Claim Missing Document
Check
Articles

Found 17 Documents
Search

Molecular identification of Cyclosorus parasiticus (L.) Farw. From Gumitir, Jember Indonesia Rizqoni, Moh Ikmal Alfi; Setyati, Dwi; Su'udi, Mukhamad; Ulum, Fuad Bahrul; Dwinianti, Edia Fitri
BIOEDUKASI Vol 22 No. 2 (2024)
Publisher : PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN UNIVERSITAS JEMBER

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.19184/bioedu.v22i2.45484

Abstract

Cyclosorus parasiticus (L.) Farw. from Mount Gumitir dominates the understory ferns vegetation along the roadside of a pine-mixed coffee plantation. Previous studies reported the metabolite profile with the flavonoid and alkaloid content. Current observations based on morphological structure of the specimens collection indicated a high variations, therefor molecular identification was required to support the phylogenetic data of the species. The aim of the study was to identify the Cyclosorus parasiticus sample originate from Gumitir using DNA barcode. We used three primers, i.e. ribulose 1,5-biphosphate carboxylase (rbcL), maturase K (matK), and Internal transcribed spacer 2 (ITS2) for molecular identification. The result showed that Cyclosorus parasiticus from Gumitir has a highest similarity with Christella latipinna (NC070300) from China with a value of Percent Identities value of 99.11% based on the ITS2 marker. The rbcL data in this study might contribute to supporting the molecular genus concept from recent Thelypteridaceae phylogeny.
The Ability of Aquatic Carnivorous Plants Utricularia vulgaris L. as Heavy Metal Bioremediators Su'udi, Mukhamad; Sururin, Fahma Wardah; Ardiyanti, Kurnia Dwi
Indonesian Journal of Life Sciences 2024: IJLS Vol 06 No.02
Publisher : Indonesia International Institute for Life Sciences

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.54250/ijls.v6i2.196

Abstract

Utricularia vulgaris is one of the aquatic carnivorous plants that is able to grow in low-nutrient environmental conditions. This unique plant is also a macrophytic plant whose entire body except for the flowers is submerged in water. Utricularia vulgaris also has no roots so it grows to float in water. The plant was found growing in an environment polluted by heavy metals. Several studies have shown that U. vulgaris is able to absorb several types of heavy metals effectively, such as Cu, Mn, Zn, and Fe. These heavy metals are needed in small amounts by organisms, but in high amounts they can inhibit the growth of aquatic organisms. Utricularia vulgaris, a carnivorous plant, has shown the potential to absorb heavy metals, making it a subject of interest for phytoremediation.
Effectiveness of antioxidants on in vitro regeneration of Musa paradisiaca var. raja to prevent browning and enhance embryo development Aisiyya Qutlana Munawaroh, Putri; Pancaningtyas, Sulistyani; Su'udi, Mukhamad
Pelita Perkebunan (a Coffee and Cocoa Research Journal) Vol. 40 No. 2 (2024)
Publisher : Indonesian Coffee and Cocoa Research Institute

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iccri.jur.pelitaperkebunan.v40i2.594

Abstract

The cultivation of raja banana is widespread in Indonesia. The process of increasing banana propagation through in vitro culture encounters a specific issue, namely the occurrence of browning during the initiation stage, which hinders the regeneration process. The objective of this study is to determine the effectivenessof antioxidants on the in vitro regeneration of raja banana to prevent browning and enhance embryo development. The study was conducted using a completely randomized design with the treatment of the antioxidant compounds ascorbic acid (AS) and melatonin (MN). The treatments consisted of control (without antioxidants), ascorbic acid (100 mg L-1, 150 mg L-1, and 200 mg L-1) and melatonin (10 mg L-1, 12 mg L-1, and 14 mg L-1). The results showed that ascorbic acid and melatonin treatment had no significant effect on the percentage of viable explants and the level of browning intensity, but provided significant results on the regeneration process. The application of melatonin at 14 mg L-1 significantly increased callus regeneration. Furthermore, at a concentration of 12 mg L-1 showed the highest callus percentage value compared to other treatments. The melatonin 12 mg L-1 treatment showed the earliest scutellar embryo formation, whereas ascorbic acid at a concentration of 100 mg L-1 resulted in the most optimal regeneration of globular and scutellar embryos. The highest concentrations of ascorbic acid and melatonin inhibit the formation of coleoptilar embryos
Potential of siam weed extract in combination with Trichoderma harzianum to stimulate seed germination of Coffea arabica Ania Ningsih, Misbahul; Pancaningtyas, Sulistyani; Su'udi, Mukhamad
Pelita Perkebunan (a Coffee and Cocoa Research Journal) Vol. 40 No. 1 (2024)
Publisher : Indonesian Coffee and Cocoa Research Institute

