método compreendendo:a. determinar o nível da expressão do marcador de infiltração de Treg em um tumor (amostra),b. comparar o nível da expressão do marcador de infiltração Treg com uma amostra ou valor de referência, ec. diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, se o nível do marcador de infiltração de Treg for maior ou igual a uma amostra ou valor de referência.[00808] A molecule is provided that binds to a Treg infiltration marker for use in a method for diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody, the method comprising: a. determining the level of expression of the Treg infiltration marker in a tumor (sample), b. comparing the level of expression of the Treg infiltration marker with a sample or reference value, and c. diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody if the level of the Treg infiltration marker is greater than or equal to a sample or reference value.
[00809] O marcador de infiltração de Treg é um marcador altamente expresso em Tregs ativados. Preferivelmente, o marcador de infiltração de Treg é selecionado de CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7, CXCL9, conforme Tabela 11.1.1, Tabela 12.8.1. O marcador de infiltração Treg pode ser diferente do CCR8. A molécula que se liga a um marcador de infiltração de Treg é preferivelmente um anticorpo, por exemplo, um anticorpo que se liga a um ou mais marcadores de infiltração de Treg.[00809] The Treg infiltration marker is a marker highly expressed on activated Tregs. Preferably, the Treg infiltration marker is selected from CCR8, FOXP3, ICOS, CCR4, TIGIT, P2RY10, CD80, TNFRSF9, CD3(G), SLAMF1, IL7R, IL2RB, CTLA4, CD5, ITK, IL2RA, LAX1, IKZF3, GBP5, CXCR6, SIRPG, CD2, CSF2RB, SLAMF7, CXCL9, as per Table 11.1.1, Table 12.8.1. The Treg infiltration marker may be different from CCR8. The molecule that binds to a Treg infiltration marker is preferably an antibody, for example, an antibody that binds to one or more Treg infiltration markers.
[00810] O marcador de infiltração de Treg aqui descrito também pode ser usado como biomarcador para controlar o sucesso do tratamento, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui. Um tratamento é considerado bem-sucedido se for obtida uma depleção (temporária) de Treg de pelo menos 40% ou 50%, conforme indicado, por exemplo, por uma diminuição do marcador de infiltração de Treg por um fator de 2.Marcador de células imunes como biomarcador para tratamento de anticorpos anti-CCR8[00810] The Treg infiltration marker described herein can also be used as a biomarker to monitor treatment success, for example, as described elsewhere herein. A treatment is considered successful if a (temporary) depletion of Treg of at least 40% or 50% is achieved, as indicated, for example, by a decrease in the Treg infiltration marker by a factor of 2. Immune cell marker as a biomarker for anti-CCR8 antibody treatment
[00811] É fornecida uma molécula que se liga a um marcador de células imunes para uso em um método para diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, o método compreendendoa. determinar o nível da expressão do marcador de células imunes em um tumor (amostra),b. comparar o nível da expressão do marcador de células imunes com uma amostra ou valor de referência, ec. diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, se o nível do marcador de células imunes for maior ou igual a uma amostra ou valor de referência.[00811] A molecule is provided that binds to an immune cell marker for use in a method for diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody, the method comprising: a. determining the level of expression of the immune cell marker in a tumor (sample); b. comparing the level of expression of the immune cell marker with a sample or reference value; and c. diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody if the level of the immune cell marker is greater than or equal to a sample or reference value.
[00812] O marcador de células imunes pode ser um marcador para linfócitos, células efetoras, células T, células T citotóxicas, células de macrófagos, células de macrófagos M1, células de macrófagos M2, células B, células NK ou uma combinação dos mesmos. Marcadores adequados para essas populações de células imunes são descritos ao longo desta invenção. Por exemplo, marcadores de células T adequados incluem CD3 (por exemplo, CD3E, D e/ou G). Por exemplo, marcadores de células T citotóxicas adequados incluem CD8 (por exemplo, CD8A e/ou B). Por exemplo, marcadores de células de macrófa- gos adequados incluem MS4A7. Por exemplo, marcadores de células M1 de macrófagos adequados incluem Acod1. Por exemplo, marcadores de células de macrófagos M2 adequados incluem Mrc1. Por exemplo, marcadores de células B adequados incluem CD19, CD20, CD22 e/ou MSA41.[00812] The immune cell marker may be a marker for lymphocytes, effector cells, T cells, cytotoxic T cells, macrophages, M1 macrophages, M2 macrophages, B cells, NK cells, or a combination thereof. Suitable markers for these immune cell populations are described throughout this invention. For example, suitable T cell markers include CD3 (e.g., CD3E, D, and/or G). For example, suitable cytotoxic T cell markers include CD8 (e.g., CD8A and/or B). For example, suitable macrophage cell markers include MS4A7. For example, suitable M1 macrophage cell markers include Acod1. For example, suitable M2 macrophage cell markers include Mrc1. For example, suitable B cell markers include CD19, CD20, CD22, and/or MSA41.
[00813] O marcador de células imunes descrito aqui também pode ser usado como biomarcador para controlar o sucesso do tratamento, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui. Um tratamento é considerado bem-sucedido se ocorrer um aumento (temporário) de células imunes, por exemplo, de pelo menos 50%, por exemplo, conforme indicado por um aumento do marcador de infiltração de células imunes por um fator de pelo menos 2.Marcador de células T como biomarcador para tratamento de anticorpos anti-CCR8[00813] The immune cell marker described herein may also be used as a biomarker to monitor treatment success, for example, as described elsewhere herein. A treatment is considered successful if there is a (temporary) increase in immune cells, for example, of at least 50%, as indicated by an increase in the immune cell infiltration marker by a factor of at least 2. T cell marker as a biomarker for anti-CCR8 antibody treatment
[00814] É fornecida uma molécula que se liga a um marcador de células T para uso em um método para diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, o método compreendendoa. determinar o nível da expressão do marcador de células T em um tumor (amostra),b. comparar o nível da expressão do marcador de células T com uma amostra ou valor de referência, ec. diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, se o nível do marcador de células T for maior ou igual a uma amostra ou valor de referência.[00814] A molecule is provided that binds to a T-cell marker for use in a method for diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody, the method comprising: a. determining the level of T-cell marker expression in a tumor (sample); b. comparing the level of T-cell marker expression with a sample or reference value; and c. diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody if the T-cell marker level is greater than or equal to a sample or reference value.
[00815] O marcador de células T pode ser um marcador altamente expresso em células T, como células T ativadas. Preferivelmente, o marcador de células T é selecionado de CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5 e membros da superfamília do receptor de TNF, incluindo 4-1BB, OX-40 ou GITR. A molécula que se liga ao marcador de células T é preferivelmente um anticorpo, por exemplo, um anticorpo que se liga a um ou mais dos marcadores de células T descritos aqui.[00815] The T-cell marker can be a marker highly expressed on T cells, such as activated T cells. Preferably, the T-cell marker is selected from CD3, CD4, CD8, CD25, CXCR3, CCR5, and members of the TNF receptor superfamily, including 4-1BB, OX-40, or GITR. The molecule that binds to the T-cell marker is preferably an antibody, for example, an antibody that binds to one or more of the T-cell markers described herein.
[00816] O marcador de células T descrito aqui também pode ser usado como biomarcador para controlar o sucesso do tratamento, sozinho ou em combinação com um marcador de infiltração de Treg, por exemplo, como descrito em outro lugar aqui. Um tratamento é considerado bem-sucedido se ocorrer um aumento (temporário) de células T, por exemplo, de pelo menos 50%, por exemplo, conforme indicado por um aumento do marcador de células T por um fator de pelo menos 2.Interferon ou proteína induzível por interferon como biomarcador para tratamento de anticorpos anti-CCR8[00816] The T-cell marker described herein may also be used as a biomarker to monitor treatment success, alone or in combination with a Treg infiltration marker, for example, as described elsewhere herein. A treatment is considered successful if a (temporary) increase in T cells occurs, for example, of at least 50%, as indicated by an increase in the T-cell marker by a factor of at least 2. Interferon or interferon-inducible protein as a biomarker for anti-CCR8 antibody treatment.
[00817] É fornecido um interferon ou proteína induzível por interferon para uso em um método para diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8 ou para monitorar o sucesso do tratamento, o método com-preendendo:a. determinar o nível de interferon ou proteína induzível por interferon em um tumor (amostra),b. comparar o nível do interferon ou proteína induzível por interferon com uma amostra ou valor de referência, ec. diagnosticar/estratificar um indivíduo como tendo um tumor que é sensível ao tratamento com um anticorpo anti-CCR8, se o nível de interferon ou proteína induzível por interferon for maior ou igual a uma amostra ou valor de referência.[00817] An interferon or interferon-inducible protein is provided for use in a method for diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody or for monitoring treatment success, the method comprising: a. determining the level of interferon or interferon-inducible protein in a tumor (sample), b. comparing the level of interferon or interferon-inducible protein with a sample or reference value, and c. diagnosing/stratifying an individual as having a tumor that is sensitive to treatment with an anti-CCR8 antibody if the level of interferon or interferon-inducible protein is greater than or equal to a sample or reference value.
[00818] O interferon ou proteínas induzíveis por interferon são preferivelmente selecionados de IFN gama, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 e TNF alfa. De acordo com a presente invenção, verificou-se que a correlação da expressão de mRNA de CCR8 com o marcador de inflamação IFN gama foi significativa para 50 indicações de tumor, conforme Tabela 11.1.2. A partir disso, pode-se concluir que os níveis de IFN gama podem ser adequados como biomarcadores, como descrito aqui. Isto foi confirmado, por exemplo, no Exemplo 12.6.2, onde os níveis de IFN gama e também de TNF alfa se correlacionaram com a resposta ao tratamento. Em um experimento diferente (Exemplo 12.6.6), níveis aumentados de IFN gama, IL-1b e IL-2 foram associados a uma eficácia melhorada. Os genes ou proteínas estimulados por interferon adequados incluem, sem limitação, ACOD1, ACTG1, ACTR2, ACTR3, ADAMTS13, AIF1, AQP4, ASS1, B2M, BST2, C9JQL5, CALCOCO2, CAMK2A, CAMK2B, CAMK2D, CAMK2G, CASP1, CCL1, CCL11, CCL13, CCL14, CCL15, CCL15, CCL14, CCL16, CCL17, CCL18, CCL19, CCL2, CCL20, CCL21, CCL22, CCL23, CCL24, CCL25, CCL26, CCL3, CCL3L1, CCL4, CCL4L1, CCL5, CCL7, CCL8, CD40, CD44, CD58, CDC42EP2, CDC42EP4, CIITA, CITED1, CLDN1,CX3CL1, CXCL16, CYP27B1 DAPK1, DAPK3, EDN1, EPRS, EVL, FCGR1A, FCGR1B, FLNB, GAPDH, GBP1, GBP2, GBP4, GBP5, GBP6, GCH1, GSN, HCK, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DPA1, HLA- DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQA2, HLA-DQB1, HLA-DQB2, HLA-DRA HLA-DRB1, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-E, HLA-F, HLA- G, HLA-H, ICAM1, IFI30, IFITM1, IFITM2, IFITM3, IFNG, IFNGR1, IFNGR2, IL12B, IL12RB1 IL23R, IRF1, IRF2, IRF3, IRF4, IRF5, IRF6, IRF7, IRF8, IRF9, JAK1, JAK2, KIF16B, KIF5B, KYNU, LGALS9, MEFV, MID1, MRC1, MT2A, MYO1C, NCAM1, NMI, NOS2, NUB1, OAS1, OAS2, OAS3, OASL, PDE12, PML, PRKCD, PTAFR, RAB12, RAB20, RAB43, RAB7B, RPL13A, RPS6KB1 RYDEN, SEC61A1 SLC11A1 SLC26A6 SLC30A8 SNCA, SP100, STAR, STAT1, STX4, STX8, STXBP1, STXBP2, STXBP3, STXBP4, SYNCRIP TDGF1, TLR2, TLR3, TLR4, TRIM21, TRIM22, TRIM25, TRIM26, TRIM31, TRIM34, TRIM38, TRIM5, TRIM62, TRIM68, TRIM8, UBD, VAMP3, VCAM1, VIM, VPS26B, WAS, WNT5A, XCL1, XCL2, ZYX.EXEMPLOS Exemplo 1: Alinhamento de receptores de quimiocinas CC e receptores de quimiocinas CXC[00818] Interferon or interferon-inducible proteins are preferably selected from IFN gamma, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2, and TNF alpha. According to the present invention, the correlation of CCR8 mRNA expression with the inflammation marker IFN gamma was found to be significant for 50 tumor indications, as shown in Table 11.1.2. From this, it can be concluded that IFN gamma levels may be suitable as biomarkers, as described herein. This was confirmed, for example, in Example 12.6.2, where IFN gamma and TNF alpha levels correlated with treatment response. In a different experiment (Example 12.6.6), increased levels of IFN gamma, IL-1b, and IL-2 were associated with improved efficacy. Suitable interferon-stimulated genes or proteins include, but are not limited to, ACOD1, ACTG1, ACTR2, ACTR3, ADAMTS13, AIF1, AQP4, ASS1, B2M, BST2, C9JQL5, CALCOCO2, CAMK2A, CAMK2B, CAMK2D, CAMK2G, CASP1, CCL1, CCL11, CCL13, CCL14, CCL15, CCL15, CCL14, CCL16, CCL17, CCL18, CCL19, CCL2, CCL20, CCL21, CCL22, CCL23, CCL24, CCL25, CCL26, CCL3, CCL3L1, CCL4, CCL4L1, CCL5, CCL7, CCL8, CD40, CD44, CD58, CDC42EP2, CDC42EP4, CIITA, CITED1, CLDN1,CX3CL1, CXCL16, CYP27B1 DAPK1, DAPK3, EDN1, EPRS, EVL, FCGR1A, FCGR1B, FLNB, GAPDH, GBP1, GBP2, GBP4, GBP5, GBP6, GCH1, GSN, HCK, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQA2, HLA-DQB1, HLA-DQB2, HLA-DRA HLA-DRB1, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-E, HLA-F, HLA- G, HLA-H, ICAM1, IFI30, IFITM1, IFITM2, IFITM3, IFNG, IFNGR1, IFNGR2, IL12B, IL12RB1 IL23R, IRF1, IRF2, IRF3, IRF4, IRF5, IRF6, IRF7, IRF8, IRF9, JAK1, JAK2, KIF16B, KIF5B, KYNU, LGALS9, MEFV, MID1, MRC1, MT2A, MYO1C, NCAM1, NMI, NOS2, NUB1, OAS1, OAS2, OAS3, OASL, PDE12, PML, PRKCD, PTAFR, RAB12, RAB20, RAB43, RAB7B, RPL13A, RPS6KB1 RYDEN, SEC61A1 SLC11A1 SLC26A6 SLC30A8 SNCA, SP100, STAR, STAT1, STX4, STX8, STXBP1, STXBP2, STXBP3, STXBP4, SYNCRIP TDGF1, TLR2, TLR3, TLR4, TRIM21, TRIM22, TRIM25, TRIM26, TRIM31, TRIM34, TRIM38, TRIM5, TRIM62, TRIM68, TRIM8, UBD, VAMP3, VCAM1, VIM, VPS26B, WAS, WNT5A, XCL1, XCL2, ZYX.EXAMPLES Example 1: Alignment of CC chemokine receptors and CXC chemokine receptors
[00819] As sequências de receptores de quimiocinas CC e CXC humanas foram recuperadas de Uniprot e alinhadas com Clustal Omega. Os resultados foram importados no Jalview para visualização (Fig. 1). Resíduos de aminoácidos negativos E e D (cinza), bem como resíduos de tirosina (Y, cinza escuro) e resíduos de cisteína (C, cinza claro) são destacados. Enquanto os domínios do N-terminal desviam na sequência, eles são caracterizados por um número comparativamente alto de aminoácidos carregados negativamente e resíduos de tirosina.Exemplo 2: Alinhamento de CCR8 humano, cinomolgo e murino[00819] Human CC and CXC chemokine receptor sequences were retrieved from Uniprot and aligned with Clustal Omega. The results were imported into Jalview for visualization (Fig. 1). Negative amino acid residues E and D (gray), as well as tyrosine residues (Y, dark gray) and cysteine residues (C, light gray) are highlighted. While the N-terminal domains deviate in the sequence, they are characterized by a comparatively high number of negatively charged amino acids and tyrosine residues. Example 2: Alignment of human, cynomolgus, and murine CCR8
[00820] As sequências de CCR8 humano, CCR8 de cinomolgo e CCR8 de murino foram recuperadas de Uniprot e alinhadas com Clus- tal Omega. Os resultados foram importados em Jalview para visualização e cálculo de identidade de sequência, veja Fig. 2 a. Embora o alinhamento de pares de CCR8 humano e cinomolgo produza uma identidade de sequência de 94,37%, as porcentagens são consideravelmente mais baixas entre o CCR8 de camundongo e humano (ID de porcentagem = 70,99), bem como entre CCR8 de camundongo e ci- nomolgo (ID de porcentagem = 71,55). Diferenças substanciais podem ser observadas na região N term (TRD) e na região C term.[00820] Human CCR8, cynomolgus CCR8, and murine CCR8 sequences were retrieved from Uniprot and aligned with Clustal Omega. The results were imported into Jalview for visualization and sequence identity calculation, see Fig. 2a. Although pairwise alignment of human and cynomolgus CCR8 yields a sequence identity of 94.37%, the percentages are considerably lower between mouse and human CCR8 (percent ID = 70.99), as well as between mouse and cynomolgus CCR8 (percent ID = 71.55). Substantial differences can be observed in the N-term region (TRD) and the C-term region.
[00821] A homologia de sequência entre o TRD de cinomolgo e o TRD humano é de 68%, enquanto a homologia de sequência entre o TRD de murino e o TRD humano é de 52%. No entanto, o TRD sulfatado por ácido e tirosina mostra um cluster carregado negativamente que foi usado com sucesso para gerar anticorpos de reação cruzada, veja o Exemplo 6. Pelo menos os motifs MDYT e YYPD foram encontrados entre as espécies.Exemplo 3: Avaliação de anticorpos da técnica anterior para ligação específica ao CCR8[00821] Sequence homology between the cynomolgus TRD and the human TRD is 68%, while sequence homology between the murine TRD and the human TRD is 52%. However, the acid-sulfated tyrosine TRD shows a negatively charged cluster that was successfully used to generate cross-reacting antibodies, see Example 6. At least the MDYT and YYPD motifs were found between species. Example 3: Evaluation of antibodies from the previous technique for specific binding to CCR8
[00822] Os experimentos FACS foram realizados usando linhagens celulares que expressam CCR8 para avaliar vários anticorpos da técnica anterior que são vendidos comercialmente como ligação ao CCR8 pela sua especificidade e coloração para CCR8. A linhagem celular de linfoma T de camundongo BW5147.4 expressa CCR8 de murino e lin- foma T cutâneo humano, HuT78 expressa baixos níveis de CCR8 humano. Os anticorpos da técnica anterior para receptores de quimioci- nas e, em particular, para CCR8, muitas vezes sofrem de baixa es-pecificidade, como descrito, por exemplo, por Xing et al., Appl IHC Mol Morphol (2015): "We were unable to evaluate CCR8 expression by immunohistochemistry due to lack of specificity of available antibodies in our experience e as previously published by others.", Chenivesse et al., JI (2012): "We were unable to evaluate the attraction of CD4+CCR8+ cells by CCL18 because of the lack of specificity of all commercially available anti-CCR8 Abs, which did not allow cell sorting, at least in our hands.", ou Pease, Biochem J (2011): "The latter has been problematic due to the lack of a seemingly reliable antibody against human CCR8. For example, in one study examining CCR8 expression on a population of CD4+ CD25+ Tregs, CCR8 surface staining was undetectable using a commercially available antibody, although the cells evidently expressed functional CCR8, as assessed by CCL1-driven actin polymerization." (conforme, Xing, Xiaoming, et al. "Expression of the chemokine receptor gene, CCR8, is associated com DUSP22 rearrangements in anaplastic large cell lymphoma." Applied immunohistochemistry & molecular morphology: AIMM/official publication of the Society for Applied Immunohistochemistry 23.8 (2015): 580; Chenivesse, Cécile, et al. "Pulmonary CCL18 recruits human regulatory T cells." The Journal of Immunology 189.1 (2012): 128-137.; ePease, James E. "Targeting chemokine receptors in allergic disease." Biochemical Journal 434.1 (2011): 11-24.).[00822] FACS experiments were performed using cell lines expressing CCR8 to evaluate several antibodies from the previous technique that are commercially sold as CCR8-binding due to their specificity and staining for CCR8. The mouse T-lymphoma cell line BW5147.4 expresses murine CCR8 and the human cutaneous T-lymphoma cell line, HuT78, expresses low levels of human CCR8. Prior art antibodies to chemokine receptors, and in particular to CCR8, often suffer from low specificity, as described, for example, by Xing et al., Appl IHC Mol Morphol (2015): "We were unable to evaluate CCR8 expression by immunohistochemistry due to lack of specificity of available antibodies in our experience and as previously published by others." evaluate the attraction of CD4+CCR8+ cells by CCL18 because of the lack of specificity of all commercially available anti-CCR8 Abs, which did not allow cell sorting, at least in our hands.", or Pease, Biochem J (2011): "The latter has been problematic due to the lack of a seemingly reliable antibody against human CCR8. undetectable using a commercially available antibody, although the cells evidently expressed functional CCR8, as assessed by CCL1-driven actin polymerization." Chenivesse, Cécile, et al. “Pulmonary CCL18 recruits human regulatory T cells.” The Journal of Immunology 189.1 (2012): 128-137.;
[00823] Tabela 3.1 lista três anticorpos disponíveis comercialmente analisados, que não coraram especificamente CCR8 nas mãos dos inventores (conforme Fig. 3). O clone IgG2B de rato #191704 (MAB1429, Systems &D) não mostrou ligação específica de CCR8 humano e isto também está de acordo com as observações descritas no Exemplo 6 do WO2007044756. Abcam E77 mostrou sinal muito fraco e fundo alto (dados não mostrados). MM0068-4G19 (Abcam), 191704 (R&D Systems), 4G19 (Biozol (Genetex)) e 11n24 e 10k39 (ambos de antikoerper-online.de) não mostraram ligação específica de CCR8 humano nas mãos dos inventores.Tabela 3.1: Anticorpos selecionados da técnica anterior, conforme a Fig. 3. [00823] Table 3.1 lists three commercially available antibodies analyzed that did not specifically stain CCR8 on the inventors' hands (as per Fig. 3). Mouse IgG2B clone #191704 (MAB1429, Systems &D) did not show specific binding to human CCR8, and this is also in agreement with the observations described in Example 6 of WO2007044756. Abcam E77 showed very weak signal and high background (data not shown). MM0068-4G19 (Abcam), 191704 (R&D Systems), 4G19 (Biozol (Genetex)), and 11n24 and 10k39 (both from antikoerper-online.de) did not show specific binding to human CCR8 on the inventors' hands. Table 3.1: Selected prior art antibodies, as per Fig. 3.
[00824] Os inventores encontraram apenas dois anticorpos mono- clonais confiáveis na técnica anterior que se ligavam especificamente ao CCR8 humano: Clone 433H desenvolvido por ICOS e inicialmente descrito no WO2007044756 e L263G8 fornecido e vendido por Biolegend. Ambos os anticorpos foram gerados usando células que supe- rexpressam CCR8 humano como imunógeno. L263G8 não é reativo cruzado para CCR8 de murino e não se ligou ao CCR8 de murino em células BW5147.3 ou células HEK 293T transfectadas com mCCR8.[00824] The inventors found only two reliable monoclonal antibodies in the prior art that specifically bound to human CCR8: Clone 433H developed by ICOS and initially described in WO2007044756 and L263G8 supplied and sold by Biolegend. Both antibodies were generated using cells that overexpress human CCR8 as an immunogen. L263G8 is not cross-reactive to murine CCR8 and did not bind to murine CCR8 in BW5147.3 cells or HEK 293T cells transfected with mCCR8.
[00825] A IgG2b de rato monoclonal, clone K anticamundongo CCR8 SA214G2 (N° de Catálogo Biolegend 150302) corou positivo para células BW5147.4 que expressam CCR8 de murino. Este anticorpo foi gerado com base em células transfectadas com CCR8 de muri- no.[00825] The mouse monoclonal IgG2b, K-cell anti-mouse CCR8 SA214G2 (Biolegend Catalog No. 150302) stained positive for BW5147.4 cells expressing murine CCR8. This antibody was generated from cells transfected with murine CCR8.
[00826] Em suma, os anticorpos que reconhecem especificamente os receptores de quimiocina CC humana são raros para alguns membros desta classe alvo. As baixas taxas estão de acordo com os resultados de outros anticorpos comercialmente disponíveis vendidos para receptores de quimiocinas humanas.Exemplo 4: Antígenos para receptores de quimiocinas CC e CXC[00826] In summary, antibodies that specifically recognize human CC chemokine receptors are rare for some members of this target class. The low rates are consistent with the results of other commercially available antibodies sold for human chemokine receptors. Example 4: Antigens for CC and CXC chemokine receptors
[00827] Visto que a literatura sobre sulfatação de tirosina é incompleta e parcialmente contraditória, por exemplo, entre espécies, os inventores usaram várias ferramentas disponíveis, pesquisa na literatura e experiências próprias para prever sítios de sulfatação.[00827] Given that the literature on tyrosine sulfation is incomplete and partially contradictory, for example, between species, the inventors used various available tools, literature research and their own experiments to predict sulfation sites.
[00828] A Tabela 4.1 resume os polipeptídeos resultantes adequados como antígenos para obter anticorpos melhorados para os respectivos receptores de quimiocina. Esses antígenos foram usados com sucesso para geração de anticorpos, por exemplo, como mostrado nos Exemplos subsequentes, como antígenos ou para panning fora do al- vo. Os sítios de sulfatação sublinhados foram confirmados com um valor de corte E de 55 aplicando o algoritmo de acordo com Monigatti F. et al. (Monigatti, Flavio, et al. "The Sulfinator: predicting tyrosine sulfation sites in protein sequences." Bioinformatics 18.5 (2002): 769770.). Nenhuma das sequências havia sido incluída anteriormente no conjunto de treinamento para os modelos de markov ocultos.[00828] Table 4.1 summarizes the resulting polypeptides suitable as antigens for obtaining enhanced antibodies for the respective chemokine receptors. These antigens were successfully used for antibody generation, for example, as shown in the subsequent Examples, as antigens or for panning off-target. The underlined sulfation sites were confirmed with an E cutoff value of 55 applying the algorithm according to Monigatti F. et al. (Monigatti, Flavio, et al. "The Sulfinator: predicting tyrosine sulfation sites in protein sequences." Bioinformatics 18.5 (2002): 769-770). None of the sequences had been previously included in the training set for the hidden Markov models.
[00829] A sulfatação das tirosinas entre parênteses pode ser omitida. Para CCR3 humano e CCR8 humano, foram previstos sítios de sulfatação adicionais para Y172 e Y353, respectivamente. Para CCR3 de macaco e CCR2 de macaco foram previstos sítios de sulfatação adicionais para Y172 e Y188, respectivamente. Os sítios de sulfatação mostrados em negrito foram descritos anteriormente na literatura (conforme Liu, Justin, et al. "Tyrosine sulfation is prevalent in human chem- okine receptors important in lung disease." American journal of respiratory cell and molecular biology 38.6 (2008): 738-743; Millard; Christopher J., et al. "Structural basis of receptor sulfotyrosine recognition by a CC chemokine: the N-terminal region of CCR3 bound toCCL11/eotaxin-1." Structure 22.11 (2014): 1571-1581).Projeto de peptídeo[00829] The sulfation of tyrosines in parentheses can be omitted. For human CCR3 and human CCR8, additional sulfation sites were predicted for Y172 and Y353, respectively. For monkey CCR3 and monkey CCR2, additional sulfation sites were predicted for Y172 and Y188, respectively. The sulfation sites shown in bold have been previously described in the literature (as per Liu, Justin, et al. "Tyrosine sulfation is prevalent in human chemokine receptors important in lung disease." American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology 38.6 (2008): 738-743; Millard; Christopher J., et al. "Structural basis of receptor sulfotyrosine recognition by a CC chemokine: the N-terminal region of CCR3 bound to CCL11/eotaxin-1." Structure 22.11 (2014): 1571-1581). Peptide design
[00830] O N term para CCR8 é formado pelos aminoácidos 1 a 35 dentro da proteína CCR8 humana e cinomolgo de comprimento total e pelos aminoácidos 1 a 33 para a proteína de comprimento completo CCR8 de camundongo. O N term consiste no TRD (aminoácidos 1 a 24 para CCR8 humano e cinomolgo e aminoácidos 1 a 22 para CCR8 de camundongo) e o domínio LID (aminoácidos 26 a 35 para CCR8 humano e cinomolgo e aminoácidos 24 a 33 para camundongo CCR8), que são conectados por uma cisteína. Para a síntese de polipeptídeos compreendendo o N term, a cisteína foi substituída por uma serina para evitar a agregação dos peptídeos. A Tabela 5.1 mostra as respectivas IDs dos polipeptídeos que foram usados para geração de anticor- pos anti-CCR8 por exibição de fagos como descrito no Exemplo 6. Para testar se modificações pós-traducionais de proteínas estavam causando dificuldades para a geração de anticorpos, peptídeos compreendendo TRD e/ou foram usadas sequências de N term, que foram não modificadas ou sulfatadas. Sulfatação no cinomolgo e TRD humano de CCR8 foram introduzidos em pelo menos 50% das tirosinas, por exemplo, nas posições 3, 15 e 17 dos respectivos peptídeos. Para os peptídeos TRD e N de camundongo, foram introduzidas sulfações nas tirosinas nas posições 3, 14 e 15 dos respectivos peptídeos (conforme a Tabela 6.1). Além disso, os peptídeos compreendendo o LID foram manipulados pela introdução de uma biotinilação C-terminal que foi ligada por meio de um ligante TTDS (ácido trioxatridecano- succinâmico). Outros marcadores e ligantes também podem ser usados. Os peptídeos para o TRD ou N term foram modificados pela introdução de uma biotinilação N-terminal ligada através de um ligante TTDS-Lisina. Novamente, outros ligantes e/ou marcadores conhecidos também podem ser usados para facilitar a imobilização dos peptídeos. Tabela 4.1: Polipeptídeos para antígeno ou panning fora do alvo para geração de anticorpos para receptores de quimiocinas. Pelo menos uma sulfatação em uma das posições de tirosina listadas do polipeptí- deo é necessária de acordo com a invenção, mas as sulfações em dois três ou mais sítios também são possíveis e podem ser benéficas. X pode ser qualquer aminoácido ou nenhum aminoácido e, preferivel-mente, é um aminoácido diferente de cisteína, tal como serina. Tabela 5.1: Polipeptídeos sintetizados para CCR8 como alvo [00830] The ON term for CCR8 is formed by amino acids 1 to 35 within the full-length human and cynomolgus CCR8 protein and by amino acids 1 to 33 for the full-length mouse CCR8 protein. The ON term consists of the TRD (amino acids 1 to 24 for human and cynomolgus CCR8 and amino acids 1 to 22 for mouse CCR8) and the LID domain (amino acids 26 to 35 for human and cynomolgus CCR8 and amino acids 24 to 33 for mouse CCR8), which are connected by a cysteine. For the synthesis of polypeptides comprising the N term, the cysteine was replaced by a serine to avoid peptide aggregation. Table 5.1 shows the respective IDs of the polypeptides that were used for the generation of anti-CCR8 antibodies by phage display as described in Example 6. To test whether post-translational protein modifications were causing difficulties for antibody generation, peptides comprising TRD and/or N-term sequences were used, which were unmodified or sulfated. Sulfation in the human cynomolgus and TRD of CCR8 was introduced in at least 50% of the tyrosines, for example, at positions 3, 15, and 17 of the respective peptides. For the mouse TRD and N-term peptides, sulfations were introduced in the tyrosines at positions 3, 14, and 15 of the respective peptides (as per Table 6.1). In addition, the peptides comprising the LID were manipulated by the introduction of a C-terminal biotinylation that was linked via a TTDS (trioxatridecanosuccinamic acid) ligand. Other markers and ligands can also be used. The peptides for the TRD or N-term were modified by the introduction of an N-terminal biotinylation linked through a TTDS-Lysine ligand. Again, other known ligands and/or markers can also be used to facilitate peptide immobilization. Table 4.1: Polypeptides for antigen or off-target panning for antibody generation for chemokine receptors. At least one sulfation at one of the listed tyrosine positions of the polypeptide is required according to the invention, but sulfations at two, three or more sites are also possible and may be beneficial. X can be any amino acid or no amino acid and, preferably, is an amino acid other than cysteine, such as serine. Table 5.1: Polypeptides synthesized for CCR8 as a target
[00831] Para estar se as modificações pós-traducionais de proteí-nas estavam causando dificuldades para a geração de anticorpos, foram usados peptídeos compreendendo sequências de TRD e/ou N term, que foram não modificados ou sulfatados. A sulfatação no TRD de cinomolgo e humano de CCR8 foi introduzida em pelo menos 50% das tirosinas, por exemplo, nas posições 3, 15 e 17 dos respectivos peptídeos. Para os peptídeos TRD e N de camundongo, foram intro- duzidas sulfatações nas tirosinas nas posições 3, 14 e 15 dos respectivos peptídeos (conforme a Tabela 6.1). Além disso, os peptídeos compreendendo o LID foram manipulados pela introdução de uma bio- tinilação C-terminal que foi ligada por meio de um ligante TTDS (ácido trioxatridecano-succinâmico). Outros marcadores e ligantes também podem ser usados. Os peptídeos para o termo TRD ou N foram modificados pela introdução de uma biotinilação N-terminal ligada através de um ligante TTDS-Lisina. Novamente, outros ligantes e/ou marcadores conhecidos também podem ser usados para facilitar a imobilização dos peptídeos.Síntese de peptídeos[00831] To determine if post-translational protein modifications were causing difficulties in antibody generation, peptides comprising TRD and/or N-term sequences that were unmodified or sulfated were used. Sulfation of the cynomolgus and human CCR8 TRD was introduced in at least 50% of the tyrosines, for example, at positions 3, 15, and 17 of the respective peptides. For mouse TRD and N peptides, sulfations were introduced in the tyrosines at positions 3, 14, and 15 of the respective peptides (as per Table 6.1). In addition, peptides comprising the LID were manipulated by the introduction of a C-terminal biotinylation that was linked via a TTDS (trioxatridecanesuccinamic acid) ligand. Other markers and ligands can also be used. The peptides for the term TRD or N were modified by the introduction of an N-terminal biotinylation linked via a TTDS-Lysine ligand. Again, other known ligands and/or markers can also be used to facilitate peptide immobilization. Peptide synthesis
[00832] Os peptídeos podem ser obtidos a partir de diferentes fontes comerciais e podem ser preparados como é conhecido na técnica, por exemplo, usando química padrão de síntese de peptídeos em fase sólida Fmoc (SPPS). A síntese eficiente de peptídeos sulfatados é tecnicamente desafiadora, pois os peptídeos tirosina-sulfatados são estáveis em condições básicas, enquanto as sulfotirosinas sofrem dessulfatação em condições ácidas, tornando a incorporação em etapas simples de FmocTyr(SO3Na)OH no peptídeo em crescimento ina-dequada. A sulfatação global de peptídeos é possível, por exemplo, usando trióxido de enxofre-piridina, mas não permite a sulfatação específica de tirosinas selecionadas. No entanto, o SSPS baseado em Fmoc pode, no entanto, ser usado para a síntese de peptídeos sulfatados. Para este fim, derivados de tirosina protegidos ortogonalmente como tirosina fluorossulfatada, tirosina protegida com azidometila ou tirosina protegida com neopentila podem ser usados para incorporação. A tirosina protegida pode ser posteriormente desmascarada de forma seletiva e quantitativa.[00832] Peptides can be obtained from different commercial sources and can be prepared as is known in the art, for example, using standard solid-phase peptide synthesis (SPPS) chemistry. Efficient synthesis of sulfated peptides is technically challenging because tyrosine-sulfated peptides are stable under basic conditions, while sulfotyrosines undergo desulfation under acidic conditions, making the stepwise incorporation of FmocTyr(SO3Na)OH into the growing peptide inadequate. Global sulfation of peptides is possible, for example, using sulfur trioxide-pyridine, but does not allow the specific sulfation of selected tyrosines. However, Fmoc-based SSPS can nevertheless be used for the synthesis of sulfated peptides. For this purpose, orthogonally protected tyrosine derivatives such as fluorosulfated tyrosine, azidomethyl-protected tyrosine, or neopentyl-protected tyrosine can be used for incorporation. The protected tyrosine can then be selectively and quantitatively unmasked.
[00833] Chen et al., Angew Chem, 2016, reportaram uma síntese de uma etapa de tirosina Fmoc-fluorossulfatada. Uma estratégia efici- ente de síntese de peptídeos em fase sólida Fmoc é então introduzida para incorporar o resíduo de tirosina fluorossulfatado em peptídeos de interesse. A clivagem simultânea padrão de peptídeo-resina e a remoção dos grupos protetores da cadeia lateral instáveis a ácido fornecem os peptídeos brutos contendo tirosina fluorosulfatada. O etileno glicol básico, servindo como solvente e reagente, transforma os peptídeos tirosina fluorossulfatados em peptídeos sulfotirosina em alto rendimento.[00833] Chen et al., Angew Chem, 2016, reported a one-step synthesis of Fmoc-fluorosulfated tyrosine. An efficient Fmoc solid-phase peptide synthesis strategy is then introduced to incorporate the fluorosulfated tyrosine residue into peptides of interest. Standard simultaneous peptide-resin cleavage and removal of acid-unstable side-chain protecting groups provide crude fluorosulfated tyrosine-containing peptides. Basic ethylene glycol, serving as both solvent and reagent, transforms the fluorosulfated tyrosine peptides into sulfotyrosine peptides in high yield.
[00834] Os peptídeos resultantes podem ser posteriormente purificados como conhecido na técnica, por exemplo, por HPLC, por exemplo, em uma coluna BEH C-18 (Waters) ou Kinetex C-18 (Phenome- nex) e podem ser analisados por espectrometria de massa (IonSpray e Positive Ion Detector), por exemplo, para controle de qualidade.[00834] The resulting peptides can be further purified as known in the art, for example, by HPLC, for example, on a BEH C-18 column (Waters) or Kinetex C-18 (Phenomenex) and can be analyzed by mass spectrometry (IonSpray and Positive Ion Detector), for example, for quality control.
[00835] Na literatura, duas pontes de dissulfeto dentro da proteína CCR8 humana de comprimento total foram descritas para conectar a alça extracelular 1 (ECL1) e alça extracelular 2 (ECL2) através das cis- teínas nas posições 106 e 183. Uma ponte de dissulfeto adicional en-tre as cisteínas 25 e 272 assume-se que liga a 7a hélice transmembra- nar com o N-terminal. No entanto, não se espera que os peptídeos de acordo com o Exemplo formem quaisquer pontes dissulfureto entre cisteínas.Exemplo 6: Exibição de fagos e análise de anticorpos CCR8 anti- humanos[00835] In the literature, two disulfide bridges within the full-length human CCR8 protein have been described to connect extracellular loop 1 (ECL1) and extracellular loop 2 (ECL2) via cysteines at positions 106 and 183. An additional disulfide bridge between cysteines 25 and 272 is assumed to link the 7th transmembrane helix with the N-terminus. However, peptides according to Example 6 are not expected to form any disulfide bridges between cysteines. Example 6: Display of phages and analysis of anti-human CCR8 antibodies
[00836] Uma biblioteca de exibição de fagos de anticorpos totalmente humanos (biblioteca bioinvent n-CoDeR Fab lambda) foi usada para isolar anticorpos monoclonais humanos por seleção contra peptí- deos biotinilados solúveis. Os peptídeos foram fornecidos pela Peps- can. A síntese de peptídeos foi realizada como descrito no Exemplo 5. Para o procedimento de panning foi aplicado o seguinte protocolo.Tabela 6.1: Lista de peptídeos incluindo modificações usadas para seleção de anticorpos por exibição de fagos e análise ELISA. [00836] A fully human antibody phage display library (bioinvent n-CoDeR Fab lambda library) was used to isolate human monoclonal antibodies by selection against soluble biotinylated peptides. The peptides were supplied by Pepscan. Peptide synthesis was performed as described in Example 5. The following protocol was applied to the panning procedure. Table 6.1: List of peptides including modifications used for antibody selection by phage display and ELISA analysis.
[00837] Dynabeads M-280 (Invitrogen™) acopladas à estreptavidina foram revestidas por uma hora em temperatura ambiente (RT) com o peptídeo biotinilado (1 tubo) e o peptídeo biotinilado fora do alvo (3 tubos), respectivamente. As Dynabeads foram lavadas e posteriormente bloqueadas durante 1h em temperatura ambiente com rotação de ponta a ponta.[00837] Streptavidin-coupled M-280 Dynabeads (Invitrogen™) were coated for one hour at room temperature (RT) with the biotinylated peptide (1 tube) and the off-target biotinylated peptide (3 tubes), respectively. The Dynabeads were washed and subsequently blocked for 1 hour at room temperature with end-to-end rotation.
[00838] Para depleção de ligantes fora do alvo, a biblioteca de fa- gos bloqueados foi adicionada às Dynabeads carregadas fora do alvo bloqueadas e incubadas durante 10 min em temperatura ambiente com rotação de ponta a ponta. Esta etapa de depleção foi repetida 2 vezes. A biblioteca de fagos esgotada foi adicionada às Dynabeads carregadas com alvo bloqueado e incubadas durante 60 min em RT com rotação de ponta a ponta.[00838] For off-target ligand depletion, the blocked phage library was added to the off-target loaded, blocked Dynabeads and incubated for 10 min at room temperature with end-to-end rotation. This depletion step was repeated 2 times. The depleted phage library was added to the blocked target loaded Dynabeads and incubated for 60 min at RT with end-to-end rotation.
[00839] Após lavagem rigorosa (3 x em tampão de bloqueio (PBS- T, 3% de leite em pó) e 9 x em PBS-T (150 mM NaCl; 8 mM Na2HPO4; 1,5 mM KH2PO4; ajustado para pH = 7,4-7,6, 0,05% Tween -20)), Dynabeads com fagos Fab que se ligam especificamente ao alvo revestido foram usads diretamente para infectar a cepa HB101 de E. coli. Subsequentemente, os fagos foram amplificados em cepa de E. coli HB101 usando o Fago Auxiliar M13KO7 (Invitrogen).[00839] After thorough washing (3x in blocking buffer (PBS-T, 3% milk powder) and 9x in PBS-T (150 mM NaCl; 8 mM Na2HPO4; 1.5 mM KH2PO4; adjusted to pH = 7.4-7.6, 0.05% Tween-20)), Dynabeads with Fab phages that bind specifically to the coated target were used directly to infect the HB101 strain of E. coli. Subsequently, the phages were amplified in the E. coli HB101 strain using the M13KO7 Helper Phage (Invitrogen).
[00840] Nos ciclos de seleção seguintes, a concentração alvo foidiminuída para aumentar a pressão de seleção para ligantes de alta afinidade. Durante o panning da biblioteca, foram realizadas duas estratégias de seleção diferentes (Fig. 4). As estratégias foram projetadas para identificar anticorpos exibindo atividade de ligação para a região N-terminal de CCR8 humana compreendendo o TRD e/ou a região N-terminal de CCR8 de cinomolgo compreendendo o TRD. Todos os peptídeos usados como antígenos ou para fora do alvo foram sulfatados em pelo menos uma posição, conforme Tabela 4.1. e Tabela 6.1.[00840] In subsequent selection cycles, the target concentration was decreased to increase the selection pressure for high-affinity ligands. During library panning, two different selection strategies were performed (Fig. 4). The strategies were designed to identify antibodies exhibiting binding activity to the N-terminal region of human CCR8 comprising the TRD and/or the N-terminal region of cynomolgus CCR8 comprising the TRD. All peptides used as antigens or off-target were sulfated at least once, as per Table 4.1 and Table 6.1.
[00841] Para ambas as estratégias, uma etapa de depleção foi incluída usando a região N-terminal de CCR4 humano biotinilado compreendendo o TRD (TPP-14829, SEQ ID NO:22, com Y22 sendo sulfatado) como peptídeo fora do alvo.[00841] For both strategies, a depletion step was included using the N-terminal region of biotinylated human CCR4 comprising TRD (TPP-14829, SEQ ID NO:22, with Y22 being sulfated) as the off-target peptide.
[00842] A estratégia I compreendeu um primeiro ciclo de panning no peptídeo sulfatado CCR8 N-terminal humano (TPP-14827, SEQ ID NO:46, com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado) seguido por 3 ciclos no mesmo peptídeo (TPP-14827, SEQ ID NO:46 com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado) ou no peptídeo CCR8 N-terminal sulfatado de cinomolgo (TPP-14828, SEQ ID NO:47 com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado).[00842] Strategy I comprised a first panning cycle on the sulfated human N-terminal CCR8 peptide (TPP-14827, SEQ ID NO:46, with Y3, Y15, Y17 being sulfated) followed by 3 cycles on the same peptide (TPP-14827, SEQ ID NO:46 with Y3, Y15, Y17 being sulfated) or on the sulfated N-terminal cynomolgus CCR8 peptide (TPP-14828, SEQ ID NO:47 with Y3, Y15, Y17 being sulfated).
[00843] A estratégia II compreendeu uma primeira rodada de panning no peptídeo sulfatado CCR8 N-terminal de cinomolgo (TPP- 14828, SEQ ID NO:47 com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado) seguido por 3 ciclos no mesmo peptídeo (TPP-14828, SEQ ID NO:47 com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado) ou três ciclos no peptídeo sulfatado CCR8 N- terminal humano (TPP-14827, SEQ ID NO:46 com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado), conforme representado na Fig. 4.[00843] Strategy II comprised a first round of panning on the N-terminal CCR8 sulfated peptide of cynomolgus (TPP-14828, SEQ ID NO:47 with Y3, Y15, Y17 being sulfated) followed by 3 cycles on the same peptide (TPP-14828, SEQ ID NO:47 with Y3, Y15, Y17 being sulfated) or three cycles on the N-terminal human CCR8 sulfated peptide (TPP-14827, SEQ ID NO:46 with Y3, Y15, Y17 being sulfated), as represented in Fig. 4.
[00844] Para uma primeira avaliação qualitativa, para cada conjunto de clones, o cultivo monoclonal e a expressão de 88 clones Fab-on- phage escolhidos aleatoriamente foi realizado e os clones foram subsequentemente testados quanto à ligação ao respectivo alvo previamente usado para seleção. Além disso, a ligação a células expressan- do CCR8 humano e cinomolgo foi determinada por citometria de fluxo (FACS).[00844] For an initial qualitative assessment, for each set of clones, monoclonal culture and expression of 88 randomly selected Fab-on-phage clones was performed, and the clones were subsequently tested for binding to the respective target previously used for selection. In addition, binding to cells expressing human CCR8 and cynomolgus was determined by flow cytometry (FACS).
[00845] Um ligante específico é definido no contexto particular como uma molécula mostrando(i) no ensaio ELISA uma intensidade de sinal para o alvo que é pelo menos 10 vezes maior que a intensidade de sinal para o alvo,(ii) no ensaio FACS um sinal para as linhagens celulares que expressam CCR8 que é pelo menos 2 vezes maior do que o sinal para uma linhagem celular de controle que não expressa CCR8, e(iii) no ensaio FACS um sinal na linhagem celular de controle que é menor que 10.000.[00845] A specific ligand is defined in the particular context as a molecule showing (i) in the ELISA assay a signal intensity for the target that is at least 10 times greater than the signal intensity for the target, (ii) in the FACS assay a signal for cell lines expressing CCR8 that is at least 2 times greater than the signal for a control cell line that does not express CCR8, and (iii) in the FACS assay a signal in the control cell line that is less than 10,000.
[00846] Plasmídeo-DNA de 12 pools com taxas de acerto significativas em pelo menos um dos dois ensaios foi submetido à remoção do gene III e os Fabs solúveis resultantes foram selecionados em uma análise ELISA e FACS de alto rendimento.Exemplo 7: Análise de alto rendimento para anticorpos CCR8 anti- humanos humanos[00846] Plasmid-DNA from 12 pools with significant hit rates in at least one of the two assays was subjected to gene III removal, and the resulting soluble Fabs were selected in a high-throughput ELISA and FACS analysis. Example 7: High-throughput analysis for human anti-CCR8 antibodies
[00847] Dos 12 pools de clones gerados durante a exibição em fa- gos, 17.000 clones sFab diferentes foram selecionados em uma análise de alto rendimento por ELISA (HTS-ELISA) para determinar sua ligação aos peptídeos que foram usados anteriormente para exibição em fagos, a saber (i) TPP- 14827, SEQ ID NO:46, com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado, (ii) TPP-14828, SEQ ID NO:47 com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado e (iii) o respectivo peptídeo fora do alvo TPP-14829, SEQ ID NO:22, com Y22 sendo sulfatado. Para análise ELISA, os pep- tídeos foram imobilizados em placas revestidas com estreptavidina (Greiner bio-one 781997) com uma concentração de 0,1 μg/ml a 4°C em tampão de revestimento (Carbonat-Basis, Candor 121125). Após lavar as placas 3 vezes com 60 μl de PBS 0,05% Tween e bloquear com 50 μl de Smart Block® (Candor 113500) por 1h a 20°C, 10 μl de amostras de sFab foram adicionados às placas e incubados a 20°C durante 1h. Após lavagem subsequente com 60 μl de PBS 0,05% Tween por 3 vezes, 20 μl de um anticorpo anti-c-Myc HRP foram adicionados e incubados por 1 h a 20°C seguido de lavagem subsequente 3 vezes com 60 μl de PBS 0,05% Tween e adição de 20 μl de solução Amplex Red (Invitrogen A12222, 1:1000 em tampão NaP 50 mM pH 7,6 com 1:10000 de 30% H2O2). Após incubação final durante 20 min a 20°C o sinal foi determinado usando um comprimento de onda de emissão de 595 nm e um comprimento de onda de excitação de 530 nm. Para análise, a relação sinal para fundo dos clones sFab únicos foi usada, enquanto o fundo é definido pelo valor médio de 48 cavidades em cada placa, não contendo nenhuma cultura sFab, mas o respectivo meio de amostra.[00847] From the 12 pools of clones generated during phage display, 17,000 different sFab clones were selected in a high-throughput ELISA (HTS-ELISA) analysis to determine their binding to the peptides that were previously used for phage display, namely (i) TPP-14827, SEQ ID NO:46, with Y3, Y15, Y17 being sulfated, (ii) TPP-14828, SEQ ID NO:47 with Y3, Y15, Y17 being sulfated and (iii) the respective off-target peptide TPP-14829, SEQ ID NO:22, with Y22 being sulfated. For ELISA analysis, the peptides were immobilized on streptavidin-coated plates (Greiner bio-one 781997) at a concentration of 0.1 μg/ml at 4°C in coating buffer (Carbonat-Basis, Candor 121125). After washing the plates 3 times with 60 μl of 0.05% Tween PBS and blocking with 50 μl of Smart Block® (Candor 113500) for 1 h at 20°C, 10 μl of sFab samples were added to the plates and incubated at 20°C for 1 h. After subsequent washing with 60 μl of 0.05% Tween PBS three times, 20 μl of an anti-c-Myc HRP antibody were added and incubated for 1 h at 20°C, followed by subsequent washing three times with 60 μl of 0.05% Tween PBS and the addition of 20 μl of Amplex Red solution (Invitrogen A12222, 1:1000 in 50 mM NaP buffer pH 7.6 with 1:10000 of 30% H2O2). After a final incubation for 20 min at 20°C, the signal was determined using an emission wavelength of 595 nm and an excitation wavelength of 530 nm. For analysis, the signal-to-background ratio of the single sFab clones was used, while the background is defined by the average value of 48 wells in each plate containing no sFab culture, but the respective sample medium.
[00848] No total, 2193 clones de sFab diferentes mostraram ligação significativa aos peptídeos sulfatados N-terminais e humanos de cino- molgos TPP-14827 (SEQ ID NO:46, com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatados) e TPP-14828 (SEQ ID NO:47 com Y3, Y15, Y17 sendo sulfatado), conforme indicado por uma relação sinal para fundo maior que 5, embora não demonstrando qualquer ligação significativa ao TPP- 14829 fora do alvo (SEQ ID NO:22 com Y22 sendo sulfatado).[00848] In total, 2193 different sFab clones showed significant binding to the N-terminal and human cynomolgus sulfated peptides TPP-14827 (SEQ ID NO:46, with Y3, Y15, Y17 being sulfated) and TPP-14828 (SEQ ID NO:47 with Y3, Y15, Y17 being sulfated), as indicated by a signal-to-background ratio greater than 5, although they did not demonstrate any significant binding to off-target TPP-14829 (SEQ ID NO:22 with Y22 being sulfated).
[00849] Esses clones de sFab foram reformatados em anticorpos IgG1 humanos de comprimento total e aplicados à análise FACS em linhagens celulares que expressam CCR8 humano e cinomolgo.[00849] These sFab clones were reformatted into full-length human IgG1 antibodies and applied to FACS analysis in cell lines expressing human CCR8 and cynomolgus.
[00850] Com base na ligação a ambos, cinomolgo, bem como células expressando CCR8 humano, bem como não demonstrando qualquer ligação inespecífica significativa a uma linhagem celular parental que não expressa CCR8, dez clones de anticorpo foram selecionados para produção e caracterização adicional. Esses acertos iniciais foram TPP-17575 a TPP-17581 e TPP-18205 a TPP-18207, as CDRs são mostradas na Tabela 7.1. Os anticorpos foram também otimizados manualmente para aplicabilidade na terapia para produzir o conjunto de anticorpos mostrado na Tabela 7.2a e Tabela 7.2b, conforme também listagem de sequências.[00850] Based on binding to both cynomolgus and human CCR8-expressing cells, and not demonstrating any significant nonspecific binding to a non-CCR8-expressing parental cell line, ten antibody clones were selected for further production and characterization. These initial hits were TPP-17575 to TPP-17581 and TPP-18205 to TPP-18207; the CDRs are shown in Table 7.1. The antibodies were also manually optimized for applicability in therapy to produce the antibody set shown in Table 7.2a and Table 7.2b, as well as sequence listing.
[00851] Além disso, para obter o anticorpo TPP-27495, as sequências de TPP-23411 foram manipuladas para compreender as mutações YTE M252Y, S254T e T256E. TPP-27495 é 70% não fucosilado.[00851] In addition, to obtain the TPP-27495 antibody, the TPP-23411 sequences were manipulated to encompass the YTE M252Y, S254T, and T256E mutations. TPP-27495 is 70% non-fucosylated.
[00852] Além disso, para obter o anticorpo TPP-27496, as sequências de TPP-23411 foram manipuladas para compreender as mutações LS M428L e N434S. TPP-27496 é 70% não fucosilado.Exemplo 8: Geração de anticorpos CCR8 antimurinoExibição de fagos e análise de anticorpos[00852] In addition, to obtain the TPP-27496 antibody, the TPP-23411 sequences were manipulated to encompass the LS M428L and N434S mutations. TPP-27496 is 70% non-fucosylated. Example 8: Generation of anti-murine CCR8 antibodies Phage display and antibody analysis
[00853] Uma biblioteca de exibição de fagos de anticorpos totalmente humanos (biblioteca de Fab lambda BioInvent n-CoDeR) foi usada para isolar anticorpos monoclonais humanos reconhecendo CCR8 de murino por seleção contra peptídeos biotinilados solúveis.[00853] A fully human antibody phage display library (BioInvent n-CoDeR lambda Fab library) was used to isolate human monoclonal antibodies recognizing murine CCR8 by selection against soluble biotinylated peptides.
[00854] Os peptídeos foram fornecidos pela Pepscan. A síntese de peptídeos foi realizada como descrito em outro lugar aqui. Para o procedimento de panning foi aplicado o protocolo a seguir.[00854] The peptides were supplied by Pepscan. Peptide synthesis was performed as described elsewhere here. The following protocol was applied to the panning procedure.
[00855] Dynabeads M-280 (Invitrogen™) acopladoas à estreptavidi- na foram revestidos durante uma hora em temperatura ambiente (RT) com o peptídeo biotinilado (1 tubo) e o peptídeo biotinilado fora do alvo (3 tubos), respectivamente. As Dynabeads foram lavadas e posterior-mente bloqueadas durante 1h em temperatura ambiente com rotação de ponta a ponta. Para esgotamento de ligantes fora do alvo, a biblioteca de fagos bloqueados foi adicionada às Dynabeads carregadas fora do alvo bloqueadas e incubadas durante 10 min em temperatura ambiente com rotação de ponta a ponta. Esta etapa de depleção foi repetida 2 vezes. A biblioteca de fagos esgotada foi adicionada às Dynabeads carregadas com alvo bloqueado e incubadas durante 60 min em RT com rotação de ponta a ponta.[00855] Streptavidin-coupled M-280 Dynabeads (Invitrogen™) were coated for one hour at room temperature (RT) with the biotinylated peptide (1 tube) and the biotinylated peptide outside the target (3 tubes), respectively. The Dynabeads were washed and subsequently blocked for 1 hour at room temperature with end-to-end rotation. For depletion of off-target ligands, the blocked phage library was added to the blocked off-target loaded Dynabeads and incubated for 10 minutes at room temperature with end-to-end rotation. This depletion step was repeated twice. The depleted phage library was added to the Dynabeads loaded with the blocked target and incubated for 60 minutes at RT with end-to-end rotation.
[00856] Após lavagem rigorosa (3 x em tampão de bloqueio (PBS- T, 3% de leite em pó) e 9 x em PBS (NaCl a 150 mM; Na2HPO4 a 8 mM; KH2PO4 a 1,5 mM; ajustado para pH = 7,4-7,6) com 0,05% de Tween- 20)), Dynabeads com fagos Fab que se ligam especificamente ao alvo revestido foram usadas diretamente para infectar a cepa HB101 de E. coli. Subsequentemente, os fagos foram amplificados em cepa E. coli HB101 usando M13KO7 Helper Phage (Invitrogen™).[00856] After thorough washing (3x in blocking buffer (PBS-T, 3% milk powder) and 9x in PBS (150 mM NaCl; 8 mM Na2HPO4; 1.5 mM KH2PO4; adjusted to pH = 7.4-7.6) with 0.05% Tween-20), Dynabeads with Fab phages that bind specifically to the coated target were used directly to infect the HB101 strain of E. coli. Subsequently, the phages were amplified into the E. coli HB101 strain using M13KO7 Helper Phage (Invitrogen™).
[00857] Nos ciclos de seleção seguintes, a concentração alvo foi diminuída para aumentar a pressão de seleção para ligantes de alta afinidade.Tabela 7.1: CDRs para anticorpos candidatos de CCR8 humanos anti- humanos específicos obtidos com o método de acordo com a presente invenção.Tabela 7.2 a: CDRs para anticorpos candidatos de CCR8 humanos anti-humanos específicos de acordo com a presente invenção comperfil terapêutico superior.Tabela 7.2 b: CDRs para anticorpos candidatos de CCR8 anti- humanos derivados de TPP-23411. Tabela 7.3: CDRs para anticorpos candidatos de CCR8 antimurino es-pecíficos derivados com uma abordagem mista.Tabela 8.1: Lista de peptídeos usados para seleção de anticorpos por de fagos e análise ELISA Tabela 9.1: A análise estrutural de HCDR3 para anticorpos candidatos de CCR8 humanos anti-humanos específicos obteve um método de acordo com a presente invenção. Tabela 9.2: Análise estrutural de HCDR3 para anticorpos candidatos de CCR8 humanos anti-humanos específicos com perfil terapêutico superior, por exemplo, baixa internalização. [00857] In subsequent selection cycles, the target concentration was decreased to increase the selection pressure for high-affinity ligands. Table 7.1: CDRs for specific human anti-human CCR8 candidate antibodies obtained using the method according to the present invention. Table 7.2 a: CDRs for specific human anti-human CCR8 candidate antibodies according to the present invention with a superior therapeutic profile. Table 7.2 b: CDRs for candidate anti-human CCR8 antibodies derived from TPP-23411. Table 7.3: CDRs for specific antimurine CCR8 candidate antibodies derived with a mixed approach. Table 8.1: List of peptides used for antibody selection by phage and ELISA analysis. Table 9.1: Structural analysis of HCDR3 for specific human anti-human CCR8 candidate antibodies yielded a method according to the present invention. Table 9.2: Structural analysis of HCDR3 for specific human anti-human CCR8 candidate antibodies with a superior therapeutic profile, e.g., low internalization.
[00858] Para a geração de anticorpos que se ligam a CCR8 de camundongo, uma estratégia de seleção foi projetada para identificar anticorpos que exibem atividade de ligação ao domínio rico em tirosina de CCR8 de camundongo (TRD) na região N-terminal. Para seleção positiva nos peptídeos TRD de CCR8 de camundongo, foi usada uma mistura contendo 50% de peptídeo normal e 50% de peptídeo sulfatado (SEQ ID NO:45 não sulfatada (TPP-13792) ou com Y3, Y14, Y15 sendo sulfatado (TPP-13793)). Uma etapa de depleção foi incluída usando um peptídeo fora do alvo biotinilado sendo o CCR4 TRD humano dentro da região N-terminal. Além disso, a etapa de depleção no CCR4 humano foi conduzida em uma mistura de peptídeo sulfatado e não sulfatado (SEQ ID NO: 19 não sulfatada (TPP-13799) ou com Y19 e Y22 sulfatados (TPP-13800)).[00858] For the generation of antibodies that bind to mouse CCR8, a selection strategy was designed to identify antibodies that exhibit binding activity to the mouse CCR8 tyrosine-rich domain (TRD) in the N-terminal region. For positive selection on mouse CCR8 TRD peptides, a mixture containing 50% normal peptide and 50% sulfated peptide (SEQ ID NO:45 non-sulfated (TPP-13792) or with Y3, Y14, Y15 being sulfated (TPP-13793)) was used. A depletion step was included using a biotinylated off-target peptide being the human CCR4 TRD within the N-terminal region. Furthermore, the depletion step in human CCR4 was conducted in a mixture of sulfated and non-sulfated peptide (SEQ ID NO: 19 non-sulfated (TPP-13799) or with sulfated Y19 and Y22 (TPP-13800)).
[00859] A estratégia de panning foi conduzir quatro ciclos de panning no total, cada uma na mistura especificada de peptídeos sulfatados e não sulfatados, veja a Fig. 5.[00859] The panning strategy was to conduct four panning cycles in total, each in the specified mixture of sulfated and non-sulfated peptides, see Fig. 5.
[00860] Para cada pool de clones, o cultivo monoclonal e a expressão de 88 clones de fagos Fab escolhidos aleatoriamente foi realizado e os clones foram subsequentemente testados quanto à ligação ao respectivo alvo usado antes para seleção. No entanto, foram realizadas medições de ELISA separadas para os peptídeos sulfatados e não sulfatados.[00860] For each clone pool, monoclonal culture and expression of 88 randomly selected Fab phage clones was performed, and the clones were subsequently tested for binding to the respective target used previously for selection. However, separate ELISA measurements were performed for the sulfated and non-sulfated peptides.
[00861] Além disso, a ligação a células que expressam CCR8 humano, camundongo e cinomolgo foi determinada por citometria de fluxo (FACS).[00861] In addition, binding to cells expressing human, mouse and cynomolgus CCR8 was determined by flow cytometry (FACS).
[00862] Um ligante específico é definido no contexto particular como uma molécula mostrando(i) no ensaio ELISA, uma intensidade de sinal para o alvo que é pelo menos 10 vezes maior que a intensidade de sinal para o alvo, e (ii) no ensaio FACS, um sinal para as linhagens celulares que expressam CCR8 que é pelo menos 10 vezes maior do que o sinal para uma linhagem celular de controle que não expressa CCR8.[00862] A specific ligand is defined in the particular context as a molecule showing (i) in the ELISA assay, a signal intensity for the target that is at least 10 times greater than the signal intensity for the target, and (ii) in the FACS assay, a signal for cell lines expressing CCR8 that is at least 10 times greater than the signal for a control cell line that does not express CCR8.
[00863] Dentro dessas medições, os anticorpos TPP-14095 e TPP- 14099 foram identificados demonstrando ligação às células que expressam CCR8 de camundongo, mas nenhuma ligação a células de controle, células de controle que expressam CCR8 humano ou células de controle que expressam CCR8 de cinomolgo. Além disso, constatou-se que os anticorpos se ligam ao peptídeo TRD sulfatado, mas não ao peptídeo não sulfatado.Exemplo 9: Caracterização estrutural dos anticorpos CCR8[00863] Within these measurements, the antibodies TPP-14095 and TPP-14099 were identified demonstrating binding to mouse CCR8-expressing cells, but no binding to control cells, human CCR8-expressing control cells, or cynomolgus CCR8-expressing control cells. Furthermore, the antibodies were found to bind to the sulfated TRD peptide, but not to the non-sulfated peptide. Example 9: Structural characterization of CCR8 antibodies
[00864] Das seis alças CDR, a alça H3 mostra a maior diversidade estrutural e está localizada no centro do sítio de ligação. Ele também ganha mais mutações por maturação de afinidade e tem em média o maior número de contatos com o antígeno. Portanto, desempenha um papel crucial na ligação ao antígeno.[00864] Of the six CDR loops, the H3 loop shows the greatest structural diversity and is located in the center of the binding site. It also acquires the most mutations through affinity maturation and has, on average, the highest number of contacts with the antigen. Therefore, it plays a crucial role in antigen binding.
[00865] Após análise da estrutura específica dos anticorpos obtidos nos Exemplos anteriores, constatou-se surpreendentemente que a composição da HCDR3 era estruturalmente diferente dos domínios de HCDR3 humanos usuais. Mais detalhadamente, o domínio HCDR3 dos anticorpos de CCR8 humanos anti-humanos tinha um número substancialmente maior de resíduos de tirosina (~ 20% para o conjunto inicial de ligantes específicos de CCR8 humanos, ~ 21% para os candidatos otimizados) do que seria esperado para uma HCDR3 totalmente humana aleatória com comprimento correspondente (~ 10%, conforme Zemlin, Michael, et al. "Expressed murine and human HCDR3 intervals of equal length exhibit distinct repertoires that differ in their amino acid composition and predicted range of structures." Journal of molecular biology 334.4 (2003): 733-749.).[00865] After analysis of the specific structure of the antibodies obtained in the previous Examples, it was surprisingly found that the composition of HCDR3 was structurally different from the usual human HCDR3 domains. More specifically, the HCDR3 domain of the human anti-human CCR8 antibodies had a substantially higher number of tyrosine residues (~20% for the initial set of human CCR8-specific ligands, ~21% for the optimized candidates) than would be expected for a random all-human HCDR3 of corresponding length (~10%, as per Zemlin, Michael, et al. "Expressed murine and human HCDR3 intervals of equal length exhibit distinct repertoires that differ in their amino acid composition and predicted range of structures." Journal of molecular biology 334.4 (2003): 733-749.).
[00866] Esses dados sugerem um impacto benéfico da presença de tirosina para a ligação específica ao antígeno sulfatado. Os anticorpos otimizados foram também caracterizados por um aumento substancial na frequência de histidina. Para estes anticorpos, o teor de histidina foi em média de 10%. A ocorrência média de histidina em HCDR3 de um comprimento compatível é de aproximadamente 2% em HCDR3 muri- no e ainda menor em HCDR3 humana, conforme Zemlin, Michael, et al. (2003).[00866] These data suggest a beneficial impact of the presence of tyrosine for specific binding to the sulfated antigen. The optimized antibodies were also characterized by a substantial increase in histidine frequency. For these antibodies, the histidine content averaged 10%. The average occurrence of histidine in HCDR3 of a compatible length is approximately 2% in murine HCDR3 and even lower in human HCDR3, according to Zemlin, Michael, et al. (2003).
[00867] Visto que os antígenos usados para seleção são caracterizados por cargas negativas fornecidas na forma de tirosinas sulfatadas e aminoácidos carregados negativamente, os inventores levantaram a hipótese de que a ocorrência de cargas positivas em HCDR3 melhora a ligação ao antígeno sulfatado, mas é menos essencial para a ligação ao antígeno não sulfatado. Embora a frequência de resíduos carregados positivamente (H, K, R) nos HCDR3s do conjunto de anticorpos inicialmente obtido fosse de aproximadamente 7%, os anticorpos me-lhorados tinham em média 15% de aminoácidos positivos por HCDR3 (por exemplo, até ~31%).[00867] Since the antigens used for selection are characterized by negative charges provided in the form of sulfated tyrosines and negatively charged amino acids, the inventors hypothesized that the occurrence of positive charges in HCDR3 improves binding to the sulfated antigen, but is less essential for binding to the non-sulfated antigen. Although the frequency of positively charged residues (H, K, R) in the HCDR3s of the initially obtained antibody set was approximately 7%, the improved antibodies had on average 15% positive amino acids per HCDR3 (e.g., up to ~31%).