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iccri.jur.pelitaperkebunan.v40i1.595

Abstract

The Arabica coffee (Coffea arabica) beans feature a solid and thick seed shape that obstructs the germination process. Seed germination is an important feature of coffee plant cultivation and significantly impacts on the growth and development of the coffee plant. Siam weed (Chromolaena odorata L.) has the potential to be used as an organic fertilizer due to its nutrients and secondary metabolite compounds which can help accelerate plant growth. The optimal use of organic fertilizer can be achieved by using Trichoderma harzianum. This research aims to determine the effect and optimal concentration of Siam weed extract (Chromolaena odorata L.) and Trichoderma harzianum on the germination of Arabica coffee seeds. The research used a factorial Completely Randomized Design (CRD) in the form of siam weed extract concentrations of 8 ppm and 16 ppm and concentrations of Trichoderma harzianum of 5 ppm, 10 ppm, 15 ppm, and 20 ppm. The research finding indicated that the C2T1 treatment had the best results in terms of germination, growth speed, growth synchrony, hypocotyl length, and number of leaves on coffee plants. Meanwhile, the C2T4 treatment had the highest chlorophyll content.
Metode Direct PCR yang Cepat dan Hemat Biaya untuk DNA Barcoding Anggrek Obat Dendrobium crumenatum Sw. Afidah, Yusfi; Su'udi, Mukhamad
BIOEDUSAINS:Jurnal Pendidikan Biologi dan Sains Vol 7 No 2 (2024): Bioedusains: Jurnal Pendidikan Biologi dan Sains
Publisher : Institut Penelitian Matematika, Komputer, Keperawatan, Pendidikan dan Ekonomi (IPM2KPE)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.31539/bioedusains.v7i2.12893

Abstract

This study aims to develop a rapid and cost-effective Direct PCR method for amplifying the rbcL gene without requiring DNA isolation, particularly for Dendrobium crumenatum Sw., an orchid species known for its traditional medicinal uses. The method involved soaking fresh leaves of D. crumenatum in TE buffer, followed by incubation at 55ºC. The incubation product was Directly used as a PCR template. The results showed a clear DNA band of 600 bp, corresponding to the target rbcL gene. BLAST analysis confirmed that the DNA sequence shared 84-85% identity with other species in GenBank. In conclusion, the Direct PCR method proved to be effective for DNA barcoding applications, offering advantages in speed and cost-efficiency over conventional DNA isolation methods. Keywords: Medicinal Orchids, Dendrobium crumenatum Sw., Direct PCR, DNA Barcoding
Studi Etnofarmakologi Potensi Terminalia arjuna (Roxb. Ex DC) Wight & Arn dan Perkembangannya dalam Bidang Kesehatan Su'udi, Mukhamad; Khoirunnisa, Gita Ayu; Ramadany, Zakiyah; Ardiyanti, Kurnia Dwi; Dwinianti, Edia Fitri
Jurnal Sains dan Edukasi Sains Vol. 8 No. 1 (2025): Jurnal Sains dan Edukasi Sains
Publisher : Faculty of Science and Mathematics, Universitas Kristen Satya Wacana, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24246/juses.v8i1p79-87