[00868] Os anticorpos, de acordo com a presente invenção, são caracterizados por uma frequência de tirosina que é maior do que para HCDR3s totalmente humanas usuais. Embora essas altas frequências de tirosina sejam mais facilmente obtidas com CDRs de murino, isso pode explicar por que tentativas anteriores de obter anticorpos humanos anti-humanos que reconhecem especificamente receptores de quimiocinas CC, tal como CCR8, não foram bem-sucedidas.Exemplo 10: Caracterização funcional dos anticorpos anti-CCR8 Linhagens Celulares[00868] The antibodies according to the present invention are characterized by a tyrosine frequency that is higher than for usual fully human CDR3s. Although these high tyrosine frequencies are more easily obtained with murine CDRs, this may explain why previous attempts to obtain human anti-human antibodies that specifically recognize CC chemokine receptors, such as CCR8, have not been successful. Example 10: Functional characterization of anti-CCR8 antibodies Cell Lines
[00869] Linhagens de células estáveis HEK 293 e CHO expressando CCR8 humano, de cinomolgo ou murino foram geradas usando Inscreenex, como conhecido na técnica. As linhagens de células de timoma Hut-78 e a linhagem de células de linfoma TALL-1 foram obti- das de ATCC e foram confirmadas como apresentando expressão de CCR8 endógena. Visto que a expressão de CCR8 pode variar, os níveis de expressão foram monitorados.Células T regulatórias humanas[00869] Stable HEK 293 and CHO cell lines expressing human, cynomolgus, or murine CCR8 were generated using Inscreenex, as known in the art. The Hut-78 thymoma cell line and the TALL-1 lymphoma cell line were obtained from ATCC and were confirmed to exhibit endogenous CCR8 expression. Since CCR8 expression can vary, expression levels were monitored. Human regulatory T cells
[00870] As células CD4+ e CD25+ classificadas por FACS de PBMCs de doadores saudáveis foram adquiridas da BioIVT, AllCells ou StemCell Technologies. Após o descongelamento das células e a recuperação em cultura durante a noite, as células foram ativadas com contas anti-CD3 e anti-CD28 projetadas para expansão de Treg de Miltenyi e suplementadas com IL-2 (R&D Systems) conforme indicado pelo protocolo do kit de expansão de Treg. Normalmente, após a ativação de PBMCs naives, a expressão de CCR8 foi a mais alta entre os dias 5 e 7 e as células podem ser re-estimuladas 7 a 9 dias após a ativação primária. Após a reestimulação, a expressão de CCR8 foi a mais alta entre os dias 2 e 4.Exemplo 10.1.1: Avaliação de afinidades para ligação de CCR8 de diferentes espéciesExperimentos FACS[00870] CD4+ and CD25+ cells sorted by FACS from healthy donor PBMCs were acquired from BioIVT, AllCells, or StemCell Technologies. After thawing and overnight recovery in culture, the cells were activated with anti-CD3 and anti-CD28 beads designed for Miltenyi Treg expansion and supplemented with IL-2 (R&D Systems) as directed by the Treg expansion kit protocol. Typically, after activation of naive PBMCs, CCR8 expression was highest between days 5 and 7, and cells could be re-stimulated 7 to 9 days after primary activation. After re-stimulation, CCR8 expression was highest between days 2 and 4. Example 10.1.1: Evaluation of CCR8 binding affinities from different species. FACS experiments.
[00871] A afinidade dos anticorpos para CCR8 humano, de cinomo- lgo e murino e outros receptores de quimiocinas foi determinada por FACS como conhecido na técnica. Em suma, as células CHO foram projetadas para expressar o CCR8 das respectivas espécies. Em alternativa, as Tregs humanas ativadas de um doador humano foram usadas para determinar a afinidade dos anticorpos para as Tregs ativadas. Os valores de EC50 foram determinados por FACS. Todos os anticorpos candidatos tinham não apenas uma afinidade superior para CCR8 humano com uma EC50 na faixa nanomolar de baixo dígito, mas também uma afinidade superior para CCR8 de cinomolgo na mesma ordem de magnitude. Afinidades semelhantes nessas espécies são importantes para facilitar estudos para previsão de problemas de segu rança posteriores em humanos. Esta é uma questão importante na busca de anticorpos terapêuticos em imuno-oncologia, porque os modelos de camundongos têm grandes limitações na previsão de efeitos colaterais imunológicos em humanos. A EC50 determinada para a liga-ção de Tregs humanas estava entre 10 e 25 nM para os anticorpos inventivos mostrados na Tabela 10.1.1.1.[00871] The affinity of antibodies for human, canine, and murine CCR8 and other chemokine receptors was determined by FACS as known in the art. In short, CHO cells were engineered to express the CCR8 of the respective species. Alternatively, activated human Tregs from a human donor were used to determine the affinity of the antibodies for the activated Tregs. EC50 values were determined by FACS. All candidate antibodies had not only a superior affinity for human CCR8 with an EC50 in the low-digit nanomolar range, but also a superior affinity for canine CCR8 by the same order of magnitude. Similar affinities in these species are important to facilitate studies for predicting future safety issues in humans. This is an important issue in the search for therapeutic antibodies in immuno-oncology because mouse models have major limitations in predicting immunological side effects in humans. The EC50 determined for the binding of human Tregs was between 10 and 25 nM for the inventive antibodies shown in Table 10.1.1.1.
[00872] As afinidades de anticorpos inventivos em células CHO que expressam CCR8 humano, células CHO que expressam CCR8 de ci- nomolgo ou Tregs humanas ativadas (doador 1) são mostradas nas Fig. 6, 7 e 8, respectivamente.Tabela 10.1.1.1: Valores EC50 de anticorpos inventivos em nM. A coloração FACS foi realizada em células CHO expressando estavelmente CCR8 humano ou CCR8 de cinomolgo, ou em células T CD4+CD25+ humanas ativadas. Essas células foram ativadas com o kit de expansão Treg da Miltenyi. [00872] The affinities of inventive antibodies on CHO cells expressing human CCR8, CHO cells expressing cynomolgus CCR8, or activated human Tregs (donor 1) are shown in Figs. 6, 7, and 8, respectively. Table 10.1.1.1: EC50 values of inventive antibodies in nM. FACS staining was performed on CHO cells stably expressing human CCR8 or cynomolgus CCR8, or on activated human CD4+CD25+ T cells. These cells were activated with the Miltenyi Treg expansion kit.
[00873] Os anticorpos TPP-23411 e TPP-21360 desviam um do outro por um resíduo de lisina adicionado no C-term da cadeia pesada, isto é, TPP-23411 compreende a lisina. TPP-23411 e TPP-21360 foram testados em um experimento FACS separado para ligação a CCR8 humano e cinomolgo. As curvas EC50 para ligação de CCR8 humano, bem como CCR8 cinomolgo, foram perfeitamente alinhadas entre os dois anticorpos (dados não mostrados, conforme Tabela 10.1.1.2 para valores IC50).Tabela 10.1.1.2: Valores EC50 de candidatos medidos em nM. A coloração foi realizada em células CHO expressando estavelmente CCR8 humano ou CCR8 de cinomolgo. [00873] Antibodies TPP-23411 and TPP-21360 differ from each other by an added lysine residue at the C-term of the heavy chain, i.e., TPP-23411 comprises lysine. TPP-23411 and TPP-21360 were tested in a separate FACS experiment for binding to human and cynomolgus CCR8. The EC50 curves for binding to human CCR8 as well as cynomolgus CCR8 were perfectly aligned between the two antibodies (data not shown, see Table 10.1.1.2 for IC50 values). Table 10.1.1.2: EC50 values of candidates measured in nM. Staining was performed on CHO cells stably expressing human CCR8 or cynomolgus CCR8.
[00874] TPP-21181 e TPP-23411 foram testados em um experi-mento FACS separado para ligação a CCR8 humano e cinomolgo, conforme Fig. 9, 10. Os respectivos valores de EC50 estão listados na Tabela 10.1.1.3.Tabela 10.1.1.3: Valores EC50 de anticorpos medidos em nM. A coloração foi realizada em células CHO expressando estavelmente CCR8 humano ou CCR8 de cinomolgo. [00874] TPP-21181 and TPP-23411 were tested in a separate FACS experiment for binding to human and cynomolgus CCR8, as shown in Figs. 9, 10. The respective EC50 values are listed in Table 10.1.1.3. Table 10.1.1.3: EC50 values of antibodies measured in nM. Staining was performed on CHO cells stably expressing human CCR8 or cynomolgus CCR8.
[00875] Em um outro experimento FACS, os anticorpos L263G8 da técnica anterior (Biolegend) e 433H (ICOS, BD) foram comparados com TPP-21360 no que diz respeito à ligação ao CCR8 humano e de cinomolgo, conforme a Fig. 11, 12 e Tabela 10.1.1.4. Os anticorpos da técnica anterior mostraram apenas baixa ou substancialmente nenhuma ligação geral ao CCR8 de cinomolgo (baixa saturação, aqui MFI << 1000). Apenas os anticorpos de acordo com a presente invenção reconheceram especificamente o CCR8 humano e cinomolgo com afinidades na mesma ordem de grandeza, isto é, em alguns casos, mesmo na faixa subnanomolar.Tabela 10.1.1.4: Valores EC50 de TPP-21360 em comparação com L263G8 e 433H. A coloração foi realizada em células CHO expressando estavelmente CCR8 humano ou CCR8 de cinomolgo. [00875] In another FACS experiment, prior art L263G8 (Biolegend) and 433H (ICOS, BD) antibodies were compared with TPP-21360 regarding binding to human and cynomolgus CCR8, as shown in Figs. 11, 12 and Table 10.1.1.4. Prior art antibodies showed only low or substantially no overall binding to cynomolgus CCR8 (low saturation, here MFI << 1000). Only the antibodies according to the present invention specifically recognized human and cynomolgus CCR8 with affinities of the same order of magnitude, i.e., in some cases, even in the subnanomolar range. Table 10.1.1.4: EC50 values of TPP-21360 compared with L263G8 and 433H. Staining was performed on CHO cells stably expressing either human CCR8 or cynomolgus CCR8.
[00876] Esses resultados mostram que o uso do antígeno sulfatado facilita a geração de anticorpos de reação cruzada, como cinomol- go/humano, para alvos difíceis, como CCR8, que são específicos para o alvo pretendido. Como prova de conceito, as Tregs humanas ativadas foram coradas com o anticorpo TPP-23411 da invenção ou anticorpo L263G8 da técnica anterior, como mostrado na Fig. 13. Os anticorpos inventivos que reconhecem CCR8 de murino têm afinidades igualmente excelentes para o seu alvo, como mostrado na Tabela 10.1.1.5.Tabela 10.1.1.5: Valores EC50 de TPP-14095 e TPP-14099. A coloração FACS foi realizada em células CHO expressando CCR8 de muri- no. [00876] These results show that the use of sulfated antigen facilitates the generation of cross-reacting antibodies, such as cynomolgus/human, for difficult targets, such as CCR8, which are specific for the intended target. As a proof of concept, activated human Tregs were stained with the TPP-23411 antibody of the invention or the L263G8 antibody of the prior art, as shown in Fig. 13. The inventive antibodies that recognize murine CCR8 have equally excellent affinities for their target, as shown in Table 10.1.1.5. Table 10.1.1.5: EC50 values of TPP-14095 and TPP-14099. FACS staining was performed on CHO cells expressing murine CCR8.
[00877] Tabela 10.1.1.6 mostra os valores de EC50 para a ligação de vários anticorpos CCR8 anti-humanos inventivos adicionais a células CHO transfectadas com CCR8 humano ou CCR8 de cinomolgo, ou a células Hut78 que expressam CCR8 humano endógeno. Interessan-temente, os anticorpos com uma mutação G50A tiveram uma afinidade de ligação mais alta às células CHO que expressam CCR8 de cinomo- lgo. Os anticorpos anti-CCR8 compreendendo esta mutação estrutural são, portanto, preferidos.Tabela 10.1.1.6 Valores EC50 em M caracterizando a ligação de anticorpos CCR8 anti-humanos inventivos às células CHO transfectadas com CCR8 humano ou CCR8 de cinomolgo, como descrito em outro lugar aqui, ou à linhagem celular HuT78, que expressa endogenamen- te CCR8 humano. Exemplo 10.1.2: Experimentos SPR para caracterização de afinidades de ligação de anticorpos para domínios TRD não modificados de diferentes espécies[00877] Table 10.1.1.6 shows the EC50 values for the binding of several additional inventive anti-human CCR8 antibodies to CHO cells transfected with human CCR8 or cynomolgus CCR8, or to Hut78 cells expressing endogenous human CCR8. Interestingly, antibodies with a G50A mutation had a higher binding affinity to CHO cells expressing cynomolgus CCR8. Anti-CCR8 antibodies comprising this structural mutation are therefore preferred. Table 10.1.1.6 EC50 values in M characterizing the binding of inventive anti-human CCR8 antibodies to CHO cells transfected with human CCR8 or cynomolgus CCR8, as described elsewhere herein, or to the HuT78 cell line, which endogenously expresses human CCR8. Example 10.1.2: SPR experiments for characterizing antibody binding affinities for unmodified TRD domains from different species.
[00878] Para analisar a afinidade dos anticorpos para seu antígeno não modificado (isto é, não sulfatado), os ensaios de ligação de ressonância plasmônica de superfície (SPR) foram realizados em um instrumento Biacore T200 a 25°C com tampão de ensaio HBS-EP+ 1x, 1 mg/ml BSA, NaCl 300 mM. As IgGs foram capturadas usando IgGs anti-Fc humana covalentemente amina acoplada a um chip sensor CM5. N terminalmente rotulado com His6 de TRD de CCR8 humano (TPP-19950: MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSP, SEQ ID NO:43),CCR8 de cinomolgo TRD (TPP-19952: MDYTLDPSMTTMTDYYYP- DSLSSP, SEQ ID NO:44) ou CCR8 TRD murino (TPP-19951: MDYTMEPNVTMTDYYPDFFTAP, SEQ ID NO:45) foi fundido no C terminal com albumina de soro humano (HSA) para gerar as proteínas de fusão CCR8-HSA. A respectiva proteína de fusão CCR8-HSA foi usada como analito com uma faixa de concentração de 1,56 - 200 nM no modo de cinética multiciclo. Os sensorgramas obtidos foram ajustados a um modelo de ligação Langmuir 1:1. Para anticorpos humanos CCR8 anti-humanos TPP-23411 e TPP-21360, a ligação foi baixa (160 nM) e a ligação a CCR8 de cinomolgo TRD foi ainda menor, por exemplo, na faixa μM, apoiando a importância da sulfatação para o reconhecimento do anticorpo para a invenção anticorpos.Tabela 10.1.2.1: Afinidades de ligação de anticorpos inventivos para o TRD fundido com HSA rotulado com His6 de CCR8 humano, de cino- molgo ou murino determinado por SPR. A ligação ao peptídeo CCR8 de cinomolgo está na faixa de μM e é uma aproximação, pois a con-centração mais alta testada foi de 200 nM. HSA sozinho e controles de isotipo não mostraram nenhuma ligação (dados não mostrados).Exemplo 10.1.3: Experimentos SPR para caracterização sistemática de afinidades de ligação[00878] To analyze the affinity of antibodies for their unmodified (i.e., non-sulfated) antigen, surface plasmon resonance (SPR) binding assays were performed on a Biacore T200 instrument at 25°C with 1x HBS-EP+ assay buffer, 1 mg/ml BSA, 300 mM NaCl. IgGs were captured using anti-human Fc IgGs covalently amine-coupled to a CM5 sensor chip. N terminally labeled with His6 of human CCR8 TRD (TPP-19950: MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSP, SEQ ID NO:43), cynomolgus CCR8 TRD (TPP-19952: MDYTLDPSMTTMTDYYYP-DSLSSP, SEQ ID NO:44) or murine CCR8 TRD (TPP-19951: MDYTMEPNVTMTDYYPDFFTAP, SEQ ID NO:45) was fused at the C-terminal with human serum albumin (HSA) to generate the CCR8-HSA fusion proteins. The respective CCR8-HSA fusion protein was used as an analyte with a concentration range of 1.56–200 nM in multicycle kinetic mode. The obtained sensorgrams were fitted to a 1:1 Langmuir binding model. For human CCR8 anti-human TPP-23411 and TPP-21360 antibodies, binding was low (160 nM) and binding to cynomolgus CCR8 TRD was even lower, e.g., in the μM range, supporting the importance of sulfation for antibody recognition for the inventive antibodies. Table 10.1.2.1: Binding affinities of inventive antibodies to the fused TRD with His6-labeled HSA from human, cynomolgus, or murine CCR8 determined by SPR. Binding to cynomolgus CCR8 peptide is in the μM range and is an approximation, as the highest concentration tested was 200 nM. HSA alone and isotype controls showed no binding (data not shown). Example 10.1.3: SPR experiments for systematic characterization of binding affinities
[00879] Os ensaios de ligação SPR foram realizados para avaliar sistematicamente a ligação do anticorpo a a) antígeno não sulfatado versus sulfatado, b) TRD versus N term e c) humano versus CCR8 de cinomolgo. Os ensaios de ligação SPR foram realizados em um ins-trumento Biacore T200 (Cytiva) a 25°C com tampão de ensaio 1x HBS-EP+ (n° de pedido BR100826, Cytiva). Peptídeos foram usados como ligantes e foram capturados usando seu rótulo de biotina C- terminal em um chip sensor revestido com estreptavidina ("Sensor Chip SA", Pedido No. BR100398, Cytiva). Para este fim, uma lisina terminal (K) foi adicionada no C-term de cada peptídeo para biotinila- ção. Para o N term de CCR8, a cisteína de ocorrência natural entre o domínio TRD e LID foi substituída por uma serina. Anticorpos foram usados como analitos (TPP-19546, TPP-21181, TPP-23411, controle do isotipo hIgG1 TPP-9809 e controle do isotipo mIgG2a TPP-10748). A concentração do analito no tampão de ensaio foi de 0,05 - 10 nM e a medição foi realizada no modo de cinética multiciclo. A superfície do sensor foi regenerada com glicina pH 2,0 após cada ciclo. Os sen- sorgramas obtidos foram duplamente referenciados (subtração do sinal da célula de fluxo de referência e injeção de tampão) e foram ajustados a um modelo de ligação Langmuir 1:1 para derivar dados cinéticos usando o software de avaliação Biacore T200.Tabela 10.1.3.1: Lista de peptídeos usados para caracterizar o epítopo dos anticorpos. Peptídeos compreendendo a sequência TRD (# 1 a 4) ou N term (# 5 a 8) de CCR8, derivados de cinomolgo (# 1, 2, 5, 6) ou humano (# 3, 4, 7, 8) CCR8, sulfatado (# 2, 4, 6, 8) ou não sulfatado (# 1, 3, 5, 7). SO3: resíduo sulfato. Biot: modificação de biotina para imobilização. [00879] SPR binding assays were performed to systematically evaluate antibody binding to aa) non-sulfated versus sulfated antigen, b) TRD versus N-term, and c) human versus cynomolgus CCR8. SPR binding assays were performed on a Biacore T200 instrument (Cytiva) at 25°C with 1x HBS-EP+ assay buffer (Order No. BR100826, Cytiva). Peptides were used as ligands and were captured using their C-terminal biotin label on a streptavidin-coated sensor chip ("Sensor Chip SA", Order No. BR100398, Cytiva). For this purpose, a terminal lysine (K) was added to the C-term of each peptide for biotinylation. For the N-term of CCR8, the naturally occurring cysteine between the TRD and LID domains was replaced with a serine. Antibodies were used as analytes (TPP-19546, TPP-21181, TPP-23411, hIgG1 isotype control TPP-9809 and mIgG2a isotype control TPP-10748). The analyte concentration in the assay buffer was 0.05–10 nM and the measurement was performed in multicycle kinetic mode. The sensor surface was regenerated with glycine pH 2.0 after each cycle. The obtained sensorgrams were doubly referenced (subtraction of the reference flow cell signal and buffer injection) and fitted to a 1:1 Langmuir binding model to derive kinetic data using the Biacore T200 evaluation software. Table 10.1.3.1: List of peptides used to characterize the antibody epitope. Peptides comprising the TRD (# 1 to 4) or N term (# 5 to 8) sequence of CCR8, derived from cynomolgus (# 1, 2, 5, 6) or human (# 3, 4, 7, 8) CCR8, sulfated (# 2, 4, 6, 8) or non-sulfated (# 1, 3, 5, 7). SO3: sulfate residue. Biot: biotin modification for immobilization.
[00880] Para os anticorpos inventivos analisados TPP-19546, TPP- 21181 e TPP-23411, nenhuma ligação ao TRD não sulfatado ou N term não sulfatado de CCR8 foi detectada, independentemente da espécie. Ao contrário, excelentes afinidades com valores de KD na faixa de pM foram determinadas para TRD sulfatado e N-term sulfatado, por exemplo, de cinomolgo e/ou CCR8 humano. Em alguns casos, o valor de K D para ligação ao TRD e ao N term do CCR8 humano foi substancialmente o mesmo, isto é, dentro da margem de erro. Em outros ca-sos, a ligação ao N term foi ligeiramente melhorada.[00880] For the inventive antibodies analyzed TPP-19546, TPP-21181, and TPP-23411, no binding to the non-sulfated TRD or non-sulfated N-term of CCR8 was detected, regardless of the species. Conversely, excellent affinities with KD values in the pM range were determined for sulfated TRD and sulfated N-term, for example, from cynomolgus and/or human CCR8. In some cases, the KD value for binding to the TRD and the N-term of human CCR8 was substantially the same, i.e., within the margin of error. In other cases, binding to the N-term was slightly improved.
[00881] Em suma, estes resultados demonstram que a tirosina sulfatada é a causa da ligação. Além disso, sugerem que o TRD sulfatado é necessário e suficiente para a ligação, mas que a presença N term completo como epítopo pode, em alguns casos, melhorar ainda mais a ligação. Finalmente, esses resultados também demonstram a reativi- dade cruzada para CCR8 humano e cinomolgo.Tabela 10.1.2.3: Afinidades de ligação de SPR de anticorpos inventivos para o termo TRD ou N de cinomolgo ou CCR8 humano. Peptí- deos com números ímpares são caracterizados por tirosinas não modificadas, peptídeos com números pares são caracterizados por tirosi- nas sulfatadas (Ys). Os controles de isotipo não mostraram ligação a nenhum dos peptídeos (dados não mostrados). 1) mp = multifásico: valores aproximados. Exemplo 10.2: Especificidade de ligação[00881] In summary, these results demonstrate that sulfated tyrosine is the cause of binding. Furthermore, they suggest that sulfated TRD is necessary and sufficient for binding, but that the presence of the complete N term as an epitope may, in some cases, further enhance binding. Finally, these results also demonstrate cross-reactivity for human CCR8 and cynomolgus. Table 10.1.2.3: SPR binding affinities of inventive antibodies for the TRD or N term of cynomolgus or human CCR8. Peptides with odd numbers are characterized by unmodified tyrosines, peptides with even numbers are characterized by sulfated tyrosines (Ys). Isotype controls showed no binding to either peptide (data not shown). 1) mp = multiphase: approximate values. Example 10.2: Link specificity
[00882] A análise FACS foi realizada como descrito em outro lugar aqui para determinar a ligação inespecífica a linhagens celulares humanas negativas alvo. Nenhuma ligação inespecífica do anticorpo anti- CCR8 humano TPP-23160 foi observada para células CHO com trans- fectantes simulados (Fig. 14).[00882] FACS analysis was performed as described elsewhere here to determine nonspecific binding to target negative human cell lines. No nonspecific binding of the anti-human CCR8 antibody TPP-23160 was observed to CHO cells with sham transfectants (Fig. 14).
[00883] Além disso, as células HEK foram transfectadas transitoriamente com CCR1 humano ou CCR4 humano. A ligação fora do alvo foi baixa para a maioria dos anticorpos inventivos (Fig. 15, 16).Um painel de células com linhagens celulares de diferentes tecidos tumorais foi usado para caracterizar a ligação inespecífica nestes tecidos (Tabela 10.2.1). O perfil geral foi favorável para a maioria dos anticorpos, enquanto um certo grau de polirreatividade pôde ser observado para alguns anticorpos. No geral, o grau de polirreatividade estava em uma faixa aceitável para aplicações terapêuticas para todos os anticorpos inventivos. No entanto, TPP-20950, TPP-18206, TPP-18429, TPP-18430 e TPP-18433 mostraram um grau mais alto de po- lirreatividade e mostraram um certo grau de ligação em pelo menos duas ou três das sete linhagens de células mostradas abaixo. Tabela 10.2.1: Polirreatividade de anticorpos inventivos em um painelde células. Se aplicável, a EC50 é mostrada em M. [00883] In addition, HEK cells were transiently transfected with human CCR1 or human CCR4. Off-target binding was low for most inventive antibodies (Figs. 15, 16). A cell panel with cell lines from different tumor tissues was used to characterize nonspecific binding in these tissues (Table 10.2.1). The overall profile was favorable for most antibodies, while a certain degree of polyreactivity could be observed for some antibodies. Overall, the degree of polyreactivity was within an acceptable range for therapeutic applications for all inventive antibodies. However, TPP-20950, TPP-18206, TPP-18429, TPP-18430, and TPP-18433 showed a higher degree of polyreactivity and showed some degree of binding in at least two or three of the seven cell lines shown below. Table 10.2.1: Polyreactivity of inventive antibodies in a cell panel. If applicable, EC50 is shown in M.
[00884] Um primeiro experimento baseado em ELISA foi realizado para analisar a ligação inespecífica a BVP, insulina ou DNA para anticorpos TPP-18206, TPP-17578, TPP-19546 e TPP-23411 e dois anticorpos de referência. A ligação inespecífica dos anticorpos inventivos à insulina, DNA e/ou BVP foi menor do que a ligação inespecífica do primeiro anticorpo de referência (Gantenerumab, Roche) a esses antí- genos e também foi menor do que a ligação inespecífica do segundo anticorpo de referência (Remicade, Janssen Biotech) a esses antíge- nos. Entre os anticorpos inventivos testados, TPP-23411 mostrou a polirreatividade mais baixa para cada DNA, BVP e insulina.[00884] A first ELISA-based experiment was performed to analyze the nonspecific binding to BVP, insulin, or DNA for antibodies TPP-18206, TPP-17578, TPP-19546, and TPP-23411 and two reference antibodies. The nonspecific binding of the inventive antibodies to insulin, DNA, and/or BVP was lower than the nonspecific binding of the first reference antibody (Gantenerumab, Roche) to these antigens and was also lower than the nonspecific binding of the second reference antibody (Remicade, Janssen Biotech) to these antigens. Among the inventive antibodies tested, TPP-23411 showed the lowest polyreactivity for each DNA, BVP, and insulin.
[00885] Um segundo experimento baseado em ELISA foi realizado para analisar a ligação inespecífica a BVP, insulina ou DNA para anticorpos TPP-18206 (tipo selvagem ou afuco), TPP-21360 afuco, TPP- 23411 (tipo selvagem ou afuco), TPP-20955, TPP-21047, e referências TPP-9809 (controle de isotipo), Gantenerumab (TPP-12151), Lenzilu- mab (TPP-12166), Remicade (TPP-12160) e Avastin (TPP-17586). A ligação inespecífica dos anticorpos inventivos testados à insulina, DNA e BVP foi menor do que ligação inespecífica do primeiro anticorpo de referência (Gantenerumab, Roche). TPP-20955 e TPP-21047 mostraram uma ligação global mais inespecífica do que os outros anticorpos inventivos (dados não mostrados). No geral, o grau de polirreatividade estava em uma faixa aceitável para aplicações terapêuticas para todos os anticorpos inventivos, independentemente de seu estado de afuco- silação.[00885] A second ELISA-based experiment was performed to analyze the nonspecific binding to BVP, insulin, or DNA for antibodies TPP-18206 (wild-type or afuco), TPP-21360 afuco, TPP-23411 (wild-type or afuco), TPP-20955, TPP-21047, and reference antibodies TPP-9809 (isotype control), Gantenerumab (TPP-12151), Lenzilumab (TPP-12166), Remicade (TPP-12160), and Avastin (TPP-17586). The nonspecific binding of the tested inventive antibodies to insulin, DNA, and BVP was lower than the nonspecific binding of the first reference antibody (Gantenerumab, Roche). TPP-20955 and TPP-21047 showed more nonspecific overall binding than the other inventive antibodies (data not shown). Overall, the degree of polyreactivity was within an acceptable range for therapeutic applications for all inventive antibodies, regardless of their afucosylation state.
[00886] Um terceiro experimento baseado em ELISA foi realizado para analisar a ligação inespecífica a BVP, insulina ou DNA para anticorpos TPP-27495 (YTE), TPP-27496 (LS), TPP-18429, TPP-18430, TPP-18432, TPP-18433, TPP -18436, TPP-27479, TPP-27480 e anticorpos de controle. No geral, o grau de polirreatividade estava em uma faixa aceitável para aplicações terapêuticas para todos os anticorpos inventivos, independentemente de mutações YTE ou LS.[00886] A third ELISA-based experiment was performed to analyze nonspecific binding to BVP, insulin, or DNA for TPP-27495 (YTE), TPP-27496 (LS), TPP-18429, TPP-18430, TPP-18432, TPP-18433, TPP-18436, TPP-27479, TPP-27480 antibodies and control antibodies. Overall, the degree of polyreactivity was within an acceptable range for therapeutic applications for all inventive antibodies, regardless of YTE or LS mutations.
[00887] A ligação indesejada de anticorpos CCR8 inventivos a populações de células imunes diferentes de Tregs humanas foi analisada por coloração dessas populações de células, conforme a Fig. 17.[00887] The unwanted binding of inventive CCR8 antibodies to immune cell populations other than human Tregs was analyzed by staining these cell populations, as shown in Fig. 17.
[00888] Fig. 18 mostra a regulação positiva de CCR8 em Tregs humanas após a ativação.Exemplo 10.3: Avaliação da indução de ADCC e ADCPExemplo 10.3.1: Afucosilação de anticorpos[00888] Fig. 18 shows the upregulation of CCR8 in human Tregs after activation. Example 10.3: Evaluation of ADCC and ADCP induction Example 10.3.1: Antibody afucosylation
[00889] Os anticorpos de acordo com a presente invenção foram glicoprojetados usando a tecnologia GlymaxX, conforme US8642292, para melhorar a interação entre a região FC dos anticorpos e o recep tor FC expresso pelas células efetoras. Em suma, a tecnologia é baseada na co-expressão citosólica heteróloga da enzima bacteriana GDP-6-desóxi-D-lixo-4-hexulose redutase que redireciona a via de síntese de novo de fucose para açúcar-nucleotídeo GDP-Rhamnose que não pode ser metabolizado pelas células eucarióticas. Isso esgota o pool de fucose e leva à produção de anticorpos não fucosilados, tanto na parte central (sem fucose central) quanto na parte variável (sem fucose antenar) de um N-glicano. Também inibe a fucosilação de O- glicanos e proteína-O-fucosilação. A remoção de fucose de N-glicanos em N297 resultou em uma afinidade aumentada para FCYRS, como mostrado no Exemplo 10.3.2.Exemplo 10.3.2: Análise de ligação ao receptor Fcy humano com base em SPR[00889] The antibodies according to the present invention were glyco-engineered using GlymaxX technology, as per US8642292, to enhance the interaction between the FC region of the antibodies and the FC receptor expressed by effector cells. In short, the technology is based on the heterologous cytosolic co-expression of the bacterial enzyme GDP-6-deoxy-D-lixo-4-hexulose reductase, which redirects the de novo synthesis pathway of fucose to the sugar-nucleotide GDP-Rhamnose, which cannot be metabolized by eukaryotic cells. This depletes the fucose pool and leads to the production of non-fucosylated antibodies, both in the central (without central fucose) and variable (without antennal fucose) portions of an N-glycan. It also inhibits the fucosylation of O-glycans and protein-O-fucosylation. The removal of fucose from N-glycans in N297 resulted in an increased affinity for FCYRS, as shown in Example 10.3.2. Example 10.3.2: Analysis of binding to the human Fcy receptor based on SPR
[00890] Para determinar a capacidade dos anticorpos inventivos e suas versões afucosiladas de se ligarem aos respectivos receptores FC expressos nas células efetoras humanas envolvidas em ADCC ou ADCP, os ensaios de ligação de SPR foram realizados em um instrumento T200 a 25°C com um chip de sensor CM5 e ensaio tampão HBS-EP+500 mM NaCl. As variantes de FcyR foram capturadas por meio de um anticorpo de captura anti-His acoplado a amina (ab) e as IgGs foram usadas como analito em concentrações de até 25 μM. Os valores KD foram derivados de uma análise de afinidade em estado constante ou de dados cinéticos ajustados a uma isoterma de Langmuir 1:1. Versões não fucosiladas dos anticorpos mostraram uma ligação aumentada a FcgRIIIa humano e cinomolgo, sugerindo uma indução de ADCC melhorada e, portanto, depleção de Treg para os anticorpos inventivos em sua forma não fucosilada em ambas as espécies (Tabela 10.3.2.1).[00890] To determine the ability of the inventive antibodies and their afucosylated versions to bind to the respective FC receptors expressed on human effector cells involved in ADCC or ADCP, SPR binding assays were performed on a T200 instrument at 25°C with a CM5 sensor chip and HBS-EP+500 mM NaCl buffer assay. FcyR variants were captured using an amine-coupled anti-His capture antibody (ab), and IgGs were used as analyte at concentrations up to 25 μM. KD values were derived from steady-state affinity analysis or from kinetic data fitted to a 1:1 Langmuir isotherm. Non-fucosylated versions of the antibodies showed increased binding to human and cynomolgus FcgRIIIa, suggesting enhanced ADCC induction and therefore Treg depletion for the inventive antibodies in their non-fucosylated form in both species (Table 10.3.2.1).
[00891] Além disso, uma afinidade comparável para ambos, cino- molgo e FCYRIII humano é importante para modelar a eficácia de ADCC em um modelo animal de cinomolgo. Esses sistemas modelo são particularmente importantes na imunologia tumoral porque os modelos de roedores muitas vezes não são adequados para refletir os efeitos colaterais imunológicos de um anticorpo terapêutico. Os anti-corpos não fucosilados de acordo com a presente invenção mostraram afinidades altamente comparáveis para os respectivos receptores de FC em cinomolgos e seres humanos. Tabela 10.3.2.1: Análise SPR de afinidades de anticorpos inventivos para diferentes receptores de FC. Itálico: aproximação apenas quando a concentração mais alta foi de 25 μM e nenhuma saturação foi alcançada; ne: não avaliável; nb: sem ligação; res. bdg.: ligação residual, não avaliável quantitativamente; KD >25 μM: valor ajustado fora da curva de saturação. TPP-9809: controle de isotipo. Exemplo 10.3.3: Indução de ADCC mediada por anticorpos CCR8 Exemplo 10.3.3.1: Indução de ADCC mediada por anticorpos CCR8 anti-humanos[00891] Furthermore, a comparable affinity for both cynomolgus and human FCYRIII is important for modeling the efficacy of ADCC in an animal model of cynomolgus. These model systems are particularly important in tumor immunology because rodent models are often inadequate to reflect the immunological side effects of a therapeutic antibody. The non-fucosylated antibodies according to the present invention have shown highly comparable affinities for the respective FC receptors in cynomolgus and humans. Table 10.3.2.1: SPR analysis of inventive antibody affinities for different FC receptors. Italics: approximation only when the highest concentration was 25 μM and no saturation was reached; ne: not evaluable; nb: no binding; res. bdg.: residual binding, not quantitatively evaluable; KD >25 μM: adjusted value outside the saturation curve. TPP-9809: isotype control. Example 10.3.3: CCR8 antibody-mediated ADCC induction Example 10.3.3.1: Anti-human CCR8 antibody-mediated ADCC induction
[00892] Para ensaios ADCC funcionais, células HEK expressando CCR8 humano ou Tregs humanas ativadas foram usadas como células alvo e NK92v-GPF-CD16 176V (NantKwest) foram usadas como células efetoras. Em uma placa tratada com cultura de tecidos de 96 cavidades, uma cocultura das respectivas células alvo expressando CCR8 com células efetoras na relação de 4:1 na presença de várias concentrações de anticorpo terapêutico foi incubada em RPMI 1640 com 1% de FBS inativado por calor, 100U/ml Pen/Strep, 1mN Na- piruvato e 1x NEAA. Digitonina foi usada para lise máxima, e CytoTox- Glo (Promega) foi adicionado ao ensaio no final de uma incubação de 2 horas. Os valores luminescentes brutos foram determinados usando o programa CytoTox-glo Promega. A Média Máxima de Fundo, MMB = (Target Max) - (Target Spontaneous) é usada para calcular a % de lise. % Lise = (Luminescent bruto - sem ab)/MMB X 100.[00892] For functional ADCC assays, HEK cells expressing human CCR8 or activated human Tregs were used as target cells and NK92v-GPF-CD16 176V (NantKwest) cells were used as effector cells. In a 96-well tissue culture-treated plate, a co-culture of the respective CCR8-expressing target cells with effector cells in a 4:1 ratio in the presence of various concentrations of therapeutic antibody was incubated in RPMI 1640 with 1% heat-inactivated FBS, 100 U/ml Pen/Strep, 1mN Na-pyruvate, and 1x NEAA. Digitonin was used for maximal lysis, and CytoTox-Glo (Promega) was added to the assay at the end of a 2-hour incubation. Crude luminescence values were determined using the CytoTox-glo Promega program. The Maximum Background Average, MMB = (Target Max) - (Target Spontaneous), is used to calculate the % lysis. % Lysis = (Gross Luminescent - without ab)/MMB x 100.
[00893] Para os candidatos de anticorpo TPP-19546 (painel superior) e TPP-21360 (painel inferior), a fucosilação aumentou a citotoxici- dade induzida por ADCC para ~50 e ~70%, respectivamente, em células HEK que expressam CCR8 humano (conforme Fig. 19).[00893] For antibody candidates TPP-19546 (top panel) and TPP-21360 (bottom panel), fucosylation increased ADCC-induced cytotoxicity to ~50 and ~70%, respectively, in HEK cells expressing human CCR8 (as shown in Fig. 19).
[00894] Em Tregs humanas ativadas com cerca de 85% de expressão de CCR8, a citotoxicidade derivada de ADCC resultante de TPP- 21360 ou TPP-23411 não fucosilado foi tão alta quanto 59% ou 52% (conforme Fig. 20, Tabela 10.3.3.1.3). Para TPP-21360 não fucosila- do, a EC50 média de % de citotoxicidade para Tregs humanos ativados com cerca de 85% de expressão de CCR8 usando NK92v como células efetoras foi de ~20 pM. As Tabelas 10.3.3.1.1 a 10.3.3.1.6 mostram os resultados para diferentes anticorpos inventivos e/ou diferentes doadores. Tabela 10.3.3.1.1: Sumário do ensaio ADCC: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e linhagem celular NK92v como células efetoras.Tabela 10.3.3.1.2: Sumário do ensaio ADCC: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e linhagem celular NK92v como células efetoras. Todos os TPPs usados neste ensaio foram não fucosilados.Tabela 10.3.3.1.3: Sumário do ensaio ADCC: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e linhagem celular NK92v como células efetoras. A Treg humana ativada usada neste estudo tinha cerca de 85% de expressão de CCR8.Tabela 10.3.3.1.4: Sumário do ensaio ADCC: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e linhagem celular NK92v como células efetoras. A Treg humana ativada usada neste estudo tinha apenas cerca de 31% de expressão de CCR8.Tabela 10.3.3.1.5: Ensaios ADCC: resposta EC50 e Max usando células HEK expressando CCR8 humano (> 95% CCR8) como células alvo e linhagem celular NK92v como células efetoras.Tabela 10.3.3.1.6: Ensaios ADCC: resposta EC50 e Max usando célu- las HEK expressando CCR8 humano (> 95% CCR8) como células alvo e linhagem celular NK92v como células efetoras.Exemplo 10.3.3.2: Indução de ADCC mediada por anticorposCCR8 anticamundongo (anticorpos substitutos)[00894] In activated human Tregs with approximately 85% CCR8 expression, ADCC-derived cytotoxicity resulting from non-fucosylated TPP-21360 or TPP-23411 was as high as 59% or 52% (as per Fig. 20, Table 10.3.3.1.3). For non-fucosylated TPP-21360, the mean EC50 % cytotoxicity for activated human Tregs with approximately 85% CCR8 expression using NK92v as effector cells was ~20 pM. Tables 10.3.3.1.1 to 10.3.3.1.6 show the results for different inventive antibodies and/or different donors. Table 10.3.3.1.1: Summary of the ADCC assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and NK92v cell line as effector cells. Table 10.3.3.1.2: Summary of the ADCC assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and NK92v cell line as effector cells. All TPPs used in this assay were non-fucosylated. Table 10.3.3.1.3: Summary of the ADCC assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and NK92v cell line as effector cells. The activated human Treg used in this study had approximately 85% CCR8 expression. Table 10.3.3.1.4: Summary of the ADCC assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and NK92v cell line as effector cells. The activated human Treg used in this study had only about 31% CCR8 expression. Table 10.3.3.1.5: ADCC assays: EC50 and Max response using HEK cells expressing human CCR8 (> 95% CCR8) as target cells and NK92v cell line as effector cells. Table 10.3.3.1.6: ADCC assays: EC50 and Max response using HEK cells expressing human CCR8 (> 95% CCR8) as target cells and NK92v cell line as effector cells. Example 10.3.3.2: Induction of ADCC mediated by anti-mouse CCR8 antibodies (surrogate antibodies)
[00895] Para comparar o comportamento dos anticorpos CCR8 anti- humanos/cyno humanos da invenção com os anticorpos substitutos CCR8 antimurinos humanos da invenção, estes últimos foram igualmente caracterizados para indução de ADCC. O ensaio ADCC funcional para os anticorpos substitutos foi realizado usando células NK mu- rinas primárias como células efetoras e células HEK293 expressando CCR8 murinas e BW 5417.3 (dados não mostrados) como células alvo. O meio contendo IgG ultrabaixo foi usado durante a cocultura para evitar a ligação inespecífica de anticorpos CCR8 a IgGs séricos. Além disso, para refletir mais de perto a situação in vivo, as células alvo foram primeiro pré-incubadas com anticorpos CCR8 substitutos antes que as células efetoras fossem adicionadas, permitindo um melhor agrupamento de FCYRIII nas células efetoras, que é a etapa inicial do modo de ação ADCC. As células efetoras e alvo foram cocultivadas em uma relação de 10:1 em RPMI 1640 com 1% de IgG Ultra-low FBS One Shot médio durante 20 horas usando placas de 96 cavidades de fundo em U. O anticorpo substituto CCR8 antimurino TPP-15285 e o anticorpo de controle de isotipo TPP-10748 foram usados em várias etapas de concentração. A citotoxicidade foi determinada usando o Ensaio de Citotoxicidade CytoTox-Glo™ (Promega) (% Citotoxicidade = [(Valor experimental - Controle sem anticorpo / (Lise máxima de células-alvo — Lise espontânea de células-alvo)] x 100%). Valores experimentais foram determinados por cocultura de células alvo com células efetoras após adição de anticorpos CCR8 substitutos. Os valores de controle foram determinados por cocultura de células alvo com células efetoras sem adição de anticorpos inventivos. Os valores máximos de lise foram determinados para células alvo onde a digitonina foi adicionada no início do ensaio. Os valores de lise espontânea foram determinados medindo a lise espontânea de células alvo em meio de ensaio sem adição de quaisquer outros reagentes. 92% a 97% das células alvo mostraram expressão de CCR8 de murino (determinado por FACS). A citotoxicidade relacionada ao ADCC para TPP-15285 foi de ~ 39% e a EC50 média foi de ~ 111 pM (Tabela 10.3.3.2.1). A maior concentração de anticorpo inventivo resultou em um efeito gancho, apoiando ainda mais o modo de ação sugerido baseado no ADCC. O ensaio ADCC funcional otimizado confirmou assim que ADCC é um modo de ação relevante para a eficácia in vivo dos anticorpos CCR8 substitutos inventivos e, desse modo, confirma a adequação do anticorpo CCR8 antimurino TPP-15285 como anticorpo substituto para os anticorpos CCR8 anti-humanos.Tabela 10.3.3.2.1: Sumário do ensaio ADCC usando anticorpos CCR8 substitutos fucosilados (tipo selvagem).Tabela 10.3.3.2.2: Ensaios de ADCC mostrando citotoxicidade em % induzida pelo anticorpo CCR8 substituto de tipo selvagem TPP-15285 (4 réplicas).Exemplo 10.3.4: Indução de ADCP mediada por anticorpos anti- CCR8Exemplo 10.3.4.1: Indução de ADCP mediada por anticorpos CCR8 anti-humanos[00895] To compare the behavior of the anti-human/cyno-human CCR8 antibodies of the invention with the anti-murine human CCR8 surrogate antibodies of the invention, the latter were also characterized for ADCC induction. The functional ADCC assay for the surrogate antibodies was performed using primary murine NK cells as effector cells and HEK293 cells expressing murine CCR8 and BW 5417.3 (data not shown) as target cells. Ultralow IgG-containing medium was used during co-culture to avoid nonspecific binding of CCR8 antibodies to serum IgGs. Furthermore, to more closely reflect the in vivo situation, target cells were first pre-incubated with surrogate CCR8 antibodies before effector cells were added, allowing for better FCYRIII clustering on effector cells, which is the initial step in the ADCC mode of action. Effector and target cells were co-cultured at a 10:1 ratio in RPMI 1640 with 1% IgG Ultra-low FBS One Shot medium for 20 hours using 96-well U-bottom plates. The antimurine CCR8 surrogate antibody TPP-15285 and the isotype control antibody TPP-10748 were used at various concentration steps. Cytotoxicity was determined using the CytoTox-Glo™ Cytotoxicity Assay (Promega) (% Cytotoxicity = [(Experimental Value - Control without antibody / (Maximum target cell lysis - Spontaneous target cell lysis)] x 100%). Experimental values were determined by co-culturing target cells with effector cells after the addition of surrogate CCR8 antibodies. Control values were determined by co-culturing target cells with effector cells without the addition of surrogate antibodies. Maximum lysis values were determined for target cells where digitonin was added at the beginning of the assay. Spontaneous lysis values were determined by measuring the spontaneous lysis of target cells in assay medium without the addition of any other reagents. 92% to 97% of target cells showed murine CCR8 expression (determined by FACS). ADCC-related cytotoxicity for TPP-15285 was ~39% and the mean EC50 was ~111. pM (Table 10.3.3.2.1). The higher concentration of inventive antibody resulted in a hook effect, further supporting the suggested mode of action based on ADCC. The optimized functional ADCC assay thus confirmed that ADCC is a relevant mode of action for the in vivo efficacy of the inventive CCR8 surrogate antibodies and, in this way, confirms the suitability of the anti-murine CCR8 antibody TPP-15285 as a surrogate antibody for anti-human CCR8 antibodies. Table 10.3.3.2.1: Summary of the ADCC assay using fucosylated (wild-type) CCR8 surrogate antibodies. Table 10.3.3.2.2: ADCC assays showing cytotoxicity in % induced by the wild-type CCR8 surrogate antibody TPP-15285 (4 replicates). Example 10.3.4: Induction of ADCP mediated by anti-CCR8 antibodies. Example 10.3.4.1: Induction of ADCP mediated by anti-human CCR8 antibodies.
[00896] Para gerar células efetoras de macrófagos (M2c), células CD14+ foram selecionadas negativamente (Miltenyi) de PBMC de doadores saudáveis (AllCells). A diferenciação de macrófagos M2c foi realizada de acordo com um protocolo de diferenciação de oito dias fornecido pela StemCell Tech (ver Fig. 21). No dia do ensaio, M2c foi corado para expressão de CD16, CD32, CD64, CD163, CD206,CD11b, CD80 e CD14 usando FACS. As células alvo eram células HEK expressando CCR8 humano ou células Treg humanas ativadas. Em suma, as células alvo foram marcadas com carboxifluoresceína succinimidil éster (CFSE) (ThermoFisher) de acordo com as instruções do fabricante. As células alvo foram incubadas em uma cocultura em placas de 96 cavidades com diferentes concentrações de anticorpos e células efetoras na relação alvo para efetora de 4:1. Nestes ensaios, foi adicionado anti-CD47 (controle positivo) em 1μg/ml; isso fornece uma resposta aprimorada, pois bloqueia o sinal não me coma. Após 3 a 4 horas de incubação, as amostras foram processadas em citómetro de fluxo MACSQuant ou Attune. A % de fagocitose foi determinada por células duplamente positivas CD206+CFSE+. CD206 é um marcador expresso em macrófagos.[00896] To generate macrophage effector cells (M2c), CD14+ cells were negatively selected (Miltenyi) from healthy donor PBMCs (AllCells). M2c macrophage differentiation was performed according to an eight-day differentiation protocol provided by StemCell Tech (see Fig. 21). On the day of the assay, M2c was stained for expression of CD16, CD32, CD64, CD163, CD206, CD11b, CD80, and CD14 using FACS. Target cells were HEK cells expressing human CCR8 or activated human Treg cells. In short, target cells were labeled with carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) (ThermoFisher) according to the manufacturer's instructions. Target cells were incubated in a co-culture in 96-well plates with different concentrations of antibodies and effector cells in a target-to-effector ratio of 4:1. In these assays, anti-CD47 (positive control) was added at 1 μg/ml; this provides an enhanced response as it blocks the "don't eat me" signal. After 3–4 hours of incubation, samples were processed using a MACSQuant or Attune flow cytometer. The % of phagocytosis was determined by double-positive CD206+CFSE+ cells. CD206 is a marker expressed on macrophages.
[00897] Macrófagos M1 foram gerados de forma semelhante e a partir do mesmo material de origem (PBMC frescas). Em suma, as células CD14+ foram isoladas por seleção negativa e cultivadas durante quatro dias em meio sem soro (StemCell Tech Immnocult) com 50ng/mL de M-CSF. No entanto, no dia 5, os macrófagos M1 foram polarizados pela adição de 10ng/mL de LPS + 50ng/mL de IFN-g, enquanto os macrófagos M2c foram polarizados com a adição de 10 ng/mL de IL-10.[00897] M1 macrophages were generated similarly and from the same source material (fresh PBMCs). In summary, CD14+ cells were isolated by negative selection and cultured for four days in serum-free medium (StemCell Tech Immnocult) with 50 ng/mL of M-CSF. However, on day 5, M1 macrophages were polarized by the addition of 10 ng/mL of LPS + 50 ng/mL of IFN-γ, while M2c macrophages were polarized with the addition of 10 ng/mL of IL-10.
[00898] A Fig. 22 mostra a indução de fagocitose em células HEK que expressam CCR8 humano como células alvo com macrófagos diferenciados in vitro M2c como células efetoras. Tanto as versões do tipo selvagem quanto não fucosiladas dos anticorpos inventivos TPP- 19546, TPP-21360 e TPP-23411 induziram ADCP. As Fig. 23 e 24 e as Tabelas 10.3.4.1.1 a 10.3.4.1.7 mostram a indução de ADCP como caracterizada por EC50 e resposta máxima para múltiplos anticorpos inventivos, múltiplos doadores e diferentes populações de macrófagos. Para todos os anticorpos, foi observado um grau substancial de ADCP. Tabela 10.3.4.1.1: Sumário do ensaio ADCP: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e macrófagos M2c como células efetoras. Todos os TPPs usados neste ensaio foram não fucosi-lados. TPP-9809 é o controle de isotipo. Para o doador de Treg humano 1212 CCR8 foi expresso por 40% das células.Tabela 10.3.4.1.2: Sumário do ensaio ADCP: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e macrófagos M2c como células efetoras. TPP-9809 é o controle de isotipo. Para o doador de Treg humano 1163 CCR8 foi expresso por 67% das células.Tabela 10.3.4.1.3: Sumário do ensaio ADCP: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e macrófagos M2c como células efetoras. TPP-9809 é o controle de isotipo. Para o doador de Treg humano 1163 CCR8 foi expresso por 67% das células. Tabela 10.3.4.1.4: Sumário do ensaio ADCP: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e macrófagos M2c como células efetoras. TPP-9809 é o controle de isoti- po. Para o doador de Treg humano 1212 CCR8 foi expresso por 40% das células.Tabela 10.3.4.1.5: Sumário do ensaio ADCP: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e macrófagos M2c como células efetoras. TPP-9809 é o controle de isotipo. Para o doador de Treg humano 1212 CCR8 foi expresso por 40% das células.Tabela 10.3.4.1.6: Sumário do ensaio ADCP: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e macrófagos M2c como células efetoras. TPP-9809 é o controle de isotipo.Tabela 10.3.4.1.7: Sumário do ensaio ADCP: resposta EC50 e Max usando Tregs ativadas como células alvo e macrófagos M2c como células efetoras. TPP-9809 é o controle de isotipo. Tabela 10.3.4.1.7: Sumário do ensaio ADCP com imagem ao vivo In- cucyte: resposta EC50 e Max usando macrófagos como células efeto- ras e células HEK expressando CCR8 humano como células alvo na relação de 4:1. A expressão de CCR8 humano foi de 80%. TPP-9809 é o controle de isotipo. Macrófagos M2c foram semeados em placas de 96 cavidades de fixação ultrabaixa. Após a adição dos anticorpos terapêuticos em várias concentrações, as células alvo marcadas com corante vermelho pHrodo (Sartorius #4649) foram adicionadas e as placas foram incubadas a 37°C e 5% de CO2. As imagens de contraste de fase e fluorescência vermelha foram adquiridas automaticamente e analisadas a cada 30 min durante 12 horas usando objetiva de 20x em Incucyte S3 (4 fotos/cavidade em triplicata). A indução de ADCP variou para anticorpos terapêuticos de tipo selvagem testados.Exemplo 10.3.4.2: Indução de ADCP mediada por anticorpos deCCR8 antimurino (anticorpos substitutos)[00898] Fig. 22 shows the induction of phagocytosis in HEK cells expressing human CCR8 as target cells with in vitro differentiated M2c macrophages as effector cells. Both wild-type and non-fucosylated versions of the inventive antibodies TPP-19546, TPP-21360, and TPP-23411 induced ADCP. Figs. 23 and 24 and Tables 10.3.4.1.1 to 10.3.4.1.7 show the induction of ADCP as characterized by EC50 and maximal response for multiple inventive antibodies, multiple donors, and different macrophage populations. For all antibodies, a substantial degree of ADCP was observed. Table 10.3.4.1.1: Summary of the ADCP assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and M2c macrophages as effector cells. All TPPs used in this assay were non-fucosylated. TPP-9809 is the isotype control. For the human Treg donor, 1212 CCR8 was expressed by 40% of the cells. Table 10.3.4.1.2: Summary of the ADCP assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and M2c macrophages as effector cells. TPP-9809 is the isotype control. For the human Treg donor 1163, CCR8 was expressed by 67% of the cells. Table 10.3.4.1.3: Summary of the ADCP assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and M2c macrophages as effector cells. TPP-9809 is the isotype control. For the human Treg donor, 1163 CCR8 was expressed by 67% of the cells. Table 10.3.4.1.4: Summary of the ADCP assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and M2c macrophages as effector cells. TPP-9809 is the isotype control. For the human Treg donor 1212, CCR8 was expressed by 40% of the cells. Table 10.3.4.1.5: Summary of the ADCP assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and M2c macrophages as effector cells. TPP-9809 is the isotype control. For the human Treg donor 1212, CCR8 was expressed by 40% of the cells. Table 10.3.4.1.6: Summary of the ADCP assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and M2c macrophages as effector cells. TPP-9809 is the isotype control. Table 10.3.4.1.7: Summary of the ADCP assay: EC50 and Max response using activated Tregs as target cells and M2c macrophages as effector cells. TPP-9809 is the isotype control. Table 10.3.4.1.7: Summary of the Incucyte live imaging ADCP assay: EC50 and Max response using macrophages as effector cells and HEK cells expressing human CCR8 as target cells in a 4:1 ratio. Human CCR8 expression was 80%. TPP-9809 is the isotype control. M2c macrophages were seeded in 96-well ultralow fixation plates. After the addition of therapeutic antibodies at various concentrations, target cells labeled with pHrodo red dye (Sartorius #4649) were added and the plates were incubated at 37°C and 5% CO2. Phase contrast and red fluorescence images were automatically acquired and analyzed every 30 min for 12 hours using a 20x objective on an Incucyte S3 (4 images/well in triplicate). ADCP induction varied for the tested wild-type therapeutic antibodies. Example 10.3.4.2: Induction of ADCP mediated by antimurine CCR8 antibodies (surrogate antibodies)
[00899] Para comparar o comportamento dos anticorpos CCR8 anti- humanos/cinos humanos inventivos com os anticorpos substitutos CCR8 antimurinos humanos da invenção, estes últimos foram igual- mente caracterizados para indução de ADCP. Para o ensaio ADCP funcional, macrófagos M2 derivados de medula óssea primária de mu- rino foram usados como células efetoras e células CCR8 de murino expressando células HEK293 e células BW 5417.3 (dados não mostrados) como células alvo. Para gerar as células efetoras, macrófagos derivados de medula óssea murina foram semeados em placa de 24 cavidades e polarizados em macrófagos M2 por adição de 20 ng/ml de M-CSF, 0,05 μg/ml de IL-4 e 0,05 μg/ml de IL-13. As células alvo foram marcadas com corante carboxifluoresceína succinimidil éster (CFSE, ThermoFisher) e foram adicionadas às células efetoras na relação efe- tora-alvo de 2:1. Finalmente, o anticorpo CCR8 antimurino substituto TPP-15285 e o controle de isotipo TPP-10748 foram adicionados em várias concentrações. Após 2 horas de cocultura, as células foram coradas para o marcador de macrófagos M2 murino F4/80 e a % de fa- gocitose foi determinada usando citometria de fluxo medindo a porção de macrófagos positivos duplos F4/80+ e CFSE+. 92% a 97% das células alvo mostraram expressão de CCR8 de murino (conforme determinado por FACS). A fagocitose induzida por TPP-15285 foi ~11% e a EC50 média foi ~402 pM (Tabela 10.3.4.2.1). A maior concentração de anticorpos resultou em um efeito gancho, apoiando ainda mais o modo de ação sugerido. O ensaio ADCP funcional otimizado confirmou ainda que o ADCP é um modo de ação relevante para a eficácia in vivo dos anticorpos CCR8 substitutos inventivos e, desse modo, confirma a adequação do anticorpo CCR8 antimurino TPP-15285 como anticorpo substituto para os anticorpos CCR8 anti-humanos.Tabela 10.3.4.2.1: Sumário do ensaio ADCP usando anticorpos CCR8 substitutos fucosilados (tipo selvagem). Exemplo 10.4: Modulação da sinalização CCR8 por anticorposCCR8[00899] To compare the behavior of the inventive anti-human/human CCR8 antibodies with the anti-murine human CCR8 surrogate antibodies of the invention, the latter were similarly characterized for ADCP induction. For the functional ADCP assay, murine primary bone marrow-derived M2 macrophages were used as effector cells and murine CCR8-expressing cells HEK293 and BW 5417.3 (data not shown) as target cells. To generate the effector cells, murine bone marrow-derived macrophages were seeded in a 24-well plate and polarized into M2 macrophages by the addition of 20 ng/ml M-CSF, 0.05 μg/ml IL-4, and 0.05 μg/ml IL-13. Target cells were labeled with carboxyfluorescein succinimidyl ester dye (CFSE, ThermoFisher) and added to effector cells in a 2:1 effector-to-target ratio. Finally, the surrogate antimurine CCR8 antibody TPP-15285 and the isotype control TPP-10748 were added at various concentrations. After 2 hours of co-culture, cells were stained for the murine M2 macrophage marker F4/80, and the % phagocytosis was determined using flow cytometry by measuring the proportion of double-positive F4/80+ and CFSE+ macrophages. 92% to 97% of target cells showed murine CCR8 expression (as determined by FACS). Phagocytosis induced by TPP-15285 was ~11% and the mean EC50 was ~402 pM (Table 10.3.4.2.1). The higher antibody concentration resulted in a hook effect, further supporting the suggested mode of action. The optimized functional ADCP assay further confirmed that ADCP is a relevant mode of action for the in vivo efficacy of the inventive CCR8 surrogate antibodies and thus confirms the suitability of the anti-murine CCR8 antibody TPP-15285 as a surrogate antibody for anti-human CCR8 antibodies. Table 10.3.4.2.1: Summary of the ADCP assay using fucosylated (wild-type) CCR8 surrogate antibodies. Example 10.4: Modulation of CCR8 signaling by CCR8 antibodies
[00900] CCL1 é um ligante específico de CCR8. Ao se ligar ao CCR8, o CCL1 pode induzir fluxo de cálcio (Ca), quimiotaxia e - via sinalização de β-arrestina - internalização do receptor, sendo este último possivelmente independente da sinalização da proteína G. Existem pelo menos 6 maneiras diferentes de um anticorpo modular um GPCR:1. Um agonista inverso, ao se ligar, acalma a potencial ativação endógena do GPCR. Para CCR8, a ativação endógena pode ser, por exemplo, ~10%.2. Um antagonista polarizado para β-arrestina ou proteína G bloqueia a sinalização dependente da proteína G ou a sinalização de β-arrestina e não tem efeito na respectiva outra via.3. Um antagonista neutro pode bloquear as vias de sinalização da proteína G e da β-arrestina.4. Um agonista total ativa as vias de sinalização da proteína G e da β-arrestina.5. Um agonista polarizado para β-arrestina ou proteína G ativa as vias de sinalização da proteína G ou de β-arrestina, mas não ambas.6. Um agonista promotor de dimerização reticula dois GPCRs, por exemplo, com os diferentes braços do anticorpo, resultando em várias atividades de sinalização[00900] CCL1 is a specific ligand for CCR8. Upon binding to CCR8, CCL1 can induce calcium (Ca) influx, chemotaxis, and – via β-arrestin signaling – receptor internalization, the latter possibly being independent of G protein signaling. There are at least 6 different ways an antibody can modulate a GPCR: 1. An inverse agonist, upon binding, calms the potential endogenous activation of the GPCR. For CCR8, endogenous activation can be, for example, ~10%. 2. A polarized antagonist for β-arrestin or G protein blocks G protein-dependent signaling or β-arrestin signaling and has no effect on the respective other pathway. 3. A neutral antagonist can block both G protein and β-arrestin signaling pathways. 4. A full agonist activates both G protein and β-arrestin signaling pathways. 5. A polarized agonist for β-arrestin or G protein activates G protein or β-arrestin signaling pathways, but not both.6. A dimerization-promoting agonist crosslinks two GPCRs, for example, with different antibody arms, resulting in multiple signaling activities.
[00901] Para uma abordagem baseada em ADCC e ADCP para esgotar as Tregs intratumorais, seria ideal excluir quaisquer efeitos potenciais de sinalização que um anticorpo possa ter no CCR8. Para avaliar isso, os inventores usaram o ensaio de fluxo de Ca como uma leitura para sinalização dependente de proteína G e ativação de β- arrestina e sinalização fosfo como uma leitura para vias de sinalização independentes de proteína G. A fosfo Erk1/2 está envolvida na via da MAP quinase e regula uma variedade de respostas celulares, enquanto a fosfo AKT é bem conhecida por estar associada à via da PI3 qui- nase e demonstrou em CCR8 estar envolvida na promoção da quimio- taxia. A via AKT também está envolvida na promoção da sobrevivência e do crescimento celular e, recentemente, o CCL1 demonstrou promover a sobrevivência de células que expressam CCR8 (Barsheshet, Yif- tah, et al. "CCR8+ FOXp3+ Treg cells as master drivers of immune regulation." Proceedings of the National Academy of Sciences 114.23 (2017): 6086-6091.).Exemplo 10.4.1: Ensaio DiscoverX para monitoramento da sinalização de β-arrestina[00901] For an ADCC and ADCP-based approach to deplete intratumoral Tregs, it would be ideal to exclude any potential signaling effects that an antibody might have on CCR8. To assess this, the inventors used the Ca flux assay as a readout for G protein-dependent signaling and β-arrestin activation, and phospho signaling as a readout for G protein-independent signaling pathways. Phospho Erk1/2 is involved in the MAP kinase pathway and regulates a variety of cellular responses, while phospho AKT is well known to be associated with the PI3 kinase pathway and has been shown in CCR8 to be involved in promoting chemotaxis. The AKT pathway is also involved in promoting cell survival and growth, and recently, CCL1 has been shown to promote the survival of cells expressing CCR8 (Barsheshet, Yiftah, et al. "CCR8+ FOXp3+ Treg cells as master drivers of immune regulation." Proceedings of the National Academy of Sciences 114.23 (2017): 6086-6091). Example 10.4.1: DiscoverX assay for monitoring β-arrestin signaling
[00902] Em resposta a um estímulo, isto é, a ligação de um ligante - como CCL1 para CCR8 - os GPCRs podem ativar a sinalização independente da proteína G, como a sinalização de β-arrestina. Isso pode resultar na internalização do receptor de quimiocina (Fox, James M., et al. "Structure/Function Relationships of CCR8 Agonists and Antagonists. Amino-terminal extension of CCL1 by a single amino acid generates a partial agonist." Journal of Biological Chemistry 281.48 (2006): 36652-36661). O ensaio de β-arrestina foi adquirido de DiscoverX. Em suma, o CCR8 é fundido no quadro com um pequeno fragmento doador de enzima ProLink™ (PK) e coexpresso em células que expressam estavelmente uma proteína de fusão de β-arrestina e o mutante de deleção N-terminal maior de β-galactosidase (chamado enzima aceitadora ou EA). A ativação de CCR8 estimula a ligação de β- arrestina ao CCR8 marcado com PK e força a complementação dos dois fragmentos enzimáticos, resultando na formação de uma enzima β-galactosidase ativa. Essa interação leva a um aumento na atividade enzimática que pode ser medida usando reagentes de detecção PathHunter quimioluminescentes.[00902] In response to a stimulus, i.e., the binding of a ligand—such as CCL1 to CCR8—GPCRs can activate G protein-independent signaling, such as β-arrestin signaling. This can result in chemokine receptor internalization (Fox, James M., et al. "Structure/Function Relationships of CCR8 Agonists and Antagonists. Amino-terminal extension of CCL1 by a single amino acid generates a partial agonist." Journal of Biological Chemistry 281.48 (2006): 36652-36661). The β-arrestin assay was acquired from DiscoverX. In summary, CCR8 is fused within the frame with a small ProLink™ enzyme donor fragment (PK) and co-expressed in cells that stably express a β-arrestin fusion protein and the larger N-terminal deletion mutant of β-galactosidase (called the acceptor enzyme or EA). Activation of CCR8 stimulates the binding of β-arrestin to PK-labeled CCR8 and forces the complementation of the two enzymatic fragments, resulting in the formation of an active β-galactosidase enzyme. This interaction leads to an increase in enzymatic activity that can be measured using PathHunter chemiluminescent detection reagents.
[00903] Em um primeiro experimento, o anticorpo ou CCL1 foi incubado com as células CHO coexpressando CCR8 humano marcado com ProLink e EA durante 90 min antes de adicionar o agente de detecção. Nem os anticorpos da técnica anterior nem os anticorpos inventivos induziram a sinalização de β-arrestina (Fig. 25).[00903] In a first experiment, the antibody or CCL1 was incubated with CHO cells co-expressing human CCR8 labeled with ProLink and EA for 90 min before adding the detection agent. Neither the antibodies from the prior technique nor the inventive antibodies induced β-arrestin signaling (Fig. 25).
[00904] Em um próximo experimento, as células foram estimuladas com CCL1 em EC80 para ativar a sinalização de β-arrestina e anticorpos inventivos ou anticorpos da técnica anterior foram adicionados para avaliar sua capacidade de bloquear a sinalização de β-arrestina ativada. Surpreendentemente, a sinalização de β-arrestina foi bloqueada tanto pelos anticorpos L263G8 quanto 433H da técnica anterior, enquanto o anticorpo inventivo TP-23411 não mostrou nenhum efeito significativo na sinalização de β-arrestina, pelo menos até uma concentração de 100 nM (Fig. 26).Tabela 10.4.1.1: Valores IC50 para inibição da sinalização de β- arrestina induzida por CCL1 de TPP-23411 e anticorpos da técnica anterior L263G8 e 433H medidos em nM. A coloração foi realizada em células CHO expressando estavelmente o CCR8 humano marcado com ProLink. Nenhum IC50 pode ser determinado para o anticorpo inventivo, sugerindo que TPP-23411 não bloqueia a sinalização de β- arrestina induzida por CCL1.Exemplo 10.4.2: Fosfo ELISA[00904] In a subsequent experiment, cells were stimulated with CCL1 at EC80 to activate β-arrestin signaling, and either inventive antibodies or prior art antibodies were added to assess their ability to block activated β-arrestin signaling. Surprisingly, β-arrestin signaling was blocked by both the prior art L263G8 and 433H antibodies, while the inventive antibody TP-23411 showed no significant effect on β-arrestin signaling, at least up to a concentration of 100 nM (Fig. 26). Table 10.4.1.1: IC50 values for inhibition of CCL1-induced β-arrestin signaling of TPP-23411 and prior art L263G8 and 433H antibodies measured in nM. Staining was performed on CHO cells stably expressing ProLink-labeled human CCR8. No IC50 could be determined for the inventive antibody, suggesting that TPP-23411 does not block CCL1-induced β-arrestin signaling. Example 10.4.2: Phospho ELISA
[00905] A sinalização de fosfo AKT promove a sobrevivência e o crescimento, enquanto a sinalização de fosfo Erk1/2 regula uma variedade de respostas celulares. Os anticorpos Fosfo Erk1/2 e fosfo AKT foram adquiridos da CellSignaling e os ensaios ELISA foram realizados de acordo com o protocolo do fabricante. As células CHO expressando CCR8 humano ou Tregs humanas ativados foram tratadas com CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8 ou anticorpo BD 433H, ou permaneceram sem tratamento para o controle negativo. CCL1 serviu como controle positivo. Interessantemente, os anticorpos da técnica anterior Biolegend L263G8 e o anticorpo BD 433H induziram um aumento significativo dos níveis de Erk1/2 fosforilados (Fig. 27, 28), bem como níveis de AKT fosforilados (Fig. 29, 30), por exemplo, após 15 minutos em humanos ativados Tregs, enquanto este não foi o caso de anticorpos inventivos.[00905] Phospho AKT signaling promotes survival and growth, while phospho Erk1/2 signaling regulates a variety of cellular responses. Phospho Erk1/2 and phospho AKT antibodies were purchased from CellSignaling, and ELISA assays were performed according to the manufacturer's protocol. CHO cells expressing human CCR8 or activated human Tregs were treated with CCL1, TPP-23411, Biolegend L263G8, or BD 433H antibody, or remained untreated for the negative control. CCL1 served as the positive control. Interestingly, the antibodies from the previous Biolegend L263G8 technique and the BD 433H antibody induced a significant increase in phosphorylated Erk1/2 levels (Figs. 27, 28), as well as phosphorylated AKT levels (Figs. 29, 30), for example, after 15 minutes in activated human Tregs, whereas this was not the case for inventive antibodies.