Abstract

Tanaman herbal telah dimanfaatkan manusia dalam bidang pengobatan untuk menyembuhkan berbagai macam penyakit dan ilmu pengobatan tradisional telah berlangsung sejak zaman kuno hingga saat ini. Terminalia arjuna merupakan salah satu tanaman yang banyak digunakan dalam obat-obatan herbal tradisional Ayurveda dari India. Pengolahan T. arjuna dalam pengobatan Ayurveda yaitu dikonsumsi dengan cara diseduh atau dikonsumsi bersama mentega (ghee) dan susu (ksheerapaka). Kulit batang T. Arjuna adalah bagian yang paling banyak dimanfaatkan oleh masyarakat India sebagai obat. Berbagai senyawa metabolit yang telah diisolasi dari akar, batang, daun, buah, dan biji dan telah diuji dalam skala laboratorium, praklinis dengan hewan uji maupun uji klinis pada manusia untuk mengetahui potensi terapeutiknya. Senyawa metabolit yang ditemukan meliputi flavonoid, terpenoid, polifenol, glikosida dan steroid beserta derivatnya. Kandungan senyawa metabolit dan potensi aktivitas terapeutik melalui berbagai penelitian dikumpulkan menggunakan ulasan ilmiah menggunakan kajian dari berbagai sumber literasi. Hasil berbagai penelitian menunjukkan T. arjuna berpotensi sebagai agen terapeutik yang berperan penting dengan kemampuan menghambat maupun menyembuhkan berbagai gangguan kesehatan. Aktivitas farmakologis T. Arjuna menunjukkan potensi terapeutik dalam aktivitas antikanker, antimikrob, antioksidan, serta memberikan efek kardioprotektif, hepatoprotektif dan gastroprotektif. Studi etnofarmakologi potensi terapeutik T. arjuna diharapkan mampu memberikan dasar pengetahuan pemanfaatan T. arjuna sebagai bahan dasar obat herbal di masa yang akan datang.
Peran forensik palinologi dalam berbagai investigasi kriminal di dunia serta potensinya untuk diterapkan di Indonesia Ramadany, Zakiyah; Rohimah, Siti; Mustafidah, Qori’atul; Su'udi, Mukhamad
Teknosains Vol 18 No 2 (2024): Mei-Agustus
Publisher : Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/teknosains.v18i2.46226

Abstract

Forensik palinologi merupakan studi tentang palynomorph yang meliputi polen, spora, dan sisa mikroskopis tumbuhan yang dapat digunakan sebagai petunjuk dalam identifikasi suatu kasus. Analisis terhadap polen dan spora yang ditemukan pada rambut, pakaian, alas kaki, kendaraan dan benda lainnya dapat menunjukkan hubungan antara korban, tempat kejadian perkara (TKP), dan perilaku kriminal. Studi ini bertujuan untuk mengetahui peran forensik palinologi dalam menyelesaikan berbagai kasus di dunia serta potensi dan aplikasinya dalam pemecahan berbagai kasus yang belum terselesaikan di Indonesia. Metode yang digunakan berupa studi literatur dari berbagai artikel dan buku baik nasional maupun internasional. Pencarian dilakukan menggunakan berbagai kata kunci yang mendukung melalui website seperti Google Scholar, ScienceDirect, dan ResearchGate. Hasil menunjukkan bahwa identifikasi melalui sampel palynomorph yang ditemukan dapat dijadikan sebagai bukti maupun petunjuk untuk menyelesaikan berbagai kasus di dunia. Analisis terhadap palynomorph sangat berpotensi untuk diterapkan dan dikembangkan di Indonesia karena memiliki keanekaragaman flora, banyaknya tumbuhan endemik, dan ribuan vegetasi habitat mikro yang dapat menjadi penanda khas antar daerahnya.
Mekanisme active flypaper traps pada Drosera capensis sebagai bentuk interaksinya dengan serangga Cahyono, Haris; Wulandari, Wardza Izza; Gunawan, Gilbert Geraldo; Mustafidah, Qori'atul; Su'udi, Mukhamad
Teknosains Vol 19 No 1 (2025): Januari-April
Publisher : Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/teknosains.v19i1.54082