[00906] Em suma, ambos os anticorpos da técnica anterior são agonísticos para vias independentes da proteína G, tais como fosfori- lação de AKT ou fosforilação de ERK1/2.Exemplo 10.4.3: Ensaio de fluxo de cálcio[00906] In summary, both antibodies from the previous technique are agonistic for G protein-independent pathways, such as AKT phosphorylation or ERK1/2 phosphorylation. Example 10.4.3: Calcium flow assay
[00907] A medição da mobilização de cálcio intracelular é um ensaio robusto que pode ser realizado de maneira de alto rendimento para estudar o efeito de compostos ou anticorpos em potenciais alvos de fármacos, como CCR8. Para este fim, a atividade dos receptores que sinalizam através da liberação de Ca2+ pode ser monitorada usando o ensaio de cálcio FLIPR baseado em fluorescência (Molecular Devices, Sunnyvale, CA). Em suma, as células CHO expressando CCR8 humano foram semeadas em placas de ensaio e incubadas durante a noite. As células foram então carregadas com corante sensível ao Ca+ BUV396/496.[00907] Measuring intracellular calcium mobilization is a robust assay that can be performed in a high-throughput manner to study the effect of compounds or antibodies on potential drug targets, such as CCR8. To this end, the activity of receptors that signal through Ca2+ release can be monitored using the fluorescence-based FLIPR calcium assay (Molecular Devices, Sunnyvale, CA). In short, human CCR8-expressing CHO cells were seeded in assay plates and incubated overnight. The cells were then loaded with Ca+-sensitive dye BUV396/496.
[00908] Para a medição da função antagônica, o monitoramento do sinal de fluxo de Ca por meio de FLIPR Tera começou em paralelo à adição de anticorpos ou composto de referência (MC148) em diferen- tes concentrações às células. Após 1 min de incubação das células com os anticorpos ou composto de referência, o agonista de CCL1 foi adicionado e o sinal de fluxo de cálcio foi registrado por mais 3 min por meio de FLIPR Tetra. Para medir a função agonística, anticor- pos/composto de referência foram adicionados em paralelo ao monitoramento do sinal de fluxo de Ca por meio de FLIPR durante 3 min.[00908] For the antagonistic function measurement, monitoring of the Ca flow signal using FLIPR Tera began in parallel with the addition of antibodies or reference compound (MC148) at different concentrations to the cells. After 1 min of incubation of the cells with the antibodies or reference compound, the CCL1 agonist was added and the calcium flow signal was recorded for a further 3 min using FLIPR Tetra. To measure the agonistic function, antibodies/reference compound were added in parallel with monitoring of the Ca flow signal using FLIPR for 3 min.
[00909] As Tabelas 10.4.3.1 a 10.4.3.4 mostram os resultados do ensaio de fluxo de cálcio para anticorpos CCR8 antimurino ou anti- humano. Nenhum IC50 pode ser determinado para TPP-14099 e TPP- 21047. IC50 para outros anticorpos inventivos variou. Em geral, a maioria dos anticorpos inventivos e também os anticorpos da técnica anterior bloquearam eficazmente a sinalização dependente da proteína G induzida por CCL1.Tabela 10.4.3.1: Ensaio de fluxo de Ca. Células CHO expressando CCR8 de murino foram usadas para testar a capacidade dos anticorpos para bloquear a sinalização de Ca dependente de proteína G induzida por CCL1. CCL1 a 40ng/ml foi usado para indução. Tanto o TPP-14095 quanto o TPP-14099 se ligam ao CCR8 de camundongo. Nenhum efeito agonista na sinalização de Ca dependente de proteína G foi observado para os anticorpos inventivos ou os anticorpos da técnica anterior (dados não mostrados).Tabela 10.4.3.2: Ensaio de fluxo de Ca. Células CHO expressando CCR8 humano foram usadas para testar a capacidade dos anticorpos para bloquear a sinalização de Ca dependente de proteína G induzida por CCL1. CCL1 foi usado em uma concentração de 80ng/ml.Tabela 10.4.3.3: Ensaio de fluxo de Ca. Células CHO expressando CCR8 humano foram usadas para testar a capacidade dos anticorpos para bloquear a sinalização de Ca dependente de proteína G induzida por CCL1. CCL1 foi usado em uma concentração de 60 ng/ml.Tabela 10.4.3.4: Ensaio de fluxo de Ca. Células CHO expressando CCR8 humano foram usadas para testar a capacidade dos anticorpos para bloquear a sinalização de Ca dependente de proteína G induzida por CCL1. CCL1 foi usado em uma concentração de 60ng/ml.Exemplo 10.5: Internalização de anticorpos inventivos[00909] Tables 10.4.3.1 to 10.4.3.4 show the results of the calcium flux assay for anti-murine or anti-human CCR8 antibodies. No IC50 could be determined for TPP-14099 and TPP-21047. IC50 for other inventive antibodies varied. In general, most inventive antibodies and also the antibodies from the prior art effectively blocked CCL1-induced G protein-dependent signaling. Table 10.4.3.1: Ca flux assay. Murine CCR8-expressing CHO cells were used to test the ability of antibodies to block CCL1-induced G protein-dependent Ca signaling. CCL1 at 40 ng/ml was used for induction. Both TPP-14095 and TPP-14099 bind to mouse CCR8. No agonist effect on G protein-dependent Ca signaling was observed for the inventive antibodies or the prior art antibodies (data not shown). Table 10.4.3.2: Ca flux assay. CHO cells expressing human CCR8 were used to test the ability of antibodies to block CCL1-induced G protein-dependent Ca signaling. CCL1 was used at a concentration of 80 ng/ml. Table 10.4.3.3: Ca flux assay. CHO cells expressing human CCR8 were used to test the ability of antibodies to block CCL1-induced G protein-dependent Ca signaling. CCL1 was used at a concentration of 60 ng/ml. Table 10.4.3.4: Ca flux assay. CHO cells expressing human CCR8 were used to test the ability of antibodies to block CCL1-induced G protein-dependent Ca signaling. CCL1 was used at a concentration of 60 ng/ml. Example 10.5: Internalization of inventive antibodies
[00910] Para avaliar a internalização do CCR8, a tecnologia de imagem foi usada para visualizar esse processo. Os anticorpos anti- CCR8 específicos TPP-21360 e TPP-23411 e o anticorpo de controle de isotipo correspondente TPP-5657 foram marcados com um corante fluorescente. Além disso, os anticorpos comerciais L263G8 e 433H, bem como o anticorpo murino SA214G2, também foram conjugados com o corante permanente BODIPY. Estes anticorpos foram conjugados com lisina com um excesso de dois a seis molar de corante BO- DIPY® FL (éster, D2184, ThermoFisher) a pH 8,3. Após a conjugação, a mistura de reação foi purificada por cromatografia (coluna de dessa- linização PD10 1-2,5 ml; GE Healthcare) para eliminar o excesso de corante e ajustar o valor de pH. Em seguida, a solução proteica foi concentrada (VIVASPIN 500, Fa. Sartorius stedim biotec). A determinação da carga de corante do anticorpo foi realizada com um espec- trofotômetro (NanoDrop) e calculada com a fórmula D:P = A corante ε proteína : (A 280 -0,16A corante) ε corante. A carga de corante dos anticorpos específicos do alvo TPP-21360 e TPP-23411 e do anticorpo de controle de isotipo mostraram estar em uma faixa semelhante (carga de coran- te/ab: 4,0 e 4,1). Os anticorpos comerciais provocam carga de coran- te/anticorpo de 3,8 e 3,9. A conjugação pode provocar um impacto negativo na afinidade do anticorpo, portanto, o teste de anticorpos conjugados em um ensaio de ligação celular (FACS) é essencial para garantir que a marcação não alterou a ligação ao CCR8 (CD198) (conforme Fig. 31 a, Fig. 32 a, Fig. 34 a, b). Os anticorpos conjugados estavam então prontos para uso em ensaios de internalização realizados com a linhagem celular positiva para CCR8 humana HuT78 e a linhagem celular positiva para CCR8 murina BW5147.3. Antes do tratamento, as linhagens celulares que expressam CCR8 (2 x 104/cavidade) foram semeadas em 100 μl de meio em um 96-MTP (CellCarrier Ultra, PerkinElmer). Após 18 h de incubação a 37°C/5% de CO2, o meio foi trocado e o anticorpo marcado foi adicionado em várias concentrações (2,5, 1μg/ml; triplicado). O mesmo protocolo de tratamento foi aplicado para o anticorpo de controle de isotipo rotulado (controle negativo). Além disso, a linhagem celular CHO-K1 parental (células negativas CCR8) foi tratada similarmente servindo como análise de contador (controle de especificidade). O estudo de internaliza- ção com os anticorpos específicos do alvo foi realizado de forma cinética. As imagens foram tiradas após diferentes pontos de tempo (0 h, 0,5 h, 2 h, 6 h e 24 h) e a eficácia da internalização foi determinada medindo a intensidade de fluorescência internalizada total/célula. A medição foi realizada com o Operetta CLS (PerkinElmer) e as análises dos dados das imagens foram realizadas com o software de análise de alto conteúdo Harmony (PerkinElmer).[00910] To evaluate CCR8 internalization, imaging technology was used to visualize this process. The specific anti-CCR8 antibodies TPP-21360 and TPP-23411 and the corresponding isotype control antibody TPP-5657 were labeled with a fluorescent dye. In addition, the commercial antibodies L263G8 and 433H, as well as the murine antibody SA214G2, were also conjugated with the permanent dye BODIPY. These antibodies were conjugated with lysine with a two to six molar excess of BODIPY® FL dye (ester, D2184, ThermoFisher) at pH 8.3. After conjugation, the reaction mixture was purified by chromatography (PD10 1-2.5 ml desalting column; GE Healthcare) to remove excess dye and adjust the pH value. Next, the protein solution was concentrated (VIVASPIN 500, Fa. Sartorius stedim biotec). The determination of the antibody dye load was performed with a spectrophotometer (NanoDrop) and calculated using the formula D:P = A dye ε protein : (A 280 -0.16A dye) ε dye. The dye load of the target-specific antibodies TPP-21360 and TPP-23411 and the isotype control antibody were found to be in a similar range (dye load/antibody: 4.0 and 4.1). Commercial antibodies produce dye loads/antibody of 3.8 and 3.9. Conjugation can negatively impact antibody affinity; therefore, testing conjugated antibodies in a cell binding assay (FACS) is essential to ensure that labeling has not altered binding to CCR8 (CD198) (as per Fig. 31a, Fig. 32a, Fig. 34a, b). The conjugated antibodies were then ready for use in internalization assays performed with the human CCR8-positive cell line HuT78 and the murine CCR8-positive cell line BW5147.3. Prior to treatment, CCR8-expressing cell lines (2 x 10⁴/well) were seeded in 100 μl of medium in a 96-MTP (CellCarrier Ultra, PerkinElmer). After 18 h of incubation at 37°C/5% CO₂, the medium was changed and the labeled antibody was added at various concentrations (2.5, 1 μg/ml; triplicated). The same treatment protocol was applied to the labeled isotype control antibody (negative control). Additionally, the parental CHO-K1 cell line (CCR8-negative cells) was similarly treated, serving as a counter analysis (specificity control). The internalization study with target-specific antibodies was performed kinetically. Images were taken after different time points (0 h, 0.5 h, 2 h, 6 h, and 24 h), and internalization efficacy was determined by measuring the total internalized fluorescence intensity per cell. Measurement was performed using the Operetta CLS (PerkinElmer), and image data analysis was performed using the Harmony high-content analysis software (PerkinElmer).
[00911] As Fig. 31 b e 32 b mostram uma internalização substanci- al dos anticorpos comerciais CCR8 anti-humanos 433H e L263G8 em células HuT78 e anticorpo comercial CCR8 antimurino SA214G2 em células BW5147.3, enquanto a Fig. 33 demonstra uma baixa ou nenhuma internalização de os anticorpos inventivos TPP-21360 e TPP- 23411, que é substancialmente comparável ao controle de isotipo.Tabela 10.5.1: Sumário dos dados de internalização para anticorpos inventivos e anticorpos da técnica anterior. nD: não testado. [00911] Figs. 31 and 32b show substantial internalization of commercial anti-human CCR8 antibodies 433H and L263G8 in HuT78 cells and commercial anti-murine CCR8 antibody SA214G2 in BW5147 cells, while Fig. 33 demonstrates low or no internalization of the inventive antibodies TPP-21360 and TPP-23411, which is substantially comparable to the isotype control. Table 10.5.1: Summary of internalization data for inventive antibodies and prior art antibodies. nD: not tested.
[00912] Para confirmar que a baixa internalização era de fato uma característica que caracteriza todos os anticorpos anti-CCR8 inventivos obtidos com um antígeno peptídico sulfatado como descrito aqui, os anticorpos inventivos listados na Tabela 10.5.2 (ver também Fig. 89) foram analisados em relação ao seu comportamento de internali- zação com área/célula da vesícula como leitura. Um anticorpo anti- CD71 com internalização substancial conhecida foi usado como controle positivo. De fato, todos os anticorpos CCR8 anti-humanos inventivos testados eram anticorpos não internalizantes, isto é, anticorpos que não apresentavam nenhum grau substancial de internalização. Interessantemente, TPP-17577, o único anticorpo de CCR8 anti- humano humano testado sem histidina dentro do HCDR3 mostrou uma internalização um pouco maior do que todos os anticorpos CCR8 anti- humanos humanos testados compreendendo histidina dentro do HCDR3.Tabela 10.5.2: Sumário dos dados de internalização para anticorpos inventivos. na: não testado.Exemplo 10.6.1: Cromatografia de afinidade FcRn de anticorpos anti-CCR8[00912] To confirm that low internalization was indeed a characteristic that characterizes all inventive anti-CCR8 antibodies obtained with a sulfated peptide antigen as described herein, the inventive antibodies listed in Table 10.5.2 (see also Fig. 89) were analyzed regarding their internalization behavior with vesicle area/cell as the readout. An anti-CD71 antibody with known substantial internalization was used as a positive control. In fact, all inventive anti-human CCR8 antibodies tested were non-internalizing antibodies, i.e., antibodies that did not exhibit any substantial degree of internalization. Interestingly, TPP-17577, the only anti-human CCR8 antibody tested without histidine within HCDR3, showed slightly higher internalization than all tested anti-human CCR8 antibodies comprising histidine within HCDR3. Table 10.5.2: Summary of internalization data for inventive antibodies. Not tested. Example 10.6.1: FcRn affinity chromatography of anti-CCR8 antibodies
[00913] O receptor Fc neonatal (FcRn) está ligado à regulação do processamento metabólico de anticorpos IgG in vivo. A ligação ao FcRn em ambiente ácido de endossomos de células endoteliais vasculares protege as IgGs da degradação lisossomal. A liberação de IgGs de FcRn na corrente sanguínea ocorre em pH fisiológico 7,4. Desse modo, FcRn se liga às IgGs em pH < 6,5 e não tem ligação em pH fisiológico 7,4 A interação entre IgGs e FcRn tem um impacto na farma- cocinética de IgGs in vivo. A caracterização da ligação de IgG dependente de pH a FcRn, imitando a interação de reciclagem de anticorpos por meio de FcRn imobilizado, pode revelar propriedades de IgG que contribuem para sua farmacocinética.[00913] The neonatal Fc receptor (FcRn) is linked to the regulation of the metabolic processing of IgG antibodies in vivo. Binding to FcRn in the acidic environment of vascular endothelial cell endosomes protects IgGs from lysosomal degradation. The release of IgGs from FcRn into the bloodstream occurs at physiological pH 7.4. Thus, FcRn binds to IgGs at pH < 6.5 and does not bind at physiological pH 7.4. The interaction between IgGs and FcRn has an impact on the pharmacokinetics of IgGs in vivo. Characterizing the pH-dependent binding of IgG to FcRn, mimicking the antibody recycling interaction via immobilized FcRn, may reveal properties of IgG that contribute to its pharmacokinetics.
[00914] As corridas de afinidade de FcRn foram realizadas num sistema de cromatografia Ãkta Pure 25 a 25°C. Uma coluna FcRn (Roche, Pedido No. 8128057001; pré-embalada com aproximadamente 1 mL de resina; capacidade de ligação: > 100 μg IgG) foi equilibrada com tampão de execução A: MES a 20 mM/HCl pH 5,5 NaCl a 140 mM. 30 μL de cada anticorpo (1mg/mL em tampão de equilíbrio) foram aplicados à coluna. O gradiente de pH linear foi gerado através do aumento da porcentagem de tampão de execução B Tris a 20 mM/HCl pH 8,8 NaCl a 140 mM como se segue: 0 min - 20% de B, 10 min - 20% de B, 80 min - 100% de B, 90 min - 100% de B, 93 min - 20% de B, 103 min - 20% de B. A taxa de fluxo foi de 0,5 mL/min. O valor de pH no ponto de eluição foi monitorado e lido a partir de cromatogramas gerados com Unicorn 7.1.[00914] FcRn affinity runs were performed on an Akta Pure 25 chromatography system at 25°C. An FcRn column (Roche, Order No. 8128057001; pre-packed with approximately 1 mL of resin; binding capacity: > 100 μg IgG) was equilibrated with running buffer A: 20 mM MES/HCl pH 5.5 140 mM NaCl. 30 μL of each antibody (1 mg/mL in equilibration buffer) were applied to the column. A linear pH gradient was generated by increasing the percentage of running buffer from 20 mM Tris B/HCl pH 8.8 to 140 mM NaCl as follows: 0 min - 20% B, 10 min - 20% B, 80 min - 100% B, 90 min - 100% B, 93 min - 20% B, 103 min - 20% B. The flow rate was 0.5 mL/min. The pH value at the elution point was monitored and read from chromatograms generated with Unicorn 7.1.
[00915] Como pode ser visto na Tabela 10.6.1.1, o anticorpo da técnica anterior Ustekinumab serviu como controle para farmacocinéti- ca padrão e o anticorpo da técnica anterior Briakinumab serviu como controle para farmacocinética rápida (conforme Schoch, Angela, et al. "Charge-mediated influence of the antibody variable domain on FcRn- dependent pharmacokinetics." Proceedings of the National Academy of Sciences 112.19 (2015): 5997-6002.). TPP-17577, TPP-18205, TPP- 27495, TPP-21047 e TPP-27496 mostram um pH de eluição maior do que pH 7,5 e pode ser considerado como apresentando ligação a FcRn também em pH 7,4 a pH 7,5. O pH medido pode ser usado para prever a clearance e a meia-vida de um anticorpo. Tabela 10.6.1.1: Cromatografia de afinidade de FcRn para diferentes anticorpos: pH na eluição. Dois valores de pH indicam um pico duplo.Exemplo 10.6.2: Análise de ligaçã io de FcRn com base em SPR[00915] As can be seen in Table 10.6.1.1, the prior art antibody Ustekinumab served as a control for standard pharmacokinetics and the prior art antibody Briakinumab served as a control for rapid pharmacokinetics (as per Schoch, Angela, et al. "Charge-mediated influence of the antibody variable domain on FcRn-dependent pharmacokinetics." Proceedings of the National Academy of Sciences 112.19 (2015): 5997-6002.). TPP-17577, TPP-18205, TPP-27495, TPP-21047, and TPP-27496 show an elution pH greater than pH 7.5 and can be considered as exhibiting FcRn binding also at pH 7.4 to pH 7.5. The measured pH can be used to predict the clearance and half-life of an antibody. Table 10.6.1.1: FcRn affinity chromatography for different antibodies: pH at elution. Two pH values indicate a double peak. Example 10.6.2: FcRn binding analysis based on SPR
[00916] Para avaliar a afinidade de ligação de anticorpos anti-CCR8 para FcRn, a ligação foi investigada usando SPR em pH 6,0 e pH 7,4. Os ensaios de ligação foram realizados em um instrumento Biacore T200 a 25°C com um chip sensor CM5 e tampão de ensaio PBST. Para ensaios de ligação a FcRn, FcRn humano, camundongo ou cinomo- lgo foi acoplado à amina à superfície do chip do sensor CM5 (~ 300 RU) e as IgGs foram injetadas em concentrações que variam de 15,6 a 2.000 nM em PBST, pH 6. A regeneração foi realizada com pH PBST 7.4. Em outro experimento apenas em pH 7,4, as IgGs foram testadas com uma concentração de 2 μM, portanto, foi avaliada apenas qualitativamente se ocorrer uma ligação. Os valores de KD foram derivados de uma análise de afinidade em estado constante, bem como de análise cinética por ajuste a uma isoterma de ligação 1:1.[00916] To evaluate the binding affinity of anti-CCR8 antibodies for FcRn, binding was investigated using SPR at pH 6.0 and pH 7.4. Binding assays were performed on a Biacore T200 instrument at 25°C with a CM5 sensor chip and PBST assay buffer. For FcRn binding assays, human, mouse, or cynomolgus FcRn was amine-coupled to the surface of the CM5 sensor chip (~300 RU) and IgGs were injected at concentrations ranging from 15.6 to 2000 nM in PBST, pH 6. Regeneration was performed with PBST pH 7.4. In another experiment at pH 7.4 only, IgGs were tested at a concentration of 2 μM, therefore, only qualitative assessment of binding was performed. The KD values were derived from a steady-state affinity analysis as well as from kinetic analysis by fitting to a 1:1 linkage isotherm.
[00917] Como pode ser visto na Tabela 10.6.2.1, e como descrito anteriormente, Ustekinumab serviu como controle positivo e Briakinu- mab como controle negativo conforme publicado em Schoch et al, 2015. Esses dois anticorpos não diferem significativamente em sua afinidade para FcRn, mas em sua resposta de ligação a FcRn a pH 7,4. Desse modo, pode-se supor que os anticorpos que apresentam uma resposta de ligação em pH 7,4 podem ter uma meia vida acelerada in vivo.Exemplo 10.7: Cromatografia de afinidade de heparina de anticorpos anti-CCR8[00917] As can be seen in Table 10.6.2.1, and as described previously, Ustekinumab served as a positive control and Briakinumab as a negative control as published in Schoch et al, 2015. These two antibodies do not differ significantly in their affinity for FcRn, but in their binding response to FcRn at pH 7.4. Thus, it can be assumed that antibodies that exhibit a binding response at pH 7.4 may have an accelerated half-life in vivo. Example 10.7: Heparin affinity chromatography of anti-CCR8 antibodies
[00918] Para os anticorpos inventivos que reconhecem o CCR8 humano, a interação mediada por carga é altamente provável, porque os anticorpos reconhecem um motif de tirosina de antígeno carregado e têm uma certa composição estrutural, por exemplo, em relação ao seu HCDR3. As interações mediadas por carga são, no entanto, uma força motriz para a degradação de IgGs além da ligação de FcRn em pH 7,4. A ligação a um glicocálix carregado negativamente de monóci- tos ou macrófagos pode levar à pinocitose e subsequente degradação proteolítica. Kraft et al. mostraram que o comportamento do anticorpo in vivo pode ser previsto de forma mais eficiente e precisa ao conduzir a cromatografia de afinidade de heparina juntamente com a cromato- grafia de FcRn (Kraft, Thomas E., et al. "Heparin chromatography as an in vitro predictor for antibody clearance rate through pinocytosis." MAbs. Vol. 12. No. 1. Taylor & Francis, 2020.). Tabela 10.6.2.1: Análise SPR de afinidades de anticorpos inventivos para diferentes receptores de FCRN. A resposta de ligação pequena é definida como uma resposta < 30 RU, a resposta de ligação como > 30 RU. [00918] For inventive antibodies that recognize human CCR8, charge-mediated interaction is highly likely because the antibodies recognize a charged antigen tyrosine motif and have a certain structural composition, for example, in relation to their HCDR3. Charge-mediated interactions are, however, a driving force for IgG degradation beyond FcRn binding at pH 7.4. Binding to a negatively charged glycocalyx of monocytes or macrophages can lead to pinocytosis and subsequent proteolytic degradation. Kraft et al. showed that antibody behavior in vivo can be predicted more efficiently and accurately by conducting heparin affinity chromatography together with FcRn chromatography (Kraft, Thomas E., et al. "Heparin chromatography as an in vitro predictor for antibody clearance rate through pinocytosis." MAbs. Vol. 12. No. 1. Taylor & Francis, 2020.). Table 10.6.2.1: SPR analysis of inventive antibody affinities for different FCRN receptors. Small binding response is defined as a response < 30 RU, large binding response as > 30 RU.
[00919] Alta afinidade, alto nível de interação e, portanto, altos tempos de retenção podem prever uma meia vida mais curta dos anticor- pos testados. Os ciclos de afinidade de heparina foram realizadas em um sistema de cromatografia Ãkta Pure 25 a 25°C. Uma coluna de he- parano (Tosoh) foi equilibrada com tampão de execução A: TRIS a 50 mM, pH 7,4. 50 μL de cada anticorpo (1 mg/mL em Histidina a 20 mM pH 5,5) foi aplicado à coluna. Um gradiente de sal linear foi gerado aumentando a porcentagem de tampão de execução B Tris a 20 mM pH 7,4 NaCl a 1M como se segue: 2 min após a injeção - 0% de B, 0 a 55% de B ao longo de 16,5 minutos, 100% ao longo de 0,5 minutos, 100% de B por quatro minutos. A taxa de fluxo foi de 0,8 mL/min. O tempo de eluição foi monitorado e lido a partir de cromatogramas gerados com Unicorn 7.1.[00919] High affinity, high level of interaction, and therefore high retention times may predict a shorter half-life of the tested antibodies. Heparin affinity cycles were performed on an Akta Pure 25 chromatography system at 25°C. A heparin (Tosoh) column was equilibrated with running buffer A: 50 mM Tris, pH 7.4. 50 μL of each antibody (1 mg/mL in 20 mM Histidine pH 5.5) was applied to the column. A linear salt gradient was generated by increasing the percentage of running buffer B: 20 mM Tris pH 7.4 1M NaCl as follows: 2 min after injection - 0% B, 0 to 55% B over 16.5 minutes, 100% over 0.5 minutes, 100% B for four minutes. The flow rate was 0.8 mL/min. The elution time was monitored and read from chromatograms generated with Unicorn 7.1.
[00920] Como pode ser observado na Tabela 10.7.1, e como descrito anteriormente, Ustekinumab serviu como controle positivo e Bria- kinumab como controle negativo. A maioria dos anticorpos inventivos testados gira em torno de um tempo de retenção de 15 a 18 min. Des-se modo, esses anticorpos podem apresentar uma meia vida reduzida se as interações eletrostáticas contribuírem in vivo.Tabela 10.7.1: Cromatografia de afinidade de heparina para diferentes anticorpos: pH na eluição. Exemplo 10.8: Estudos toxicológicos e depleção de CCR8 em macaca fascicularis[00920] As can be seen in Table 10.7.1, and as described previously, Ustekinumab served as a positive control and Briakinumab as a negative control. Most of the inventive antibodies tested have a retention time of around 15 to 18 min. Therefore, these antibodies may have a reduced half-life if electrostatic interactions contribute in vivo. Table 10.7.1: Heparin affinity chromatography for different antibodies: pH at elution. Example 10.8: Toxicological studies and CCR8 depletion in Macaca fascicularis
[00921] Macaca fascicularis foi tratada com 50mg/kg de TPP-23411 durante quatro semanas. Os animais não apresentaram sinais de toxicidade. Uma semana após o último tratamento, o tecido do timo (que possui os níveis mais altos de CCR8 entre os tecidos saudáveis) foi analisado usando RNA-seq. O nível de mRNA de CCR8 foi significativamente reduzido nos animais tratados com anticorpo anti-CCR8. Nenhuma redução significativa nos níveis de CCR8 foi encontrada em doses mais baixas de TPP-23411.Exemplo 11 : Aplicabilidade terapêutica do alvo[00921] Macaca fascicularis was treated with 50 mg/kg of TPP-23411 for four weeks. The animals showed no signs of toxicity. One week after the last treatment, thymus tissue (which has the highest levels of CCR8 among healthy tissues) was analyzed using RNA-seq. The CCR8 mRNA level was significantly reduced in animals treated with anti-CCR8 antibody. No significant reduction in CCR8 levels was found at lower doses of TPP-23411. Example 11: Therapeutic applicability of the target
[00922] Para uso terapêutico de um determinado alvo em imuno- oncologia, a expressão específica de um alvo é de extrema importância para minimizar os efeitos colaterais sistêmicos. O alvo deve ser específico para o tecido ou células alvo, por exemplo, para Tregs intra- tumorais e não deve ser expresso em tecidos saudáveis. Além disso, o aumento da expressão do alvo em um determinado tecido tumoral pode apontar para o uso médico dessa indicação. Por exemplo, CCR8 também é expresso em linhagens de células tumorais de linfoma de células B e linfoma de células T.[00922] For therapeutic use of a given target in immuno-oncology, specific target expression is of utmost importance to minimize systemic side effects. The target must be specific to the target tissue or cells, for example, to intra-tumoral Tregs, and must not be expressed in healthy tissues. Furthermore, increased target expression in a given tumor tissue may point to the medical use of that indication. For example, CCR8 is also expressed in B-cell lymphoma and T-cell lymphoma tumor cell lines.
[00923] A remoção sistêmica de células Treg pode evocar e aumentar não apenas a imunidade tumoral, mas também a autoimunidade, como evidenciado por pacientes que sofrem de síndrome de desregu- lação imune-poliendocrinopatia-enteropatia-ligada ao X (IPEX). Nesta doença, os pacientes não apresentam Tregs devido a uma alteração genética e morrem nos primeiros 2 anos de vida devido à autoimuni- dade sistêmica se não forem tratados com imunossupressão apropriada. A alta especificidade de um alvo destinado à remoção ou supres-são de Tregs intratumorais é, portanto, considerada muito importante para evitar efeitos colaterais de um anticorpo terapêutico, como os observados para anticorpos direcionados a CCR4.Exemplo 11.1: Especificidade do alvo CCR8[00923] Systemic removal of Treg cells can evoke and enhance not only tumor immunity but also autoimmunity, as evidenced by patients suffering from X-linked polyendocrinopathy-enteropathy immune dysregulation syndrome (IPEX). In this disease, patients lack Tregs due to a genetic alteration and die within the first 2 years of life due to systemic autoimmunity if not treated with appropriate immunosuppression. The high specificity of a target intended for the removal or suppression of intratumoral Tregs is therefore considered very important to avoid side effects of a therapeutic antibody, such as those observed for antibodies targeting CCR4. Example 11.1: Specificity of the CCR8 target
[00924] Em uma primeira análise, os inventores avaliaram a expressão de mRNA de CCR8 em diferentes tecidos humanos e tipos de células. A expressão significativa de mRNA de CCR8 foi observada apenas em células T regulatórias ativadas, bem como em linfócitos infiltrantes de tumor (Fig. 35).[00924] In an initial analysis, the inventors evaluated CCR8 mRNA expression in different human tissues and cell types. Significant CCR8 mRNA expression was observed only in activated regulatory T cells, as well as in tumor-infiltrating lymphocytes (Fig. 35).
[00925] Em uma segunda análise, os inventores avaliaram a expressão de mRNA de CCR8 em 50 diferentes indicações de tumor. As indicações com maior expressão de CCR8 são, por exemplo, câncer de mama, adenocarcinoma de pulmão (ADC), câncer de testículo, câncer de estômago e carcinoma de células escamosas (CEC), neoplasias malignas de cabeça e pescoço, bem como tumores de esôfago, mas alta expressão também foi encontrada em câncer colorretal, ovário câncer e câncer do colo do útero. Em todas as indicações, ex- ceto adenocarcinoma pancreático e melanoma, constatou-se que a expressão era mais elevada no tumor em comparação com o tecido normal correspondente (Fig. 36).[00925] In a second analysis, the inventors evaluated CCR8 mRNA expression in 50 different tumor indications. The indications with the highest CCR8 expression are, for example, breast cancer, lung adenocarcinoma (ADC), testicular cancer, stomach cancer and squamous cell carcinoma (SCC), head and neck malignancies, as well as esophageal tumors, but high expression was also found in colorectal cancer, ovarian cancer and cervical cancer. In all indications, except pancreatic adenocarcinoma and melanoma, expression was found to be higher in the tumor compared to the corresponding normal tissue (Fig. 36).
[00926] Em uma terceira análise, os inventores avaliaram a coex- pressão de mRNA de CCR8 com mRNA de FOXP3 em várias indicações de tumor. A coexpressão com o marcador Treg FOXP3 é importante para demonstrar que CCR8 é de fato expresso principalmente em Tregs, conforme Tabela 11.1.1. As colorações de IHC confirmaram esses achados, veja a Fig. 37.Tabela 11.1.1: CCR8 e o marcador regulador de definição de células T FOXP3 são os genes mais correlacionados em todas as 9588 amostras de tumor TCGA (excluindo Timoma como indicação) apontando para esses genes sendo coexpressos no mesmo tipo de célula. A tabela mostra os 25 genes (de 35.021 genes) mais fortemente correlacionados com os níveis de expressão de mRNA de CCR8 e FOXP3 e seus respectivos coeficientes de correlação de Pearson, r. [00926] In a third analysis, the inventors evaluated the co-expression of CCR8 mRNA with FOXP3 mRNA in various tumor indications. Co-expression with the Treg marker FOXP3 is important to demonstrate that CCR8 is indeed primarily expressed in Tregs, as per Table 11.1.1. IHC staining confirmed these findings, see Fig. 37. Table 11.1.1: CCR8 and the T-cell defining regulatory marker FOXP3 are the most strongly correlated genes in all 9588 TCGA tumor samples (excluding Thymoma as an indication), pointing to these genes being co-expressed in the same cell type. The table shows the 25 genes (out of 35,021 genes) most strongly correlated with CCR8 and FOXP3 mRNA expression levels and their respective Pearson correlation coefficients, r.
[00927] Além disso, a correlação do mRNA de CCR8 com o marcador de células pan-T CD3, marcador de células T citotóxicas CD8, marcador de macrófagos MS4A7, marcador de inflamação geral IFNg e marcadores de células B CD19, CD20, CD22 foi avaliada para 50 indicações de tumor, conforme a Tabela 11.1.2. Interessantemente, para quase todas as indicações, a correlação foi altamente significativa, sugerindo aumento da expressão de CCR8 após a infiltração de células imunes no tumor per se, e infiltração de T reg em particular. A partir disso, pode-se esperar que a infiltração de células imunes e, em particular, a infiltração de células T sejam biomarcadores igualmente valiosos para estratificação de pacientes para identificar pacientes que são mais propensos se benificiar com a terapia anti-CCR8. Tabela 11.1.2: Coeficientes de correlação de Pearson, r, entre os níveis de mRNA log2 de CCR8 e marcador Treg FOXP3, marcador de células pan-T CD3, marcador de células T citotóxicas CD8, marcador de macrófagos MS4A7, marcador de inflamação geral IFNg ou marcadores de células B CD19, CD20, CD22. Os resultados sugerem uma co- expressão altamente significativa de CCR8 com células imunes e, em particular, infiltração de Treg em tumores em 48 das 50 indicações do TCGA. Portanto, pode-se esperar que, por exemplo, a infiltração de células T constitua um bio- marcador de estratificação valioso para identificar pacientes que provavelmente se beneficiam com a terapia anti- CCR8. Exemplo 11.2: Especificidade de CCR8 para Tregs intratumorais em comparação com células T efetoras[00927] Furthermore, the correlation of CCR8 mRNA with the pan-T cell marker CD3, cytotoxic T cell marker CD8, macrophage marker MS4A7, general inflammation marker IFNγ, and B cell markers CD19, CD20, CD22 was evaluated for 50 tumor indications, as shown in Table 11.1.2. Interestingly, for almost all indications, the correlation was highly significant, suggesting increased CCR8 expression following immune cell infiltration into the tumor per se, and T reg infiltration in particular. From this, it can be expected that immune cell infiltration, and in particular T cell infiltration, will be equally valuable biomarkers for patient stratification to identify patients who are more likely to benefit from anti-CCR8 therapy. Table 11.1.2: Pearson correlation coefficients, r, between CCR8 log2 mRNA levels and Treg marker FOXP3, pan-T cell marker CD3, cytotoxic T cell marker CD8, macrophage marker MS4A7, general inflammation marker IFNγ, or B cell markers CD19, CD20, CD22. The results suggest a highly significant co-expression of CCR8 with immune cells and, in particular, Treg infiltration in tumors in 48 of the 50 TCGA indications. Therefore, it can be expected that, for example, T cell infiltration will constitute a valuable stratification biomarker for identifying patients likely to benefit from anti-CCR8 therapy. Example 11.2: Specificity of CCR8 for intratumoral Tregs compared to effector T cells
[00928] Existem várias questões a serem consideradas com relação à depleção de Treg para imunoterapia de câncer em humanos. Células Tregs e T efetoras ativadas na maioria das vezes compartilham a expressão dos mesmos tipos de moléculas da superfície celular, incluindo CD25 e CTLA-4, dificultando a depleção seletiva de células Tregs sem afetar também as T efetoras por anticorpos específicos para essas moléculas.[00928] There are several issues to consider regarding Treg depletion for cancer immunotherapy in humans. Activated Tregs and T effector cells most often share the expression of the same types of cell surface molecules, including CD25 and CTLA-4, making selective depletion of Tregs without also affecting T effector cells by antibodies specific to these molecules difficult.
[00929] As células Treg Foxp3+CD25+CD4+ em tumores (Tregs infiltrantes tumorais ou intratumorais) expressam níveis mais altos de moléculas de superfície celular associadas à ativação de células T, como CD25, CTLA-4, PD-1, LAG3, TIGIT, ICOS, e membros da super- família de receptores de TNF, incluindo 4-1BB, OX-40 e GITR, em comparação com Tregs em tecidos linfoides ou não linfoides ou no sangue. Além disso, as Tregs infiltrantes de tumor expressam altos níveis de receptores específicos de quimiocinas, incluindo CCR4 e CCR8.[00929] Foxp3+CD25+CD4+ Treg cells in tumors (tumor-infiltrating or intratumoral Tregs) express higher levels of cell surface molecules associated with T cell activation, such as CD25, CTLA-4, PD-1, LAG3, TIGIT, ICOS, and members of the TNF receptor superfamily, including 4-1BB, OX-40, and GITR, compared to Tregs in lymphoid or non-lymphoid tissues or in the blood. Furthermore, tumor-infiltrating Tregs express high levels of specific chemokine receptors, including CCR4 and CCR8.
[00930] PBMCs CD4+ CD25+ classificadas e não classificadas foram ativadas com contas anti-CD3 e anti-CD28 + IL2 durante 6 dias. A análise FACS mostrou a expressão da proteína CCR8 preferenciale- mente em Tregs estimuladas (CD4+CD25+FoxP3+CD127dim), veja a Fig. 38. Alvos alternativos OX40, GITR e CD25, mas não CCR8, são significativamente expressos em células CD8+ Teff estimuladas e células T CD4+ (CD4+CD25+Foxp3-). CCR4 mostra uma expressão bastante específica de Treg, mas nenhuma especificidade de Treg intra- tumoral. Esses achados são consistentes com a observação de que os anticorpos CCR4 mostraram efeitos colaterais imunológicos, que foram atribuídos à depleção sistêmica de Tregs. Em termos de especificidade, CCR8 parece ser superior para suportar a depleção específica de Tregs intratumorais.[00930] Sorted and unsorted CD4+ CD25+ PBMCs were activated with anti-CD3 and anti-CD28 + IL2 beads for 6 days. FACS analysis showed preferential expression of the CCR8 protein on stimulated Tregs (CD4+CD25+FoxP3+CD127dim), see Fig. 38. Alternative targets OX40, GITR, and CD25, but not CCR8, are significantly expressed on stimulated CD8+ Teff cells and CD4+ T cells (CD4+CD25+Foxp3-). CCR4 shows fairly specific Treg expression, but no specificity for intratumoral Tregs. These findings are consistent with the observation that CCR4 antibodies have shown immunological side effects, which have been attributed to systemic Treg depletion. In terms of specificity, CCR8 appears to be superior in supporting specific intratumoral Treg depletion.
[00931] Para confirmar os resultados, os dados brutos de pacientes com NSCLC, CRC e câncer de fígado foram recuperados de Guo, Xinyi, et al. "Global characterization of T cells in non-small-cell lung cancer by single-cell sequencing." Nature medicine 24.7 (2018): 978985, Zhang, Yuanyuan, et al. "Deep single-cell RNA sequencing data of individual T cells from treatment-naive colorectal cancer patients." Scientific data 6.1 (2019): 1-15, e Zheng, Chunhong, et al. "Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by single-cell sequencing." Cell 169.7 (2017): 1342-1356, respectivamente e usados para análise da especificidade de CCR8, veja a Fig 39. De fato, para esses tumores, a expressão de mRNA de CCR8 é amplamente restrita a células T regulatórias (caixas cinza-claro) que residem no tecido tumoral, enquanto em grande parte está ausente em células T regulatórias de tecidos normais, bem como de células T citotóxicas CD4 auxiliares e CD8 (médias e caixas cinza escuro, respectivamente).[00931] To confirm the results, raw data from patients with NSCLC, CRC, and liver cancer were retrieved from Guo, Xinyi, et al. "Global characterization of T cells in non-small-cell lung cancer by single-cell sequencing." Nature medicine 24.7 (2018): 978-985, Zhang, Yuanyuan, et al. "Deep single-cell RNA sequencing data of individual T cells from treatment-naive colorectal cancer patients." Scientific data 6.1 (2019): 1-15, and Zheng, Chunhong, et al. "Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by single-cell sequencing." Cell 169.7 (2017): 1342-1356, respectively, and used for analysis of CCR8 specificity, see Fig 39. In fact, for these tumors, CCR8 mRNA expression is largely restricted to regulatory T cells (light gray boxes) residing in tumor tissue, while it is largely absent in regulatory T cells from normal tissues, as well as from CD4 helper and CD8 cytotoxic T cells (medium and dark gray boxes, respectively).
[00932] A análise FACS de amostras de lisado de tumor humano confirmou que a proteína CCR8 é expressa especificamente em Tregs infiltrantes de tumor humano em câncer de pulmão de não pequenas células (NSCLC), carcinoma colorretal (CRC), carcinoma de células renais (RCC) e linfonodos (LNs, dados não mostrados), Fig. 40. Até 90% das Tregs infiltradas por tumor são positivas para CCR8, por exemplo, em NSCLC, 40 a 90% em estágio III+ e 40 a 70% em estágio I/II, em CRC 20 a 40% em estágio III+ e em RCC 40 a 50% no estágio III+. Com base nesses dados, supõe-se que a estratificação de acordo com o estadiamento leve a um benefício adicional para pacientes tratados com um anticorpo anti-CCR8.Exemplo 12: Experimentos in vivoExemplo 12.1.1: Anticorpos substitutos e modelos de tumor sin- gênico[00932] FACS analysis of human tumor lysate samples confirmed that the CCR8 protein is specifically expressed in human tumor-infiltrating Tregs in non-small cell lung cancer (NSCLC), colorectal carcinoma (CRC), renal cell carcinoma (RCC), and lymph nodes (LNs, data not shown), Fig. 40. Up to 90% of tumor-infiltrated Tregs are positive for CCR8, for example, in NSCLC, 40 to 90% in stage III+ and 40 to 70% in stage I/II, in CRC 20 to 40% in stage III+ and in RCC 40 to 50% in stage III+. Based on these data, it is assumed that stratification according to staging leads to an additional benefit for patients treated with an anti-CCR8 antibody. Example 12: In vivo experiments Example 12.1.1: Surrogate antibodies and syngene tumor models
[00933] Em experimentos com camundongos, anticorpos substitutos que se ligam ao CCR8 de camundongo foram usados para demonstrar a eficácia antitumoral e para caracterizar o modo de ação, isto é, depleção de Treg dentro do tumor dependendo da potência de ADCC (citotoxicidade celular dependente de anticorpos) e ADCP (fa- gocitose celular dependente de anticorpos).Tabela 12.1.1.1: Lista de anticorpos CCR8 anticamundongo substitutos usados para estudos in vivo. A ADCC foi determinada usando células HEK293 superexpressando CCR8 de murino como células alvo e células NK92 como células efetoras. A atividade ADCC é medida pela liberação de lactato desidrogenase (LDH). [00933] In mouse experiments, surrogate antibodies that bind to mouse CCR8 were used to demonstrate antitumor efficacy and to characterize the mode of action, i.e., Treg depletion within the tumor depending on the potency of ADCC (antibody-dependent cellular cytotoxicity) and ADCP (antibody-dependent cellular phagocytosis). Table 12.1.1.1: List of mouse CCR8 surrogate antibodies used for in vivo studies. ADCC was determined using murine CCR8-overexpressing HEK293 cells as target cells and NK92 cells as effector cells. ADCC activity is measured by lactate dehydrogenase (LDH) release.
[00934] O anticorpo CCR8 antimurino TPP-14099 liga-se às célulasCHO que expressam CCR8 de murino com uma EC50 de 3 nM e iTregs murinos com uma EC50 de 13,2 nM, conforme determinado por FACS (dados não mostrados).[00934] The anti-murine CCR8 antibody TPP-14099 binds to murine CCR8-expressing CHO cells with an EC50 of 3 nM and murine iTregs with an EC50 of 13.2 nM, as determined by FACS (data not shown).
[00935] Diferentes modelos de tumores singênicos foram usados para modelar tumores com alto grau de infiltração imune, bem como tumores com baixo grau de infiltração de células imunes. Além disso, os modelos usados divergem em suas respostas ao tratamento com inibidores de ponto de verificação conhecidos, por exemplo, tratamento com anticorpos anti-CTLA4, anti-PD1 ou anti-PD-L1. Uma visão geral dos modelos de tumor testados com os dados de eficácia para o respectivo anticorpo anti-CCR8 inventivo é mostrada na Tabela 12.1.1.2. Notavelmente, a eficácia foi demonstrada em vários modelos de tumores singênicos.[00935] Different syngeneic tumor models were used to model tumors with a high degree of immune infiltration, as well as tumors with a low degree of immune cell infiltration. Furthermore, the models used diverge in their responses to treatment with known checkpoint inhibitors, for example, treatment with anti-CTLA4, anti-PD1, or anti-PD-L1 antibodies. An overview of the tumor models tested with efficacy data for the respective inventive anti-CCR8 antibody is shown in Table 12.1.1.2. Notably, efficacy was demonstrated in several syngeneic tumor models.
[00936] Em suma, uma suspensão contendo geralmente 500.000 a 1.000.000 células tumorais por 100 μl de PBS, meio ou uma mistura de 50% de Matrigel foi injetada subcutaneamente no flanco de camundongos imunocompetentes fêmeas (por exemplo, Balb/c, C57Bl6). Em tamanhos de tumor palpáveis de cerca de 60-100 mm 3 (geralmente 100 mm3) a administração do anticorpo CCR8 começou por injecção intraperitoneal de tipicamente 10 mg/kg em um volume de 5 a 10 ml/kg. Em estudos de titulação de dose foram testadas doses mais baixas. Anticorpos não ligantes do respectivo isotipo serviram como controle. Os grupos compreenderam n = 10 camundongos. A terapia foi aplicada duas vezes por semana, tipicamente como um cronogra- ma de q3/4d, e o tamanho do tumor e o peso corporal foram medidos três vezes por semana. Os dados de crescimento do tumor são plota- dos como volume médio ao longo do tempo.[00936] In summary, a suspension containing generally 500,000 to 1,000,000 tumor cells per 100 μl of PBS, medium, or a 50% Matrigel mixture was injected subcutaneously into the flank of immunocompetent female mice (e.g., Balb/c, C57Bl6). At palpable tumor sizes of approximately 60–100 mm³ (generally 100 mm³), CCR8 antibody administration began with intraperitoneal injection of typically 10 mg/kg in a volume of 5–10 ml/kg. Lower doses were tested in dose titration studies. Non-binding antibodies of the respective isotype served as controls. Groups comprised n = 10 mice. Therapy was applied twice weekly, typically on a q3/4d schedule, and tumor size and body weight were measured three times weekly. Tumor growth data are plotted as average volume over time.
[00937] Amostras de tumor e tecido foram retiradas de animais satélites tratados de forma idêntica (n = 5 por grupo) 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo e foram analisadas por citometria de fluxo após dissociação em células únicas e lise de eritrócitos com foco particular em alterações em números absolutos de Células T (Tregs) por 100 mg de tecido. Os marcadores usados para determinar as Tregs ativadas foram CD45+CD4+CD25+FoxP3+. Outros marcadores FACS incluíram CD8, NKp46, 4-1BB, F4/80, CD11c, Gr1 e MHCII.Tabela 12.1.1.2: Visão geral de diferentes modelos de tumor com parâmetros para caracterizar o resultado do tratamento. A eficácia foi medida por depleção de Treg, taxa de resposta global e relação tumor- controle com base nos volumes tumorais finais de anticorpos substitutos anti-CCR8 em modelos de tumor de camundongo singênico. 1 A depleção de Treg foi calculada como a diferença percentual entre as Tregs intratumorais no controle do isotipo e as Tregs intratumorais em tumores tratados com o anticorpo terapêutico. 2 A taxa de resposta geral (ORR) e a resposta completa (CR) são baseadas em uma adaptação dos critérios RECIST ao crescimento rápido do tumor em um modelo de camundongo (CR: respondedor completo (<10% do volume inicial do tumor); PR: respondedor parcial (máximo 300% do volume inicial do tumor); NR: não respondedor (>300% do volume inicial do tumor)). 3 T/C refere-se ao volume do tumor de tratamento/volume do tumor de controle no final do estudo. nd: não determinado. 4Médias de vários estudos neste modelo de tumor. [00937] Tumor and tissue samples were taken from identically treated satellite animals (n = 5 per group) 24 hours after the second antibody treatment and were analyzed by flow cytometry after single-cell dissociation and erythrocyte lysis with particular focus on changes in absolute numbers of T cells (Tregs) per 100 mg of tissue. The markers used to determine activated Tregs were CD45+CD4+CD25+FoxP3+. Other FACS markers included CD8, NKp46, 4-1BB, F4/80, CD11c, Gr1, and MHCII. Table 12.1.1.2: Overview of different tumor models with parameters to characterize treatment outcome. Efficacy was measured by Treg depletion, overall response rate, and tumor-control ratio based on final tumor volumes of anti-CCR8 surrogate antibodies in syngeneic mouse tumor models. 1 Treg depletion was calculated as the percentage difference between intratumoral Tregs in the isotype control and intratumoral Tregs in tumors treated with the therapeutic antibody. 2 Overall response rate (ORR) and complete response (CR) are based on an adaptation of the RECIST criteria to rapid tumor growth in a mouse model (CR: complete responder (<10% of initial tumor volume); PR: partial responder (maximum 300% of initial tumor volume); NR: non-responder (>300% of initial tumor volume)). 3 T/C refers to the treatment tumor volume/control tumor volume at the end of the study. nd: not determined. 4 Averages from several studies in this tumor model.
[00938] Para cada modelo de tumor de camundongo singênico, 10 tumores tanto no grupo de controle de isotipo quanto no grupo de tratamento anti-CCR8 foram coletados no final do ciclo de tratamento, 24h após o último tratamento (tratamento quinzenal até que os tumores em qualquer grupo atingissem um volume médio de 3000 mm3) e a expressão de mRNA em todo o genoma foi medida por meio de RNA- seq. Dos 17 modelos avaliados por meio de RNA-seq 13, os modelos mostraram níveis elevados de mRNA de CD8 no grupo de tratamento anti-CCR8 em comparação com o grupo de controle com alterações de dobra conforme mostrado na Tabela 12.1.1.3. Para os modelos CT26, H22, RM1, MBT2 e Hepa1-6, o aumento nos níveis de CD8 foi significativo de acordo com uma estatística de teste T indicando aumentos significativos na infiltração de células T citotóxicas no final do ciclo de tratamento. Esses dados sugerem fortemente que as células CD8+ estavam envolvidas na efetivação da resposta tumoral. Tabela 12.1.1.3 : Alterações nos níveis de mRNA de CD8 induzidaspelo tratamento anti-CCR8.Exemplo 12.1.2: Caracterização de modelo singênico para identificação de biomarcadores[00938] For each syngeneic mouse tumor model, 10 tumors from both the isotype control group and the anti-CCR8 treatment group were collected at the end of the treatment cycle, 24h after the last treatment (biweekly treatment until tumors in either group reached a mean volume of 3000 mm3), and genome-wide mRNA expression was measured using RNA-seq. Of the 17 models evaluated using RNA-seq 13, the models showed elevated CD8 mRNA levels in the anti-CCR8 treatment group compared to the control group with fold alterations as shown in Table 12.1.1.3. For the CT26, H22, RM1, MBT2, and Hepa1-6 models, the increase in CD8 levels was significant according to a T-test statistic indicating significant increases in cytotoxic T cell infiltration at the end of the treatment cycle. These data strongly suggest that CD8+ cells were involved in enforcing the tumor response. Table 12.1.1.3: Changes in CD8 mRNA levels induced by anti-CCR8 treatment. Example 12.1.2: Characterization of a syngeneic model for biomarker identification
[00939] Com base nos dados RNA-seq de todo o genoma de tumores precoces dos modelos singênicos, os níveis aumentados dos seguintes genes foram fortemente correlacionados com a resposta do tumor: Eif3j2, Eno1b, Ifi44l, Hist1h2al, Ifi202b, Hmga1b, Amd2, Sycp1, Itln1, Trim34b, Catsperg2, Zfp868, Serpina1b, Prss41, C1rb, Cyld, Ccnb1ip1, Masp2, Acaa1b, C4a, Snord93, Abhd1, Serpina3h, H2-K2, Cd1d2, Hal, Rnf151, Rbm46, Arg2, Mir8099-2, Igsf21, Olfr373, C1s2, Crym, Arv1, Hddc3, Plppr4, Ppp1r11, Rps3a2, Zfp459, Rnd1, Serpi- na1a, Vcpkmt, Atp10d, Gbp2b, H2-T24, Tlcd2, Ctse, H2-Q10, Cyp2c55, Borcs8, Tpsab1,Trim43b, Cc2d1a, Serpina1d, Cacna1a, Kcnj14, Ttc13, Farsa, Olfr1217, Jaml, H2-Bl, Tnpo2, Rims3, Dock9, Car5b, Atp1a4, H2-Q1, Zfp69, Slpi, Pcdhgb8, Ocel1, Selenbp2, Nsd3, Wt1, Nap1l2, Ranbp9, Gtpbp3, AY761185, Rnaset2a, Serpina3i, Ell2, Gal3st2b, Urb2, F12, Klk1, Ifi214, Cstl1, Agtpbp1, Msh5, Cox18, Zfp330, Ttc37, Klk4, H2-Q5, Cxcl11, Rab39, Pm20d1, Nod2, H2- DMb2. Interessantemente, este conjunto é altamente enriquecido para fatores precoces do complemento, fatores reguladores do complemento, tais como Serpinas e componentes do MHC. Esses marcadores ou uma combinação dos mesmos podem ser usados para estratificação ou para prever ou monitorar a resposta do tumor. Em particular, a presença de altos níveis de Complemento C1/C4 pode contribuir para a lise de Treg. Quando a depleção/consumo de fatores do complemento reduz a eficácia da depleção de Treg, a suplementação do sistema de complemento, por exemplo, em um tratamento combinado, pode ser uma opção.[00939] Based on genome-wide RNA-seq data from early tumors in syngeneic models, increased levels of the following genes were strongly correlated with tumor response: Eif3j2, Eno1b, Ifi44l, Hist1h2al, Ifi202b, Hmga1b, Amd2, Sycp1, Itln1, Trim34b, Catsperg2, Zfp868, Serpina1b, Prss41, C1rb, Cyld, Ccnb1ip1, Masp2, Acaa1b, C4a, Snord93, Abhd1, Serpina3h, H2-K2, Cd1d2, Hal, Rnf151, Rbm46, Arg2, Mir8099-2, Igsf21, Olfr373, C1s2, Crym, Arv1, Hddc3, Plppr4, Ppp1r11, Rps3a2, Zfp459, Rnd1, Serpina1a, Vcpkmt, Atp10d, Gbp2b, H2-T24, Tlcd2, Ctse, H2-Q10, Cyp2c55, Borcs8, Tpsab1, Trim43b, Cc2d1a, Serpina1d, Cacna1a, Kcnj14, Ttc13, Farsa, Olfr1217, Jaml, H2-Bl, Tnpo2, Rims3, Dock9, Car5b, Atp1a4, H2-Q1, Zfp69, Slpi, Pcdhgb8, Ocel1, Selenbp2, Nsd3, Wt1, Nap1l2, Ranbp9, Gtpbp3, AY761185, Rnaset2a, Serpina3i, Ell2, Gal3st2b, Urb2, F12, Klk1, Ifi214, Cstl1, Agtpbp1, Msh5, Cox18, Zfp330, Ttc37, Klk4, H2-Q5, Cxcl11, Rab39, Pm20d1, Nod2, H2-DMb2. Interestingly, this set is highly enriched for early complement factors, complement regulatory factors such as Serpins, and MHC components. These markers, or a combination thereof, can be used for stratification or to predict or monitor tumor response. In particular, the presence of high levels of Complement C1/C4 may contribute to Treg lysis. When depletion/consumption of complement factors reduces the effectiveness of Treg depletion, supplementation of the complement system, for example, in a combination therapy, may be an option.
[00940] Os diferentes modelos singênicos foram também caracterizados em relação ao número absoluto de subconjuntos de células imunes e frequência dentro das células imunes CD45+ totais nos tumores. Para os modelos analisados por citometria de fluxo (Tabela 12.1.2.1), B16F10 é caracterizado pelo menor número de células imunes - e apresentou a menor redução no volume tumoral, conforme a Tabela 12.1.2.1. Desse modo, a infiltração de células imunes pode ser usada para estratificação para prever a resposta ao tratamento com anticorpos CCR8. Esta hipótese poderia ser posteriormente confirmada usando B16Bl6.Tabela 12.1.2.1: Caracterização do microambiente tumoral por números absolutos de subconjuntos de células imunes e frequência no total de células imunes CD45+ nos tumores do grupo de veículo analisado em um ponto de tempo inicial (24 horas após o segundo tratamento). T/C vol descreve a relação do volume do tumor do grupo tratado com anticorpo CCR8 (10 mg/kg duas vezes por semana) versus grupo con- trole no final do estudo.Exemplo 12.2: Eficácia em camundongos que transportam tumorCT26[00940] The different syngeneic models were also characterized in relation to the absolute number of immune cell subsets and frequency within the total CD45+ immune cells in the tumors. For the models analyzed by flow cytometry (Table 12.1.2.1), B16F10 is characterized by the lowest number of immune cells - and showed the smallest reduction in tumor volume, as shown in Table 12.1.2.1. Thus, immune cell infiltration can be used for stratification to predict the response to treatment with CCR8 antibodies. This hypothesis could be subsequently confirmed using B16Bl6. Table 12.1.2.1: Characterization of the tumor microenvironment by absolute numbers of immune cell subsets and frequency in the total CD45+ immune cells in the tumors of the vehicle group analyzed at an initial time point (24 hours after the second treatment). T/C vol describes the ratio of tumor volume in the group treated with CCR8 antibody (10 mg/kg twice weekly) versus the control group at the end of the study. Example 12.2: Efficacy in tumor-carrying mice CT26
[00941] O tratamento com anticorpos anti-CCR8 TPP-15285 e TPP- 15286 mostrou forte eficácia antitumoral em camundongos que transportam tumor CT26 (Fig. 41). TPP-15285 mostrou eficácia reduzida na dose mais baixa de 0,1 mg/kg, outras diferenças dependentes da dose não foram significativas. Como esperado, um anticorpo anti-PD-L1 ("PDL1") demonstrou eficácia média no modelo. Os anticorpos não ligantes dos respectivos isotipos não mostraram eficácia.[00941] Treatment with anti-CCR8 antibodies TPP-15285 and TPP-15286 showed strong antitumor efficacy in mice carrying CT26 tumor (Fig. 41). TPP-15285 showed reduced efficacy at the lowest dose of 0.1 mg/kg; other dose-dependent differences were not significant. As expected, an anti-PD-L1 ("PDL1") antibody demonstrated moderate efficacy in the model. Non-binding antibodies of the respective isotypes showed no efficacy.
[00942] Os gráficos aranha (crescimento tumoral de camundongos individuais ao longo do tempo) dos grupos de tratamento correspondentes (Fig. 42) demonstraram claramente eficácia homogeneamente forte com respostas completas ocorrendo em todos os grupos de dose com ambos os anticorpos anti-CCR8.[00942] The spider plots (tumor growth of individual mice over time) of the corresponding treatment groups (Fig. 42) clearly demonstrated homogeneously strong efficacy with complete responses occurring in all dose groups with both anti-CCR8 antibodies.
[00943] A análise de Tregs de amostras de tumor CT26 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo por citometria de fluxo mostrou números fortemente reduzidos de Tregs no grupo tratado com anticorpo anti-CCR8 versus o grupo de controle de isotipo. A depleção de Treg foi claramente dependente da dose no caso de TPP-15285 (Fig. 43).Tabela 12.2.1: Dados correspondentes da Fig. 43.Exemplo 12.3: Estudos de modo de açãoExemplo 12.3.1: Estudos de modo de ação de ADCC/ADCP em camundongos que transportam tumor CT26[00943] Analysis of Tregs from CT26 tumor samples 24 hours after the second antibody treatment by flow cytometry showed strongly reduced numbers of Tregs in the anti-CCR8 antibody-treated group versus the isotype control group. Treg depletion was clearly dose-dependent in the case of TPP-15285 (Fig. 43). Table 12.2.1: Corresponding data from Fig. 43. Example 12.3: Mode of action studies Example 12.3.1: Mode of action studies of ADCC/ADCP in CT26 tumor-carrying mice
[00944] Anticorpos aglicosilados, que podem ser produzidos em hospedeiros procarióticos, mostram afinidade de ligação ao antígeno quase idêntica, estabilidade em uma temperatura fisiológica e persistência no soro in vivo em comparação com contrapartes glicosiladas. No entanto, a ausência de glicanos ligados a N anula quase toda a afinidade de ligação a FCYR e funções efetoras imunes que são essenciais para limpar células alvo opsonizadas por anticorpos por meio de ADCC ou ADCP. Para fornecer evidências para o modo de ação ba-seado em ADCC/ADCP, versões aglicosiladas dos anticorpos foram geradas como um controle negativo.[00944] Aglycosylated antibodies, which can be produced in prokaryotic hosts, show nearly identical antigen-binding affinity, stability at physiological temperature, and persistence in serum in vivo compared to glycosylated counterparts. However, the absence of N-linked glycans negates almost all FCYR-binding affinity and immune effector functions that are essential for clearing antibody-opsonized target cells via ADCC or ADCP. To provide evidence for the ADCC/ADCP-based mode of action, aglycosylated versions of the antibodies were generated as a negative control.
[00945] TPP-18208 e TPP-18209 são versões IgG1 humanas agli-cosiladas de anticorpos substitutos anti-CCR8 e são incapazes de se ligar às células efetoras, como células NK e/ou macrófagos, através de receptores Fc-gama. Esses anticorpos foram testados quanto à eficácia antitumoral em camundongos que transportam tumor CT26 e foram comparados com as respectivas contrapartes de tipo selva- gem/glicosiladas compreendendo a mesma sequência (TPP-14095, TPP-14099). Além disso, os anticorpos anti-CCR8 TPP-15285 e TPP- 15286 (glicosilado, isotipo mIgG2) foram incluídos no estudo.[00945] TPP-18208 and TPP-18209 are glycosylated human IgG1 versions of anti-CCR8 surrogate antibodies and are unable to bind to effector cells, such as NK cells and/or macrophages, via Fc-gamma receptors. These antibodies were tested for antitumor efficacy in mice carrying CT26 tumor and were compared with their respective wild-type/glycosylated counterparts comprising the same sequence (TPP-14095, TPP-14099). In addition, the anti-CCR8 antibodies TPP-15285 and TPP-15286 (glycosylated, mIgG2 isotype) were included in the study.
[00946] Os anticorpos de tipo selvagem mostraram uma forte eficácia antitumoral, enquanto os anticorpos aglicosilados não mostraram qualquer eficácia em comparação com o controle de isotipo (Fig. 44). Os gráficos aranha ilustram os resultados para camundongos individuais em cada grupo de tratamento (Fig. 45). Consequentemente, a análise de tumor ex vivo por citometria de fluxo demonstrou depleção de Treg apenas após tratamento com os anticorpos de tipo selvagem (gli- cosilados), enquanto os anticorpos aglicosilados não mostraram de- pleção de Treg em comparação com o respectivo controle de isotipo sem ligação (Fig. 46).[00946] Wild-type antibodies showed strong antitumor efficacy, while aglycosylated antibodies showed no efficacy compared to the isotype control (Fig. 44). Spider plots illustrate the results for individual mice in each treatment group (Fig. 45). Consequently, ex vivo tumor analysis by flow cytometry demonstrated Treg depletion only after treatment with wild-type (glycosylated) antibodies, while aglycosylated antibodies showed no Treg depletion compared to the respective unbound isotype control (Fig. 46).
[00947] Esses resultados confirmaram ADCC e/ou ADCP como modo de ação predominante para depleção de Treg por anticorpos an- ti-CCR8 em tumores CT26.Exemplo 12.3.2: Envolvimento de células B ou células T e impacto da depleção de células CD8+ ou depleção de células CD19+ na eficácia antitumoral de anticorpos anti-CCR8[00947] These results confirmed ADCC and/or ADCP as the predominant mode of action for Treg depletion by anti-CCR8 antibodies in CT26 tumors.Example 12.3.2: Involvement of B cells or T cells and impact of CD8+ cell depletion or CD19+ cell depletion on the antitumor efficacy of anti-CCR8 antibodies
[00948] Para testar a relevância da presença de células T CD8+ infiltrantes de tumor ou células B CD19+ na eficácia antitumoral de anticorpos anti-CCR8, os inventores usaram camundongos C57BL6 geneticamente modificados que expressam o receptor da toxina da difteria (DTR) sob o controle do promotor Cd8a+ específico da linhagem ou do promotor Cd19+ específico da linhagem. Após a injeção de toxina da difteria (DT), células T CD8+ ou células B CD19+ foram quantitativamente esgotadas tanto do sangue dos camundongos (dados não mostrados) quanto de tumores MC38 singênicos transportados subcu- taneamente (Tabela 12.3.2.1).[00948] To test the relevance of the presence of tumor-infiltrating CD8+ T cells or CD19+ B cells on the antitumor efficacy of anti-CCR8 antibodies, the inventors used genetically modified C57BL6 mice expressing the diphtheria toxin receptor (DTR) under the control of the lineage-specific Cd8a+ promoter or the lineage-specific Cd19+ promoter. After diphtheria toxin (DT) injection, CD8+ T cells or CD19+ B cells were quantitatively depleted from both mouse blood (data not shown) and subcutaneously transported syngeneic MC38 tumors (Table 12.3.2.1).
[00949] Como esperado, a depleção de células T CD8+ anulou completamente o efeito antitumoral do tratamento anti-CCR8, resultando em crescimento tumoral idêntico ao do grupo de controle do iso- tipo (Fig. 87). Estes resultados confirmaram a dependência da eficácia antitumoral dos anticorpos anti-CCR8 inventivos na presença de células T CD8+.[00949] As expected, depletion of CD8+ T cells completely negated the antitumor effect of the anti-CCR8 treatment, resulting in tumor growth identical to that of the isotype control group (Fig. 87). These results confirmed the dependence of the antitumor efficacy of the inventive anti-CCR8 antibodies on the presence of CD8+ T cells.
[00950] Ao contrário, e muito surpreendentemente, a depleção de células B CD19+ aumentou significativamente a eficácia de TPP15285 (Fig. 88), resultando em uma redução da relação T/C de 0,35 para 0,16 (valor p do teste T = 0,032). A combinação do tratamento anti- CCR8 com depleção de células B ou agentes de depleção de células B, como anticorpos anti-CD19 ou anticorpos anti-CD20, tal como Rituximab, é, portanto, sugerida para melhorar ainda mais o tratamento do câncer na clínica. Tabela 12.3.2.1: Depleção da expressão de CD8a e CD19 em camundongos DTR tratados com toxina da difteria.Tabela 12.3.2.2: Grupos de tratamento para avaliar a influência da de- pleção de células B CD19+ ou depleção de células T CD8+.Exemplo 12.3.3: Curso de tempo de aumento das relações CD8/FOXP3 em camundongos que transportam tumor singênico CT26[00950] Conversely, and very surprisingly, CD19+ B cell depletion significantly increased the efficacy of TPP15285 (Fig. 88), resulting in a reduction of the T/C ratio from 0.35 to 0.16 (T-test p-value = 0.032). The combination of anti-CCR8 treatment with B cell depletion or B cell depleting agents, such as anti-CD19 antibodies or anti-CD20 antibodies, such as Rituximab, is therefore suggested to further improve cancer treatment in the clinic. Table 12.3.2.1: Depletion of CD8a and CD19 expression in DTR mice treated with diphtheria toxin. Table 12.3.2.2: Treatment groups to evaluate the influence of CD19+ B cell depletion or CD8+ T cell depletion. Example 12.3.3: Time course of increasing CD8/FOXP3 ratios in mice carrying the CT26 syngeneic tumor
[00951] Para obter alguns insights mecanicistas sobre os níveis de células imunes, os níveis de mRNA de CD8 e FOXP3 foram monitorados em camundongos que transportam tumor singênico CT26 tratados com TPP15285 ou controle de isotipo. 10 tumores foram coletados para análise de RNA-seq diretamente antes da administração da primeira dose, bem como 12h, 24h, 36h, 48h, 72h após a administração da primeira dose. Similarmente, os tumores foram coletados 24h após a administração de uma segunda, terceira e quarta doses de TPP15285. Todos os tumores foram submetidos a análise de RNA-seq para medir os níveis de mRNA de Foxp3, CD8a e CD8b1 de murino. As relações das relações médias de Cd8a e Cd8b1 para Fopx3 foram calculadas e a significância das diferenças nas relações entre os grupos de controle e tratados com TPP15285 foi calculada por meio de um teste T.[00951] To gain some mechanistic insights into immune cell levels, CD8 and FOXP3 mRNA levels were monitored in mice carrying CT26 syngeneic tumors treated with TPP15285 or isotype control. Ten tumors were collected for RNA-seq analysis directly before the first dose administration, as well as 12h, 24h, 36h, 48h, and 72h after the first dose administration. Similarly, tumors were collected 24h after the administration of a second, third, and fourth dose of TPP15285. All tumors underwent RNA-seq analysis to measure murine Foxp3, CD8a, and CD8b1 mRNA levels. The mean ratios of Cd8a and Cd8b1 to Fopx3 were calculated, and the significance of the differences in ratios between the control and TPP15285-treated groups was assessed using a t-test.