Abstract

Drosera capensis adalah spesies tumbuhan karnivora endemik wilayah Cape, Afrika Selatan yang dikenal memiliki bentuk dan fungsi fisiologis yang khas karena memiliki mekanisme active flypaper traps. Daun D. capensis memiliki tentakel yang dapat mengeluarkan cairan lengket untuk menangkap dan menyerap nutrisi dari mangsa yang diperoleh. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui keunikan D. capensis dalam memenuhi kebutuhan nutrisinya melalui berbagai interaksi dengan serangga. Metode yang digunakan pada penelitian ini berupa studi literatur (literature review) sistematis dari berbagai artikel dan buku berisi informasi yang menunjang. Koleksi sumber referensi dilakukan melalui berbagai basis data ilmiah seperti Researchgate, ScienceDirect, dan Google Scholar dengan kriteria inklusi dan eksklusi yang relevan. Berdasarkan hasil studi literatur menunjukkan bahwa fisiologi yang unik pada D. capensis yaitu dapat menarik mangsa secara visual (antosianin), extra-floral nectar (EFN), dan penciuman (volatil). Banyak serangga yang melakukan interaksi dengan tumbuhan ini khususnya kelompok Diptera dan Collembola yang menunjukkan adanya interaksi non-mutualistik. Mekanisme active flypaper traps pada D. capensis dilakukan melalui gerakan tigmonasti dengan menggulungkan daun untuk menangkap mangsa. Peristiwa ini dipicu oleh sinyal elektrik dan diikuti dengan aktivasi asam jasmonat yang terkait dengan produksi enzim pencernaan seperti protease. D. capensis juga memproduksi gland cell yang memiliki kandungan asam polisakarida yang membuat D. capensis memiliki lendir yang sangat lengket. Lendir tersebut berfungsi untuk menjerat dan menahan serangga, memfasilitasi transmisi sinyal elektrik, serta membantu dalam distribusi enzim pencernaan.
Interaksi Venus Flytrap (Dionaea muscipula) dengan Serangga Mangsa dan Serangga Polinator Utami, Diah Ayu; Amero, Movhalky Argeswara Delta Cancera; Munawaroh, Putri Aisiyya Qutlana; Su'udi, Mukhamad
Jurnal Penelitian Sains Vol 26, No 1 (2024)
Publisher : Faculty of Mathtmatics and Natural Sciences

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.56064/jps.v26i1.913

Abstract

Dionaea muscipula merupakan tumbuhan karnivora yang hidup di daerah terestrial yang kurang nutrisi khususnya nitrogen dan memiliki active snap trap. Tumbuhan karnivora ini memangsa serangga untuk memenuhi kebutuhan nitrogen dengan membentuk lobus berumbai yang akan menutup saat serangga mangsa masuk karena memiliki trigger hairs sebagai sensor. Lobus juga mensekresikan pigmen antosianin dan Volatile Organic Compounds (VOCs) untuk menarik perhatian serangga mangsa. Peran serangga selain menjadi mangsa juga berperan sebagai polinator, maka terjadi prey/pollinator paradox karena polinator dapat termangsa oleh D. muscipula. Maka dari itu, D. muscipula membentuk mekanisme dengan membentuk bunga sekitar 15-35 cm diatas jebakan. Mekanisme ini menyebabkan polinator yang berupa serangga terbang tidak termangsa oleh D. Muscipula dan membantu membawa polen. Mekanisme tersebut meminimalisasi overlapping antara serangga mangsa dan serangga polinator. 
Adaptasi Morfologi Trikoma pada Tillandsia sp. dalam Penyerapan Air Afidah, Yusfi; Noviyani, Anis; Munawaroh, Putri Aisiyya Qutlana; Su'udi, Mukhamad
Jurnal Penelitian Sains Vol 26, No 1 (2024)
Publisher : Faculty of Mathtmatics and Natural Sciences

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.56064/jps.v26i1.920

Abstract

Tillandsia sp. merupakan tanaman hijau sepanjang tahun yang berasal dari Amerika Latin. Tanaman ini tergolong tanaman epifit dengan ciri khusus tidak memiliki akar tanah yang kokoh seperti tanaman pada umumnya. Bentuk adaptasi yang dilakukan dengan adanya trikoma yang berfungsi sebagai penyerapan air dan nutrisi sehingga Tillandsia sp. dapat tumbuh dengan baik. Berbagai macam bentuk trikoma dapat menyesuaikan dengan kondisi lingkungan yang ada, sehingga morfologi setiap jenisnya berbeda sebagai bentuk adaptasi. Melalui berbagai sumber ditemukan adanya perbedaan pada kerapatan trikoma serta panjang sel sayap “wing cells” yang dimiliki oleh beberapa jenis Tillandsia sp. Ciri khusus yang dimiliki tanaman ini yaitu pada trikoma dan sel sayap berfungsi sebagai sistem penyerapan air untuk menggantikan fungsi dan peran akar.