[00952] As relações de mRNA de CD8 para FOXP3 variaram entre um valor de 0,9 e um valor de cerca de 2,0 no controle do isotipo e os primeiros pontos de tempo após o tratamento com TPP15285, mas depois aumentaram significativamente nos grupos TPP15285 para valores de 5,8, 3,9 e 4,4 em 72 h após a 1a dose, 24 h após a 2a dose e 24 h após a 3a dose, respectivamente, demonstrando depleção significativa de células T regulatórias por TPP15285. As relações caíram para um valor de 2,6 24 h após a administração da 4a dose.Tabela 12.3.3.1: relação de CD8/FOXP3 dos níveis de mRNA medidos em diferentes pontos de tempo após a administração de TPP15285 ou controle de isotipo.Exemplo 12.4: Eficácia do anticorpo CCR8 TPP-15285 em camun- dongos que transportam tumor EMT6Exemplo 12.4.1: Eficácia do anticorpo CCR8 TPP-15285 em camundongos que transportam tumor EMT6 - dosagem diferente[00952] CD8 to FOXP3 mRNA ratios ranged from 0.9 to approximately 2.0 in the isotype control and early time points after TPP15285 treatment, but then significantly increased in the TPP15285 groups to values of 5.8, 3.9, and 4.4 at 72 h after the 1st dose, 24 h after the 2nd dose, and 24 h after the 3rd dose, respectively, demonstrating significant depletion of regulatory T cells by TPP15285. The ratios fell to a value of 2.6 24 h after the 4th dose administration. Table 12.3.3.1: CD8/FOXP3 ratio of mRNA levels measured at different time points after TPP15285 administration or isotype control. Example 12.4: Efficacy of the CCR8 TPP-15285 antibody in mice carrying the EMT6 tumor. Example 12.4.1: Efficacy of the CCR8 TPP-15285 antibody in mice carrying the EMT6 tumor - different dosage.
[00953] O anticorpo anti-CCR8 substituto TPP-15285 mostrou eficácia dependente da dose em camundongos que transportam tumor EMT6 com o efeito mais forte no grupo de dose de 10 mg/kg. Para esta dose, TPP-15285 teve uma eficácia superior em relação ao anticorpo anti-CTLA4 (Fig. 47, Fig. 48). A eficácia forte foi também observada no grupo de dose de 1 mg/kg, enquanto os grupos de dose de 0,1 e 0,01 mg/kg quase não mostraram eficácia. Gráficos aranha ilustram esses resultados em um nível de camundongo individual (Fig. 49).[00953] The surrogate anti-CCR8 antibody TPP-15285 showed dose-dependent efficacy in EMT6 tumor-carrying mice, with the strongest effect in the 10 mg/kg dose group. At this dose, TPP-15285 had superior efficacy compared to the anti-CTLA4 antibody (Fig. 47, Fig. 48). Strong efficacy was also observed in the 1 mg/kg dose group, while the 0.1 and 0.01 mg/kg dose groups showed almost no efficacy. Spider plots illustrate these results at an individual mouse level (Fig. 49).
[00954] A análise de Tregs de amostras de tumor EMT6 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo por citometria de fluxo mostrou números fortemente reduzidos de Tregs no anticorpo anti-CCR8 tratado versus o grupo controle de isotipo. A depleção de Treg foi cla-ramente dependente da dose (Fig. 50). Também foi observada deple- ção de Treg para anti-CTLA4, como descrito anteriormente na literatura. Adicionalmente, foi demonstrado um forte aumento de células T CD8+ nos tumores amostrados no final do estudo para os grupos de dose eficaz de 10 mg/kg e 1 mg/kg de TPP-15285, bem como para anti-CTLA4 (Fig. 51). Outras alterações das populações de células imunes são mostradas na Tabela 12.4.1.1 e na Tabela 12.4.1.2. Tabela 12.4.1.1: Porcentagem relativa de populações de células imunes determinadas por análise FACS de células imunes 24 horas após o segundo tratamento de camundongos que transportam tumor EMT6 com diferentes doses de anticorpo CCR8 TPP-15285, ou no final do estudo. Tabela 1 2.4.1.2: Porcentagem rela tiva de Tregs, relação CD8:T Preg ourelação CD4conv:Treg determinada por análise FACS de células imunes 24 horas após o segundo tratamento de camundongos que transportam tumor EMT6 com diferentes doses de anticorpo CCR8 TPP- 15285, ou no final do estudo.cExemplo 12.4.2: Eficácia do anticorpo CCR8 TPP-15285 em camundongos que transportam tumor EMT6 - dosagem única ou múltipla[00954] Analysis of Tregs from EMT6 tumor samples 24 hours after the second antibody treatment by flow cytometry showed strongly reduced numbers of Tregs in the anti-CCR8 antibody-treated group versus the isotype control group. Treg depletion was clearly dose-dependent (Fig. 50). Treg depletion was also observed for anti-CTLA4, as previously described in the literature. Additionally, a strong increase in CD8+ T cells was demonstrated in the tumors sampled at the end of the study for the effective dose groups of 10 mg/kg and 1 mg/kg of TPP-15285, as well as for anti-CTLA4 (Fig. 51). Other changes in immune cell populations are shown in Table 12.4.1.1 and Table 12.4.1.2. Table 12.4.1.1: Relative percentage of immune cell populations determined by FACS analysis of immune cells 24 hours after the second treatment of EMT6 tumor-carrying mice with different doses of CCR8 TPP-15285 antibody, or at the end of the study. Table 1 2.4.1.2: Relative percentage of Tregs, CD8:T Preg ratio or CD4conv:Treg ratio determined by FACS analysis of immune cells 24 hours after the second treatment of EMT6 tumor-carrying mice with different doses of CCR8 TPP-15285 antibody, or at the end of the study. Example 12.4.2: Efficacy of CCR8 TPP-15285 antibody in EMT6 tumor-carrying mice - single or multiple dosing
[00955] O modelo de câncer de mama murino EMT-6 foi usado com TPP-15285 para testar o impacto de dosagem única versus dosagem múltipla. Quatro esquemas de tratamento diferentes foram testados: tratamento único, duas vezes o tratamento BIW, três vezes o trata- mento BIW ou quatro vezes o tratamento BIW. Cada grupo foi tratado com controle de veículo ou 0,1 mg/kg, 1 mg/kg ou 5 mg/kg de TPP- 15285. Além do estudo de eficácia, animais satélites foram sacrificados para fenotipagem ex vivo em 24 horas, 48 horas e 120 horas após os tratamentos. A administração de anticorpos ocorreu ip, mas outras vias podem ser usadas.[00955] The EMT-6 murine breast cancer model was used with TPP-15285 to test the impact of single versus multiple dosing. Four different treatment regimens were tested: single treatment, twice-biw treatment, three times-biw treatment, or four times-biw treatment. Each group was treated with vehicle control or 0.1 mg/kg, 1 mg/kg, or 5 mg/kg of TPP-15285. In addition to the efficacy study, satellite animals were sacrificed for ex vivo phenotyping at 24 hours, 48 hours, and 120 hours after treatments. Antibody administration occurred ip, but other routes may be used.
[00956] Os dados de eficácia para tratamento único, duas vezes o tratamento BIW, três vezes o tratamento BIW ou quatro vezes o tratamento BIW são mostrados na Fig. 85. Interessantemente, o tratamento com dose única foi adequado para obter uma excelente eficácia do tratamento. Ao final do estudo, houve aumento na frequência, número absoluto e ativação de células T intratumorais CD8+, conforme a Tabela 12.4.2.1. No entanto, no final do estudo não houve diferença no número e frequência de Tregs intratumorais ou expressão de CCR8, conforme a Tabela 12.4.2.2. Além disso, não houve diferença no número de células NK intratumorais ou macrófagos no final do estudo ou durante o estudo (dados não mostrados).[00956] Efficacy data for single-dose, double-dose BIW, triple-dose BIW, or quadruple-dose BIW treatment are shown in Fig. 85. Interestingly, single-dose treatment was adequate to achieve excellent treatment efficacy. At the end of the study, there was an increase in the frequency, absolute number, and activation of intratumoral CD8+ T cells, as shown in Table 12.4.2.1. However, at the end of the study, there was no difference in the number and frequency of intratumoral Tregs or CCR8 expression, as shown in Table 12.4.2.2. Furthermore, there was no difference in the number of intratumoral NK cells or macrophages at the end of the study or during the study (data not shown).
[00957] No entanto, ao longo do tempo, houve uma redução dose- dependente das Tregs intratumorais (CD4+CD25+Foxp3+) após o 1° e 2° tratamentos, mas menos pronunciada após o 3° e 4° tratamentos, conforme a Tabela 12.4.2.3. Isso também foi observado em Tregs CCR8+ (dados não mostrados). Além disso, o número absoluto de células T CD8+ aumentou ao longo do tempo, conforme a Tabela 12.4.2.4. Desse modo, as relações de CD8 para Treg aumentaram após a primeira dose e permaneceram altas até depois da quarta dose em comparação com os controles de isotipo. A caracterização de amostras de sangue não mostrou diminuição substancial de Tregs ou aumento de células T CD8 no sangue em diferentes esquemas de tra-tamento e ao longo do tempo (dados não mostrados). Além disso, nenhuma alteração foi observada em NK e macrófagos no sangue (da- dos não mostrados).Tabela 12.4.2.1: Células CD8+ absolutas por tumor de 100 mg conforme determinado por FACS no final do estudo. A análise FACS revelou aumento da frequência, número absoluto e estado de ativação das células T citotóxicas.Tabela 12.4.2.2: Células Treg CD4+ CD25+ FoxP3+ absolutas por tu-mor de 100 mg conforme determinado por FACS no final do estudo.Tabela 12.4.2.3: Células Treg CD4+ CD25+ FoxP3+ absolutas por tu-mor de 100 mg conforme determinado por FACS em animais satélites. Tabela 12.4.2.4: Células CD8+ absolutas por tumor de 100mg conforme determinado por FACS em animais satélites.Exemplo 12.5: Eficácia do anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 em camundongos que transportam tumor F9[00957] However, over time, there was a dose-dependent reduction in intratumoral Tregs (CD4+CD25+Foxp3+) after the 1st and 2nd treatments, but less pronounced after the 3rd and 4th treatments, as shown in Table 12.4.2.3. This was also observed in CCR8+ Tregs (data not shown). In addition, the absolute number of CD8+ T cells increased over time, as shown in Table 12.4.2.4. Thus, the CD8 to Treg ratios increased after the first dose and remained high until after the fourth dose compared to isotype controls. Characterization of blood samples did not show a substantial decrease in Tregs or an increase in CD8 T cells in the blood in different treatment regimens and over time (data not shown). Furthermore, no changes were observed in NK and macrophages in the blood (data not shown). Table 12.4.2.1: Absolute CD8+ cells per 100 mg tumor as determined by FACS at the end of the study. FACS analysis revealed increased frequency, absolute number, and activation status of cytotoxic T cells. Table 12.4.2.2: Absolute CD4+ CD25+ FoxP3+ Treg cells per 100 mg tumor as determined by FACS at the end of the study. Table 12.4.2.3: Absolute CD4+ CD25+ FoxP3+ Treg cells per 100 mg tumor as determined by FACS in satellite animals. Table 12.4.2.4: Absolute CD8+ cells per 100mg tumor as determined by FACS in satellite animals. Example 12.5: Efficacy of the anti-CCR8 antibody TPP-15285 in mice carrying the F9 tumor.
[00958] O anticorpo substituto anti-CCR8 TPP-15285 mostrou eficácia dependente da dose em camundongos que transportam tumor F9 com fortes efeitos nos grupos de dose de 10 mg/kg e 1 mg/kg, mas eficácia reduzida no grupo de dose de 0,4 mg/kg, comparável a a eficácia do anticorpo anti-PD-L1 (Fig. 52, Fig. 53). Gráficos aranha ilustram estes resultados em uma base de camundongo individual (Fig. 54).[00958] The anti-CCR8 surrogate antibody TPP-15285 showed dose-dependent efficacy in F9 tumor-carrying mice with strong effects in the 10 mg/kg and 1 mg/kg dose groups, but reduced efficacy in the 0.4 mg/kg dose group, comparable to the efficacy of the anti-PD-L1 antibody (Fig. 52, Fig. 53). Spider plots illustrate these results on an individual mouse basis (Fig. 54).
[00959] A análise de Tregs de amostras de tumor F9 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo foi realizada por citometria de fluxo e mostrou números fortemente reduzidos de Tregs no grupo tratado com anticorpo anti-CCR8 com dose de 10 mg/kg versus o grupo controle de isotipo. A depleção de Treg foi claramente dependente da dose (Fig. 55). A depleção de Treg também foi observada para o tratamento com anticorpo anti-PD-L1. Além disso, foi demonstrado um aumento forte e dependente da dose de células T CD8+ nos tumores para todos os grupos de dose de TPP-15285, bem como para o anticorpo anti-PD-L1 (Fig. 55). Outros efeitos em várias populações de células imunes são mostrados na Fig. 55, Fig. 56 e Tabela 12.5.1.Tabela 12.5.1: Efeitos de anticorpos anti-CCR8 ou anticorpo anti- PDL1 em populações de células imunes e suas proporções em 24 horas após o segundo tratamento. Exemplo 12.6: Eficácia de anticorpos anti-CCR8 em terapia de combinação[00959] Analysis of Tregs from F9 tumor samples 24 hours after the second antibody treatment was performed by flow cytometry and showed strongly reduced numbers of Tregs in the group treated with anti-CCR8 antibody at a dose of 10 mg/kg versus the isotype control group. Treg depletion was clearly dose-dependent (Fig. 55). Treg depletion was also observed for treatment with anti-PD-L1 antibody. Furthermore, a strong dose-dependent increase in CD8+ T cells in tumors was demonstrated for all TPP-15285 dose groups, as well as for the anti-PD-L1 antibody (Fig. 55). Other effects on various immune cell populations are shown in Fig. 55, Fig. 56 and Table 12.5.1. Table 12.5.1: Effects of anti-CCR8 antibodies or anti-PDL1 antibodies on immune cell populations and their proportions 24 hours after the second treatment. Example 12.6: Efficacy of anti-CCR8 antibodies in combination therapy
[00960] Vários experimentos foram realizados para analisar a eficácia dos anticorpos anti-CCR8 sozinhos ou em combinação com anticorpos que têm como alvo o ponto de verificação, tais como anticorpos anti-PD-L1, anti-PD1 e anti-CTLA4. A combinação com essas moléculas que têm como alvo o ponto de verificação foi constatada fornecer eficácia adicional. Além disso, outros tratamentos combinados foram avaliados, por exemplo, com agentes quimioterapêuticos, tais como oxaliplatina, doxorrubicina, gencitabina ou radioterapia. A Tabela 12.6.1 resume os resultados para diferentes tratamentos combinados. Foi observado benefício adicional se o tratamento com o segundo agente terapêutico foi iniciado somente após o início do tratamento com anticorpo anti-CCR8.Tabela 12.6.1: Tratamentos e resultados da combinação de anticorpos anti-CCR8. [00960] Several experiments were conducted to analyze the efficacy of anti-CCR8 antibodies alone or in combination with antibodies that target the checkpoint, such as anti-PD-L1, anti-PD1, and anti-CTLA4 antibodies. The combination with these checkpoint-targeting molecules was found to provide additional efficacy. Furthermore, other combined treatments were evaluated, for example, with chemotherapeutic agents such as oxaliplatin, doxorubicin, gemcitabine, or radiotherapy. Table 12.6.1 summarizes the results for different combined treatments. Additional benefit was observed if treatment with the second therapeutic agent was initiated only after the start of treatment with the anti-CCR8 antibody. Table 12.6.1: Treatments and results of the combination of anti-CCR8 antibodies.
[00961] Esses resultados demonstram o impacto benéfico da combinação do tratamento com anticorpo anti-CCR8 com outros agentes terapeuticamente ativos. Além disso, os inventores concluem que a administração sequencial dos agentes terapêuticos adiciona benefícios adicionais, se o anticorpo anti-CCR8 for administrado primeiro e se um agente terapêutico adicional for administrado somente após uma redução inicial de células Treg (por exemplo, em pelo menos 50%) ocorreu, por exemplo, conforme demonstrado nos Exemplos 12.6.5 e 12.6.7.[00961] These results demonstrate the beneficial impact of combining anti-CCR8 antibody treatment with other therapeutically active agents. Furthermore, the inventors conclude that sequential administration of the therapeutic agents adds further benefits if the anti-CCR8 antibody is administered first and if an additional therapeutic agent is administered only after an initial reduction in Treg cells (e.g., by at least 50%) has occurred, for example, as demonstrated in Examples 12.6.5 and 12.6.7.
[00962] Em vista desses experimentos e resultados, os inventores estão convencidos de que a combinação tripla, por exemplo, com um anticorpo anti-CCR8, um anticorpo que tem como alvo a uma proteína de ponto de verificação e um agente terapêutico direcionado (pequenas moléculas, bem como anticorpos) fornece benefícios adicionais na sobrevivência devido a diferenças nos modos de ação desses tratamentos. Portanto, a combinação de um anticorpo anti-CCR8 com um anticorpo que tem como alvo o ponto de verificação e um anticorpo ou agente que tem como alvo as células tumorais é sugerida para o tratamento de tumores. Em uma modalidade preferida, a combinação é uma combinação de um anticorpo CCR8, um anticorpo anti-PD(L)-1 e paclitaxel.Exemplo 12.6.1: Eficácia de anticorpos anti-CCR8 em camundongos que transportam tumor C38 e terapia de combinação com anticorpo anti-PD-L1[00962] In view of these experiments and results, the inventors are convinced that the triple combination, for example, with an anti-CCR8 antibody, an antibody targeting a checkpoint protein, and a targeted therapeutic agent (small molecules as well as antibodies) provides additional survival benefits due to differences in the modes of action of these treatments. Therefore, the combination of an anti-CCR8 antibody with an antibody targeting the checkpoint and an antibody or agent targeting tumor cells is suggested for the treatment of tumors. In a preferred embodiment, the combination is a combination of a CCR8 antibody, an anti-PD(L)-1 antibody, and paclitaxel. Example 12.6.1: Efficacy of anti-CCR8 antibodies in C38 tumor-bearing mice and combination therapy with anti-PD-L1 antibody
[00963] Os anticorpos anti-CCR8 TPP-14099 e TPP-15285 substitu- tos mostraram forte eficácia em camundongos que transportam tumor C38, comparável com a eficácia do anticorpo anti-PD-L1 (Fig. 57 a). A combinação de TPP-15285 com 3 mg/kg de anticorpo anti-PD-L1 mostrou eficácia também melhorada. Ambos os anticorpos foram formula-dos separadamente em solução salina tamponada com fosfato e foram aplicados como um total de quatro injeções intraperitoneais individuais duas vezes por semana, isto é, em combinação no mesmo dia com um início de tratamento simultâneo.[00963] The anti-CCR8 antibodies TPP-14099 and TPP-15285 surrogate showed strong efficacy in C38 tumor-carrying mice, comparable to the efficacy of the anti-PD-L1 antibody (Fig. 57a). The combination of TPP-15285 with 3 mg/kg of anti-PD-L1 antibody also showed improved efficacy. Both antibodies were formulated separately in phosphate-buffered saline and were administered as a total of four individual intraperitoneal injections twice weekly, i.e., in combination on the same day with a simultaneous treatment initiation.
[00964] Os camundongos foram monitorizados num estudo de sobrevivência durante 94 dias (Fig. 57b). Notavelmente, 8 de 10 camundongos tratados com a combinação de anticorpo anti-CCR8 e anticorpo anti-PD-L1 sobreviveram ao dia 94, 4 de 10 camundongos tratados com anticorpo CCR8 TPP-15285 sozinho sobreviveram ao dia 94 e nenhum dos camundongos tratados com o anticorpo anti-PD-L1 sozinho sobreviveu ao dia 94, demonstrando uma eficácia sinérgica do anticorpo anti-CCR8 e do anticorpo PD-L1. C38 é um modelo de camundongo singênico de baixa infiltração que usa células C38 de câncer de cólon para indução de tumor. O modelo é geralmente considerado responsivo ao tratamento com anticorpo anti-PD-L1. Em vista dos dados disponíveis descritos aqui, sugere-se que a estratificação de pacientes com base na infiltração de células T e/ou resposta à terapia PD- L1 forneça benefícios adicionais.[00964] Mice were monitored in a survival study for 94 days (Fig. 57b). Notably, 8 of 10 mice treated with the combination of anti-CCR8 antibody and anti-PD-L1 antibody survived to day 94, 4 of 10 mice treated with CCR8 antibody TPP-15285 alone survived to day 94, and none of the mice treated with anti-PD-L1 antibody alone survived to day 94, demonstrating a synergistic efficacy of anti-CCR8 antibody and PD-L1 antibody. C38 is a syngeneic low-infiltration mouse model that uses C38 colon cancer cells for tumor induction. The model is generally considered responsive to treatment with anti-PD-L1 antibody. In view of the available data described here, it is suggested that stratifying patients based on T-cell infiltration and/or response to PD-L1 therapy would provide additional benefits.
[00965] A análise de Tregs de amostras de tumor C38 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo por citometria de fluxo mostrou números fortemente reduzidos de Tregs nos grupos tratados com anticorpo anti-CCR8 versus grupo de controle de isotipo (Fig. 58). A depleção de Treg mais forte foi observada para a combinação de TPP- 15285 com anticorpo anti-PD-L1. Além disso, a relação CD8+/Treg mais alta foi observada para a combinação de TPP-15285 com anti-corpo anti-PD-L1. Interessantemente, a análise de macrófagos mos- trou um aumento no dia 24 do estudo (Fig. 59).Exemplo 12.6.2: Eficácia de anticorpos anti-CCR8 em camundongos que transportam tumor B16F10-OVA e terapia de combinação com anticorpo anti-CTLA4[00965] Analysis of Tregs from C38 tumor samples 24 hours after the second antibody treatment by flow cytometry showed strongly reduced numbers of Tregs in the groups treated with anti-CCR8 antibody versus the isotype control group (Fig. 58). The strongest Treg depletion was observed for the combination of TPP-15285 with anti-PD-L1 antibody. Furthermore, the highest CD8+/Treg ratio was observed for the combination of TPP-15285 with anti-PD-L1 antibody. Interestingly, macrophage analysis showed an increase on day 24 of the study (Fig. 59). Example 12.6.2: Efficacy of anti-CCR8 antibodies in mice carrying B16F10-OVA tumor and combination therapy with anti-CTLA4 antibody
[00966] O anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 (10 mg/kg) mostrou forte eficácia em camundongos que transportam B16F10-OVA comparável à eficácia de um anticorpo anti-CTLA4 (10 mg/kg) (Fig. 60). A combinação de TPP-15285 com anticorpo anti-CTLA4 mostrou eficácia si- nérgica, correlacionando-se com um aumento de células T CD8+ e níveis de IFNg/TNFa.[00966] The anti-CCR8 antibody TPP-15285 (10 mg/kg) showed strong efficacy in mice carrying B16F10-OVA comparable to the efficacy of an anti-CTLA4 antibody (10 mg/kg) (Fig. 60). The combination of TPP-15285 with anti-CTLA4 antibody showed synergistic efficacy, correlating with an increase in CD8+ T cells and IFNγ/TNFα levels.
[00967] Ambos os anticorpos foram formulados em PBS e foram aplicados como um total de três injeções intraperitoneais individuais duas vezes por semana, em combinação no mesmo dia com um início de tratamento simultâneo.[00967] Both antibodies were formulated in PBS and were administered as a total of three individual intraperitoneal injections twice weekly, in combination on the same day with a simultaneous treatment initiation.
[00968] A análise de Tregs de amostras de tumor B16F10-OVA 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo (dia 12) por citometria de fluxo mostrou números fortemente reduzidos de Tregs nos grupos tratados com anticorpo CCR8 versus o grupo de controle de isotipo (Tabela 12.6.2.1). A depleção de Treg mais forte foi observada para a combinação de TPP-15285 com anticorpo anti-CTLA4. Além disso, o aumento mais forte de células T CD8+ foi observado para a combinação de TPP-15285 com anticorpo anti-CTLA4.[00968] Analysis of Tregs from B16F10-OVA tumor samples 24 hours after the second antibody treatment (day 12) by flow cytometry showed strongly reduced numbers of Tregs in the CCR8 antibody-treated groups versus the isotype control group (Table 12.6.2.1). The strongest Treg depletion was observed for the combination of TPP-15285 with anti-CTLA4 antibody. In addition, the strongest increase in CD8+ T cells was observed for the combination of TPP-15285 with anti-CTLA4 antibody.
[00969] A análise FACS de tumores B16F10-OVA 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo com TPP-15285 + controle de iso- tipo, anticorpo anti-CTLA4 + controle de isotipo ou TPP-15285 + anticorpo anti-CTLA4 demonstrou uma diminuição da frequência de Treg intratumoral e um aumento de números absolutos de células T CD8+.Tabela 12.6.2.1: Populações de células intratumorais determinadas por FACS e IFNg determinadas por ELISA no final do estudo. *média para n=5 amostras.Exemplo 12.6.3: Tratamento de combinação com anticorpo anti- PD-1 e anticorpo anti-CCR8 em camundongos que transportam tumor EMT-6: eficácia sinérgica[00969] FACS analysis of B16F10-OVA tumors 24 hours after the second antibody treatment with TPP-15285 + isotype control, anti-CTLA4 antibody + isotype control, or TPP-15285 + anti-CTLA4 antibody demonstrated a decrease in the frequency of intratumoral Tregs and an increase in absolute numbers of CD8+ T cells. Table 12.6.2.1: Intratumoral cell populations determined by FACS and IFNγ determined by ELISA at the end of the study. *mean for n=5 samples. Example 12.6.3: Combination treatment with anti-PD-1 antibody and anti-CCR8 antibody in EMT-6 tumor-carrying mice: synergistic efficacy
[00970] As eficácias terapêuticas do anticorpo CCR8 antimurino TPP-15285 (1 mg/kg) sozinho, anticorpo PD-1 antimurino (CDRs: ate- zolizumab, 10 mg/kg) sozinho ou combinação de TPP-15285 (1 mg/kg) e anticorpo PD-1 antimurino (10 mg/kg) foram avaliados em camundongos que transportam tumor EMT-6. Ambos os anticorpos foram formulados em PBS e aplicados como um total de quatro injeções in- traperitoneais individuais duas vezes por semana, em combinação no mesmo dia com um início de tratamento simultâneo.[00970] The therapeutic efficacies of the antimurine CCR8 antibody TPP-15285 (1 mg/kg) alone, antimurine PD-1 antibody (CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) alone, or a combination of TPP-15285 (1 mg/kg) and antimurine PD-1 antibody (10 mg/kg) were evaluated in mice carrying the EMT-6 tumor. Both antibodies were formulated in PBS and administered as a total of four individual intraperitoneal injections twice weekly, in combination on the same day with a simultaneous treatment initiation.
[00971] O anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 mostrou eficácia fraca em camundongos que transportam EMT-6 em uma dose baixa de 1 mg/kg, comparável com a eficácia fraca do anticorpo anti-PD-1 em 10 mg/kg (Fig. 61). A combinação de 1 mg/kg de TPP-15285 com 10 mg/kg de anti-PD-1 mostrou eficácia sinérgica.[00971] The anti-CCR8 antibody TPP-15285 showed weak efficacy in mice carrying EMT-6 at a low dose of 1 mg/kg, comparable to the weak efficacy of the anti-PD-1 antibody at 10 mg/kg (Fig. 61). The combination of 1 mg/kg of TPP-15285 with 10 mg/kg of anti-PD-1 showed synergistic efficacy.
[00972] A análise de Tregs de amostras de tumor EMT-6 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo por citometria de fluxo mostrou números fortemente reduzidos de Tregs nos grupos tratados com anticorpo CCR8 versus o grupo de controle de isotipo ou monoterapia anti-PD-1 (Fig. 62).Tabela 12.6.3.1: Populações de células intratumorais determinadas por FACS em tumores EMT-6 no final do estudo. * média para n=5 amostras, células/100mg tumor.Exemplo 12.6.4: Tratamento de combinação com anticorpo anti- PD-1 e anticorpo anti-CCR8 em camundongos que transportam tumor C38[00972] Analysis of Tregs from EMT-6 tumor samples 24 hours after the second antibody treatment by flow cytometry showed strongly reduced numbers of Tregs in the CCR8 antibody-treated groups versus the isotype control group or anti-PD-1 monotherapy (Fig. 62). Table 12.6.3.1: Intratumoral cell populations determined by FACS in EMT-6 tumors at the end of the study. * mean for n=5 samples, cells/100mg tumor. Example 12.6.4: Combination treatment with anti-PD-1 antibody and anti-CCR8 antibody in C38 tumor-carrying mice
[00973] As eficácias terapêuticas do anticorpo CCR8 antimurino TPP-15285 (5 mg/kg) sozinho, anticorpo PD-1 antimurino (aPD-1, CDRs: atezolizumab, 5 mg/kg) sozinho ou combinação de TPP-15285 (5 mg/kg) e anticorpo PD-1 antimurino (5 mg/kg) foram avaliados em camundongos que transportam tumor C38. Ambos os anticorpos foram formulados em PBS e aplicados como um total de quatro injeções in- traperitoneais individuais duas vezes por semana, em combinação no mesmo dia com um início de tratamento simultâneo.[00973] The therapeutic efficacies of the antimurine CCR8 antibody TPP-15285 (5 mg/kg) alone, antimurine PD-1 antibody (aPD-1, CDRs: atezolizumab, 5 mg/kg) alone, or a combination of TPP-15285 (5 mg/kg) and antimurine PD-1 antibody (5 mg/kg) were evaluated in mice carrying C38 tumors. Both antibodies were formulated in PBS and administered as a total of four individual intraperitoneal injections twice weekly, in combination on the same day with a simultaneous treatment initiation.
[00974] O anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 mostrou uma forte eficácia em camundongos que transportam tumor C38 que foi superior à eficácia de um anticorpo anti-PD-1 administrado na mesma dose (Fig. 63 a). Após 64 dias, a combinação de 5 mg/kg de TPP-15285 com 5 mg/kg de anticorpo anti-PD-1 mostrou eficácia melhorada na sobrevida com 10/10 respondedores completos em comparação com 9/10 para monoterapia anti-CCR8 e 4/10 para monoterapia anti-PD1 (Fig. 63 b).[00974] The anti-CCR8 antibody TPP-15285 showed strong efficacy in C38 tumor-bearing mice that was superior to the efficacy of an anti-PD-1 antibody administered at the same dose (Fig. 63a). After 64 days, the combination of 5 mg/kg of TPP-15285 with 5 mg/kg of anti-PD-1 antibody showed improved survival efficacy with 10/10 complete responders compared to 9/10 for anti-CCR8 monotherapy and 4/10 for anti-PD1 monotherapy (Fig. 63b).
[00975] A análise Treg de amostras de tumor C38 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo por citometria de fluxo é mostrada na Fig. 64, Tabela 12.6.4.1.Tabela 12.6.4.1: Populações de células intratumorais determinadas por FACS em tumores C38 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo. *média para n=5 amostras, células/100mg tumor.Exemplo 12.6.5: Tratamento de combinação sequencial de anticorpo anti-CCR8 com anticorpo anti-PD-1 em camundongos que transportam tumor MB49[00975] Treg analysis of C38 tumor samples 24 hours after the second antibody treatment by flow cytometry is shown in Fig. 64, Table 12.6.4.1. Table 12.6.4.1: Intratumoral cell populations determined by FACS in C38 tumors 24 hours after the second antibody treatment. *mean for n=5 samples, cells/100mg tumor. Example 12.6.5: Sequential combination treatment of anti-CCR8 antibody with anti-PD-1 antibody in MB49 tumor-bearing mice
[00976] A eficácia terapêutica do anticorpo anti-CCR8 de murino TPP-15285 (10 mg/kg) sozinho, anticorpo PD-1 antimurino (CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) sozinho e combinação de TPP-15285 (10 mg/kg) e o anticorpo anti-PD-1 (10 mg/kg) foi avaliado em um estudo em camundongos que transportam tumor MB49. Neste estudo, a primeira dose do anticorpo anti-PD1 foi administrada somente após o anticorpo anti-CCR8, isto é, após permitir que o anticorpo anti-CCR8 causasse um efeito nas Tregs levando a um aumento da relação de células T CD8+ para Treg. Mais especificamente, o tratamento com anticorpo anti-PD1 foi iniciado 24 horas após o segundo tratamento com anticorpo anti-CCR8. O anticorpo anti-CCR8 TPP-15285 mostrou uma forte eficácia em camundongos que transportam tumor MB49 que também foi maior do que para o anticorpo anti-PD1 (Fig. 65). A combinação de 10 mg/kg de TPP-15285 com 10 mg/kg de anti-PD-1 mostrou eficácia também melhorada.[00976] The therapeutic efficacy of the murine anti-CCR8 antibody TPP-15285 (10 mg/kg) alone, the anti-murine PD-1 antibody (CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) alone, and the combination of TPP-15285 (10 mg/kg) and the anti-PD-1 antibody (10 mg/kg) was evaluated in a study in MB49 tumor-bearing mice. In this study, the first dose of the anti-PD1 antibody was administered only after the anti-CCR8 antibody, that is, after allowing the anti-CCR8 antibody to have an effect on Tregs leading to an increase in the ratio of CD8+ T cells to Tregs. More specifically, treatment with the anti-PD1 antibody was initiated 24 hours after the second treatment with the anti-CCR8 antibody. The anti-CCR8 antibody TPP-15285 showed strong efficacy in mice carrying MB49 tumors, which was also greater than that of the anti-PD1 antibody (Fig. 65). The combination of 10 mg/kg of TPP-15285 with 10 mg/kg of anti-PD-1 also showed improved efficacy.
[00977] A análise FACS de amostras de tumor derivadas de MB49 no final do estudo mostrou aumento da frequência de células CD45+, células CD8+ e células NK e frequência reduzida de Tregs nos grupos tratados com anticorpo anti-CCR8 versus grupo controle de veículo ou monoterapia com anticorpo anti-PD-1 (Fig 66, Tabela 12.6.5.1).[00977] FACS analysis of MB49-derived tumor samples at the end of the study showed increased frequency of CD45+ cells, CD8+ cells, and NK cells and reduced frequency of Tregs in the groups treated with anti-CCR8 antibody versus the vehicle control group or anti-PD-1 antibody monotherapy (Fig 66, Table 12.6.5.1).
[00978] MB49 é um modelo singênico infiltrado em meio usando células de câncer de bexiga que respondem à terapia com inibidor de ponto de verificação imunológica (ICI). Em vista desses dados, sugere- se que a estratificação de indivíduos para baixa infiltração imunológica e/ou resposta à terapia com ICI forneça benefício adicional para essa terapia de combinação.[00978] MB49 is a syngeneic model infiltrated in medium using bladder cancer cells that respond to immune checkpoint inhibitor (ICI) therapy. In view of these data, it is suggested that stratifying individuals for low immune infiltration and/or response to ICI therapy provides additional benefit for this combination therapy.
[00979] Em particular, constatou-se que o início do tratamento de combinação após o tratamento com anticorpo anti-CCR8 fornece um benefício. Sem se limitarem à teoria, os inventores assumem que a depleção inicial de Tregs por anticorpos CCR8 aumenta a atividade de células apresentadoras de antígenos e iniciação de células T tumorais, resultando em sensibilidade melhorada para inibidores de ponto de verificação, tal como PD-(L)1, porque Tregs como fatores extrínsecos de células tumorais desempenham um papel quanto à resistência primária e adaptativa aos inibidores de ponto de verificação em pacientes com câncer.Tabela 12.6.5.1: Populações de células intratumorais determinadas por FACS em tumores MB49 no final do estudo. *média para n=5 amostras, células/100mg tumor.Exemplo 12.6.6: Tratamento de combinação compreendendo anticorpo anti-CCR8 e quimioterapia em camundongos que transportam tumor EMT-6[00979] In particular, it was found that initiating combination therapy after anti-CCR8 antibody treatment provides a benefit. Without limiting themselves to theory, the inventors assume that the initial depletion of Tregs by CCR8 antibodies increases antigen-presenting cell activity and tumor T cell initiation, resulting in improved sensitivity to checkpoint inhibitors, such as PD-(L)1, because Tregs as extrinsic tumor cell factors play a role in primary and adaptive resistance to checkpoint inhibitors in cancer patients. Table 12.6.5.1: Intratumoral cell populations determined by FACS in MB49 tumors at the end of the study. *mean for n=5 samples, cells/100mg tumor. Example 12.6.6: Combination treatment comprising anti-CCR8 antibody and chemotherapy in mice carrying the EMT-6 tumor.
[00980] As eficácias terapêuticas do anticorpo anti-CCR8 TPP- 15285 (5 mg/kg, q3/4d ip) sozinho, Oxaliplatina (5 mg/kg, q4d ip) sozinho, Doxorrubicina (6 mg/kg, iv SD) sozinho, Docetaxel (10 mg/kg, q2dx5, iv) sozinho ou uma combinação de TPP-15285 com Oxaliplati- na, Doxorrubicina ou Docetaxel foram avaliados em camundongos que transportam tumor EMT-6. Os terapêuticos foram formulados em PBS, o tratamento combinado foi iniciado no mesmo dia com início simultâneo do tratamento.[00980] The therapeutic efficacies of the anti-CCR8 antibody TPP-15285 (5 mg/kg, q3/4d ip) alone, Oxaliplatin (5 mg/kg, q4d ip) alone, Doxorubicin (6 mg/kg, iv SD) alone, Docetaxel (10 mg/kg, q2dx5, iv) alone, or a combination of TPP-15285 with Oxaliplatin, Doxorubicin, or Docetaxel were evaluated in mice carrying the EMT-6 tumor. The therapeutics were formulated in PBS, and the combined treatment was initiated on the same day with simultaneous start of treatment.
[00981] Embora a combinação de anticorpo anti-CCR8 com cada agente quimioterapêutico tenha proporcionado benefícios em relação à monoterapia com esse agente quimioterapêutico, a combinação não foi superior à monoterapia anti-CCR8 (Fig. 67). Os inventores estão convencidos de que a administração sequencial dos agentes terapêuticos é benéfica, permitindo que o anticorpo anti-CCR8 esgote eficazmente as Tregs antes que o quimioterápico seja aplicado para esgotar as células de divisão rápida.[00981] Although the combination of anti-CCR8 antibody with each chemotherapeutic agent provided benefits compared to monotherapy with that chemotherapeutic agent, the combination was not superior to anti-CCR8 monotherapy (Fig. 67). The inventors are convinced that sequential administration of the therapeutic agents is beneficial, allowing the anti-CCR8 antibody to effectively deplete Tregs before the chemotherapeutic agent is applied to deplete the rapidly dividing cells.
[00982] As populações de células imunes foram analisadas no final do estudo, tanto no tumor quanto no sangue por citometria de fluxo, conforme Tabela 12.6.6.1 e Tabela 12.6.6.2. Para tratamentos combinados, a relação CD8/Treg intratumoral e a frequência de células T CD8+CD25+ ativadas no sangue aumentaram em comparação com cada monoterapia e controle.[00982] Immune cell populations were analyzed at the end of the study, both in the tumor and in the blood by flow cytometry, as shown in Table 12.6.6.1 and Table 12.6.6.2. For combined treatments, the intratumoral CD8/Treg ratio and the frequency of activated CD8+CD25+ T cells in the blood increased compared to each monotherapy and control.
[00983] Além disso, IFN gama, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2 e TNF alfa foram analisados. Níveis aumentados de IFN gama, IL-1b e IL-2 foram observados nos grupos mono e combinação. O aumento de TNF alfa foi observado apenas em grupos de combinação (dados não mostrados).Tabela 12.6.6.1: Populações de células intratumorais determinadas por FACS no final do estudo. *média para n=5 amostras, células/100 mg tumor, se não especificado de outra forma. Tabela 12.6.6.2: Populações de células imunes do sangue determinadas por FACS no final do estudo. *média para n=5 amostras, célu- las/100μl de sangue.Exemplo 12.6.7: Tratamento de combinação sequencial com anti- corpo anti-PD-(L)1 e anticorpo anti-CCR8 em camundongos que transportam carcinoma de pulmão de Lewis[00983] In addition, IFN gamma, IL10, IL12p70, IL1beta, IL2, and TNF alpha were analyzed. Increased levels of IFN gamma, IL-1b, and IL-2 were observed in both the mono and combination groups. Increased TNF alpha was observed only in the combination groups (data not shown). Table 12.6.6.1: Intratumoral cell populations determined by FACS at the end of the study. *mean for n=5 samples, cells/100 mg tumor, unless otherwise specified. Table 12.6.6.2: Blood immune cell populations determined by FACS at the end of the study. *mean for n=5 samples, cells/100μl of blood. Example 12.6.7: Sequential combination treatment with anti-PD-(L)1 antibody and anti-CCR8 antibody in mice carrying Lewis lung carcinoma.
[00984] As eficácias terapêuticas do anticorpo anti-CCR8 TPP- 15285 (10 mg/kg) sozinho, anticorpo anti-PD-1 (aPD-1, CDRs: atezoli- zumab, 10 mg/kg) sozinho, anticorpo anti-PD-L1 (10 mg /kg) sozinho, anticorpo anti-CTLA4 sozinho, TPP-15285 (10 mg/kg) e anticorpo anti- PD-1 (10 mg/kg) em combinação, ou TPP-15285 (10 mg/kg) e anticorpo anti-PD-L1 (10 mg/kg) em combinação foram avaliadas em camundongos que transportam tumor de pulmão de Lewis (Fig. 69). Os anticorpos foram formulados em PBS. Para o anticorpo anti-CCR8, as doses foram administradas nos dias 11, 14, 18 e 22 após a inoculação do tumor. Para tratamento de combinação, a administração do anticorpo anti-PD-(L)1 começou 24 horas após a 2a dose de anticorpo anti- CCR8. Neste ponto de tempo, a análise FACS mostrou uma depleção de Treg intratumoral para o grupo mono TPP-15285 de 60% em relação ao controle de isotipo (dados não mostrados).[00984] The therapeutic efficacies of the anti-CCR8 antibody TPP-15285 (10 mg/kg) alone, anti-PD-1 antibody (aPD-1, CDRs: atezolizumab, 10 mg/kg) alone, anti-PD-L1 antibody (10 mg/kg) alone, anti-CTLA4 antibody alone, TPP-15285 (10 mg/kg) and anti-PD-1 antibody (10 mg/kg) in combination, or TPP-15285 (10 mg/kg) and anti-PD-L1 antibody (10 mg/kg) in combination were evaluated in mice carrying Lewis lung tumor (Fig. 69). The antibodies were formulated in PBS. For the anti-CCR8 antibody, doses were administered on days 11, 14, 18, and 22 after tumor inoculation. For combination therapy, administration of the anti-PD-(L)1 antibody began 24 hours after the second dose of anti-CCR8 antibody. At this time point, FACS analysis showed a 60% depletion of intratumoral Treg cells in the TPP-15285 monogroup compared to the isotype control (data not shown).
[00985] O pulmão de Lewis foi usado como um modelo singênico com um microambiente tumoral supressor e é conhecido por não ser responsivo ao tratamento anti-PD-(L)1 e ao tratamento anti-CTLA4. Nenhuma eficácia monoterapêutica de TPP-15285 foi observada apesar da depleção efetiva de Treg medida 24 horas após o 2° tratamento. No entanto, o tratamento de combinação com anticorpo PD-1 antimu- rino após anticorpo anti-CCR8 mostrou eficácia melhorada e isso também foi associado ao aumento da relação CD8/Treg no final do estudo (Tabela 12.6.7.1). Tabela 12.6.7.1: Populações de células intratumorais determinadas por FACS no final do estudo. *média para n=5 amostras.Exemplo 12.6.8: Tratamento de combinação compreendendo anticorpo anti-CCR8 e radioterapia em camundongos que transportam tumor EMT-6[00985] Lewis lung was used as a syngeneic model with a suppressive tumor microenvironment and is known to be unresponsive to anti-PD-(L)1 and anti-CTLA4 treatment. No monotherapy efficacy of TPP-15285 was observed despite effective Treg depletion measured 24 hours after the 2nd treatment. However, combination treatment with anti-murine PD-1 antibody after anti-CCR8 antibody showed improved efficacy and this was also associated with an increased CD8/Treg ratio at the end of the study (Table 12.6.7.1). Table 12.6.7.1: Intratumoral cell populations determined by FACS at the end of the study. *mean for n=5 samples. Example 12.6.8: Combination treatment comprising anti-CCR8 antibody and radiotherapy in mice carrying EMT-6 tumor
[00986] As eficácias terapêuticas do anticorpo anti-CCR8 TPP- 15285 (3 mg/kg) ou radioterapia (RT, 3 x 2 Gy) foram avaliadas isoladamente ou em combinação em camundongos que transportam tumor EMT-6 (Fig. 70). O tratamento combinado foi iniciado com irradiação fracional de 3 x 2 Gy, seguida por 3 mg/kg biw x 2. A radioterapia sozinha apenas retardou levemente o crescimento do tumor. A combinação de anticorpo anti-CCR8 e radioterapia mostrou apenas uma pequena melhora na eficácia, mas a depleção de Treg no final do estudo foi mais pronunciada do que para cada monoterapia (dados não mostrados).Exemplo 12.6.9: Tratamento de combinação compreendendo anticorpo anti-CCR8 e administração de anticorpo PD-1, anticorpo PD-L1 ou Paclitaxel em camundongos que transportam tumor MBT2[00986] The therapeutic efficacies of the anti-CCR8 antibody TPP-15285 (3 mg/kg) or radiotherapy (RT, 3 x 2 Gy) were evaluated alone or in combination in mice carrying EMT-6 tumor (Fig. 70). The combined treatment was initiated with fractional irradiation of 3 x 2 Gy, followed by 3 mg/kg biw x 2. Radiotherapy alone only slightly retarded tumor growth. The combination of anti-CCR8 antibody and radiotherapy showed only a small improvement in efficacy, but Treg depletion at the end of the study was more pronounced than for each monotherapy (data not shown). Example 12.6.9: Combination treatment comprising anti-CCR8 antibody and administration of PD-1 antibody, PD-L1 antibody or Paclitaxel in mice carrying MBT2 tumor
[00987] As eficácias terapêuticas do anticorpo anti-CCR8 inventivo, anticorpo anti-PD-1, anticorpo anti-PD-L1 ou Paclitaxel foram testadas sozinhas ou em combinação em camundongos que transportam tumor singênico MBT2, conforme mostrado na Tabela 12.6.9.1. Cada grupo compreendia 10 camundongos que transportam tumor e o tratamento começou no dia 10 após a inoculação, quando os tumores atingiram um tamanho de cerca de 100 mm3. Entre os grupos de tratamento único, o anti-CCR8 mostrou o efeito antitumoral mais forte e significativo.[00987] The therapeutic efficacies of the inventive anti-CCR8 antibody, anti-PD-1 antibody, anti-PD-L1 antibody, or Paclitaxel were tested alone or in combination in mice carrying MBT2 syngeneic tumors, as shown in Table 12.6.9.1. Each group comprised 10 tumor-carrying mice, and treatment began on day 10 after inoculation, when the tumors reached a size of approximately 100 mm3. Among the single-treatment groups, anti-CCR8 showed the strongest and most significant antitumor effect.
[00988] O efeito antitumoral do anticorpo anti-PD-1, anticorpo anti- PD-L1 ou Paclitaxel foi significativamente aumentado pela combinação desses tratamentos com a terapia anti-CCR8. Os anticorpos foram formulados em PBS. As razões T/C foram analisadas após três semanas de tratamento quinzenal.Tabela 12.6.9.1: Grupos de tratamento e relação T/C em relação ao controle de isotipo no dia 24.Tabela 12.6.9.2: Os níveis de mRNA de CD8 aumentam após tratamentos de combinação anti-CCR8. Os níveis de mRNA de CD8 foram obtidos por meio de RNA-seq realizado em tumores MBT2 obtidos 24h após o término do ciclo de tratamento. Os níveis médios de expressão de CD8 foram calculados para 10 tumores de cada grupo de tratamento. O tratamento anti-CCR8 sozinho aumentou significativamente os níveis de CD8 em comparação com o isotipo, enquanto PD1, PDL1 e paclitaxel não tiveram efeito significativo. Os níveis de CD8 foram aumentados pela combinação do tratamento anti-CCR8 com os outros três tratamentos. O aumento mais significativo e mais forte de mais de 8 vezes foi obtido pela combinação de anti-CCR8 com tratamento anti- PD1.Tabela 12.6.9.3: Os tamanhos dos tumores no dia 24 são significativamente reduzidos pelo tratamento anti-CCR8 e ainda mais reduzidos pela combinação do anti-CCR8 com o anticorpo PD1 (CrownVivoPre- mium, N° de Catálogo RMP1-14), anticorpo PDL1 (CrownVivoPre- mium, N° de Catálogo CVP034), ou Paclitaxel. A maior e mais significativa redução no tamanho do tumor em comparação com o controle do isotipo é alcançada pela combinação de anti-CCR8 com anticorpo anti-PD1. Exemplo 12.7.1: Correlação entre a resposta do anticorpo anti-PD-L1 e a resposta do anticorpo anti-CCR8[00988] The antitumor effect of anti-PD-1 antibody, anti-PD-L1 antibody, or Paclitaxel was significantly increased by combining these treatments with anti-CCR8 therapy. The antibodies were formulated in PBS. T/C ratios were analyzed after three weeks of biweekly treatment. Table 12.6.9.1: Treatment groups and T/C ratio relative to isotype control on day 24. Table 12.6.9.2: CD8 mRNA levels increase after anti-CCR8 combination treatments. CD8 mRNA levels were obtained via RNA-seq performed on MBT2 tumors obtained 24h after the end of the treatment cycle. Mean CD8 expression levels were calculated for 10 tumors from each treatment group. Anti-CCR8 treatment alone significantly increased CD8 levels compared to the isotype, while PD1, PDL1, and paclitaxel had no significant effect. CD8 levels were increased by combining anti-CCR8 treatment with the other three treatments. The most significant and strongest increase of more than 8 times was obtained by combining anti-CCR8 with anti-PD1 treatment. Table 12.6.9.3: Tumor sizes on day 24 are significantly reduced by anti-CCR8 treatment and further reduced by the combination of anti-CCR8 with PD1 antibody (CrownVivoPremium, Catalog No. RMP1-14), PDL1 antibody (CrownVivoPremium, Catalog No. CVP034), or Paclitaxel. The greatest and most significant reduction in tumor size compared to the isotype control is achieved by the combination of anti-CCR8 with anti-PD1 antibody. Example 12.7.1: Correlation between the anti-PD-L1 antibody response and the anti-CCR8 antibody response.
[00989] A fim de comparar a eficácia do tratamento com anticorpo anti-CCR8 contra o tratamento com anticorpo anti-PD-L1, os resultados para os diferentes modelos de tumor singênico foram montados, veja a Tabela 12.7.1.1. Surpreendentemente, uma boa resposta ao tratamento com anticorpos anti-PD-L1 - medida, por exemplo, pelo volume T/C - também foi preditiva para uma boa resposta ao tratamento com anticorpos anti-CCR8. A expressão de PD-L1 é um preditor conhecido para selecionar respondedores ao tratamento anti-PD-L1. A partir dessas observações, os inventores levantaram a hipótese de que a expressão de PD-L1 também pode ser adequada para estratificar indivíduos a fim de identificar aqueles que provavelmente se beneficiariam do tratamento com anticorpo anti-CCR8. Essa hipótese pode ser validada retroativamente correlacionando os níveis de expressão de PD-L1 com o volume do tumor.Tabela 12.7.1.1 Comparação entre as respostas ao anticorpo anti PD- L1 vs. anticorpo anti-CCR8 para diferentes modelos singênicos. Exemplo 12.7.2: Correlação entre resposta antitumoral e biomar- cador de mRNA para estratificação ou controle de doença[00989] In order to compare the efficacy of anti-CCR8 antibody treatment versus anti-PD-L1 antibody treatment, the results for different syngeneic tumor models were compiled, see Table 12.7.1.1. Surprisingly, a good response to anti-PD-L1 antibody treatment – measured, for example, by T/C volume – was also predictive of a good response to anti-CCR8 antibody treatment. PD-L1 expression is a known predictor for selecting responders to anti-PD-L1 treatment. From these observations, the inventors hypothesized that PD-L1 expression may also be suitable for stratifying individuals in order to identify those likely to benefit from anti-CCR8 antibody treatment. This hypothesis can be retroactively validated by correlating PD-L1 expression levels with tumor volume. Table 12.7.1.1 Comparison between responses to anti-PD-L1 antibody vs. Anti-CCR8 antibody for different syngeneic models. Example 12.7.2: Correlation between antitumor response and mRNA biomarker for disease stratification or control.
[00990] A expressão gênica média (RNA-seq) em tumores não tratados precocemente (100 a 200 mm3 de tamanho, N = 10 por modelo), tumores não tratados maiores (500 e 1000 mm3) ou no final do estudo foi correlacionada com relações T/C de 21 modelos de camundongos singênicos tratados com TPP-14099 ou TPP-15285 como descrito em outro lugar aqui.[00990] Mean gene expression (RNA-seq) in untreated tumors early (100 to 200 mm3 in size, N = 10 per model), larger untreated tumors (500 and 1000 mm3) or at the end of the study was correlated with T/C ratios of 21 syngeneic mouse models treated with TPP-14099 or TPP-15285 as described elsewhere here.
[00991] Os principais genes correlacionados foram significativamente enriquecidos com células T e marcadores de inflamação (valores de correlação de Pearson), conforme a Tabela 12.7.2.1. Marcadores de inflamação IFNg e genes de resposta IFNg (por exemplo, Gbp3/4/5/8/9, Cxcl9, Acod1), PDL1 (CD276), fatores de complemento C1, genes de células T, tais como Klra3/5 e Trav, bem como marcadores Treg CD25 (IL2RA), FOXP3 e CTLA4 estão entre os genes mais correlacionados com a resposta.[00991] The main correlated genes were significantly enriched with T cell and inflammation markers (Pearson correlation values), as shown in Table 12.7.2.1. IFNγ inflammation markers and IFNγ response genes (e.g., Gbp3/4/5/8/9, Cxcl9, Acod1), PDL1 (CD276), complement factors C1, T cell genes such as Klra3/5 and Trav, as well as Treg markers CD25 (IL2RA), FOXP3, and CTLA4 are among the genes most correlated with the response.
[00992] A Tabela 12.7.2.2 mostra a alteração de expressão em linhagens de células respondedoras (T/C < 0,6) versus linhagens celulares não respondedoras (T/C > 0,6) para tumores não tratados preco- cemente.[00992] Table 12.7.2.2 shows the change in expression in responder cell lines (T/C < 0.6) versus non-responder cell lines (T/C > 0.6) for tumors not treated early.
[00993] Os 100 genes com maior mudança de expressão entre res- pondedores e não respondedores estão listados. Genes de resposta IFNg e IFNg (por exemplo, Gbp2/3/4/8/10/11, Cxcl9/11, Ubd), marcadores de células T citotóxicas (por exemplo, Granzymes, Prf1), bem como marcadores de mastócitos (Tpsab1, Cma1, Tpsb2), e os fatores do complemento C1 estão entre os genes mais preditivos de resposta.[00993] The 100 genes with the greatest expression change between responders and non-responders are listed. IFNγ and IFNγ response genes (e.g., Gbp2/3/4/8/10/11, Cxcl9/11, Ubd), cytotoxic T cell markers (e.g., Granzymes, Prf1), as well as mast cell markers (Tpsab1, Cma1, Tpsb2), and complement factor C1 are among the most predictive response genes.
[00994] A Tabela 12.7.2.3 mostra a alteração de expressão em linhagens de células respondedoras (T/C < 0,6) versus linhagens celulares não respondedoras (T/C > 0,6) para tumores não tratados maiores (500 e 1000 mm3).[00994] Table 12.7.2.3 shows the change in expression in responder cell lines (T/C < 0.6) versus non-responder cell lines (T/C > 0.6) for larger untreated tumors (500 and 1000 mm3).
[00995] Os candidatos a biomarcadores estão listados na Tabela 12.7.2.1, 12.7.2.2 e 12.7.2.3. Pacientes com alta expressão das con- trapartes humanas desses genes ou uma combinação ou assinatura das contrapartes humanas desses genes podem responder ao tratamento anti-CCR8 na clínica. Além disso, esses marcadores ou sua combinação também podem ser usados para monitorar o sucesso do tratamento. Biomarcadores derivados de genes em itálico/negrito são particularmente preferidos.Tabela 12.7.2.1 Biomarcadores adequados correlacionados com a resposta antitumoral alcançada com anticorpos anti-CCR8 inventivos. Esses biomarcadores foram encontrados regulados positivamente em tumores não tratados precocemente e correlacionados com a resposta ao tratamento. Biomarcadores derivados de genes em itálico/negrito são particularmente preferidos. Os 100 genes com maior coeficiente de correlação negativa (valores de r são mostrados) entre a expressão e as relações T/C são listados. Tabela 12.7.2.2 Biomarcadores adequados correlacionados com a resposta antitumoral alcançada com anticorpos anti-CCR8 inventivos. Mudança de expressão em linhagens celulares respondedoras (T/C < 0,6) versus linhagens celulares não respondedoras (T/C > 0,6). Os principais genes correlacionados (pearson) foram constatados significativamente enriquecidos com células T e marcadores de inflamação. Tabela 12.7.2.3 Biomarcadores adequados baseados em genes com maiores mudanças de dobra entre respondedores e não respondedo- res com base em grandes tumores não tratados (500 mm3 e 1000 mm3). A expressão de granzimas e outros marcadores de células imunes é maior em modelos respondedores do que em modelos não res- pondedores. Biomarcadores derivados de genes em itálico/negrito são particularmente preferidos. Exemplo 12.8: Expressão de mRNA alterada em modelos de tumor singênico após administração de anticorpo anti-CCR8[00995] Candidate biomarkers are listed in Tables 12.7.2.1, 12.7.2.2, and 12.7.2.3. Patients with high expression of the human counterparts of these genes, or a combination or signature of the human counterparts of these genes, may respond to anti-CCR8 treatment in the clinic. Furthermore, these markers or their combination can also be used to monitor treatment success. Biomarkers derived from genes in italics/bold are particularly preferred. Table 12.7.2.1 Suitable biomarkers correlated with the antitumor response achieved with inventive anti-CCR8 antibodies. These biomarkers were found to be upregulated in early untreated tumors and correlated with treatment response. Biomarkers derived from genes in italics/bold are particularly preferred. The 100 genes with the highest negative correlation coefficient (r values are shown) between expression and T/C ratios are listed. Table 12.7.2.2 Suitable biomarkers correlated with the antitumor response achieved with inventive anti-CCR8 antibodies. Change in expression in responder cell lines (T/C < 0.6) versus non-responder cell lines (T/C > 0.6). The main correlated genes (Pearson) were found to be significantly enriched with T cells and inflammation markers. Table 12.7.2.3 Suitable biomarkers based on genes with major fold changes between responders and non-responders based on large untreated tumors (500 mm3 and 1000 mm3). The expression of granzymes and other immune cell markers is higher in responder models than in non-responder models. Biomarkers derived from genes in italics/bold are particularly preferred. Example 12.8: Altered mRNA expression in syngeneic tumor models after administration of anti-CCR8 antibody.
[00996] Para cada modelo de tumor singênico, 10 camundongos tratados com anticorpo anti-CCR8 TPP-14099 e 10 camundongos tratados com controle de isotipo foram sacrificados 24h após o tratamento final. Os tumores foram cortados em pequenos pedaços e imersos em RNAlater a 4°C. O mRNA poli-A foi extraído e as bibliotecas de cDNA foram geradas de acordo com o protocolo Hi-seq da Illumina para sequenciamento de RNA subsequente. As amostras foram se- quenciadas em uma profundidade de ~ 40 milhões de leitu-ras/amostras de pares longos de 150 pb.[00996] For each syngeneic tumor model, 10 mice treated with anti-CCR8 TPP-14099 antibody and 10 mice treated with isotype control were sacrificed 24h after final treatment. Tumors were cut into small pieces and immersed in RNAlater at 4°C. Poly-A mRNA was extracted and cDNA libraries were generated according to the Illumina Hi-seq protocol for subsequent RNA sequencing. Samples were sequenced at a depth of ~40 million reads/samples of 150 bp long pairs.
[00997] As Fig. 63 a 73 mostram o impacto do tratamento com controle de isotipo (TPP-9809) ou anticorpo anti-CCR8 (TPP-14099) nos níveis de expressão de mRNA de diferentes marcadores de células imunes em diferentes modelos de tumor singênico. O tratamento aumentou o marcador de inflamação lfng, marcadores de macrófagos Ms4a7, Acod1 e Mrc1, marcadores de células T citotóxicas Cd8a e Cd8b1, marcador de células exterminadoras naturais (NK) Ncr1, mar-cadores de células pan T Cd3e/d/g e marcadores de células B Cd19 e Cd22.[00997] Figures 63 to 73 show the impact of treatment with isotype control (TPP-9809) or anti-CCR8 antibody (TPP-14099) on mRNA expression levels of different immune cell markers in different syngeneic tumor models. Treatment increased the inflammation marker lfng, macrophage markers Ms4a7, Acod1 and Mrc1, cytotoxic T cell markers Cd8a and Cd8b1, natural killer (NK) cell marker Ncr1, pan T cell markers Cd3e/d/g and B cell markers Cd19 and Cd22.
[00998] Notavelmente, os inventores observaram indução significativa de LTta/b, bem como Cxcr5 e seu ligante Cxcl13 nos modelos tu- morais CT26, MBT2 e H22, bem como uma regulação positiva geral desses genes em vários outros modelos, incluindo RM1, Hepa1-6 e 4T1. Sem estar limitado pela teoria, uma indução de estruturas linfoi- des terciárias pelo anticorpo anti-CCR8 TPP-14099 ou TPP-15285 pode contribuir para a resposta antitumoral induzida por esses anticor-pos.Tabela 12.8.1: Anticorrelação de marcador de células T, proteínas de ponto de verificação, marcadores Treg, marcador de células NK, marcador de macrófagos, marcador de células B e interferon gama com resposta ao tratamento com anticorpo anti-CCR8. Exemplo 13: Preparação de Conjugado de Tório Direcionado (TTC) compreendendo anticorpos anti-CCR8[00998] Notably, the inventors observed significant induction of LTta/b, as well as Cxcr5 and its ligand Cxcl13 in the CT26, MBT2, and H22 tumor models, as well as a general upregulation of these genes in several other models, including RM1, Hepa1-6, and 4T1. Without being limited by theory, an induction of tertiary lymphoid structures by the anti-CCR8 antibody TPP-14099 or TPP-15285 may contribute to the antitumor response induced by these antibodies. Table 12.8.1: Anticorrelation of T cell marker, checkpoint proteins, Treg markers, NK cell marker, macrophage marker, B cell marker, and interferon gamma with response to anti-CCR8 antibody treatment. Example 13: Preparation of a Targeted Thorium Conjugate (TTC) comprising anti-CCR8 antibodies
[00999] A invenção do WO2016096843 é incorporada aqui por referência em sua totalidade e em particular no que diz respeito à produção dos conjugados como descrito neste Exemplo.[00999] The invention of WO2016096843 is incorporated herein by reference in its entirety and in particular with regard to the production of the conjugates as described in this Example.
[001000] A conjugação do quelante 3,2-hidroxipiridonona (3,2- HOPO) ou qualquer outro quelante adequado com os anticorpos TPP- 23411, TPP-21360 ou quaisquer outros anticorpos anti-CCR8 descritos pode ser realizada como descrito anteriormente no pedido de patente WO2016096843. Em suma, para ativar o quelante, o quelante 3,2-HOPO, dissolvido em DMA na relação de 1:1 com tampão MES 0,1 M pH 5,4, NHS e EDC, ambos dissolvidos em tampão MES 0,1 M pH 5,4, é misturado em uma relação de 1/1/3. Para conjugação com os anticorpos, uma relação molar de 7,5/7,5/22,5/1 (quelan- te/NHS/EDC/mAb) do quelante ativado pode ser carregada no mAb. Após 20 a 60 min, a reação é extinta com 12% v/v 0,3 M de ácido cítrico para ajustar o pH para 5,5. A concentração de proteína é determinada por HPLC, integrando a área do pico a uma absorbância de 280 nm. A solução é então trocada com tampão em citrato a 30 mM, 50 mg/mlx de M sacarose, EDTA a 2 mM, pABA 0,5 mg/ml, pH 5,5 por filtração de fluxo tangencial (TFF) em volume constante. No final da diafiltração, a solução é descarregada para um recipiente de formulação. O produto é formulado com tampão TFF (Citrato a 30 mM, x 50 mg/ml de M Sacarose, EDTA a 2 mM, 0,5 mg/ml pABA, pH 5,5) e 7% p/v polissorbato 80 para obter 2,5 mg/ml do respectivo CCR8 conjugados anticorpo-quelante (CCR8-ACCs). CCR8-ACCs podem ser filtra-dos através de um filtro de 0,2 μm em frascos estéreis.[001000] The conjugation of the chelating agent 3,2-hydroxypyridonone (3,2-HOPO) or any other suitable chelating agent with the antibodies TPP-23411, TPP-21360 or any other anti-CCR8 antibodies described can be carried out as previously described in patent application WO2016096843. In short, to activate the chelating agent, the chelating agent 3,2-HOPO, dissolved in DMA in a 1:1 ratio with 0.1 M MES buffer pH 5.4, NHS and EDC, both dissolved in 0.1 M MES buffer pH 5.4, is mixed in a 1/1/3 ratio. For conjugation with the antibodies, a molar ratio of 7.5/7.5/22.5/1 (chelating agent/NHS/EDC/mAb) of the activated chelating agent can be loaded onto the mAb. After 20 to 60 min, the reaction is quenched with 12% v/v 0.3 M citric acid to adjust the pH to 5.5. The protein concentration is determined by HPLC, integrating the peak area at an absorbance of 280 nm. The solution is then exchanged with a buffer solution containing 30 mM citrate, 50 mg/ml sucrose, 2 mM EDTA, 0.5 mg/ml pABA, and pH 5.5 by constant-volume tangential flow filtration (TFF). At the end of diafiltration, the solution is discharged into a formulation container. The product is formulated with TFF buffer (30 mM citrate, 50 mg/ml sucrose, 2 mM EDTA, 0.5 mg/ml pABA, pH 5.5) and 7% w/v polysorbate 80 to obtain 2.5 mg/ml of the respective CCR8 antibody-chelating conjugate (CCR8-ACCs). CCR8-ACCs can be filtered through a 0.2 μm filter into sterile vials.
[001001] CCR8-ACCs são radiomarcados com tório-227 como descrito no WO2016096843. Em suma, 5 μl de CCR8-ACCs são misturados com 32 μl de tório-227 (atividade de 3,875 MBq/ml) e 13 μl de tampão citrato, resultando em conjugados de tório-227 direcionados a CCR8 (CCR8-TTCs) em atividades específicas de 10 kBq/μg. A amostra pode ser incubada durante 60 min em temperatura ambiente para permitir a radiomarcação estável de tório-227 no quelante 3,2-HOPO. Uma alíquota da amostra pode ser analisada por cromatografia em camada fina instantânea (iTLC). SEQUÊNCIAS DE ANTICORPOS [001001] CCR8-ACCs are radiolabeled with thorium-227 as described in WO2016096843. In summary, 5 μl of CCR8-ACCs are mixed with 32 μl of thorium-227 (activity of 3.875 MBq/ml) and 13 μl of citrate buffer, resulting in CCR8-targeted thorium-227 conjugates (CCR8-TTCs) at specific activities of 10 kBq/μg. The sample can be incubated for 60 min at room temperature to allow stable radiolabeling of thorium-227 on the chelating agent 3,2-HOPO. An aliquot of the sample can be analyzed by flash thin-layer chromatography (iTLC). ANTIBODY SEQUENCES
Claims (3)
Applications Claiming Priority (3)
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|---|---|---|---|
| US62/705,434 | 2020-06-26 | ||
| US62/705,608 | 2020-07-07 | ||
| EP20205426.8 | 2020-11-03 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
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| BR122024025431A2 BR122024025431A2 (en) | 2025-01-14 |
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